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I'd Give My Right Kidney to Be Altruistic: The Social Biogeography of Altruism in the United States of AmericaGarcia, Rafael Antonio, Garcia, Rafael Antonio January 2017 (has links)
The purpose of this dissertation is to model biosocial determinants of group-directed altruistic behavior – exploring the nomological net around it. To do this a study will be presented to determine existing associations among various biological and social predictors and test a life-history-derived causal cascade using a partially exploratory and partially confirmatory statistical technique called Sequential Canonical Analysis to ultimately predict living-donor, non-directed kidney donations (NDKD). Toward that end, some important methodological considerations first need to be discussed. The first consideration revolves around the level of analysis and how this frames the cascade model and its interpretation. Following a general discussion, an exercise in some of the general principles is provided – investigating the higher-order factor structure of the Big-5 personality constructs across two levels of analysis. The second consideration is the use of unit-weighted factor scores and their appropriateness. Following the theoretical discussion, a demonstration is provided – deriving an estimate of genetic relatedness from a set of heterogeneous data sets. Once the methodological considerations have been discussed, the primary cascade model is presented in two parts: 1) the measurement model – operationalizing the measures incorporated into 2) the structural model – testing the proposed causal cascade using Sequential Canonical Analysis. A discussion follows in which the results are summarized, limitations are articulated, and further research directions are explored.
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Identifikace vinných kvasinek metodou PCR-RFLP / Identification of wine yeasts by PCR-RFLP methodŠuranská, Hana January 2009 (has links)
This thesis deals with identification of the wine yeasts by applying the PCR-RFLP method. The identification and characteristic of the yeasts has gone through substantial changes in recent years. There have been introduced new methods of taxonomic classifying based on the molecular methods, which are oriented to easy and fast identification. One of these methods is the PCR-RFLP method. The amplification of the 5•8S-ITS rDNA sequence by the polymerase chain reaction with use of the primers ITS1 and ITS4 leads to the amplification of the specific sequence of DNA. Such multiplied DNA is after repurifying by the ethanol and drying submitted to the restriction analysis. With use of the restriction endonuklases DNA is chopped into the specific segments typical for the particular genus. The chopped fragments can be separated in the electric field in the agarose gel and subsequently evaluated. In this thesis together 63 type yeasts were used. These yeasts were analysed by applying of the seven restriction endonuklases – HaeIII, HhaI, HinfI, HpaII, TaqI, AluI a MseI. The final image of type yeasts splitting was compared to the results of splitting of already identified wine yeasts and these yeasts were subsequently taxonomically classified. Evaluation of genetic similarity was conducted by program BioNumerics and as the results the dendrograms that were created with use of Jaccard‘s coefficients are obtained.
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Vztah atraktivity a MHC: Role menstruačního cyklu a partnerského statusu. / Vztah atraktivity a MHC: Role menstruačního cyklu a partnerského statusu.Vávrová, Kateřina January 2011 (has links)
Extremely polymorphic genes of major histocompatibility complex (MHC) play a significant role in the function of immune system by recognizing heterogeneous particles, mainly pathogenic origin. Previous research on various vertebrate species indicates that MHC influences individual body odour and mate choice preferences. Many individuals tend to prefer MHC dissimilar partner so that warrants them an offspring resistant against wider spectrum of infections. Research on MHC-related mate preferences in humans, however, is inconclusive to date. Several studies indicate that women not taking hormonal contraceptives prefer the smell of MHC dissimilar partners while other studies have not come to this conclusion. This can be caused by the absence of potentially influencing factors like the menstrual cycle phase. The aim of this study was to test MHC-similarity mate choice preferences in odour, facial and vocal modalities. In particular, we focused on a potential effect of hormonal contraception. Furtermore, we tested preferential shifts across the menstrual cycle by comparing women's preferences in the follicular and the luteal phase in pill and non-pill users. A group of 52 women in different phases of their menstrual cycle rated odour samples, photos and vocal recordings taken from 51 men. All...
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Isolamento de microssatélites e análise genética de ararinha-azul (Cyanopsitta spixii, Aves, Psittaciformes) / Isolation of microsatelites and genetic analysis of Spix\'s macaw (Cyanopsitta spixii, Psitaciformes, Aves)Monteiro, Rafaella Sávia 19 June 2015 (has links)
A ararinha-azul (Cyanopsitta spixii) é uma das aves mais ameaçadas do mundo e está extinta na natureza. Estudos estão sendo realizados para o manejo e conservação em cativeiro para futura reintrodução. Microssatélites são marcadores moleculares úteis para estimar parentesco entre indivíduos. Esse dado pode ser utilizado para minimizar os efeitos deletérios da endogamia e a perda de diversidade genética do plantel do programa de reprodução em cativeiro, recomendando pares reprodutivos. O presente estudo teve como objetivos identificar microssatélites polimórficos específicos para acessar o nível de diversidade genética da espécie e estimar o parentesco entre pares de aves para auxiliar o manejo genético da população. O genoma de um indivíduo foi parcialmente sequenciado na plataforma 454 GS FLX (Roche). Foram desenhados 25 pares de primers, sendo 20 para dinucleotídeos e cinco para tetranucleotídeos. Dezenove microssatélites puderam ser amplificados e foram testados quanto ao nível de polimorfismo em 12 indivíduos selecionados. Desses, 14 microssatélites foram polimórficos. Também foram usados dados de microssatélites heterólogos nas análises. Dois microssatélites apresentaram desvio do equilíbrio de Hardy-Wenberg e cinco microssatélites foram excluídos devido à presença de desequilíbrio de ligação. A probabilidade de exclusão de paternidade quando um parental é conhecido foi de 94,8% e a probabilidade de identidade foi de 0,00000793. A riqueza alélica média foi de 2,49 alelos por microssatélite, confirmando a baixa diversidade genética da espécie. Alguns alelos já foram perdidos no plantel atual em cativeiro. A população tem valor de índice de parentesco médio similar àquela de, no mínimo, primos de primeiro grau e alguns dos fundadores são muito aparentados. Alguns potenciais casais com baixo índice de parentesco r podem vir a ser importantes para o programa de reprodução em cativeiro. / Spix\'s macaw (Cyanopsitta spixii) is one of the most endangered birds of the world and is extinct in the wild. Several coordinated studies are being conducted for its management and conservation in captivity for future reintroduction. Microsatellites are useful markers to estimate relatedness between individuals. This information can be used to minimize the deleterious effects of inbreeding and loss of genetic diversity of captive birds, recommending less closely related pairs for the breeding program. The present study aims to identify specific polymorphic microsatellites to assess the levels of genetic variability of the species and the genetic relatedness among birds for the genetic management of the population. The partial genome of an individual was sequenced on a 454 GS FLX (Roche) platform. Twenty-five pairs of primers were designed, being 20 for di- and five tetra-nucleotide microsatellites. Nineteen microsatellites were amplified and tested in 12 selected individuals. Fourteen microsatellites were polymorphic. Heterologous microsatellites were also used in the analyses. Two microsatellites were not in Hardy-Weinberg equilibrium and five presented linkage disequilibrium. Exclusion paternity probability when one parental is known was 94.8% and identity probability was 0.00000793. Mean allele richness was 2.49 alleles per microsatellite, confirming the low genetic diversity of the species. The current captive population has lost some alleles. The mean relatedness among individuals was, at least, similar to the one between first cousins and some founders are very closely related. Based on the relatedness index, some unrelated potential couples can become important for the captive program.
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DIVERSIDADE GENÉTICA EM MILHO CRIOULO ATRAVÉS DOS MARCADORES MOLECULARES RAPD, MICROSSATÉLITE E AFLPMolin, Dayane 23 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Dayane Molin.pdf: 2944692 bytes, checksum: a8d299024aefbd42062cb84bd7720a9d (MD5)
Previous issue date: 2012-02-23 / Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Paraná / The wide variability in corn is due to the numerous landraces, important genotypes for breeding programs, because they constitute a source of genetic variability in the exploration of new genes of economic interest. The objectives were to analyze the genetic diversity between landraces from Rio Grande do Sul and Paraná through the analysis of polymorphism generated by RAPD, microsatellite (SSR) and AFLP markers; cluster these genotypes through estimates of genetic similarity and establish possible relationships between genetic similarity and the sampling sites of the landraces. PCR reactions for each marker were optimized through specific protocols being used: 30 RAPD primers, 47 SSR primers pairs and 25 combinations of primers for the EcoRI + MseI for the AFLP marker. The amplified fragments (RAPD and SSR) were visualized in agarose gel at 2 and 3 %, respectively, through horizontal electrophoresis run for approximately 4 h at 80 V. The AFLP amplification products were resolved on a polyacrylamide gel (6 %) submitted to a vertical electrophoresis run for 3 h 30 min at 80 W (1500 V). Genotyping of the varieties of corn with the RAPD marker amplified 409 fragments with a polymorphism average rate of 81.9 %. The SSR generated 134 fragments with 78.3 % of polymorphism. On the other hand, the AFLP amplified 1889 fragments with a polymorphism average rate of only 40.3 %. The polymorphic fragments were submitted to analysis of genetic similarity using the Jaccard coefficient and UPGMA clustering method individually and jointly for all markers. The coefficient mean of similarity was 57 % for RAPD, 56 % for SSR, 74 % for the AFLP and 69 % for the joint analysis. The dendrograms obtained from RAPD and SSR showed 8 different groups, while the dendrogram obtained from AFLP and the joint analysis formed six and seven groups, respectively. In general, the correlations between the similarity matrices were low, but between the AFLP and combined analysis was 96 %. Results revealed a wide genetic variability among landraces. The RAPD and SSR had the highest average rates of polymorphism and AFLP showed the highest rates of genetic similarity among landraces. In general, the markers used were effective tools for sampling the genetic diversity and cluster varieties according to the sampling sites, although they have differential capacity to reveal polymorphism as well as to cluster the landraces. / A ampla variabilidade existente em milho deve-se às inúmeras variedades crioulas, genótipos importantes para o melhoramento, pois constituem fonte de variabilidade genética na prospecção de novos genes de interesse econômico. Os objetivos deste trabalho foram analisar a diversidade genética existente entre acessos de milho crioulo oriundos do Rio Grande do Sul e do Paraná a partir da análise do polimorfismo gerado pelos marcadores RAPD, microssatélite (SSR) e AFLP; realizar o agrupamento destes genótipos através das estimativas da similaridade genética e estabelecer possíveis relações entre a similaridade genética e os locais de coleta das variedades crioulas. As reações de PCR para cada marcador foram otimizadas através de protocolos específicos, sendo utilizados: 30 primers RAPD, 47 pares de primers SSR e 25 combinações de primers EcoRI + MseI para o marcador AFLP. Os fragmentos amplificados (RAPD e SSR) foram visualizados em gel de agarose a 2 e 3 %, respectivamente, através de corrida eletroforética horizontal por aproximadamente 4 h a 80 V. Os produtos da amplificação do AFLP foram resolvidos em gel de poliacrilamida (6 %) submetidos à corrida eletroforética vertical por 3 h e 30 minutos a 80 W (1500 V). A genotipagem das variedades de milho com o marcador RAPD amplificou 409 fragmentos com índice médio de polimorfismo de 81,9 %. O SSR gerou 134 fragmentos com 78,3 % de polimorfismo. Por outro lado, o AFLP amplificou 1889 fragmentos com índice médio de polimorfismo de apenas 40,3 %. Os fragmentos polimórficos foram submetidos às análises de similaridade genética através do coeficiente de Jaccard e de agrupamento pelo método UPGMA individualmente e conjuntamente para os marcadores. O coeficiente médio de similaridade foi de 57 % para o RAPD; 56 % para o SSR; 74 % para o AFLP e 69 % para a análise conjunta. Os dendogramas obtidos a partir do RAPD e SSR mostraram 8 grupos distintos, enquanto que o dendograma obtido a partir do AFLP e da análise conjunta formaram 6 e 7 grupos, respectivamente. De maneira geral, as correlações entre as matrizes de similaridade foram baixas, porém entre o AFLP e a análise conjunta foi de 96 %. Os resultados revelaram ampla variabilidade genética entre os acessos de milho crioulo. Os marcadores RAPD e SSR apresentaram os maiores índices médios de polimorfismo e o AFLP demonstrou maiores índices de similaridade genética entre os acessos crioulos. De maneira geral, os marcadores utilizados foram ferramentas eficientes para amostrar a diversidade genética e agrupar as variedades de acordo com os locais de coleta, embora possuam capacidade diferencial de revelar polimorfismo bem como para agrupar os acessos crioulos de milho.
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Caracteriza??o gen?tica de arroz (Oryza Sativa L.) atrav?s de marcadores moleculares RAPD e efici?ncia na aquisi??o de N. / Genetic Characterization of Rice (Oryza sativa l.) Using the RAPD Molecular Markers and Nitrogen Uptake Efficiency.Baptista, Jane de Ara?jo 27 March 2002 (has links)
Submitted by Leticia Schettini (leticia@ufrrj.br) on 2016-08-05T14:09:04Z
No. of bitstreams: 1
2002 Jane Ara?jo Baptista.pdf: 1264077 bytes, checksum: 40b93a67e37e2aad7edfc01cc029f2c4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-05T14:09:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1
2002 Jane Ara?jo Baptista.pdf: 1264077 bytes, checksum: 40b93a67e37e2aad7edfc01cc029f2c4 (MD5)
Previous issue date: 2002-03-27 / We have studied the influence of using 6 different coefficients of similarity when
grouping 16 varieties of rice analyzed by the RAPD technique. DNA samples of these
varieties were amplified using 20 primers, only 15 (75%) of which produced amplified
fragments, compresing 90 of these were polimorphic fragments. The analysis of the
band, profile produced a ?fingerprint?. For the calculation of the similarity index several
coefficients were tested: Nei & Li, Jaccard, Ochiai, Russel & Rao, Simple Matching and
Rogers & Tanimoto. Comparison among them was carried out through the evaluation of
the dendrograms generated by the UPGMA algorithm and by the correlations between
the genetic pitches. The coefficients of Nei & Li, Jaccard, and Ochiai discriminated the
varieties in three main groups according to their genetic similarities. Our results show
that the coefficients of Nei & Li, Jaccard and Ochiai adjusted better the groups with
hight genetic similarities. While the coefficients Simple Matching and Rogers &
Tanimoto were not as efficient, banding together varieties that are genetically different.
In experiments, with the objective to studies the effect of levels (20 or 60 mg N/L) e
forms of N (NH4
+ and NO3
-) under the kinetics parameters, proton extrusion, the
activity of the N-assimilation enzymes and the N-partition in the plant, were conducted
in greenhouse, using 5 upland rice varieties (Lageado, IAC 47, Dobradinho, Agulha e
Bico Ganga), in nutrient solution. It was observed an ample variation of the kinetics
parameters and biochemists, and a distinguishing behavior among varieties in the
uptake and use of N. The varieties Agulha and IAC-47 had presented the best
combination of KM, Vm?x, GS/GOGAT in conditions of hight avaibility of N- NO3
-,
and Bico Ganga, in conditions of low avaibility of N- NO3
- in nutrient solution. In
another experiment, with the objective to study the assimilation and remobiliza??o of N
in season nitrate conditions, used varieties Sagrim?o, Goiano, Zebu, Agulha, IAC 1278,
IR08, Comum Branco, IAC 47 e Ligeiro had been cultivated in nutritional solution. The
N-assimilation enzymes were estudied in the leaf blades and root of 62 and 69 days old
rice plants, under 20 and 200 mg mgN-NO3
-/L. Under higher nitrate supply had increase
the activity of the NR, GS and GOGAT in rice plants. The GS activities had been low in
roots, in comparison with the activities observed in leaf. The GOGAT activity was
bigger in roots, in both the treatments. The GDH-A activity occurred mainly in tessues
foliar. The GDH-D activity occurred in leaf as in roots. The GDH-D activity not
occurred in tissues foliar. The activity of the enzymes of N-assimilation was higher in
tissues foliar. These results seem indicate the leaves as the main site of NH4
+-N
assimilation in rice plants under higher NO3
--supply. / Neste trabalho avaliaram-se as altera??es provocadas por 6 diferentes coeficientes de
similaridade no agrupamento de 16 variedades de arroz analisadas pela t?cnica de
RAPD. Amostras de DNA das variedades foram amplificadas com 20 iniciadores, sendo
15 (75%) produziram fragmentos amplificados, resultando em 90 fragmentos
polim?rficos. A an?lise dos resultados se constituiu na descri??o do padr?o de bandas.
Para o c?lculo do coeficiente de similaridade foram testados os coeficientes Nei & Li,
Jaccard, Ochiai, Russel & Rao, Simple Matching e Rogers & Tanimoto, sendo as
compara??es entre eles realizadas pela avalia??o dos dendrogramas gerados pelo
algoritmo UPGMA e pelas correla??es entre as dist?ncias gen?ticas. Os resultados
obtidos indicam que os melhores coeficientes para determina??o da similaridade foram
os de Nei & Li, de Jaccard e de Ochiai que foram capazes de agrupar as variedades com
alta similaridade, enquanto os coeficientes Simple Matching e de Rogers & Tanimoto
foram ligeiramente inferiores colocando variedades distantes no mesmo grupo. Em
experimentos objetivando analisar o efeito de n?veis (20 e 60 mg N/L) e formas de N
(NH4
+ e NO3
-) sob os par?metros cin?ticos de absor??o, a extrus?o de pr?tons, a
atividade das enzimas de assimila??o de N, e a parti??o de N na planta, usou-se 5
variedades de arroz-de-sequeiro (Lageado, IAC 47, Dobradinho, Agulha e Bico Ganga),
cultivadas em solu??o nutritiva. Houve um comportamento diferencial entre as
variedades quanta ? capacidade de absor??o e uso de N. As variedades Agulha e IAC 47
apresentaram a melhor combina??o de KM, Vm?x, GS/GOGAT em condi??es de alta
disponibilidade de N-NO3
-, e a variedade Bico Ganga, sob condi??es de baixa
disponibilidade de N. Noutro experimento, objetivando estudar a assimila??o e
remobiliza??o de N em condi??es sazonais de N, utilizou-se as variedades Sagrim?o,
Goiano, Zebu, Agulha, IAC 1278, IR 08, Comum Branco, IAC 25 e Ligeiro, com 62 e
69 dias de idade, cultivadas em solu??o nutritiva, com 20 e 200 mg N-NO3
-/L. O
aumento no suprimento de N aumentou a atividade da NR, da GS e GOGAT. A
atividade de NR ocorreu em ra?zes e na parte a?rea. A atividade da GS foi baixa em
ra?zes. A atividade da GOGAT foi maior nas ra?zes, em ambos os tratamentos. A
atividade de GDH-A ocorreu principalmente em tecidos foliares. A atividade de GDHD
ocorreu tanto em folhas como em ra?zes. A atividade das enzimas de assimila??o de
N foi superior nas folhas, indicando serem estas os principais s?tios de incorpora??o de
am?nio em amino?cidos, quando plantas de arroz s?o submetidas a altos n?veis de NO3
-.
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Parâmetros genéticos populacionais como indicadores de sustentabilidade em populações naturais de pimenta rosa - Schinus terebinthifolius RADDI. (Anacardiaceae) no baixo curso do rio São Francisco - SE/AL / POPULATIONAL GENETIC PARAMETERS AS SUSTAINABILITY INDICATORS IN NATURAL POPULATIONS OF RED PEPPER Schinus terebinthifolius RADDI (Anacardiaceae), IN LOW SÃO FRANCISCO RIVER-SE/AL.Carvalho, Sheila Valéria álvares 25 June 2009 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The conservation of forest species requires the prior knowledge of genetic parameters belonging to the population, to help to design strategies for this purpose. This study
aimed to evaluate genetic parameters and suggest indicators of sustainability in populations of Schinus terebinthifolius Raddi. aiming the conservation and maintenance of diversity in this species. In analysis of the study area, were selected 20 descriptors, and these suggested 20 indicators of sustainability for the area. Tender vegetal leaves were sampled in five populations located on the shores and islands of São Francisco River, and the material collected from 15 individuals for each population. In the DNA extraction it was used tender leaves of individuals and 2% CTAB method. We applied 20 primers of 10 bases of arbitrary sequence in amplification, the products were separated in agarose gel at 1% submitted to horizontal electrophoresis, stained with
ethidium bromide and visualized in ultraviolet light. The presence and absence of bands were used to construct a binary matrix for the analysis of genetic parameters. In each
population the percentage of polymorphic loci ranged from 32.92% to 45.34%. The average gene diversity of Nei was 0.37. The total genetic variation observed, 63.60%
corresponded to variation among populations, and 36.40% within populations. The gene flow (Nm) estimated was 0.28. Thus the conclusion is the populations are genetically
isolated, and analyzed the genetic parameters can be used as indicators of sustainability of the area. / A conservação de espécies florestais requer o conhecimento prévio de parâmetros genéticos pertencentes às populações, para se traçar estratégias para este fim. Assim, este trabalho teve como objetivo avaliar parâmetros genéticos e sugerir indicadores de sustentabilidade em populações de Schinus terebinthifolius Raddi. visando à conservação e manutenção da diversidade nesta espécie. Em análise da área de estudo,
foram selecionados 20 descritores, e destes sugeridos 20 indicadores de sustentabilidade da área. As amostragens foram realizadas em cinco populações localizadas nas margens
e ilhas do Rio São Francisco, sendo coletado material de 15 indivíduos para cada uma das populações. Na extração do DNA, empregou-se folhas tenras dos indivíduos e o método CTAB 2%. Foram usados 20 oligonucleotídeos de 10 bases de sequência arbitrária nas amplificações, cujos produtos foram separados em gel de agarose 1% submetidos à eletroforese horizontal, corados com brometo de etídio e visualizados em
luz ultravioleta. A presença e a ausência de bandas foi usada para a construção de uma matriz de binária para a análise dos parâmetros genéticos. Em cada população a porcentagem de locos polimórficos variou de 32,92 a 45,34%. A diversidade média gênica de Nei foi de 0,37. Da variação genética total observada, 63,60% correspondeu à variação entre as populações; e, 36,40% dentro das populações. O fluxo gênico (Nm) estimado foi de 0,28. Desta forma conclui-se que as populações encontram-se isoladas geneticamente e os parâmetros genéticos analisados podem ser utilizados como
indicadores de sustentabilidade da área.
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Parâmetros genéticos populacionais como indicadores de sustentabilidade em populações naturais de pimenta rosa - Schinus terebinthifolius RADDI. (Anacardiaceae) no baixo curso do rio São Francisco - SE/AL / POPULATIONAL GENETIC PARAMETERS AS SUSTAINABILITY INDICATORS IN NATURAL POPULATIONS OF RED PEPPER Schinus terebinthifolius RADDI (Anacardiaceae), IN LOW SÃO FRANCISCO RIVER-SE/AL.Carvalho, Sheila Valéria álvares 25 June 2009 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The conservation of forest species requires the prior knowledge of genetic parameters belonging to the population, to help to design strategies for this purpose. This study
aimed to evaluate genetic parameters and suggest indicators of sustainability in populations of Schinus terebinthifolius Raddi. aiming the conservation and maintenance of diversity in this species. In analysis of the study area, were selected 20 descriptors, and these suggested 20 indicators of sustainability for the area. Tender vegetal leaves were sampled in five populations located on the shores and islands of São Francisco River, and the material collected from 15 individuals for each population. In the DNA extraction it was used tender leaves of individuals and 2% CTAB method. We applied 20 primers of 10 bases of arbitrary sequence in amplification, the products were separated in agarose gel at 1% submitted to horizontal electrophoresis, stained with
ethidium bromide and visualized in ultraviolet light. The presence and absence of bands were used to construct a binary matrix for the analysis of genetic parameters. In each
population the percentage of polymorphic loci ranged from 32.92% to 45.34%. The average gene diversity of Nei was 0.37. The total genetic variation observed, 63.60%
corresponded to variation among populations, and 36.40% within populations. The gene flow (Nm) estimated was 0.28. Thus the conclusion is the populations are genetically
isolated, and analyzed the genetic parameters can be used as indicators of sustainability of the area. / A conservação de espécies florestais requer o conhecimento prévio de parâmetros genéticos pertencentes às populações, para se traçar estratégias para este fim. Assim, este trabalho teve como objetivo avaliar parâmetros genéticos e sugerir indicadores de sustentabilidade em populações de Schinus terebinthifolius Raddi. visando à conservação e manutenção da diversidade nesta espécie. Em análise da área de estudo,
foram selecionados 20 descritores, e destes sugeridos 20 indicadores de sustentabilidade da área. As amostragens foram realizadas em cinco populações localizadas nas margens
e ilhas do Rio São Francisco, sendo coletado material de 15 indivíduos para cada uma das populações. Na extração do DNA, empregou-se folhas tenras dos indivíduos e o método CTAB 2%. Foram usados 20 oligonucleotídeos de 10 bases de sequência arbitrária nas amplificações, cujos produtos foram separados em gel de agarose 1% submetidos à eletroforese horizontal, corados com brometo de etídio e visualizados em
luz ultravioleta. A presença e a ausência de bandas foi usada para a construção de uma matriz de binária para a análise dos parâmetros genéticos. Em cada população a porcentagem de locos polimórficos variou de 32,92 a 45,34%. A diversidade média gênica de Nei foi de 0,37. Da variação genética total observada, 63,60% correspondeu à variação entre as populações; e, 36,40% dentro das populações. O fluxo gênico (Nm) estimado foi de 0,28. Desta forma conclui-se que as populações encontram-se isoladas geneticamente e os parâmetros genéticos analisados podem ser utilizados como
indicadores de sustentabilidade da área.
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Caracterização morfoagronômica de progênies de guaranazeiroFajardo, Juan Daniel Villacis 26 February 2016 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:06Z
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Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1
Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1
Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-30T15:17:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2016-02-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The guaraná (Paullinia cupana var. Sorbilis (Mart.) Ducke) is a native plant
valued by Amazonian peoples, especially by Sateré-Maue tribe in northern
Amazon region on the border with the state of Pará. Research shows that
guaraná has stimulating and therapeutic properties that make it an important
input for chemical refrigerants, pharmaceutical, and cosmetics. The aim of the
study was to evaluate genetic, estimate variance components for morphological
characteristics, and production of guaraná progenies. In the experiment
conducted in the city of Maués-Am / EMBRAPA were evaluated 36 progenies
brothers guaraná means in experimental design of randomized blocks with two
replications and six plants per plot for agronomic characters and fruit yield
(g.plant-1.year-1) arranged in two rows of three plants, spaced 5 m x 5 m. The
analysis of quantitative character production (g.plant-1.year-1) was based on the
average production over six years. The average of the best individual
production was 28,355 g.plant-1.year-1, which is ten times higher than the state
average productivity. Progenies have enough genetic diversity for selection of
progeny and senior individuals with controlled crossings or intercross could
generate a base population with high productivity and sufficient genetic diversity
increases the likelihood of recovery of superior genotypes. / O guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) é uma planta
nativa valorizada pelos povos Amazônicos, especialmente pela tribo Sateré-
Maué no norte da região Amazônica, na fronteira com o estado do Pará. As
pesquisas mostram que o guaraná tem propriedades estimulantes e
terapêuticas o que o tornam um importante insumo para as indústrias químicas
de refrigerantes, farmacêuticas, e cosméticos. O objetivo do estudo foi avaliar
valores genéticos, estimar componentes de variância para caracteres
morfoagronômicos, e da produção de progênies de guaranazeiro. No
experimento conduzido na cidade de Maués-Am/EMBRAPA, foram avaliadas
36 progênies de meios irmãos de guaranazeiro em delineamento experimental
de blocos ao acaso com duas repetições e seis plantas por parcela para os
caracteres agronômicos e produção de frutos (g.planta-1.ano-1) dispostas em
duas fileiras de três plantas, no espaçamento de 5 m x 5 m. A análise do
caráter quantitativo Produção (g.planta-1.ano-1) foi baseado na média da
produção ao longo de seis anos. A média da produção do melhor indivíduo foi
de 28.355 g.planta-1.ano-1, que é dez vezes maior do que a produtividade
média estadual. As progênies apresentam diversidade genética suficiente para
a seleção de progênies e de indivíduos superiores que com cruzamentos
controlados ou intercruzamentos poderiam gerar uma população base com alta
produtividade e diversidade genética suficiente aumentando a probabilidade de
recuperação de genótipos superiores.
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Isolamento de microssatélites e análise genética de ararinha-azul (Cyanopsitta spixii, Aves, Psittaciformes) / Isolation of microsatelites and genetic analysis of Spix\'s macaw (Cyanopsitta spixii, Psitaciformes, Aves)Rafaella Sávia Monteiro 19 June 2015 (has links)
A ararinha-azul (Cyanopsitta spixii) é uma das aves mais ameaçadas do mundo e está extinta na natureza. Estudos estão sendo realizados para o manejo e conservação em cativeiro para futura reintrodução. Microssatélites são marcadores moleculares úteis para estimar parentesco entre indivíduos. Esse dado pode ser utilizado para minimizar os efeitos deletérios da endogamia e a perda de diversidade genética do plantel do programa de reprodução em cativeiro, recomendando pares reprodutivos. O presente estudo teve como objetivos identificar microssatélites polimórficos específicos para acessar o nível de diversidade genética da espécie e estimar o parentesco entre pares de aves para auxiliar o manejo genético da população. O genoma de um indivíduo foi parcialmente sequenciado na plataforma 454 GS FLX (Roche). Foram desenhados 25 pares de primers, sendo 20 para dinucleotídeos e cinco para tetranucleotídeos. Dezenove microssatélites puderam ser amplificados e foram testados quanto ao nível de polimorfismo em 12 indivíduos selecionados. Desses, 14 microssatélites foram polimórficos. Também foram usados dados de microssatélites heterólogos nas análises. Dois microssatélites apresentaram desvio do equilíbrio de Hardy-Wenberg e cinco microssatélites foram excluídos devido à presença de desequilíbrio de ligação. A probabilidade de exclusão de paternidade quando um parental é conhecido foi de 94,8% e a probabilidade de identidade foi de 0,00000793. A riqueza alélica média foi de 2,49 alelos por microssatélite, confirmando a baixa diversidade genética da espécie. Alguns alelos já foram perdidos no plantel atual em cativeiro. A população tem valor de índice de parentesco médio similar àquela de, no mínimo, primos de primeiro grau e alguns dos fundadores são muito aparentados. Alguns potenciais casais com baixo índice de parentesco r podem vir a ser importantes para o programa de reprodução em cativeiro. / Spix\'s macaw (Cyanopsitta spixii) is one of the most endangered birds of the world and is extinct in the wild. Several coordinated studies are being conducted for its management and conservation in captivity for future reintroduction. Microsatellites are useful markers to estimate relatedness between individuals. This information can be used to minimize the deleterious effects of inbreeding and loss of genetic diversity of captive birds, recommending less closely related pairs for the breeding program. The present study aims to identify specific polymorphic microsatellites to assess the levels of genetic variability of the species and the genetic relatedness among birds for the genetic management of the population. The partial genome of an individual was sequenced on a 454 GS FLX (Roche) platform. Twenty-five pairs of primers were designed, being 20 for di- and five tetra-nucleotide microsatellites. Nineteen microsatellites were amplified and tested in 12 selected individuals. Fourteen microsatellites were polymorphic. Heterologous microsatellites were also used in the analyses. Two microsatellites were not in Hardy-Weinberg equilibrium and five presented linkage disequilibrium. Exclusion paternity probability when one parental is known was 94.8% and identity probability was 0.00000793. Mean allele richness was 2.49 alleles per microsatellite, confirming the low genetic diversity of the species. The current captive population has lost some alleles. The mean relatedness among individuals was, at least, similar to the one between first cousins and some founders are very closely related. Based on the relatedness index, some unrelated potential couples can become important for the captive program.
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