Os Poliomavírus JC e BK são os mais importantes integrantes da família Polyomaviridae, gênero Orthopolyomavirus, devido ao seu grau de patogenicidade no homem. O poliomavírus humano JC (JCV) foi isolado a partir de fragmento do cérebro de um paciente com linfoma de Hodgkin e leucoencefalopatia multifocal progressiva por Padgett e colaboradores. Já o poliomavírus humano BK foi isolado em 1971 por Gardner e colaboradores a partir da semeadura da urina de um paciente, submetido a transplante renal, em cultura de células da linhagem VERO Poucos são os dados sobre os poliomavírus humanos JC e BK em indivíduos sadios no mundo e no Brasil. Além disso, as formas de excreção e transmissão destes vírus ainda não estão completamente elucidadas. Este estudo teve como objetivos principais determinar a incidência, a dinâmica de excreção e a caracterização genotípica dos poliomavírus JC e BK em amostras sequenciais de urina de indivíduos sadios. Como objetivo secundário, foram analisados filogeneticamente os subtipos dos vírus encontrados. Foram incluídos 71 indivíduos de ambos os sexos, com idades variando entre 21 e 65 anos e destes foram coletadas amostras mensais de urina durante 6 meses. Todas as amostras do estudo foram submetidas a um teste de PCR em tempo real, que amplifica um fragmento do gene que codifica o antígeno T, e a um PCR convencional que amplifica um fragmento do gene da proteína VP1 do vírus. Ao final do período de 6 meses de acompanhamento a incidência de excreção urinária dos poliomavírus JCV e BKV na população estudada foi de 53,52% e 64,79% respectivamente. O perfil de excreção do JCV mostrou-se continuo em 42% dos casos , intermitente em 8% e esporádico em 50% dos casos. Analisando o perfil de excreção do BKV, em 80% dos casos mostrou-se esporádico, em 17% intermitente e em 3% dos casos contínuo. Posteriormente, as amostras positivas foram sequenciadas e analisadas filogeneticamente observando-se que os genótipos mais prevalentes do JCV foram o 1, subtipo 1B e 3, seguidos dos genótipos 1, subtipo 1A e 4. Com relação ao BKV, o genótipo 1, subtipo 1A foi o mais prevalente, seguido do 4 e do 1, subtipo 1B. / The Polyomavirus JC and BK are the most important members of Polyomaviridae family, genus Orthopolyomavirus, due to their degree of pathogenicity in humans. The human polyomavirus JC (JCV) was isolated from a fragment of the brain of a patient with Hodgkin\'s lymphoma and progressive multifocal leukoencephalopathy by Padgett et al. On the other hand the human polyomavirus BK was also isolated in 1971 by Gardner et al from the urine of a patient who underwent renal transplantation in VERO cell line. There are few data on human polyomavirus JC and BK in healthy individuals on the world and in Brazil. Moreover the forms of excretion and transmission of these viruses are not yet fully elucidated. This study aimed to determine the incidence, the dynamics of excretion, and the molecular characterization of polyomavirus JC and BK in serial samples of urine of healthy individuals. A secondary objective was to analyze phylogenetically the subtypes of the viruses found during the study. Were included 71 patients of both genders, aged from 21 to 65 yearsold. Urine samples were collected every month for six months. All samples in the study were screened by a real time PCR which amplifies a fragment of the T antigen gene, and to a conventional PCR that amplifies a fragment of the gene of VP1 protein of the virus. At the end of 6 months of follow-up, the incidence of urinary excretion of polyomaviruses BKV and JCV in the study population was 53.52% and 64.79% respectively The profile of excretion of JCV was continuous in 42% of cases, intermittent in 8% and sporadic in 50% of cases. The profile of excretion of BKV was shown to be sporadic in 80% of cases, intermittent in 17% and continuous in only 3% of cases. Subsequently, the positive samples were sequenced and analyzed phylogenetically showing that the more prevalent genotypes were JCV 1, subtype 1b and 3, followed by genotype 1, subtypes 1a and 4. Regarding the BKV genotype 1 subtype 1a was the most prevalent, followed by 4 and 1, subtype 1b.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Michel_Aldrighi_Goncalves.pdf: 1516499 bytes, checksum: 9da5ae7039fd806dd67f130ae9fec997 (MD5) Previous issue date: 2011-03-02 / The present work aimed to evaluate and characterize the behavior of different peach genotypes submitted to variations of period and type of pruning, in the region of Pelotas, RS. The work was carried out in Pelotas, RS, in an experimental area belonging to Embrapa Clima Temperado (CPACT) during 2009 and 2010 seasons. Two experiments were done: the first one was comprised of a combination among three periods of pruning (Winter pruning WP; winter pruning plus summer pruning WSP; and summer pruning SP) and three genotypes (Cascata 805, Cascata 834 (BRS Kampai) and Cascata 952 (BRS Rubimel), resulting in nine distinct combinations. The second experiment consisted in three types of pruning (short pruning SP; long pruning LP; and no shoot topping NST) and two genotypes (Riograndense and Leonense), resulting in six treatments. In general, the chemical characteristics of the fruits are not affected by the different pruning period, as well as, the fruitset. BRS Rubimel did not show uniformity of yield in the following years when using the summer pruning; however, BRS Kampai had a good yield equilibrium at all pruning date tested. Trees pruned only in the winter period showed higher vigor whether compared to other studies. The different types of pruning directly affected the number of flowers and fruits, diameter and mean mass, and yield. The short pruning stimulates the growth of undesirable shoots, making unviable the summer pruning practice. In general, the variations of pruning type and period could be commercially used depending on the genotype studied. / Com o presente trabalho objetivou-se avaliar e caracterizar o comportamento de diferentes genótipos, submetidos a variações de época e tipo de poda na região de Pelotas, RS. O mesmo foi conduzido no município de Pelotas, RS, em uma área experimental pertencente a Embrapa Clima Temperado (CPACT), durante os anos de 2009 e 2010 e, composto de dois experimentos: o primeiro teve como tratamentos a combinação de três épocas de poda (Poda de inverno (PI), poda de inverno mais poda de verão (PIV) e poda de verão (PV)) e três genótipos (Cascata 805, Cascata 834 (BRS Kampai) e Cascata 952 (BRS Rubimel), resultando em nove combinações distintas; o segundo experimento os tratamentos foram compostos por três tipos de poda (Poda curta (PC), poda longa (PL) e poda sem desponte (PSD) e dois genótipos (Riograndense e Leonense), resultando em seis tratamentos. Em geral as características químicas dos frutos não são alteradas com as variações de época de poda estudadas, assim como a frutificação efetiva. BRS Rubimel não apresentou uniformidade produtiva com a sucessão de cultivos com poda apenas no período de verão, já a BRS Kampai teve um bom equilíbrio produtivo em todas as datas de podas testadas. Plantas podadas apenas no período de inverno apresentam maior vigor quando comparadas com as demais estudados. Já os diferentes tipos de poda influenciaram diretamente no número de flores e frutos, diâmetro e massa média, assim como na produtividade. A poda curta estimula o crescimento de ramificações indesejáveis tornando mais trabalhosa a prática da poda verde. De maneira geral as variações de tipo e época de poda podem ser utilizadas comercialmente dependendo do genótipo trabalhado.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-10-20T18:58:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thais Augusto Marinho - 2012.pdf: 1266028 bytes, checksum: cd93decbadceaf3e44ca429c0702442e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-10-20T20:08:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thais Augusto Marinho - 2012.pdf: 1266028 bytes, checksum: cd93decbadceaf3e44ca429c0702442e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-20T20:08:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thais Augusto Marinho - 2012.pdf: 1266028 bytes, checksum: cd93decbadceaf3e44ca429c0702442e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Hepatitis C represents an important public health problem. Although acute hepatitis C virus (HCV) infection is often asymptomatic, 50 to 85% of these cases progress to chronic disease, and can lead to liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Accidents involving contaminated sharps occur in recyclable waste collectors as a result of contact with glass, ferrous sharp, needles and syringes, demonstrating, thus, the increased risk of these professionals in acquiring infections by the parenteral route, such as hepatitis C. There is currently very little data on HCV infection among recyclable waste collectors. This study aimed to investigate the epidemiological and molecular profile of the hepatitis C virus infection among recyclable waste collectors in Goiânia, Goiás. A total of 431individuals were interviewed for socio-demographic characteristics and risk factors for HCV infection. Blood samples were collected and sera were tested for the presence of antibodies to HCV (anti-HCV) using an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and immunoblot. All samples were submitted to HCV RNA detection by polymerase chain reaction (PCR) with primers complementary to the conserved area of the 5’ non-coding (NC) region of HCV. Positive HCV RNA samples were genotyped by direct sequencing analysis of the NS5B region of viral genome, followed by phylogenetic analysis. The HCV infection prevalence was 1.6% (95% CI: 0.6-3.6) in recyclable waste collectors in Goiânia-GO. In a multivariate analysis, history of sexually transmitted disease was independently associated with this infection, while the variables history of blood transfusion and number of sexual partners showed an association with a borderline P value (p = 0.05 and p = 0.07, respectively). Viral RNA was detected in five of the seven anti-HCV positive samples, and the genotype 1, subtypes 1a (n = 1), 1b (n = 2) and 1a/1b (n = 2) were identified in the study population. Although the HCV infection prevalence found among recyclable waste collectors in Goiânia-GO is similar to that observed in local blood donors (1.4%), this population is in risk to HCV by sexual and parenteral transmission. / A hepatite C representa um importante problema de saúde pública. Apesar da infecção aguda pelo vírus da hepatite C (HCV) ser geralmente assintomática, 50 a 85% dos casos evoluem para cronicidade, podendo desenvolver cirrose hepática e carcinoma hepatocelular. Acidentes com objetos perfurocortantes contaminados podem ocorrer em catadores de materiais recicláveis como consequência do contato com vidros, materiais ferrosos pontiagudos, agulhas e seringas, evidenciando-se, assim, o risco aumentado desses profissionais em adquirir infecções por via parenteral, como a hepatite C. São escassos os trabalhos sobre a infecção pelo HCV em catadores de materiais recicláveis. O presente estudo teve como objetivo investigar o perfil soroepidemiológico e molecular da infecção pelo vírus da hepatite C em catadores de materiais recicláveis em Goiânia, Goiás. Um total de 431 indivíduos foi entrevistado sobre características sociodemográficas e fatores de risco para infecção pelo HCV. Amostras de sangue foram coletadas e os soros testados para detecção de anticorpos para o HCV (anti- HCV), por ensaio imunoenzimático (ELISA) e immunoblot. Todas as amostras foram submetidas à detecção do RNA viral por reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores complementares as região 5’ não codificante (NC) do HCV. As amostras RNA-HCV positivas foram genotipadas por sequenciamento direto da região NS5B do genoma viral, seguido de análise filogenética. A prevalência da infecção pelo HCV em catadores de materiais recicláveis em Goiânia-GO foi de 1,6% (IC 95%: 0,6–3,6). Pela análise multivariada, história de doença sexualmente transmissível foi independentemente associada a esta infecção, enquanto as variáveis história de transfusão e número de parceiros sexuais apresentaram associação marginal (p = 0,05 e p = 0,07, respectivamente). O RNA viral foi detectado em cinco das sete amostras anti- HCV positivas, sendo identificado o genótipo 1, subtipos 1a (n=1), 1b (n=2) e 1a/1b (n=2) na população estudada. Apesar da prevalência da infecção pelo HCV em catadores de materiais recicláveis em Goiânia-GO ser semelhante a observada previamente em doadores de sangue (1,4%), a referida população mostrou-se em risco transmissão sexual e parenteral do HCV.

Made available in DSpace on 2015-04-20T12:31:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PRE-TEXTUAL.pdf: 394027 bytes, checksum: d5e64d94f3ade196d4079ab1173940e8 (MD5) Previous issue date: 2009-06-30 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The global epidemic of AIDS began in 1981, the United States, and after the introduction of antiretroviral drugs to patients infected with HIV / AIDS have been given a higher survival emerged a new challenge, co-infection with the hepatitis C virus (HCV), which is already the leading cause of death in these individuals. The HCV was discovered in 1989 and its main route of transmission, parenteral, is common to HIV, thus increasing the prevalence of co-infection HIV / HCV and are currently more than 30% of those infected by HIV also infected by HCV. There are few studies on co-infection HIV / HCV in the Amazon and this study provides an opportunity to evaluate the association of these viruses. The work is a description of a number of cases and is intended to study the clinical implications and immunobiologicals of co-infection HIV / HCV in a population of patients in the Tropical Medicine Foundation of Amazonas (FMTAM), in the period 2000 to 2007. This study found a prevalence of patients co-infected HIV / HCV of 4.42% (n = 70), with an average annual growth of 3.6%. Of these 72.9% were male, 47.1% were aged 30 | - 40. Of these 80% had completed the first grade, 50% received up to a minimum wage and 55.7% were natural in the city of Manaus where 94.3% from the capital too. Of the patients studied, 68.6% were heterosexuals and 84.3% of patients there was sexual promiscuity as a risk factor. During the study period 34.3% of the patients died. Co-infected individuals, only 25.7% (n = 18/70) to attend the clinic for viral hepatitis FMTAM for collection of biological material. In these patients (n = 18) the mean AST was 61.5 ± 61 U / L, ALT of 62.2 ± 37 U / L and the AST / ALT was 0.88 ± 0.33 U / L. As for lipids 38.9% had total cholesterol> 200mg/dl, 83.3% had HDL ≤ 40 mg / dL, 77.8% had triglycerides> 150 mg / dL and 33.3% had glucose> 110 mg / dL . Included 83.3% of patients used HAART scheme whereby 100% of these were using the protease inhibitor regimen. In applying the FIB-4 score in predicting fibrosis found that 77.8% with a cutoff point was <1.45 and 22.2% with a cutoff> 3.25. As for CD4 + T cells 72.2% had <500 cls/mm3 with a median of 271 cls/mm3, on the T CD8 + 88.9% had ≥ 215 cls/mm3 with a median of 794.5 cls/mm3. The ratio CD4 + / CD8 + was 0.32 cls/mm3. As the viral load of HIV and HCV there was a median of 16,911 copies / mL and 543,209 copies / mL, respectively. In this population 88.9% had the genotype 1 of HCV and 94.4% had a sub-type B HIV. Of these, 83.3% had Child-Pugh A and 61.1% who had normal liver on ultrasound. When the dose cytokines IL4, IL6, IL8, IL10, IL12 and IFN-γ in these patients found that only the IL6 (p = <0.001) showed statistical significance especially when correlated to the logarithm of the HCV viral load (0.031). The results found in this study, despite the low prevalence, have annual growth of co-infection due to improvement in the research of hepatitis C in patients with HIV. These results contribute to a better understanding of the clinical, epidemiological and immunological profile of patients co-infected in the north, because these data may lead to greater understanding of the interaction of these two viruses resulted in early diagnosis and consequent reduction of deaths. / A epidemia mundial da AIDS teve início em 1981, nos Estados Unidos, e pós a introdução dos anti-retrovirais os pacientes infectados com HIV/AIDS passaram a ter uma sobrevida maior surgindo um novo desafio, a co-infecção com o vírus da hepatite C (HCV), a qual já é a principal causa de morte nestes indivíduos. O HCV foi descoberto em 1989 e sua principal via de transmissão, a parenteral, é comum ao HIV, com isso aumentando a prevalência da co-infecção HIV/HCV e estando atualmente, mais de 30% dos infectados pelo HIV também infectados pelo HCV. Existem poucos estudos sobre co-infecção HIV/HCV no Amazonas e o presente estudo oferece uma oportunidade de avaliar a associação destes vírus. O trabalho é do tipo descritivo de uma série de casos e tem o objetivo de estudar as implicações clínicas e imunobiológicas da co-infecção HIV/HCV em uma população de pacientes atendidos na Fundação de Medicina Tropical do Amazonas (FMTAM), no período de 2000 a 2007. Este estudo encontrou uma freqüência de pacientes co-infectados HIV/HCV de 4,4% (n=70), com uma média de crescimento anual de 3,6% dos casos. Destes 72,9% eram do sexo masculino, 47,1% tinham entre 30|- 40 anos. Destes 80% possuíam o primeiro grau completo, 50% recebiam até um salário mínimo e 55,7% eram naturais da cidade de Manaus sendo que 94,3% também procedentes da capital. Dos pacientes estudados, 68,6% eram heterossexuais e em 84,3% dos pacientes encontrou-se a promiscuidade sexual como fator de risco. No período do estudo 34,3% dos pacientes foram à óbito. Dos indivíduos co-infectados, apenas 25,7% (n=18/70) comparecerem ao ambulatório de hepatites virais da FMTAM para coleta de material biológico. Nestes pacientes (n=18) a média da AST foi 61,5±61 U/L, da ALT 62,2±37 U/L e a relação AST/ALT foi 0,88±0,33 U/L. Quanto aos lipídeos 38,9% apresentaram colesterol total >200mg/dL, 83,3% apresentaram HDL ≤ 40 mg/dL, 77,8% tinham triglicerídeos >150 mg/dL e 33,3% tinham glicemia >110 mg/dL. Dos pacientes incluídos 83,3% usavam esquema HAART sendo que 100% destes faziam uso de inibidor da protease no esquema. Ao aplicar o escore FIB-4 para predizer fibrose verificou-se que 77,8% ficou com ponto de corte <1,45 e 22,2% com ponto de corte >3,25. Quanto às células T CD4+ 72,2% tinham <500 cls/mm3 com uma mediana de 271 cls/mm3, quanto ao T CD8+ 88,9% tinham ≥215 cls/mm3 com uma mediana de 794,5 cls/mm3. A razão CD4+ /CD8+ foi 0,32 cls/mm3. Quanto à carga viral do HIV e do HCV verificou-se uma mediana de 16.911 cópias /mL e de 543.209 cópias/mL, respectivamente. Nesta população 88,9% apresentaram o genótipo 1 do HCV e 94,4% apresentaram o sub-tipo B do HIV. Destes, 83,3% apresentavam Child-Pugh A sendo que 61,1% apresentavam fígado normal na ultra-sonografia. Ao dosar as citocinas IL4, IL6, IL8, IL10, IL12 e IFN-γ nestes pacientes verificou-se que apenas a IL6 (p= <0,001) apresentou significância estatística principalmente quando correlacionada ao logaritmo da carga viral do HCV (0,031). Os resultados encontrados neste estudo, apesar da baixa prevalência, apresentam crescimento anual da co-infecção provavelmente devido à melhora na investigação da hepatite C nos pacientes com HIV. Estes resultados contribuem para um melhor conhecimento sobre os dados clínicos, epidemiológicos, bem como perfil imunológico dos pacientes co-infectados da região Norte, uma vez que estes dados podem levar à uma maior compreensão da interação destes dois vírus resultando em diagnóstico precoce, e conseqüente redução dos óbitos.

Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-12-15T16:34:33Z No. of bitstreams: 2 Tese - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2016.pdf: 5653902 bytes, checksum: 8bdbf3d657fcdca5983ccf5099b3b42d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Rejected by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com), reason: Veja com a Cláudia se realmente devemos colocar na BDTD, pois no sumário vi artigo "a ser submetido". on 2017-12-18T13:47:56Z (GMT) / Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-12-18T16:39:42Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2016.pdf: 5653902 bytes, checksum: 8bdbf3d657fcdca5983ccf5099b3b42d (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-12-19T12:05:01Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2016.pdf: 5653902 bytes, checksum: 8bdbf3d657fcdca5983ccf5099b3b42d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-19T12:05:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2016.pdf: 5653902 bytes, checksum: 8bdbf3d657fcdca5983ccf5099b3b42d (MD5) Previous issue date: 2016-03-08 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Crack users are uniquely vulnerable to acquisition and transmission of infectious agents such as hepatitis C virus (HCV) because the artifacts used for drug consumption are often shared among individuals with lesions in the oral cavity. The objective of this study was to investigate the epidemiological and molecular profile of infection with hepatitis C virus among in-treatment crack users in Goiania, Goias, Central Brazil. The population consisted of 600 crack users in a drug treatment hospital in Goiania (Spiritist Hospital Euripides Barsanulfo - Euripides House), from August 2012 to April 2013. Blood samples were tested for antibodies to HCV by (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay - ELISA). Samples with anti-HCV reagents were subjected to detection of viral RNA by RT-PCR (Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction). All HCV RNA-positive samples were genotyped by line probe assay - LiPA, using the 5 'NC and direct sequencing of the NS5B region of the viral genome, followed by phylogenetic analysis. The prevalence of HCV infection among the study participants was 3.7% (95% CI: 2.4% -5.6%). Viral RNA was detected in 63.6% of the samples for the 5 'NC region and 54.5% in the NS5B region. Genotypes 1 and 3 were identified, predominantly subtype 1a (n = 7) followed subtype 1b (n = 3) and 3a (n = 2). Following logistic regression, age older than 40 years (OR: 17.72; 95% CI: 6.22 to 50.48) and a history of injection drug use (OR: 11.10; 95% CI: 3.95 to 31, 22) were associated with HCV infection (p <0.05). These findings reinforce the need to implement public health policies emphasizing prevention and control of hepatitis C, aimed specifically toward crack users. / Os usuários de crack são considerados uma população vulnerável à aquisição e transmissão de agentes infecciosos, como o vírus da hepatite C (HCV), pois os artefatos utilizados para consumo da droga, muitas vezes, são compartilhados entre indivíduos que possuem lesões na cavidade oral. Este estudo teve como objetivo investigar o perfil epidemiológico e molecular da infecção pelo vírus da hepatite C em indivíduos usuários de crack institucionalizados em Goiânia-GO. A população foi constituída por 600 usuários de crack em tratamento em um hospital psiquiátrico de Goiânia (Hospital Espírita Eurípedes Barsanulfo – Casa de Eurípedes), no período de agosto de 2012 a abril de 2013. Os soros foram testados para a detecção de anticorpos para o HCV (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay - ELISA). As amostras anti-HCV reagentes foram submetidas à detecção do RNA viral pela RT-PCR (Transcrição Reversa - Reação em Cadeia pela Polimerase). Todas as amostras RNA-HCV positivas foram genotipadas pelo método line probe assay - LiPA, utilizando a região 5’ NC e por sequenciamento direto da região NS5B do genoma viral, seguido de análise filogenética. A prevalência da infecção pelo HCV em usuários de crack institucionalizados foi de 3,7% (IC 95%: 2,4%-5,6%). O RNA viral foi detectado em 63,6% das amostras para a região 5’ NC e 54,5% para a região NS5B. Foram identificados os genótipos 1 e 3, com predomínio do subtipo 1a (n=7), seguido dos subtipos 1b (n=3) e 3a (n=2). Após regressão logística, idade superior a 40 anos (OR: 17,72; IC 95%: 6,22-50,48) e antecedentes de drogas injetáveis (OR: 11,10; IC 95%: 3,95-31,22) foram associados à infecção pelo HCV (p < 0,05). Os achados reforçam a necessidade de implementação de políticas públicas de saúde, com ênfase na prevenção e controle da hepatite C, voltadas para os usuários de crack.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-09-09T13:24:18Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ramon Ramos Filho - 2002.pdf: 1651595 bytes, checksum: da2b2e148f79fbda613d8593834b9e91 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-09-09T15:25:27Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ramon Ramos Filho - 2002.pdf: 1651595 bytes, checksum: da2b2e148f79fbda613d8593834b9e91 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-09T15:25:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ramon Ramos Filho - 2002.pdf: 1651595 bytes, checksum: da2b2e148f79fbda613d8593834b9e91 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2002-08-29 / Patients with renal failure are at high risk of acquiring viral hepatitis thought blood transfusion, kidney transplant and nosocomial transmission. High prevalence of hepatitis C (HCV) and G (HGV) have been observed among these patients. To assess the prevalence of infection by these viruses in a dialysis unit, 123 patients in Goiânia- Goias were interviewed and blood colleted. They were tested for the presence of antibodies to HCV (anti-HCV) and RNA-HCV, and to detect RNA-HGV. RNA viral positive samples were genotyped. An overall prevalence of 37.4% and 14.6% for hepatitis C and G viruses were found respectively. Patients in hemodyalisis (41.8% and 15.3%) and renal transplanted subjects (33.3% and 16.7%), had higher rates of positivity for the virus C and G when compared to patients in peritoneal dialysis (7.7%). Genotype 1 (54.8%) and 3 (45.2%) of HCV were the most frequently found, and the subtypes 1a and 3a were prevalent. Regarding HGV genotypes 1 (17%), 2 (72%) and 3 (11%) were found, with predominance of subtype 2b. A co-infection by C and G viruses of 3.2% was observed. History of blood transfusions, the duration of end-stage renal disease and co-infection with hepatitis B were risk factors associated with infection by virus C. The patients infected with HGV reported blood transfusion, treatment with a non graduated dentist and sexually transmitted disease as risk factors, beside most of them had been in hemodyalisis. Our data showed a high prevalence for HCV infection in this population, in spite of the screening for blood products and the adoption of universal precautions in dialysis units, and also a high prevalence of HGV in this population was observed. / Os pacientes portadores de insuficiência renal crônica em terapia renal substitutiva apresentam um risco elevado de adquirirem as hepatites virais através de transfusão sangüínea, transplante de órgãos ou ainda pela transmissão horizontal em unidades de hemodiálise. Prevalências altas para as infecções pelos vírus das hepatites C (HCV) e G (HGV) têm sido observadas nos pacientes renais crônicos. Para determinar a prevalência destas infecções em um serviço de terapia renal substitutiva em Goiânia-GO, 123 pacientes foram entrevistados e amostras sangüíneas coletadas, sendo testadas para detecção de anticorpos para o HCV (anti-HCV) e do RNA-HCV. Com relação ao vírus da hepatite G, foi realizada a pesquisa do RNA-HGV. As amostras que apresentaram o RNA viral foram genotipadas. Prevalências globais de 37,4% e 14,6% para as infecções pelos vírus das hepatites C e G foram encontradas, respectivamente. Os pacientes que realizaram hemodiálise (41,8% e 15,3%) e os transplantados renais (33,3% e 16,7%) apresentaram maiores taxas de soropositividade para os vírus C e G em relação às encontradas em pacientes em diálise peritoneal (7,7%). Os genótipos 1 (54,8%) e 3 (45,2%) do HCV foram os mais freqüentemente encontrados, sendo os subtipos 1a e 3a os mais prevalentes. Em relação ao HGV, os genótipos 1 (17%), 2 (72%) e 3 (11%) foram identificados, havendo dominância do subtipo 2b. Uma taxa de 3,2% foi verificada para co-infecção pelos vírus das hepatites C e G. Tempo de tratamento e sorologia positiva para a hepatite B mostraram-se como fatores de risco para a infecção pelo vírus C. Os pacientes soropositivos para o RNA-HGV relataram transfusão sangüínea prévia, historia de tratamento odontológico com dentista prático e de doença sexualmente transmissível, além da maioria ter realizado hemodiálise. Os resultados do presente estudo mostraram que ainda é alta a prevalência para o HCV nesta população, apesar da triagem dos derivados sangüíneos e do aumento do controle de infecção nos ambientes de terapia dialitica, bem como é elevada a prevalência do HGV neste grupo.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-03-23T21:02:36Z No. of bitstreams: 2 Tese - Marina Pedroso de Oliveira - 2017.pdf: 6913469 bytes, checksum: 0f52c792d453bdaabe154c7fca4f726b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-03-24T11:03:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Marina Pedroso de Oliveira - 2017.pdf: 6913469 bytes, checksum: 0f52c792d453bdaabe154c7fca4f726b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T11:03:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Marina Pedroso de Oliveira - 2017.pdf: 6913469 bytes, checksum: 0f52c792d453bdaabe154c7fca4f726b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / Outro / Men who have sex with men (MSM) are more vulnerable to hepatitis B virus (HBV) infection when compared to the general population. In Brazil, the epidemiological profile of hepatitis B in MSM is still poorly understood. This study aimed to estimate the prevalence of HBV infection in MSM in Goiânia-Goiás and to analyze the associated factors, perform a molecular characterization of the viral isolates, as well as to investigate the vaccine situation against hepatitis B in this population. A cross-sectional study was conducted among MSM in the City of Goiânia, Central Brazil. From March to November 2014, a total of 522 participants were recruited using respondent-driven sampling (RDS). After signing the consent form, MSM were interviewed and a blood sample was collected. All samples were tested for HBV serological markers and HBV DNA. HBV isolates were sequenced for the determination of HBV genotypes and subgenotypes by phylogenetic analysis and for identification of mutations in viral genome. Data were analyzed using the RDSAT and SPSS programs. The overall prevalence of HBV infection (presence of anti-HBc marker) was 15.4% (95% CI: 8.7-25.8) and the rate of HBsAg carriers was 0.6% (95% CI: 0.2-1.6). Age over 25 years old, receptive anal intercourse, previous sex with women, and history of sexually transmitted infection (STI) were factors associated with HBV infection. Viral DNA was detected only in HBsAg-positive individuals, and occult HBV infection was not observed in the study population. HBV isolates were classified into genotype A (subgenotypes A1 and A2).Mutations in the S (T131N), basal core promoter (BCP) (A1762T/G1764A) and Pre-C/C (G1862T/G1888A and G1862T) regions of the HBV genome were identified. About 40% (95% CI: 32.3-48.8) of the participants had serological evidence of previous HBV vaccination (reactive for isolated anti-HBs), while 76.2% reported having previously received the vaccine. In addition, 44.3% (95% CI: 36.1-52.9) of MSM were susceptible to HBV infection. A greater frequency of positivity for anti-HBs alone was observed among MSM up to 25 years old, followed by declining vaccination with increasing age. By contrast, an increase in HBV infection with increasing age was found. HBV vaccination was associated with unprotected anal intercourse and history of STI (with a borderline p-value). In this study, we observed a poor agreement when comparing the self-reported and serologic evidence of HBV vaccination (k = 0.17). These results reveal a high overall prevalence of HBV infection in the study population associated with sexual risk behaviors, and in contrast, a low frequency of hepatitis B vaccination, evidencing a need for public health strategies to increase vaccine coverage in MSM, in addition to monitoring HBV carriers. / Homens que fazem sexo com homens (HSH) apresentam maior vulnerabilidade para infecção pelo vírus da hepatite B (HBV) quando comparados à população em geral. No Brasil, o perfil epidemiológico da hepatite B em HSH ainda é pouco conhecido. Este estudo teve como objetivos estimar a prevalência da infecção pelo HBV em HSH em Goiânia-Goiás e analisar os fatores associados, realizar a caracterização molecular dos isolados virais, bem como investigar a situação vacinal contra hepatite B e fatores associados. Estudo transversal conduzido em HSH na região metropolitana de Goiânia-GO. De março a novembro de 2014, um total de 522 participantes foi recrutado utilizando o método respondent-driven sampling (RDS). Após assinatura do termo de consentimento livre e esclarecido, os HSH foram entrevistados e amostras sanguíneas coletadas. Todas as amostras foram testadas por ensaio imunoenzimático (ELISA) para detecção dos marcadores sorológicos da hepatite B e submetidas à extração e amplificação do HBV DNA. Os isolados do HBV foram sequenciados para determinação dos genótipos e subgenótipos do vírus por análise filogenética e para identificação de mutações no genoma viral. Os dados foram analisados utilizando os programas RDSAT e SPSS. A prevalência global da infecção pelo HBV (anti-HBc) foi de 15,4% (IC 95%: 8,7-25,8) e do HBsAg de 0,6% (IC 95%: 0,2-1,6). Idade acima de 25 anos, sexo anal receptivo, relação sexual com mulheres e história de infecções sexualmente transmissíveis (IST) foram fatores associados à infecção pelo HBV. O DNA viral foi detectado apenas nos indivíduos HBsAg positivos, não sendo observada infecção oculta na população estudada. Os isolados do HBV foram classificados como pertencentes ao genótipo A (subgenótipos A1 e A2) do HBV. Mutações nas regiões S (T131N), promotora basal do core (BCP) (A1762T/G1764A) e Pré-C/C (G1862T/G1888A e G1862T) do genoma viral foram identificadas. Cerca de 40% (IC 95%: 32,3-48,8) dos participantes tinham evidência sorológica de vacinação contra hepatite B (anti-HBs isolado), enquanto que 76,2% relataram ter recebido a vacina previamente. Além disso, 44,3% (IC 95%: 36,1-52,9) dos HSH eram suscetíveis à infecção pelo HBV. Observou-se uma maior positividade para anti-HBs isolado entre os HSH com até 25 anos de idade, seguido de seu declínio com o aumento da idade e, por outro lado, verificou-se aumento da infecção pelo HBV. A vacinação contra a hepatite B foi associada ao sexo anal desprotegido e marginalmente à história de IST. Neste estudo, notou-se, ainda, uma baixa concordância entre evidência sorológica e auto relato de vacinação (k = 0,17). Estes resultados revelam uma prevalência global elevada da infecção pelo HBV na população estudada e sua associação com comportamentos sexuais de risco e, em contraste, uma frequência baixa de vacinação contra hepatite B, evidenciando a necessidade de políticas públicas contínuas de saúde voltadas para os HSH, incluindo estratégias para aumentar a cobertura vacinal, além do monitoramento dos indivíduos portadores do HBV.

As enzimas CYP2D6, CYP2C19 e CYP2C9 são responsáveis pelo metabolismo de aproximadamente metade dos 200 medicamentos mais prescritos nos EUA. Padronizamos ensaios de genotipagem baseados na discriminação alélica com o sistema TaqMan® em 198 indivíduos. Para o gene CYP2D6, os alelos *1 e *2 foram os mais freqüentes, seguidos pelos alelos *4, *41, *35, *17, *5, *10, *6, *29 e *9. Desenvolvemos também uma nova metodologia para a determinação do número de cópias do gene CYP2D6. Para o gene CYP2C19, o alelo *1 foi o mais frequente, seguido pelos alelos *17, *2 e *3. Nosso estudo foi o primeiro a determinar a freqüência alélica do gene CYP2C19 no Brasil. Para o gene CYP2C9, o alelo *1 foi o mais frequente, seguido pelos alelos *2 e *3. Desenvolvemos uma metodologia reprodutível e acessível para a genotipagem dos polimorfismos principais dos genes CYP2D6, CYP2C19 e CYP2C9. A identificação precoce de indivíduos suscetíveis a efeitos adversos, bem como de metabolizadores rápidos pode trazer grandes benefícios aos pacientes possibilitando assim uma medicina personalizada. / The enzymes CYP2D6, CYP2C19 and CYP2C9 metabolize approximately half of the 200 most prescribed drugs in the USA. We standardized genotyping tests based on allelic discrimination, using TaqMan® genotyping system in 198 samples. For the CYP2D6 gene, allele *1 and *2 were the most frequent, followed by alleles *4, *4, *35, *17, *5, *10, *6, *29 and *9. We have also developed a new methodology for determining the copy number variations of the CYP2D6 gene. For the CYP2C19 gene, the allele *1 was the most common, followed by the alleles *17, *2 and *3. In our concern, our study was the first to determine the allele frequency of the CYP2C19 gene in Brazil. For CYP2C9 gene, the allele *1 was the most common followed by the alleles *2 and *3. We developed a methodology reproducible and accessible for genotyping the most important polymorphisms of the genes CYP2D6, CYP2C19 and CYP2C9. The previous identification of individuals at risk to develop adverse drug reactions as well as ultrarapid-metabolizers may bring benefits to the patients, leading to a personalized therapy.

O objetivo deste trabalho é propor uma nova metodologia de interpretação da estabilidade dos métodos de agrupamento, para dados de vegetação, utilizando a metodologia AMMI e a reamostragem (bootstrap), para ganhar confiabilidade nos agrupamentos formados. Os dados utilizados são provenientes do departamento de genética da Escola Superior de Agricultura \"Luiz de Queiroz\", e visam à produtividade de soja. Primeiramente aplica-se a metodologia AMMI e então, é estimada a matriz de distâncias euclidianas - com base nos dados originais e obtidos via reamostragem (bootstrap) - para a aplicação dos métodos de agrupamento (vizinho mais próximo, vizinho mais distante, ligação média, centroide, mediana e Ward). Para a verificação da validade dos agrupamentos formados utiliza-se o coeficiente de correlação cofenética, e pelo teste de Mantel, é apresentada a distribuição empírica dos coeficientes de correlação cofenética. Os agrupamentos obtidos pelos diferentes métodos são, em sua maioria, semelhantes indicando que, em princípio, qualquer um desses métodos seria adequado para a representação. O método que apresenta resultados discrepantes em relação aos outros (tanto para os dados originais, quanto pelos dados obtidos via bootstrap) - na representação gráfica em dendrograma - é método de Ward. Este estudo é promissor na análise da validade de agrupamentos formados em dados de vegetação. / The objective of this work is to propose a new interpretation methodology of clustering methods for vegetation data stability, using the AMMI and bootstrap methodology, to gain reliability in the clusters formed. The database used is from the Departament of Genetics of Luiz de Queiroz College of Agriculture, aiming soybean yield. Firstly AMMI is applied, then the Euclidian distance matrix is estimated - based on the original data and on the acquired by the bootstrap method - for the application of clustering methods (nearest neighbor, furthest neighbor, average linkage, centroid , median and Ward). In order to assess the validity of clusters formed the cophenetic correlation coefficient is used, and the Mantel test, in order to show the empirical distribution of the cophenetic correlation coefficients. The clusters obtained by different methods are, in most cases, quite similar, indicating that in principle, any of these methods would be suitable for the representation. The method that presents discrepant results (for both the original and bootstrap method obtained data) - on the dendrogram graphical representation, compared to the others - is the Ward\'s. This study is promising in the analysis of validity of clusters formed in vegetation data.

Neste trabalho apresenta-se a aplicação dos modelos AMMI para um estudo detalhado do efeito das interações entre genótipos e ambientes em experimentos multiambientais. Através da decomposição da soma de quadrados dessas interações, busca-se selecionar o número de termos que explicam essa interação, descartando o ruído presente na mesma. Há duas maneiras para a escolha desses termos: validação cruzada e teste de hipóteses. O foco será na validação cruzada pela vantagem de ser um critério &#34;preditivo&#34; de avaliação. São apresentados dois métodos de validação cruzada, métodos esses esboçados por Eastment e Krzanowski (1982) e Gabriel (2002). Esses métodos utilizam a decomposição por valores singulares para obter os autovalores referentes à matriz de interações, cuja soma de quadrados nos dá exatamente a soma de quadrados da interação. Como esses autovalores são superestimados ou subestimados (ARAÚJO; DIAS, 2002), essas técnicas de validação serão aperfeiçoadas através da correção desses autovalores e, para reordená-los, será utilizada a regressão isotônica. Será realizado um estudo comparativo entre esses métodos, através de dados reais. / This paper presents the application of AMMI models for a thorough study about the effect of the interaction between genotypes and environments in multi-environments experiments. Through the decomposition of the sum of squares of these interactions, one searches to select the number of terms that explains this interaction, discarding its noise in. There are two ways for choosing these terms: cross-validation and hypotheses test. The focus will be on the crossvalidation for its advantage of being one prediction criterion of evaluation. Two methods of cross-validation are presented , both outlined by Eastment and Krzanowski (1982) and Gabriel (2002). These methods use the decomposition by singular values in order to obtain eigenvalues referred to the matrix of interactions, whose sum of squares accurately gives us the sum of squares of the interation. As these eigenvalues either over- or underestimated (ARAÚJO; DIAS, 2002), these techniques of validation will be improved through the correction of these eigenvalues and, in order to rearrange them, isotonic regression will be used . A comparative study between these methods through real data will be carried out.