Orientador: Marcos Antônio Machado / Coorientador: Carolina Munari Rodrigues / Banca: Chirlei Glienke / Banca: Paulo Martins Ribolla / Resumo: A Mancha Preta dos Citros (MPC), causada pelo fungo Phyllosticta citricarpa, é uma das mais importantes doenças da citricultura brasileira. No entanto, muito pouco se sabe sobre os mecanismos de patogenicidade deste patógeno na interação com seus hospedeiros. Além disso, P. citricarpa é morfologicamente muito semelhante a P. capitalensis, espécie endofítica também em citros, o que dificulta a diferenciação entre elas, gerando evidentes barreiras fitossanitárias à exportação de frutos in natura. Do mesmo modo, pouco ainda é conhecido sobre seus genomas, ainda não completamente sequenciados, assim como seus transcriptomas em diferentes condições. Assim, o objetivo geral desse trabalho foi avaliar e comparar os genomas e transcriptomas de P. citricarpa e P. capitalensis. O sequenciamento genômico com tecnologia Illumina gerou 179.880.616 reads para P. citricarpa que foram montados em 19.143 contigs, e 148.831.020 reads de P. capitalensis contidos em 11.080 contigs. Foram preditas 16.267 ORFs para a espécie patogênica e 14.813 para a espécie endofítica. Ambos os genomas são similares, com quantidades semelhantes de genes na maioria das categorias analisadas. Os transcriptomas por sua vez geraram em média 74 bilhões de reads por repetição biológica para ambas as espécies, com 3.074 transcritos diferencialmente expressos, sendo 2.637 mais expressos em P. citricarpa e 1.097 em P. capitalensis, com expressiva diferença qualitativa em ambas. P. citricarpa apresentou maior quantidade de genes expressos que P. capitalensis em quase todas as vias analisadas. A espécie endofítica apresentou maior número de genes expressos nas vias de sinalização e adesão. Além disso, os genes envolvidos na interação planta-patógeno foram também mais expressos na espécie endofítica. Os resultados obtidos dos genomas e transcriptomas de P. citricarpa e de P. capitalensis contribuem para maior compreensão da biologia dessas espécies / Abstract: Citrus black spot (CBP), caused by Phyllosticta citricarpa, is one of the most important citrus disease in the Brazilian citrus industry. However, the mechanisms of pathogenicity of this pathogen during the interactions with their hosts are poorly understood. P. citricarpa is frequently associated with P. capitalensis, which is morphologically similar to the endophytic specie. This feature difficults the differentiation of both species resulting in phytossanitary barriers for in natura fruit exportation. Moreover, their genomes were not fully sequenced yet and there is a lack of knowledge of their transcriptomes in different conditions. Thus, the overall objectives of this work were to evaluate and compare the genome and transcriptome of both species. The total genome sequence was 179,880,616 reads for P. citricarpa and 148,831,020 reads for P. capitalensis assembled in 19,143 and 11,080 contigs, respectively. There were predicted 16,267 ORFs for the pathogenic specie and 14,813 for the endophytic specie. P. citricarpa and P. capitalensis presented very similar amounts of genes. The transcriptomic sequence generated on average 74 billion of reads per biological repeat for each species. There were obtained 3,074 differential expressed transcripts, 2,637 were more expressed in P. citricarpa and 1,097 in P. capitalensis. Transcriptional differences between these species were observed. P. citricarpa showed more expressed genes than P. capitalensis in most analyzed categories. The endophytic specie presented more expressed genes on signaling pathway and adhesion than the pathogenic specie. Additionally, plant-pathogen interaction genes were expressed on P. capitalensis. Thus, the results of genomic and transcriptomic analyses of the P. citricarpa and P. capitalensis contribute to the biology comprehension of these species / Mestre

Citrus is a valuable fruit crop in world trade. Citrus Black Spot (CBS), caused by Guignardia citricarpa Kiely, is a fungal disease of citrus. It occurs in many citrus producing countries including parts of Australia and South Africa, but it does not occur in the countries of the European Union (EU) or the United States of America (USA). To prevent the introduction of CBS, the EU and the USA have phytosanitary regulations that restrict the import of citrus fruit from areas where CBS is found. This study uses two bioclimatic modelling approaches — CLIMEX and response surface modelling — to predict which areas have climates suitable for CBS to establish. The work focuses on the citrus growing areas of South Africa and Europe, but other parts of the world are also considered. As CBS is dependent on citrus, geographical areas of global citrus production are also mapped, and models are used to predict which areas of South Africa have climates suitable for citrus cultivation under current and future climates. The potential impacts of climate change on CBS distribution in South Africa are also estimated. Results indicate that under current and future climates many areas in South Africa where citrus is not currently grown have a climate suitable for citrus cultivation, but most of these areas are also climatically favourable for CBS. Of the current citrus producing areas in South Africa, only the Northern and Western Cape Provinces are predicted to be unsuitable for CBS. Under climate change scenarios, some citrus production areas of Western Cape are predicted to become suitable for CBS, but the greater part of the Northern Cape will remain climatically unsuitable for the establishment of CBS in future. The climates of several CBS-free citrus producing areas around the world, such as Mexico, and Florida and Texas (USA) are suitable for CBS. However, European climate is unfavourable for CBS establishment, and provided importing countries comply to minimum standards, phytosanitary restrictions on the import of fruit from CBS infected areas may be unnecessary. This study is the first of its kind in citriculture, and in South Africa it is one of the few studies that investigates the effects of climate change on the potential distribution of a plant pathogen. Bioclimatic modelling was found to be a very useful means to combine complex data in order to make predictions relevant to Pest Risk Assessments. / Thesis (PhD (Environmental Management))--University of Pretoria, 2007. / Microbiology and Plant Pathology / unrestricted

Please read the Summary and Conclusions(04chapter4) on pages 141-143 / Thesis (DSc (Agriculture))--University of Pretoria, 1963. / Microbiology and Plant Pathology / unrestricted

As pragas e doenças apresentam-se como um desafio para a citricultura brasileira em razão do impacto económico que elas causam à produção. Neste trabalho é dado destaque à doença da mancha preta (MPC), causada pelo fungo Guignardia citricarpa. Essa doença provoca lesões no fruto, depreciando-o no mercado de frutas in natura, além de causar amadurecimento e queda precoce. Um dos principais agravantes da doença é a demora no aparecimento dos sintomas, sendo muito importante detectar a presença dos esporos do fungo no pomar, antes que os sintomas apareçam. Dessa maneira, há a possibilidade de se controlar a doença de forma eficaz, aplicando-se quantidades menores de fungicidas e, consequentemente, reduzindo os custos da produção e os efeitos deletérios ao meio-ambiente. Atualmente, a detecção desses esporos é realizada por meio da análise de amostras coletadas nos pomares. Essa análise é efetuada por especialistas que realizam a identificação e a contagem dos ascósporos manualmente. Com o objetivo de automatizar esse processo, um conjunto de técnicas para a análise das imagens e a caracterização dos ascósporos do fungo a partir da forma foi estudado e comparado. Dentre as técnicas, a curvatura e os descritores de Fourier apresentaram resultados bastante satisfatórios e foram utilizados na implementação do protótipo de um sistema de visão computacional - o CITRUSVIS, que analisa e identifica os ascósporos existentes nas imagens dos discos de coleta. / The pest and disease management is one of the significant factors in the citrus culture. This work focuses on the black spot disease ( C B S ) , a fungai disease caused by Guignardia citricarpa that occasions sunken lesions in the rind of fruits causing precocious maturation, accented fali, depreciation for in natura fruit market and increase of the production costs for disease controlling. One of the main problems to control the CBS disease is the delay to appearance of symptom (when the orchard is already infected), and the fungai presence identification is necessary as soon as possible, allowing the appliance of procedures to control it. Nowadays, spores identification, particularly the ascospores (sexual spores), is made by collecting suspended particles in orchards blown on discs, which are analyzed by specialists using the microscope. The use of a computer aided vision system to assist the spores identification is one of the strategies to speed up this process. In this work, methods to analyze and characterize the spores, based on its shape, were studied and compared. Among them, the shape curvature method and the Fourier descriptors, chosen for presenting the best result, were implemented in a system - the CITRUS Vis - to analyze the images and identify the ascospores.

Resumo: A mancha preta dos citros (MPC) causada pelo fungo Guignardia citricarpa, é a principal doença fúngica da cultura no Brasil. Todas as principais variedades comerciais de laranjeiras doces são suscetíveis ao patógeno, que deprecia comercialmente os frutos para o mercado in natura, além de provocar sua queda antes do período de colheita. Como os níveis de controle da MPC apresentado pelo manejo químico têm se mostrado aquém dos desejáveis, o presente trabalho teve como objetivos: avaliar o efeito do manejo do mato utilizando o equipamento conjugado rastelo mecânico e trincha e a roçadeira ecológica, associado ao controle químico, no manejo da mancha preta dos citros e; determinar a correlação entre a distância das lesões de mancha preta ao pedúnculo com a queda precoce de frutos da variedade de laranja doce 'Hamlin'. Foi observado que o uso do equipamento conjugado rastelo mecânico e trincha e da roçadeira ecológica em conjunto ao controle químico, auxilia no manejo da MPC reduzindo sua incidência nas áreas de elevada intensidade da doença. Nas áreas onde a intensidade da doença não é elevada, a associação entre os equipamentos para o manejo do mato e o controle químico auxilia na redução da severidade da doença. Em relação à queda precoce de frutos de laranjeira 'Hamlin' foi observado que existe correlação significativa e positiva entre a força necessária para desprender o fruto e a distância das lesões de mancha preta do tipo mancha dura, próximas à região peduncular dos frutos / Abstract: The citrus black spot (CBS) cause by fungus Guignardia citricarpa, is the main fungal disease of citrus crop in Brazil. All the principal commercial varieties of sweet oranges are susceptible to pathogen which commercially depreciates the fruits to the trade "in natura", beyond to cause its drop before the harvest season. Due the control levels of CBS showed by chemical management are below the desirable, work had the objective: to evaluate the effect of bush management using conjugated mechanic cleaner and brush and ecological mowing, associated to chemical control on citrus black spot and; to determinate the correlation of distance between black spot lesions until peduncle with early drop of fruits of sweet orange variety Hamlin. The use of conjugated mechanic cleaner and brush and ecological mowing together assists the CBS management, decreasing its incidence in areas with high disease intensity. In areas where disease intensity is not high, the association between conjugated equipment to the management of bush and the chemical control assists to decrease the disease severity. We observed that has significant correlation and positive between the force required to detach the fruit and the distance from the black spot lesions of the hard spot, near the fruit peduncular region / Orientador: Antonio de Goes / Coorientador: Marcel Bellato Spósito / Banca: Eduardo Sanches Stuchi / Banca: Simone Rodrigues da Silva / Banca: Antonio Baldo Geraldo Martins / Banca: Margarete Camargo / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:39Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-12-20Bitstream added on 2014-06-13T19:23:52Z : No. of bitstreams: 1 scaloppi_emt_dr_jabo.pdf: 1163749 bytes, checksum: 8f476140c4b101f0e35b9b1c2e957710 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A mancha preta dos citros (MPC) causada pelo fungo Guignardia citricarpa, é a principal doença fúngica da cultura no Brasil. Todas as principais variedades comerciais de laranjeiras doces são suscetíveis ao patógeno, que deprecia comercialmente os frutos para o mercado in natura, além de provocar sua queda antes do período de colheita. Como os níveis de controle da MPC apresentado pelo manejo químico têm se mostrado aquém dos desejáveis, o presente trabalho teve como objetivos: avaliar o efeito do manejo do mato utilizando o equipamento conjugado rastelo mecânico e trincha e a roçadeira ecológica, associado ao controle químico, no manejo da mancha preta dos citros e; determinar a correlação entre a distância das lesões de mancha preta ao pedúnculo com a queda precoce de frutos da variedade de laranja doce ‘Hamlin’. Foi observado que o uso do equipamento conjugado rastelo mecânico e trincha e da roçadeira ecológica em conjunto ao controle químico, auxilia no manejo da MPC reduzindo sua incidência nas áreas de elevada intensidade da doença. Nas áreas onde a intensidade da doença não é elevada, a associação entre os equipamentos para o manejo do mato e o controle químico auxilia na redução da severidade da doença. Em relação à queda precoce de frutos de laranjeira ‘Hamlin’ foi observado que existe correlação significativa e positiva entre a força necessária para desprender o fruto e a distância das lesões de mancha preta do tipo mancha dura, próximas à região peduncular dos frutos / The citrus black spot (CBS) cause by fungus Guignardia citricarpa, is the main fungal disease of citrus crop in Brazil. All the principal commercial varieties of sweet oranges are susceptible to pathogen which commercially depreciates the fruits to the trade “in natura”, beyond to cause its drop before the harvest season. Due the control levels of CBS showed by chemical management are below the desirable, work had the objective: to evaluate the effect of bush management using conjugated mechanic cleaner and brush and ecological mowing, associated to chemical control on citrus black spot and; to determinate the correlation of distance between black spot lesions until peduncle with early drop of fruits of sweet orange variety Hamlin. The use of conjugated mechanic cleaner and brush and ecological mowing together assists the CBS management, decreasing its incidence in areas with high disease intensity. In areas where disease intensity is not high, the association between conjugated equipment to the management of bush and the chemical control assists to decrease the disease severity. We observed that has significant correlation and positive between the force required to detach the fruit and the distance from the black spot lesions of the hard spot, near the fruit peduncular region

As pragas e doenças apresentam-se como um desafio para a citricultura brasileira em razão do impacto económico que elas causam à produção. Neste trabalho é dado destaque à doença da mancha preta (MPC), causada pelo fungo Guignardia citricarpa. Essa doença provoca lesões no fruto, depreciando-o no mercado de frutas in natura, além de causar amadurecimento e queda precoce. Um dos principais agravantes da doença é a demora no aparecimento dos sintomas, sendo muito importante detectar a presença dos esporos do fungo no pomar, antes que os sintomas apareçam. Dessa maneira, há a possibilidade de se controlar a doença de forma eficaz, aplicando-se quantidades menores de fungicidas e, consequentemente, reduzindo os custos da produção e os efeitos deletérios ao meio-ambiente. Atualmente, a detecção desses esporos é realizada por meio da análise de amostras coletadas nos pomares. Essa análise é efetuada por especialistas que realizam a identificação e a contagem dos ascósporos manualmente. Com o objetivo de automatizar esse processo, um conjunto de técnicas para a análise das imagens e a caracterização dos ascósporos do fungo a partir da forma foi estudado e comparado. Dentre as técnicas, a curvatura e os descritores de Fourier apresentaram resultados bastante satisfatórios e foram utilizados na implementação do protótipo de um sistema de visão computacional - o CITRUSVIS, que analisa e identifica os ascósporos existentes nas imagens dos discos de coleta. / The pest and disease management is one of the significant factors in the citrus culture. This work focuses on the black spot disease ( C B S ) , a fungai disease caused by Guignardia citricarpa that occasions sunken lesions in the rind of fruits causing precocious maturation, accented fali, depreciation for in natura fruit market and increase of the production costs for disease controlling. One of the main problems to control the CBS disease is the delay to appearance of symptom (when the orchard is already infected), and the fungai presence identification is necessary as soon as possible, allowing the appliance of procedures to control it. Nowadays, spores identification, particularly the ascospores (sexual spores), is made by collecting suspended particles in orchards blown on discs, which are analyzed by specialists using the microscope. The use of a computer aided vision system to assist the spores identification is one of the strategies to speed up this process. In this work, methods to analyze and characterize the spores, based on its shape, were studied and compared. Among them, the shape curvature method and the Fourier descriptors, chosen for presenting the best result, were implemented in a system - the CITRUS Vis - to analyze the images and identify the ascospores.

A mancha preta dos citros (MPC), incitada pelo fungo Guignardia citricarpa, causa lesões em frutos depreciando-os para a comercialização no mercado interno de fruta fresca, restringindo-os para a exportação e pode causar queda prematura. Para auxiliar nos estudos epidemiológicos, foi desenvolvida uma escala diagramática para a severidade da MPC que contempla os dois tipos de sintomas usualmente observados no campo, "mancha dura", cujos valores variam entre 0,5 e 49,0%, e "falsa melanose", cujos valores variam entre 1,1 e 68%. O grau de suscetibilidade das variedades cítricas ‘Hamlin’, ‘Pera’ e ‘Valência’ à MPC foi avaliado em pomar comercial, sob infecção natural. O modelo monomolecular ajustou-se às curvas de progresso da incidência e da severidade da doença para as três variedades. Não houve diferença estatística significativa entre as taxas de progresso da MPC, concluindo-se que as três variedades possuem o mesmo grau de suscetibilidade à doença. O agente causal da MPC em sua fase epidêmica forma ascósporos e conídios. Os ascósporos, formados em folhas em decomposição no solo, são disseminados a curtas e longas distâncias pela ação do vento. Os conídios, formados em ramos e frutos fixados à planta, são disseminados a curtas distâncias pela ação da água. O padrão de distribuição espacial de plantas com MPC foi avaliado pelo índice de dispersão e pela função K de Ripley. As plantas doentes mostraram-se agregadas independentemente da incidência da doença, indicando elevada importância da dispersão do inóculo a curtas distâncias. Avaliou-se, também, o padrão de distribuição de frutos sintomáticos dentro da planta, pelo índice de dispersão e pela forma binária da lei de Taylor. Pelo índice de dispersão 84% das plantas avaliadas mostraram agregação de frutos sintomáticos. Pela lei de Taylor concluiu-se que a agregação de frutos sintomáticos independe da incidência da doença na planta, sugerindo a participação dos conídios no incremento da doença em condições de campo. Estudou-se o efeito da supressão de ascósporos, pela retirada periódica de folhas cítricas em decomposição do campo e o de conídios, pela colheita antecipada de frutos de maturação tardia, na intensidade da MPC, por dois anos, em área com alta pressão de inóculo. Esses tratamentos reduziram a severidade da doença, no segundo ano de avaliação, entretanto não foram suficientes para controlá-la adequadamente. Estas medidas de sanitização são importantes no controle da MPC, devendo ser adotadas em conjunto com o controle químico. Danos causados pela redução na produtividade e perdas medidas pelo retorno financeiro foram avaliados em dois experimentos. Tratamentos cujo incremento na produção por hectare que, em comparação com a isenção de tratamento, excederam 100 caixas de 40,8 kg, foram rentáveis. A amostragem de áreas para diagnosticar a presença da MPC depende da finalidade da produção. Em áreas para exportação e mercado interno de fruta fresca deve-se avaliar todas as plant as do talhão, uma vez que esta doença é quarentenária e causa danos qualitativos. Em áreas para a indústria de suco cítrico concentrado, 285 plantas são suficientes para amostrar incidências superiores a 15% de MPC, em pomares médios de 2200 plantas. / The fungus Guignardia citricarpa is the causal agent of citrus black spot (CBS), which is a disease that become the fruits unsightly and unsuitable for the fresh fruit market. Besides, premature fruit drop may occur, reducing the productivity. A diagrammatic scale for the two symptoms of CBS (hard spot and false melanose) was developed to evaluate the severity and help in epidemiological studies of this disease. The susceptibility level of ‘Hamlin’, ‘Pera’ and ‘Valência’ sweet orange to CBS was evaluated in commercial orchard, under natural infection. The monomolecular model was fitted to the incidence and severity progress curves of the disease for the three sweet oranges. According to the progress curves, there was not significant difference among cultivars, showing that ‘Hamlin’, ‘Pera’ and ‘Valência’ sweet orange have similar susceptibility level to CBS. G. citricarpa in the epidemic phase produce ascospores and conidia. The ascospores, produced in leaves on soil, are disseminated by wind, while conidia, produced in plant twigs and fruits, are disseminated by water. The pattern of spatial distribution of CBS plants was evaluated by dispersion index and Ripley K function. The groups of symptomatic plants were distributed independently of disease incidence, suggesting that short distance dispersion of the inocullum could be the most important factor in distribution of the disease. The binary form of Taylor´s power law and dispersion index were used to evaluate the distribution of symptomatic fruits in the plant. According to dispersion index 84% o f the evaluated plants showed aggregation of symptomatic fruits, while by the Taylor´s power law the symptomatic fruits aggregation occurred independently of the incidence of plant disease, suggesting that the increase of disease in field conditions is related to conidia production. The effect of ascospore suppression on intensity of CBS was evaluated by removing citrus leaves from the orchard soil surface, while the conidia suppression was evaluated by early harvesting of late maturation fruits. These treatments, carried out during two years in a high inocullum incidence area, reduced the disease severity in the second year, but the satisfactory control was not observed. However, these treatments could be important in CBS control whether used in association with chemical control. Damages caused by yield reduction and losses of financial return were evaluated in two experiments. In relation to non-treated orchards, those treated orchards where the production/ha increased more than hundred boxes (40.8 kg each box) were considered profitable. The destination of the orange production (juice of fresh fruit market) are important for determine the size of samples to assess the CBS incidence. Since the G. citricarpa fungus is considered a quarentine organism that causes qualitative losses, in areas used for production of fresh fruit market whole orchard has to be evaluated. However, in areas used for production of fruits to concentrated orange juice, 285 plants sampled are enough to determinate the CBS incidence superior to 15%, in average orchards containing 2200 plants.

Orientador: Kátia Cristina Kupper / Banca: Fabio Augusto / Banca: Alessandra Sussulini / Banca: Antonio de Góes / Banca: Jackson Antonio Marcondes de Souza / Resumo: O setor citrícola é o maior produtor de frutos no mundo, porém, encontra-se ameaçado por diversos patógenos, dentre esses, o fungo Phyllosticta citricarpa, agente causal da mancha preta dos citros. Como alternativa à utilização de fungicidas sintéticos para o controle do patógeno, o controle biológico, utilizando bactérias do gênero Bacillus, apresenta destaque. Tais microrganismos possibilitam o biocontrole pela produção de compostos orgânicos voláteis ou não voláteis. Sendo assim, este trabalho teve por objetivos: identificar os isolados de Bacillus spp. por meio de técnicas moleculares; avaliar a produção de compostos orgânicos voláteis produzidos por Bacillus spp. em diferentes meios de cultura; verificar os seus efeitos na evolução dos sintomas da doença em frutos de laranja, na morfologia de P. citricarpa em lesões de mancha preta e na indução de resistência, identificar os compostos voláteis por cromatografia gasosa unidimensional e finalmente, avaliar o efeito de diferentes meios de cultura no antagonismo e metabolismo secundário dos isolados de Bacillus. Os isolados bacterianos foram identificados como pertencentes às espécies de Bacillus subtilis, B. amyloliquefaciens e B. methylotrophicus. Os resultados mostraram que houve maior controle do patógeno, em decorrência da produção de voláteis, quando se utilizou os meios triptona de soja ágar (TSA) e caldo de triptona (TSB) para cultivo da bactéria, apresentando valores de inibição da colônia do fungo de até 73%. Com r... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The citrus sector is the largest producer of fruits in the world, but it is threatened by several pathogens, among them Phyllosticta citricarpa fungus, causal agent of the citrus black spot. As an alternative to the use of synthetic fungicides to control the pathogen, the biological control, using bacteria of the genus Bacillus, is highlighted. Such microorganisms enable biocontrol by the production of volatile or non-volatile organic compounds. Therefore, this work had as objectives: to identify the isolates of Bacillus spp. by means of molecular techniques; to evaluate the production of volatile organic compounds produced by Bacillus spp. in different culture media; to verify its effects on the evolution of orange disease symptoms, P. citricarpa morphology in black spot lesions and induction of resistance, to identify the volatile compounds by one-dimensional gas chromatography and, finally, to evaluate the effect of different culture in the antagonism and secondary metabolism of Bacillus isolates. The bacterial isolates were identified as belonging to the species of Bacillus subtilis, Bacillus amyloliquefaciens and Bacillus methylotrophicus. The results showed that there was greater control of the pathogen, due to the volatile production, when tryptone broth (TSA) and tryptone broth (TSB) were used to culture the bacteria, presenting inhibition values of the fungus colony up to 73%. With regard to the effect of volatile compounds on the evolution of disease symptoms, the best results in terms of inhibition (86%) of freckles that progressed to hard spots were obtained with ACB-65 and ACB-73, when cultured in TSB culture medium. Such antagonists have caused deformations in the hyphae of the pathogen, which may explain the non-evolution of the disease symptoms, as previously reported. The volatiles of Ba... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:34:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4393.pdf: 23560579 bytes, checksum: 0869152d96e7734e1dd6786fa23cb550 (MD5) Previous issue date: 2012-05-03 / Universidade Federal de Sao Carlos / The study of phytopathogenic fungi Alternaria alternata has improved the chemical of this micro-organism. The fungus was grown up in large scale incubated in rice medium for 26 days. After grown period was interrupted an extract of the microorganism was made and fractionated using several chromatographic techniques, obtaining 11 different classes of metabolites which are: alternariol monomethyl éter, alternariol, altertoxin, altenuen, altenusin, uridine, uracila, 5 -inosil, ergosterol, peróxido de ergosterol e triglycerides. Also, a study was made via LC-MS in order to identify some toxins produced by A. alternata like a pathogen of citrus, and it was possible to identify four of these. Other research via LC-MS was the study of co-cultivation of the fungus A. alternata, the causal agent of alternaria brown spot, and Guignardia citricarpa, the causal agent of citrus black spot. In this study was possible to observe the variation in concentration of alternariol and thenuazonic acid, mycotoxins produced by A. alternata when this fungus is in contact with G. citricarpa. The study identification of the volatiles produced by A. Alternaria in different ways contributed significantly to improve the knowledge of their chemistry. Once, the A. alternata is a pathogenic fungus of 'Murcott' a study was performed via scanning electron microscopy (ESEM). Thus it was possible to observe the penetration of this fungus by stomatal cavity of young leaves of citrus. In order to search for natural inhibitors to control the disease, were tested several classes of natural products against the A. alternata, and some alkaloids, a xxvi coumarin, a xanthyletin, and a flavonoid substances showed Higher inhibition of mycelial growth, spore germination and appressorium formation. With the aim to obtain information on natural inhibitors were tested metabolites produced by A. alternata opposite and G. citricarpa, the results indicated that alternariol monomethyl ether and alternariol were substances that had a potential fungistatic against the causal agent of citrus black spot. / O estudo do fungo fitopatógeno Alternaria alternata contribuiu com a química desse micro-organismo. O fungo foi cultivado em larga escala utilizando como meio de cultura arroz por um período de 26 dias. Após esse período o crescimento foi interrompido e foi feito um extrato do microorganismo o qual foi fracionado utilizando várias técnicas cromatográficas obtendo 11 metabólitos de distintas classes sendo eles: alternariol monometil éter, alternariol, altertoxina, altenueno, altenusina, uridina, uracila, 5 -inosil, ergosterol, peróxido de ergosterol e triglicerídeo. Além disso, foi feito um estudo via LC-MS buscando identificar algumas toxinas de citros produzidas por A. alternata, sendo que foi possível a identificação de quatro dessas. Outra pesquisa realizada via LC-MS foi o estudo de co-cultivo entre os fungos A. alternata, o agente causal da mancha marrom de alternaria, e Guignardia citricarpa, o agente causal da mancha preta de citros. Nesse estudo foi possível observar a variação de alternariol e ácido tenuazônico, micotoxinas produzidas por A. alternata, quando este fungo está em contato com outro fitopatógeno. O estudo de identificação dos voláteis produzidos por A. alternaria em diferentes meios contribuiu muito para um maior conhecimento de sua química. Sabendo que A. alternata é um fitopatógeno de tangor Murcott foi realizado um estudo via microscopia eletrônica de varredura (MEV) a qual foi possível observar a penetração desse fungo pela cavidade estomatal de folhas jovens desse citros. Visando a busca de inibidores naturais para o controle da doença, foram ensaiadas diversas classes de produtos naturais frente a A. alternata, sendo que alcalóides e uma cumarina, a xantiletina, foram as substâncias que apresentaram uma maior inibição no crescimento micelial, germinação de esporos e formação de apressórios. Pensando em inibidores naturais, foram ensaiados metabólitos produzidos pelo A. alternata frente ao G. citricarpa, e os resultados obtidos revelaram que alternariol monometil éter e alternariol foram as substâncias que apresentaram um potencial fungistático frente ao agente causal da mancha preta de citros.