Os objetivos deste trabalho foram estimar parâmetros genéticos, com os modelos mistos reprodutor e animal, para características reprodutivas contínuas e discretas, bem como, predizer os valores genéticos dos reprodutores para características reprodutivas contínuas e discretas em ovinos da raça Santa Inês. Foram analisadas as características reprodutivas intervalo de partos (IDP, N=1.066), fertilidade ao parto (FP, N=1.006) e número de cordeiros ao parto (NCP, N=3.593) de ovinos com partos ocorridos entre os anos de 1998 a 2005. A característica FP foi expressa na forma de fêmeas paridas em relação às fêmeas cobertas, sendo codificada como \"1\" se pariu e \"0\", caso contrário e NCP, representou o número de crias nascidas por ovelha parida, codificada como \"1\" (simples) e 2 (múltiplos). O modelo reprodutor apresentou a característica de superestimar as herdabilidades para as características reprodutivas em relação ao modelo animal. As estimativas de herdabilidades, obtidas por modelo animal linear, foram 0,12, 0,23 e 0,16 para NCP, FP e IDP, respectivamente. As estimativas de herdabilidades, obtidas por modelo animal de limiar, foram 0,16, 0,15 e 0,10 para NCP, FP e IDP, respectivamente. As estimativas das correlações genéticas pelo uso de modelo animal linear, foram 0,13 (entre NCP e FP) e -0,21 (entre NCP e IDP). Já as estimativas das correlações genéticas, quando utilizado modelo animal de limiar, foram 0,81 (entre NCP e FP) e -0,52 (entre NCP e IDP). As correlações entre os valores genéticos preditos para 258 reprodutores avaliados variaram de 0,4835 a 0,8561 entre os modelos reprodutor e animal obtidos por metodologia linear e de limiar. Este fato sugere a existência de alterações significativas nas classificações dos valores genéticos preditos dos reprodutores em função do tipo de modelo e da metodologia utilizada na avaliação genética. / The aims of this study were evaluated genetic parameters with sire and animal mixed models, to continuous and discreet reproductive traits, as well as predict sires breeding values to continuous and discreet reproductive traits in Santa Inês ewes breed. The traits analyzed in this study were lambing interval (LI, N = 1,066), fertility (FR, N = 1,006) and number of lambs born (NLB, N = 3,593) of ewes with birth occurred among 1998 to 2005. The FR trait was expressed in form of delivered females in respect to sheltered females, been codified as \"1\" delivered and \"0\" otherwise. The NLB trait represented the number of fully formed lambs born per ewe lambing, codified as \"1\" (simple) and \"2\" (multiples). The sire model showed super estimate comportment in respect to animal model for reproductive traits heritabilities. The estimates of heritability obtained by linear animal model were 0.12, 0.23 and 0.16 for NLB, FR and LI, respectively. The estimates of heritability obtained by threshold animal model were 0.16, 0.15 and 0.10 for NLB, FR and LI, respectively. The estimates of genetic correlations using linear animal model were 0.13 (between NLB and FR) and -0,21 (between NLB and LI). However, the estimates of genetics correlations using threshold animal model were 0.81 (between NLB and FR) and -0,52 (between NLB and LI). The Pearson correlations between predicted breeding values for 258 sires varying by 0.4835 to 0.8561 between sire and animal models obtained by linear and threshold methodology. This fact suggest the existence of significative changes on sires predicted breeding values classifications by virtue of model type and used methodology on genetic evaluation.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 508483 bytes, checksum: ed19e15dac174ba29cb7068c7f83a289 (MD5) Previous issue date: 2013-04-26 / The objective of this work was to verify the efficiency of Box-Cox and Blom scores transformations in correcting the phenotypic heterogeneity of variance adjusted weights of cattle Tabapuã the Brazilian Northeast to the factors producing regions, ages and sex. We used data Tabapuã the Brazilian Northeast, collected from 1970, from the control of weight development Brazilian Association of Zebu Breeders (ABCZ) with information concerning the weights adjusted to 205, 365 and 550 days of age. The Box-Cox and Blom scores transformations were used in an attempt to correct the heterogeneity of variances for the factors of production regions, ages and sex. Bartlett's test was applied before and after the transformation of the data to see if there was a reduction of heterogeneity of phenotypic variances. The Blom scores transformation was effective in reducing the coefficients of skewness and kurtosis and was more appropriate than the Box-Cox transformation to correct the phenotypic heterogeneity of variance between production regions, ages and sex, since produced significantly more favorable results. / O objetivo deste trabalho foi verificar a eficiência das transformações de Box- Cox e escores de Blom na correção da heterogeneidade de variâncias fenotípicas dos pesos ajustados de bovinos da raça Tabapuã do Nordeste brasileiro para os fatores regiões de produção, idades e sexos. Foram utilizados dados da raça Tabapuã do Nordeste brasileiro, coletados a partir de 1970, provenientes do controle de desenvolvimento ponderal da Associação Brasileira de Criadores de Zebuíno (ABCZ) com informações relativas a pesos ajustados para 205, 365 e 550 dias de idade. As transformações em escores de Blom e Box-Cox foram utilizadas na tentativa de corrigir a heterogeneidade de variâncias para os fatores regiões de produção, idades e sexos. O teste de Bartlett foi aplicado antes e após a transformação dos dados para verificar se houve redução da heterogeneidade de variâncias fenotípicas. A transformação em escores de Blom foi efetiva na redução dos coeficientes de assimetria e curtose e mostrou-se mais adequada do que a transformação de Box-Cox para correção da heterogeneidade de variâncias fenotípicas entre regiões de produção, idades e sexos, uma vez que apresentou um maior número de resultados favoráveis.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-11-05Bitstream added on 2014-06-13T19:02:48Z : No. of bitstreams: 1 mendozasanchez_g_dr_jabo.pdf: 284774 bytes, checksum: 92c1507cf74421e8e38247e70aded393 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Considerando-se que a contagem de células somáticas (CCS) de amostras de leite é um valioso indicador da saúde do úbere de búfalas, foi desenvolvido este trabalho com o objetivo de estimar a relação existente entre a CCS e a produção de leite (PL). Foram analisadas informações de 9404 amostras de controles de CCS e PL, referentes a 2198 lactações de animais da raça Murrah com idades entre 2 e 15 anos, filhas de 187 reprodutores, que ocorreram entre os anos 1997 e 2005. Para quantificar as perdas de PL em relação à CCS, nas análises de variância para a variável PL, foram incluídos no modelo os efeitos fixos de fazenda, ordem e ano de parto e estação do parto o escore da contagem de células somáticas (ECCS) como covariável, o efeito de animal dentro da fazenda foi considerado como aleatório. Para a estimação de parâmetros genéticos para a CCS, utilizaram-se “test day models”, a média da contagem de células somáticas na lactação (CCSt270) e a produção de leite aos 270 dias (PL270); os componentes de (co) variância foram estimados usando método de máxima verossimilhança restrita. A CCS de cada mês da lactação foi considerada como uma característica distinta, em análises uni e bicaracterísticas, o modelo incluiu como efeitos aleatórios, o genético aditivo direto e de ambiente permanente e residual. Além disso, foram considerados como efeitos fixos: grupo de contemporâneos, número de controle e idade da vaca ao parto como covariável (efeito linear e quadrático). Para a CCSt nos diferentes meses, os grupos de contemporâneos foram definidos como... / Considering that the somatic cells count (SCC) of samples of milk is a valuable indicator of the health of the buffaloes’ udder, this work was developed with the objective of estimating the relationship between SCC and milk yield (MY). Information on 9404 SCC and MY controls were analyzed. Data contained 2198 lactations of Murrah animals aging between 2 and 15 years, daughters of 187 sires, from 1997 and 2005. To quantify the decreases of MY in relation to SCC, the analyses of variance for the variable MY, included in the model a random animal effect nested in farm and the fixed effects of farm, order and year of parity and season of parity, somatic cells count score (SCCE) as covariate. For estimating genetic parameters for SCC, “test day models were used. For average of somatic cells count in the lactation (SCCt270) and milk yield to 270 days (MY270); the (co) variance components were estimated using Restricted Maximum Likelihood (MTDFREML). SCCs of every month of lactation were considered as different traits in single and double trait analyses. The model included genetic additive, permanent environmental (for SCCt270 and for MY270) and residual random effects. Other fixed effects were: contemporary group; control number and age of cow at parity as a covariate (linear and quadratic effects). For CCSt, contemporary groups were defined as flock-year-month of the control, and for SCCt270 and MY270 as herd-year- season of the parity. x It was found that all effects influenced the expression of SCCE. For first parity females, no relationship between MY and SCC was found. The results indicated that the largest decreases were observed in females with more than one parity. This category... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 410459 bytes, checksum: 9aa898e3c647385d90a7cb5f69a130fc (MD5) Previous issue date: 2008-02-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The data used in this study originates from 26835 and 27447 observations, from 3909 and 4040 meat quails of the UFV-1 and UFV-2 lineage, respectively, pertaining to the Program of Genetic Improvement of Poultry of the Federal University of Viçosa. The characteristic physical weight was evaluated in the two lineages, 1, 7, 14, 21, 28, 35 and 42 days of age, through random regression models. The modeling of the residual variance was evaluated first through classes of age, grouped as follows: CL1: homogeneous; CL2: 1 and 7-42 days; CL3: 1, 7 and 14-42 days; CL4: 1, 7, 14 and 21- 42 days; CL5: 1, 7, 14, 21 and 28-42 days; CL6: 1, 7, 14, 21, 28 and 35-42 days; CL7: 1, 7, 14, 21, 28, 35 and 42 days old and, subsequently, the adjustment order of the Legendre polynomial functions applied to the random regression models, were gradually increased (orders varying from 3 to 6), aiming to determine the least order of each random effect, which is necessary to describe (co)variance structures in function of time. Comparing the residue models through classes, increases were found in Loge L, significant (P <0,01) to the Liklihood Ratio Test (LRT), with an increase in the number of heterogeneous classes (CL7). In accordance with all the criteria used to evaluate the adjustment quality, the model considering homogeneity (CL1) of residual variances appeared unsuitable, as well as unicharacteristic (UNI) analysis model. The variance estimates, herdability and correlations were influenced by the modeling of the residual varaiance and by the polynomial adjustment function. The use of a Legendre polynomial function with orders 6 for a straight additive genetic effect and 5 for a constant animal effect, for lineage UFV-1 and 6 for both random effects on lineage UFV-2, must be used in the genetic evaluation of the growth curve of these quails. So, the heterogeneity use of residual variance and the appropriate adjustment order to each random effect to model the variances associated to the curve of the growth quail meat if it is necessary. / Os dados utilizados neste estudo são provenientes de 26835 e 27447 observações, de 3909 e 4040 codornas de corte das linhagens UFV-1 e UFV-2, respectivamente, pertencentes ao Programa de Melhoramento Genético de Aves da Universidade Federal de Viçosa. A característica peso corporal foi avaliada nas duas linhagens, aos 1, 7, 14, 21, 28, 35 e 42 dias de idade, por meio de modelos de regressão aleatória. A modelagem da variância residual foi avaliada primeiramente por meio de classes de idades, agrupadas como se seguem: CL1: homogênea; CL2: 1 e 7-42 dias; CL3: 1, 7 e 14-42 dias; CL4: 1, 7, 14 e 21-42 dias; CL5: 1, 7, 14, 21 e 28-42 dias; CL6: 1, 7, 14, 21, 28 e 35-42 dias; CL7: 1, 7, 14, 21, 28, 35 e 42 dias de idade e, posteriormente, as ordens de ajuste das funções polinomiais de Legendre, aplicadas aos modelos de regressão aleatória, foram gradualmente aumentadas (ordens variando de 3 a 6), visando determinar a ordem mínima de cada efeito aleatório, necessária para descrever as estruturas de (co)variâncias em função do tempo. Comparando as modelagens do resíduo por meio de classes, observaram-se aumentos no Loge L, significativos (P<0,01) pelo teste da razão de verossimilhança (LRT), com o aumento do número de classes heterogêneas (CL7). De acordo com todos os critérios utilizados para avaliar a qualidade de ajuste, o modelo considerando homogeneidade (CL1) de variâncias residuais mostrou-se inadequado, assim como o modelo de análise unicaracterística (UNI). As estimavas de variâncias, herdabilidades e correlações foram influenciadas pela modelagem da variância residual e pelo ajuste da função polinomial. A utilização de uma função polinomial de Legendre com as ordens 6 para efeito genético aditivo direto e 5 para efeito permanente de animal, para a linhagem UFV-1 e 6 para ambos efeitos aleatórios para a linhagem UFV-2, devem ser utilizados na avaliação genética da curva de crescimento dessas codornas. Portanto, a utilização de heterogeneidade de variância residual e a ordem de ajuste adequada a cada efeito aleatório para modelar as variâncias associadas à curva de crescimento de codornas de corte se fazem necessárias.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:55:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1554500 bytes, checksum: d9400566acf11c9dff69fd60fcda665e (MD5) Previous issue date: 2013-03-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Considering the importance of raising buffaloes to the national dairy farming, the objective of this study was to model variations in test-day milk yield (TDMY) during the first lactation of Murrah buffaloes by random regression models (RRM), using orthogonal Legendre polynomials (POL) and linear B-splines (BSP). A total of 15,161 test-day records from 1,158 first lactations of Murrah buffaloes breed from herds belonging to São Paulo state, Brazil, with calving recorded from 1988 to 2005, were analyzed. For TDMY, 38 weekly classes of lactation days were considered and analyzed using a single-trait RRM, including the additive genetic, permanent environmental and residual random effects. In addition, contemporary group, linear and quadratic effects of the covariate age of the buffalo at birth, number of milkings and mean lactation curve of the population, modeled using a fourth-order orthogonal Legendre polynomials, were included as fixed effects. Covariance functions of additive genetic and permanent environmental regression coefficients were equally modeled by POL (3th to 6th order) or linear BPL (4 to 6 knots). Residual variances were modeled considering 9 classes uniformly spaced. The (co)variance components of parameters were estimated by Bayesian inference, using the GIBBS3F90 software. The convergence of Gibbs chains was verified by graphic inspection and using BOA package from the R program. The post-gibbs analyses were performed using the POSTGIBBS1F90 software. The selection of the models was based on deviance information criterion (DIC). The average TDMY was 6.31±2.13 kg. The sixth order POL and six-knot BSP (knots at 8, 29, 57, 120, 239 and 267 days), with highest degree of complexity (51 parameters) were considered as the most suitable to describe the TDMY variation. The genetic parameters presented similar tendencies for both models, excepted for genetic variances and heritability, which showed low estimates at first lactation weeks for model BSP6. It was possible realize that, despite the low correlation between the predicted breeding value for 270-day milk yield and lactation persistency, the best models classified the bulls similarly. The results indicate that linear B-spline function with six knots was the most appropriate RRM to genetic evaluation of TDMY of Murrah buffaloes, given that parcimonious models with higher computational advantages to model variations of TDMY are most sought, and given the better control of heritability estimates of the edges of the lactation curve. / Ao considerar a crescente importância da bubalinocultura na pecuária leiteira nacional, objetivou-se com o presente estudo modelar as variações da produção de leite no dia de controle (PLDC) de búfalas da raça Murrah por meio de modelos de regressão aleatória (polinômios ortogonais de Legendre POL e B-splines BSP lineares). Para tanto, foram analisados 15161 registros semanais de PLDC provenientes da primeira lactação de 1158 búfalas da raça Murrah, com partos registrados entre os anos de 1988 a 2005 e pertencentes a rebanhos do estado de São Paulo, Brasil. As PLDC foram divididas em 38 classes semanais e analisadas considerando modelo animal de regressão aleatória - que incluiu efeitos aleatórios genético-aditivo, de ambiente permanente e residual. Adicionalmente, incluíram-se efeitos fixos de grupo de contemporâneo, a covariável idade da búfala ao parto (efeito linear e quadrático), número de ordenhas e as médias dos coeficientes da curva de lactação representativa da população (sendo esta ajustada por meio de POL de 4ª ordem). As funções de covariâncias relativas aos coeficientes de regressão aleatória dos efeitos genético-aditivo e de ambiente permanente foram igualmente modeladas por meio de POL (3ª à 6ª ordem) ou BSP lineares (4 a 6 nós). A estrutura residual foi considerada heterogênea, contendo nove classes de variâncias. Os componentes de (co)variância dos parâmetros foram estimados via inferência bayesiana, utilizando o programa GIBBS3F90. A convergência das cadeias de Gibbs foi verificada por meio de inspeção gráfica e o pacote BOA, do programa R. As análises pós-gibbs foram feitas utilizando o POSTGIBBS1F90. A seleção dos melhores modelos se deu pela utilização do critério de informação da deviance (DIC). A média de PLDC foi igual a 6,31±2,13 kg. Os modelos POL de sexta ordem POL6, e BSP com seis nós BSP6 (8, 29, 57, 120, 239, 267 dias), com maior número de parâmetros (51) foram considerados os melhores para descrever a variação da PLDC ao longo da lactação. De modo geral, os parâmetros genéticos apresentaram tendências semelhantes para estes modelos, à exceção das estimativas de variância genética aditiva e herdabilidade, menores nas primeiras semanas de lactação para o modelo BSP6. Verificou-se que, apesar de pouco correlacionados, os valores genéticos preditos para produção de leite aos 270 dias e persistência da lactação para os melhores modelos classificam os reprodutores de forma similar. O MRA mais recomendável para avaliação genética da PLDC de búfalos da raça Murrah é uma função B-spline (com seis nós), haja vista a procura por modelos mais parcimoniosos e com maiores vantagens computacionais para modelar variações da PLDC de búfalas da raça Murrah; e dado maior controle das estimativas de herdabilidade referentes aos extremos na curva de lactação.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:55:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2381950 bytes, checksum: 3e57a6a4857e06c924b3a18669ef4389 (MD5) Previous issue date: 2013-08-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / This study aimed to compare different scenarios including methods of selection, mating and sexual reasons economic interest characteristics of quails in the long term. Were simulated for each trait (slaughter weight, carcass yield and mortality) different genomes similar to the European quail through the computer program GENESYS. From each genome was originally obtained from a population base of 1200 patients (600 males and 600 females) heterozygotes with no relationship to one another. Subsequently, the initial population was formed by random sampling and mating of 204 males and 204 females obtaining an initial population of 2040 individuals corresponding to an average number of offspring per female 10. Formed after the initial populations began the formation of the selected populations, a total of 24 for each characteristic, corresponding to scenarios formed by two selection methods (SI= Single and BP= BLUP), four sex ratios (D1= 204 males: 204 females; D2= 102 males: 204 females; D3= 68 males: 204 females, and D4= 51 males: 204 females) and three mating systems (RAA= Players randomly mated; EIC= Deleting Brothers Completion; EICMI= Deleting Brothers Full and Half-Brothers) over 20 generations with 10 repetitions. Populations under selection were compared using the parameters: phenotypic value, the average coefficient of inbreeding, fixation of favorable and unfavorable alleles and selection limit. It was observed that the method of selection, the phenotypic values were generally higher for the BLUP, especially in the characteristic slaughter weight. However, individuals undergoing BLUP resulted in higher increase in inbreeding coefficient, the greater percentage of fixation favorable and unfavorable alleles and greater reduction in threshold selection. The increase in sex ratios mainly influenced coefficients of inbreeding within the population. Mating systems that excluded the crossing among relatives (EIC and EICMI) were instrumental in reducing inbreeding, besides providing an increased fixation of favorable alleles and reduction in unfavorable allele fixation and selection limit. / Objetivou-se comparar diferentes cenários incluindo métodos de seleção, tipos de acasalamento e razões sexuais em características de interesse econômico de codornas de corte a longo prazo. Foram simulados para cada característica (peso ao abate, rendimento de carcaça e mortalidade) diferentes genomas similares ao da codorna européia por meio do programa computacional GENESYS. A partir de cada genoma foi obtido inicialmente uma população base de 1200 indivíduos (600 machos e 600 fêmeas) heterozigotos sem nenhum parentesco entre si. Posteriormente, foi formada a população inicial através da amostragem e acasalamento aleatório de 204 machos e 204 fêmeas obtendo uma população inicial de 2040 indivíduos correspondentes a um número médio de 10 descendentes por fêmea. Depois de formadas a populações iniciais, teve início à formação das populações de seleção, num total de 24 para cada característica, correspondendo aos cenários formados por dois métodos de seleção (SI= Individual e BP= BLUP), quatro razões sexuais (D1= 204 machos: 204 fêmeas; D2= 102 machos: 204 fêmeas; D3= 68 machos: 204 fêmeas; e D4= 51 machos: 204 fêmeas) e três sistemas de acasalamento (RAA= Reprodutores Acasalados Aleatoriamente; EIC= Exclusão de Irmãos Completos; EICMI= Exclusão de Irmãos Completos e Meio-Irmãos) ao longo de 20 gerações com 10 repetições. As populações sob seleção foram comparadas através dos parâmetros: valor fenotípico, coeficiente médio de endogamia, fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis e limite da seleção. Observou-se que quanto ao método de seleção, os valores fenotípicos médios em geral foram superiores para o BLUP, principalmente na característica peso ao abate. Entretanto, os indivíduos submetidos ao BLUP resultaram em maior incremento do coeficiente de endogamia, maior percentagem de fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis e a maior redução no limite de seleção. O aumento das razões sexuais influenciou principalmente os coeficientes de endogamia dentro da população. Os sistemas de acasalamento que excluíram o cruzamento entre aparentados (EIC e EICMI) foram determinantes na redução da endogamia, além de proporcionarem um aumento da fixação de alelos favoráveis e redução na fixação de alelos desfavoráveis e no limite da seleção.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:55:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 852599 bytes, checksum: bd1bf419a690cadd03e8fd6652ce22d3 (MD5) Previous issue date: 2013-07-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objective of this study was to analyse the structure of population, genetic tendency and evaluate the effect of inbreeding ongrowth and production traits of meat type quail selected by weigth. Strains UFV1 and UFV2, from Universidade Federal de Viçosa, was used to calculate inbreeding coefficient (F) and effective population size (Ne), totalizing 12.965 animals and 11generations from UFV1 and 18.273 animals and 17 generations from UFV2. The software Endog was used to calculate the genetic structure of population. The software Wombat was used to predict breeding values for growth and production traits using a bicharacteristicmodel. Traits were birth weight (P1), body weight at 28 days (P28), average egg weight up to 112 days of age (POM112), number of eggs up to 112 days (NO112) and egg mass up to 112 days (MO112).Also, general linear models (GLM) were used to analyze effects of generation on genetic value and the effects of inbreeding on genetic value traits. All regressions was tested for significance (P < 0.05) using the software SAS. The UFV1 strain showed an average F of 0,79% and Ne 330,18. UFV2 strain showed an average F of 1,85% and Ne 194,58. The effect of generations on inbreeding and effect of generations on average of genetic value was quadratic, for both strains. The inbreeding presented a quadratic effect on genetic value, for all traits and strains. The genetic gain with body weight selection was superior to losses by inbreeding depression. Animals with inbreeding over than 13% have suffered the effects of inbreeding depression for P1, P28 and POM112. / Objetivou-se, com este trabalho, fazer um estudo da estrutura da população, bem como uma análise da tendência genética e avaliação do efeito da endogamia sobre características de crescimento e produção de ovos de duas linhagens de codornas de corte submetidas a seleção por peso. Foi utilizado um banco de dados das linhagens,UFV1 e UFV2, provenientes do programa de melhoramento genético de codornas de corte da Universidade Federal de Viçosa. Para cálculo da endogamia e estrutura de população através do programa Endog, foram utilizadas 11 gerações da UFV1, totalizando 12.965 animais, e 17 gerações da UFV2, totalizando 18.373 animais. Os valores genéticospara as características de crescimento e produção foram preditos através do programa WOMBAT, usando um modelo bicaracterística. As características foram peso ao nascimento (P1), peso aos 28 dias (P28), peso médio do ovo até 112 dias(POM112), número de ovos até 112 dias (NO112) e massa de ovos até 112 dias (MO112).Para estudo de tendência genética foi testada regressão linear e quadrática do valor genético em função das gerações avaliadas. Para estudo do efeito da endogamia sobre as características, foram testadas regressões linear e quadrática do valor genético das características avaliadas em função da taxa de endogamia (F%). A significância das regressões obtidas, utilizando o programa SAS, foi avaliada ao nível de 5% de probabilidade. Para a linhagem UFV1, a taxa de endogamia média foi 0,79% e tamanho efetivo de população 330,18.Para a linhagem UFV2, o coeficiente de endogamia médio foi 1,85% e o tamanho efetivo 194,58. A endogamia média em função das gerações apresentou efeito quadrático para as duas linhagens. O valor genético em função das gerações apresentou efeito quadrático para todas as características e linhagens. O valor genético em função da taxa de endogamia apresentou efeito quadrático para todas as características e linhagens. O ganho genético obtido com a seleção foi superior às perdas por depressão endogâmica. Animais com endogamia superior a 13% sofreram efeitos da depressão endogâmica para P1, P28 e POM112.

Submitted by Liliane Ferreira (ljuvencia30@gmail.com) on 2018-11-19T11:21:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Taynara Raimundo Martins - 2018.pdf: 8253406 bytes, checksum: a7da32a235e58e0bd75d8ec73ca6bb5a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-19T11:43:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Taynara Raimundo Martins - 2018.pdf: 8253406 bytes, checksum: a7da32a235e58e0bd75d8ec73ca6bb5a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-19T11:43:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Taynara Raimundo Martins - 2018.pdf: 8253406 bytes, checksum: a7da32a235e58e0bd75d8ec73ca6bb5a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-09-19 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / The search for more efficient and profitable production systems is well connected with the choice of genetic resources that optimize genetic trinomics, nutrition and sanity. Measuring the density of the resources, we have a Senepol breed, an adapted taurine, which represents an interesting option of use. As this breed as controller of genetic parameters for economic aspects is non-existent, the focus of this work is the estimation of the genetic parameters of the growth, reproductive and carcass traits of Senepol cattle. The parameters for the traits of birth weight (BW), weight at 120 days of age (W120), weaning weight (WW), yearling age weight (YW), scrotal circumference overhead (SC), backfat thickness (BF), rib eye area (REA) and slaughter conformation at yearling age (SCY). The themes were used, group of contemporaries, and age of cow at birth as covariate. maternal and residual permanent environment. As for post-weaning characteristics, the maternal genetic effect of the permanent environment and the age of the cow as a covariate were not included. Consider null covariance between the direct and maternal twins. The (co) variance components were obtained, using the GIBBS2F90 software, assuming an animal model for 4 traits (BW, W120, WW and YW) and another one for 5 traits (YW, SC, BF, REA and SCY). The following statistics were obtained for BW (0.19), W120 (0.22), WW (0.15), YW (0.23), SC (0.25), BF (0.11), REA (0.26) and SCY (0.12) indicated the probability of genetic selection and incorporation in the herd. As for the occurrence of maternal herds for BW (0,09), W120 (0,11) and WW (0,10), genetic alterations of the progenies were recorded. Genetic variations between growth variables ranged from 0.49 to 0.94 and between growth traits, the rate of change from 0.17 to 0.81. Genetic conditions between reproductive and starting traits were low from 0.02 to 0.17. The coefficients of genetic correlations, in general, were favorable. The result is that there is a genetic variability among cattle of the breed and that the selection of the genetic gene is part of the selection process. This study will make it possible to better delineate the Senepol breed breeding program, thus providing a better response to breed selection. / A busca por sistemas de produção mais eficientes e rentáveis, está inteiramente relacionada com a escolha de recursos genéticos que otimizem o trinômio genética, nutrição e sanidade. Mediante a diversidade desses recursos, tem-se a raça Senepol, um taurino adaptado, que representa uma interessante opção de utilização. Como nessa raça as estimativas de parâmetros genéticos para características de interesse econômico são escassas, o foco deste trabalho foi estimar os parâmetros genéticos das características de crescimento, reprodutivas e de carcaça de bovinos da raça Senepol. Foram estimados parâmetros genéticos para as características de peso ao nascer (PN), peso aos 120 dias de idade (P120), peso a desmama (PD), peso ao sobreano (PS), perímetro escrotal ao sobreano (PES), espessura de gordura subcultânea (EGS), área de olho de lombo (AOL) e conformação frigorífica ao sobreano (CFS). Dois modelos foram utilizados, sendo um para as características pré-desmama, que incluiu como efeito fixo, grupo de contemporâneos, e idade da vaca ao parto como covariável (efeito linear e quadrático) e como efeitos aleatórios foram considerados os efeitos genéticos direto, materno, ambiente permanente materno e residual. Já para as características pós-desmama, não foi incluso o efeito genético materno, de ambiente permanente materno. Considerou- se covariância nula entre os efeitos genéticos diretos e maternos. Os componentes de (co)variância foram obtidos, empregando-se o software GIBBS2F90, assumindo um modelo animal para 4 características (PN, P120, PD e PS) e outro para 5 características (PS, PES, EGS, AOL e CFS). As estimativas de herdabilidades diretas encontradas para PN (0,19), P120 (0,22), PD (0,15), PS (0,23), PES (0,25), EGS (0,11), AOL (0,26) e CFS (0,12) foram de baixa a média magnitude e indicaram possibilidade de seleção genética e incorporação no rebanho. Já as estimativas de herdabilidades maternas para PN (0,09), P120 (0,11) e PD (0,10) de baixa magnitude, indicando efeitos genéticos das matrizes no desempenho das progênies. As correlações genéticas das características de crescimento variaram de 0,49 a 0,94 e entre as características de crescimento, carcaça e reprodutiva variaram de 0,17 a 0,81. As associações genéticas entre as características reprodutivas e de carcaça foram baixas 0,02 a 0,17. Os coeficientes de correlações genéticas, de modo geral, foram favoráveis. Esses resultados apontam que há variabilidade genética entre os bovinos da raça Senepol e que ao selecionar para determinada característica de crescimento, haverá seleção nas demais, indicando a possibilidade de progresso genético se as mesmas forem incluídas como critérios de seleção. Este estudo possibilitará que seja melhor delineado o programa de melhoramento genético da raça Senepol no Brasil, proporcionando assim, uma maior resposta a seleção na raça.

O presente estudo teve por objetivo estudar os efeitos da interação genótipo x ambiente sobre as características peso à desmama, peso ao sobreano e ganho de peso da desmama ao sobreano em bovinos da raça Nelore. Foram analisados 58.032 registros de peso à desmama ajustados para 205 dias (PD), 46.032 registros de peso ao sobreano ajustados para 550 dias (PS) e 45.844 registros de ganho de peso da desmama ao sobreano ajustados para 345 dias (GP), originários de três rebanhos distintos. Os dados foram submetidos a dois métodos de análises: no primeiro, processaram-se análises unicaracterísticas para os rebanhos individuais e para o conjunto formado pelos três rebanhos, e análises tri-características para os dados de cada rebanho, em que as mesmas características foram consideradas como variáveis distintas. Foi utilizado o programa GIBBS2F90, sob abordagem bayesiana. As estimativas dadas pelas médias dos coeficientes de herdabilidade para PD, PS e GP variaram de 0,09 a 0,24, 0,24 a 0,44 e 0,09 a 0,31, respectivamente. Nesta mesma ordem, as correlações genéticas das mesmas características nos diferentes ambientes variaram de 0,88 a 0,93, 0,85 a 0,98 e 0,75 a 0,97. As correlações entre as DEPs dos touros nos ambientes variaram de 0,97 a 0,99, 0,69 a 0,95 e 0,77 a 0,98 para PD, PS e GP, respectivamente. No segundo método, utilizou-se um modelo de regressão aleatória para descrever alterações nos valores genéticos dos animais em função do gradiente ambiental, formado pelos grupos contemporâneos. As análises foram feitas pelo programa INTERGEN, também sob enfoque bayesiano. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade para PD, PS e GP variaram de 0,06 a 0,44, 0,19 a 0,63 e 0,20 a 0,40, respectivamente. As correlações genéticas entre intercepto e inclinação das normas de reação foram de 0,75, para PD, 0,76 para PS e 0,34 para GP. As correlações entre os valores genéticos dos touros nos ambientes variaram de -0,38 a 0,99, 0,79 a 1,00 e 0,68 a 0,99 para PD, PS e GP, respectivamente. Os resultados de ambos os métodos apontaram efeito da interação genótipo x ambiente sobre as características nos rebanhos incluídos neste estudo, especialmente sobre a classificação dos touros. / The objective of the present study was to evaluate the genotype by environment interaction effect on weaning weight, post-weaning weight and post-weaning weight gain in Nellore cattle. It were analyzed 58,032 records of weaning weight adjusted for 205 days (PD), 46,032 records of post-weaning weight adjusted for 550 days (PS) and 45,844 records of post-weaning weight gain adjusted for 345 days (GP), originated from three distinct herds. Those data were analyzed applying two different methods: in the first proceeding, the data set of the three herds separately and the data set composed by all herds in one was submitted to single-trait analysis, while a three-trait analysis considered the same trait as a distinct variables in different herds. The variance components were estimated by GIBBS2F90, under bayesian inference. The estimates given by the means of heritability coefficients for PD, PS and GP ranged from 0.09 to 0.24, 0.24 to 0.44 and 0.09 to 0.31, respectively. In the same sequence, the genetic correlation among the same traits in different environments varied from 0.88 to 0.93, 0.85 to 0.98 and 0.75 to 0.97. The correlation between sire\'s EPDs in the environments ranged from 0.97 to 0.99, 0.69 a 0.95 and 0.77 to 0.98 for PD, PS and GP, respectively. In the second method, a random regression model was performed in order to describe changes in breeding values as a function of the gradient environment, arranged by contemporary groups. The analyses were performed by INTERGEN, also under bayesian inference. The estimates of heritability coefficients for PD, PS and GP ranged 0.06 to 0.44, 0.19 to 0.63 and 0.20 to 0.40, respectively. The genetic correlation between level and slope of reaction norms were 0.75 for PD, 0.76 for PS and 0.34 for GP. The correlation between sire\'s breeding values in the environments ranged from - 0.38 to 0.99, 0.79 to 1.00 and 0.68 to 0.99 for PD, PS and GP, respectively. The results of both methods shown effect of genotype by environment interaction over the traits in herds included in this study, especially over the ranking of sires.

Os objetivos deste trabalho foram estimar parâmetros genéticos, com os modelos mistos reprodutor e animal, para características reprodutivas contínuas e discretas, bem como, predizer os valores genéticos dos reprodutores para características reprodutivas contínuas e discretas em ovinos da raça Santa Inês. Foram analisadas as características reprodutivas intervalo de partos (IDP, N=1.066), fertilidade ao parto (FP, N=1.006) e número de cordeiros ao parto (NCP, N=3.593) de ovinos com partos ocorridos entre os anos de 1998 a 2005. A característica FP foi expressa na forma de fêmeas paridas em relação às fêmeas cobertas, sendo codificada como \"1\" se pariu e \"0\", caso contrário e NCP, representou o número de crias nascidas por ovelha parida, codificada como \"1\" (simples) e 2 (múltiplos). O modelo reprodutor apresentou a característica de superestimar as herdabilidades para as características reprodutivas em relação ao modelo animal. As estimativas de herdabilidades, obtidas por modelo animal linear, foram 0,12, 0,23 e 0,16 para NCP, FP e IDP, respectivamente. As estimativas de herdabilidades, obtidas por modelo animal de limiar, foram 0,16, 0,15 e 0,10 para NCP, FP e IDP, respectivamente. As estimativas das correlações genéticas pelo uso de modelo animal linear, foram 0,13 (entre NCP e FP) e -0,21 (entre NCP e IDP). Já as estimativas das correlações genéticas, quando utilizado modelo animal de limiar, foram 0,81 (entre NCP e FP) e -0,52 (entre NCP e IDP). As correlações entre os valores genéticos preditos para 258 reprodutores avaliados variaram de 0,4835 a 0,8561 entre os modelos reprodutor e animal obtidos por metodologia linear e de limiar. Este fato sugere a existência de alterações significativas nas classificações dos valores genéticos preditos dos reprodutores em função do tipo de modelo e da metodologia utilizada na avaliação genética. / The aims of this study were evaluated genetic parameters with sire and animal mixed models, to continuous and discreet reproductive traits, as well as predict sires breeding values to continuous and discreet reproductive traits in Santa Inês ewes breed. The traits analyzed in this study were lambing interval (LI, N = 1,066), fertility (FR, N = 1,006) and number of lambs born (NLB, N = 3,593) of ewes with birth occurred among 1998 to 2005. The FR trait was expressed in form of delivered females in respect to sheltered females, been codified as \"1\" delivered and \"0\" otherwise. The NLB trait represented the number of fully formed lambs born per ewe lambing, codified as \"1\" (simple) and \"2\" (multiples). The sire model showed super estimate comportment in respect to animal model for reproductive traits heritabilities. The estimates of heritability obtained by linear animal model were 0.12, 0.23 and 0.16 for NLB, FR and LI, respectively. The estimates of heritability obtained by threshold animal model were 0.16, 0.15 and 0.10 for NLB, FR and LI, respectively. The estimates of genetic correlations using linear animal model were 0.13 (between NLB and FR) and -0,21 (between NLB and LI). However, the estimates of genetics correlations using threshold animal model were 0.81 (between NLB and FR) and -0,52 (between NLB and LI). The Pearson correlations between predicted breeding values for 258 sires varying by 0.4835 to 0.8561 between sire and animal models obtained by linear and threshold methodology. This fact suggest the existence of significative changes on sires predicted breeding values classifications by virtue of model type and used methodology on genetic evaluation.