Desde que os vírus de computadores tornaram-se um grave problema para sistemas individuais e corporativos, diversos modelos de disseminação de vírus têm sido usados para explicar o comportamento dinâmico da propagação desse agente infeccioso. Como estratégias de prevenção de proliferação de vírus, o uso de antivírus e sistema de vacinação, têm contribuído para a contenção da proliferação da infecção. Outra forma de combater os vírus é estabelecer políticas de prevenção baseadas nas operações dos sistemas, que podem ser propostas com o uso de modelos populacionais, como os usados em estudos epidemiológicos. Entre os diversos trabalhos, que consideram o clássico modelo epidemiológico de Kermack e Mckendrick, SIR (suscetível - infectado - removido), aplicado ao contexto de propagação de vírus, a introdução de computadores antidotais, como programa antivírus, fornece muitos resultados operacionais satisfatórios. Neste trabalho, o modelo SIRA (suscetível - infectado - removido - antidotal) é estudado considerando a taxa de mortalidade como parâmetro e associado a isso, o parâmetro que recupera os nós infectados é variado de acordo com a alteração da taxa de mortalidade. Nessas condições, a existência dos pontos de equilíbrio livre de infecção são encontrados, mostrando que o modelo é robusto. / Since computer viruses have become a serious problem for individual and corporate systems, several models of virus dissemination have been used to explain the dynamic behavior of the spread of this infectious agent. As prevention strategies for virus proliferation, the use of antivirus and vaccination system, have contributed to contain the proliferation of the infection. Another way to combat viruses is to establish prevention policies based on the operations of the systems, which can be proposed with the use of population models, such as those used in epidemiological studies. Among the several papers, which consider the classic epidemiological model of Kermack and Mckendrick, SIR (susceptible - infected - removed), applied to the context of virus propagation, the introduction of antidotal computers, such as antivirus program, provides many satisfactory operational results. In this work, the SIRA (susceptible - infected - removed - antidotal) model is studied considering the mortality rate as a parameter and associated with this, the parameter that recovers infected nodes is varied according to the change in mortality rate. Under these conditions, the existence of infection free equilibrium points are found, showing that the model is robust.

Objetivo. Desenvolvimento de uma estrutura para aplicação de simulação numérica estocástica no estudo de espalhamento de doenças em metapopulações de maneira que esta incorpore a topologia dinâmica de contatos entre as subpopulações, verificando as peculiaridades do modelo e aplicando este modelo às redes de movimentação de animais de Pernambuco para estudar o papel das feiras de animais. Método. Foi utilizado o paradigma de modelos híbridos para tratar do espalhamento de doenças nas metapopulações que, das nossas aplicações, resultou na união de duas estratégias de modelagem: Modelos Baseados no Indivíduo e o Algorítimo de Simulação Estocástica. Aplicamos os modelos híbridos em redes de movimentação de animais reais e fictícias para destacar as diferenças dos modelos híbridos com diferentes abordagens de migração (pendular e definitiva) e comparamos estes modelos com modelos clássicos de equações diferenciais. Ainda, através do pacote hybridModels, estudamos o papel das feiras de animais em cenários de epidemia de febre aftosa na rede de movimentação de animais de Pernambuco, introduzindo a doença numa feira de animais contida numa amostra da base de Guia de Trânsito Animal e calculamos a cadeia de infecção dos estabelecimentos. Resultados. Constatamos que no estudo de epidemias com o uso de modelo híbrido, a migração pendular, na média, subestima o número de animais infectados no cenário de comercialização de animais (migração defi nitiva), além de traduzir uma dinâmica de espalhamento enganosa, ignorando cenários mais complexo oferecido pela migração definitiva. Criamos o pacote hybridModels que generaliza os modelos híbridos com migração definitiva e com ele aplicamos um modelo híbrido SIR na rede de Pernambuco e verificamos que as feiras de animais de Pernambuco são potentes disseminadores de doenças transmissíveis. Conclusão. Apesar de custo computacional maior no estudo de espalhamento de doenças, a migração definitiva é o mais adequado tipo de conexão entre as subpopulações de animais de produção. Ainda, de acordo com as nossas analises, as feiras de animais estão entre os mais importantes nós na rede de movimentação de Pernambuco e devem ter lugar de destaque nas estratégias de controle e vigilância epidemiológica / Objective. Development of framework applied to stochastic numerical simulation for the study of disease spreading in metapopulations, in a way that it incorporates the dynamic topology of contacts between subpopulations, checking the framework peculiarities and applying it to the animal movement network of Pernambuco to study the role of animal markets. Method. We used hybrid models paradigm to treat disease spread in metapopulations. From our applications it has resulted in the union of two modeling strategies: Individual-based model and the Algorithm for Stochastic Simulation. We applied hybrid models in real and fictitious networks to highlight the differences between different animal movement approaches (commuting and migration) and we compared these models with classic models of differential equations. Furthermore, through the hybridModels package, we studied the role of animal markets in epidemic scenarios of Foot and Mouth Disease (FMD) in animal movement networks of Pernambuco, introducing the disease in an animal market of a sample from the Animal Transit Record of Pernambuco’s database and calculating the contact infection chain of premises. Results. We noted that in the study of epidemics using a hybrid model, commuting can underestimates the number of infected animals in the animal trade scenario (migration), and resulting in a misleading spreading dynamic by ignoring a more complex scenario that occurs with migration. We created the hybridModels package that generalizes the hybrid models with migration, applied a SIR hybrid model to the animal movement network of Pernambuco and verified that animal markets are important disease spreaders. Conclusion. Despite its higher computational cost in the study of epidemics in animal movement networks, migration is the most suitable type of connection between subpopulations. Furthermore, animal markets of Pernambuco are among the most important nodes for disease transmission and should be considered in strategies of surveillance and disease control

Submitted by Marcio Maciel Bastos (marciomacielbastos@hotmail.com) on 2018-04-02T15:09:10Z No. of bitstreams: 4 dsrtcao.pdf: 3763696 bytes, checksum: e5614aca9d57fde04661fc6da2f7fe8d (MD5) Folha de assinaturas.pdf: 145939 bytes, checksum: b0efa18a3054171cdc8cc52a6a4d715f (MD5) EMAp Ficha catalográfica.pdf: 16727 bytes, checksum: 10446f26497b911613967664f6ca959c (MD5) dissertacao.pdf: 3462226 bytes, checksum: 2cb3f716b95b7d4ba28b55bcf90ed3c8 (MD5) / Approved for entry into archive by Janete de Oliveira Feitosa (janete.feitosa@fgv.br) on 2018-04-06T14:17:00Z (GMT) No. of bitstreams: 4 dsrtcao.pdf: 3763696 bytes, checksum: e5614aca9d57fde04661fc6da2f7fe8d (MD5) Folha de assinaturas.pdf: 145939 bytes, checksum: b0efa18a3054171cdc8cc52a6a4d715f (MD5) EMAp Ficha catalográfica.pdf: 16727 bytes, checksum: 10446f26497b911613967664f6ca959c (MD5) dissertacao.pdf: 3462226 bytes, checksum: 2cb3f716b95b7d4ba28b55bcf90ed3c8 (MD5) / Approved for entry into archive by Marcia Bacha (marcia.bacha@fgv.br) on 2018-04-12T18:20:43Z (GMT) No. of bitstreams: 4 dsrtcao.pdf: 3763696 bytes, checksum: e5614aca9d57fde04661fc6da2f7fe8d (MD5) Folha de assinaturas.pdf: 145939 bytes, checksum: b0efa18a3054171cdc8cc52a6a4d715f (MD5) EMAp Ficha catalográfica.pdf: 16727 bytes, checksum: 10446f26497b911613967664f6ca959c (MD5) dissertacao.pdf: 3462226 bytes, checksum: 2cb3f716b95b7d4ba28b55bcf90ed3c8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-12T18:21:12Z (GMT). No. of bitstreams: 4 dsrtcao.pdf: 3763696 bytes, checksum: e5614aca9d57fde04661fc6da2f7fe8d (MD5) Folha de assinaturas.pdf: 145939 bytes, checksum: b0efa18a3054171cdc8cc52a6a4d715f (MD5) EMAp Ficha catalográfica.pdf: 16727 bytes, checksum: 10446f26497b911613967664f6ca959c (MD5) dissertacao.pdf: 3462226 bytes, checksum: 2cb3f716b95b7d4ba28b55bcf90ed3c8 (MD5) Previous issue date: 2018-03-06 / The Zika virus (ZIKV) is a pathogen of the family Flaviviridae, transmitted in Brazil mainly by the mosquito Aedes aegypti and in less extent by sexual relations. In addition to symptoms common to dengue and chikungunya, the zika virus is also capable of causing irreversible damage to the nervous system, in adults it is related to Guillain-Barr´e syndrome and in fetuses it causes microcephaly. The Health Department of Rio de Janeiro maintains a database with records of patients who sought care and was infeccted with Zika. Our study seeks to estimate the true size of the epidemic that occurred in the year 2016 and the parameters that fit to explain the dissemination process. To make these estimates, we used the data provided by the Health Department and a hierarchical Bayesian model adapted to the SIR epidemiological model. We perform the inference process through modern sampling techniques such as Automatic Differentiation Variational Inference (ADVI), Stein Variational Gradient Descent (SVGD) and No-U-Turn (NUTS). / O Zika virus (ZIKV) é um patógeno da família Flaviviridae transmitido no Brasil principalmente pelo mosquito Aedes aegypti e em menor escala por relações sexuais. Além dos sintomas comuns à dengue e chikungunya, o vírus da zika também é capaz de causar danos irreversíveis no sistema nervoso, em adultos está relacionada à síndrome de Guillain-Barré e em fetos provoca microcefalia. O sistema de saúde do Rio de Janeiro mantém um banco de dados com os registros dos pacientes que buscaram atendimento e apresentaram sintomas de Zika. O nosso estudo busca estimar o verdadeiro tamanho da epidemia que ocorreu no ano de 2016 e os parâmetros que podem ser ajustados para explicar o processo de disseminação. Para realizar essas estimativas, utilizamos os dados fornecidos pelo sistema de saúde e uma modelagem Bayesiana hierárquica adaptada ao modelo epidemiológico SIR. Realizamos o processo de inferência através de modernas técnicas de amostragem, como Automatic Differentiation Variational Inference (ADVI), Stein Variational Gradient Descent (SVGD) e No-U-Turn (NUTS).

Submitted by Jamile Barbosa da Cruz (jamile.cruz@ucsal.br) on 2017-01-17T17:50:35Z No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO COSETE.pdf: 922415 bytes, checksum: e7926e11b5b74b6e1f8c5d5b54144e94 (MD5) / Approved for entry into archive by Rosemary Magalhães (rosemary.magalhaes@ucsal.br) on 2017-01-18T16:56:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO COSETE.pdf: 922415 bytes, checksum: e7926e11b5b74b6e1f8c5d5b54144e94 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-18T16:56:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO COSETE.pdf: 922415 bytes, checksum: e7926e11b5b74b6e1f8c5d5b54144e94 (MD5) Previous issue date: 2013-03-07 / Desde a sua descoberta em 1981, a epidemia da infecção pelo vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) e Aids vem se mostrando como um fenômeno global, contínuo, instável e dinâmico. Em pouco tempo, essa epidemia se transformou em um grave problema de saúde pública mundial em razão dos altos índices de morbi-mortalidade. A característica epidêmica fortemente masculina dessa patologia, com a maioria das vitimas homens, tanto homossexuais quanto heterossexuais vem mudando o seu perfil, e, cada vez mais a população feminina tem sido acometida: segundo dados da UNAIDS, no mundo, as mulheres jovens representam mais de 60% de todos os jovens que vivem com HIV e na África essa taxa chega a 72%. Diante desses dados, suscitou-se ao seguinte questionamento: Será que a vulnerabilidade das mulheres relacionada ao gênero vem contribuindo com o processo de feminização do HIV/Aids no município de Salvador no estado da Bahia? A partir de então, traçou-se como objetivo geral dessa pesquisa: descrever valores, atitudes, crenças, comportamentos e contextos historico-socio-culturais que possam ter vulnerabilizado mulheres para a infecção pelo vírus HIV/Aids em Salvador, no estado da Bahia. E, como objetivos específicos: identificar com mulheres já contaminadas, no município de Salvador, valores, atitudes, crenças, comportamentos e contextos historico-socio culturais que vulnerabilizaram as mulheres ao processo de infecção ao HIV/Aids; buscar com mulheres já contaminadas sua percepção frente a contaminação pelo HIV/Aids com relação ao homem, a idade, a renda e ao bairro; examinar com mulheres contaminadas as ações de saúde que poderiam ser realizadas na intenção de minimizar o processo de feminização do HIV/Aids. A metodologia adotada foi a qualitativa, com abordagem exploratória, tendo como foco a feminização da AIDS, adotando o gênero como recorte analítico. Essa pesquisa foi desenvolvida no antigo Centro de Referencia em DST/ AIDS do Estado da Bahia (Creaids), instituição pública do Sistema Único de Saúde (SUS). A população foi composta por um quantitativo mínimo de 14 mulheres cadastradas no serviço, no período de 2004 (momento do início do funcionamento da unidade) a agosto de 2011. / Since its discovery in 1981, the epidemic infection by the Human Immunodeficiency vírus (HIV) and AIDS presentes itself as a continuous, dynamic, and unstable global phenomenon. In a short space of time, this epidemic became a serious worldwide public health problem due to the high rates of morbidity and mortality. This epidemic that was heavily male with most victims both heterosexual and homosexual men is increasingly female: according to data from UNAIDS, in the world, young women represent over 60% of all young people living with HIV in Africa and this rate reaches 72%. Given these data, raised to the following question: Does the vulnerability of women related to gender has contributed to the process of feminization of HIV / AIDS in the city of Salvador in Bahia? From then drew up the general objective of this research: to describe values, attitudes, beliefs, behaviors and contexts historico-socio-cultural factors that may have vulnerabilized women to HIV infection / AIDS in Salvador, state of Bahia. And, as specific objectives: to identify with women already infected, in the city of Salvador, values, attitudes, beliefs, behaviors and socio-historical contexts cultural that may have vulnerabilized women to the process of infection with HIV / AIDS; seeking women already infected with their perception against contamination by HIV / AIDS in relation to men, age, income and neighborhood; examine women infected health actions that could be undertaken in an attempt to minimize the process of feminization of HIV / AIDS. The methodology was qualitative, with exploratory, focusing on the feminization of AIDS, adopting gender as analytical approach. This research was developed in ancient Reference Center for STD / AIDS State of Bahia (CREAIDS), a public institution of the Unified Health System (SUS). The population was composed of a minimum quantity of 14 women enrolled in the service, from 2004 (the time of initial operation of the unit) to August 2011.

Submitted by TIAGO BARRETO DE ANDRADE COSTA null (tiagobac@yahoo.com.br) on 2017-07-13T22:57:26Z No. of bitstreams: 1 TESE_TIAGO COSTA_VERSÃO FINAL.pdf: 23380596 bytes, checksum: 619a0746dd076316d81d596da3513a6c (MD5) / Approved for entry into archive by Monique Sasaki (sayumi_sasaki@hotmail.com) on 2017-07-14T18:38:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 costa_tba_dr_prud.pdf: 23380596 bytes, checksum: 619a0746dd076316d81d596da3513a6c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-14T18:38:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 costa_tba_dr_prud.pdf: 23380596 bytes, checksum: 619a0746dd076316d81d596da3513a6c (MD5) Previous issue date: 2017-07-06 / A mortalidade por agressão no Brasil desde pelo menos o início de 1980 vem apresentando um recrudescimento linear, em paralelo ao contexto de produção das periferias urbanas. A desagregação desse fenômeno em escalas de maior detalhe, entretanto, permite-nos perceber que esse crescimento linear é na verdade o resultado de diversas dinâmicas locais, várias delas com características epidêmicas. Isto é, crescimentos abruptos fora do padrão histórico de dada localidade, portanto, crescimentos não-lineares. De acordo com a análise proposta no presente trabalho, identificamos Belém/PA enquanto um desses contextos epidêmicos de agressões letais. Tais expressões de violência naquela cidade vêm crescendo fora de sua dinâmica costumeira desde o início dos anos 2000 e a expressão geográfica desse fenômeno tem sido a difusão das mortes pelo espaço intraurbano. Dessa forma, propomos enquanto tese que tal propagação espacial da problemática, sendo uma típica expressão de difusão sobre o espaço geográfico, não se dá de forma homogênea em todas as direções a partir de um foco. Antes, segue por caminhos que oferecem condições mais favoráveis à epidemia (corredores de difusão) e evita aqueles mais desfavoráveis (barreiras à difusão). Enfim, no presente trabalho argumentamos no sentido de demonstrar essa dinâmica espaço-temporal peculiar do crescimento dos homicídios em Belém nos últimos anos, a partir de uma abordagem dos conceitos de epidemia e difusão espacial calcada em análise de dados espaciais. Ficou demonstrado, com base nessa análise, que os homicídios nessa metrópole brasileira têm alta correlação espacial, o que aponta para a necessidade dos fundamentos teóricos e metodológicos da Geografia na análise dessa problemática no contexto brasileiro. / Since at least 1980 the homicide mortality on Brazil has increased linearly at the same time of the urban slums has being shaped. However, in a larger zoom into the fenomeno, we can to see this linear growth is a result of several local dynamics, some of which are epidemic. That is, abrupt growth outside the historical pattern of a given locality, therefore, nonlinear growth. According to the analysis proposed in the present study, we identified Belém/PA as one of those epidemic contexts of lethal violence. Such expressions of violence in that city have been growing out of their usual dynamics since the early 2000s and the geographic expression of this phenomenon has been the spread of deaths through intraurban space. In this way, we propose as thesis that such spread of the problematic, as a typical expression of the diffusion on the geographical space, does not take place homogeneously in all directions from a focus. Indeed, it follows paths that offer more favorable conditions to the epidemic (diffusion channels) and avoid the more unfavorable ones (barriers to diffusion). Therefore, using a spatial data analysis approach, in the present work we argue to demonstrating this peculiar space-time dynamics of the present-day increase in the Belém’s homicides events. We do this from an approach of the concepts of epidemic and spatial diffusion based on spatial data analysis. It was demonstrated that the homicides in this Brazilian metropolis have a high spatial correlation, which points to the need of the theoretical and methodological foundations of Geography in the analysis of this problem in the Brazilian context.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:14:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese Alcineia Rodrigues dos Santos.pdf: 2107648 bytes, checksum: 02d1f969d2c15d06a421febc4a845a41 (MD5) Previous issue date: 2011-05-03 / The beginning of this research lies at the wish of understanding the relation among the population from the region of Seridó, the death and the dead when cholera morbus, smallpox and yellow fever‟s epidemic outbreak exterminated part of the population from that region, causing deep modifications in the funeral culture. Thus, our aim is to analyze how this epidemic impact contributed to a changing action towards people‟s funeral habits and attitudes concerning death and the dead in Seridó as from 1850. During the 18th century and the first half of the 19th century, the attitudes of the inhabitants from the Province of Rio Grande do Norte regarding life‟s finite limit were based on the familiarity between the living and the dead, which led to a relation characterized by rituals after the death and the burial inside churches. This procedure was largely used by the Catholic Christians and it allowed a close contact between the dead and the living because when the congregation was inside the church they would walk around, sit and pray on the grave. The impact of the epidemic was fundamental to change the funeral culture. The diseases were responsible for a high mortality rate and consequently the burial inside the churches turned out being unfeasible because there was no time enough to the bodies‟ decomposition. As a result, the hygienist discourse that, under European influence, struggled against the ad sanctos burial was enhanced in order to prevent from other diseases and in favor of public hygiene. Under this perspective, a secularizing process takes place in Seridó, alike other Brazilian regions such as in São Paulo and Rio de Janeiro. It is this process we want to comprehend, based on official documents produced by the Presidents of the Province and Municipal Counties, wills and parochial obituary registers, besides visual resources like ground plans, photographs and videos, so that the secularized cemeteries of the region are analyzed. / Esta pesquisa surgiu a partir do desejo de compreender a relação que a população do Seridó manteve com a morte e com os mortos no momento em que os surtos epidêmicos de cólera-morbo, varíola e febre amarela grassaram na região, provocando modificações na cultura fúnebre. Assim, nosso objetivo é analisar como o impacto dessas epidemias, que atingiram esse espaço a partir de 1850, contribuiu para a ação transformadora sobre os costumes fúnebres e as atitudes da população para com a morte e os mortos. As atitudes dos habitantes da capitania do Rio Grande do Norte quanta à finitude da vida tinham como eixo central, durante toda a extensão do século XVIII e a primeira metade do século XIX, a familiaridade entre vivos e mortos, relação definida pelos rituais efetivados no momento pós-morte e pelas inumações no interior das igrejas. Essas inumações, utilizadas pelos cristãos católicos, permitiam o contato direto entre vivos e mortos: os fiéis que frequentavam as igrejas passavam, sentavam-se e faziam suas orações sobre as sepulturas. O impacto das epidemias nas transformações na cultura funerária foi fundamental. As doenças provocavam alto índice de mortalidade, tornando inviável o enterramento no interior das igrejas, uma vez que não havia tempo suficiente para a total decomposição dos corpos. Logo, constituíram-se em um dos elementos catalisadores do discurso higienista, que há tempos lutava, sob influência europeia, contra o enterramento ad sanctos, com base na prevenção de males e a favor da higienização pública. Dentro dessa conjuntura, o Seridó, a exemplo de outras regiões brasileiras, como São Paulo e o Rio de Janeiro, iniciou o processo de secularização da morte. É esse processo que pretendemos compreender, tendo como base o uso de documentação oficial produzida pelos Presidentes de Província e os de Comarcas Municipais, testamentos e registros paroquiais de óbito, além de recursos visuais, como plantas baixas, fotografias e vídeos, para análise dos cemitérios secularizados da região.

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / Esta pesquisa busca interpretar as diversas experiÃncias vivenciadas pela populaÃÃo do Baixo Jaguaribe CearÃ, durante a epidemia de malÃria ao longo dos anos de 1937 a 1940. SerÃo analisadas as adversidades, mudanÃas e permanÃncias culturais que a peste palustre trazia para o dia-a-dia da regiÃo. Tais interferÃncias originaram uma crise na economia local, uma vez que o tempo do trabalho ficou submetido aos intervalos em que os acessos da doenÃa nÃo se manifestavam. Muitas safras, entÃo, ficaram perdidas e muito trabalho por ser realizado nas roÃas, nos carnaubais, nos pastos, nos algodoeiros, dentre outros, pois, em muitas residÃncias, a doenÃa se manifestou em todos os membros de uma mesma famÃlia. A incidÃncia da malÃria tambÃm ocasionou mudanÃas nos rituais fÃnebres: as pessoas nÃo acompanhavam os enterros, evitavam freqÃentar as sentinelas, os sinos das igrejas nÃo badalavam anunciando as mortes e, para alÃm destas, os padres da regiÃo nÃo conseguiam dar conta dos pedidos de extrema-unÃÃo aos moribundos. SerÃo ressaltadas tambÃm as diversas explicaÃÃes para o processo de erradicaÃÃo da doenÃa. Portanto, busca compreender a peste palustre para alÃm do seu carÃter patolÃgico, classificando-a como elemento responsÃvel por todo um processo de desorganizaÃÃo social. Dessa forma, ao optar por estudar a epidemia de malÃria, acabamos por tecer uma teia que envolve tanto os sentimentos, como as experiÃncias vivenciadas pelas pessoas atingidas pela mazela. / This research aims to understand the sort of experiences lived by the population of âBaixo Jaguaribeâ region, state of CearÃ, during the epidemics of malaria through 1937 until 1940. The adversities and the cultural permanency and changes the swampy plague brought to the routine of that region were analyzed. Such interferences originate a crisis in the local economy, once the time dedicated to laboring submitted itself to the intervals that the diseaseâs peak had not appeared. Sometimes the disease reached all the members of one single family, thereupon many crops were lost and also a lot of work to be done in the field (cultivated with carnaubas, cotton) and in the pasture were left behind. Due to the plague, some funeral rituais changed: people did not follow funerals and did not attend to the death-watch, the churchesâ bell did not toll to announce deaths in the community and, besides all this, the priests were not able to attend all the moribund requests to âextrema-unÃÃoâ. The whole set of explications to the process of eradication of the plague were highlighted in this research. Thus, swampy plague was understood beyond its pathologic aspect, referring to it as a component responsible for a complete social disorganization process. Therefore, as the option to study the epidemics of malaria was set, a complex network that embodies feelings as well as experiences lived by the people caught by the plague was found.

Desde que os vírus de computadores tornaram-se um grave problema para sistemas individuais e corporativos, diversos modelos de disseminação de vírus têm sido usados para explicar o comportamento dinâmico da propagação desse agente infeccioso. Como estratégias de prevenção de proliferação de vírus, o uso de antivírus e sistema de vacinação, têm contribuído para a contenção da proliferação da infecção. Outra forma de combater os vírus é estabelecer políticas de prevenção baseadas nas operações dos sistemas, que podem ser propostas com o uso de modelos populacionais, como os usados em estudos epidemiológicos. Entre os diversos trabalhos, que consideram o clássico modelo epidemiológico de Kermack e Mckendrick, SIR (suscetível - infectado - removido), aplicado ao contexto de propagação de vírus, a introdução de computadores antidotais, como programa antivírus, fornece muitos resultados operacionais satisfatórios. Neste trabalho, o modelo SIRA (suscetível - infectado - removido - antidotal) é estudado considerando a taxa de mortalidade como parâmetro e associado a isso, o parâmetro que recupera os nós infectados é variado de acordo com a alteração da taxa de mortalidade. Nessas condições, a existência dos pontos de equilíbrio livre de infecção são encontrados, mostrando que o modelo é robusto. / Since computer viruses have become a serious problem for individual and corporate systems, several models of virus dissemination have been used to explain the dynamic behavior of the spread of this infectious agent. As prevention strategies for virus proliferation, the use of antivirus and vaccination system, have contributed to contain the proliferation of the infection. Another way to combat viruses is to establish prevention policies based on the operations of the systems, which can be proposed with the use of population models, such as those used in epidemiological studies. Among the several papers, which consider the classic epidemiological model of Kermack and Mckendrick, SIR (susceptible - infected - removed), applied to the context of virus propagation, the introduction of antidotal computers, such as antivirus program, provides many satisfactory operational results. In this work, the SIRA (susceptible - infected - removed - antidotal) model is studied considering the mortality rate as a parameter and associated with this, the parameter that recovers infected nodes is varied according to the change in mortality rate. Under these conditions, the existence of infection free equilibrium points are found, showing that the model is robust.

Objetivo. Desenvolvimento de uma estrutura para aplicação de simulação numérica estocástica no estudo de espalhamento de doenças em metapopulações de maneira que esta incorpore a topologia dinâmica de contatos entre as subpopulações, verificando as peculiaridades do modelo e aplicando este modelo às redes de movimentação de animais de Pernambuco para estudar o papel das feiras de animais. Método. Foi utilizado o paradigma de modelos híbridos para tratar do espalhamento de doenças nas metapopulações que, das nossas aplicações, resultou na união de duas estratégias de modelagem: Modelos Baseados no Indivíduo e o Algorítimo de Simulação Estocástica. Aplicamos os modelos híbridos em redes de movimentação de animais reais e fictícias para destacar as diferenças dos modelos híbridos com diferentes abordagens de migração (pendular e definitiva) e comparamos estes modelos com modelos clássicos de equações diferenciais. Ainda, através do pacote hybridModels, estudamos o papel das feiras de animais em cenários de epidemia de febre aftosa na rede de movimentação de animais de Pernambuco, introduzindo a doença numa feira de animais contida numa amostra da base de Guia de Trânsito Animal e calculamos a cadeia de infecção dos estabelecimentos. Resultados. Constatamos que no estudo de epidemias com o uso de modelo híbrido, a migração pendular, na média, subestima o número de animais infectados no cenário de comercialização de animais (migração defi nitiva), além de traduzir uma dinâmica de espalhamento enganosa, ignorando cenários mais complexo oferecido pela migração definitiva. Criamos o pacote hybridModels que generaliza os modelos híbridos com migração definitiva e com ele aplicamos um modelo híbrido SIR na rede de Pernambuco e verificamos que as feiras de animais de Pernambuco são potentes disseminadores de doenças transmissíveis. Conclusão. Apesar de custo computacional maior no estudo de espalhamento de doenças, a migração definitiva é o mais adequado tipo de conexão entre as subpopulações de animais de produção. Ainda, de acordo com as nossas analises, as feiras de animais estão entre os mais importantes nós na rede de movimentação de Pernambuco e devem ter lugar de destaque nas estratégias de controle e vigilância epidemiológica / Objective. Development of framework applied to stochastic numerical simulation for the study of disease spreading in metapopulations, in a way that it incorporates the dynamic topology of contacts between subpopulations, checking the framework peculiarities and applying it to the animal movement network of Pernambuco to study the role of animal markets. Method. We used hybrid models paradigm to treat disease spread in metapopulations. From our applications it has resulted in the union of two modeling strategies: Individual-based model and the Algorithm for Stochastic Simulation. We applied hybrid models in real and fictitious networks to highlight the differences between different animal movement approaches (commuting and migration) and we compared these models with classic models of differential equations. Furthermore, through the hybridModels package, we studied the role of animal markets in epidemic scenarios of Foot and Mouth Disease (FMD) in animal movement networks of Pernambuco, introducing the disease in an animal market of a sample from the Animal Transit Record of Pernambuco’s database and calculating the contact infection chain of premises. Results. We noted that in the study of epidemics using a hybrid model, commuting can underestimates the number of infected animals in the animal trade scenario (migration), and resulting in a misleading spreading dynamic by ignoring a more complex scenario that occurs with migration. We created the hybridModels package that generalizes the hybrid models with migration, applied a SIR hybrid model to the animal movement network of Pernambuco and verified that animal markets are important disease spreaders. Conclusion. Despite its higher computational cost in the study of epidemics in animal movement networks, migration is the most suitable type of connection between subpopulations. Furthermore, animal markets of Pernambuco are among the most important nodes for disease transmission and should be considered in strategies of surveillance and disease control

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-03-28T11:28:50Z No. of bitstreams: 1 vanessacostaassis.pdf: 2261462 bytes, checksum: 2bbcf8fbf1a6e34788de1d872c3f5f7c (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-04-24T02:34:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 vanessacostaassis.pdf: 2261462 bytes, checksum: 2bbcf8fbf1a6e34788de1d872c3f5f7c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-24T02:34:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 vanessacostaassis.pdf: 2261462 bytes, checksum: 2bbcf8fbf1a6e34788de1d872c3f5f7c (MD5) Previous issue date: 2013-02-04 / A dengue é uma doença viral que se apresenta como um importante problema de saúde pública mundial. Todo caso suspeito ou confirmado de dengue deve ser notificado no Sistema de Informação de Agravos de Notificação – SINAN. Os dados inseridos nesse sistema representam uma importante fonte de informação para estudos epidemiológicos e para a avaliação da qualidade do mesmo. Este estudo teve como principal objetivo analisar a qualidade das notificações de dengue informadas no SINAN, referentes à epidemia ocorrida em 2010 no município de Juiz de Fora – MG. Trata-se de um estudo epidemiológico descritivo, cujos dados foram obtidos do SINAN, disponibilizados pelo Departamento de Vigilância Epidemiológica e Ambiental de Juiz de Fora. Foram analisadas as variáveis sexo, faixa etária, dados de residência, raça/cor, escolaridade, local provável de infecção, dados laboratoriais e clínico-epidemiológicos, assim como a completitude, o encerramento oportuno dos casos registrados no Sistema, a duplicidade e a consistência dos dados. Foram notificados 9396 casos de dengue em Juiz de Fora, dos quais 62,9% foram classificados como Dengue Clássico, 0,9% como Dengue com Complicações, 0,1% como Febre Hemorrágica da Dengue, 0,04% como Síndrome do Choque da Dengue, 4,9% casos descartados, 30,8% inconclusivos, 0,3% casos ignorados/em branco, sendo que entre o total dos casos notificados 0,2% evoluíram para óbito. A maioria dos casos foi constatada em indivíduos do sexo feminino, na faixa etária de 32 a 59 anos, residentes na zona urbana, da raça branca, com ensino fundamental completo/incompleto e autóctones do município. A análise da completitude obteve classificação ruim para a maioria de seus campos, exceto para os de preenchimento obrigatório que receberam classificação excelente. Não foram encontradas notificações em duplicidade e 95,88% dos casos foram encerrados oportunamente. A análise da consistência obteve classificação excelente. As análises realizadas nesse trabalho apresentaram importantes informações para o conhecimento da epidemiologia da dengue em Juiz de Fora, consequentemente criando parâmetros para um melhor direcionamento das atividades de vigilância e controle da doença. Mostrou-se preocupante a quantidade de variáveis em branco/ignorado, apontando a necessidade de capacitação dos profissionais sobre a importância do preenchimento dos instrumentos base dos sistemas de informação. / Dengue is a viral disease that presents itself as an important public health problem worldwide. All suspected or confirmed case of dengue should be notified in the Notifiable Hazards Information System (Sistema de Informação de Agravos de Notificação – SINAN). Data included in this system represent an important source of information for epidemiological studies and for the evaluation of quality. This study aimed to analyze the quality of reports of dengue reported in SINAN, referring to the epidemic occurred in 2010 in the city of Juiz de Fora - MG. This is a descriptive epidemiological study whose data were obtained from SINAN, provided by the Environmental and Epidemiological Surveillance Department of Juiz de Fora. The analysis included the variables sex, age range, address, race/skin color, schooling, probable source of infection acquisition, laboratory and clinical and epidemiological data, as well as the completeness, timely closure of the recorded cases, duplicity and consistency of the data. Of the 9396 dengue cases notified in Juiz de Fora, 62.9% were classified as Classical Dengue, 0,9% as Dengue with Complications, 0,1% as Dengue Hemorrhagic Fever, 0.04% as Dengue Shock Syndrome, 4.9% were discarded, 30.8% inconclusive, 0.3% cases ignored / blank and 0.2% of the total of reported cases died. Most cases occurred in healthy adults aged 32 to 59 years, of the female sex, living in the urban area, of the white race, with complete/incomplete fundamental education, and autochthonous from the municipality. Completeness was poor for most fields, except for those to be compulsorily completed, which were classified as excellent. No notifications in duplicity were found, and 95.88% of the cases were timely closed. Consistency was classified as excellent. The analyzes performed in this study provided important information for understanding the epidemiology of dengue in Juiz de Fora, thus creating a better parameters for directing the activities of surveillance and disease control. It was showed a worrying amount of variables in white / ignored, pointing to the need for training of professionals about the importance of filling the information systems´s instruments based.