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Structure, Function and Evolution of Filamentous Fungal Telomerase RNA

January 2011 (has links)
abstract: Telomerase ribonucleoprotein is a unique reverse transcriptase that adds telomeric DNA repeats to chromosome ends. Telomerase RNA (TER) is extremely divergent in size, sequence and has to date only been identified in vertebrate, yeast, ciliate and plant species. Herein, the identification and characterization of TERs from an evolutionarily distinct group, filamentous fungi, is presented. Based on phylogenetic analysis of 69 TER sequences and mutagenesis analysis of in vitro reconstituted Neurospora telomerase, we discovered a conserved functional core in filamentous fungal TERs sharing homologous structural features with vertebrate TERs. This core contains the template-pseudoknot and P6/P6.1 domains, essential for enzymatic activity, which retain function in trans. The in vitro reconstituted Neurospora telomerase is highly processive, synthesizing canonical TTAGGG repeats. Similar to Schizosaccharomycetes pombe, filamentous fungal TERs utilize the spliceosomal splicing machinery for 3' processing. Neurospora telomerase, while associating with the Est1 protein in vivo, does not bind homologous Ku or Sm proteins found in both budding and fission yeast telomerase holoenzyme, suggesting a unique biogenesis pathway. The development of Neurospora as a model organism to study telomeres and telomerase may shed light upon the evolution of the canonical TTAGGG telomeric repeat and telomerase processivity within fungal species. / Dissertation/Thesis / Ph.D. Biochemistry 2011
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Produção de xilanase por fungos filamentosos isolados de solo de área de caatinga

Simões, Maria Lúcia Garcia [UNESP] 28 July 2006 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-07-28Bitstream added on 2014-06-13T19:56:06Z : No. of bitstreams: 1 simoes_mlg_me_rcla.pdf: 924529 bytes, checksum: 4fd62ec448289172b02333ca84efaa63 (MD5) / Neste estudo, foram isoladas 67 linhagens de fungos filamentosos de solo de área de caatinga, sendo as coletas efetuadas em períodos seco e chuvoso, com o objetivo de se conhecer a biodiversidade deste bioma não explorado e avaliar o potencial destes fungos na produção de xilanase. Algumas linhagens não foram identificadas por inexistência de metodologias específicas e outras foram identificadas através de métodos microscópicos e bioquímicos. Foi efetuada uma triagem dos fungos potencialmente produtores desta enzima em meio de Vogel contendo xilano 1% como única fonte de carbono e avaliou-se através do Método Turbidimétrico Automatizado (Bioscreen-C), a melhor fonte de carbono para crescimento dos fungos selecionados. Os resultados obtidos nos cultivos em MFS, foram inexpressivos quando comparados aos obtidos em MFT. Os melhores produtores de xilanase em MFT foram cultivados em meio líquido de Vogel e MFT com adição individual de outras fontes de carbono a 1% (carbometilcelulose- CMC, xilano e a melhor fonte de carbono para crescimento, determinada pelo Bioscreen-C) em temperaturas apropriadas, pH 5, por 5 dias, inóculo de 1 x 107 esporos/mL. O CMC causou repressão catabólica na síntese de xilanase por estes fungos tendo a adição do xilano apresentado o mesmo efeito, com exceção de Trichoderma viride, que teve sua atividade aumentada para 143,0 U/mL e Aspergillus niger 11 que teve sua atividade aumentada de 33,4 U/mL para 57,1 U/mL. / In this study, 67 strains of filamentous fungi were isolated from caatinga area, the collections were performed during the dry and rainy period, aiming to know the biodiversity of this not explored bioma and to evaluate the potential of these fungi to produce xylanase. Some of the strains were not identified due to the lack of specific methodologies and others were identified through microscopic and biochemical methods. A selection of the fungi which were considered potentially producers of xylanase was carried out in Voguel medium containing 1% of xylan as an only carbon source, and through a Automatized Turbidimetric Method (Bioscreen - C) the best carbon source for the fungi growth was evaluated. The results obtained in SBM were not expressive when compared to the ones obtained in WBM. The best xylanase producers in WBM were cultivated in Voguel liquid medium and WBM adding individually other carbon sources at 1% (carboxymethylcellulose -CMC; xylan; and the best growth carbon source determined by Bioscreen-C) at appropriated temperatures, pH 5,0 ; for 5 days, and a spore concentration of 1 x107 spores/mL. The CMC addition caused catabolic repression in xylanase production by these fungi, xylan addition showed the same effect, but Trichoderma viride 13 and Aspergillus niger 11 which have their activities increased from 39,21 U/mL to 143,0 U/mL and from 33,4 U/mL to 57,1 U/mL, respectively.
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Método simples e rápido para seleção de fungos filamentosos produtores de compostos absorvedores de radiação UV para aplicação em protetores solares / Simple and fast method for selection of filamentous fungi producers of UV absorbing compounds for use in sunscreens

Andrade, Michelle de 07 April 2016 (has links)
Foram estudadas trinta e uma cepas fúngicas não identificadas, as quais foram denominadasX1 a X31. O potencial fotoprotetor foi avaliado pela medida espectrofotométrica da absorçãodos extratos na região do UV (280-400 nm). Os extratos com os melhores perfis de absorção em cultura estacionária foram X1, X2, X6, X12, X13, X18, X19, X22, X24 e X31 e, em cultura agitada X4 e X17. A reprodutibilidade do processo foi avaliada e as cepas fúngicas que apresentaram coeficiente de variação menor que 15% foram selecionadas para o estudo de fotoestabilidade. A fotoestabilidade dos extratos foi avaliada pela medida da viabilidade celular de fibroblastos L929 tratados com extratos previamente irradiados sob radiação UVA (11,2 J/cm2) e UVB (3,43 J/cm2) e extratos não irradiados, bem como, pela comparação das áreas sob as curvas de absorção na região do UV dos extratos irradiados e não irradiados. Os extratos selecionados para o estudo de fotoestabilidade foram X4, X12, X19, X22, X24 e X31. Os extratos não irradiados apresentaram os seguintes valores deIC50 para viabilidade celular (citotoxidade): X4-130µg/ml, X19-20µg/ml, X22-10 µg/ml e X24-60µg/ml. Após a radiação UVA e UVB, os extratos apresentaram redução significativa da viabilidade celular em relação ao IC50 dos extratos não irradiados. Sob luz UVB, os extratos X12 (IC50 35µg/ml) e X31 (IC50 70µg/ml) mantiveram a mesma porcentagem de redução da viabilidade celular quando comparado ao IC50 dos extratos não irradiados. No entanto após exposição à luz UVA, o extrato X12 aumentou a viabilidade celular de 50% (quando não irradiado) para 75% (irradiado). Enquanto que o extrato X31, mesmo após a radiação UVA, manteve a mesma redução de 50% da viabilidade celular. Nessa etapa os extratos selecionados foram os X12 e X31. O espectro de absorção na região do UV obtido para o extrato X12 mostrou uma redução da absorbância de 28,3% sob radiação UVB e de 60% sob radiação UVA em relação ao extrato não irradiado. O extrato X31 apresentou uma redução da absorbância de 17,6% e30% sob radiação UVB e UVA respectivamente, em relação ao extrato não irradiado. Os fungos selecionados foram identificados por PCR, sugerindo que o fungo X12 seja o Aspergillus terreus e o X31 seja o Talaromyces pinophilus. Por fim, foi feita a identificação da substância ativa do extrato X12 empregando a técnica de desreplicação, a qual fez o uso da instrumentação analítica acoplada UHPLC-DAD-(ESI)-HRMS associada ao banco de dados Chapman& Hall\'s Dictionary of Natural Products (DNP). No extrato X12 o composto majoritário foi identificado como sendo a citreoviridina. Assim, os resultados do presente trabalho permitiu estabelecer um procedimento para a seleção de fungos produtores de compostos absorvedores de radiação UV, que poderia ser aplicado na obtenção de novos filtros orgânicos naturais para protetores solares. / It were studied thirty-one fungal strains not identified, which were named X1 to X31. The photoprotective potential was assessed spectrophotometrically by measuring absorption of the extract in the UV region (280-400 nm). The extracts that presented the best absorption profiles in stationary culture were X1, X2, X6, X12, X13, X18, X19, X22, X24 and X31, and X4 and X17 in stirred culture. The reproducibility of the process was evaluated and fungal strains that showed a coefficient of variation lower than 15% were selected for the study of photostability. The photostability of the extracts was assessed by measuring cell viability of L929 fibroblasts treated with extracts previously irradiated under UVA light (11,2 J/cm2) and UVB (3,43 J/cm2) and not irradiated extracts, as well as by comparison of the areas under the curves of absorption in the UV region of the irradiated and non-irradiated extracts. The extracts selected for the study of photostability were X4, X12, X19, X22, X24 and X31. The non-irradiated extracts showed the following IC50 values for cell viability (cytotoxicity): X4- 130?g/ml X19-20?g/ml, X22-10/ml and X24-60?g/ml. After UVA and UVB radiation, the extracts showed significant reduction in cell viability compared to the IC50 of the unirradiated extracts. Under UVB light, the X12 extracts (IC50 35?g/ml) and X31 (IC50 70mg/ml) maintained the same percentage of cell viability reduction when compared to the IC50 of the unirradiated extracts. However after exposure to UVA light, X12 extract increased the cell viability from 50% (when not irradiated) to 75% (irradiated). While X31 extract even after the UVA irradiation, remained the same 50% of reduction in cell viability. At this stage the selected extracts were X12 and X31. The absorption spectrum in the UV region obtained for X12 extract showed a decrease in absorbance of 28.3% under UVB and 60% under UVA radiation relative to non-irradiated extract. The X31extract showed a reduction in absorbance of 17.6% and 30% in UVA and UVB radiation, respectively, compared to non-irradiated extract. The selected fungi were identified by PCR, suggesting that X12 fungus is Aspergillus terreus and X31 is the Talaromyces pinophilus. Finally it was identified the active substance of X12 extract employing dereplication technique which makes use of coupled analytical instrumentation UHPLC-DAD- (ESI) HRMS associated to the Chapman and Hall\'s Dictionary of Natural Products (DNP) database. The majority compound of X12 extract was identified as the citreoviridin. Thus, the results of this study allowed us to establish a procedure for the selection of producers of UV absorbing compounds from fungi, which could be applied in obtaining new natural organic filters for sunscreens.
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Produção de β-D-frutofuranosidases pelo fungo filamentoso Aspergillus niveus através de fermentação em estado sólido, purificação e caracterização bioquímica /

Fernandes, Maysa Lima Parente. January 2016 (has links)
Orientador: Luis Henrique Souza Guimarães / Banca: Saulo Santesso Garrido / Banca: Hamilton Cabral / Resumo: As invertases ou β-D-frutofuranosidases (EC 3.2.1.26) são responsáveis pela produção da mistura equimolar de glicose e frutose, conhecida como açúcar invertido, através da hidrólise da ligação β 2-1 da molécula de sacarose. Essa mistura apresenta sabor mais doce que a sacarose e é destinada à diversos fins na indústria alimentícia (doces, xaropes, leite condensado e bebidas). É importante destacar que o produto obtido por hidrólise enzimática é bastante superior ao obtido por hidrólise ácida. A hidrólise catalisada pela enzima β-D-frutofuranosidase produz um xarope de alta qualidade com ausência de hidroximetilfurfural e sem desenvolvimento de cor. Diante do interesse industrial e biotecnológico, e das diversas aplicações dessa enzima, o objetivo deste trabalho foi investigar a produção de β-D-frutofuranosidase extracelular pelo fungo filamentoso Aspergillus niveus através de Fermentação em Estado Sólido (FES) purificando-a e caracterizando-a bioquimicamente. Entre os substratos testados em FES, a maior produção β-D-frutofuranosidásica foi obtida em casca de mandioca, com granulometria de 10 mesh, umidificada na proporção de 1:1 com água de torneira, a uma temperatura de 30ºC com umidade relativa de 30%, por um período de 9 dias de incubação. A β-D-frutofuranosidase extracelular obtida em FES foi purificada 6,53 vezes com recuperação de 5,27%, obtendo-se em SDS-PAGE 8% uma única banda protéica (37 kDa), e massa molecular nativa de 91,2 kDa estimada por Sepharose CL-6B. A temp... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The invertases or β-D-fructofuranosidases (EC 3.2.1.26) are responsible for the production of an equimolar mixture of glucose and fructose, known as invert sugar, by hydrolysis of β 2-1 bond of the sucrose molecule. This mixture is sweeter than sucrose and is intended for various purposes in the food industry (sweets, syrup, condensed milk and drinks). It is important to note that the product obtained by enzymatic hydrolysis is much higher than that obtained by acid hydrolysis. The hydrolysis catalyzed by β-D-fructofuranosidase enzyme produces a high-quality syrup without hydroxymethylfurfural and color development. Before the industrial and biotechnological interest, and the various applications of this enzyme, the aim of this study was to investigate the production of the extracellular β-D-fructofuranosidase by filamentous fungus Aspergillus niveus under Solid Fermentation State (SSF) purifying it and characterizing it biochemically. Among the substrates tested in the SSF, the highest yield of β-D-fructofuranosidase was obtained in cassava hulls with a particle size of 10 mesh, humidified in the ratio 1:1 with tap water and maintained at 30°C with a relative humidity of 30%, for 9 days of incubation. The extracellular β-Dfructofuranosidase obtained in SSF was purified 6.53-folds with a recovery of 5.27%. A single protein band (37 kDa) was obtained in 8% SDS-PAGE and the native molecular mass was estimated as 91.2 kDa by Sepharose CL-6B. The optimum temperature and pH for ac... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Purificação e caracterização bioquímica da invertase extracelular produzida pelo fungo filamentoso Aspergillus terreus

Giraldo, Marielle Aleixo [UNESP] 09 May 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:04Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-05-09Bitstream added on 2014-06-13T20:10:32Z : No. of bitstreams: 1 giraldo_ma_me_araiq.pdf: 658373 bytes, checksum: 20a8019dced41467e4d92b76d704ce76 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os microrganismos, de modo especial os fungos filamentosos, possuem papel fundamental na decomposição de matéria orgânica, sendo interessantes como modelos para realização de diferentes estudos biológicos. Além disso, são de fácil manejo e as condições de cultivo podem ser facilmente adaptadas em laboratório. Outra vantagem é, geralmente, o baixo custo e o fácil acesso aos nutrientes necessários para o crescimento dos mesmos. Entre os microrganismos, os fungos filamentosos têm se destacado na obtenção de enzimas de interesse biotecnológico, como é o caso das invertases, as quais podem ser empregadas nas indústrias de alimentos e bebidas. As invertases (EC 3.2.1.26) são hidrolases que podem ser encontradas em uma grande variedade de organismos, realizando a hidrólise da ligação - D-frutofuranosídica, agindo sobre a sacarose, gerando como produtos D-glicose e D-frutose, em quantidades equimolares. Essa mistura é conhecida como açúcar invertido e é geralmente utilizada pelas indústrias de alimentos. Desta maneira, o objetivo deste trabalho foi estudar a produção de invertase extracelular pelo fungo filamentoso Aspergillus terreus, em fermentação submersa e em fermentação em substrato sólido, bem como purificar e caracterizar a enzima bioquimicamente. Entre os diversos meios de cultura testados em FSbm, a maior produção invertásica foi obtida em meio M5 mantido em agitação orbital (100 rpm) a uma temperatura de 30ºC, por um período de 48 horas de incubação. Já na FSS, o melhor período de incubação foi de 72 horas, também a 30ºC. Entre todas as fontes de carbono testadas, a maior produção invertásica foi obtida utilizandose farinha de centeio para a FSbm e soja moída para FSS. A enzima iv extracelular obtida em FSbm foi purificada 139 vezes com uma recuperação de 11%. A invertase extracelular... / The microorganisms, especially filamentous fungi, have a fundamental role in the decomposition of organic matter, and they are interesting as models for carrying out different biological studies. Moreover, they are easy to handle, and their growing conditions can be easily adapted in the laboratory. Another advantage is, generally, the low cost and easy access to the nutrients needed for their growth. Among the microorganisms, filamentous fungi have been essential in obtaining enzymes of biotechnological interest, such as invertase, which may be employed in the food and beverage industries. The invertases (EC 3.2.1.26) are hydrolases that can be found in a great variety of organisms, performing the hydrolysis of the -D fructofuranosidic bond acting on sucrose, generating products such as D-glucose and D-fructose, in equimolar amounts. This mixture is known as inverted sugar and it is commonly used by food industries. This way, the aim of this work was to study the production of extracellular invertase by the filamentous fungus Aspergillus terreus in submerged fermentation and solid state fermentation, as well as its purification and biochemical characterization. Among the various media tested in FSbm, the highest yield of invertase was obtained by using M5 medium under orbital agitation (100 rpm) at 30°C for 48 hours of incubation. In the FSS, the best incubation period was 72 hours, also at 30°C. Among all carbon sources tested, the highest invertase production was obtained using rye flour for FSbm and soybean meal for FSS. The extracellular enzyme obtained from FSbm was purified 139 fold with 11% recovery. The extracellular invertase of A. terreus is a heterodimer of native vi molecular mass of 74.67 kDa consisting of two subunits, one of 46.77 kDa and another of 26.92 kDa determined... (Complete abstract click electronic access below)
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Prospecção de enzimas de degradação de materials vegetal em fungos endofíticos

Marques, Natália Paganini [UNESP] 16 August 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-08-16Bitstream added on 2014-06-13T19:08:55Z : No. of bitstreams: 1 marques_np_me_araiq_parcial.pdf: 117061 bytes, checksum: 111016526ed0a98902d9d6c8b01f9d3b (MD5) Bitstreams deleted on 2015-06-22T12:53:53Z: marques_np_me_araiq_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-22T12:54:47Z : No. of bitstreams: 1 000721712_20150917.pdf: 105117 bytes, checksum: bd9855c12b3ec4afdcb5547ce783e4e6 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-09-17T16:31:32Z: 000721712_20150917.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T16:32:27Z : No. of bitstreams: 1 000721712.pdf: 835904 bytes, checksum: fd7bf1792a2e5436543d83a39fa9040f (MD5) / Os fungos filamentosos são conhecidos por sua notável capacidade de produção de enzimas, particularmente as de degradação de material vegetal. O campo de aplicações industriais destas enzimas tem crescido consideravelmente, especialmente em relação às celulases, que tem sido extensivamente estudadas visando à sacarificação da celulose para a obtenção de etanol de segunda geração. Os fungos endofíticos estão entre os potenciais produtores de enzimas de degradação de material vegetal, são pouco estudados neste sentido e, uma vez que colonizam os tecidos vegetais, suas enzimas devem apresentar características interessantes do ponto de vista do ataque aos componentes da parede celular. Dentro deste contexto, o presente estudo teve por finalidade a prospecção de celulases, xilanases, pectinases e amilases entre fungos endofíticos, bem como estudos da produção e das características das enzimas. Inicialmente, 14 fungos endofíticos foram cultivados por fermentação estado sólido (FES) em bagaço de cana-de-açúcar e farelo de trigo (1:1 m/m), durante 7 dias, a 28 °C. Nesta etapa, 8 fungos se destacaram na produção de celulases e foram posteriormente cultivados, em FES, em outras misturas de substratos lignocelulósicos. Os isolados Botryosphaeria sp. AM01 e Saccharicola sp. EJC04 foram os mais versáteis em relação à produção das enzimas em diferentes meios, sendo selecionados para dar continuidade ao trabalho. A partir desta etapa foram focadas as produções de celulases e xilanases, visando à aplicação destas enzimas em trabalhos futuros envolvendo a sacarificação de materiais lignocelulósicos. O substrato selecionado foi composto por farelo de algodão e farelo de trigo e a influência do tempo de cultivo, da concentração de inóculo e da umidade inicial do substrato foram avaliadas, pelo cultivo em... / Filamentous fungi are known for their remarkable ability for enzymes production, particularly those for plant material degradation. The field of industrial applications of these enzymes has increased considerably, particularly regarding to cellulases which have been extensively studied for cellulose saccharification aiming the production of second generation ethanol. Endophytic fungi are among the potential producers of enzymes for plant material degradation. They are underexplored in this sense and, once they colonize the plant tissues. Their enzymes should present interesting features from the point of view of the attack to the cell wall components. In this context, the present study had as purpose the prospecting of cellulases, xylanases, pectinases and amylases among endophytic fungi, as well as studies of the enzymes production and characteristics. As an initial evaluation of enzymes production, 14 endophytic fungi were cultivated under solid state fermentation (SSF) in sugar cane bagasse and wheat bran (1:1 w/w), for 7 days, at 28 ºC. In this phase, 8 fungi stood out and were subsequently cultivated by SSF, in other mixtures of lignocellulosic substrates. The isolates Botryosphaeria sp. AM01 and Saccharicola sp. EJC04 were the most versatile in relation to enzymes production on different substrates and were selected to continue the work. From this stage on the productions of cellulases and xylanases were focused, aiming the application of these enzymes in future studies involving the saccharification of lignocellulosic materials. The selected substrate was composed by cotton bran and wheat bran and the influence of cultivation time, concentration of inoculum and substrate initial moisture were evaluated, by FES.For almost all the enzymes produced by the two fungi, the peak of production occurred in 192h or... (Complete abstract click electronic access below)
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Prospecção de enzimas de degradação de materials vegetal em fungos endofíticos /

Marques, Natália Paganini. January 2013 (has links)
Orientador: Daniela Alonso Bocchini Martins / Banca: Hamilton Cabral / Banca: Luis Henrique Souza Guimarães / Resumo: Os fungos filamentosos são conhecidos por sua notável capacidade de produção de enzimas, particularmente as de degradação de material vegetal. O campo de aplicações industriais destas enzimas tem crescido consideravelmente, especialmente em relação às celulases, que tem sido extensivamente estudadas visando à sacarificação da celulose para a obtenção de etanol de segunda geração. Os fungos endofíticos estão entre os potenciais produtores de enzimas de degradação de material vegetal, são pouco estudados neste sentido e, uma vez que colonizam os tecidos vegetais, suas enzimas devem apresentar características interessantes do ponto de vista do ataque aos componentes da parede celular. Dentro deste contexto, o presente estudo teve por finalidade a prospecção de celulases, xilanases, pectinases e amilases entre fungos endofíticos, bem como estudos da produção e das características das enzimas. Inicialmente, 14 fungos endofíticos foram cultivados por fermentação estado sólido (FES) em bagaço de cana-de-açúcar e farelo de trigo (1:1 m/m), durante 7 dias, a 28 °C. Nesta etapa, 8 fungos se destacaram na produção de celulases e foram posteriormente cultivados, em FES, em outras misturas de substratos lignocelulósicos. Os isolados Botryosphaeria sp. AM01 e Saccharicola sp. EJC04 foram os mais versáteis em relação à produção das enzimas em diferentes meios, sendo selecionados para dar continuidade ao trabalho. A partir desta etapa foram focadas as produções de celulases e xilanases, visando à aplicação destas enzimas em trabalhos futuros envolvendo a sacarificação de materiais lignocelulósicos. O substrato selecionado foi composto por farelo de algodão e farelo de trigo e a influência do tempo de cultivo, da concentração de inóculo e da umidade inicial do substrato foram avaliadas, pelo cultivo em... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Filamentous fungi are known for their remarkable ability for enzymes production, particularly those for plant material degradation. The field of industrial applications of these enzymes has increased considerably, particularly regarding to cellulases which have been extensively studied for cellulose saccharification aiming the production of second generation ethanol. Endophytic fungi are among the potential producers of enzymes for plant material degradation. They are underexplored in this sense and, once they colonize the plant tissues. Their enzymes should present interesting features from the point of view of the attack to the cell wall components. In this context, the present study had as purpose the prospecting of cellulases, xylanases, pectinases and amylases among endophytic fungi, as well as studies of the enzymes production and characteristics. As an initial evaluation of enzymes production, 14 endophytic fungi were cultivated under solid state fermentation (SSF) in sugar cane bagasse and wheat bran (1:1 w/w), for 7 days, at 28 ºC. In this phase, 8 fungi stood out and were subsequently cultivated by SSF, in other mixtures of lignocellulosic substrates. The isolates Botryosphaeria sp. AM01 and Saccharicola sp. EJC04 were the most versatile in relation to enzymes production on different substrates and were selected to continue the work. From this stage on the productions of cellulases and xylanases were focused, aiming the application of these enzymes in future studies involving the saccharification of lignocellulosic materials. The selected substrate was composed by cotton bran and wheat bran and the influence of cultivation time, concentration of inoculum and substrate initial moisture were evaluated, by FES.For almost all the enzymes produced by the two fungi, the peak of production occurred in 192h or... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Produção de xilanase por fungos filamentosos isolados de solo de área de caatinga /

Simões, Maria Lúcia Garcia. January 2006 (has links)
Orientador: Sâmia Maria Tauk Tornisielo / Banca: Jonas Contiero / Banca: Luis Henrique Souza Guimarães / Resumo: Neste estudo, foram isoladas 67 linhagens de fungos filamentosos de solo de área de caatinga, sendo as coletas efetuadas em períodos seco e chuvoso, com o objetivo de se conhecer a biodiversidade deste bioma não explorado e avaliar o potencial destes fungos na produção de xilanase. Algumas linhagens não foram identificadas por inexistência de metodologias específicas e outras foram identificadas através de métodos microscópicos e bioquímicos. Foi efetuada uma triagem dos fungos potencialmente produtores desta enzima em meio de Vogel contendo xilano 1% como única fonte de carbono e avaliou-se através do Método Turbidimétrico Automatizado (Bioscreen-C), a melhor fonte de carbono para crescimento dos fungos selecionados. Os resultados obtidos nos cultivos em MFS, foram inexpressivos quando comparados aos obtidos em MFT. Os melhores produtores de xilanase em MFT foram cultivados em meio líquido de Vogel e MFT com adição individual de outras fontes de carbono a 1% (carbometilcelulose- CMC, xilano e a melhor fonte de carbono para crescimento, determinada pelo Bioscreen-C) em temperaturas apropriadas, pH 5, por 5 dias, inóculo de 1 x 107 esporos/mL. O CMC causou repressão catabólica na síntese de xilanase por estes fungos tendo a adição do xilano apresentado o mesmo efeito, com exceção de Trichoderma viride, que teve sua atividade aumentada para 143,0 U/mL e Aspergillus niger 11 que teve sua atividade aumentada de 33,4 U/mL para 57,1 U/mL / Abstract: In this study, 67 strains of filamentous fungi were isolated from caatinga area, the collections were performed during the dry and rainy period, aiming to know the biodiversity of this not explored bioma and to evaluate the potential of these fungi to produce xylanase. Some of the strains were not identified due to the lack of specific methodologies and others were identified through microscopic and biochemical methods. A selection of the fungi which were considered potentially producers of xylanase was carried out in Voguel medium containing 1% of xylan as an only carbon source, and through a Automatized Turbidimetric Method (Bioscreen - C) the best carbon source for the fungi growth was evaluated. The results obtained in SBM were not expressive when compared to the ones obtained in WBM. The best xylanase producers in WBM were cultivated in Voguel liquid medium and WBM adding individually other carbon sources at 1% (carboxymethylcellulose -CMC; xylan; and the best growth carbon source determined by Bioscreen-C) at appropriated temperatures, pH 5,0 ; for 5 days, and a spore concentration of 1 x107 spores/mL. The CMC addition caused catabolic repression in xylanase production by these fungi, xylan addition showed the same effect, but Trichoderma viride 13 and Aspergillus niger 11 which have their activities increased from 39,21 U/mL to 143,0 U/mL and from 33,4 U/mL to 57,1 U/mL, respectively / Mestre
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Aplicação do modelo microbiano do metabolismo animal ao estudo da biotransformação de um potencial agente anti-hipertensivo / Application of microbial metalism animal model to study the biotransformation a potential agent anti-hipertensiv

Guimarães, Telma de Matos 27 May 2013 (has links)
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-11-20T12:15:35Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Telma Matos Guimaraes - 2013.pdf: 3613198 bytes, checksum: 0db69968e4da150a386327dd2a7a8213 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-11-20T12:16:24Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Telma Matos Guimaraes - 2013.pdf: 3613198 bytes, checksum: 0db69968e4da150a386327dd2a7a8213 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-20T12:16:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Telma Matos Guimaraes - 2013.pdf: 3613198 bytes, checksum: 0db69968e4da150a386327dd2a7a8213 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-05-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The " Microbial Models of Mammalian Metabolism" using filamentous fungi be used to study the biotransformation as an alternative to identify and product mammalian metabolites, with the goal of evaluate the profile of biotransformation of LASSBio 897, this This model was appliedto 3-thyenilidine-3,4-methylenedioxybenzoylhydrazide (LASSBio-897), a potential antihypertensive agent. The fungi Aspergillus alliaceus NRRL315, Beauveria bassiana ATCC 7159, Cunninghamella echinulata ATCC9244, NRRL1757 and Mortierela isabelina NRRL 1757 e Muccor plumbeus ATCC4740 were selected for the biotransformation LASSBio-897. The biotransformation was carried outin culture medium PDSM and Corn Steep at two different concentration sof the substrate.The monitoring of there action kinetics was done by methods thin layer chromatography (TLC) and high performance liquid chromatography(HPLC), separation and purification of the formed products was performed by colun chromatography (CC). Nuclear magnetic resonance (RMN) methods, mass spectrometry and spectroscopyin the region of Infrared (IR) assisted in the elucidation of the structure of the biotransformation products of LASSBio 897. We identified four metabolites in the reaction mixture and, based on information obtained by MS and NMR was proposed structure of 3-tienilidena-3,4-dihydroxybenzoilidrazine (Met. I), 1,3-benzodioxol-5-carboxamide (Met. II), 1, 3-benzodioxol acid (Met. III) and sulfoxide (Met. IV); A simultaneous study of the pharmacokinetics of LASSBio 897 in healthy Beagle dog indicated the presence of MET.I and II in dog serum confirming the importance of applying this model.to obtain metabolites mamalia. / O ―Modelo Microbiano do Metabolismo Animal‖ utilizando fungos filamentosos, pode ser usado para estudos de biotransformação como forma alternativa para identificar e produzir metabólitos de mamíferos. Com o objetivo de avaliar o perfil de biotransformação do LASSBio 897, esse modelo foi aplicado a 3-tienilidina-3,4- metilenedioxibenzoilidrazida (LASSBio-897), um potencial agente anti-hipertensivo. Os fungos Aspergillus alliaceus NRRL 315, Beauveria bassiana ATCC 7159, Cunninghamella echinulata ATCC 9244, Mortierela isabelina NRRL 1757 e Muccor plumbeus ATCC4740 foram selecionados. A biotransformação foi realizada nos meios de cultura PDSM e Corn Steep em duas concentrações diferentes. O monitoramento das cinéticas reacionais foi feito por Cromatografia em Camada Delgada (CCD) e Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE), a separação e purificação dos produtos formados foi realizada por Cromatografia em Coluna (CC). Métodos de ressonância nuclear magnética (RMN), Espectrometria de Massas (EM) e Espectroscopia na região do Infravermelho (IV) auxiliaram na elucidação da estrutura dos compostos obtidos pela biotransformação do LASSBio 897. Quatro metabólitos foram identificados na mistura reacional, com base em informações obtidas por MS e RMN foram propostas as estruturas 3,4-tielidina diidroxibenzoilidrazina (Met. I); 1,3-benzodioxol-5-carboxiamida (Met. II); ácido 1,3-benzodioxóico (Met. III) e sulfóxido (Met. IV). Um estudo simultâneo de farmacocinética do LASSBio 897 em cão saudável da raça Beagle indicou a presença do Met. I e do Met. II no soro do animal. Confirmando a importância da aplicação deste modelo para obtenção de metabólitos de maíferos.
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Utilização de resíduos vegetais para a produção de biossurfactantes por fungos isolados de amostras de solo da região amazônica

Sanches, Michele Alves 15 March 2016 (has links)
Submitted by Sáboia Nágila (nagila.saboia01@gmail.com) on 2016-07-29T14:48:25Z No. of bitstreams: 1 Dissertação-Michele Alves Sanches.pdf: 930400 bytes, checksum: 3b455ac91457a2d15e86539fbdc9d3e3 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-08-26T13:29:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação-Michele Alves Sanches.pdf: 930400 bytes, checksum: 3b455ac91457a2d15e86539fbdc9d3e3 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-08-26T13:32:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação-Michele Alves Sanches.pdf: 930400 bytes, checksum: 3b455ac91457a2d15e86539fbdc9d3e3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-26T13:32:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação-Michele Alves Sanches.pdf: 930400 bytes, checksum: 3b455ac91457a2d15e86539fbdc9d3e3 (MD5) Previous issue date: 2016-03-15 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O homem tem a necessidade de misturar a água com substâncias insolúveis em suas atividades diárias e industriais. Os surfactantes, derivados de petróleo, têm sido utilizados com essa finalidade, no entanto, esses apresentam problemas quanto a sua toxicidade e biodegradabilidade. Os biossurfactantes de origem microbiana são uma alternativa para essa situação, porém, o seu custo de produção é alto, e em parte, devido aos substratos que são utilizados nos bioprocessos. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi investigar a utilização de resíduos como substrato para produção de biossurfactantes por fungos filamentosos isolados de amostras de solo da região Amazônica. Foram realizados bioprocessos com cinco isolados fúngicos sabidamente produtores de biossurfactantes, com a finalidade de investigar qual deles produziria em menor tempo. Em seguida, foi avaliada a possibilidade de utilização de resíduos (cascas de tucumã, pupunha, banana, cupuaçu e também o óleo pós-fritura) como subtrato para o bioprocesso com o isolado selecionado. Os fatores que influenciam na produção do biossurfactante foram avaliados por planejamento fatorial. O fungo Fusarium oxysporum 87-2LIVI produziu altos níveis de biossurfactantes em três dias de bioprocesso. E também se destacou devido a alta produção de biossurfactante utilizando a casca de pupunha como substrato. O pH e extrato de levedura foram os fatores mais importantes relacionados a produção de biossurfactante por esse isolado. Desta forma, o presente trabalho demonstrou que isolados da espécie F. oxysporum, isolados de solo Amazônico, são potenciais produtores de surfactantes e que resíduos Amazônicos, em especial casca de pupunha, possui potencial para ser utilizado como substrato. / Human being has the need to mix water with insoluble substances in their daily and industrial activities. Surfactants derived from petroleum have been used for this purpose, however, they have problems such as their toxicity and biodegradability. Biosurfactants from microbial origin are an alternative to this, on the other hand, its production cost is high due to the substrates that are used in the bioprocesses. In this context, the aim of this study was to investigate the use of wastes as a substrate for the production of biosurfactants by filamentous fungi isolated from soil samples in Amazon region. Bioprocess were conducted with five known fungi isolates producers of biosurfactants in order to investigate which of them would produce in a shorter time. Then, we evaluated the possibility using wastes of peel from tucumã, peach palm, banana, cupuacu and also the post-fry oil as substrate for the bioprocess with the selected isolated. Factors that influence the production of biosurfactant were evaluated by factorial design. As a result, the fungus Fusarium oxysporum 87-2LIVI produced high levels of biosurfactants in three days of bioprocess. Moreover, this specie also showed highlight due to high biosurfactant production using peach palm peel as substract. The pH and yeast extract were the most important factors related to production of biosurfactant by this isolated. Thus, the present study showed isolated of F. oxysporum specie from Amazonian soil is potential producer of surfactants and also Amazon waste, particularly, peel of peach palm has the potential to be used as a bioprocess substrate for production of biosurfactant.

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