Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This research aimed to analyze in the work Amazona, by the brazilian writer Sérgio Sant'Anna, how new forms of contemporary literature are taking advantage of serialized procedures representation, typical of speeches and/or vehicles from the scope of mass culture. The first chapter seeks to situate the literary writing of Amazona within a cultural background in process of depletion, which operates the weakening of the illustrated models of representation and enables the emergence of new literary forms, which stand for the appropriation, the deviation, the rewriting, the secondary status, the simulation. In the second chapter, which deals with the discursive procedures of hybridization present in Amazona, the aim is to highlight the influence, in the narrative fabrication of the novel, of images and compositional procedures typically feuilletonistic, mapping the ways in which the narrative resembles and conforms to address this serialized discourse of this entertainment literature. From this considerations, it becomes possible, then, already in the last chapter, to determine how the narrative appropriates these discourses in order to recycle then and reframes them, as they are removed from their home environment and inserted into a new context of production. For another perspective, if it is notorious in Amazona to set up a novel that behaves and in many ways simulates the typical narratives of feuilletonistic matrix, it is also possible to observe the incorporation into the fictional universe discursive instances from the cinematographic scope. The Seventh Art works on Amazona in order to influence much of the narrative organization, marking the construction of the narrator, characters, time and space and opening to the formation of a scripture that tends, in many aspects, to the filmic realization. / Esta pesquisa teve por objetivo analisar na obra Amazona, do escritor brasileiro Sérgio Sant Anna, de que modo as novas formas literárias da contemporaneidade vêm se valendo de procedimentos de representação serializantes, próprios dos discursos e/ou veículos provenientes do âmbito da cultura de massa. O primeiro capítulo busca situar a escritura literária de Amazona dentro de um cenário cultural em fase de esgotamento, que opera o enfraquecimento dos modelos ilustrados de representação e possibilita a emergência de novas formas literárias, que primam pela apropriação, pelo desvio, pela reescritura, pela secundariedade, pela simulação. No segundo capítulo, que trata dos procedimentos de hibridização discursiva presentes em Amazona, o objetivo é destacar a influência, na tessitura narrativa da novela, de imagens e procedimentos de composição caracteristicamente folhetinescos, mapeando os aspectos nos quais a narrativa se assemelha ou se conforma ao discurso serializado dessa literatura de entretenimento. A partir dessas considerações, torna-se possível, então, já no último capítulo, determinar de que modo a narrativa se apropria desses discursos com o intuito de reciclá-los e ressignificá-los, à medida que os retira de seu meio de origem e os insere em um novo contexto de produção. Por outro viés, se é notória em Amazona a tentativa de configurar uma novela que se comporta e em muitos aspectos simula as típicas narrativas de matriz folhetinesca, também é possível que se observe a incorporação ao universo ficcional de instâncias discursivas diretamente provenientes do âmbito cinematográfico. A Sétima Arte atua, assim, em Amazona, de modo a influenciar boa parte da organização narrativa, marcando a construção de narrador, personagens, tempo e espaço e abrindo margem à formação de uma escritura que tende em muitos aspectos para a realização fílmica.

Ce travail s’inscrit dans le cadre de la recherche relative au développement de biosenseurs à ADN électrochimiques. Des aspects fondamentaux, ainsi que des aspects d’application de la détection d’hybridation d’ADN sont envisagés.<p>Dans un premier temps, le comportement interfacial et le processus d’hybridation d’oligonucléotides d’ADN linéaires et ADN hairpin (structure en épingle à cheveux) nonmarqués sont étudiés en formant des monocouches auto-assemblées mixtes de monobrins d’ADN (ssADN) thiolés et d’un hydroxyalcanethiol (4-mercaptobutan-1-ol) par coadsorption spontanée sur des électrodes d’or polycristallin. L’immobilisation de monocouches mixtes ssADN/MCB est caractérisée par voie électrochimique et par spectroscopie des photoélectrons X. Des mesures de chronocoulométrie, en présence de [Ru(NH3)6]3+ (RuHex), permettent de déterminer la quantité d’ADN dans la monocouche mixte formée. Les résultats montrent que l’excès superficiel d’ADN linéaire est plus important que l’excès superficiel d’ADN hairpin sous des conditions de formation identiques.<p>La réaction de reconnaissance moléculaire d’hybridation est détectée par des mesures d’impédance en présence de [Fe(CN)6]3-/4-. L’hybridation se traduit dans le cas de l’ADN linéaire par une augmentation de la résistance au transfert d’électron Rct tandis que dans le cas de l’ADN hairpin, Rct diminue. Ces différences sont dues au plus faible recouvrement et au changement de conformation des molécules d’ADN hairpin lors de l’hybridation. Des mesures de réflectivité de neutrons nous ont permis de mettre en évidence l’augmentation de l’épaisseur du film d’ADN hairpin et de confirmer le changement conformationel ces sondes lors de la reconnaissance moléculaire.<p>Dans la seconde partie, nous présentons une nouvelle méthode électrochimique de détection d’hybridation, basée sur les interactions électrostatiques entre le complexe cationique RuHex et les groupements phosphates de l’ADN. Afin d’améliorer la détection des molécules de PNA (peptide nucleic acid) ont été immobilisées comme sondes de reconnaissance moléculaire. Après hybridation des sondes PNA avec le brin complémentaire, RuHex s’adsorbe sur l’ADN hybridé et un signal de réduction de ces complexes redox, enregistré par voltampérométrie alternative, constitue une signature claire de l’hybridation d’ADN à l’interface modifiée. Les interactions RuHex/PNA-ADN ont été étudiées. La constante d’adsorption de RuHex sur l’électrode modifiée PNA/MCB après hybridation est évaluée à 2,9 (±0,3) 105 M-1 en milieu Tris-HCl 0,01M, selon une isotherme de Langmuir.<p>Les performances analytiques de la méthode de détection (sensibilité, sélectivité et reproductibilité) ont été évaluées et optimisées pour la détection des séquences d’ADN du gène de l’ARNr 23S d’Helicobacter pylori. La méthode de détection électrochimique présentée est assez sélective pour permettre de discriminer les mutations ponctuelles A2143G et A2144C de la séquence de type sauvage. La diminution significative des signaux d’admittance enregistrés en présence des séquences mutées est attribuée à la capacité accrue de discrimination de mutations ponctuelles des molécules PNA.<p>La réponse de détection est linéaire en fonction du logarithme de la concentration de la cible d’ADN sur plus de quatre ordres de grandeur (10-6 M à 10-10 M). La limite de détection de l’oligonucléotide d’ADN complémentaire de 80 pM est très bonne. La méthode a été appliquée avec succès à la détection de fragments PCR complémentaires de 100 et 400 paires de bases, amplifiés à partir de souches SS1 d’H.pylori. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Master thesis investigates reproductive barriers in diploid-polyploid complex of Vicia cracca. Complex with basic chromosome number x=7 consists of diploid (2x=14), tetraploid (4x=28) and rare triploid (3x=21) cytotype. I studied prereproductive barriers between diploid and tetraploid cytotype: phenology of flowering, pollinators' behavior (preference of spieces of pollinators to cytotypes, sequence of visited cytotypes), variables, that could explain pollinators' behavior (amount of nectar as the main reward, size and amount of pollen grains as a potentional reward). To find out how strong the triploid block is I analyzed ploidy of seeds and seedlings from mixed-ploidy population. The habitat isolation showed up to be the strongest reproductive barrier. Pollinator's behavior meaningfully contributes to isolation, phenology of flowering contributes only minimally. Index expressing rate of prereproductive barriers is 0,956. Pollinator Bombus pascuorum visited on one locality preferably tetraploid plants and Andrena sp. preferred diploid plants. Even though tetraploid plants produce more nectar, no other analysis showed pollinators' preference to tetraploid plants. I prepared one squash of diploid V. cracca using method of in situ hybridization. This method needs to be optimilized for the studied taxon.

Abstract This thesis aimed at developing methods for tracking the environmental origins of microbial contaminants of the food chain. We worked on three targets: i) environmental mycobacteria ii) toxinogenic Bacillus species iii) post-harvest fungi in strawberry jam. Our aim was to develop methods for early detection of the above contaminants, which have the potential to endanger consumer health. We developed a novel method based on 16S rRNA hybridization for tracking the reservoirs of potentially pathogenic environmental mycobacteria in piggeries and soil. From 1010 to 1012 16S rRNA molecules of environmental mycobacteria were found per gram of peat, wood shavings and straw in piggeries with a high prevalence of infections. These beddings may thus be a source of mycobacteria for pigs. We found 1010–1011 of mycobacterial 16S rRNA molecules per gram of Finnish forest soil, indicating that the soil contained 107–109 mycobacteria per gram. These numbers exceed the previous cultivation-based estimates of mycobacterial content in Finnish soils. To elucidate the role of mastitis in the input of toxinogenic Bacillus into the dairy production chain, milks were sampled from mastitic cows. Twenty-three Bacillus isolates were screened for toxins using the sperm cell motility inhibition assay. Four of the six toxinogenic isolates found were identified as Bacillus pumilus and two as Bacillus licheniformis. The isolates produced toxic substances that were heat-stable (100 °C) and soluble in methanol, thus being of non-protein nature. The extracts prepared from the toxin-producing isolates disrupted the plasma membrane of exposed sperm cells at concentrations 1–15 μg ml-1 (B. pumilus) 20–30 μg ml-1 (B. licheniformis). The toxic action of the mastitis-associated B. licheniformis strains was similar to that of the lipopeptide lichenysin A. The genes for lichenysin synthetase were found in these strains by PCR. This study revealed that heat-stable toxin-producing strains of B. pumilus and B. licheniformis occur in milk of mastitic milking cows. They may enter the dairy production chain when milk of clinically healthy cows recovered from mastitis is sent to dairies. Many foodborne contaminant fungi are known to produce volatile organic compounds. We investigated the suitability of such metabolites as early indicators of fungal contamination of strawberry jam. We found that volatile organic compounds commonly produced by the contaminant fungi in strawberry jam were 2-pentanone, styrene, 3-methyl-1-butanol, 1,3-pentadiene and ethanol. The results indicate that these compounds could be used to detect fungal contamination of jam.

La thèse a pour objet l’analyse de mécanismes d’assemblage permettant la création de structures auto-assemblées à base d’ADN, fonctionnalisées par des protéines. Les PDNA sont des molécules synthétiques associant de manière covalente une séquence d’ADN et un module protéique. Basés sur le domaine hèmique du cytochrome b5, les PDNA présentent des propriétés d’absorption optique dépendant de l’état d’oxydoréduction. Pour comparer leurs propriétés d’assemblage à celles des ADN correspondants, différentes briques ont été assemblées en ensembles finis ou ouverts. Un premier chapitre développe des approches expérimentales et de modélisation pour caractériser les paramètres contrôlant ces assemblages dans le cas des ADN. Un second chapitre transpose ces approches aux assemblages de PDNA afin de mettre en évidence l’influence des domaines protéiques. Dans les deux cas, les travaux sont menés à la fois à un niveau macroscopique et de molécule unique par AFM classique ou à haute vitesse. Une troisième partie vise à comprendre comment ces assemblages peuvent être multiplexés sur des puces au sein de matrices poreuses de dextran. Nous avons modélisé l’influence de la matrice sur l’assemblage et utilisé ces modèles pour définir les relations entre observables et paramètres microscopiques. Une dernière partie vise à lever les limitations (pièges d’assemblages) mises en évidence dans les réactions sous contrôle cinétique. Nous avons développé des assemblages dans des conditions douces et contrôlées par le pH impliquant des structures ADN en motifs-i. Leur mécanisme de formation et de polymérisation en suprastructures a été étudié en combinant biochimie et analyse structurale par AFM. / The work aimed at the analysis of assembly mechanisms allowing the creation of DNA-based self-assembled structures functionalized with proteins. PDNA are synthetic molecules covalently associating a DNA strand to a protein domain. The ones based on the heme binding domain of cytochrome b5 feature optic properties that depend on oxydoreduction state. In order to compare self-assembly properties of PDNA and corresponding DNA, different building blocks were assembled into converging or open ensembles. A first part develops experimental and modeling approaches to characterize parameters controlling such assemblies of DNA blocks. A second part extends these approaches to PDNA assemblies, bringing in evidence the influence of the protein domain on nucleic parts. Studies were both performed at macroscopic and single molecule levels using conventional and high-speed AFM. A third part describes how chip multiplexing of those assemblies onto a porous dextran matrix influences behaviors. Modeling the matrix influence on assembly allowed defining relations between experimental and macroscopic parameters. A last part aims at bypassing bottlenecks related to the formation of trapped structures when reactions are kinetically driven. We developed i-motif based DNA structures that can be assembled into mild, pH controlled conditions. Their mechanism of formation and polymerization into supramolecular structures were studied combining physico-chemical and structural analyses using AFM.

Cajanus cajan (L.) Millsp. (Pigeonpea) belongs to the Leguminosae genus Cajanus which is composed of 34 species. Pigeonpea is the only cultivated member of the genus, while the remaining species are wild relatives belonging mainly to the secondary gene pool. DNA sequence data from the nuclear ITS region and the chloroplast trnL-F spacer were utilized to investigate the phylogenetic relationships between Cajanus and five other allied genera in the subtribe Cajaninae. This study revealed the non-monophyly of Cajanus and Rhynchosia and supported the monophyly of Eriosema and Flemingia, but more sampling ,especially from the large genera of Rhynchosia and Eriosema, is recommend to adequately test the hypothesis of generic monophyly. The phylogenetic relationships within the genus Cajanus resolved Cajanus scarabaeoides (L.) Thouars as the most basal species in the Cajanus clade. The study also utilized Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers derived from low copy orthologous genes and genotyped using the high throughput SNP-OPA Illumina golden gate assay. The aim was to understand phylogenetic and domestication history, genetic structure, patterns of genetic diversity, gene flow and historical hybridization between Cajanus cajan (pigeonpea) and wild relatives. The neighbor-joining tree resolved well-supported clusters, which reflect the distinctiveness of species and congruence with their geographical origin. It supported the ITS based phylogeny and resolved C. scarabaeoides as basal to the Cajanus clade. The phylogenetic signal and genetic signatures revealed insights into the domestication history of pigeonpea. Our results supported Cajanus cajanifolius as the presumed progenitor of pigeonpea and we speculate that for pigeonpea there was a single major domestication event in India. Genetic admixture and historical hybridization were evident between pigeonpea and wild relatives. Abundant allelic variation and genetic diversity was found in the wild relatives, with the exception of wild species from Australia, as compared to the domesticated pigeonpea. There was a reduction of about 75% in genetic polymorphism in domesticated pigeonpea as compared to the wild relatives, indicating a severe “domestication bottleneck” during pigeonpea domestication. We discovered SNP markers associated with disease resistance (NBS-LRR) loci. The SNPs were mined in a comparison of BAC-end sequences (BES) of C. cajan and amplicons of the wild species, C. scarabaeoides. A total of ~3000 SNPs were identified from 304 BES. These SNPs could potentially be used in constructing a genetic map and for marker assisted breeding.

Dans le cadre du processus de Bologne et de l’évolution des pratiques traditionnelles vers des modes plus flexibles d’enseignement, notre projet de recherche en cours se propose d’analyser les modalités innovantes d’utilisation des TICE dans les processus d’apprentissage et d’enseignement ainsi que dans les communautés de pratique. Depuis plusieurs années, le concept d’eLearning est entré dans le langage pédagogique et dans les institutions d’enseignement. La plupart des sources consultées le définissent généralement comme un « apprentissage soutenu par les technologies de l’information et de la communication (TIC) » Il s’agit là de définitions intéressantes qui relient l’apprentissage (considéré comme objectif de l’action) avec les technologies (considérées le plus souvent comme un moyen). Cette proximité dans la définition ne signifie pas causalité. Jusqu’ici, toutes les recherches sur les différentes formes de technologies qui sont apparues dans les trente dernières années (de l’EAO au Cédérom interactif), ont conclu en l’importance du dispositif pédagogique dans lequel les outils technologiques sont immergés (Kadiyala & Crynes, 2000). Ceci peut expliquer une grande partie des recherches actuelles sur les conditions d’efficacité des technologies de l’information et de la communication (Technology Enhanced Learning) dans l’éducation (Quelles méthodes ? Quels dispositifs ?) et la recherche des valeurs ajoutées (Quels résultats ?). D’autres recherches ont vu dans les technologies un catalyseur et un accélérateur de l’innovation pédagogique dans les institutions (Liétart, 2007). Dans ce sens, le contexte des Universités de la Communauté française de Belgique (et/ou européennes) est particulièrement intéressant à investiguer : le mélange actuel de formes d’enseignements très variées, les usages technologiques principalement autour de certaines plates-formes comme Claroline (pour bon nombre de partenaires potentiels), la présence de disciplines d’enseignement contrastées, les formes tout aussi variées de formation des enseignants, d’encouragement aux innovations pédagogiques, les dispositifs hybrides, … constituent à la fois un terrain riche et des variables intéressantes à investiguer pour une meilleure compréhension des conditions et des facteurs de qualité de l’innovation technopédagogique et de l’interaction homme/ machine. / The ICTE (Information and Communication Technologies for Education) and the Educational Innovation in the Higher Education : Why and How Human Interaction Modes Evolve within the Pedagogical Information Systems ? ”Within the framework of the Bologna process and the evolution of the traditional practices towards more flexible ways of teaching, our ongoing research project, proposes to analyse the innovative modes of the use of the ICTE in the educational and learning process just as in the practice communities. For many years, the eLearning concept came in the common educational usage and in the educational institutions. Most of the sources we refered to, generally define it as a “learning supported by the ICT”. These are interesting definitions that link the learning process (considered as the action’s goal) with the technologies (considered most of the time as a means). This closeness in the definition doesn’t mean causality. Until now, all the research on the different forms of technologies that appeared during the last thirty years (from the Teaching Assisted by Computer TAC to interactive cd) have highlighted the importance of the educational system in which technological tools are immersed (Kadiyala & Crynes, 2000). This can explain for a large part of the current researches on the conditions of the efficiency of the information and the communication technologies, (Technology Enhanced Learning) in education (Which methods? Which systems?), and the research of the added values (Which results?). Other researches consider the technologies as a catalyst and an accelerator of the pedagogic innovation in the institutions (Liétart, 2007). In that matter, the context of the Universities of the French Community of Belgium (and/or European) is particularly interesting to investigate : the much diversified current mix of educational forms, the technological uses mainly around certain platforms such as Claroline (for many potential partners), the presence of contrasting educational disciplines, the also diversified teacher’s training, the encouragement for educational innovations, the hybrid devices …constitute at the same time a rich field and interesting variables to investigate for a better comprehension of the conditions and of the quality factors of techno-educational innovation and of the human/machine interaction.

Le genre Ectocarpus Lyngbye (Ectocarpales, Phaeophyceae) regroupe des algues marines filamenteuses caractérisées par un cycle haploïde-diploïde. L'objectif de la thèse était de délimiter les espèces et d'étudier la spéciation dans ce genre. Nous avons commencé par clarifier le nombre d'espèces cryptiques en utilisant deux loci indépendants et une approche intégrative associant une analyse de détection de " barcode gap " avec des reconstructions phylogénétiques. Nos résultats montrent l'existence d'au moins 15 espèces qui se répartissent en un groupe monophylétique composé d'E. crouaniorum (Ecro) et de deux espèces proches ainsi que d'un mélange paraphylétique composé des 12 autres espèces incluant E. siliculosus (Esil). Deuxièmement, les analyses de séquençage Rad et de phylogénomique ont permis de résoudre les relations au sein du groupe paraphylétique. Les espèces se regroupent maintenant en deux clades divergents (Ecro and Esil). Des niveaux de divergence variables entre espèces sont révélés au sein du clade Esil. Des phénomènes d'hybridation entre les espèces les plus apparentées, et trouvées en sympatrie, sont suspectés. Finalement, l'importance de l'isolement reproducteur a été étudié entre les espèces Esil et Ecro, les plus communes, mais les plus divergentes, en utilisant des marqueurs spécifiques de chacune des espèces. Nos résultats indiquent que la méiose agit comme une forte barrière reproductive entre ces espèces et démontrent que les espèces du genre Ectocarpus sont d'excellents systèmes pour étudier les conséquences évolutives de l'hybridation et de l'introgression pour le maintien ou la divergence des espèces grâce à leur cycle haploïde-diploïde. / The genus Ectocarpus Lyngbye (Ectocarpales, Phaeophyceae) comprises marine filamentous algae characterized by an alternation between two independent multicellular organisms of different ploidy. The general objective of the thesis was to study species delineation and speciation within this genus. We started clarifying the number of cryptic species using two unlinked loci (COI-5P and ITS1) and an integrative approach associating barcode gap detection analyses with phylogenetic reconstructions. We showed the presence of at least 15 species partitioned within a monophyletic group composed of E. crouaniorum (Ecro) and two closely related species and a paraphyletic assemblage composed of the remaining 12 other species including E. siliculosus (Esil). Second, Rad sequencing and phylogenomics analyses allowed to resolve the relationships within the paraphyletic assemblage. The different species becomes well separated into two divergent clades (Ecro and Esil). A diversity of taxa with various levels of divergence was revealed within the clade Esil and hybridization between the closest and sympatric species was suggested. Finally, the importance of reproductive isolation among the two commonest but most divergent species Esil and Ecro was studied using species-specific nuclear and cytoplasmic markers jointly with 9 microsatellites. We showed that meiosis acts as a strong reproductive barrier among these two species and demonstrates that the species of the genus Ectocarpus are excellent systems to study evolutionary consequences of hybridization and introgression for the maintenance or breakdown of species because of their haploid diploid life cycle.

Une méthode améliorant le calcul des facteurs d’intensité de contrainte en mode I par hybridation de deux fonctions de poids est présentée et appliquée aux cas de fissures elliptiques sous différents chargements. L'hybridation consiste à utiliser l'une ou l'autre des deux fonctions dans la zone de la fissure où la fonction est la plus efficace. La délimitation des zones est faite après optimisation des paramètres géométriques de la fissure. Afin d’étendre l’utilisation de cette approche à la modélisation des fissures semi-elliptiques, son couplage avec la PWFM (Point Weight Function Method) pour tenir compte de l’effet de la surface libre a été réalisé. L’utilisation des lois de propagation de fissure (de Paris et de Sih) a permis l’extension de l’application de l’approche d’hybridation aux problèmes de fatigue. La qualité des résultats trouvés pour les fissures elliptiques et semi-elliptiques est bonne aussi bien pour les chargements quasi-statiques que pour ceux de fatigue. / A method improving the evaluation of the stress intensity factor by hybridization of two weight functions is presented and applied for embedded elliptical cracks under various loadings. The hybridization consists in using one or another function in the zone of the crack where it is the most efficient. The delimitation of the zones is achieved after optimizing the geometrical parameters of the crack. In order to extend the use of this approach to the modeling of semi-elliptical surface cracks, its coupling with the PWFM (Point Weight Function Method) to take account of the free edge effect were carried out. The use of the fatigue crack growth laws (Paris law and Sih law) allowed the extension of the application of the hybrid approach to the fatigue problems. The quality of the results found for the elliptical and the semi-elliptical cracks is good for the static loads as well as for the fatigue ones.

Comparative studies on endangered species and their more common congeners can shed light on the mechanism of species rarity, and enable conservationists to formulate effective management strategies. I compared the breeding and pollination systems of the endangered Geodorum eulophioides and its two more common sympatric congeners in subtropical China. Geodorum eulophioides and G. recurvum were self-compatible, both depending on Ceratina cognata for fruit production, while G. densiflorum can autonomously self. Although the floral visitation frequency of G. eulophioides was the highest among the three, its natural fruit set was similar to that of G. recurvum, but both lower than that of G. densiflorum. These results partially explain the difference in species abundance. Coupled with severe habitat loss and degradation, the extremely low pollinator visitation and natural fruit set of G. eulophioides calls for rapid establishment of ex-situ collection, in conjunction with improving in-situ habitat. Natural hybridization tendencies were also studied among species.