As Mucopolissacaridoses (MPS) são um grupo de doenças de armazenamento lisossômico causadas por deficiência de enzimas que catalisam a degradação gradual das glicosaminoglicanas (GAGs). GAGs (anteriormente chamadas de mucopolissacarídeos) são produtos de degradação das proteoglicanas que existem na matriz extracelular e tem efeito proteolítico. A classificação das MPS é baseada na deficiência enzimática específica. A MPS IVA é causada por mutações no gene que codifica a enzima GALNS (Nacetilgalactosamina-6-sulfatase), a qual desempenha um papel crucial na degradação do sulfato de queratano e condroitina-6-sulfatase. As mutações na enzima se resumem em três categorias: interrupção do sítio ativo, alterações no núcleo hidrofóbico e exposição da superfície, onde mutações missense na estrutura podem afetar gravemente a atividade da proteína GALNS, alterando seu núcleo hidrofóbico ou modificando seu enovelamento (folding). Com a falta de tratamentos efetivos, sendo em sua maioria paliativos, e tendo como base a estrutura já resolvida da GLANS selvagem, este trabalho teve como objetivo modelar 3 variantes da enzima GALNs, sendo uma mutação no sítio ativo, uma no núcleo hidrofóbico e uma na superfície. Foi usado o software MODELLER 9.12 para a modelagem comparativa, os softwares Prochek, PROSA II, ERRATv2, Verify3d, ProQ para a avaliação dos modelos, o software NAND 2.10, para simulação de dinâmica molecular e o software Chimera 1.10.1 para cálculo de superfícies eletrostáticas e hidrofobicidade da superfície. Os modelos apresentaram bons resultados segundo os softwares de avaliação e análise visual. Apresentaram poucas diferenças estruturais em relação à estrutura da GALNS selvagem, demonstraram estabilidade em simulação de dinâmica molecular. Entretanto, algumas diferenças foram observadas com relação à distribuição de cargas e hidrofobicidade no sítio ativo do modelo da variante com mutação no sítio ativo. Pôde ser concluído que as 3 mutações analisadas não causaram alterações estruturais significativas, não interferiram na estabilidade estrutural em simulação de dinâmica molecular, entretanto, foi demonstrado que mutações na região do sítio ativo podem interferir na função da enzima. / The Mucopolysaccharidoses (MPS) are a group of lysosomal storage diseases caused by deficiencies in enzymes that catalyze the gradual glycosaminoglycans (GAGs) degradation. GAGs (formerly called mucopolysaccharides) are products of proteoglycan degradation that exist in the extracellular matrix and have proteolytic effect. The classification of MPS is based on the specific enzyme deficiency. MPS IVA is caused by mutations in the gene that encodes the GALNS enzyme (Nacetilgalactosamina-6-sulfatase), which plays a crucial role in the degradation of keratan sulfate and chondroitin-6-sulfatase. Mutations in the enzyme can be summarized in three categories: interruption of the active site, changes in the hydrophobic core and display surface, where missense mutations in the structure can seriously affect the activity of GALNS protein, changing its hydrophobic core or modifying its folding. With the lack of effective treatments, in its most palliative, and based on the wild GALNS structure already determined, this study aimed to model 3 variants of GALNS enzyme, a mutation in the active site, one in the hydrophobic core and a on the surface. 9.12 MODELLER was used for comparative modeling software, the software Prochek, Prose II, ERRATv2, Verify3d, ProQ models for the evaluation of the NAND 2.10 software, for molecular dynamics simulation and software Chimera 1.10.1 calculates electrostatic and hydrophobic surface. The models showed good results according to the evaluation software and visual analysis. Presented few structural differences from the wild GALNS structure and showed stability in molecular dynamics simulation. However, some differences were observed with respect to the charge distribution and hydrophobicity in the active site of the variants of the model with a mutation in the active site. It might be concluded that the three mutations analyzed did not cause significant structural changes and did not affect the structural stability in molecular dynamics simulation, however, it has been shown that mutations in the active site region may interfere with the function of this enzyme.

As Mucopolissacaridoses (MPS) são um grupo de doenças de armazenamento lisossômico causadas por deficiência de enzimas que catalisam a degradação gradual das glicosaminoglicanas (GAGs). GAGs (anteriormente chamadas de mucopolissacarídeos) são produtos de degradação das proteoglicanas que existem na matriz extracelular e tem efeito proteolítico. A classificação das MPS é baseada na deficiência enzimática específica. A MPS IVA é causada por mutações no gene que codifica a enzima GALNS (Nacetilgalactosamina-6-sulfatase), a qual desempenha um papel crucial na degradação do sulfato de queratano e condroitina-6-sulfatase. As mutações na enzima se resumem em três categorias: interrupção do sítio ativo, alterações no núcleo hidrofóbico e exposição da superfície, onde mutações missense na estrutura podem afetar gravemente a atividade da proteína GALNS, alterando seu núcleo hidrofóbico ou modificando seu enovelamento (folding). Com a falta de tratamentos efetivos, sendo em sua maioria paliativos, e tendo como base a estrutura já resolvida da GLANS selvagem, este trabalho teve como objetivo modelar 3 variantes da enzima GALNs, sendo uma mutação no sítio ativo, uma no núcleo hidrofóbico e uma na superfície. Foi usado o software MODELLER 9.12 para a modelagem comparativa, os softwares Prochek, PROSA II, ERRATv2, Verify3d, ProQ para a avaliação dos modelos, o software NAND 2.10, para simulação de dinâmica molecular e o software Chimera 1.10.1 para cálculo de superfícies eletrostáticas e hidrofobicidade da superfície. Os modelos apresentaram bons resultados segundo os softwares de avaliação e análise visual. Apresentaram poucas diferenças estruturais em relação à estrutura da GALNS selvagem, demonstraram estabilidade em simulação de dinâmica molecular. Entretanto, algumas diferenças foram observadas com relação à distribuição de cargas e hidrofobicidade no sítio ativo do modelo da variante com mutação no sítio ativo. Pôde ser concluído que as 3 mutações analisadas não causaram alterações estruturais significativas, não interferiram na estabilidade estrutural em simulação de dinâmica molecular, entretanto, foi demonstrado que mutações na região do sítio ativo podem interferir na função da enzima. / The Mucopolysaccharidoses (MPS) are a group of lysosomal storage diseases caused by deficiencies in enzymes that catalyze the gradual glycosaminoglycans (GAGs) degradation. GAGs (formerly called mucopolysaccharides) are products of proteoglycan degradation that exist in the extracellular matrix and have proteolytic effect. The classification of MPS is based on the specific enzyme deficiency. MPS IVA is caused by mutations in the gene that encodes the GALNS enzyme (Nacetilgalactosamina-6-sulfatase), which plays a crucial role in the degradation of keratan sulfate and chondroitin-6-sulfatase. Mutations in the enzyme can be summarized in three categories: interruption of the active site, changes in the hydrophobic core and display surface, where missense mutations in the structure can seriously affect the activity of GALNS protein, changing its hydrophobic core or modifying its folding. With the lack of effective treatments, in its most palliative, and based on the wild GALNS structure already determined, this study aimed to model 3 variants of GALNS enzyme, a mutation in the active site, one in the hydrophobic core and a on the surface. 9.12 MODELLER was used for comparative modeling software, the software Prochek, Prose II, ERRATv2, Verify3d, ProQ models for the evaluation of the NAND 2.10 software, for molecular dynamics simulation and software Chimera 1.10.1 calculates electrostatic and hydrophobic surface. The models showed good results according to the evaluation software and visual analysis. Presented few structural differences from the wild GALNS structure and showed stability in molecular dynamics simulation. However, some differences were observed with respect to the charge distribution and hydrophobicity in the active site of the variants of the model with a mutation in the active site. It might be concluded that the three mutations analyzed did not cause significant structural changes and did not affect the structural stability in molecular dynamics simulation, however, it has been shown that mutations in the active site region may interfere with the function of this enzyme.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / A indústria de software brasileira tem buscado cada vez mais se especializar e aumentar sua capacidade competitiva para sobreviver no mercado globalizado. Formada por aproximadamente 7800 empresas de software e serviços relacionados, segundo pesquisa publicada pela Associação Brasileira das Empresas de Software (ABES) em abril de 2007, a indústria de software brasileira movimentou 9,09 bilhões de dólares no ano de 2006, representando 0,97% do PIB brasileiro naquele ano. Com crescimento anual de mais de 20% nos três anos anteriores ao da pesquisa da ABES e ocupando o 13° lugar no ranking mundial do mercado software e serviços, as principais dificuldades da indústria de software brasileira estão relacionadas ao pequeno porte das empresas e ao baixo nível de capacidade dos seus processos. Considerando este contexto, foi desenvolvida neste trabalho uma metodologia para implantar programas de Melhoria de Processo de Software (MPS) em grupos de empresas desenvolvedoras de software. Esta metodologia foi criada com base na abordagem para melhoria de processo PRO2PI e busca tratar problemas comuns em iniciativas de MPS e de trabalho com grupos de empresas. A validação e avaliação da metodologia proposta ocorreu em dois grupos de empresas que almejavam o nível G de maturidade no modelo de qualidade de software MPS.BR. Os resultados obtidos com estes estudos de caso indicaram que a abordagem é viável e pode ser utilizada como referência para realizar trabalhos desta natureza, uma vez que foi superada significativamente a média histórica de menos de dez por cento de sucesso em iniciativas de MPS em grupos de empresa

Made available in DSpace on 2014-06-12T16:00:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6369_1.pdf: 1583587 bytes, checksum: 633847499f421dc9ca8d4a93a2d07630 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / Iniciativas de melhoria de processos de software (MPS) têm tido uma importância cada vez maior na indústria de software como fator de evolução da qualidade de seus produtos e de combate à alta taxa de insucesso em projetos desta indústria. Pesquisas mostram que as iniciativas de MPS, por sua vez, também têm uma alta taxa de insucesso. Mostram também, que vários dos principais fatores críticos em MPS não são questões técnicas de engenharia de software e sim questões humanas, sociais e organizacionais, relativas à condução das iniciativas de melhoria, e à interação entre seus participantes. Esta dissertação mostra que iniciativas de MPS podem ser vistas como uma intervenção na organização que produz software. A teoria de intervenção e conceitos complementares de teorias de ação e de aprendizagem organizacional do cientista social Chris Argyris e seus colaboradores são usados nesta dissertação para reinterpretar e compreender mais profundamente os problemas sócio-técnicos de iniciativas de MPS. São particularmente apontados como problemas que permeiam iniciativas de MPS: a incongruência das normas internalizadas da organização com os objetivos da intervenção de MPS; a dificuldade dos atores em lidar produtivamente com situações conflitivas; a incongruência da teoria em uso dos atores para com as atividades primárias de intervenção preconizadas por Argyris; e finalmente, as limitações da abordagem predominantemente técnica na condução da intervenção de MPS. A mesma abordagem teórica é utilizada como base para prescrição de estratégias de ação de como tratar os problemas levantados. A interpretação dos problemas tomou por base uma pesquisa de campo sobre fatores críticos (facilitadores e barreiras) em iniciativas de MPS. A pesquisa foi realizada com entrevistas a profissionais desempenhando vários papéis (engenheiros da qualidade, consultores externos, diretor, gerentes de projetos e engenheiros de software) e que estiveram envolvidos em iniciativas de MPS em suas empresas. Esta dissertação contribui, assim, para preencher uma lacuna comumente encontrada na condução de iniciativas MPS, que usam modelos normativos tais como CMMI e MPS.Br, quanto ao entendimento e tratamento dos fenômenos humanos e sociais inerentes a este tipo de iniciativa

京都大学 / 0048 / 新制・課程博士 / 博士(工学) / 甲第18223号 / 工博第3815号 / 新制||工||1585(附属図書館) / 31081 / 京都大学大学院工学研究科社会基盤工学専攻 / (主査)教授 後藤 仁志, 教授 細田 尚, 准教授 KHAYYER Abbas / 学位規則第4条第1項該当 / Doctor of Philosophy (Engineering) / Kyoto University / DFAM

<p>MPS-system syftar till att öka intäkterna, minska kostnaderna och frigöra kapital genom ökad leveransservice, flexibilitet och reducerade kostnader för lagerhållning, administration och transporter. Implementeringen av ett datoriserat MPS-system ska leda till förbättringar, kostnadsbesparingar och i överlag bara positiva förändringar hos tillverkande företag enligt litteraturen. Studien avser att undersöka vilka förbättringar och nackdelar/begränsningar företag som implementerat MPS-system upplever med sina MPS-system. Har de kunnat förbättra styrningen och kontrollen av verksamheten, i form av förbättrade variabler, som kan påvisas till implementeringen av MPS-system?</p><p>Syftet med den här uppsatsen är att undersöka om införandet av MPS-system förbättrat de undersökta legotillverkarnas styrning och kontroll av sina verksamheter samt vilka begränsningar de upplever med sina MPS-system.</p><p>Vi har genomfört personliga intervjuer med våra respondenter på AHAN AB, PNM Plåt och Modellteknik AB i Eskilstuna/Torshällaområdena. För att resultatet ska vara någorlunda tillförlitligt och användbart så har urvalet av företag gjorts efter kriteriet legotillverkare. Vi genomförde semistrukturerade personliga intervjuer med alla våra respondenter. Sammanlagt intervjuades fem respondenter. Undersökningen är huvudsakligen av kvalitativ karaktär.</p><p>Av undersökningen framgick det att det fanns få brister med själva MPS-systemet. Missnöjena och begränsningarna berodde främst på andra anledningar än brister hos MPS-systemet. Utifrån de undersökta variablerna så har de tre legotillverkarna uppnått bättre kontroll och styrning över sina verksamheter. Dock inte i samma utsträckning som det intryck vi hade fått i början, av vår litteratur. I praktiken är några av dessa målsättningar också motstridiga. Vidare är inte alla de undersökta målsättningarna relevanta för alla företag. Även om alla företag inte kunnat förbättra samtliga variabler så framgick det av undersökningen att de flesta av målsättningarna ändå kunde uppnås.</p> / <p>MPC systems aim to increase companies’ revenue, reduce costs, generate capital by providing better delivery service, flexibility, while reducing transportation, administration and storage costs. The implementation of MPC systems are meant to result in reduced production costs, generate capital and overall pave the way for betterments in manufacturing companies according our literature. We are interested in studying the same. What kind of improvements and limitations do companies experience with their MPC systems?</p><p>The purpose of this thesis is to study whether the implementation of MPC systems have improved the interviewed contract manufacturers’ management and control of their business entities as well as to study the MPC systems limitations.   </p><p>This study is based on a qualitative survey conducted on three contract manufacturers in Eskilstuna and Torshälla. We have conducted semi-structured interviews with five respondents at AHAN AB, PNM Plåt AB and Modellteknik AB. The companies were selected on the basis of their mode of operation, i.e. that all be contract manufacturers.</p><p>The results from the study show that there were few disadvantages with the MPC systems per se. The limitations depended mostly on other factors such as time restriction and the personnel’s knowledge limitations than faults with the MPC systems. We have concluded that the interviewed companies had improved the management and control of their business entities with their MPC systems. However, the improvements were not as remarkable as implied by our literature. In reality, some of the goals can be conflicting. Some companies have to ignore some goals in order to achieve or better others. The study also showed that many of the goals were achievable although not all the companies had managed to achieve them.</p>

<p>Merparten av de kommersiella system för mobilkommunikation som finns och byggs i världen idag bygger fortfarande på GSM, antalet abbonnenter är över 2 miljarder. För att utöka funktionaliteten med mobila terminaler har det forskats på att införa positionering i GSM-nätverk. Tjänster som använder abbonnentens positionsinformation kallas Location Based Service och de ger möjlighet att utöka funktionaliteten och spara användaren av tjänsten arbete. </p><p>Rapporten beskriver olika tekniker för positionering och slutsatsen att CGI-TA är den teknik som positioneringen ska byggas på. Denna teknik finns tillgänglig hos de svenska operatörerna idag och för att kommunicera med dem används Mobile Location Protocol 3.0.0. Implementation av positioneringen realiserades i en J2EE-miljö i form av en WebLogic Server 8.1 med hjälp av Enterprise Java Beans och Java Connector Architecture. Prototypen verifierades med hjälp av en emulator till Ericsson Mobile Positioning System som klarar av att hantera Mobile Location Protocol 3.0.0.</p>

<p>Det var när Lucas Knies var dryga året som han fick sin diagnos – han lider av en svår ämnesomsättningssjukdom som bara fyra personer till i Sverige har. Sjukdomen är ärftlig och tillhör sjukdomsgruppen mukopolysackaridoser, MPS-sjukdomar. Läkarna har tidigare stått handfallna men forskningen har gått framåt och behandling för dessa sjukdomar håller på att utvecklas. De familjer som får beskedet att deras barn är svårt sjukt vill ofta ha kontakt med andra människor som befinner sig i samma situation. Informationsbehovet är stort och i juli 2005 startade MPS-föreningen för alla MPS-sjuka och deras familjer.</p>

MPS-system syftar till att öka intäkterna, minska kostnaderna och frigöra kapital genom ökad leveransservice, flexibilitet och reducerade kostnader för lagerhållning, administration och transporter. Implementeringen av ett datoriserat MPS-system ska leda till förbättringar, kostnadsbesparingar och i överlag bara positiva förändringar hos tillverkande företag enligt litteraturen. Studien avser att undersöka vilka förbättringar och nackdelar/begränsningar företag som implementerat MPS-system upplever med sina MPS-system. Har de kunnat förbättra styrningen och kontrollen av verksamheten, i form av förbättrade variabler, som kan påvisas till implementeringen av MPS-system? Syftet med den här uppsatsen är att undersöka om införandet av MPS-system förbättrat de undersökta legotillverkarnas styrning och kontroll av sina verksamheter samt vilka begränsningar de upplever med sina MPS-system. Vi har genomfört personliga intervjuer med våra respondenter på AHAN AB, PNM Plåt och Modellteknik AB i Eskilstuna/Torshällaområdena. För att resultatet ska vara någorlunda tillförlitligt och användbart så har urvalet av företag gjorts efter kriteriet legotillverkare. Vi genomförde semistrukturerade personliga intervjuer med alla våra respondenter. Sammanlagt intervjuades fem respondenter. Undersökningen är huvudsakligen av kvalitativ karaktär. Av undersökningen framgick det att det fanns få brister med själva MPS-systemet. Missnöjena och begränsningarna berodde främst på andra anledningar än brister hos MPS-systemet. Utifrån de undersökta variablerna så har de tre legotillverkarna uppnått bättre kontroll och styrning över sina verksamheter. Dock inte i samma utsträckning som det intryck vi hade fått i början, av vår litteratur. I praktiken är några av dessa målsättningar också motstridiga. Vidare är inte alla de undersökta målsättningarna relevanta för alla företag. Även om alla företag inte kunnat förbättra samtliga variabler så framgick det av undersökningen att de flesta av målsättningarna ändå kunde uppnås. / MPC systems aim to increase companies’ revenue, reduce costs, generate capital by providing better delivery service, flexibility, while reducing transportation, administration and storage costs. The implementation of MPC systems are meant to result in reduced production costs, generate capital and overall pave the way for betterments in manufacturing companies according our literature. We are interested in studying the same. What kind of improvements and limitations do companies experience with their MPC systems? The purpose of this thesis is to study whether the implementation of MPC systems have improved the interviewed contract manufacturers’ management and control of their business entities as well as to study the MPC systems limitations.    This study is based on a qualitative survey conducted on three contract manufacturers in Eskilstuna and Torshälla. We have conducted semi-structured interviews with five respondents at AHAN AB, PNM Plåt AB and Modellteknik AB. The companies were selected on the basis of their mode of operation, i.e. that all be contract manufacturers. The results from the study show that there were few disadvantages with the MPC systems per se. The limitations depended mostly on other factors such as time restriction and the personnel’s knowledge limitations than faults with the MPC systems. We have concluded that the interviewed companies had improved the management and control of their business entities with their MPC systems. However, the improvements were not as remarkable as implied by our literature. In reality, some of the goals can be conflicting. Some companies have to ignore some goals in order to achieve or better others. The study also showed that many of the goals were achievable although not all the companies had managed to achieve them.

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