Made available in DSpace on 2017-07-10T17:36:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_Diss_Monica_Bartira_da_Silva.pdf: 3850308 bytes, checksum: d02468b594802294eb0d5213855959d9 (MD5) Previous issue date: 2013-07-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This study aimed to evaluate the ambience on growth and yield characteristics of cultivars of lettuce in a greenhouse, greenhouse type, with and without screen termorefletora conducted in four seasons (spring, summer, autumn and winter) in an organic system. Four experiments were conducted at the experimental station belonging to the core experimental stations Unioeste, from Marechal Cândido Rondon, PR, in the period 2011/2012. The plants were evaluated for growth characteristics at 0, 10, 20, 30, and 40 days after transplanting and the productive characteristics at harvest. For this we used two experimental designs, one was on the evaluation to the development of the seedlings before transplanting where treatments were arranged in a randomized block design in a split-plot design with three replications, and the portion comprised of four production stations seedlings (spring, summer, autumn and winter), and subplots for lettuce cultivars (Kaiser, Raider Plus, Lucy Brown and Angelina). For the second design, corresponding assessments of plant growth treatments were arranged in a randomized block design in split-split plot design with three replications. The plots consisted of two rooms which are growing greenhouse gases with and without type screen termorefletora, subplots by cultivars of lettuce, and the split the season that culture was located. Each subsubplot comprised of 38 plants. Evaluated throughout the growing season plant height, crown projection, number of leaves, height and stem diameter, total dry matter of roots and shoots, we calculated the rate of crop growth rate, relative growth, net assimilation rate, leaf area ratio, specific leaf area, leaf mass ratio, and the date of collection were also evaluated the number of leaves, diameter and height of the skirt of leaves, fresh weight of shoot, productivity, commercial fresh mass, diameter, height and number of leaves commercial, compact head, incidence of "tip burn". To characterize the growth environment are derived from temperature and relative humidity, evaporation from minitanques and soil temperature. Genotype environment interaction was observed in all evaluations. The best seasons for production of lettuce in the spring and fall, and to cultivate Angelina only recommended for spring. The environment screen termorefletora decreased air temperature at the hottest times of the day, the seasons of spring, summer and fall. The final yield of lettuce was not affected by the use of the screen termorefletora / O presente trabalho teve por objetivo avaliar a ambiência no crescimento e características produtivas de cultivares de alface americana em ambiente protegido, tipo estufa, com e sem tela termorefletora, conduzidas nas quatro estações do ano (primavera, verão, outono e inverno) em sistema orgânico. Foram conduzidos quatro experimentos, na estação experimental pertencente ao núcleo de estações experimentais da Unioeste, do município de Marechal Cândido Rondon-PR, no período de 2011/2012. As plantas foram avaliadas quanto às características de crescimento aos 0, 10, 20, 30, e 40 dias após o transplantio e quanto às características produtivas na colheita. Para isso foi utilizado delineamento de blocos casualizados em esquema de parcelas subsubdivididas, com três repetições. As parcelas foram constituídas de dois ambientes de cultivo sendo estes, ambiente protegido tipo estufa com e sem tela termorefletora, as subparcelas pelas cultivares de alface americana e as subsubparcelas pela estação do ano em que a cultura foi implantada. Cada subsubparcela foi composta por 38 plantas. Avaliou-se ao longo do crescimento da cultura a altura da planta, projeção da copa, números de folhas, altura e diâmetro do caule, massa seca total, das raízes e da parte aérea, foram calculadas a taxa de crescimento da cultura, taxa de crescimento relativo, taxa assimilatória líquida, razão de área foliar, área foliar especifica, razão de massa foliar, e na data da colheita, foram avaliados o número de folhas, diâmetro e altura das folhas da saia, massa fresca da parte aérea, produtividade, massa fresca comercial, diâmetro, altura e número de folhas comercial, compacidade de cabeça e incidência de tip burn . Para a caracterização do ambiente de cultivo foram obtidos os dados de temperatura e umidade relativa do ar, evaporação a partir de minitanques e a temperatura do solo. Foi observado interação genótipo ambiente em todas as avaliações. As melhores estações do ano para a produção da alface foram à primavera e o outono, sendo a cultivar Angelina recomendada apenas para a primavera. O ambiente com tela termorefletora diminuiu a temperatura do ar nos horários mais quentes do dia, nas estações de primavera, verão e outono. A produtividade final da alface não foi afetada pela utilização da tela termorefletora

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-09-11T18:30:24Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CaracterizacaoGenotipicaVirus.pdf: 758796 bytes, checksum: b0da38512afba739aff613a2497d7ba3 (MD5) / Approved for entry into archive by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2017-09-21T14:23:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CaracterizacaoGenotipicaVirus.pdf: 758796 bytes, checksum: b0da38512afba739aff613a2497d7ba3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-21T14:23:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CaracterizacaoGenotipicaVirus.pdf: 758796 bytes, checksum: b0da38512afba739aff613a2497d7ba3 (MD5) Previous issue date: 2013 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O vírus Varicela-zoster (VVZ) pode causar varicela durante a infecção primária, estabelecendo posteriormente uma infecção latente. Na ocorrência de reativação do vírus, pode surgir o herpes zoster. A análise da presença de anticorpos IgG e IgM é fundamental para verificar a prevalência deste vírus na Região Metropolitana de Belém. O estudo de polimorfismos nucleotídicos específicos é utilizado para definir os genótipos do VVZ. A análise das ORFs 22, 38 e 54 permitiu identificar os genótipos do VVZ de acordo com a classificação estabelecida na conferência de 25 de julho de 2008 em Whitechapel, Londres/Reino Unido, em que as cepas de VVZ detectadas e caracterizadas por sequenciamento dos SNPs foram agrupadas em classes de 1 a 5. Avaliar a prevalência de anticorpos e descrever os genótipos circulantes foi o objetivo deste estudo. A frequência de anticorpos IgG e IgM nos casos de varicela foi 68,2% e 48,2%, respectivamente. Os casos de herpes zoster apresentaram prevalência de anti- VVZ IgG e IgM de 87,5% e 12,5%, respectivamente. Os genótipos 1 ou 3 e 5 estavam presentes nas 13 amostras sequenciadas, sendo que a cepa Européia (classe 1 ou 3) foi encontrada em amostras de todos os municípios estudados. A identificação das cepas VVZ circulantes é de extrema importância em virtude da associação de determinados genótipos a quadros clínicos mais severos e para avaliar a implantação da vacina no Programa Nacional de Imunização. / Varicella zoster virus (VZV) can cause chickenpox during primary infection, subsequently establishing a latent infection. In case of reactivation of the virus, the herpes zoster may occur. Analysis of the presence of IgG and IgM is critical to determine the prevalence of this virus in the Metropolitan Region of Belém. The study of specific nucleotide polymorphisms is used to define the genotypes of VZV. Analysis of ORFs 22, 38 and 54 identified genotypes of VZV according to the classification established in conference July 25, 2008 in Whitechapel, London / UK, where the strains of VZV detected and characterized by sequencing of SNPs were grouped into classes 1 through 5. To evaluate the prevalence of antibodies and describe the circulating genotypes was the aim of this study. The frequency of IgM and IgG antibodies in cases of chickenpox was 68.2% and 48.2%, respectively. Cases of herpes zoster showed prevalence of anti-VZV IgG and IgM of 87.5% and 12.5%, respectively. The genotypes 1 or 3 and 5 were present in 13 samples sequenced, and the European strain (class 1 or 3) was found in samples from all the cities studied. The identification of strains circulating VZV is extremely important because of the association of specific genotypes with clinical harshest and to assess the implementation of the vaccine in the National Immunization Program.

As enzimas CYP2D6, CYP2C19 e CYP2C9 são responsáveis pelo metabolismo de aproximadamente metade dos 200 medicamentos mais prescritos nos EUA. Padronizamos ensaios de genotipagem baseados na discriminação alélica com o sistema TaqMan® em 198 indivíduos. Para o gene CYP2D6, os alelos *1 e *2 foram os mais freqüentes, seguidos pelos alelos *4, *41, *35, *17, *5, *10, *6, *29 e *9. Desenvolvemos também uma nova metodologia para a determinação do número de cópias do gene CYP2D6. Para o gene CYP2C19, o alelo *1 foi o mais frequente, seguido pelos alelos *17, *2 e *3. Nosso estudo foi o primeiro a determinar a freqüência alélica do gene CYP2C19 no Brasil. Para o gene CYP2C9, o alelo *1 foi o mais frequente, seguido pelos alelos *2 e *3. Desenvolvemos uma metodologia reprodutível e acessível para a genotipagem dos polimorfismos principais dos genes CYP2D6, CYP2C19 e CYP2C9. A identificação precoce de indivíduos suscetíveis a efeitos adversos, bem como de metabolizadores rápidos pode trazer grandes benefícios aos pacientes possibilitando assim uma medicina personalizada. / The enzymes CYP2D6, CYP2C19 and CYP2C9 metabolize approximately half of the 200 most prescribed drugs in the USA. We standardized genotyping tests based on allelic discrimination, using TaqMan® genotyping system in 198 samples. For the CYP2D6 gene, allele *1 and *2 were the most frequent, followed by alleles *4, *4, *35, *17, *5, *10, *6, *29 and *9. We have also developed a new methodology for determining the copy number variations of the CYP2D6 gene. For the CYP2C19 gene, the allele *1 was the most common, followed by the alleles *17, *2 and *3. In our concern, our study was the first to determine the allele frequency of the CYP2C19 gene in Brazil. For CYP2C9 gene, the allele *1 was the most common followed by the alleles *2 and *3. We developed a methodology reproducible and accessible for genotyping the most important polymorphisms of the genes CYP2D6, CYP2C19 and CYP2C9. The previous identification of individuals at risk to develop adverse drug reactions as well as ultrarapid-metabolizers may bring benefits to the patients, leading to a personalized therapy.

Para poder compreender e descrever o crescimento das plantas forrageiras é necessário ter conhecimento acerca de seus aspectos agronômicos e morfofisiológicos e suas respostas aos fatores edafoclimáticos. O desenvolvimento de ferramentas que viabilizem a racionalização dessas inter-relações é de grande importância para a comunidade científica, ao facilitar a explicação da dinâmica do crescimento, e para o pecuarista dando opções de planejamento e auxílio à tomada de decisão na propriedade pecuária. O objetivo deste trabalho foi avaliar as respostas agronômicas e morfofisiológicas de cinco genótipos de Brachiaria spp. e gerar modelos de crescimento baseados em soma térmica e fotoperíodo além de adaptar o modelo CROPGROForragem, visando explorar esses recursos computacionais para estabelecer uma base racional de manejo desses capins. Foram estudados quatro genótipos de Brachiaria brizantha (Hochst. ex A. Rich.) Stapf (Marandu, Xaraés, Arapoty e Capiporã) e uma de B. decumbens Stapf (cv. Basilisk) colhidos a 15 e 7,5 cm durante onze ciclos distribuídos em um ano. As unidades experimentais (parcelas de 9 x 4 m) foram irrigadas e adubadas com o equivalente a 220 kg ha-1 ano-1 de N e K2O. O delineamento experimental foi de blocos completos casualizados em parcelas subdivididas com quatro repetições. Foi calculada a produção total e estacional de forragem. Foram monitoradas uma rebrotação de verão e de inverno, descrevendo-se a massa do resíduo, o fluxo de tecidos, padrão de acúmulo de forragem e as taxas de fotossíntese foliar dos capins, que foram utilizadas para a simulação da taxa de fotossíntese do dossel. Os capins Capiporã e Xaraés foram mais produtivos durante o verão. No inverno não houve diferença na produção dos genótipos. A altura de corte de 7,5 cm proporcionou maior acúmulo de forragem acima do resíduo para todos os genótipos, sendo que nesse regime de corte as plantas apresentaram as maiores taxas de crescimento em nível de perfilho, expressas pela maior taxa de alongamento e aparecimento de folhas. Além disso, houve maior renovação de perfilhos sob essas condições. Apesar dos capins terem produções diferentes, suas taxas de fotossíntese de dossel, foram semelhantes nas duas alturas de corte dentro de cada estação, sugerindo um mecanismo de compensação entre a área foliar e fotossíntese de folhas individuais. Os modelos de acúmulo de forragem baseados em graus dia (GD) e unidades fototérmicas (UF) se ajustaram bem à produção. O uso da UF mostrou-se efetivo na predição de características produtivas dos capins estudados. O resultado da adaptação do modelo CROPGRO-Forragem sugere que essa é uma ferramenta eficiente para integrar aspectos fisiológicos de B. brizantha e pode ser usado para simular o crescimento com boa exatidão. / In order to understand and describe forage growth knowledge is needed on their agronomical and physiological aspects as well as their responses to soil and climate. Developing tools that enable the rationalization of these relationships is important both under an academic (e.g., in studies of growth dynamics) and a practical (management and decision making in productions systems) standpoints. The objective of this study was to evaluate the agronomic, morphological and physiological responses of five genotypes of Brachiaria spp. and to develop growth models based on thermal sum (growing degree-days, GDD) and daylength (photothermal unit, PU) as well as to adapt the CROPGRO-Forage model, aiming at evaluating the potential of this resources in forage research and production. Four genotypes of Brachiaria brizantha (Hochst. ex A. Rich.) Stapf (Marandu, Xaraés, Arapoty, and Capiporã) and one of B. decumbens Stapf (Basilisk) were harvested at 15 and 7.5 cm over 11 cycles in one year. The experimental units (9 x 4 m plots) were irrigated and fertilized with the equivalent to 220 kg ha-1 yr-1 of N and K2O. The experimental design was a randomized complete block in split-plot with four replications. Total annual and seasonal forage yields were calculated. One mid-summer and one mid-winter regrowths were monitored weekly to describe stubble mass, tissue flow, forage accumulation rate and the rates of leaf photosynthesis, which were used to simulate canopy photosynthesis. Capiporã and Xaraés were more productive during the summer, but in winter there was no difference among genotypes in yield. Clipping at 7.5 cm yielded more forage for all genotypes and under this management, plants showed the highest growth rates at the tiller level, expressed as higher leaf appearance and elongation rates. There was also higher tiller turnover under these conditions. Despite the differences in forage yield among grasses rates of canopy photosynthesis were similar within the two clipping heights within each season, suggesting the operational of a compensatory mechanism between leaf area and photosynthesis per unit of leaf area. The accumulation models based on GDD and PU showed good fit to observed forage production. The PU model was effective in predicting the productivity of Brachiaria grasses. The adaptation of the CROPGRO-Forage model suggests it is an efficient tool to integrate physiological aspects of B. brizantha and can be used to simulate yield with good accuracy.

Made available in DSpace on 2016-12-23T13:23:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Welington Braida Marre -capa.pdf: 12115 bytes, checksum: 57bfb703610f55f86bfd85423038c9c5 (MD5) Previous issue date: 2012-05-25 / O conhecimento de aspectos fenológicos nutricionais é fundamental na melhoria da qualidade e produtividade do cafeeiro. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi determinar o crescimento sazonal e o acúmulo de nutrientes pelo cafeeiro Conilon (Coffea canephora Pierre), com estágios de maturação distintas e o crescimento de grupos de ramos ortotrópicos e plagiotrópicos com diferentes idades, relacionandoos com os fatores climáticos. O experimento foi conduzido de 14/08/2010 a 08/10/2011 em uma lavoura a campo no município de Nova Venécia-ES. O delineamento experimental empregado foi inteiramente ao acaso, com cinco repetições. Foram utilizadas plantas com três anos de idade, cultivadas sob condição de pleno sol, no espaçamento de três metros entre fileiras e um metro entre plantas. A taxa de crescimento dos ramos ortotrópicos e plagiotrópicos do C canephora é diferente entre os genótipos e sofre variação sazonal durante todo o período do ano, influenciada principalmente pelas variações de temperatura do ar. Sob temperaturas mínimas do ar, abaixo de 17,2 ºC, a taxa de crescimento dos ramos de C. canephora é bastante reduzida para maioria dos genótipos estudados. Os ramos plagiotrópicos, com o passar dos meses (especialmente aqueles com café) apresentam menor crescimento vegetativo, quando comparados a ramos mais novos. Genótipos com ciclo de maturação distintos também apresentaram particularidades em cada nutriente absorvido, variando de acordo o período, podendo sugerir que cada genótipo demanda uma quantidade variável de nutriente no mesmo período. Genótipos com ciclo de maturação dos frutos mais prolongados demandam mais nutrientes, com melhor distribuição no ciclo. Sugere-se que o período, em que a maioria dos genótipos de café Conilon demanda mais nutrientes para o crescimento, é entre meado de setembro e a segunda semana de maio. Sugere-se também que as adubações devem ser realizadas em datas diferenciadas para cada tipo de maturação, de acordo com a necessidade do nutriente na formação do fruto / The nutrients phenological aspects knowledge is primordial for a better quality and productivity of the coffee. So, the goal of this project was to determinate the seasonable growth and nutrients accumulation by Conilon coffee (Coffea canephora Pierre), along with different periods of maturation and with the orthotropic and plagiotropic branch growth in distinct ages, as well as relate them to climate factors. The experiment was lead between 08/14/2010 and 10/08/2011 in a agriculture rural field, situated on Nova Venécia, Espírito Santo. The principal set lead used in the experiment was completely random, repeated five times. Plants of three years old were utilized, cultivated under full sunshine conditions, with therr meters between lines and one meter between each plant. The growth rate of orthotropic and plagiotropic branches of C canephora are different between distinct kinds of genotypes and they suffer of a seasonable climate variation during the whole year, influenced especially by air temperature variation. Plagiontropic branches along some months and especially with the fruit (coffee) presented lower vegetative growth, compared to newer branches. Distinct genotypes maturation cycle also presented singularities in each absorbed nutrient, varying according to a certain period of time, suggesting, maybe, that each genotype demand a variable quantity of nutrient at the same period. Longer fruit maturation cycles genotypes demand more nutrients and better redistribute them along the cycle. It is suggested that most of Conilon coffee genotypes demand more growth nutrients between mid-September to the second week of May. It is also suggested that fertilizations must be performed in different periods during the year for each kind of maturation cycle, according to nutrient demand for generating the fruit

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Sheep milk is produced in Brazil mainly in the South and Southeast regions and, because it has a higher content of solids than cow milk, it is usually processed into dairy products, especially cheese and yogurt. In this sense, the reduced number of studies in the area, associated to the lack of scientific information related to dairy products from ovine culture, stimulated the creation of the present study that aims to evaluate the physicochemical composition and to determine and analyze the content of mineral elements and the profile of fatty acids of sheep milk, related to the period of lactation. Two treatments were used: treatment 1 with milk of ½ Laucane blood sheep and treatment 2 with milk of Ile de France x Texel crossbred sheep, which were milked from the 1st to the 10th week of lactation. The progress in the lactation period of ½ blood and crossbred sheep showed an increase in fat content, with 7.37 and 6.47% in the first week passing to 7.54 and 7.62% in the last week, respectively. The values of protein were 4.75% for ½ Laucane blood sheep and 4.97% for Ile de France x Texel crossbred sheep in the beginning of the lactation reaching the tenth week with values of 4.67 and 4.61%, respectively. There is a higher concentration of saturated fatty acids for the Ile de France x Texel crossbred sheep with values oscillating between 67.09 and 74.65%. Regarding the concentrations of mono and polyunsaturated fatty acids, a superiority for ½ Laucane blood sheep was observed, with values of monounsaturated fatty acids ranging from 22.50 to 28.50% and polyunsaturated from 4.52 to 5.20%. The mineral elements Ca, S, P, Mg, K and Na present in ovine milk did not show a pattern of variation during the evaluated lactation period for both genetic groups. The Ca content was higher for the milk of ½ Laucane blood sheep, demonstrating a variation between 131.63 and 218.49 mg/100 mL. The amount of P obtained in ovine milk was lower than that of Ca, where ½ Laucane blood sheep showed higher values, presenting the same behavior that the element Ca. The Na and K content was higher in the milk of ½ Laucane blood sheep, not differing significantly in the fourth and fifth weeks for the two genetic groups evaluated, in the same way that K did not differ in the third week of lactation either. Similar to the other minerals, S and Mg content was lower for Ile de France x Texel crossbred sheep. / O leite de ovelha é produzido no Brasil principalmente nas regiões Sul e Sudeste e, por apresentar maior teor de sólidos do que o leite de vaca, geralmente é processado em derivados lácteos, especialmente queijos e iogurtes. Neste sentido, o reduzido número de trabalhos realizados na área, associado à carência de informações científicas relacionadas aos produtos lácteos oriundos da ovinocultura estimularam a realização do presente trabalho com o objetivo de avaliar a composição físico-química e, determinar e analisar o teor dos elementos minerais e o perfil de ácidos graxos do leite de ovelhas, em relação ao período de lactação. Foram utilizados dois tratamentos, leite de ovelhas ½ sangue Lacaune e o leite de ovelhas cruza Ile de France x Texel, sendo estas ordenhadas da 1ª a 10ª semana de lactação. Com avanço no período de lactação, ovelhas ½ sangue e cruza apresentaram aumento no teor de gordura, com 7,37 e 6,47 % na primeira semana passando a 7,54 e 7,62 % na última semana, respectivamente. Os valores encontrados de proteína foram de 4,75 % para as ovelhas ½ sangue Lacaune e 4,97 % para as cruzas Ile de France x Texel no início da lactação chegando a décima semana com valores de 4,67 e 4,61 %, respectivamente. Há maior concentração de ácidos graxos saturados para as ovelhas cruza Ile de France x Texel com valores oscilando entre 67,09 e 74,65 %. Com relação às concentrações de ácidos graxos mono e poliinsaturados observa-se superioridade para ovelhas ½ sangue Lacaune, com valores de ácidos graxos monoinsaturados variando entre 22,50 a 28,59 % e poliinsaturados de 4,57 a 5,20%. Os elementos minerais Ca, S, P, Mg, K e Na presentes no leite ovino, não apresentaram um padrão de variação durante o período de lactação avaliado para ambos grupos genéticos. O teor de cálcio foi superior para o leite das ovelhas ½ sangue Lacaune, demonstrando uma variação entre 131,63 a 218,49 mg/100mL. A quantidade de P obtida no leite ovino foi menor que a de Ca, onde ovelhas ½ sangue Lacaune apresentaram valores superiores, apresentando o mesmo comportamento que o elemento Ca. O teor de Na e K apresentou-se mais elevado no leite das ovelhas ½ sangue Lacaune, não diferindo significativamente na quarta e quinta semana para os dois grupos genéticos avaliados, da mesma forma que o potássio também não diferiu na terceira semana de lactação. De forma semelhante aos demais minerais, os teores de S e Mg foram menores para as ovelhas cruza Ile de France x Texel.

Um total de 8.961 amostras fecais coletadas de pacientes com diarréia aguda, no período de 1996 a 2006, no Estado de São Paulo foi testado para rotavírus por EIE. Destas, 20,0% foram positivas e posteriormente realizadas a caracterização dos rotavírus em genótipos G e P por nested RT-PCR. O genótipo G1 de rotavírus foi o mais freqüente, detectado em 35,2% das amostras, seguidos dos tipos G9, G2, G3, G4, infecção mista e G12. A associação mais freqüente foi a P[8]G1 e P[8]G9. Foi realizada a sequencia nucleotídica do gene 9 (VP7) de 38 rotavirus genótipo G1. Duas cepas foram analisadas dos anos de 1997, 1998, 2001 e 2002, três cepas dos anos 1996, 1999 e 2003, quatro cepas em 2000, sete cepas em 2004 e 2005, e cinco em 2006. Os 38 rotavírus G1 foram classificados em duas linhagens distintas, linhagem G1-I e linhagem G1-II. A linhagem G1-I foi detectada durante seis anos, 1996-1997, 2001-2002 e 2004-2006, e a linhagem G1-II foi detectada durante os anos de 1998-2001, e 2003-2005. Análises preliminares mostraram que Rotarix ® foi eficiente contra estas linhagens G1. / Rotavirus (RV) infections are recognized as a major cause of severe gastroenteritis in children worldwide. In March 2006, a monovalente P[8]G1, human RV vaccine (Rotarix® GlaxoSmithKline Biologicals) was introduced in Brazil into the routine childhood immunization schedule. Therefore, the study of genetic diversity among rotavirus strains before and after the introduction of this vaccine may be important for the development of vaccination strategies. A total of 8,961 fecal samples collected from patients with acute diarrhea, during the 11-year period surveillance in São Paulo State (1996 to 2006) were tested for rotavirus by ELISA. One thousand seven hundred eighty- four (1,784, 20.0%) were positive, and the characterization of the G and P genotypes was performed on 1,300 rotavirus samples by nested RT-PCR. The G1 type was the most prevalent rotavirus strain (35.2%). The second most prevalente was the G9 type (31.2%), followed by G2 (4.0%), G3 (3.5%), G4 (2.2%), mix infection (1.8%) and G12 (0.5%). The more frequent association was P[8]G1 and P[8]G9. We performed a sequence analysis of 38 P[8]G1 rotavirus strains, selected from a total of 341 P[8]G1.Two strains from 1997, 1998, 2001, and 2002 were analyzed; three strains from 1996, 1999, and 2003; four strains from 2000; seven strains from 2004, and 2005; and five strains from 2006. All 38 rotavirus G1 sequence in this study were found to be classified into two distinct lineages, lineage I with 44.7% (17/38) and lineage II with 55.3% (21/38). The G1I lineages were detected during six rotavirus seasons 1996-1997, 2001- 2002, and 2004-2006 whereas and lineage G1- II was detected during 1998-2001, and 2003-2005. Preliminary analyses 4 demonstrated that Rotarix® has been efficacious against these G1 lineages.

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-02-23T14:35:18Z No. of bitstreams: 1 PGPV16MA192.pdf: 957637 bytes, checksum: 97f795d2bfa5bbcfdfd15778233312bb (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-23T14:35:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV16MA192.pdf: 957637 bytes, checksum: 97f795d2bfa5bbcfdfd15778233312bb (MD5) Previous issue date: 2016-07-15 / FAPESC / The main causes of reduction in bean crop productivity are the abiotic stresses such as drought stress, low availability of nutrients in the soil and unfavorable temperatures. The selection of bean cultivars with a larger root distribution is an excellent strategy to improve nutrient absorption capacity in soils with low nutrient availability, and also genotypes with more developed root system has increased tolerance to drought stress. So it is very important to analyze the distribution of the root bean system in breeding programs, as cultivars with larger root profile are more productive and resistant to biotic and abiotic factors. Thus, this study aimed to: i) estimate the phenotypic correlation and its direct and indirect effects of the aerial part of the components that are associated with root distribution, facilitating the indirect selection for this character; ii) evaluate the genetic variability and association of root distribution in relation to the growth habit in bean lines. The experiments were conducted in the experimental area of IMEGEM, arranged in a randomized block design. To evaluate the root system was used Bohm method, when the genotypes full flowering were perpendicular profiles open the line of sowing, a rectangle with dimensions of 0.5 m wide by 0.3 m high, with checkered 0 05 m side was willing and a photo was taken. The determination of the root distribution in binary (presence denomination (1) and absence (0) of the root in each square) was performed using photo analysis. The measurement of characteristic root distribution of the determination of simple events (presence = 1 and absence = 0). In addition, it evaluated the root angle through Shovelomics method and also measured the aboveground parts. The results revealed the importance of stem diameter characters, leaf area index, the first pod insertion and root angle, since it had the highest positive correlation with root distribution to assist in indirect selection of this character. The residual effect was greater than the coefficient of determination indicating that the independent characteristics are not fully influence on the root distribution and low values of correlation coefficients are attributed to the effects of environment, competition for nutrients and different physiological mechanisms that control the expression multiple genes with minor effects. The results revealed that genetic variability exists in the root system of the analyzed strains. All contrasts involving the particular growth habit showed significant difference, indicating that the habit indeterminate genotypes are promising for use in crossing blocks, when the aim is the selection of cultivars with good root distributions / As principais causas de redução na produtividade da cultura do feijão são os estresses abióticos, como deficiência hídrica, baixa disponibilidade de nutrientes no solo e temperaturas desfavoráveis. A seleção de cultivares de feijão com uma maior distribuição radicular é uma excelente estratégia para melhorar a capacidade de absorção de nutrientes, em solos com baixa disponibilidade de nutrientes, e também, genótipos com sistema radicular mais desenvolvido possuem maior tolerância ao estresse hídrico. Por isso, é de grande importância a análise da distribuição do sistema radicular do feijão em programas de melhoramento, já que cultivares com maior perfil radicular se mostram mais produtivas e com resistência a fatores bióticos e abióticos. Sendo assim, este trabalho teve como objetivos: i) estimar a correlação fenotípica e seus efeitos diretos e indiretos dos componentes da parte aérea que estão associados com a distribuição radicular; ii) avaliar a variabilidade genética e associação da distribuição radicular em relação ao hábito de crescimento em linhagens de feijão. Os experimentos foram realizados na área experimental do IMEGEM, arranjados em delineamento de blocos casualizados. Para avaliação do sistema radicular foi utilizado o método de Bohm, quando os genótipos apresentaram pleno florescimento foram abertos perfis perpendiculares a linha de semeadura, onde um retângulo com dimensões de 0,5 m de largura por 0,3 m de altura, quadriculado com 0,05 m de lado foi disposto e uma foto foi capturada. A determinação da distribuição radicular no sistema binário (denominação de presença (1) e ausência (0) das raízes em cada quadrícula) foi realizada por meio da análise da foto. A mensuração da característica distribuição radicular a partir da determinação de eventos simples (presença=1 e ausência=0). Além disso, foi avaliado o ângulo de raiz através do método de Shovelomics e também mensurado os componentes da parte aérea. Os resultados revelaram a importância dos caracteres diâmetro de caule, índice de área foliar, inserção do primeiro legume e ângulo de raiz, uma vez que apresentaram as maiores correlações positivas com a distribuição radicular, podendo auxiliar na seleção indireta desse caráter. O efeito residual foi superior ao coeficiente de determinação, indicando que as características independentes não têm total influência na distribuição radicular, e os baixos valores dos coeficientes de determinação estão atribuídos a efeitos do ambiente, competição por nutrientes e a diferentes mecanismos fisiológicos que controlam a expressão de vários genes com efeitos menores. Os resultados revelaram que existe variabilidade genética no sistema radicular das linhagens analisadas. Todos os contrastes envolvendo o hábito de crescimento determinado apresentaram diferença significativa, evidenciando que os genótipos de hábito indeterminado são promissores para utilização em blocos de cruzamentos, quando a finalidade é a seleção de cultivares com boas distribuições radiculares

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV13MA121.pdf: 2648167 bytes, checksum: 59970008b360631f92048903e41ccc75 (MD5) Previous issue date: 2013-07-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The seed quality is due as a set of characteristics that determine its value for sowing, indicating its potential performance under adverse conditions, following as criteria the genetic physical, physiological and sanitary attributes. The soybean cultivars are classified by maturation groups (GM). This work objectified to evaluate the genetic quality associated with physiological and seed sanitary quality, and the contribution of high yield components from soybean cultivars of maturation group different. The experiment was carried out with 16 cultivars of soybean from GM and cycle, under field conditions in the 2011/2012and 2012/2013 growing season using randomized block design with three repetitions in Santa Catarina countries: Campos Novos place.The cultivars used were: 7 veryearly cycle cultivars (GM 4.7 to 5.8), 5 early (5.9 to 6.2 GM) and 4 medium (GM 6.3 to 6.7). In growing season 2011/2012 due to low rainfall precipitation (3.5 mm / day) in stages between pre-harvest ripening, observed a low incidence of pathogens in soybean seeds (0.1% to 8.5%) which the GM cultivars of 6.3 to 6.7 (semi-early cycle) had a higher incidence of fungi in seeds (0.1% to 8.5%). In 2012/2013 with the condition of high rainfall (6.9 mm / day), the cultivars belonging to GM 4.7 to 5.8 cycle veryearly showed the highest incidence of fungi in seeds (0.0% to 12.4 %), which allowed indicate a higher incidence of fungi on seeds due to higher rainfall. Cultivars GM 4.7 to 5.8 with veryearly cycle had higher yields, and yield components between the number of pods per plant and number of seed per pod, its characters have greater potential for selection and identification of superior genotypes for yield in soybean seeds. The physiological quality of soybean seeds was dependent from cultivar used and interaction with growing season, because the GM 6.3 to 6.7 cultivars showed higher physiological quality in the MF, due to rainfall in the maturation stage contributing to its better development. In general, the physiological and sanitary seed quality can be attributed by interaction between genetic quality and environmental conditions / A qualidade da semente é definida como um conjunto de características que determinam seu valor para a semeadura, indicando seu potencial de desempenho sob condições adversas, seguindo como critérios os atributos genéticos, físicos, fisiológicos e sanitários. As cultivares de soja são classificadas por grupos de maturação (GM). O objetivo do trabalho foi avaliar a qualidade genética associada à qualidade fisiológica e sanitária, e a contribuição dos componentes de rendimento para elevadas produtividades em cultivares de soja de diferentes grupos de maturação. O experimento foi conduzido no município de Campos Novos (SC) nas safras 2011/2012 e 2012/2013 e, utilizou-se 16 cultivares de diferentes GM e ciclo, sendo 7 cultivares de ciclo superprecoce (GM 4.7 a 5.8), 5 precoce (GM 5.9 a 6.2) e, 4 semiprecoce (GM 6.3 a 6.7). Na safra 2011/2012 devido a baixa precipitação pluviométrica precipitação (3,5 mm/dia) nas fases entre maturação e pré-colheita houve baixa incidência de patógenos nas sementes de soja (0,1% a 8,5%) nas quais as cultivares do GM 6.3 a 6.7 (ciclo semiprecoce) apresentaram maior incidência de fungos nas sementes (0,1% a 8,5%). Na safra 2012/2013 com condição de alta precipitação pluviométrica (6,9 mm/dia), as cultivares pertencentes ao GM 4.7 a 5.8 de ciclo superprecoce foram as que apresentaram maior incidência de fungos nas sementes (0,0% a 12,4%), o que permitiu indicar a maior incidência de fungos nas sementes em função das maiores precipitações pluviométricas. As cultivares do GM 4.7 a 5.8 com ciclo superprecoce, apresentaram maior produtividade e, entre os componentes de rendimento, o número de vagem por planta e o número de semente por vagem são caracteres de maior potencialidade para a seleção e identificação de genótipos superiores para o rendimento de sementes em soja. A qualidade fisiológica das sementes de soja foi dependente da cultivar utilizada e da interação com as condições ambientais, pois as cultivares do GM 6.3 a 6.7 apresentaram maior qualidade fisiológica na MF, devido à uniformidade de precipitação no estádio de enchimento de sementes contribuindo para o seu melhor desenvolvimento

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV14MA142.pdf: 646523 bytes, checksum: e0bd829f134f5d24d758fee703f47aa9 (MD5) Previous issue date: 2014-06-27 / The objectives of the survey and typing traditional orchards subsistence containing fig plants in rural and urban perimeter Catarina were performing. Characterize the roughness of the fig tree clones and evaluate the use of homeopathic preparations in fig rust control in organic production systems. The metodology used for the survey and location of fig germplasm nigger were held through technical visits. We conducted 43 interviews with semi-structured questionnaire, rising information about the history, potential use, ways to use the fruit and procedures for management of fig. For characterization of resistance expedriments were conducted at the Experimental Station of the Agriocultural Research and Rural Extension, Lages, SC and the Federal Institute of Santa Catarina Concord Campus, in the period 2013/2014. The experiments consisted of evaluation of 35 clones in four replication, with and experimental ploto f fours plants, the revews were incidence and severity of rust on the leaves fortnightly. The study wth the use of homeopathic preparations was conducted in the greenhouse and the field at trhe Federal Institute of Santa Catarina Concord Campus, SC, in two cropping cycles, 2012/2014. The experimental design was a randomized block with four replications, the field and eight replicates in a greenhouse. The homeopatic treatments were prepared: Belladonna, Ferrum fosforicum, Aconitum napelus and biotherapic of fig leaves, all in CH12 (twelfth order of Hahnemann s centesimal dolution), Bordeaux mixture 0.2% and 0.3% sulfue syruo. Witnesses were water and non-intervention. It was found that the cultivation of the fig tree is associated with the lemon, orange, bergamoteiras, vines, peac, persimmon and plum trees in backyards, near the home. Phytosanitary problems were repprted by 86% of respondentes in rural areas and 14% in the urban áreas. All respondentes (43) figs intended for personal use and also sells only one. The age of the plants of figs were between 8-65 years. Two accessions of purple figs and two accessions of fine purple fig showed less incidence and severity ofrust on the leaves. The availability of Creoles genotypes resistance to rust offers potential for use on a comercial scale in the locations studies. In the greenhouse, fig treated with Belladonna 12CH, 0.2% Bordeaux misture and lime súlfur to 0.3% showed less senescence and showed the lowest área under the disease progress curve. The field, fig treated with Belladonna 12CH, 0.2% Bordeaux mixture and lime súlfur to 0.3% also showed the lowest área under the disease progress curve and a lower incidence of rust average of seven ecaluations. Holders of knowledge about the cultivation and use of fig fruits are prevalente in the elderly. There Creoles genptypes high resistance rust. Belladonna and nosode rust were equivalente to Bordeaux mixture in most trials in the management of rust fig / Este estudo teve objetivo de reconhecer germoplasma crioulo de figo, o conhecimento associado e avaliar a resistência da figueira e uso de preparados homeopáticos no manejo da ferrugem. A localização e levantamento de germoplasma de figo crioulo foram realizadas através de visitas técnicas a área rural no Oeste Catarinense e urbana de Lages. Realizou-se 43 entrevistas com questionário semi-estruturado, levantandose informações sobre o histórico, potencial de uso, formas de utilização do fruto e procedimentos de manejo de figueiras. Para caracterização de resistência experimentos foram realizados na Estação Experimental da Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural, Lages, SC e no Instituto Federal Catarinense Campus Concórdia, no período de 2013/2014. Os experimentos constaram de avaliação de 35 clones em quatro repetições, sendo a parcela experimental de quatro plantas. As avaliações foram quinzenais de incidência e severidade de ferrugem nas folhas. O estudo com uso de preparados homeopáticos foi realizado em casa de vegetação e a campo no Instituto Federal Catarinense Campus Concórdia, SC, em dois ciclos de cultivo de 2012 a 2014. O delineamento experimental foi de blocos ao acaso com quatro repetições, a campo, e oito repetições, em casa de vegetação. Os tratamentos foram os preparados homeopáticos: Belladonna, Ferrum fosforicum, Aconitum napelus, e bioterápico de folhas de figueiras, todas na CH12 (décima segunda ordem de diluição centesimal hahnemanniana). Calda bordalesa a 0,2% e calda sulfocalcica a 0,3% foram os tratamentos padrão. Testemunhas foram a água e não intervenção. Verificou-se que o cultivo da figueira está associado, a limoeiros, laranjeiras, bergamoteiras, videiras, pessegueiros, caquizeiros e ameixeiras em quintais, próximos às residências. Problemas fitossanitários foram reportados por 86% dos entrevistados na área rural e 14% no perímetro urbano. Todos os entrevistados (43) destinam os figos para consumo próprio e apenas um também comercializa. A idade das plantas de figos foi entre 8 a 65 anos. Dois acessos de figo roxo e dois acessos de figo roxo fino mostraram menos incidência e severidade de ferrugem nas folhas. A disponibilidade de genótipos crioulos resistentes a ferrugem oferece potencial de uso em escala comercial nos locais estudados. Em casa de vegetação, figueiras tratadas com Belladonna 12CH, calda bordalesa a 0,2% e calda sulfocálcica a 0,3% apresentaram menor senescência e apresentaram menor índice de área abaixo da curva de progresso da doença. A campo, figueiras tratadas com Belladonna 12CH, calda bordalesa a 0,2% e calda sulfocálcica a 0,3% também apresentaram menor índice de área abaixo da curva de progresso da doença e menor incidência da ferrugem, média das sete avaliações. Detentores do conhecimento sobre o cultivo e uso de frutos de figo são predominantes de terceira idade. Belladonna e Nosódio da ferrugem foram equivalentes a calda bordalesa na maioria dos ensaios no manejo da ferrugem da figueira