Intensive aquaculture of Atlantic cod is fast developing in both Northern Europe and Canada. The last six years have seen major improvements in the larval rearing protocols and husbandry techniques for this species. Although breeding programmes are currently being developed by both governmental and private institutions in the main cod producing countries (i.e. Norway, Iceland and Canada), most hatcheries still rely on the mass spawning of their own broodstock. Mass spawning tanks are complex systems where fish are left to spawn naturally and fertilised eggs are collected with the overflowing water, with little or no control over the matings of the animals. Few published studies in other commercial marine species (i.e. turbot and sole) have attempted to analyse the output from such systems using microsatellite markers and several parentage analysis software programs. A review of these publications exposed a lack of consistency in the methods used to analyse such complex datasets. This problem was addressed by carrying out a detailed comparison of two analytical principals (i.e. assignment by strict exclusion and assignment by probabilities) and four parentage software programmes (i.e. FAP, VITASSIGN, CERVUS and PAPA), using the DNA profiles, at 5 loci, from 300 cod fry issued from the mass spawning of a large hatchery cod broodstock tank (consisting of 99 fish). This study revealed large discrepancies in the allocation outcomes between exclusion-based and probability-based assignments caused by the important rate of typing errors present in the dataset. Out of the four softwares tested, FAP (Taggart, 2007) was the most appropriate to use for handling such a dataset. It combined the most conservative method of assignment with the most informative output for the results displayed. In an attempt to study the breeding dynamics in a cod commercial hatchery, parental contributions to five groups of 300 fry (from five single days of spawning and from two commercial mass spawning cod tanks) were analysed, based on the genotyping data from eight loci. The parentage results from the exclusion-based analyses revealed that, on a single day, at least 25 to 30% of the total breeding population contributed to fertilised eggs that resulted in viable offspring at 50 and 83 days post-hatch. Family representations were highly skewed - with the marked dominance of a few males - and effective breeding populations were consistently low (approx. 5% of the total breeding population). Parental contribution to a group of 960 codlings - produced following intensive commercial practices (i.e. including successive size gradings and mixing of batches) and belonging to a single graded group - was also analysed, based on the genotyping data from eleven loci. The effective breeding population size of the juvenile batch (c. 14% of the total broodstock population) was two to three times greater than the effective size observed on a single day of mass spawning. The per-generation rate of inbreeding was however relatively high, for this batch alone, at 2.5%. Based on these results, suggestions were made to manage hatchery cod broodstock populations and implement genetic selection. Early maturation of farmed cod in sea cages (at two or three years old) is a major concern for ongrowers. Understanding the mechanism(s) behind sex determination in cod would probably help the development of a method to control sexual maturation. In an attempt to elucidate sex determination in cod, a protocol to induce gynogenesis was developed. Gynogenetic fish were successfully produced by irradiating cod milt with UV and applying a cold shock (at -6oC) to newly fertilised eggs. However, due to poor survival during larval rearing, only one gynogenetic fish survived long enough to be sexed; not enough to conclude anything on the sex determination mechanism(s) in cod.

Made available in DSpace on 2016-08-12T19:15:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AnaCAD_DISSERT.pdf: 992908 bytes, checksum: 8c8ed25d36c890fc913b87012539bb33 (MD5) Previous issue date: 2011-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The melon plant is distributed worldwide and is the kind that has the highest phenotypic variability of the genus, especially observed in its fruit. There is great variability which consists an important source of germplasm for genetic improvement programs. Therefore, the knowledge of the genetic variability of vegetable species and how it distributes itself, provides the rational and sustainable use of genetic resources. The objective of the present study was to do a morphological and molecular characterization of accessions of melon plant collected in brazilian northeastern. Were evaluated 40 accesses and three commercial cultivars in a trial conducted in randomized complete block with two repetitions in Mossoró-RN. The morphological characterization was performed through 17 descriptors, one of the seed, fourteen of fruit and two of the inflorescence. The molecular characterization was performed by RAPD markers using 18 primers and by microsatellite (SSR) with 15 primers synthesized for Cucumis melo. It was verified that the morphological markers, RAPD and SSR were satisfactory to allow the detection of polymorphism among the genotypes evaluated. The grouping methods of Tocher and the hierarchical partially agreed on morphological and molecular characterizations. The RAPD marker was more discriminating in relation to microsatellite by the fact of cluster the accesses in most groups. The germplasm bank of UFERSA has high genetic variability among the accessions. / O meloeiro está distribuído em todo o mundo, e é a espécie que possui a maior variabilidade fenotípica do gênero, observada principalmente nos seus frutos. Existe grande variabilidade que consiste em importante fonte de germoplasma para programas de melhoramento. Portanto, o conhecimento da variabilidade genética de espécies vegetais e como ela se distribui, proporciona o uso racional e sustentável dos recursos genéticos. O objetivo do presente trabalho foi realizar a caracterização morfológica e molecular de acessos de meloeiro coletados no Nordeste brasileiro. Foram avaliados 40 acessos e três cultivares comerciais em um experimento conduzido em blocos completos casualizados com duas repetições no município de Mossoró-RN. A caracterização morfológica foi feita através de 17 descritores, sendo um da semente, quatorze de frutos e dois da inflorescência. A caracterização molecular foi realizada pelos marcadores RAPD utilizando 18 primers e por microssatélites (SSR) com 15 primers sintetizados para Cucumis melo. Verificou-se que os marcadores morfológicos, RAPD e SSR foram satisfatórios em permitir a detecção de polimorfismo entre os genótipos avaliados. Os métodos de agrupamento de Tocher e o hierárquico concordaram parcialmente nas caracterizações morfológicas e moleculares. O marcador RAPD foi mais discriminante em relação ao microssatélite pelo fato de agrupar os acessos em mais grupos. O banco de germoplasma da UFERSA possui alta variabilidade genética entre os acessos.

Made available in DSpace on 2016-08-12T19:18:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AnaCAD_DISSERT.pdf: 992908 bytes, checksum: 8c8ed25d36c890fc913b87012539bb33 (MD5) Previous issue date: 2011-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The melon plant is distributed worldwide and is the kind that has the highest phenotypic variability of the genus, especially observed in its fruit. There is great variability which consists an important source of germplasm for genetic improvement programs. Therefore, the knowledge of the genetic variability of vegetable species and how it distributes itself, provides the rational and sustainable use of genetic resources. The objective of the present study was to do a morphological and molecular characterization of accessions of melon plant collected in brazilian northeastern. Were evaluated 40 accesses and three commercial cultivars in a trial conducted in randomized complete block with two repetitions in Mossoró-RN. The morphological characterization was performed through 17 descriptors, one of the seed, fourteen of fruit and two of the inflorescence. The molecular characterization was performed by RAPD markers using 18 primers and by microsatellite (SSR) with 15 primers synthesized for Cucumis melo. It was verified that the morphological markers, RAPD and SSR were satisfactory to allow the detection of polymorphism among the genotypes evaluated. The grouping methods of Tocher and the hierarchical partially agreed on morphological and molecular characterizations. The RAPD marker was more discriminating in relation to microsatellite by the fact of cluster the accesses in most groups. The germplasm bank of UFERSA has high genetic variability among the accessions. / O meloeiro está distribuído em todo o mundo, e é a espécie que possui a maior variabilidade fenotípica do gênero, observada principalmente nos seus frutos. Existe grande variabilidade que consiste em importante fonte de germoplasma para programas de melhoramento. Portanto, o conhecimento da variabilidade genética de espécies vegetais e como ela se distribui, proporciona o uso racional e sustentável dos recursos genéticos. O objetivo do presente trabalho foi realizar a caracterização morfológica e molecular de acessos de meloeiro coletados no Nordeste brasileiro. Foram avaliados 40 acessos e três cultivares comerciais em um experimento conduzido em blocos completos casualizados com duas repetições no município de Mossoró-RN. A caracterização morfológica foi feita através de 17 descritores, sendo um da semente, quatorze de frutos e dois da inflorescência. A caracterização molecular foi realizada pelos marcadores RAPD utilizando 18 primers e por microssatélites (SSR) com 15 primers sintetizados para Cucumis melo. Verificou-se que os marcadores morfológicos, RAPD e SSR foram satisfatórios em permitir a detecção de polimorfismo entre os genótipos avaliados. Os métodos de agrupamento de Tocher e o hierárquico concordaram parcialmente nas caracterizações morfológicas e moleculares. O marcador RAPD foi mais discriminante em relação ao microssatélite pelo fato de agrupar os acessos em mais grupos. O banco de germoplasma da UFERSA possui alta variabilidade genética entre os acessos.

Submitted by M?rden L?les (marden.inacio@ufvjm.edu.br) on 2016-07-22T18:27:43Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) D?bora_Ara?jo_de _Carvalho.pdf: 1646528 bytes, checksum: 9dc491b7402a28d39731f09e2ae99069 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2016-07-25T17:36:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) D?bora_Ara?jo_de _Carvalho.pdf: 1646528 bytes, checksum: 9dc491b7402a28d39731f09e2ae99069 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-25T17:36:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) D?bora_Ara?jo_de _Carvalho.pdf: 1646528 bytes, checksum: 9dc491b7402a28d39731f09e2ae99069 (MD5) Previous issue date: 2016 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Canelas-preta s?o galinhas nativas brasileiras, encontradas no estado do Piau? e provavelmente em outros estados do Nordeste. Caracteriza-se por possuir carne de colora??o escura. Sua plumagem ? predominantemente preta, com varia??es de cores na regi?o do pesco?o (branco, dourado e preto) e a cor do dorso ? preta. S?o criadas em sistema tradicionais, a campo. S?o aves que apresentam pouca exig?ncia em manejo, aparentemente s?o r?sticas e resistentes ?s doen?as e parasitas. Objetivou-se caracterizar geneticamente com uso de doze loci de microssat?lites as galinhas nativas Canelas-Preta do estado do Piau? e, tamb?m, caracterizar e analisar a diversidade fenot?pica dessas aves com base em descritores fenot?picos. Para caracteriza??o gen?tica e fenot?pica foram utilizadas, respectivamente, 118 e 116 aves de tr?s munic?pios do estado. Para as an?lises gen?ticas foram utilizados 12 loci de microssat?lites e para as an?lises fenot?picas foram usados 32 descritores morfol?gicos, sendo 21 quantitativos e 11 qualitativos. Para o estudo gen?tico foram estimadas frequ?ncias al?licas em cada loco, heterozigosidades esperada (He) e observada (Ho), ocorr?ncia do equil?brio de Hardy-Weinberg, n?mero efetivo de popula??es e valores de PIC. Tamb?m foram realizadas as an?lises da estat?stica F pela an?lise do FIS (coeficiente de endogamia), AMOVA e componentes principais. Foi gerada uma matriz de dissimilaridade, gr?fico de dispers?o. A an?lise de estrutura populacional foi realizada usando o software STRUCTURE. Na caracteriza??o fenot?pica, os caracteres quantitativos foram submetidos a uma an?lise de vari?ncia. A an?lise estat?stica foi feita utilizando o m?todo dos quadrados m?nimos tendo sido realizadas an?lise da m?dia, m?nimo, m?ximo e coeficiente de varia??o de cada vari?vel e para cada n?cleo. A diversidade gen?tica foi obtida por meio da an?lise de agrupamento. As galinhas nativas Canelas-Preta, apresentaram elevada variabilidade gen?tica para os loci analisados, o que mostra a conserva??o desse material gen?tico. Foi poss?vel verificar a exist?ncia de alta variabilidade gen?tica intrapopulacional, o que indica que os n?cleos foram formados com suficiente variabilidade gen?tica (efeito fundador). Essa elevada diferencia??o gen?tica dentro das popula??es somada a baixa diferencia??o entre as popula??es, permite afirmar que os indiv?duos analisados pertencem a ?nico grupo gen?tico. As galinhas Canelas-Preta apresentam caracter?sticas de aves nativas, uma vez que mostraram semelhan?a nas distribui??es dos descritores qualitativos entre os n?cleos amostrados e varia??o na frequ?ncia desses descritores dentro de cada n?cleo, isso a caracteriza como ra?a e fenotipicamente estruturada, com padr?es uniformes. Possuem caracter?sticas fenot?picas quantitativas de elevado, m?dio e pequeno coeficiente de varia??o, que revela a riqueza genica da ra?a e as qualifica para programas de conserva??o, utiliza??o e melhoramento dos recursos gen?ticos. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2016. / ABSTRACT Canelas-preta are Brazilian native chickens, found in the state of Piau? and probably in other states of the Northeast, characterized by having dark colored meat. The plumage is predominantly black with color variations in the hackle (white, gold and black) and the back color is black. These birds are raised in extensive system, allowing little demand in management, being apparently rustics and resistant to diseases and parasites. This study aimed to characterize genetically Canelas-Preta native chickens of the Piau? state by using twelve microsatellite loci and also to characterize and analyze the phenotypic diversity of these birds based on phenotypic descriptors. For genetic and phenotypic characterization were used, respectively, 118 and 116 birds from three towns of the state. For the genetic analyzes were used 12 microsatellite loci and for phenotypic analyzes were used 32 morphological descriptors: 21 quantitative and 11 qualitative. For the genetic study, allele frequencies at each locus, expected heterozygosity (He) and observed (Ho), the occurrence of Hardy-Weinberg equilibrium, effective number of populations and PIC values were estimated. Furthermore, also it have been carried out F statistical analyzes by the analysis of FIS (inbreeding coefficient), AMOVA and main components. One dissimilarity matrix and a scatter plot were generated. The population structure analysis was performed using the STRUCTURE software. In the phenotypic characterization, quantitative characters were subjected to an analysis of variance. The statistical analysis was done by using the method of least squares, the analysis of average, minimum, maximum and coefficient of variation of each variable and for each core was performed. Genetic diversity was obtained by cluster analysis. The Canelas-Preta native chickens presented a high genetic variability for the loci analyzed, which shows the conservation of this genetic material. It was possible to verify the existence of high intrapopulation genetic variability, indicating that the nuclei were formed with sufficient genetic variability (founder effect). This high genetic differentiation within populations coupled with lower differentiation among populations, allows affirming that individuals analyzed belong to single genetic group. The Canelas-Preta native chicken have characteristics of native birds, once there was demonstration of similarity in the distributions of qualitative descriptors between sampled cores and variation in the frequency of those descriptors within each core, so this characterize the Canelas-Preta as a phenotypically structured breed with uniform patterns. This breed has quantitative phenotypic characteristics of high, medium and low coefficient of variation, which reveals its genetic wealth and qualify them for conservation programs, use and improvement of genetic resources.

Aiming to characterize morphologically the genotypes of sweet potato, to estimate the genetic divergence and to evaluate the yield performance in the edaphoclimatics conditions in the municipality of Junqueiro, Alagoas, Brazil, an experiment was developed, consisting of two varieties and nine clones, in the randomized blocks design with three replications. For morphological characterization, were used 21 descriptors, being fourteen of the shoot and seven of the storage roots. To evaluate the genetic divergence, were used two methodologies: principal components and the generalized Mahalanobis distance, being the genotypes grouped by Tocher method. For the evaluation of the yield performance of the genotypes, were conducted variance analysis, with the averages confronted by Scott-Knott test (P < 0.05). The results indicate there phenotypic variability between the traits of shoot and storage root of the genotypes of sweet potato evaluated. In the estimation of the genetic divergence from principal components analysis, the general form of the mature leaf, the immature leaf color and secondary color of the stem were the traits that most contributed to the divergence of the shoot, explaining 77.08% of the variability existing in the first three principal components. In storage roots, the format, the defect of the surface and the intensity of the predominant color, were the traits that most contributed to the divergence, achieving explain 86.79% of the variability existing in the first three principal components. The acquisition of six groups among the eleven genotypes studied, showed a significant divergence between the genotypes of sweet potato based on the morphological descriptors. When used the generalized Mahalanobis distance methodology, the clone 6 and the variety Sergipana, by their distances of high magnitude, were the most dissimilar (D2 = 244.3). The traits that contributed mostly to the genetic dissimilarity were the marketable root yield (30.79%), the shoot phytomass yield (16.56%) and the internode length (12.84%). The taking of five groups among the eleven genotypes studied showed a significant genetic divergence between the genotypes of sweet potato. The clones 6 and 11 showed the highest marketable roots yield, with 12.08 and 9.08 t ha-1, respectively. The clones 8, 14 and the variety Rainha Prata had the highest shoot phytomass yield, with 5.42, 5.17 and 5.83 t ha-1. These results suggest new prospects for the cultivation of sweet potato in the region of Junqueiro, Alagoas. It was concluded that there is genetic and phenotypic variation among genotypes of sweet potato, explained by morphological characterization and the two techniques to estimate the genetic divergence. According to the results presented in this paper, the Breeding Program of CECA - UFAL may to adopt three measures: the first is the assessment of clones 6 and 11, most yields, in field testing in the municipality of Junqueiro, aiming stability tests, to launch them as varieties. The second will be realization of artificial crosses aiming based in the genetic distances and the per se yields of parents (clones 6 and 8). And the third measure will be the formation of a population with large genetic basis, thereby increasing the probability of obtaining superior genotypes in the segregating generations. / Com o objetivo de caracterizar morfologicamente os genótipos de batata-doce, estimar a divergência genética e avaliar o desempenho produtivo nas condições edafoclimáticas do município de Junqueiro, Estado de Alagoas, foi desenvolvido um experimento, composto por duas variedades e nove clones, no delineamento em blocos casualizados com três repetições. Para a caracterização morfológica, foram utilizados 21 descritores, sendo quatorze da parte aérea e sete das raízes. Para estimar a divergência genética, foram utilizadas duas metodologias: componentes principais e distância generalizada de Mahalanobis, sendo os genótipos agrupados pelo método de Tocher. Para a avaliação do desempenho produtivo dos genótipos, foram realizadas análises de variância, sendo as médias confrontadas pelo teste Scott-Knott (P < 0,05). Os resultados indicam haver variabilidade fenotípica entre os caracteres da parte aérea e os da raiz dos genótipos de batata-doce avaliados. Na estimativa da divergência genética a partir da metodologia dos componentes principais, a forma geral da folha madura, a cor da folha imatura e a cor secundária da haste foram às características que mais contribuíram para a divergência da parte aérea, explicando 77,08% da variabilidade existente nos três primeiros componentes principais. Nas raízes, o formato, o defeito da superfície e a intensidade da cor predominante, foram os caracteres que mais contribuíram para a divergência, conseguindo explicar 86,79% da variabilidade existente nos três primeiros componentes principais. A obtenção de seis grupos entre os onze genótipos analisados evidenciam uma significativa divergência entre os genótipos de batata-doce com base nos descritores morfológicos. Quando utilizado a metodologia da distância generalizada de Mahalanobis, o clone 6 e a variedade Sergipana, por suas distâncias de alta magnitude, foram as mais dissimilares (D2 = 244,3). As variáveis que mais contribuíram para a dissimilaridade genética foram a produtividade de raízes comerciais (30,79%), a produtividade de fitomassa da parte aérea (16,56%) e o comprimento do entrenó (12,84%). A obtenção de cinco grupos entre os onze genótipos analisados evidenciam uma significativa divergência genética entre os genótipos de batata-doce. Os clones 6 e 11 apresentaram as maiores produtividades de raízes comerciais, com 12,08 e 9,08 t ha- 1, respectivamente. Os clones 8, 14 e a variedade local Rainha Prata apresentaram as maiores produtividades de fitomassa da parte aérea, com 5,42; 5,17 e 5,83 t ha-1. Estes resultados apontam novas perspectivas para o cultivo de batata-doce na região de Junqueiro, Estado de Alagoas. Diante do exposto, pode-se concluir que existe variabilidade fenotípica e genética entre os genótipos de batata-doce, explicado pela caracterização morfológica e pelas duas técnicas para estimar a divergência genética. De acordo com os resultados apresentados nesta pesquisa, o Programa de Melhoramento do CECA UFAL poderá adotar três medidas: a primeira será a avaliação dos clones 6 e 11, mais produtivos, em ensaios de campo no município de Junqueiro, Estado de Alagoas, visando testes de estabilidade, para lançá-los como variedades. A segunda será a realização de cruzamentos direcionados com base nas distâncias genéticas e nos rendimentos per se dos genitores (clones 6 e 8). E a terceira medida será a formação de uma população de ampla base genética, aumentando assim, a probabilidade de obtenção de genótipos superiores nas gerações segregantes.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 184500 bytes, checksum: da94e7e2492b99a28eb97e5893f21931 (MD5) Previous issue date: 2006-02-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objectives of this work went to evaluate the genetic diversity and to elaborate a representative core col of the tomato accesses of the Vegetable Germoplasm Bank at the UFV. Were evaluated 70 accesses of tomato at the BGH-UFV divided in three experiments mounted in blocks and three repetitions. They were used you cultivate them Santa Clara and Débora Plus, as witness, in the three experiments. The data were analyzed considering groups of experiments. Before all the statistical analyses the averages of the accesses were corrected in agreement with the environmental effect of each experiment. To evaluate the genetic diversity among the accesses they took place analyses univariate and multivariate. The analyses univariate were: contrast between the averages of the accesses and witness and coincidence coefficient between the original data and the corrected data. The multivariate analyses were: grouping of Tocher and relative importance of the characteristics. Significant differences were verified among the averages of the accesses and of the witness for the characteristics length of the leaf, length of the stem, length of the fruit, width of the fruit, thickness of the endocarp, width of the central axis, lóculos number, number of good fruits, weight of good fruits, I weigh medium of the fruits, total number of fruits, total weight of fruits, precocity index, total soluble solids and quality of fruit. The characteristics with the smallest coincidence coefficients were: length of the stem, weight of good fruits and weigh of total of fruits, demonstrating that these characteristics are very influenced by the environment. For the analysis of grouping of Tocher, the accesses were separate in 10 groups, and, together with the witness, 28 accesses were allocated, what means similarity among these. On the other hand the accesses 981, 997, 989, 978 and 1214 were divergence the witness and they had superior averages for medium weight of the fruits, total weight of the fruits and total soluble solids. For definition of the representative core collection that best represented the tomato accesses of BGH-UFV they took place the calculations of the index of variability retention. Twelve representative core collection were developed, being derived of the combination among the sampling strategies, of sampling intensity and of definition of the number of accesses sampling for extract. The sampling strategies used they were aleatory and multivariate. The appraised intensities were 15, 20 and 30% and the strategies of definition of the number of accesses smapling for extract they were proportional and logarithmic. The chosen representative core collection was ML-30, in other words, sampling based on multivariate analyses, number of accesses defined for the logarithmic strategy and intensity of sampling of 30%. With this representative core collection it was possible the reduction of the number of tomato accesses they be maintained by BGH- UFV in 70%, in other words, with only 21 accesses, of the appraised 70, it was possible to represent approximately 90% of the existent variability. / Os objetivos deste trabalho foram avaliar a diversidade genética e elaborar uma subcoleção representativa dos acessos de tomateiro do Banco de Germoplasma de Hortaliças da UFV. Avaliaram-se 70 acessos de tomateiro do BGH-UFV divididos em três experimentos montados em blocos ao acaso com três repetições. Utilizaram-se as cultivares Santa Clara e Débora Plus, como testemunhas, nos três experimentos. Os dados foram analisados em conjunto considerando grupos de experimentos. Antes de todas as análises estatísticas as médias dos acessos foram corrigidas de acordo com o efeito ambiental de cada experimento. Para avaliar a diversidade genética entre os acessos realizaram-se análises uni e multivariadas. As análises univariadas foram: contraste entre as médias dos acessos e testemunhas e coeficiente de coincidência entre os dados originais e os dados corrigidos. As análises multivariadas foram: agrupamento de Tocher e importância relativa das características. Verificaram-se diferenças significativas entre as médias dos acessos e das testemunhas para as características comprimento da folha, comprimento do entrenó, comprimento do fruto, largura do fruto, espessura do endocarpo, largura do eixo central, número de lóculos, número de frutos bons, peso de frutos bons, peso médio dos frutos, número total de frutos, peso total de frutos, índice de precocidade, sólidos solúveis totais e qualidade organoléptica. As características com os menores coeficientes de coincidência foram: comprimento do entrenó, peso de frutos bons e peso de total de frutos, demonstrando que estas características são muito influenciadas pelo ambiente. Pela análise de agrupamento de Tocher, os acessos foram separados em 10 grupos, sendo que, juntamente com as testemunhas ficaram alocados 28 acessos, o que significa similaridade entre estes. Por outro lado os acessos 981, 997, 989, 978 e 1214 foram divergentes as testemunhas e tiveram médias superiores para peso médio dos frutos, peso total dos frutos e sólidos solúveis totais. Para definição da subcoleção que melhor representou os acessos de tomateiro do BGH-UFV realizaram-se os cálculos do índice de retenção de variabilidade. Foram desenvolvidas 12 subcoleções, sendo derivadas da combinação entre as estratégias de amostragem, de intensidade de amostragem e de definição do número de acessos amostrados por extrato. As estratégias de amostragem utilizadas foram aleatória e multivariada. As intensidades avaliadas foram 15, 20 e 30% e as estratégias de definição do número de acessos amostrados por extrato foram proporcional e logarítmica. A subcoleção escolhida foi a ML-30, ou seja, amostragem baseada em análises multivariadas, número de acessos definido pela estratégia logarítmica e intensidade de amostragem de 30%. Com esta subcoleção foi possível a redução do número de acessos de tomateiro a serem mantidos pelo BGH-UFV em 70%, ou seja, com apenas 21 acessos, dos 70 avaliados, foi possível representar aproximadamente 90% da variabilidade existente.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 699144 bytes, checksum: 594cd8149486dec5391aad3d0097bf7b (MD5) Previous issue date: 2009-02-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / It is up to the enhancers that use the sub-samples that is of the Germplasm Bank to make available genetic resources for the programs of enhancements, given that for the success of any pre-program of enhancement it is necessary to have the knowledge of the amount of existing variation of the specie being analyzed. The genetic resources of the Germplasm Bank of Vegetables of the Federal University of Viçosa (BGH-UFV) represent more than 40 years of collected data. Therefore, it is necessary to make a characterization and evaluation of these accesses, considering that generally these are landraces from different regions of the country and of the world. This work had the objective of assessing sub-samples from the same commercial group of tomato of the Germplasm Bank of Vegetables of the Federal University of Viçosa (BGH-UFV). Initially, 101 sub-samples from the Salada group and 28 tomatoes sub-samples from the Santa Cruz group and the Fanny, Débora and Santa Clara commercial cultivars were selected for analysis. An analysis of the joint variation was performed, identifying the characteristics with interaction between significant testimonies and tests, and the type of existing interaction was analyzed. After that, the diagnostic of multicollinearity was performed and, through the Singh method (1981), the relative importance of each characteristic for the genetic diversity as well. The Garcia methodology (1998) was used to discard the characteristics of lower importance. In the multifarious analysis, the generalized distance of Mahalanobis was used as measure for dissimilarity. And to form the groups, the hierarchical cluster method of average non-standard connection (UPGMA) and the Tocher optimization procedure were used. There was interaction of the complex type for total soluble solids (TSS) in the Salada group and thickness of the main stem (TMS) and total acidity (TA) in the Santa Cruz group. In the multicollinearity diagnostic for the Salada group the characteristics &#8220;number of good fruits&#8221; (NGF), &#8220;thickness of the endocarp&#8221; (TE) and &#8220;mass of good fruits&#8221; (MGF) needed to be eliminated. Just as NFG, TE and MGF were eliminated, so were eliminated from the Santa Cruz group width of the fruit (WF), mass of bad fruits (MBF), width of the scar of the pedicel (WSP), width of the axis (WA), width of the leaf (WL), total number of fruits (TNF), length of the fruit (LF), number of locules (NL), width of the mesocarp (WM) e sensorial quality (QO). Through the Garcia Methodology, the characteristics number of bad fruits, diameter of the internode (DI), length of the internode (LI), total acidity (TA), width of the leaf (WL) and width of the stem (WS) were eliminated in the Salada group, while in the Santa Cruz group no characteristic was eliminated. There was a similarity between the Toucher&#8217;s grouping and the dendogram generated by the average connection between groups (UPGMA) concerning the number of groups formed when the cut in the dendogram is made between 38 &#8211; 35% and 37 &#8211; 52% of dissimilarity for the Salada group and the Santa Cruz group respectively. The sup-samples BGH-2273 and BGH-2247 of the Salada group and the Santa Cruz group respectively were the most diverging ones amongst all the sub-samples assessed. / Cabe aos pré melhoristas que utilizam subamostras pertencentes a Bancos de Germoplasma disponibilizar recursos genéticos para os programas de melhoramento, sendo que para o sucesso de qualquer programa de melhoramento é necessário se ter o conhecimento da variabilidade existente na espécie trabalhada. Desta forma, é necessário que se realize a caracterização e avaliação dessas subamostras, uma vez que em sua maioria são landraces de diferentes regiões do país e do mundo. Os recursos genéticos do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH-UFV) representam mais de 40 anos de coleta no Brasil e intercâmbio com diversas instituições mundiais. Assim este trabalho teve como objetivo avaliar subamostras de dois grupos comerciais de tomateiro. Inicialmente foram separados, para o estudo, 101 subamostras de tomateiro do grupo Salada e 28 subamostras de tomateiro do grupo Santa Cruz e mais as cultivares comerciais Fanny, Débora e Santa Clara, utilizadas como testemunhas. Foi realizada a análise de variância conjunta, identificando as características com interação significativa entre testemunhas e ensaios e estudado o tipo de interação existente. Foi em seguida realizado o diagnóstico de multicolinearidade e também, mediante o método de Singh (1981), a importância relativa de cada característica para a divergência genética eutilizou-se a metodologia de Garcia (1998) para o descarte das características de menor importância relativa. Nas análises multivariadas, utilizou-se a distância generalizada de Mahalanobis como medida de dissimilaridade, e para formação dos grupos utilizou-se o método hierárquico aglomerativode ligação média não padronizada (UPGMA) e o método de otimização de Tocher. Houve interação do tipo complexa para sólido solúveis totais (SST) no grupo Salada e espessura do pecíolo principal (EPP) e acidez total (AT) no grupo Santa Cruz. No diagnóstico de multicolinearidade, para o grupo Salada, as características número de frutos bons (NFB), espessura do endocarpo (EE) e massa de frutos bons (MFB) necessitaram ser eliminadas. Assim como número de frutos bons (NFB), massa de frutos bons (MFB), espessura do endocarpo (EE), largura do fruto (LFr), massa de frutos ruins (MFR), largura da cicatriz do pedicelo (LCP), largura do eixo central (LEC), largura da folha (LFo), número total de frutos (NTF), comprimento do fruto (CFr), número de lóculos (NL), espessura do mesocarpo (EM) e qualidade sensorial (QO) foram eliminadas no grupo Santa Cruz. Pela metodologia de Garcia, as características número de frutos ruins (NFR), diâmetro do entrenó (DE), comprimento do entrenó (CE), acidez total (AT), largura da folha (LFo) e espessura do pecíolo principal (EPP) foram eliminadas no grupo Salada, enquanto no grupo Santa Cruz nenhuma característica foi eliminada. Ocorreu similaridade entre o agrupamento de Tocher e o dendograma gerado pela ligação média entre grupos (UPGMA) quanto ao número de grupos formados quando o corte no dendograma foi realizado entre 38 e 55% e 37 e 52 % de dissimilaridade para o grupo Salada e grupo Santa Cruz, respectivamente. As subamostras BGH-2273 e BGH-2247 do grupo Salada e grupo Santa Cruz, respectivamente, foram as mais divergentes entre todas sub amotras avaliadas.

Orientador: Ana Maria Soares Pereira / Banca: Giuseppina Pace Pereira Lima / Banca : Roberto Fontes Vieira / Banca: Márcia Ortiz Mayo Marques / Banca: Roberto Fontes Vieira / Banca: Zuzelei de Castro França / Resumo: O presente estudo teve como objetivos coletar germoplasma de Pfaffia glomerata (Spreng.) Pedersen, caracterizar genótipos provenientes de oito populações naturais, utilizando descritores morfológicos e um marcador químico e estabelecer um banco de germoplasma in vitro. Foram realizadas duas expedições de coleta, a primeira, à região localizada às margens do rio Santo Inácio e rio Tamanduá, Itatinga, SP e a segunda, ao Pantanal Sul Mato-grossense às margens do rio Paraguai, Corumbá, e às margens do rio Miranda, MS. Foram coletados 218 indivíduos em oito populações naturais que ainda não haviam sido amostradas e incorporação desses materiais ao banco de germoplasma in vitro da Unaerp, Ribeirão Preto, SP. Para a caracterização morfológica e química foi conduzido um experimento de campo com oito populações, em delineamento com blocos casualizados. As características avaliadas foram: altura da planta, comprimento do entrenó, diâmetro do caule, número de caules, tipo de caule, comprimento da raiz principal, número de raízes secundárias, diâmetro da raiz principal, matéria fresca e seca do caule, matéria fresca e seca das raízes, índice de colheita, a produtividade, cor caule, cor do pecíolo, pilosidade, cor da raiz, formato do limbo foliar, forma do ápice e da base do limbo foliar, relação comprimento/largura do limbo foliar, ocorrência de nematóides formadores de galhas e o teor de β-ecdisona. Foi registrada também a presença de insetos nas inflorescências. Os resultados foram submetidos à análise de variância, ao teste de separação de médias de Scott Knott a 5% de probabilidade. Visando definir o meio de cultura ideal para o estabelecimento do banco de germoplasma in vitro para a espécie foram avaliados seis tratamentos: 1) MS + 2% de sacarose + 4% de sorbitol; 2) MS/2 + 2% de sacarose + 4% de sorbitol; 3) MS + 2% de sacarose + 4% de sorbitol...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim in the present study was to collect germplasm of Pfaffia glomerata(Spreng.) Pedresen, characterize genotypes from eight natural populations utilizing morphological descriptors and a chemical marker and to establish a germplasm bank. The collecting expeditions were first to the region of the Santo Inacio and Tamandua riverbanks, Itatinga, SP and secondly to the Pantanal Sul region of the State of Mato Grosso, at the Paraguai and Miranda riverbanks. Two hundred and eighteen individuals were collected from eight natural populations not previously sampled and incorporated to the in vitro germplasm bank of the University of Ribeirao Preto (Unaerp), Ribeirao Preto Sao Paulo. For the morphological and chemical characterization the field experiment was conducted with eight populations and delineated in randomized blocks. The characteristics evaluated were: plant height, inter-nodule length, stem diameter, number of stems, type of stem, main root length, number of secondary roots, diameter of the main root, fresh and dry stem matter, fresh and dry root matter, stem color, petiole color, hairiness, root color, shape of the foliar limbus, shape of the apical part and base of the foliar limbus, length/width ratio of the foliar limbus, occurrence of gall forming nematodes, level of β-ecdysone and harvest index. Productivity and insect presence in the inflorescences was also verified. The results were submitted to analysis of variance and to the Scott Knott test of mean separations, with 5% probability. To define the best culture medium for the establishment of an in vitro germplasm bank six treatments were evaluated: 1) MS + 2% sacarose + 4% sorbitol; 2) MS/2 + 2% sacarose + 4% sorbitol; 3) MS + 2% sacarose + 4% sorbitol + 2mg.L-1 calcium pantothenate; 4) MS/2 + 2% sacarose + 4% sorbitol + 2mg.L-1 calcium pantothenate; 5) MS + 2% sacarose + 3% manitol + 2mg.L-1 calcium pantothenate; 6) ...(Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Due to the great social, economic and cultural context which Mangabeira (Hancornia speciosa) represents, as well as the intense devastation of the areas where it occurs naturally, was implemented in 2006, the Active Bank Mangabeira Embrapa Tabuleiros Costeiros (BAGMangaba) in Itaporanga d'Ajuda, SE. The Genebank (bags) gather genetic constitutions of different backgrounds and represent sources of genes for breeding programs. Therefore, it is essential that the breeder knows the genetic diversity of germplasm available. The aim of this study was to estimate the genetic variability of 55 accessions of BAG Mangaba RAPD markers (Polymorphic DNA Randomly Amplified). 13 primers were used for synthesis (primers), which generated 82 fragments (bands), 72 polymorphic, which were analyzed as binary data. From these data yields a similarity matrix using Jaccard's coefficient. With this coefficient and the UPGMA method agglomerative cluster analysis were performed using the programs FreeTree; TreeView and XLSTAT and a method of resampling (bootstraps) generated dendrograms that used to distinguish among the accessions. The similarity ranged from 0.02 to 0.91. Individuals were more similar CA4 and CA5 and more divergent lining IP6 and PR4. From the SGM were detected at the pair of individuals and CA5 CA4, CA1 and CA2, PT2, and PT3 are considered similar (clones). Through Clustering UPGMA and PCoA was possible to identify five groups. The high level of polymorphism (95%) suggests that RAPD markers are a useful tool to detect genetic differences among accessions of H. speciosa, assisting in a future program to improve the species. / Devido à grande importância social, econômica e cultural que a mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) representa, bem como a intensa devastação das áreas onde ocorre naturalmente, foi implantado em 2006, o Banco Ativo de Mangabeira da Embrapa Tabuleiros Costeiros (BAG Mangaba), em Itaporanga d‟Ajuda, SE. Os Bancos de Germoplasma (BAGs) reúnem constituições genéticas de diferentes origens e representam fontes de genes para programas de melhoramento. Para tanto, é fundamental que o melhorista conheça a variabilidade genética do germoplasma disponível. O objetivo deste estudo foi estimar a variabilidade genética de 55 acessos do BAG Mangaba utilizando marcadores RAPD (Polimorfismo de DNA amplificado ao acaso). Foram usados 13 iniciadores de síntese (primers), que geraram 82 fragmentos (bandas), sendo 72 polimórficos, os quais foram analisados como dados binários. A partir desses dados foi obtida uma matriz de similaridade utilizando o coeficiente de Jaccard. Com esse coeficiente e com o método aglomerativo UPGMA foram realizadas análises de agrupamento utilizando os programas FreeTree; TreeView e XLSTAT e um método de reamostragens (bootstraps), gerou dendrogramas que permitiu a distinção genética entre os acessos. A similaridade variou entre 0,02 e 0,91. Os indivíduos mais similares foram CA4 e CA5 e mais divergentes forram IP6 e PR4. A partir do nível SGM foram detectados que os pares de indivíduos CA4 e CA5; CA1 e CA2; PT2 e PT3 são considerados similares (duplicatas). Por meio do Agrupamento UPGMA e ACoP foi possível identificar seis grupos. O alto nível de polimorfismo observado (95%) sugere que os marcadores RAPD são uma ferramenta adequada para detectar diferenças genéticas entre acessos de mangabeira, auxiliando futuros programas de melhoramento da espécie.

Morphological characterization, performed by use of descriptors, identifies and describes the variability or diversity within and between accessions maintained in Germplasm Banks Assets. This information, provided for genetic resources studies may be used in improvement programs of coconut, especially when there are characteristics of interest to serve as matrices for production of hybrids or the selection of adapted or resistant varieties to certain factors. The study aimed to characterize and evaluate the dwarf accessions stored in the Active Germplasm Bank of Embrapa Coastal Boards, using a descriptive list drawn up by IBPGR in 1995, now Bioversity International. The experimental design was randomized block, with six treatments (accessions) and five replications, 16 useful plants /plot, spaced 7.5 x 7.5 x 7.5. It evaluated 11 useful plants of six accessions of Dwarf coconut: Green Dwarf Jiqui Brazil (DGeBrJ), Red Dwarf Cameroon (DRC), Red Dwarf Malaysia (DRM), Red Dwarf Gramame (DRG), Yellow Dwarf Gramame (DYG), Yellow Dwarf of Malaysia (DYM). Quantitative and qualitative descriptors, all data-related to vegetative, morphological and reproductive were considered. The genetic-statistical analysis was executed by SAS 9.1 and genes 2009 program. Data were submitted to ANOVA and the means of cultivars compared by Tukey test (5%) and genetic parameters (h2, CVg, and CVe Iv) were estimated. Genetic divergence between genotypes was quantified by Standardized mean Euclidean distance. The clustering methods used to group the genotypes were the UPGMA, the Tocher optimization and Main Components. With descriptors morpho-agronomics was possible to detect genetic divergence among accessions of the dwarf coconut germplasm bank. The UPGMA cluster analysis, Tocher and principal components demonstrated efficiency in the evaluation of the accessions. It was observed that characters like number of leaves, length of leaflets, width of leaflets, peduncle length, number of male flowers, number of floral branches, average length of floral branches, length of reproductive cycle, male reproductive phase duration, period between emergency and opening of inflorescences and number of inflorescence have high genetic variability, allowing success in improving of coconut using simpler selection methods such as mass selection. The AVeBrJ had the highest means to following characteristics: number of leaflets, length of leaflets, number of flower branches, length of reproductive cycle, male reproductive phase duration, showing a good vegetative and reproductive development. / A caracterização morfológica, realizada por meio de descritores, identifica e descreve a variabilidade ou diversidade existente dentro e entre os acessos conservados em Bancos Ativos de Germoplasma (BAGs). Estas informações, fornecidas pela área de recursos genéticos, podem ser utilizadas nos programas de melhoramento de coco, especialmente quando da utilização dos acessos com características de interesse para servir como matrizes para produção de híbridos ou na escolha de variedades mais adaptadas ou resistentes a determinados fatores. O trabalho teve como objetivo caracterizar e avaliar por meio da lista descritiva elaborada pelo IBPGR 1995, atual Bioversity International, os acessos de coqueiro anão conservados no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Tabuleiros Costeiros. Os acessos caracterizados e avaliados encontram-se no delineamento experimental em blocos casualizados, com seis tratamentos (acessos) e cinco repetições, sendo 16 plantas úteis por parcela, no espaçamento de 7,5 x 7,5 x 7,5. Foram avaliadas 11 plantas úteis de seis acessos de coqueiro-anão: Anão Verde do Brasil Jiqui (AVeBrJ), Anão Vermelho de Camarões (AVC), Anão Vermelho da Malásia (AVM), Anão Vermelho de Gramame (AVG), Anão Amarelo de Gramame (AAG), Anão Amarelo da Malásia (AAM). Foram utilizados descritores quantitativos e qualitativos, sendo todos relacionados a dados vegetativos, morfológicos e reprodutivos. As análises genético-estatísticas foram realizadas com o programa SAS 9.1 e genes 2009, os dados foram submetidos à análise de variância e as médias das cultivares comparadas pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade e estimados parâmetros genéticos (h2, CVg, CVe e Iv). Para quantificar a divergência genética entre os genótipos foi empregada a distância euclidiana média padronizada. Os métodos de agrupamento utilizados para agrupar os genótipos foram o hierárquico UPGMA, o de otimização Tocher e os Componentes Principais. Utilizando descritores morfoagrômicos foi possível detectar divergência genética entre os acessos de coqueiro anão do Banco de germoplasma de coco. Os métodos de agrupamento UPGMA, Tocher e componentes principais demonstraram a eficiência na avaliação dos acessos. Foi observado que os caracteres, número de folíolos, comprimento do folíolo, largura do folíolo, comprimento do pedúnculo, número de flores masculinas, número de ramos florais, comprimento médio dos ramos florais, duração do ciclo reprodutivo, duração da fase reprodutiva masculina, período entre emergência e abertura das inflorescências e número de inflorescência dispõem de alta variabilidade genética, possibilitando êxito no melhoramento do coqueiro empregando métodos de seleção mais simples, como a seleção massal. O AVeBrJ apresentou as maiores médias quanto: número de folíolos, comprimento do folíolo, número de ramos florais, duração do ciclo reprodutivo, duração da fase reprodutiva masculina, indicando bom desenvolvimento vegetativo e reprodutivo.