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Genetic evaluation of longevity in dairy cattle - A new model for an old trait / Genetic evaluation of longevity in dairy cattle - A new model for an old traitHeise, Johannes 03 May 2017 (has links)
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Estimation of genetic and phenotypic parameters for stillbirth in South African holstein cattleRatshivhombela, Phillipine Mulisa January 2020 (has links)
Thesis (M.Sc. Agriculture (Animal Production)) -- University of Limpopo, 2020 / Stillbirth is a trait of high economic importance in dairy cattle and is increasingly being
included in dairy cattle breeding objectives worldwide. In South Africa, however, there
is limited information on stillbirth that can be used to improve this trait genetically.
Currently, there are no estimated breeding values (EBVs) for any measures of calving
performance produced under the national genetic evaluation programme. The current
study was, therefore, conducted to assess the incidence of stillbirth and estimate the
genetic and environmental influences on maternal effects for stillbirth in South African
Holstein cattle, to enable estimation of breeding values for the trait. Data used in the
study comprised 13 143 calving records of 7 723 Holstein cows, from 41 herds,
participating in the National Dairy Animal Recording and Improvement Scheme during
the period 2014 to 2018. Incidence of stillbirth was determined using the PROC FREQ
procedure and environmental effects were tested by the General Linear Models (GLM)
procedure of Statistical Analysis System (SAS 9.4, 2016). Maternal heritability of
stillbirth was estimated by the Restricted Maximum Likelihood (REML) procedure,
using the ASReml software (Gilmour et al., 2018). The analyses were carried out using
a threshold animal model and a repeatability animal model, where the latter
considered stillbirth in different parities as repeated measures of the same trait.
Environmental effects significantly influencing stillbirth (p<0.05) were herd-year season of calving, dam parity and calf sex, and these were included in the model for
variance component estimation. Estimates of maternal heritability effects from the
threshold animal model were 0.12±0.04, 0.15±0.08 and 0.14±0.06 for parities 1 to 3,
respectively. The repeatability animal model gave a heritability estimate of 0.09±0.03
and a repeatability of 0.18±0.03. The moderate estimates of maternal heritability
indicate scope for reducing incidence of stillbirth by selectively breeding cows that are
less genetically predisposed to calving dead calves. Stillbirth in different parities should
not be considered as the same trait, as indicated by the low repeatability estimate.
Results of the current study estimate genetic parameters that are required to compute
accurate estimated breeding values (EBVs) for stillbirth, which will enable South
African Holstein farmers to select for reduced stillbirths, thus improving calving
performance / National Research Foundation (NRF),
University of Limpopo (UL) and
Department of Agriculture Forestry and Fisheries (DAFF)
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Les impacts de la sélection génomique sur les évaluations génétiques classiques / Impacts of genomic selection on classical genetic evaluationsPatry, Clotilde 09 December 2011 (has links)
Les évaluations génomiques apportent une information précoce et suffisamment précise pour choisir les jeunes taureaux dans les schémas de sélection des bovins laitiers, incitant à remplacer le long processus de testage sur descendance par une étape de sélection génomique.Dès lors, seuls les candidats sélectionnés ont des filles avec performances et participent aux évaluations génétiques classiques. Cependant, toutes les informations ayant servi à la sélection ne sont plus incluses dans l’analyse et l’estimation des valeurs génétiques par la méthode du BLUP (Best Linear Unbiased Prediction) peut être incorrecte.Les évaluations génétiques classiques restent indispensables pour l’évaluation des animaux non génotypés, pour la comparaison des taureaux à l’échelle mondiale, et pour le calcul des futures prédictions génomiques. Compte-tenu de la rapide intégration de la génomique dans les schémas de sélection des bovins laitiers, il était important d’en étudier les conséquences sur les évaluations génétiques classiques.A l’échelle nationale, nos simulations ont montré que les valeurs génétiques des taureaux retenus sur information génomique étaient systématiquement sous-estimées et moins précises quand l’étape de sélection génomique n’était pas prise en compte dans le modèle statistique. Pour éviter ce biais, une méthode a été testée avec succès : pour l’ensemble des candidats à la sélection, des pseudo-performances sont calculées à partir des index génomiques et analysées par le BLUP. Suivant la prise en compte ou non de l’étape de sélection génomique, les pays participant aux évaluations internationales peuvent fournir des données biaisées et/ou incomplètes, au risque de pénaliser fortement leurs propres taureaux dans les classements internationaux. La diversité des pratiques à l’échelle mondiale et l’interaction des possibles sources de biais dans les évaluations internationales rendent sa propagation incontrôlable et fortement dommageable.Il est donc nécessaire et urgent d’adapter les évaluations génétiques classiques pour prendre en compte l’information génomique et ses pratiques associées. Diverses approches récentes sont discutées afin de proposer des alternatives faciles à mettre en place dans les centres d’évaluation, permettant de maintenir des évaluations non biaisées mais aussi plus précises. / With the fast and wide development of genomic evaluations in dairy cattle, the design of breeding schemes has been modified and the long process of progeny testing is being replaced by an early and accurate genomic selection step.In the future, only selected candidates will get performances to be evaluated by the classical method of Best Linear Unbiased Prediction (BLUP). After a genomic selection step, information about the selection process is no longer complete, BLUP assumptions are violated and solutions, i.e., estimated breeding values, are feared to be incorrect.The aim of the thesis study was to consider the consequences of genomic selection on the classical genetic evaluations at the national and international levels.First, bias in national breeding values was assessed by repeated simulations. Estimated breeding values were systematically underestimated and less accurate after a genomic selection step not accounted for in genetic evaluation models.Secondly, a statistical procedure, a BLUP model with genomic pseudo-performances, was investigated to eliminate, with success, bias in estimated breeding values.In a third part, the consequences of genomic selection on international evaluations were studied by simulations. Bulls from the country sending incomplete and/or biased breeding values were the most penalized in international rankings.In conclusion, it is not only necessary but also urgent to prevent from bias in classical evaluations and therefore avoid harmful impacts on international comparisons, on future genomic evaluations, and more generally on selection efficiency. Alternative approaches were thus discussed to propose short and long term strategies for routine evaluations. Nevertheless, a main consequence of bias corrected breeding values is that all genetic predictions will include some genomic information in a near future: adaptations of evaluation methods are still required to optimally benefit from all types of information.
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Impacto da utilização da somatotropina bovina (bST) sobre a produção de leite e a avaliação genética de bovinos da raça Holandesa / Impact of bovine somatotropin (bST) on the milk yield and genetic evaluation of Holstein cattleRodrigues, Marcelo 18 February 2009 (has links)
O objetivo do presente trabalho foi estudar a influência do uso da somatotropina bovina (bST) sobre a produção de leite e a avaliação genética de bovinos da raça Holandesa. Para análise foram utilizados dados referentes a 474 touros e observações referentes a 3341 lactações de 1271 vacas, provenientes da Agropecuária Agrindus - S.A no estado de São Paulo no período de 1999 a 2003. Análise de variância (método dos quadrados mínimos) foi realizada pelo procedimento GLM do SAS® (2003), visando identificar o efeito da classe de aplicação do bST sobre a produção de leite aos 305 dias de lactação (PL305). Os valores genéticos preditos dos touros (PBV), componentes de variância e herdabilidade para a característica PL305 foram estimados utilizando-se um modelo animal a partir de duas análises; na primeira incluiu-se o efeito do bST como fixo e na segunda o referido efeito foi ignorado. Foram calculadas correlações de Spearman entre PBV dos touros para quatro conjuntos de touros avaliados: a) todos os touros; b) os melhores 20%; c) os melhores 10% e d) os melhores 5%. As médias da PL305 para as classes de bST foram 9175,11kg - sem bST, 9530,94kg - de 11 a 20 aplicações, 10150,57kg - de 21 a 30 aplicações e 11089,89 Kg de 31 a 59 aplicações. As herdabilidades foram respectivamente de 0,26±0,00 e 0,23±0,00 para as duas análises e as correlações entre os valores genéticos preditos para os conjuntos de touros a, b, c e d foram, respectivamente, 0,9484, 0,9829, 0,9752 e 0,8974. A análise de variância demonstrou as médias de PL305 aumentaram significativamente (P<0,0001), com o aumento do número de aplicações do bST. Os coeficientes de herdabilidade, embora relativamente baixos, indicam possível ganho genético, por meio de seleção, para produção de leite. As altas correlações de Spearman entre os valores genéticos dos touros, considerando-se ou não o uso do bST no modelo, indicam que o uso desta tecnologia não interfere na classificação dos touros avaliados geneticamente. / The aim of this study was to investigate the influence of the use of the bovine somatotropin (bST) on the milk production and the bovine genetic evaluation of Holstein cattle. Data regarding 474 bulls and observation concerning 3341 lactations of 1271 cows from the Agrindus Agriculture and Cattle Raising S.A. in the state of São Paulo, Brazil, between 1999 and 2003 were used for the analysis. The variance analysis (the minimum square method) was performed by the GLM procedure of the SAS® (2003) for identify the effects of the application class of the bST on the milk production at 305 days of lactation (PL305). For the bulls, the predicted breeding values (PBV), variance components and heritability for the PL305 characteristic were estimated using an animal model from two analyses; in the first, the bST was considered as fixed effect and in the second, the effect of bST was ignored. Spearman correlations between PBV for four sets of evaluated bulls were calculated: a) all bulls; b) the best 20%; c) the best 10% and d) the best 5%. The PL305 averages for the bST classes were 9175.11kg without bST; 9530.94kg from 11 to 20 applications; 10150.57kg from 21 to 30 applications; and 11089.89kg from 31 to 59 applications. The heritabilities were 0.26±0.00 and 0.23±0.00 respectively for both analyses and the correlations between the PBV for a, b, c, and d bull sets were, respectively, 0.9484, 0.9829, 0.9752 and 0.8974. The variance analysis demonstrated that the PL305 averages increased significantly (P<0.0001) with the increase of number of bST applications. The heritability coefficients, although relatively low, indicate a possible genetic gain, by selection, for milk production. The Spearman high correlations between the PBV of bulls, considering or not the bST use in the model, indicate that the use of this technology does not interfere in the genetically evaluated bulls classification.
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Modelos de dimensão finita e infinita para avaliação da produção de ovos em aves de posturaVenturini, Guilherme Costa [UNESP] 20 February 2009 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2009-02-20Bitstream added on 2014-06-13T18:29:29Z : No. of bitstreams: 1
venturini_gc_me_jabo.pdf: 314438 bytes, checksum: 32a3f00b923881d721cf605c82c08d7c (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Objetivou-se estimar parâmetros genéticos e fenotípicos da produção de ovos total e parcial em aves de postura por meio de modelos de dimensão finita e infinita, visando à seleção das aves para a característica produção de ovos. Utilizou-se dados de fêmeas, nascidas a partir de três incubações, provenientes de uma geração de uma linhagem de poedeiras, desenvolvida pela EMBRAPA Suínos e Aves em Concórdia, SC. A produção de ovos foi avaliada individualmente por meio do número de ovos, a partir de 20 até 70 semanas de idade. As produções foram divididas em períodos, sendo que cada período consistiu em três semanas de produção. As características estudadas foram os registros parciais nos períodos e o registro total da produção de ovos (PTOTAL). Para análise em modelo animal uni e bicaracterística, utilizou-se o programa computacional MTDFREML. Maior herdabilidade foi estimada para o período de 20 a 22 semanas de idade (P1) e PTOTAL (0,33 ± 0,07 e 0,23 ± 0,06). Correlações genéticas entre os períodos parciais e PTOTAL variaram de 0,42 ± 0,15 (PTOTAL com P2, de 20 a 22 semanas de idade) até 1,00 (PTOTAL com P9 e P11, de 44 a 46 e 50 a 52 semanas de idade, respectivamente). A correlação de Spearman entre as ordens dos 43 galos quanto aos valores genéticos para produção de P9, P10 (de 47 a 49 semanas de idade) e de P11 com PTOTAL foi significativa (p<0,001) para P9 e P11, igual a 1,00 e para P10 (p<0,0028), igual a 0,99. Concluiu-se que o registro parcial de ovos para os períodos P9, P10 e P11 poderiam ser considerados no processo de seleção visando à produção total de ovos. Porém, devido os mesmos apresentarem baixas estimativas de herdabilidade (0,06; 0,12 e 0,10, respectivamente para P9, P10 e P11) a seleção seria mais eficiente considerando o PTOTAL. Portanto, seria recomendada a seleção baseada na produção total de ovos, pois a mesma... / The aim was to estimate genetic and phenotypic parameters for total and partial records of egg production of laying hens using finite and infinite-dimension models, with a view to selecting birds for egg production. Data on females born from three incubations, from a generation of an egg-laying strain developed by EMBRAPA Suínos e Aves, Concórdia, SC, were used. Egg production was evaluated individually as the number of eggs produced between the ages of 20 and 70 weeks. The production was divided into three-week periods. The traits studied were the partial records for each period (P1 to P17) and the total recorded egg production (PTOTAL). For analysis in one and two-trait animal models, the MTDFREML software was used. Higher heritabilities were estimated for the periods of 20 to 22 weeks of age (P1) (0.33 ± 0.07) and PTOTAL (0.23 ± 0.06). The genetic correlations between the partial periods and PTOTAL ranged from 0.42 ± 0.15 (P1) to 1.00 (for P9 and P11, representing 44-46 and 50-52 weeks of age, respectively). Spearman’s correlation between the ranks of the 43 sires, regarding the genetic values for production in P9, P10 (47-49 weeks of age) and P11 in relation to PTOTAL, was significant and equal to 1.00 (P<0.001) for P9 and P11 and equal to 0.99 (P<0.0028) for P10. Although highly correlated with PTOTAL, these periods had low heritability estimates in two-trait analysis (0.06, 0.12 and 0.10, respectively for P9, P10 and P11). Thus, selection based on these partial periods would be inefficient and basing it on total egg production would be recommended, since this presented higher heritability estimates. To estimate the covariance functions using random regression models, the DXMRR option in the DFREML statistical software was used. The most appropriate model regarding goodness-of-fit of the egg production data in these laying hens was the one composed of third-order... (Complete abstract click electronic access below)
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Avaliação da endogamia em um programa de melhoramento de codornas de corte / Avaliation of inbreeding from a meat quail breeding programSousa, Mariele Freitas 13 February 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-02-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A total of 17,985 animals, within 8,746 quails from UFV1 strain and 9,239 from UFV2 strain, belonging to the Poultry Breeding Program of UFV were used to evaluate the effect of inbreeding on body weight characteristics at 28 and 42 days of age and egg production. The MTDFNRM (Multiple Trait Derivative Free Numerator Relationship Matrix) software, a system component of MTDFREML (Boldman et al., 1995), was used to process the records of the quails in numerical codes, so the identification number of the quail was always greater than the identification number of their parents, and to obtain the coefficient of inbreeding of it quail. The complete pedigree file was used to analyze the genetic structure of the population by mean of ENDOG v. 4.5 software (Gutiérrez and GOYACHE, 2008). The UFV1 strain showed an average F of 0.54%, anaverage relationship coefficient of 1.27% and 0.25% of increment or new inbreeding. The percentage of inbred this strain was 30.85% with an average F of 1.73%, ranging from 0.1% to 26.6%. The effective population size was 200.38 quails. The UFV2 strain showed an average F of 0.76%, an average relationship coefficient of 1.83% and 0.30% of increment or new inbreeding. The percentage of inbred quails for this strain was 45.54%, with an average F of 1.67%, ranging from 0.1% to 25.8%. The effective population size was 164.42. Inbreeding did not affect body weight at 28 and 42 days and egg production. The UFV genetic group 2 showed a lower effective population size, larger increment or new inbreeding, smaller effective population size than UFV1, requiring more accurate control in mating of the selected quails. / Foram utilizados dois grupos genéticos de codornas da subespécie Coturnix coturnix coturnix, totalizando 17985 aves, sendo 8746 da linhagem UFV1 e 9239 da linhagem UFV2, pertencentes ao Programa de Melhoramento de Codornas da Universidade Federal de Viçosa, com o objetivo de avaliar o efeito da endogamia nas características peso corporal das aves aos 28 e 42 dias de idade e produção de ovos. Utilizou-se o programa computacional MTDFNRM ("Multiple Trait Derivative Free Numerator Relationship Matrix"), componente do sistema MTDFREML (Boldman ET AL., 1995) para transformação dos registros dos animais em códigos numéricos, de modo que o número do animal sempre fosse maior que o número dos pais, e obter o coeficiente de endogamia das aves. O arquivo de pedigree completo foi utilizado para análise da estrutura genética da população, executada pelo programa ENDOG v. 4.5 (Gutiérrez E Goyache, 2008). O Grupo Genético UFV 1 apresentou um F médio de 0,54%, coeficiente de relação médio de 1,27% e 0,25% de incremento de endogamia. Do total de animais, 30,85% são endogâmicos, com um F médio de 1,73%, variando de 0,1% a 26,6 %. O tamanho efetivo encontrado foi de 200,38. O Grupo Genético UFV 2 apresentou um F médio de 0,76%, coeficiente de relação médio de 1,83% e 0,30% de incremento de endogamia. Do total de animais, 45,54% são endogâmicos, com um F médio de 1,67%, variando de 0,1% e 25,8 %. O tamanho efetivo encontradofoi de 164,42. A endogamia não influenciou nenhuma das características estudadas (peso corporal aos 28 e 42 dias e produção de ovos). O Grupo Genético UFV 2 apresentou menor tamanho efetivo, maior incremento de endogamia , menor número efetivo de fundadores e de ancestrais do que o UFV 1, requerendo maior controle nos acasalamentos das codornas selecionadas para reprodução.
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Estudo genético e quantitativo da contagem de células somáticas em bubalinos leiteiros /Mendoza-Sánchez, Geovanny. January 2007 (has links)
Resumo: Considerando-se que a contagem de células somáticas (CCS) de amostras de leite é um valioso indicador da saúde do úbere de búfalas, foi desenvolvido este trabalho com o objetivo de estimar a relação existente entre a CCS e a produção de leite (PL). Foram analisadas informações de 9404 amostras de controles de CCS e PL, referentes a 2198 lactações de animais da raça Murrah com idades entre 2 e 15 anos, filhas de 187 reprodutores, que ocorreram entre os anos 1997 e 2005. Para quantificar as perdas de PL em relação à CCS, nas análises de variância para a variável PL, foram incluídos no modelo os efeitos fixos de fazenda, ordem e ano de parto e estação do parto o escore da contagem de células somáticas (ECCS) como covariável, o efeito de animal dentro da fazenda foi considerado como aleatório. Para a estimação de parâmetros genéticos para a CCS, utilizaram-se "test day models", a média da contagem de células somáticas na lactação (CCSt270) e a produção de leite aos 270 dias (PL270); os componentes de (co) variância foram estimados usando método de máxima verossimilhança restrita. A CCS de cada mês da lactação foi considerada como uma característica distinta, em análises uni e bicaracterísticas, o modelo incluiu como efeitos aleatórios, o genético aditivo direto e de ambiente permanente e residual. Além disso, foram considerados como efeitos fixos: grupo de contemporâneos, número de controle e idade da vaca ao parto como covariável (efeito linear e quadrático). Para a CCSt nos diferentes meses, os grupos de contemporâneos foram definidos como... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Considering that the somatic cells count (SCC) of samples of milk is a valuable indicator of the health of the buffaloes' udder, this work was developed with the objective of estimating the relationship between SCC and milk yield (MY). Information on 9404 SCC and MY controls were analyzed. Data contained 2198 lactations of Murrah animals aging between 2 and 15 years, daughters of 187 sires, from 1997 and 2005. To quantify the decreases of MY in relation to SCC, the analyses of variance for the variable MY, included in the model a random animal effect nested in farm and the fixed effects of farm, order and year of parity and season of parity, somatic cells count score (SCCE) as covariate. For estimating genetic parameters for SCC, "test day models" were used. For average of somatic cells count in the lactation (SCCt270) and milk yield to 270 days (MY270); the (co) variance components were estimated using Restricted Maximum Likelihood (MTDFREML). SCCs of every month of lactation were considered as different traits in single and double trait analyses. The model included genetic additive, permanent environmental (for SCCt270 and for MY270) and residual random effects. Other fixed effects were: contemporary group; control number and age of cow at parity as a covariate (linear and quadratic effects). For CCSt, contemporary groups were defined as flock-year-month of the control, and for SCCt270 and MY270 as herd-year- season of the parity. x It was found that all effects influenced the expression of SCCE. For first parity females, no relationship between MY and SCC was found. The results indicated that the largest decreases were observed in females with more than one parity. This category... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Humberto Tonhati / Coorientador: Lenira El Faro Zadra / Coorientador: Mario Fernando Ceron Munoz / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Vera Lúcia Cardoso / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Doutor
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Estudo genético-quantitativo de características de crescimento, reprodução, carcaça e escores visuais em um rebanho nelore sob seleção para precocidade sexual / Genetic quantitative analisys for growth, reproductive, carcass and visual traits in a nellore cattle herd under selection for sexual precocityBrunes, Ludmilla Costa 23 February 2017 (has links)
Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-03-17T19:54:54Z
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Previous issue date: 2017-02-23 / The reproductive efficiency in cattle herds, as well as the anticipation of puberty, has positive
effects on zootechnical indexes and on the profitability of production systems. Thus, the aim
of this study was to estimate the genetic parameters and the genetic and phenotypic trends for
growth, carcass, and reproductive traits in a Nellore cattle herd under selection for sexual
precocity, given age at first conception and age at first calving as selection criterion.
Furthermore, this study also aimed to evaluate, using multivariate analyzes, which traits,
among growth, carcass and visual scores, better discern early pregnancy. Genetic parameters
were estimated for birth weight (BW), weight at 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365) and
450 (W450) days of age, average daily gain pre-weaning and post-weaning (ADGPRE e
ADGPOS), rib eye area (REA), backfat thickness (BF), rump fat thickness (RF), marbling
(MAR), hot carcass weight (HCW), weight of edible portion (WEP), scrotal circumference at
365 (SC365) and 450 (SC450) days of age, gestation length (LG), days open (DO), calving
interval (CI), real fertility (RF), cumulative productivity (CP), relation to weaning (RW), age
at first conception (AFCo) and age at first calving (AFCa). Data were provided by Vera Cruz
Ranch and the National Association of Breeders and Researchers (ANCP). The covariance
components were estimated using the Restricted Maximum Likelihood method, available on
BLUPF90 package, in univariate and bivariate analyzes using animal model. The heritability
estimated for BW (0.39), W120 (0.32), W210 (0.31), W365 (0.33), W450 (0.34), ADGPRE
(0.23), ADGPOS (0.27), REA (0.39), BF (0.34), RF (0.34), MAR (0.38), HCW (0.39), WEP
(0.39), SC365 (0.33), SC450 (0.33), LG (0.23), DO (0.34), CI (0.23), RF (0.21), CP (0.25),
RW (0.26), AFCo (0.21) and AFCa (0.24) indicated the possibility of genetic selection. The
maternal heritability estimated for BW (0.06), W120 (0.08), W210 (0.07), W365 (0.05),
W450 (0.11), ADGPRE (0.12), ADGPOS (0.08), SC365 (0.07) and SC450 (0.03) indicated
genetic effects of the dam on the progeny performance, until the post-weaning phase, for
growth traits. The genetic correlations estimated within growth traits, between growth and
carcass traits, within carcass traits and reproductive trait were favorable and of moderate
magnitude. The traits that indicate sexual precocity showed genetic correlation coefficients
ranging from -0.51 to -0.15, -0.62 to -0.33 and -0.61 to 0.14, between growth, carcass and
reproductive traits, respectively. Genetic correlation coefficients were, in most cases,
favorable. The genetic trends obtained showed, in general, the effectiveness of the adopted
selection criteria with satisfactory genetic gains. Selection for sexual precocity, based on age
at first conception, shall promote opposite direction genetic changes on growth, carcass and
reproductive traits, which is the desirable effect. Birth weight, fat thickness, bone structure,
musculature, rib depth, tail and rump insertion were the traits that presented greater
discrimination power for early pregnancy. Thus, these traits can be used as such management
targeting criteria and decision-making practices, in order to enable animals to express early
pregnancy, guiding the breeders in selecting females for sexual precocity. / A eficiência reprodutiva de bovinos, bem como a antecipação da puberdade, traz efeitos
positivos nos índices zootécnicos e também na rentabilidade dos sistemas de produção.
Assim, objetivou-se neste estudo estimar os parâmetros genéticos e tendências genéticas e
fenotípicas para características de crescimento, carcaça e reprodutivas, em um rebanho de
bovinos da raça Nelore sob seleção para precocidade sexual, tendo como critério de seleção as
características de idade à primeira concepção e ao primeiro parto. Além disso, objetivou-se
também avaliar, através de análises multivariadas, dentre as características de crescimento,
carcaça e escores visuais, quais discriminam a prenhez precoce. Foram estimados os
parâmetros genéticos para as características de peso a nascer (PN), peso aos 120 (P120), 210
(P210), 365 (P365) e 450 (P450) dias de idade, ganho médio diário pré e pós-desmame
(GMDPRE e GMDPOS), área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea
(EG), espessura de gordura subcutânea na garupa (EGP8), marmoreio (MAR), peso da
carcaça quente (PCQ), peso da porção comestível (PPC), perímetro escrotal aos 365 (PE365)
e 450 (PE450) dias de idade, período de gestação (PG), período de serviço (PS), intervalo de
parto (IDP), fertilidade real (FR), produtividade acumulada (PAC), relação do peso à
desmama (RD), idade à primeira concepção (IPC) e idade ao primeiro parto (IPP). Os dados
foram fornecidos pela Fazenda Vera Cruz e pelo Programa de Melhoramento Genético Nelore
Brasil, coordenado pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). Os
componentes de (co)variância foram obtidos por meio do método de Máxima
Verossimilhança Restrita, disponível no pacote BLUPF90, em análises uni e bicaracterísticas,
utilizando o modelo animal. As estimativas de herdabilidade obtidas para PN (0,39), P120
(0,32), P210 (0,31), P365 (0,33), P450 (0,34), GMDPRE (0,23), GMDPOS (0,27), AOL
(0,39), EG (0,34), EGP8 (0,34), MAR (0,38), PCQ (0,39), PPC (0,39), PE365 (0,33), PE450
(0,33), PG (0,23), PS (0,34), IDP (0,23), FR (0,21), PAC (0,23), RD (0,25), IPC (0,21) e IPP
(0,24) indicaram possibilidade de seleção genética e incorporação no rebanho. As estimativas
de herdabilidade materna para PN (0,06), P120 (0,08), P210 (0,07), P365 (0,05), P450 (0,11),
GMDPRE (0,12), GMDPOS (0,08), PE365 (0,07) e PE450 (0,03) indicaram efeitos genéticos
das matrizes no desempenho das progênies até a fase pós-desmame, para características de
crescimento. As correlações genéticas estimadas entre as características de crescimento, entre
crescimento e carcaça, entre as características de carcaça e entre as reprodutivas apresentaram
valores de moderada magnitude, sendo todos favoráveis. As características indicadoras de
precocidade sexual apresentaram coeficientes de correlação genética variando de -0,51 a -
0,15; de -0,62 a -0,33; e de -0,61 a 0,14, com as características de crescimento, carcaça e
reprodutivas, respectivamente. Os coeficientes de correlação genética foram, na maior parte
dos casos, favoráveis. As tendências genéticas obtidas no presente estudo demonstraram, de
modo geral, a eficácia da utilização dos critérios de seleção adotados, com ganhos genéticos
satisfatórios. A seleção para precocidade sexual, com base na idade à primeira concepção,
deverá promover mudanças genéticas no sentido contrário nas características de crescimento,
carcaça e reprodutivas, sendo este efeito desejável. As características de peso ao nascer,
espessura de gordura, ossatura, musculatura, profundidade, inserção da cauda e garupa foram
as que apresentaram maior poder de discriminação para a prenhez precoce. Assim, essas
características podem ser utilizadas como critérios de direcionamento de manejo e tomada de
decisões práticas, a fim de possibilitar que os animais expressem prenhez precoce, orientando
o criador na seleção prática de fêmeas para precocidade sexual.
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Impacto da utilização da somatotropina bovina (bST) sobre a produção de leite e a avaliação genética de bovinos da raça Holandesa / Impact of bovine somatotropin (bST) on the milk yield and genetic evaluation of Holstein cattleMarcelo Rodrigues 18 February 2009 (has links)
O objetivo do presente trabalho foi estudar a influência do uso da somatotropina bovina (bST) sobre a produção de leite e a avaliação genética de bovinos da raça Holandesa. Para análise foram utilizados dados referentes a 474 touros e observações referentes a 3341 lactações de 1271 vacas, provenientes da Agropecuária Agrindus - S.A no estado de São Paulo no período de 1999 a 2003. Análise de variância (método dos quadrados mínimos) foi realizada pelo procedimento GLM do SAS® (2003), visando identificar o efeito da classe de aplicação do bST sobre a produção de leite aos 305 dias de lactação (PL305). Os valores genéticos preditos dos touros (PBV), componentes de variância e herdabilidade para a característica PL305 foram estimados utilizando-se um modelo animal a partir de duas análises; na primeira incluiu-se o efeito do bST como fixo e na segunda o referido efeito foi ignorado. Foram calculadas correlações de Spearman entre PBV dos touros para quatro conjuntos de touros avaliados: a) todos os touros; b) os melhores 20%; c) os melhores 10% e d) os melhores 5%. As médias da PL305 para as classes de bST foram 9175,11kg - sem bST, 9530,94kg - de 11 a 20 aplicações, 10150,57kg - de 21 a 30 aplicações e 11089,89 Kg de 31 a 59 aplicações. As herdabilidades foram respectivamente de 0,26±0,00 e 0,23±0,00 para as duas análises e as correlações entre os valores genéticos preditos para os conjuntos de touros a, b, c e d foram, respectivamente, 0,9484, 0,9829, 0,9752 e 0,8974. A análise de variância demonstrou as médias de PL305 aumentaram significativamente (P<0,0001), com o aumento do número de aplicações do bST. Os coeficientes de herdabilidade, embora relativamente baixos, indicam possível ganho genético, por meio de seleção, para produção de leite. As altas correlações de Spearman entre os valores genéticos dos touros, considerando-se ou não o uso do bST no modelo, indicam que o uso desta tecnologia não interfere na classificação dos touros avaliados geneticamente. / The aim of this study was to investigate the influence of the use of the bovine somatotropin (bST) on the milk production and the bovine genetic evaluation of Holstein cattle. Data regarding 474 bulls and observation concerning 3341 lactations of 1271 cows from the Agrindus Agriculture and Cattle Raising S.A. in the state of São Paulo, Brazil, between 1999 and 2003 were used for the analysis. The variance analysis (the minimum square method) was performed by the GLM procedure of the SAS® (2003) for identify the effects of the application class of the bST on the milk production at 305 days of lactation (PL305). For the bulls, the predicted breeding values (PBV), variance components and heritability for the PL305 characteristic were estimated using an animal model from two analyses; in the first, the bST was considered as fixed effect and in the second, the effect of bST was ignored. Spearman correlations between PBV for four sets of evaluated bulls were calculated: a) all bulls; b) the best 20%; c) the best 10% and d) the best 5%. The PL305 averages for the bST classes were 9175.11kg without bST; 9530.94kg from 11 to 20 applications; 10150.57kg from 21 to 30 applications; and 11089.89kg from 31 to 59 applications. The heritabilities were 0.26±0.00 and 0.23±0.00 respectively for both analyses and the correlations between the PBV for a, b, c, and d bull sets were, respectively, 0.9484, 0.9829, 0.9752 and 0.8974. The variance analysis demonstrated that the PL305 averages increased significantly (P<0.0001) with the increase of number of bST applications. The heritability coefficients, although relatively low, indicate a possible genetic gain, by selection, for milk production. The Spearman high correlations between the PBV of bulls, considering or not the bST use in the model, indicate that the use of this technology does not interfere in the genetically evaluated bulls classification.
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Interação genótipo x ambiente via correlações genéticas entre rebanhos e normas de reação utilizando abordagem bayesiana em bovinos de corte / Genotype by environment interaction using genetic correlations between herds and reaction norms under bayesian approach in beef cattleRibeiro, Sandra 05 March 2010 (has links)
O presente estudo teve por objetivo estudar os efeitos da interação genótipo x ambiente sobre as características peso à desmama, peso ao sobreano e ganho de peso da desmama ao sobreano em bovinos da raça Nelore. Foram analisados 58.032 registros de peso à desmama ajustados para 205 dias (PD), 46.032 registros de peso ao sobreano ajustados para 550 dias (PS) e 45.844 registros de ganho de peso da desmama ao sobreano ajustados para 345 dias (GP), originários de três rebanhos distintos. Os dados foram submetidos a dois métodos de análises: no primeiro, processaram-se análises unicaracterísticas para os rebanhos individuais e para o conjunto formado pelos três rebanhos, e análises tri-características para os dados de cada rebanho, em que as mesmas características foram consideradas como variáveis distintas. Foi utilizado o programa GIBBS2F90, sob abordagem bayesiana. As estimativas dadas pelas médias dos coeficientes de herdabilidade para PD, PS e GP variaram de 0,09 a 0,24, 0,24 a 0,44 e 0,09 a 0,31, respectivamente. Nesta mesma ordem, as correlações genéticas das mesmas características nos diferentes ambientes variaram de 0,88 a 0,93, 0,85 a 0,98 e 0,75 a 0,97. As correlações entre as DEPs dos touros nos ambientes variaram de 0,97 a 0,99, 0,69 a 0,95 e 0,77 a 0,98 para PD, PS e GP, respectivamente. No segundo método, utilizou-se um modelo de regressão aleatória para descrever alterações nos valores genéticos dos animais em função do gradiente ambiental, formado pelos grupos contemporâneos. As análises foram feitas pelo programa INTERGEN, também sob enfoque bayesiano. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade para PD, PS e GP variaram de 0,06 a 0,44, 0,19 a 0,63 e 0,20 a 0,40, respectivamente. As correlações genéticas entre intercepto e inclinação das normas de reação foram de 0,75, para PD, 0,76 para PS e 0,34 para GP. As correlações entre os valores genéticos dos touros nos ambientes variaram de -0,38 a 0,99, 0,79 a 1,00 e 0,68 a 0,99 para PD, PS e GP, respectivamente. Os resultados de ambos os métodos apontaram efeito da interação genótipo x ambiente sobre as características nos rebanhos incluídos neste estudo, especialmente sobre a classificação dos touros. / The objective of the present study was to evaluate the genotype by environment interaction effect on weaning weight, post-weaning weight and post-weaning weight gain in Nellore cattle. It were analyzed 58,032 records of weaning weight adjusted for 205 days (PD), 46,032 records of post-weaning weight adjusted for 550 days (PS) and 45,844 records of post-weaning weight gain adjusted for 345 days (GP), originated from three distinct herds. Those data were analyzed applying two different methods: in the first proceeding, the data set of the three herds separately and the data set composed by all herds in one was submitted to single-trait analysis, while a three-trait analysis considered the same trait as a distinct variables in different herds. The variance components were estimated by GIBBS2F90, under bayesian inference. The estimates given by the means of heritability coefficients for PD, PS and GP ranged from 0.09 to 0.24, 0.24 to 0.44 and 0.09 to 0.31, respectively. In the same sequence, the genetic correlation among the same traits in different environments varied from 0.88 to 0.93, 0.85 to 0.98 and 0.75 to 0.97. The correlation between sire\'s EPDs in the environments ranged from 0.97 to 0.99, 0.69 a 0.95 and 0.77 to 0.98 for PD, PS and GP, respectively. In the second method, a random regression model was performed in order to describe changes in breeding values as a function of the gradient environment, arranged by contemporary groups. The analyses were performed by INTERGEN, also under bayesian inference. The estimates of heritability coefficients for PD, PS and GP ranged 0.06 to 0.44, 0.19 to 0.63 and 0.20 to 0.40, respectively. The genetic correlation between level and slope of reaction norms were 0.75 for PD, 0.76 for PS and 0.34 for GP. The correlation between sire\'s breeding values in the environments ranged from - 0.38 to 0.99, 0.79 to 1.00 and 0.68 to 0.99 for PD, PS and GP, respectively. The results of both methods shown effect of genotype by environment interaction over the traits in herds included in this study, especially over the ranking of sires.
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