Genomas bacterianos são extremamente dinâmicos e boa parte dessa dinâmica ocorre devido a transferência horizontal e aquisição de DNA exógeno, um processo natural e fundamental para a evolução, adaptação e diversificação dos microrganismos. Ilhas genômicas são grandes regiões do cromossomo bacteriano adquiridas por transferência horizontal e estão presentes em apenas algumas linhagens, podendo conferir alguma vantagem adaptativa. Em Pseudomonas aeruginosa, até o momento foram caracterizadas pelo menos dezesseis ilhas genômicas e cada uma delas confere características diferentes a seus hospedeiros. Em P. aeruginosa UCBPP-PA14 (ou simplesmente PA14), encontram-se duas ilhas de patogenicidade denominadas PAPI-1 e PAPI-2, sendo a primeira a maior e a mais estudada, contendo 115 ORFs (“Open Reading Frame”, ou quadros abertos de leitura). Dentre estes, o gene int codifica uma integrase essencial para a excisão e integração de PAPI-1, e o gene soj é necessário para a manutenção da ilha na célula e é expresso apenas quando esta se encontra na forma epissomal. PAPI-1 codifica um provável sistema de secreção tipo IV (T4SS), similar ao do elemento móvel ICEHin1056, responsável pela transferência deste para outras bactérias. O objetivo deste trabalho foi identificar fatores genéticos e ambientais que contribuem para a transferência de PAPI-1 entre linhagens de P. aeruginosa. Foi observado que os mutantes por transposon nos genes PAPI-1 PA14_59860, PA14_59880, PA14_59920 e PA14_59940 têm a frequência de transferência de PAPI-1 diminuída, mas os genes interrompidos nesses mutantes não são essenciais para a excisão da ilha. Também foi mostrado que os reguladores percepção de quorum RhlR e MvfR têm influência na expressão do gene int, mas não de soj. O terceiro regulador de percepção de quorum, LasR, assim como a proteína H-NS MvaT, não tem influência na expressão de int e de soj. Ensaios de RT-PCR quantitativos mostraram que o choque térmico aumentou os níveis do mRNA de soj, mas não de int, corroborando dados previamente sugeridos pela literatura, que mostram uma maior freqüência de transferência de PAPI-1 nessas condições. Também foi analisado se o segundo mensageiro celular em bactérias, c-di-GMP, poderia contribuir para a excisão/manutenção de PAPI-1. Alterações nas concentrações deste segundo mensageiro pela superexpressão de proteínas responsáveis por sua síntese ou degradação não foram capazes de afetar a excisão/manutenção de PAPI-1. Houve diminuição na frequência de transferência de PAPI-1 a partir de linhagens doadoras superexpressando uma diguanilato ciclase ou uma fosfodiesterase de c-di-GMP, mas provavelmente este efeito não se deve aos níveis alterados desse segundo mensageiro. Em Xanthomonas axonopodis pv. citri 306 (XAC), uma região de 86 kb possui uma grande semelhança com PAPI-1 na organização dos genes. Além disso, possui uma série de ORFs relacionados aos genes “core” que definem uma família de ilhas genômicas sintênicas das quais PAPI-1 faz parte. Entretanto, os genes acessórios encontrados entre os blocos de genes conservados varia muito entre PAPI-1 e a região de XAC. Foi determinado que esta região de XAC não pode se excisar do cromossomo nas condições analisadas. Por fim, com o intuito de verificar as possíveis interações entre os produtos dos genes conservados em PAPI-1 e XAC, ensaios de duplo-híbrido foram realizados, porém não foi possível determiná-las, visto que apenas resultados falsos positivos foram obtidos. Este trabalho mostrou pela primeira vez que a percepção de quorum está envolvida com a expressão de soj e determinou uma extensa similaridade entre essa ilha e uma região do genoma de XAC / Bacterial genomes are extremely dynamic mostly because of horizontal gene transfer, a natural and fundamental process for evolution, adaptation and diversification of microorganisms. Genomic islands are large DNA segments acquired by horizontal gene transfer which are present only in a few strains and may confer some adaptative advantage. At least sixteen genomic islands have been characterized in Pseudomonas aeruginosa to date and each confers different characteristics to its host strain. P. aeruginosa UCBPP-PA14 (PA14) harbors two pathogenicity islands named PAPI-1 and PAPI-2. PAPI-1 is the largest one, carrying 115 open reading frames (ORFs). Among these, int codes for an integrase essential for PAPI-1 excision and integration, and soj is required for maintaining PAPI-1 in the cells, being expressed only when this island is in an episomal, circular form. PAPI-1 also harbors genes coding for a type four secretion system (T4SS) similar to the mobile element ICEHin1056, which is responsible for transferring this element to other bacteria. In this work, we show that transposon insertion in PAPI-1 genes PA14_59860, PA14_59880, PA14_59920 and PA14_59940 lowered the frequency of conjugation of PAPI-1 from PA14 to other bacteria, but those genes were not essential for PAPI-1 excision. Quorum sensing regulators RhlR and MvfR had a role in int expression, but did not alter soj transcription. The third quorum sensing regulator LasR, as well as the H-NS protein MvaT, did not alter both int and soj expression. Quantitative RT-PCR assays showed that cells incubated at heat shock conditions present higher levels of soj, mRNA, confirming published data that showed an increase in PAPI-1 transfer in these conditions. It was also analyzed whether the second messenger c-di-GMP would contribute to PAPI-1 excision/maintenance. Changes in the levels of this second messenger in cells overexpressing proteins responsible for its synthesis or degradation did not affect PAPI-1 excision and maintenance. A decrease in PAPI-1 transfer frequency was detected when those cells were used as donors in conjugation, but this effect cannot be attributed to the altered c-di-GMP levels. In Xanthomonas axonopodis pv. citri 306 (XAC), an 86 kb genome region shares similarity with PAPI-1 regarding gene homology and organization. It also carries ORFs related to the core genes that define a syntenic family of genomic islands that includes PAPI-1. Nevertheless, the accessory genes dispersed among the clusters of conserved genes are not related, when comparing PAPI-1 and this region in XAC. An epissomal form of this putative XAC island could not be detected in the conditions tested in this work. Finally, in order to verify interactions involving the conserved proteins in PAPI-1 and XAC, two hybrid assays were carried out, but only false positives results were obtained

Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-09-15T12:14:46Z No. of bitstreams: 1 2011 - Daiane Ouvernay Fernandes da Silva.pdf: 7586481 bytes, checksum: 5a97593f1df40687d3039aaf482f7a65 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-15T12:14:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011 - Daiane Ouvernay Fernandes da Silva.pdf: 7586481 bytes, checksum: 5a97593f1df40687d3039aaf482f7a65 (MD5) Previous issue date: 2011-06-21 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / This study investigated the relationship between species of frogs, lizards, gradients environmental and insularity. We could detect a strong relationship between lizards in open habitats and anthropic as well as a strong influence of the area to the richness and abundance of lizards, rather than habitat heterogeneity. The community was the most diverse State Park Cunhambebe. The lizards of island environments of the Sepetiba Bay showed a strong relationship between abundance and area, supporting the hypothesis of Ecological Release. The species Cycloramphus sp., Thoropa miliaris, Hylodes asper, H. phyllodes, Phasmahyla cruzi and Scinax trapicheiroi are those with lower values of tolerance of distance from this physiognomy and sometimes only occur in this environment. / Neste estudo foram investigadas as rela??es entre esp?cies de anf?bios anuros, lagartos, gradientes ambientais e insularidade. Nota-se uma forte rela??o dos lagartos com ambientes abertos e antr?picos, bem como uma forte influ?ncia da ?rea para a riqueza e abund?ncia dos lagartos, mais que a heterogeneidade de habitats. A comunidade mais diversa foi a do Parque Estadual do Cunhambebe. Os lagartos de ambientes insulares da Ba?a de Sepetiba demonstraram forte rela??o entre abund?ncia e ?rea, corroborando com a hip?tese de Libera??o ecol?gica. As esp?cies Cycloramphus sp., Thoropa miliaris, Hylodes asper, H. phyllodes, Phasmahyla cruzi e Scinax trapicheiroi s?o as que possuem menores valores de toler?ncia de dist?ncia da cachoeira e, algumas vezes, s? ocorrem neste ambiente

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2015-08-24T16:27:17Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_AnaliseEfeitosTermicos.pdf: 2592758 bytes, checksum: db2d3c0a9d0ae11b1a0915209254db34 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2015-08-27T15:07:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_AnaliseEfeitosTermicos.pdf: 2592758 bytes, checksum: db2d3c0a9d0ae11b1a0915209254db34 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-27T15:07:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_AnaliseEfeitosTermicos.pdf: 2592758 bytes, checksum: db2d3c0a9d0ae11b1a0915209254db34 (MD5) Previous issue date: 2011 / FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas / Utilizando dados observacionais de precipitação e temperatura do ar para o período de 1967 a 2008, do qual se elaborou a climatologia destas variáveis, e analisando as condições atmosféricas influenciadas pelo fenômeno ENOS, pretende-se identificar, caracterizar e analisar os efeitos térmicos espaciais na cidade de Belém-PA, a partir de dados meteorológicos de superfície e de imagens do sensor MODIS, o qual está disposto sobre a plataforma do satélite Aqua. Observou-se que, a média da precipitação anual foi de 2978,6 mm/ano, e que apresenta tendência de aumento ao longo dos anos, comportamento semelhante observou-se para a temperatura do ar. Em geral, os resultados mostram dois núcleos de maiores intensidade de temperaturas da superfície, um na cidade de Belém e outro na cidade vizinha, Ananindeua. Estes variam espacialmente e temporalmente de intensidade. Durante eventos de La Niña, o núcleo da ilha de calor fica localizado em bairros mais próximos a baía do Guajará, enquanto que durante eventos de El Niño estes bairros apresentam temperaturas mais amenas do que os bairros mais afastados dos corpos hídricos. Observou-se ainda que, a amplitude térmica da temperatura superficial entre áreas urbana e rural variam bastante, com a maior variação de 30,8°C e a menor de 16,8°C. Neste sentido, as maiores temperaturas da superfície foram observadas nos bairros com baixo NDVI, conseqüência de uma urbanização mais densa. As superfícies urbanas e as superfícies vegetadas apresentam relações de causa e efeito muito próximas, principalmente, durante o período menos chuvoso, isto pode ser percebido pela correlação que apresenta valor acima de 50%. Este estudo apresenta resultados que auxiliam no melhor entendimento do comportamento e dos efeitos térmicos espaciais e temporais na cidade de Belém, pois o uso de imagens do satélite é de fundamental importância para a identificação e caracterização das condições ambientais climáticas e ilhas de calor urbanas. / Using observational data of precipitation and air temperature from1967 to 2008, which drafted the climatology of these variables and analyzed the weather influenced by ENOS, were made an identification, characterization and analysis of spatial thermal effects in Belem (PA), from surface meteorological data and MODIS sensor images (which is prepared on a platform of the Aqua satellite). The average annual precipitation was 2978.6 mm/year, and presented an upward trend over the years, similar behavior has proved to the air temperature. In General, the results show two centers of greater intensity of surface temperatures: a center in Belem and another center in nearby town, Ananindeua. These centers vary spatially and temporally in intensity. During La Niña events, the center of heat island is located in the neighborhoods closest to Guajara Bay, while in the El Niño events, these neighborhoods have milder temperatures than the neighborhoods farther from water sources. The thermal amplitude of surface temperature between urban and rural areas varies greatly, with largest variation of 30,8°C and the lowest of 16,8°C. Thus, the highest surface temperatures were observed in neighborhoods with low NDVI, which is a consequence of a denser urbanization. Urban areas and most vegetated surfaces show cause/effect relationships very close, especially during the dry season, this can be realized by correlation that has value greater than 50%. This study presents results that assist in better understanding of behavior and spatial and temporal thermal effects in Belem, because the use of satellite images is important for the identification and characterization of climatic environmental conditions and urban heat islands.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Urbanization and the changes imposed by man disturb the complex natural system, modifying the elements and characteristics of climate on a local scale. Considering the influence of urbanization as derived from the fact that the local climate and responsible for the generation of an urban environment specifically, this work was to analyze the field thermo-hygrometric and the formation of heat islands and urban cool in Santa Maria RS (Rio Grande do Sul, State of Southern of Brazil), relating these variables geourbans and geoecologycs in the study area. To accomplish this work was used the methodology of the transects, consisting of mobile collections in points pre-established. It was established two transects for data collection of temperature and relative humidity of the atmospheric air: one has the direction more or less in a north/northwest-south/southeast (NNW-SSE), linking Street Sete de Setembro , in Neighborhood Perpétuo Socorro , the end Fernando Ferrari Avenue in Neighborhood Nossa Senhora de Lourdes and the other in the east/northeastwest/southwest (WSW-ENE), linking the Street Major Duarte to get Street Venâncio Aires near the Arroio Cadena at Central portion of the Santa Maria City. The data were collected on days August 14, 2008 and January 06, 2009, the area was under the weather for the South Atlantic Polar Mass in winter time and the Old Polar Mass or modified in the summer, respectively. Were made cotte measures at five different times (9, 12, 15h, 18h and 21h), in order to verify the responses of thermal and humidity from the points pre-established and distributed along the transects, totaling 13 points of measures along the transect 1 (NNWSSE) and 15 in the transect 2 (ENE-WSW). Armed with the data of temperature and humidity, were made cartograms of the field thermo-hygrometric. For this application was used the Software Surfer for Windows 8.0. In the preparation of cartograms of the thermal field were established color scales to represent the values of temperature, so the cool colors were associated with lower temperatures and the warm colors at higher temperatures. Cartograms of hygrometric field values were represented in the cartogram using a variation of blue scale, so the lighter blue was used to represent the values of lower humidity and dark blue for higher values. The results highlight that the hygrometric and thermal fields of the coverage area of the transects, both on the day of collection in the field of Mass Polar Atlantic in winter time and in the field of Old Polar Mass or modified in the summer, need to move apparent daily sun exposure of the slopes and to solar radiation. By analyzing the thermal field of January 06, 2009 in five hours of collection, it became clear the migratory movements of the heat islands of the eastern slope, during the morning, to the slopes facing the north and west quadrant, during periods of midday and afternoon. The weather conditions that occurred on January 06, 2009 (summer), with clear skies, calm winds and a light with high incidence of solar radiation on the surface, favored the formation of heat islands and freshness of magnitude rating, strong and very strong. Was verified the thermal contrast between the center and periphery of the study area. / A urbanização e as transformações impostas pela ação do homem desequilibram o complexo sistema natural, modificando os elementos e as características do clima na escala local. Considerando a influência da urbanização como fato derivador do clima local e responsável pela geração de um clima especificamente urbano, este trabalho, teve por objetivo analisar o campo termohigrométrico, bem como a formação de ilhas de calor e de frescor urbanas em Santa Maria/RS, relacionando-as as variáveis geourbanas e geoecológicas existentes na área de estudo. Para isso utilizou-se a metodologia dos transectos, que consiste em coletas móveis em pontos pré-estabelecidos. Foi estabelecido dois transectos para a coleta dos dados de temperatura e umidade relativa do ar: um no sentido norte/noroeste-sul/sudeste (NNW-SSE), ligando a rua Sete de Setembro, no bairro Perpétuo Socorro, ao final da avenida Fernando Ferrari no bairro Nossa Senhora de Lourdes e o outro no sentido leste/nordeste-oeste/sudoeste (ENE-WSW), ligando a rua Major Duarte ao começo da rua Venâncio Aires próximo, ao Arroio Cadena. Os dados foram coletados nos dias 14 de agosto de 2008 e 06 de janeiro de 2009, sob domínio das condições atmosféricas pela Massa Polar Atlântica no inverno e pela Massa Polar Velha ou modificada no verão, respectivamente. As coletas foram realizadas em cinco horários diferentes (9h, 12h, 15h, 18h e 21h), com o intuito de verificar as respostas térmicas e de umidade dos pontos pré-estabelecidos e distribuídos ao longo dos transectos, num total de 13 pontos ao longo do transecto 1 (NNW-SSE) e de 15 no transecto 2 (ENE-WSW). De posse dos dados de temperatura e umidade do ar, foram confeccionados os cartogramas do campo termo-higrométrico. Para tal foi utilizado o aplicativo Surfer for Windows 8.0. Na elaboração dos cartogramas do campo térmico foram estabelecidas escalas de cores para os valores de temperatura, onde as cores frias foram associadas a temperaturas mais baixas e as cores quentes a temperaturas mais altas. Nos cartogramas do campo higrométrico os valores de umidade foram representados utilizando uma variação da cor azul. Assim, o azul mais claro foi utilizado para representar os valores de umidade mais baixos e, a cor azul escura, para os valores mais altos. Como resultados destaca-se que os campos térmico e higrométrico da área de abrangência dos transectos, tanto no dia de coleta sob domínio da Massa Polar Atlântica, no inverno, quanto no domínio da Massa Polar Velha ou modificada, no verão, estão condicionados ao movimento aparente diário do sol e a exposição das vertentes à radiação solar. Ao analisar o campo térmico do dia 06 de janeiro de 2009, nos cinco horários de coleta, percebe-se o movimento migratório das ilhas de calor da vertente leste, para as vertentes voltadas para o quadrante norte e oeste. As condições de tempo ocorridas no dia 06 de janeiro de 2009 (verão), com céu limpo, ventos calmos a leve e com forte incidência de radiação solar na superfície, favoreceram a formação de ilhas de calor e de frescor de magnitude media, forte e muito forte, bem como o contraste térmico entre o centro e a periferia da área de estudo.

Submitted by Lafaiete Santos Santiago (lafaiete.santiago@ucsal.br) on 2016-11-23T12:30:31Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_PaixãoLindomarLuisdeS_2011.pdf: 4229250 bytes, checksum: d19e766c1753a7d172205bdd1f4ac50a (MD5) / Approved for entry into archive by Rosemary Magalhães (rosemary.magalhaes@ucsal.br) on 2017-01-14T16:46:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao Lindomar.pdf: 4229250 bytes, checksum: d19e766c1753a7d172205bdd1f4ac50a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-14T16:46:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_PaixãoLindomarLuisdeS_2011.pdf: 4229250 bytes, checksum: d19e766c1753a7d172205bdd1f4ac50a (MD5) Previous issue date: 2011-12-19 / A presente pesquisa realizou uma análise espacial das ilhas que fazem parte do município de Salvador. A Ilha de Bom Jesus dos Passos, Ilha dos Frades e Ilha de Maré foram estudadas através de uma abordagem que buscou estabelecer relação entre os conceitos de espaço, território e lugar. Partindo de uma concepção de que o espaço existe a priori sob o território e o lugar, foram levantados elementos que caracterizam a formação das ilhas. Desta forma, foi de fundamental importância conhecer o espaço estudado, sua história e os mecanismos que interferiram na formação da paisagem atual. Utilizou-se como fonte fundamental de dados as reportagens de jornais, que puderam mostrar a evolução da visão sobre as ilhas, bem como da própria formação do espaço. No período que vai de 1912 a 2010 inúmeras reportagens foram catalogadas fornecendo um material riquíssimo para análise. Com base nesse conhecimento e no levantamento de dados a partir de outras fontes documentais e do contato com o próprio objeto de pesquisa, por meio de visitas de campo, registros fotográficos, aplicação de questionários e entrevistas, observação in loco, consolidou-se dados para caracterização das dimensões que compõem a dinâmica destes territórios. Dentro da perspectiva que o território também é um lugar, que possui uma dimensão simbólica e subjetiva, teve relevante importância para este trabalho a compreensão do lugar das ilhas. Como parte da análise das perspectivas para esta localidade e do planejamento institucional foram analisados o Plano Diretor de Desenvolvimento Urbano e o Plano Estratégico do Turismo Náutico na Baía de Todos os Santos. / This research was conducted a spatial analysis of the islands which are part of the city of Salvador. Bom Jesus dos Passos Island, Frades Island and Maré Island were studied by means of an approach that sought to establish a relationship between the concepts of space, territory and place. Starting from a design of the space there is a priori in the territory and the place, were raised elements that characterize the formation of the islands. In this way, it was of fundamental importance to know the area studied, its history and the mechanisms that interfered in training the current landscape. It was used as key source of data for the reports of newspapers, which could show the evolution of the vision on the islands, as well as the formation of the area. In the period from 1912 to 2010 many reports have been cataloged by providing a rich material for analysis. On the basis of this knowledge and the collection of data from other sources of documentation and the contact with the object of research, by means of field visits, photographic records, questionnaires and interviews, on-site observation, has been consolidated data to characterize the dimensions that constitute the dynamics of these territories. Within the perspective that the territory is also a place that has a symbolic dimension is subjective, was important in this work to the understanding of the place of the islands. As part of the analysis of the prospects for this locality and the institutional planning were analyzed the Master Plan for Urban Development and the Strategic Plan of Nautical Tourism in the All Saints Bay

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3992.pdf: 1107503 bytes, checksum: 7c3e8c7b1f79eb3747f360b3ec8d02b4 (MD5) Previous issue date: 2011-03-01 / The Lagoa do Peixe National Park is an important conservation unity, aiming to protect the wetlands, one of the most endangered type of ecosystem in the world. In Southern Brazil around 90% of the wetlands were already lost. The protected ecosystems in the park are ernationally important for biodiversity conservation and it is the unique Ramsar site in Southern Brazil. The existence of areas invaded by Pinus eliotti and the artificial breaching of the lagoon sandbar are severe problems that can threaten the biodiversity in this preservation area. The goal of this study was to evaluate the diversity of aquatic macrophyte present in the park and test some ecological hypothesis about the community diversity of aquatic macrophyte in natural areas and areas under influence of the main problems of the park (pine invasion and the sandbar breaching). To answer this questions a survey was conducted in 32 wetlands situated inside the park between 2007 and 2009. We identified 176 aquatic macrophyte species in the palustrine wetlands of the park. The aquatic macrophyte richness and composition in coastal wetlands are directly related to the isolation degree of these wetlands in relation to the source wetland and other closer wetlands. The wetland area was not a significant factor for the spatial structure of the aquatic macrophyte community. Other determinant factors for the community were habitat diversity and hydroperiod. The influence of those environmental characteristics was different among the macrophyte groups defined as: hydrophytes, palustrine, and amphibious. The presence of pine resulted in a decrease in macrophyte richness, and the species composition in this area is, in a general way, a subset of the species found in natural wetlands. The artificial sandbar breaching did not affect the richness of aquatic macrophytes in the floodplain wetlands of Lagoa do Peixe. However, in this areas affected by the sandbar breaching, the community composition 4 was characterized by a pattern of continuous species replacement during the two-year study. These results provide important information for wetland management in the park. / O Parque Nacional da Lagoa do Peixe, o único sítio Ramsar no sul do Brasil, é uma importante Unidade de Conservação do sul do Brasil visando à proteção de áreas úmidas um dos tipos de ecossistemas mais ameaçados no mundo. No sul do Brasil, cerca de 90% das áreas úmidas já foram perdidas. A existência de áreas invadidas por Pinus elliottii e a abertura artificial da barra da Lagoa do Peixe são problemas graves que podem representar severos riscos à biodiversidade no parque. O objetivo desse estudo foi avaliar a diversidade de macrófitas aquáticas do parque e testar algumas hipóteses ecológicas sobre a dinâmica da comunidade de macrófitas aquáticas em áreas naturais e sob a influência da invasão do pinus e da abertura da barra. Foi realizado um inventário em 32 áreas úmidas do parque entre 2007 e 2009, nas quais foram identificadas 176 espécies de macrófitas aquáticas. A riqueza e a composição de macrófitas aquáticas estiveram diretamente relacionadas ao grau de isolamento dessas áreas em relação às áreas-fonte e a outras áreas úmidas próximas. O tamanho da área não foi um fator importante para a estrutura espacial da comunidade de macrófitas aquáticas, sendo fatores determinantes a diversidade de hábitats e o hidroperíodo. A influência desses fatores variou entre os grupos de macrófitas definidos como: hidrófitas, palustres e anfíbias. A invasão por pinus resultou na redução da riqueza de macrófitas e a composição de espécies nessas áreas é, de forma geral, um subconjunto das espécies encontradas nas áreas úmidas naturais. A abertura da barra não alterou a riqueza de macrófitas, as quais estão sujeitas ao manejo da barra. A composição da comunidade foi caracterizada por um padrão de contínua substituição de espécies ao longo dos dois anos de estudo. Esses resultados são informações importantes para o gerenciamento das áreas úmidas do parque.

Made available in DSpace on 2015-02-24T19:48:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ZuleideMCL.pdf: 3563963 bytes, checksum: d530c00861412b2b316c4040482b9f16 (MD5) Previous issue date: 2004-03-10 / This doctorate thesis concerning on the Characterization of the Environmental Dynamics of the Coastal Area of the Municipal district of Galinhos, Septentrional Coast of Rio Grande do Norte State, is located in the influence area of the Guamar? Petroliferous Pole, having as general objective the understanding of the active coastal dynamics in the region of Galinhos, whose specific objectives were: To study the variation of the coast line in the decades of 1954, 1967,1988, 1996, 2000, from remote sensing products; To elucidate the hypothesis of the region of Galinhos to have been an old system of islands barriers, using as basic tool the penetration radar in the soil - GPR; To monitor and to characterize the coastal dynamics of the study area starting from monthly data of beach profiles, sedimentological analysis, hydrodynamic data and environmental characterization data; which were used to feed the database of the N-NE network of Environmental Monitoring of Areas under Influence of the Petroliferous Industry;(REDE05/FINEP/CNPq/CTPETRO/ PETROBRAS). This research is justified, of the environmental point of view, by involving the mangrove ecosystem considered one of the most delicated environments of the State. From the viewpoint of the petroleum exploration, the systems of islands barriers are favorable for hydrocarbons reservoirs and, consequently important targets to the oil and gas industry, becoming this region attractive in comparison with similar lithified environments. With the results of the variability study in the position of the coast line in the Municipal district of Galinhos/RN from the analysis of remote sensing images, it was possible to investigate the changes in the coast line in temporal scale; the use of directional filters allowed to emphasize linings in the direction NE and to identify submerged features such as sandwaves. The use of GPR enabled the confirmation of paleochannels existence and thus confirmed the hypothesis that the Galinhos spit was formed from an old system of islands barriers. The results of the granulometric analyses indicated that in the summer period the sediments in the profiles A and B in the foreshore portion were classified with the granulometry of sand with scattered gravel and in the shoreface were constituted by sand, but in the winter period these same morphologic compartments were constituted by sand with sparse gravel and siltic sand respectively. In the profile C, in the summer and in the winter, the shoreface and foreshore compartments presented predominantly constituted by sand with sparse gravel. The hydrodynamic results showed that the largest wave heights were registered in the month of February (62 cm) and the highest period of 1,00 m/s in the month of May, the sense of the coastal currents was kept among the quadrants SW and NW, and the winds coming from NE were predominant. The analysis of the beach profiles demonstrated that in the profile A, although it had occurred erosion and deposition during the monitored months, the morphology of the referred profile was kept constant. In the profiles B and C, there were abrupt changes in the morphology, during the monitored months, having been identified a cyclic pattern in the features of the foreshore zone sometimes forming longitudinal sandy bars and in other times forming berm. These results evidenced, therefore, that studies of this nature are of fundamental importance for the coastal zoning, aiming subsidies to the organs managers in the closing of decisions as for the implantation of enterprises in the area, and for the industry of the petroleum through generation of information that subsidize the implementation and location of petroliferous structures adequate to this environment / Esta tese de doutorado sobre a caracteriza??o da din?mica ambiental da regi?o costeira do munic?pio de Galinhos, Litoral Setentrional do Rio Grande do Norte, acha-se inserida na ?rea de influ?ncia do P?lo Petrol?fero de Guamar?, tendo como objetivo geral o entendimento da din?mica costeira atuante na regi?o de Galinhos, cujos objetivos espec?ficos foram : estudar a varia??o da linha de costa nas d?cadas de 1954, 1967, 1988, 1996 e 2000, a partir de produtos de sensoriamneto remoto; elucidar a hipotese da regi?o de Galinhos ter sido um antigo sisitema de ilhas barreiras, utilizando como ferramneta b?sica o radar de penetra??o no solo - GPR; monitorar e caracterizar a dinamica costeira da ?rea em estudo a partir de dados mensais da perfis praiais, analise sedimentologica, dados hidrodin?micos e dados de caracteriza??o ambiental; este conjunto de dados foram utilizados para alimetar o banco de dados da Rede NNE de monitoramneto ambiental das ?reas sob influ?ncia da industria petrol?fera (REDE05/FINEP/CNPq/CTPERO/PETROBRAS). Esta pesquisa se justifica, do ponto de vista ambiental, por envolver ecossistemas de alta fragilidade como dunas, praias e manguezais. Do ponto de vista da explora??o do petr?leo, os sistemas de ilhas barreiras s?o prop?cios para reservat?rios de hidrocarbonetos e, por conseguinte, alvos importantes para a ind?stria do petr?leo e g?s tornando esta regi?o atrativa na compara??o com dep?sitos similares litificados. O estudo da variabilidade na posi??o da linha de costa no Munic?pio de Galinhos/RN a partir da an?lise de imagens de sensores remotos, foi poss?vel investigar as mudan?as na linha de costa em escala temporal; a utiliza??o de filtros direcionais permitiu enfatizar lineamentos de dire??o NE e identificar fei??es submersas tais como sandwaves. A utiliza??o do GPR possibilitou a comprova??o da exist?ncia de paleocanais confirmando a hip?tese de que o spit de Galinhos foi formado a partir de um antigo sistema de ilhas barreiras. Os resultados das an?lises granulom?tricas indicaram que no per?odo de ver?o os sedimentos nos perfis A e B na por??o de estir?ncio foram classificados como de granulometria areia com cascalho esparso e na antepraia foram constitu?dos por areia, j? no per?odo de inverno estes mesmos compartimentos morfol?gicos apresentaram-se com areia com cascalho esparso e areia siltosa respectivamente No perfil C, tanto no ver?o como no inverno, os compartimentos de estir?ncio e antepraia apresentaram-se predominantemente por areia com cascalho esparso. Os resultados hidrodin?micos mostraram que as maiores alturas de onda foram registradas no m?s de fevereiro (62 cm) e o maior per?odo de 1,00 m/s no m?s de maio, o sentido das correntes litor?neas se manteve entre os quadrantes SW e NW, e os ventos provenientes de NE foram predominantes. A an?lise dos perfis praiais demonstrou que no perfil A, embora tenha ocorrido tanto eros?o como deposi??o durante os meses monitorados, a morfologia do referido perfil permaneceu constante. Nos perfis B e C, ocorreram mudan?as bruscas na morfologia, durante os meses monitorados, tendo sido identificada uma ciclicidade nas fei??es da zona de estir?ncio ora formando barras arenosas longitudinais ora formando berma. Estes resultados evidenciaram, portanto, que estudos desta natureza s?o de fundamental import?ncia para o zoneamento costeiro, dando subs?dios aos ?rg?os gestores na tomada de decis?es quanto ? implanta??o de empreendimentos na regi?o, e para a ind?stria do petr?leo atrav?s de gera??o de informa??es que subsidiam a implementa??o de estruturas petrol?feras adequadas ao ambiente estudado

In this work we study the magnetic field modeling of realistic non-axisymmetric plasma equilibrium configurations and the heat flux patterns on the plasma facing components of tokamak divertor discharges. We start by establishing the relation between generic magnetic configurations and Hamiltonian dynamical systems. We apply the concept of magnetic helicity, used to establish topological bounds for the magnetic field lines in ideal plasmas, and to understand the self-consistency of reconnected magnetic surfaces in non-axisymmetric configurations. After this theoretical discussion, we present some results on magnetohydrodynamic equilibrium and the use of analytical solutions to the Grad-Shafranov equation for describing real tokamak discharges based on the experimental diagnostics and realistic boundary conditions. We also compare the equilibrium reconstruction of a DIII-D discharge obtained with a numerical reconstruction routine, developed as part of this research, and the EFIT code used by several tokamak laboratories around the world. The magnetic topology and plasma profiles obtained with our method are in considerable agreement with the numerical reconstruction performed with the other code. Then, we introduce a simplified description of the generic non-axisymmetric magnetic field created by known sources and implement it numerically for describing the magnetic field due to external coils in tokamak devices. After that, we use this routines to develop a numerical procedure to adjust a suitable set of non-linear parameters of internal filamentary currents, which are intended to model the plasma response based on the magnetic field measurements outside the plasma. Finally, these methods are used to model the magnetic field created by a slowly rotating plasma instability in a real DIII-D discharge. The plasma response modeling is based on the magnetic probe measurements and allow us to calculate the magnetic field in arbitrary locations near the plasma edge. Using this information we determine the non-axisymmetric plasma edge through the magnetic invariant manifolds routine developed during this work. The intersection of the calculated invariant manifold with the tokamak chamber agrees considerably well with the heat flux measurements for the same discharge at the divertor plates, indicating the development of a rotating manifold due to the internal asymmetric plasma currents, giving quantitative support to our simplified description of the magnetic field and the plasma edge definition through the invariant manifolds. / Neste trabalho estuda-se a modelagem do campo magnético em configurações realistas de plasmas em equilíbrio não-axissimétrico e o fluxo de calor nos componentes em contato com o plasma em descargas de tokamaks com desviadores poloidais. Começa-se estabelecendo a relação entre configurações magnéticas arbitrárias e sistemas dinâmicos Hamiltonianos. Então aplicamos o conceito de helicidade magnética, que é usado para estabelecer limitações topológicas sobre as linhas de campo magnético em plasmas ideais, assim como para compreender a auto-consistência das superfícies magnéticas reconectadas em configurações não-axissimétricas. Após esta discussão teórica, apresentam-se alguns resultados sobre o equilíbrio magnetohidrodinâmico e o uso de soluções analíticas à equação de Grad-Shafranov para descrever descargas reais em tokamaks, com base em diagnósticos experimentais e condições de contorno realistas. Também realiza-se uma comparação entre a reconstrução do equilíbrio de uma descarga do DIII-D, obtida mediante uma rotina numérica desenvolvida para esta pesquisa, com a obtida mediante o código EFIT, usado amplamente em diversos tokamaks. Após isso, apresenta-se uma descrição simplificada do campo magnético não-axissimétrico, criado por fontes determinadas, e a sua implementação para descrever o campo magnético devido às correntes externas em tokamaks. Então, usam-se estas rotinas para desenvolver um procedimento numérico que ajusta um conjunto adequado de parâmetros não-lineares de correntes filamentares internas, com as quais pretende-se modelar a resposta do plasma com base nas medidas de campo magnético fora do plasma. Finalmente, estes métodos são utilizados para modelar o campo magnético criado por uma instabilidade com rotação lenta numa descarga do DIII-D. Com base nas medidas das sondas magnéticas é possível modelar os campos criados em regiões arbitrárias próximas da borda do plasma. Usando esta informação é possível determinar a borda não-axissimétrica do plasma mediante as invariantes magnéticas calculadas com a utilização de uma rotina desenvolvida durante este trabalho. A intersecção da superfície invariante com a câmara do tokamak coincide satisfatoriamente com as medidas de fluxo de calor nas placas do divertor para a mesma descarga, indicando o desenvolvimento de uma variedade giratória criada pelas correntes de plasma não-axissimétricas, e sustentando quantitativamente a nossa descrição simplificada do campo magnético, assim como a definição da borda do plasma mediante as invariantes magnéticas.

Sabe-se que algumas alterações nutricionais maternas durante o período perinatal estão associadas com doenças metabólicas na vida adulta das proles, tais como diabetes melito tipo 2, resistência à insulina, obesidade e hipertensão arterial. O período da gestação em que estas alterações nutricionais influenciam a prole na idade adulta ainda não está elucidado. Modificações epigenéticas têm sido propostas como mecanismos responsáveis por estas desordens metabólicas. Ratas Wistar de doze semanas de idade foram alimentadas com dieta com conteúdo baixo (HO - 0,15% NaCl) ou normal (NR - 1,3% NaCl) de sódio desde o primeiro dia de gestação até o nascimento da prole ou HO durante a primeira (HO10) ou segunda (HO20) metade da gestação. O peso corpóreo e a ingestão de água e ração foram avaliados semanalmente durante a gestação. Teste de tolerância à insulina (ITT) e à glicose (GTT) e HOMA-IR foram realizados nas proles adultas. Expressão gênica por qRT-PCR e metilação do DNA na região promotora dos genes foram mapeadas utilizando tratamento com bissulfito de sódio e avaliadas por pirosequenciamento. O ganho de peso materno foi menor no HO e HO20 na terceira semana de gestação em comparação com NR e HO10. O peso ao nascimento da prole foi menor em machos e fêmeas dos grupos HO e HO20 em relação ao NR e HO10. O HOMA-IR foi maior nos machos com 12 semanas de idade do grupo HO em comparação com NR e com 20 semanas de idade do grupo HO10 em comparação com NR e HO20. Nas fêmeas com 12 semanas de idade o HOMA-IR foi maior no HO10 comparado com HO. Os níveis de insulina no soro foram maiores tanto nos machos com 20 semanas de idade do grupo HO10 comparado com NR quanto nas fêmeas com 12 semanas de idade do grupo HO10 comparado com HO. A área sob a curva do GTT indicou intolerância à glicose nos machos do grupo HO. A porcentagem de metilação das ilhas CpG no promotor dos genes de Igf1, Igf1r, Ins1, Ins2 e Insr no fígado de machos e fêmeas neonatais e no fígado, tecido adiposo branco e músculo em machos com 20 semanas de idade foi influenciada pela baixa ingestão de sal durante a gestação. Nenhuma destas alterações foi identificada nas fêmeas com 20 semanas de idade. Em conclusão, a baixa ingestão de sal na segunda metade da gestação é responsável pelo baixo peso ao nascimento em ambos os sexos. A intolerância à glicose observada na prole adulta ocorreu somente se a dieta hipossódica é dada durante a gestação inteira. Por outro lado, a resistência à insulina em resposta ao consumo de dieta hipossódica durante a gestação está relacionada com o momento em que ocorre este insulto e com o envelhecimento da prole. Também foi observado que alterações na metilação do promotor do gene Igf1 está correlacionado com o baixo peso ao nascimento em resposta a ingestão de dieta hipossódica durante a gestação / It is known that some maternal nutritional alterations during pregnancy are associated with metabolic disorders in adult offspring, such as insulin resistance, type 2 diabetes mellitus, obesity and arterial hypertension. The period of pregnancy in which these nutritional alterations influence adult offspring remains uncertain. Epigenetic changes are proposed to underlie these metabolic disorders. Twelve-week-old female Wistar rats were fed a low-salt (LS - 0.15% NaCl) or normal-salt (NS - 1.3% NaCl) diet since the first day of gestation until delivery or LS during the first (LS10) or second (LS20) half of gestation. Body weight, food and water intake were weekly evaluated during gestation. Blood glucose, insulin (ITT) and glucose (GTT) tolerance tests, HOMA-IR were performed in adult offspring. Gene expression and DNA methylation were mapped using bisulfite treatment evaluated by pyrosequencing in the male and female neonates and adult offspring. Weight gain was lower in LS and LS20 dams than in NS and LS10 dams in the third week of pregnancy. Birth weights were lower in male and female LS20 and LS rats compared with NS and LS10 neonates. HOMA-IR was higher in 12-week-old LS males compared with NS and in 20-week-old male LS10 rats compared with NS and LS20 rats. In 12-week-old LS10 females, HOMA-IR was higher than in LS. Serum insulin levels were higher in 20 week-old LS10 male compared with NS rats and in 12-week-old LS10 female compared to LS rats. The area under the curve of GTT indicated glucose intolerance in 12- and 20-week-old LS male. Methylation of CpG islands of the Insr, Igf1, Igf1r, Ins1 and Ins2 genes in liver in neonates male and female offspring and liver, white adipose tissue and muscle in 20-week-old male offspring were influenced by low-salt intake during pregnancy. None of these alterations was identified in 20-week-old females. In conclusion, low-salt diet consumption in the second half of pregnancy can result in low birth weights in the males and females offspring. Glucose intolerance observed in adult offspring occurred only if low salt intake was given throughout pregnancy. However, insulin resistance in response to low salt intake during pregnancy is related to the time at which this insult occurs and to the age of the offspring. Alterations in the DNA methylation of Igf1 were observed to be correlated with low birth weight in response to low salt feeding during pregnancy

As aves marinhas são sensíveis às alterações em todos os níveis tróficos, decorrentes de variações na disponibilidade de presas e contaminação por alguns compostos, capazes de se acumular nos tecidos dos organismos e magnificar-se através da cadeia trófica. As ilhas oceânicas brasileiras abrigam importantes colônias reprodutivas de aves marinhas e, apesar de serem consideradas locais remotos, estão sujeitas à contaminação decorrente de atividades humanas. Este trabalho avaliou a presença de poluentes orgânicos persistentes (POPs) em sangue, uma matriz não-destrutiva, de seis espécies de aves marinhas no Arquipélago de São Pedro e São Paulo e na Ilha da Trindade, que possibilita o monitoramento destes indivíduos ao longo dos anos. Os resultados indicaram que os principais POPs detectados no sangue (em ng g-1 de massa úmida) foram PCBs (0,05 a 55,09), DDTs (0,01 a 17,36) e Mirex (0,01 a 5,53). A migração influenciou nos altos níveis de POPs encontrados em Pterodroma arminjoniana e a massa (g) média dos indivíduos apresentou uma forte correlação negativa com as concentrações dos compostos predominantes no sangue. O sexo das aves não contribuiu significativamente nas concentrações de POPs em espécies monotípicas, exceto para a espécie Sula leucogaster que apresenta dimorfismo sexual acentuado. O comportamento alimentar, avaliado através da análise de isótopos estáveis de carbono e de nitrogênio (δ13C e δ15N), bem como as condições biológicas de cada animal contribuíram para explicar as variações nos perfis de contaminação entre as diferentes espécies. No geral, observou-se que as concentrações de POPS nos dois locais apresentaram valores baixos e similares sugerindo a via atmosférica como principal mecanismo de entrada desses contaminantes para estas regiões. Os resultados inéditos de POPs em sangue das aves marinhas nas duas mais recentes unidades de conservação marinhas criadas no Brasil, podem contribuir como referência para o monitoramento desses compostos em longo-prazo nessas regiões. / Seabirds are sensitive to changes at all trophic levels, due to variations in prey availability and contamination by some compounds, which can be accumulated in the tissues of organisms and to be magnified through the trophic chain. The Brazilian oceanic islands harbor important seabird breeding colonies and, although they are considered remote sites, they are subject to contamination from human activities. This work evaluated the presence of Persistent Organic Pollutants (POPs) in blood, a non-destructive matrix, of six species of seabirds in the São Pedro and São Paulo Archipelago (SPSPA) and Trindade Island (TI), that allows the monitoring of these individuals over the years. The results indicated that the major POPs detected in blood (ng g-1 in wet weight) were PCBs (0.05 to 55.09), DDTs (0.01 to 17.36) and Mirex (0.01 to 5,53). Migration influenced the high levels of POPs found in Pterodroma arminjoniana and the mean mass (g) of the individuals drove a strong negative correlation with the concentrations of the predominant compounds in the blood. The gender of the individuals did not contribute significantly to the concentrations of POPs in monotypic species, except for the species Sula leucogaster that presents marked sexual dimorphism. The feeding behavior was evaluated through the analysis of stable isotopes of carbon and nitrogen (δ13C and δ15N) as well as the biological conditions of each animal contributed to explain the variations in the contamination profiles between the different species. In general, we observed that POPS concentrations at both sites presented low and similar values suggesting the atmospheric transport as the main input mechanism of these compounds for these regions. The unpublished results of POPs, in blood of seabirds from the two most recent marine conservation units created in Brazil, can contribute as reference values for their long-term monitoring in those regions.