Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:30Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-28Bitstream added on 2014-06-13T20:37:27Z : No. of bitstreams: 1 souza_a_me_jabo.pdf: 1098095 bytes, checksum: 90c36824f4f63db09ab3ab57ecb91613 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A mangueira (Mangifera indica L.) conta com diversos problemas de ordem fitossanitária, destacando-se como um dos mais importantes, a antracnose, causada na maioria das vezes pelo fungo C. gloeosporioides. Dada a importância comercial dessa doença, esse trabalho teve por objetivo realizar a caracterização genética e patogênica de uma população de isolados de Colletotrichum spp. oriundos de tecidos com sintomas de antracnose de diferentes variedades e órgãos das plantas de manga, dos principais municípios produtores do Estado de São Paulo, além de compará-los geneticamente com isolados obtidos de citros. O sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2 possibilitou a identificação de 183 isolados de uma população obtida de mangueiras como C. gloeosporioides, com exceção de apenas um deles, o qual foi identificado como C. acutatum. Já os isolados de citros, sendo três obtidos de folhas assintomáticas e dois de flores com sintomas de podridão, foram classificados em C. gloeosporioides e C. acutatum, respectivamente. Os resultados obtidos mediante o emprego de marcadores fAFLP indicaram uma alta variabilidade genética entre isolados de uma mesma população e a ocorrência de fluxo gênico. Além disso, tais resultados corroboraram aqueles obtidos pelo sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, por agruparem os isolados do estudo segundo a sua espécie. Os isolados representativos da população, inclusive aqueles obtidos de citros, de ambas as espécies de Colletotrichum, causaram sintomas típicos de antracnose quando inoculados em folhas de mangueiras „Palmer‟ e „Tommy Atkins‟, indicando que, provavelmente, não há especificidade de hospedeiros para essas espécies / The mango crop (Mangifera indica L.) is attacked by several diseases and in this context, the anthracnose is one of the most important. This disease is caused by the fungus C. gloeosporioides in most situations. Due to economic importance of the anthracnose on mango, the aim of this study was to analyze the genetic and pathogenic variability of Colletotrichum spp. isolates obtained from different organs and varieties of mango plants with anthracnose symptoms, and from different municipalities of São Paulo State that are among the major producers of mango. The isolates from mango were also compared with isolates obtained from citrus. Sequencing of ITS1-5.8S-ITS2 region from 183 isolates obtained from mango allowed the identification of them as C. gloeosporioides, however, one of them, was identified as C. acutatum. The isolates from citrus, obtained from syptomless leaves and flowers with rot symptoms, were identified as C. gloeosporioides and C. acutatum, respectively. The results obtained by applying fAFLP markers indicated high level of genetic variability among isolates within population and the occurrence of gene flow. Moreover, these results corroborated those achieved by sequencing of the ITS1-5.8S-ITS2 region, because the isolates were grouped according to its species. Representative isolates of the population, including those obtained from citrus, belonging to both species of Colletotrichum, caused typical symptoms of anthracnose disease on mango leaves of Palmer and Tommy Atkins varieties, indicating the lack of host specificity for these species

Orientador: Antonio de Goes / Banca: Rita de Cassia Panizzi / Banca: Nilvanira Donizete Tebaldi / Resumo: A Podridão floral dos citros (PFC), ocasionada por Colletotrichum acutatum e C. gloeosporioides, reduz consideravelmente a produção de citros nas principais áreas produtoras e a utilização de fungicidas ainda é a estratégia de controle mais eficaz. No ano de 2012 os benzimidazóis, grupo químico que por muitos anos foi importante no controle de PFC, tiveram seu uso suspenso em pomares de citros destinados à produção de suco para exportação, uma exigência de adequação aos padrões de qualidade dos EUA, principal comprador. Em decorrência disso, fez-se necessária a busca por novos fungicidas, que apresentassem boa eficiência agronômica e que atendessem às taxas de resíduos permitidas. Sendo assim, o objetivo do presente estudo foi avaliar novos grupos químicos de fungicidas, isoladamente ou em combinação, bem como reguladores de crescimento, indutores de resistência e fertilizantes químicos no controle da PFC, em pomares comerciais, nas safras 2012/13 e 2013/14. Os experimentos foram realizados em plantas de laranjeira „Pera‟ localizadas nos municípios paulistas de Itapetininga (IT), Santa Cruz do Rio Pardo (SC) e Casa Branca (CB). O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados (DBC), com cinco repetições. Dentre as novas estratégias de manejo foram avaliadas: i) Fungicidas dos grupos das estrobilurinas em combinação com outros grupos químicos; ii) Reguladores de crescimento aplicados isoladamente ou em combinação com reguladores hormonais e fungicidas; iii) Eficiência de misturas de estrobilurinas e triazóis, aplicadas em conjunto com reguladores hormonais e fertilizantes químicos; iv) Eficiência de clorotalonil combinado a estrobilurinas e triazóis, e v) Eficiência de Stimulate combinado a Hold e fungicida. Observou-se que fungicidas do grupo das estrobilurinas em combinação com triazóis ou clorotalonil, bem como a utilização de biorreguladores e indutores ... / Abstract: The postbloom fruit drop (PFD), caused by Colletotrichum acutatum and C. gloeosporioides, considerably reduces citrus production in the main producing areas and the use of fungicides is still the most effective control strategy. In 2012 benzimidazoles, chemical group which, for many years, was important in controlling PFD, have had their use suspended in citrus orchards for the production of exportation juice, an adaptation requirement to the quality standards of the USA, the main buyer. As a result, it was made necessary to search for new fungicides enhancing good agronomic efficiency and heeding the rate of waste allowed. Thus, the aim of this study was to evaluate new chemical groups of fungicides, alone or in combination, as well as growth regulators, resistance inducers and chemical fertilizers to control PFC in commercial orchards, during 2012/13 and 2013/14 crop seasons. The experiments were performed with sweet orange 'Pera' trees located in the municipalities of Itapetininga (IT), Santa Cruz do Rio Pardo (SC) and Casa Branca (CB). The experimental design was a randomized block design (RBD) with five replications. Among the new management strategies were evaluated: i) fungicides of the strobilurin group in combination with other chemical groups; ii) growth regulators applied alone or in combination with hormonal regulators and fungicides; iii) efficiency of strobilurin and triazole mixtures applied in conjunction with hormonal regulators and chemical fertilizers; iv) efficiency of strobilurins and triazoles combined with chlorothalonil, v) efficiency Stimulate® combined to Hold® and fungicide. It was observed that fungicides of the strobilurin and triazoles groups or in combination with chlorothalonil, as well as the use of bioregulators e resistance inducers are efficient alternative preventive control of the PFC / Mestre

Orientador: Antonio de Goes / Banca: Rita de Cássia Panizzi / Banca: Nilvanira Donizete Tebaldi / Resumo: A podridão floral dos citros (PFC) é uma importante doença dessa cultura, responsável por elevadas perdas de produção. Normalmente, essa doença mostra-se limitante quando ocorrem prolongados períodos chuvosos durante o florescimento das plantas ou quando existe intenso molhamento foliar. Duas espécies de Colletotrichum estão associadas à doença: C. acutatum e C. gloeosporioides. Entretanto, recentemente tem-se verificado que, mesmo sob condições não tão propícias, a doença tem ocorrido com relativa frequência; suspeitando-se do envolvimento de outras espécies de Colletotrichum ou de novas condições de adaptação das espécies descritas. Esse trabalho teve como objetivo determinar se há ou não outra espécie de Colletotrichum associada a PFC e avaliar a viabilidade do emprego de marcadores moleculares ISSR na caracterização taxonômica de isolados de Colletotrichum spp. associados a sintomas de PFC em flores, assim como de tecidos foliares e frutos cítricos assintomáticos. Para tanto, foi empregada uma combinação de iniciadores específicos, levando em conta a região ITS e marcadores moleculares ISSR. Os marcadores ISSR mostraram-se eficientes na caracterização taxonômica dos isolados de Colletotrichum analisados. A população avaliada foi constituída apenas por C. acutatum e C. gloeosporioides, descartando o envolvimento de uma espécie adicional, o que converge com os registros na literatura. Foi constatada alta diversidade genética entre os isolados analisados, o que também se mostra convergente quanto às diferenças fenotípicas observadas sob condições de campo. Entretanto, não foi encontrada relação quanto à origem e as espécies de Colletotrichum spp. associadas. De modo inédito, ainda que assintomaticamente, foi detectada a presença de um isolado de C. acutatum associado a frutos cítricos / Abstract: Postbloom fruit drop of citrus (PFD) is a serious disease of this crop, accounting for high yield losses. Usually, this disease shows to be limiting when there are prolonged rainy periods during plant flowering or when there is intense leaf wetness. Two Colletotrichum species are associated with the disease: C. acutatum and C. gloeosporioides. However, recently, it has been found that, even under not so favorable conditions, the disease has occurred with some frequency; one suspects the involvement of other Colletotrichum species or new adaptation conditions of the described species. This study aimed to determine whether there is another Colletotrichum species associated with PFD and it assess the viability of using molecular markers ISSR for taxonomic characterization of Colletotrichum spp. isolates associated with PFD symptoms in flowers, as well as of leaf tissues and asymptomatic citrus fruits. For this purpose, we used a combination of specific primers, taking into account the ITS region and ISSR molecular markers. ISSR markers have proven to be effective for taxonomic characterization of the Colletotrichum isolates analyzed. The population assessed consisted only of C. acutatum and C. gloeosporioides, discarding the involvement of an additional species, something which converges with records in the literature. We found high genetic diversity among the isolates analyzed, and this also shows to converge as for the phenotypic differences observed under field conditions. However, no relation was found regarding the origin and associated Colletotrichum spp. species. In an unprecedented way, although asymptomatically, we detected the presence of a C. acutatum isolate associated with citrus fruits / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4458_1.pdf: 786506 bytes, checksum: 30ccb6ed2c83e0fa52dedbb745159fb1 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / Foram analisadas 20 linhagens de C. gloeosporioides quanto às características genéticas e citomorfológicas. Os marcadores moleculares, RAPD, microssatélites, Intron Spice Site Primer e região ITS do DNA ribossomal, foram utilizados para avaliar a diversidade genética entre as linhagens. A análise de agrupamento através do método UPGMA confirmou a diversidade genética intraespecífica reconhecida em C. gloeosporioides. Com a técnica de RAPD foi detectada uma maior similaridade genética entre as linhagens. As regiões de microssatélites investigadas, demonstraram alto polimorfismo genético e os introns discriminaram todos as linhagens apenas com o primer (EI-1), e revelaram maior diversidade genética em relação aos outros marcadores moleculares utilizados. As três enzimas de restrição testadas, HaeIII, DraI e MspI evidenciaram a diversidade genética entre as linhagens nos produtos de amplificação dos loci ITS1-5.8S-ITS2 do rDNA com os primers ITS1 e ITS4. Todos os marcadores empregados, foram eficientes em demonstrar o alto grau de polimorfismo genético, constatado pela formação de grupos altamente diversificados, sem apresentar correlação entre os hospedeiros. Os aspectos macroscópicos exibiram uma variação na coloração, textura e segregação de setores nas colônias, e as observações microscópicas demonstraram a formação de estruturas vegetativas e reprodutivas peculiares da espécie. A condição nuclear investigada através da técnica de HCl-Giemsa, evidenciou conídios 100% uninucleados

A antracnose é uma das doenças mais importantes do pimentão em vários países. Por muitos anos, somente C. gloeosporioides foi relatado como agente causal da antracnose desta cultura no Brasil. Entretanto, recentemente C. acutatum e C. capsici também tem sido associados a esta doença em algumas regiões do país. Neste trabalho, 56 isolados de Colletotrichum obtidos de pimentão e procedentes de diferentes regiões produtoras do país foram caracterizados e identificados por meio de algumas características morfológicas e culturais, e pela análise por PCR utilizando oligonucleotídeos espécie-específicos. Isolados representativos de cada espécie identificada na população amostrada também foram caracterizados quanto à patogenicidade em frutos de pimentão verdes e maduros, feridos e não feridos e quanto a sensibilidade aos fungicidas azoxistrobina, carbendazim, tiabendazol, tebuconazol, captana, clorotalonil e cloreto de benzalcônio. Os resultados demonstram que C. acutatum é a espécie predominante nas principais regiões produtoras de pimentão do país, representando cerca de 72% da população amostrada. C. capsici foi encontrada com freqüência aproximada de 14%, nos estados de São Paulo e Minas Gerais. C. gloeosporioides representou apenas 5% da população amostrada e teve distribuição restrita ao estado de São Paulo e ao Distrito Federal. Um único isolado de C. coccodes foi encontrado no Rio Grande do Sul. Além dessas espécies, isolados identificados como C. boninense foram encontrados em São Paulo e no Rio Grande do Sul, com freqüência de 7% na população amostrada. Este parece ser o primeiro relato de C. boninense infectando pimentão no Brasil e em outras partes do mundo. A caracterização patogênica mostrou que isolados representativos de todas as espécies foram patogênicos aos frutos maduros feridos e não feridos. Nos frutos verdes feridos, apenas os isolados de C. acutatum e de C. capsici promoveram sintomas. Não foram observados sintomas nos frutos verdes sem ferimentos durante o período de avaliação do experimento (12 dias) para nenhum dos isolados. C. acutatum demonstrou ser a espécie mais agressiva, apresentando os menores períodos de latência e a maior esporulação tanto em frutos verdes (feridos) como nos maduros (feridos e não feridos). Os isolados pertencentes a diferentes espécies de Colletotrichum apresentaram sensibilidade diferenciada para todos os fungicidas sistêmicos avaliados. Os isolados de C. acutatum foram mais sensíveis a azoxistrobina, enquanto os isolados de C. gloeosporioides demonstraram a menor sensibilidade para este fungicida. Os isolados de C. gloeosporioides e C. boninense foram os mais sensíveis aos benzimidazóis (carbendazim e tiabendazol), enquanto o isolado de C. coccodes teve a menor sensibilidade para estes fungicidas. O fungicida tebuconazol promoveu o maior controle sobre o crescimento micelial dos isolados. Para este fungicida, C. capsici demonstrou ser a espécie menos sensível. Os resultados deste trabalho demonstram a presença de pelo menos cinco espécies de Colletotrichum responsáveis pela antracnose do pimentão no país e evidenciam a presença de importantes diferenças entre essas, que devem ser consideradas durante o manejo da doença. / In several countries, anthracnose is one of the most serious diseases in pepper. C. gloeosporioides has, for many years, been reported as the causal agent of anthracnose in Brazil. C. acutatum and C. capsici have only recently been reported as agents of anthracnose in some regions of the country. In this study, 56 isolates of Colletotrichum obtained from pepper from different areas of the country were characterized and identified based on the morphological characteristics of the conidia, as well as culture characteristics and PCR analysis with species-specific pairs of primers. Isolates representative of each identified species in the sampled population were also characterized according to their pathogenicity in pepper fruits (unripe, ripe, wounded and nonwounded) and also according to their sensitivity to fungicide (azoxystrobin, carbendazim, thiabendazole, tebuconazole, captan, chlorothalonil and benzalkonium chloride). The results have showed that C. acutatum is the most prevalent species found in the main production areas of pepper, present in about 72% of the sampled population. C. capsici was equivalent to 14% of the sampled population and found in the states of São Paulo and Minas Gerais. C. gloeosporioides was present in only 5% of the samples and it was restricted to the state of São Paulo and Distrito Federal. Only one isolate of C. coccodes was found in Rio Grande do Sul. Besides theses species, isolates of C. boninense were found in São Paulo and Rio Grande do Sul, with an occurrence of 7% in the sampled population. This seems to be the first report of C. boninense infecting pepper in Brazil and other parts of the world. The pathogenic characterization showed that representative isolates of all species were pathogenic in ripe, wounded, or nonwounded fruits. In wounded green fruit, only isolates of C. acutatum and C. capsici caused infection resulting in disease symptoms. No disease symptoms were observed in green nonwounded fruits inoculated with all Colletotrichum isolates, after 12 days of inoculation. C. acutatum was the most aggressive species with the shortest periods of latency and the highest rate of sporulation in either green wounded fruits or ripe fruits (wounded and nonwounded). Isolates of different species of Colletotrichum showed different sensitivity to the systemic fungicides evaluated. The isolates of C. acutatum were more sensitive to azoxystrobin, whereas C. gloeosporioides showed the lowest sensitivity to this fungicide. C. gloeosporioides and C. boninense isolates were the most sensitive to benzimidazoles fungicides (carbendazim and thiabendazole), whereas C. coccodes isolates showed the lowest sensitivity to these fungicides. The tebuconazol fungicide exerted the highest effect on mycelial growth for all Colletotrichum species. C. capsici showed to be less sensitive to this fungicide. The results of this work have shown the presence of at least five species of Colletotrichum responsible for anthracnose in pepper in Brazil and have made evident the importance of the differences between these species, which must be taken into account for the control of the disease.

Orientador: Marta Cristina Teixeira Duarte / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-27T13:08:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Almeida_GustavoSteffende_M.pdf: 767493 bytes, checksum: c194394bcc80ba1852de47976dba16ad (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: A cultura do morango é de grande importância no contexto agrícola mundial, com uma produção anual que supera 4,5 milhões de toneladas. Porém, as características desta fruta a tornam altamente susceptível a fatores físicos e biológicos de deterioração, tornando-a altamente perecível e acarretando altos níveis de perdas no campo e na pós-colheita. Dentre os fatores biológicos tem destaque a ação de fungos fitopatogênicos, dentre os quais o 'Botrytis cinerea' e o' Colletotrichum gloeosporioides' tem papel principal. Dentre as alternativas naturais para controle destes fitopatógenos, os óleos essenciais de plantas medicinais e aromáticas vêm sendo investigados. Neste contexto, no presente trabalho a atividade antifúngica de óleos essenciais de nove espécies de 'Citrus' e de 'Cymbopogon citratus' foi avaliada in vitro contra 'B. cinerea' e' C. gloeosporioides'. Os óleos de 'Citrus sinensis' e 'C. citratus' foram os mais ativos in vitro (MIC ¿ 0,25 e 0,06 mg.mL-1, respectivamente) e, portanto, selecionados para os ensaios com morangos in natura, visando manter sua qualidade pós-colheita. Os ensaios foram conduzidos sob duas condições ambientais, ou seja, sob condições ambiente de armazenamento (25 ºC) e em armazenamento refrigerado (10 ºC). Aplicados na concentração 1,0 mg.mL-1 , o óleo essencial de 'C. sinensis' mostrou-se mais eficaz sob condições ambiente de armazenamento, e a mistura dos dois óleos em partes iguais em armazenamento refrigerado. Em ambas as condições, melhores resultados foram obtidos através da aplicação por contato direto. Os óleos essenciais foram ainda incorporados a um filme de revestimento composto por matriz de metil-celulose e testados in vitro quanto ao seu potencial de inibição de 'B. cinerea'. Nestas condições, o óleo essencial de 'C. sinensis' mostrou-se o mais eficiente. Através dos resultados foi possível concluir que os óleos essenciais são uma opção viável para o controle de fitopatógenos em morango e para manutenção de sua qualidade pós-colheita / Abstract: The strawberry crop has great importance in agricultural world wide context, with an annual production exceeding 4.5 million tons. However, the characteristics of this fruit make it highly susceptible to physical and biological damage, making it easily perishable and causing losses in field and postharvest. Among the biological factors, the action of phytopathogenic fungi such as 'Botrytis cinerea' and "Colletotrichum gloeosporioides" have a main role. Natural alternatives have been proposed in order to replace synthetic products currently used in control of these plant pathogens, of which the essential oils from medicinal and aromatic plants have demonstrated good potential. In this context, the present study evaluated the in vitro antifungal activity of the essential oils from nine 'Citrus' species and from' Cymbopogon citratus' against 'B. cinerea' and 'C. gloeosporioides'. 'Citrus sinensi's and 'C. citratus' essential oils showed highest activities (MIC values 0.25 mg.mL-1 and 0.06 mg.mL-1, respectively) and were selected for the assays with in natura strawberries aiming at maintaining its postharvest quality. The tests were conducted under two simulated environmental conditions, ie, environment conditions of storage (25 ºC) and refrigerated storage (10 ºC). The crude essential oil of 'C. sinensis' (1.0 mg.mL-1) was the more effective in environmental conditions of storage, and the mixture of the two oils (1:1 ¿ 1.0 mg.mL-1) in refrigerated storage. In both conditions, best results were obtained when the oils were applied by direct contact. The essential oils were also incorporated into a coating film consisting of methyl cellulose matrix and tested to their 'in vitro' inhibitory potential against 'B. cinerea'. Accordingly, the essential oil of 'C. sinensis' proved to be the most effective as antifungal. The results allowed conclude that essential oils are a viable option for controlling phytopathogenic fungi in strawberry and for continuing postharvest quality / Mestrado / Ciência de Alimentos / Mestre em Ciência de Alimentos

The mango (Mangifera indica L.) is an appealing subtropical fresh fruit with a pleasant flavor and taste, high nutritional value, beneficial medicinal properties and various processing options. However, as is the case with most subtropical fruit, it is a sensitive commodity, prone to losses postharvestly. The South African mango industry is highly dependent on a hot water and cold prochloraz dip treatment, to control postharvest anthracnose and soft brown rot on fruit destined for export. However, negatve public perceptions of synthetic fungicides and its use on fresh produce for disease control has been increasing in major export markets such as the European Union. This growing concern from a public point of view is forcing industry to consider more environmentally acceptable methods to maintain quality of mangoes during extended export periods. ‘Tommy Atkins’ and ‘Kent’ mangoes either uninoculated or artificially inoculated with Colletotrichum gloesporioiedes, Botryosphaeria parva or sterile agar, were used to evaluate softer, greener alternatives, in this study. Fruit were subjected to either a hot, Bacillus amyloliquefaciens (PPCB004) containing dip treatment for two minutes or a 24 hour 1-methylcyclopropene (1-MCP) gas treatment at 16 ºC or no treatment. Fruit were then stored at 10 ºC under either 5% O2 and 5% CO2 (CA-1) or 3% O2 and 8% CO2 (CA-2) controlled atmospheres (CA) for 18 days and allowed to ripen for five days at 25 ºC. Similarly, uninoculated or artificially inoculated fruit subjected to B. amyloliquefaciens, 1-MCP or a combination of the two treatments was stored at 10 ºC for 18 days under conventional storage. ‘Tommy Atkins’ fruit were packed into bags made from four different film types, untreated or after being subjected to a cold B. amyloliquefaciens dip treatment and stored for 23 days at 10 ºC. Overall, ‘Kent’ fruit were more susceptible to anthracnose and SBR after artificial inoculation. In vivo inoculated ‘Tommy Atkins’ fruit, storage under CA-1 gave the best control of soft brown rot whilst CA-2 storage gave the best control of anthracnose. For quality retention no definite conclusion could be made for both cultivars after CA storage or the combination of 1-MCP pre-treatment and CA storage. The combination of 1-MCP pre-treatment and B. amyloliquefaciens maintained the quality of ‘Kent’ mangoes under conventional storage the best. Anthracnose severity on both cultivars was reduced with 1-MCP treated fruit combined with the biocontrol pre-treatment. Modified atmosphere packaging in this study was found to be ineffective in maintaining quality of mangoes. Copyright / Dissertation (MSc(Agric))--University of Pretoria, 2011. / Microbiology and Plant Pathology / unrestricted

Die pilzlichen Erreger der Tomate Alternaria solani und des Manioks Colletotrichum gloeosporioides f.sp. manihotis verursachen große Ertragsausfälle in Westafrika. In der vorliegenden Arbeit wurden die Blattkrankheiten nach Applikationen mit wässerigen Extrakten aus Westafrika (Ausgangsmaterial: organischer Haushaltsmüll) unter kontrollierten Bedingungen unterdrückt. Im Pathosystem Tomate - A. solani erzielten die Extrakte eine Befallsverminderung um bis zu 94 % im Vergleich zur Kontrollvariante und im Maniok - C. gloeosporioides wurde die Anzahl der gebildeten Acervuli/cm² Blattoberfläche bis um 87 % reduziert. Der primäre Wirkmechanismus der Extrakte gegen die Pathogene ist Antagonismus, hervorgerufen von den Mikroorganismen in den Extrakten. Isolierte Bakterien aus den Extrakten hemmten das Wachstum der Pathogene in Plattentests, was auf die Bildung von fungistatischen Substanzen zurückzuführen war. Die Bakterien, die aus den Extrakten isoliert und identifiziert wurden, gehörten überwiegend zu den Bakteriengattungen Pseudomonas und Bacillus. Die Extraktionsbedingungen nahmen in Hinblick auf die Wirksamkeit der Extrakte gegen die Pathogene eine wichtige Stellung ein. Die Untersuchungen zeigten einen Zusammenhang zwischen gestiegener Mikroorganismenanzahl und Befallsreduktion. Durch die Auswahl optimaler Extraktionsbedingungen erhöhte sich die Anzahl der Koloniedichte in den Extrakten; dies führte zur einer stärkeren Befallsreduzierung an der Tomate und am Maniok. Hierbei waren die Umgebungstemperatur und die Häufigkeit des Durchmischens des Kompost-Wasser-Gemisches von besonderer Bedeutung. Extrakte, die während der Extraktionszeit einer Temperatur von 20°C ausgesetzt waren, erzielten eine stärkere Befallsreduzierung von A. solani an der Tomate und wiesen eine höhere Mikroorganismendichte auf als Extrakte, die einer Temperatur von 30°C und 35°C ausgesetzt waren. Tägliches Durchmischen des Wasser-Kompost-Gemisches während der Extraktionszeit erhöhte die Mikroorganismendichte um das Siebenfache in den Extrakten und die Wirksamkeit gegen A. solani und C. gloeosporioides im Vergleich zu den Extrakten, die nur zu Beginn durchmischt wurden. Die Lagerungszeit der fertigen Komposte hatte einen Einfluß auf die Mikroorganismendichte der wässerigen Extrakte sowie auf deren Wirksamkeit. Extrakte, die aus frischen Komposten hergestellt wurden, zeigten einen besseren suppressiven Effekt gegen die Pathogene und wiesen eine höhere Mikroorganismenanzahl auf als Extrakte, deren Komposte schon länger gelagert worden waren. Die Anreicherung der Extrakte mit dem Formulierungshilfsstoff Xanthan steigerte die Wirksamkeit der Extrakte gegen A. solani an Tomatenpflanzen und gegen C. gloeosporioides f.sp. manihotis an abgetrennten Maniokblättern. Angereicherte Extrakte reduzierten den Befall um bis zu 46 % mehr als der Extrakt ohne Formulierungshilfsstoffe, während die Steigerung der Wirksamkeit nach Anreicherung mit Alginat oder Zellulose eine Abhängigkeit von der Herkunft der Komposte zeigte. Eine erhöhte ß-1,3-Glucanase-Aktivität wurde am vierten Tag nach der Applikation von Extrakten an der Tomate und an der Batate festgestellt. Diese Ergebnisse belegen die Bedeutung von Spritzbehandlungen mit wässerigen Kompostextrakten gegen die Pathogene A. solani und C. gloeosporioides f.sp. manihotis und stellen eine erfolgversprechende Alternative zur Bekämpfung von Pilzkrankheiten in Westafrika dar. / Great yield losses of cassava in West Africa are caused by fungal pathogens that also affect tomato, e.g. Alternaria solani and Colletotrichum gloeosporioides f sp. manihotis. In the present study these foliar diseases were effectively suppressed under controlled conditions after application of watery compost extracts to tomato and cassava The disease incidence of A. solani on tomato was reduced up to 94 % and the number of the acervuli produced on the surface of cassava leaves was reduced up to 87% compared to the control treatment. Reduction is due to antagonistic effects of the microorganisms in the extracts towards the pathogens. Bacterial strains isolated from the extracts suppressed the growth of the pathogens in dual-culture-tests due to the production of antibiotics. Bacteria isolated and identified from the extracts were mostly pseudomonas and bacillus strains. The conditions used for extraction of compost played a significant role for their effectiveness against different pathogens. The investigations showed that optimisation of extract conditions increased the density of microorganisms in the extracts and led to a higher disease reduction on tomato and cassava plants. Temperature and stirring frequency of the compost - water mixture during the extraction period were very important factors for increased effectiveness. Extracts incubated at 20 °C during the extraction period caused a higher disease reduction on tomato and showed a higher density of microorganisms, than extracts that were incubated at 30 or 35 °C. Daily stirring of the compost - water mixture during the extraction period increased the density of microorganisms in the extracts sevenfold and increased the effectiveness against A. solani and C. gloeosporioides compared to the extract that was stirred only once at the beginning. The Effectiveness as well as the density of the microorganisms were depended on the incubation time of the compost extracts. Extracts produced from fresh composts showed greater suppressive effects against pathogens and higher densities of microorganisms than extracts of composts that were stored for a longer time. Enrichment of the extracts with the formulate substance xanthan increased the effectiveness against A. solani on tomato plants and against C. gloeosporioides on detached leaves of cassava and reduced the disease incidence up to 46% compared to the extract without formulate substances. The increase of the effectiveness after enriching with alginate was depended on the origin of the compost. An increased ß-1,3- glucanase activity were determined on tomato and sweet potato leaves 4 days after the application of the extracts onto the plants. The results of this study show that watery compost extracts can be successfully applied against the cassava and tomato pathogens A. solani and C. gloeosporioides f. sp. manihotis and offers easily applicable methods for the reduction of fungal diseases in West Africa.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:00:03Z No. of bitstreams: 1 Kesia Ferreira Alves.pdf: 466143 bytes, checksum: 66630edcc98b43dfb320ee8189581aa0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T16:00:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kesia Ferreira Alves.pdf: 466143 bytes, checksum: 66630edcc98b43dfb320ee8189581aa0 (MD5) Previous issue date: 2008-02-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Anthracnose is considered an important disease of bell pepper (Capsicum annuum L.) in the state of Pernambuco and in various parts of the world, causing significant losses for fruit commercialization. Actions directed to preventive measures such as alternative control, are of great importance through the exploration of secondary compounds present in medicinal plants with antimicrobial activity. This study aimed to, assess the efficiency of crude extracts in the control of anthracnose in bell pepper, and analyze the control stability of promising treatments in relation to different extract, inoculum, temperature and pathogen isolates concentrations. In preliminary selection, 16 plant species were used in order to obtain aqueous and hidroalcoólico extracts. The aqueous extracts of garlic (Allium sativum L.), Mallow (Malva sp.), and ginger (Zingiber officinale Roscoe.) showed greater than 97% reductions in disease severity levels. The greatest value of CL75 was found for the garlic extract (3.5%), while the lowest value of CL75 was verified with the application of the ginger extract (2.1%). The lowest rate of efficiency reduction of the anthracnose control (TRE) with the pathogen inoculum increase occurred with garlic extract. With regard to different C. gloeosporioides isolates, significant interaction was found between the different extracts and isolates of the pathogen. The plant extracts were effective in controlling the disease in temperatures of 20, 25 and 30 ° C, while temperatures in the 10, 15and 35 ° C there was no disease. There were no differences in the efficiencies of garlic and ginger extracts, while the extract of hollyhock had the lower efficiency at 20 ° C, differing from the other temperatures, and other extracts at this temperature. The results obtained in this study indicate the great potential for use of the garlic extract (6%) in anthracnose control of bell pepper, considering its stability in different situations. / A antracnose é considerada uma importante doença do pimentão (Capsicum annuum L.) no Estado de Pernambuco e em várias partes do mundo, causando perdas significativas à produção de frutos para comercialização. Ações voltadas para medidas preventivas como o controle alternativo, são de grande relevância por meio da exploração de compostos secundários presentes em plantas medicinais com atividade antimicrobiana. O presente trabalho teve por objetivo, avaliar a eficiência de extratos vegetais brutos no controle da antracnose em pimentão, bem como analisar a estabilidade do controle dos tratamentos promissores em relação a.diferentes concentrações dos extratos, concentrações do inoculo e isolados do patógeno e, temperaturas. Na seleção preliminar foram utilizadas 16 espécies vegetais para obtenção de extratos aquosos e etanólicos. Os extratos aquosos de alho (Allium sativum L.), malva (Malva sp.) e gengibre (Zingiber officinale Roscoe.) propiciaram reduções superiores a 97% nos níveis de severidade. O maior valor de CL75 foi constatado para o extrato de alho (3,5%), enquanto o menor valor de CL75 foi verificado com a aplicação de extrato de gengibre (2,1%). A menor taxa de redução da eficiência do controle (TRE) da antracnose com o incremento do inóculo do patógeno ocorreu no extrato de alho. Com relação a diferentes isolados de C. gloeosporioides, foi constatada interação significativa entre os tipos de extratos e os isolados do patógeno. Os extratos vegetais foram eficientes no controle da doença nas temperaturas de 20, 25 e 30 oC, enquanto nas temperaturas 10, 15 e 35 °C não houve doença. Não houve diferenças nas eficiências dos extratos de alho e gengibre, enquanto o extrato de malva apresentou a menor eficiência a 20 oC, diferindo das outras temperaturas, bem como dos demais extratos nessa temperatura. Os resultados obtidos nesse estudo indicam o grande potencial de utilização do extrato de alho a 6% no controle da antracnose em pimentão, considerando sua estabilidade em diferentes situações.

Submitted by ANGELICA AUGUSTA GRIGOLI DOMINATO null (angelica@unoeste.br) on 2017-02-16T18:51:51Z No. of bitstreams: 1 Angélica A. Grigoli Dominato.pdf: 4485568 bytes, checksum: 4abc8fe39b8c64a5ed8be37f2be077de (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-02-20T20:26:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dominato_aag_dr_sjrp.pdf: 4485568 bytes, checksum: 4abc8fe39b8c64a5ed8be37f2be077de (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-20T20:26:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dominato_aag_dr_sjrp.pdf: 4485568 bytes, checksum: 4abc8fe39b8c64a5ed8be37f2be077de (MD5) Previous issue date: 2017-01-20 / A atividade metabólica fúngica, especialmente nos endofíticos, favorece a secreção de moléculas como antibióticos, pigmentos, enzimas e polissacarídeos, que podem ser aplicadas nas indústrias alimentícia, cosmética, farmacêutica, entre outras. A diversidade química dos exopolissacarídeos (EPS) bem como a possibilidade de sua utilização como substrato para diferentes modificações químicas (carboxilação, sulfatação e metilação) aumentam seu espectro de aplicação. Realizar o cultivo submerso dos fungos endofíticos Neofusicoccum parvum, Fusarium sp e Colletotrichum gloeosporioides para a produção de EPS foi o primeiro objetivo deste trabalho. Uma vez obtidos, os EPS foram purificados e quimicamente caracterizados. Sulfatação e ensaio da atividade anticoagulante foram realizados. Os parâmetros concentração de inóculo e tempo de cultivo foram estabelecidos para maior produção dos EPS, por fermentação submersa. Etapas de purificação, por centrifugação, foram efetuadas após análises por cromatografia de exclusão estérica a alta pressão, com detecção por índice de refração (HPSEC/RID). Os EPS purificados [precipitado do C. gloeosporioides (C. gloeosporioidesprec) e os três sobrenadantes] mostraram-se praticamente isentos de proteínas. A hidrólise ácida e subsequente análise dos hidrolisados por cromatografia de troca aniônica a alta pressão com detecção por amperometria pulsada (HPAEC/PAD) indicaram que apenas o C. gloeosporioidesprec era uma glucana. A análise por cromatografia gasosa acoplada à espectrometria de massa (GC/MS) mostrou um único derivado, 1,3,5 tri-O-acetil, 2,4,6-tri-O-metil glucitol com fragmentos de massa (m/z 118, 161, 203, 234.1) condizente com uma glucana do tipo (1→3). Os espectros de FT-IR apresentaram sinais na região de impressão digital, 926 cm-1 e 820 cm-1, típicos de polissacarídeos em configuração . Esses resultados foram confirmados por ressonância magnética nuclear bidimensional (HSQC), com um único acoplamento C1/H1, em 99,3/5,18 ppm e um sinal deslocado para campo baixo, 82,8/3,74 ppm, característico de C-3 substituído, indicando que o EPS é uma α-(1→3)-glucana. A sulfatação desta molécula resultou em α-(1→3)-D-glucanasulf com DS de 0,75 que foi utilizada nos ensaios de atividade anticoagulante. O aumento do tempo para a coagulação, nos testes do APTT (Tempo de Tromboplastina Parcial Ativada) e TT (Tempo de Trombina), foi concentração-dependente, indicando que [α-(1→3)-D-glucanasulf] pode atuar como um inibidor da via intrínseca da coagulação sanguínea e da conversão do fibrinogênio em fibrina, caracterizando-a como um potencial anticoagulante. / Fungal metabolic activity, especially in the endophytic, favors secretion of molecules such as antibiotics, pigments, enzymes and polysaccharides, which can be applicable by food, cosmetic and pharmaceutical industries, and others. The chemical diversity of the exopolysaccharides (EPS), as well as the possibility of their use as substrate for different chemical modifications (carboxylation, sulfation and methylation) increases their application spectrum. Submerged cultivation of the endophytic fungi Neofusicoccum parvum, Fusarium sp and Colletotrichum gloeosporioides for the production of EPS was the first aim of this study. Once the EPS were obtained, they were purified and chemically characterized. Chemical modification by sulfation and anticoagulant activity assays were performed. Cultivation to obtain EPS were performed in submerged fermentation. The inoculum concentration and incubation time parameters were set in order to obtain a higher amount of EPS. Purification by centrifugation was performed after analysis by high pressure steric exclusion chromatography with refractive index detection (HPSEC / RID). Purified EPS [precipitate of C. gloeosporioides (C. gloeosporioidesprec) and the three supernatants] proved to be virtually free of protein polysaccharides. Acid hydrolysis and subsequent analysis of the hydrolysates with high performance anionic exchange chromatography with amperometric detection (HPAEC/PAD) indicated that only the C. gloeosporioidesprec was a glucan. Analysis from gas chromatography and mass spectrometry showed a single derivative, 1,3,5-tri-Oacetyl, 2,4,6-tri-O-methyl glucitol with mass fragments (m/z 118, 161, 203, 234.1) consistent with a (1→3)-glucan. FT-IR spectra showed absorption bands typical from carbohydrate and signals in the digital region at 926 cm-1 and 820 cm-1, typical of polysaccharides in the α- configuration. These results were confirmed by two-dimensional nuclear magnetic resonance (HSQC), with a single C1/H1, in 99.2/4.98 ppm, typical of one α bonding, and low-field 82.6/3.55 ppm signal displacement, characteristic of substituted C-3, indicating that EPS is an α-(1→3)-glucan. Sulfation of this molecule resulted in α- (1→3)-glucansulf with DS of 0.75 which was used in the anticoagulant activity assays. The increase in coagulation reaction time in the APTT (Activated Partial Thromboplastin Time) and TT (Thrombin Time) tests was concentration-dependent, indicating that [α-(1→3)-D-glucansulf] might act as an inhibitor of the intrinsic via of blood clotting and conversion of fibrinogen into fibrin, characterizing it as a potential anticoagulant.