Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 533113 bytes, checksum: 68efaa131b463a2ce6d30117b183bd46 (MD5) Previous issue date: 2011-07-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The efficiency in the use of N (EUN) and P (EUP) in maize is important because it allows achieving satisfactory yields with lower costs and in a sustainable way. The use of early evaluation methods and indirect selection in plants is also of great interest in the improvement for abiotic stresses. For this, it is very valuable to have the knowledge of the relationship between characters, especially if the characters of interest show problems of measurement and identification. Thus the objective was to identify the relationship between determinant characters of the efficiency in the use of nitrogen and phosphorus in maize. For this, 14 inbred lines and 39 hybrids were evaluated in two simple experiments, in high and low availability of N and P in a completely randomized design with two replications in a simple factorial design. The experiments were conducted in a greenhouse at the Federal University of Viçosa, during the month of October 2010. The plants were harvested in the V6 stage. From the material that was collected, the measured characters were dry shoot mass (MPS), specific root area (ARE), lateral root length (CRLat), axial root lenght (CRAxi), as well as the two components of the EU N or P were estimated (utilization efficiency - EUt - and absorbing - EAb). The data was subjected to analysis of variance and path. Significant differences between the genotypes were detected for most of the traits studied in high and low availability, except for the EUt in both nutrient levels and ARE in low N (BN). In the phenotypic correlation matrices, the presence of multicollinearity was diagnosed, at a moderate level, between the characters for the high explanatory N (AN). The characters of the root showed no effects on the EU. Thus, it is possible to conclude that the dry mass of shoots and the efficiency in the absorption are the determinant characters of efficiency in the use of nitrogen of high availability, the first one being the most important. The dry mass shoot of the character is the determinant character of the efficiency in the use of nitrogen in low availability of this nutrient and in the efficiency in the use of phosphorus in high and low availability. / A eficiência no uso de N (EUN) e P (EUP) em milho é importante, pois permite alcançar produtividades satisfatórias com menores custos e de modo sustentável. O uso de métodos de avaliação precoce ou de seleção indireta em plantas é também de grande interesse no melhoramento para estresses abióticos. Para isso, o conhecimento da relação entre caracteres é de grande valia, principalmente se os caracteres de interesse apresentam problemas de mensuração e identificação. Assim, o objetivo foi identificar a relação entre caracteres determinantes da eficiência no uso de nitrogênio e fósforo em milho. Para isso, foram avaliados 14 linhagens e 39 híbridos simples em dois experimentos, em baixa e alta disponibilidade de N e P, em delineamento inteiramente casualizado com duas repetições, em esquema fatorial simples. Os experimentos foram conduzidos em casa de vegetação, na Universidade Federal de Viçosa, durante o mês de outubro de 2010. As plantas foram colhidas no estádio V6. A partir do material coletado, os caracteres mensurados foram massa da parte aérea seca (MPS), área de raiz específica (ARE), comprimento de raiz lateral (CRLat), comprimento de raiz axial (CRAxi), bem como foram estimados os dois componentes da EU de N ou P (eficiência de utilização EUt e absorção - EAb). Os dados foram submetidos a análises de variância e trilha. Detectou-se diferenças significativas entre os genótipos para a maioria dos caracteres estudados, em alta e baixa disponibilidade, exceto para a EUt nos dois níveis dos nutrientes e ARE em baixo N (BN). Nas matrizes de correlação fenotípica, foi diagnosticada a presença de multicolinearidade, em nível moderado, entre os caracteres explicativos referentes ao alto N (AN). Os caracteres de raiz não apresentaram efeitos sobre as EU. Com isso, é possível concluir que a massa de parte aérea seca e a eficiência na absorção são os caracteres determinantes da eficiência no uso de nitrogênio em alta disponibilidade, sendo o primeiro de maior importância; A massa de parte aérea seca é o caractere determinante da eficiência no uso de nitrogênio em baixa disponibilidade desse nutriente e na eficiência no uso de fósforo em alta e baixa disponibilidade.

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV10MA056.pdf: 373311 bytes, checksum: b60aab4751e6600ccd1303f723cdfd00 (MD5) Previous issue date: 2010-09-17 / This work aimed to estimate the general and specific combining ability on five bean genotypes. The experiment was conducted at the Experimental area of Instituto de Melhoramento e Genética Molecular da Universidade do Estado de Santa Catarina (IMEGEM/UDESC) in a randomized block design with two replications. The traits plant height (EP), number of pods per plant (NLP) and cycle plant (CIC) were employed. Data were analyzed by Griffing I method I. For the EP additive gene action was predominant for NGL and CIC to non additive gene action predominates. The parents IPR Chopim, BAF 97 and BAF 7 were higher for EP, BRS Valente BAF 7 for NLP and BRS Supremo and BRS Valente for CIC. BAF 7 is promising to be used in crosses to develop strains with higher plant height, increased number of pods per plant and late maturity / O objetivo deste trabalho foi estimar a capacidade geral e específica de combinação em cinco genótipos de feijão. O experimento foi conduzido na área experimental do Instituto de Melhoramento e Genética Molecular da Universidade do Estado de Santa Catarina (IMEGEM/UDESC), em delineamento de blocos casualizados com 2 repetições. Foram avaliados os caracteres estatura de planta (EP), número de legumes por planta (NLP) e ciclo de planta (CIC). Os dados foram analisados pelo método I de Griffing. Para EP a ação gênica predominante foi aditiva, para NGL e CIC a ação gênica não-aditiva predomina. Os genitores IPR Chopim, BAF 97 e BAF 7 foram superiores para EP, BRS Valente e BAF 7 para NLP e BRS Supremo e BRS Valente para CIC. BAF 7 é promissor para ser utilizado em cruzamentos para o desenvolvimento de linhagens com estatura de planta elevada, maior número de legumes por planta e ciclo tardio

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_murilo_cerioli.pdf: 248504 bytes, checksum: 5753f583efc83bb06c02cd0f2c7db965 (MD5) Previous issue date: 2013-05-17 / Improvements in methods of selection are extremely important for breeding programs because the market requires speed and efficiency in development new cultivars. In potato breeding, the elimination of genotypes with undesirable characteristics through early generation selection avoids that inferior genotypes be taken to the field. Selection for some traits in the seedling generation saves considerable resources and improves the quality of the population carried to the field. The aim of this study was to investigate in the seedling generation the influence of pot size on the expression of general appearance and yield of tubers and the selection efficiency. The study consisted of two generations of seedlings obtained from ten different crosses grown in the greenhouse in three different pot sizes during the autumn and spring. A first clonal generation was derived from autumn seedlings and planted in the field. Traits components of tuber appearance and yield were measured and trait correlations within seedling generation and between generations were determined. The results show that pot size influences trait expression and that early selection in the seedling generation is a viable option for many tuber appearance and yield component traits. Most traits are better expressed in large pots except skin roughness which showed more reticulated skin tubers in small pots. Skin roughness, tuber shape, tuber weight and number of tubers are more efficient for selection in the seedling generation. / Buscar melhorias em um programa de melhoramento é de grande importância, pois cada vez mais o mercado exige rapidez e eficiência no desenvolvimento de novas cultivares. No melhoramento de batata, a exclusão de genótipos com características indesejáveis o mais cedo possível, por meio da seleção em gerações iniciais, evita que genótipos inferiores sejam mantidos nos ensaios de campo. A seleção para alguns caracteres na geração de plântulas pode economizar recursos consideráveis e melhorar a qualidade da população que é levada a campo. O objetivo desse estudo foi verificar a influência do tamanho de recipiente na expressão de caracteres de aparência e rendimento de tubérculos na geração de plântulas, assim como a eficiência da seleção nessa geração. O estudo foi composto de duas gerações de plântulas obtidas de dez cruzamentos distintos, cultivadas em casa de vegetação no outono e na primavera, conduzidas em três tamanhos diferentes de recipiente e a primeira geração clonal derivada de uma das gerações de plântulas. Foram avaliados caracteres componentes da aparência geral e rendimento de tubérculos e suas correlações entre caracteres na geração de plântulas e entre a geração de plântulas e sua respectiva primeira geração clonal. Os resultados evidenciam que o tamanho do recipiente influencia na expressão de caracteres e que a seleção precoce na geração de plântulas é uma opção viável para muitos caracteres componentes de aparência geral e rendimento de tubérculos. A maior parte dos caracteres avaliados se expressa melhor nos recipientes de tamanho grande, exceto o caráter aspereza de película, que apresentou tubérculos com película mais reticulada no recipiente de tamanho pequeno. Aspereza de película, formato, massa e número de tubérculos são os caracteres com maior eficiência para seleção em geração de plântulas.

Made available in DSpace on 2014-07-29T14:42:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Renata Cristina Alvares.pdf: 663864 bytes, checksum: f42760430c0fcf1ae2b7997353c2fcf7 (MD5) Previous issue date: 2011-03-22 / Collecting and characterization of Capsicum chinense Jacq accesses are very important to recover and preserve genetic resources of this species; however, it is necessary to quantify the existing divergence for its use in breeding programs. The objective of this work was to verify the genetic divergence of 137 accesses of Capsicum chinense Jacq collected in southwest Goiás through 25 morphological descriptors suggested by IPGRI, and to quantify them using the colorimetric method in absorbance/gram of the capseine present in fruits. The experiment was carried out in a green house, at the University of Goiás Jataí campus, arranged in a completely randomized bloc design, with four replicates of one plant in an eight kilogram soil pot. Data was subjected to the analysis of variance and the 100 seed weight was significant at 5% of probability, and the other traits significant at 1% probability. The same occurred with the means grouping by Scott-Knott at 5% probability, with the formation of one more group for all descriptors: 10 fruit mass, fruit length average, and fruit pedicel length; which presented a larger number of groups. In the multivariate statistic the optimizing grouping of Tocher was performed for all 137 accesses, with the inclusion of 95% of the accesses in the first group. Regrouping of the group I accesses was chosen, indicating the formation of 19 new groups, showing a large intragroup heterogeneity. 16 groups were formed by the hierarchical UPGMA method, with a cut at approximately 60% from the distance. The first three main components were able to explain 43.68% of the total variation; however, even with low explanation it was possible to observe agreement between the grouping techniques used. ACP was complemented with the projection of CP1, CP2 and CP4. There were no drastic changes, enabling a 7.85% increase in the explanation. The variables with the largest contribution, by the Singh method were plant height and plant canopy diameter; both related to plant size. Based on what was proposed by Julliffe, 14 descriptors were likely to be discarded. The analyses performed contributed for the generation of information regarding the variability present in the accesses tested with subsidies for further studies of the species assessed. / A coleta e caracterização de acessos de Capsicum chinense Jacq. é importante para constituição e recuperação de recursos genéticos da espécie. Contudo, é necessário conhecer o quanto esses materiais que constitui o recurso genético são divergentes para que possam ser utilizados em programas de melhoramento. No presente trabalho objetivou-se avaliar a divergência genética de 137 acessos da espécie Capsicum chinense Jacq. provenientes da região sudoeste do estado de Goiás, por meio de 25 descritores morfológicos do IPGRI e a quantificação por métodos colorimétricos, em absorbância/grama da capsaicina presente nos frutos. O experimento foi conduzido em casa de vegetação, na área experimental da UFG Campus Jataí. Utilizou-se o delineamento em blocos casualizados com 4 repetições, sendo cada parcela constituída por um vaso de 8 quilogramas de solo com uma planta. Na análise de variância, o peso de cem sementes foi significativo ao nível de 5%de significância e os demais caracteres avaliados significativo a 1% de significância. O mesmo ocorreu com o agrupamento das médias pelo teste de Scott-Knott a 5%, com a formação de mais de um grupo para todos os descritores, sendo os descritores massa de 10 frutos, comprimento médio dos frutos e comprimento do pedúnculo dos frutos, os que apresentaram um maior número de grupos. Na estatística multivariada, procedeu-se o agrupamento de otimização de Tocher para os 137 acessos, com a presença de 95% dos acessos no primeiro grupo. Optou-se pelo reagrupamento dos acessos do grupo I, indicando a formação de 19 novos grupos, o que mostrou grande heterogeneidade intragrupo. Pelo método hierárquico UPGMA houve a formação de 16 grupos com um corte a cerca de 60% da distância. Os três primeiros componentes principais conseguiram explicar 43,68% da variação total, no entanto, mesmo com baixa explicação foi possível observar concordâncias entre as técnicas de agrupamento utilizadas. Complementou-se a ACP com a projeção dos CP1, CP2 e CP4, não houve mudanças drásticas e possibilitou um aumento de 7,85% na explicação. Pelo método de Singh as variáveis que mais contribuíram para a variação total foram a altura das plantas e diâmetro do dossel, ambas relacionadas ao porte da planta. Com base no proposto por Jolliffe, 14 descritores foram considerados passíveis de descarte. As análises contribuíram com a geração de informações sobre a variabilidade existente nos acessos em estudo e de subsídios para futuros trabalhos com a espécie.

Soja (Glycine max (L.) Merrill) é uma das mais importantes oleaginosas no mundo e sua relevância pode ser também mensurada pela extensão da sua produção no Brasil, onde representa quase a metade do total da área plantada com grãos. A importância da soja está também associada à multiplicidade de utilização do grão, como por exemplo, na alimentação humana e animal, na indústria química e na geração de energia como biodiesel. A produtividade da soja tem sido frequentemente impactada devido ao ataque de pragas e doenças. Dentre as espécies de fitonematoides, o nematoide-das-lesões-radiculares (Pratylenchus brachyurus Godfrey), tem gerado significativas perdas econômicas aos produtores, variando entre 30 a 50%, dependendo da infestação da cultura. Este trabalho teve como objetivo identificar QTLs (Quantitative Trait Loci), a partir de um conjunto de fenótipos associados à resistência ao nematoide-das-lesões-radiculares utilizando a abordagem de mapeamento multivariado. Uma população de 174 indivíduos F2, obtidos a partir do cruzamento entre duas linhagens de soja FTPG06A e FTPG12X (com baixo fator de reprodução do nematoide), foi utilizada para a obtenção dos valores genéticos preditos (BLUPs - Best Linear Unbiased Predictions) de cinco características estudadas e também para a genotipagem com o SoySNP6k Bead Chip. As características avaliadas foram: fator de reprodução (FR), peso fresco (PA) e comprimento (CA) da parte aérea, peso fresco (PR) e comprimento (CR) da raiz. Um total de 1.240 marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) foram mapeados nos 20 grupos de ligação (GLs) da soja. O comprimento total do mapa foi de 3.084,46 centiMorgans (cM), com intervalo médio de 2,54 cM entre marcadores adjacentes. A identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci) para os caracteres fenotípicos foi realizada utilizando-se o mapeamento de intervalos múltiplos univariado (MIM) e multivariado (MT-MIM), com estimativa dos efeitos principais dos QTLs e análises de epistasia envolvendo pares de QTLs. Na abordagem MIM foram identificados três QTLs associados à variável CR, nos GLs (Grupos de Ligação) A2 e E (2 QTLs), explicando um total de 34,22% da variação fenotípica dessa variável para a população em estudo. Na abordagem MT-MIM, foram selecionados dois conjuntos de variáveis, de acordo com a correlação entre as mesmas. Três regiões genômicas foram reveladas, sendo estatisticamente significativas para as variáveis CR, FR e CA. A comparação dos seis QTLs identificados no presente estudo com o banco de dados de QTLs do Soybase forneceu evidências de que cinco QTLs, ainda não foram descritos na literatura. Uma busca por sequências candidatas em duas regiões de interesse, associadas à variável FR, foi realizada, com base na plataforma de dados genômicos PlantGDB. Várias sequências candidatas indicam relação com mecanismos importantes na resposta das plantas a estresses bióticos. Dessa forma, os resultados obtidos no presente estudo forneceram informações para auxiliar na melhor compreensão da arquitetura genética dos caracteres quantitativos analisados. / Soybean (Glycine max (L.) Merrill) is one of the most important oil crop worldwide and its relevance can also be measured by the extension of soybean grain production in Brazil, where it represents almost half of the total planting area with grains crops. Importance of soybean is also related to a multiplicity of usage of the grain, for example, in human consumption, animal feed, chemical industry and for energy generation as biofuel. Soybean yield has been frequently reduced by occurrence of pest and diseases. Among phytonematodes species, root lesion nematode (Pratylenchus brachyurus Godfrey) has caused significant economic losses to farmers, ranging from 30 to 50%, depending on crop infestation. This research aimed to identify QTLs (Quantitative Trait Loci), from a set of phenotypes associated with resistance to root lesion nematode, using the multivariate multiple interval mapping. A mapping population of 174 F2 plants derived from a by-parental cross between two soybean breeding lines FTPG06A and FTPG12X (with low nematode reproduction factor), was used for prediction of genetic values (BLUPs - Best Linear Unbiased Predictions) for five traits studied and also for genotyping with SoySNP6k Bead Chip. Traits evaluated were reproduction factor (FR), shoot weight (PA), shoot length (CA), root weight (PR) and root length (CR). A total of 1,240 SNP (Single Nucleotide Polymorphism) markers were mapped into 20 soybean linkage groups (LG). A total map length was 3,084.46 centiMorgans (cM) with an average of 2.54 cM between flanking markers. QTL mapping for those traits was performed using univariate (MIM) and multivariate (MT-MIM) multiple-interval mapping, with main QTL effects estimates and epistasis analysis between QTL pairs. MIM analysis identified three QTLs associated to CR trait at LG A2 and LG E (2 QTL), explaining 34,22% of phenotypic variation estimated for this mapping population. For MT-MIM analysis, two sets of traits were selected, according to the correlation among them. Three genomic regions statistically significant for CR, FR and CA traits were identified. Comparison between six identified QTL and QTL database at Soybase provided evidence that five QTL have not been published yet. Search for candidate sequences located in two regions associated with FR trait were further performed on the PlantGDB genomic data platform. Several candidate sequences indicate relationships with important plant response mechanisms to biotic stresses. Thus, results obtained in the present study provided information to improve knowledge of the genetic architecture of the analyzed quantitative traits.

A soja é a cultura agrícola brasileira que mais se expandiu nas últimas três décadas. Atualmente é uma commodity comercializada em larga escala na forma de grão, farelo e óleo. Por ser uma importante fonte de proteína, possui papel fundamental na indústria alimentícia, tanto humana quanto animal. O monocultivo em extensas áreas tem ocasionado o aumento da vulnerabilidade da cultura a patógenos e insetos-praga, com consequências relevantes na produção dos grãos. Dentre tais insetos-praga, os percevejos fitófagos representam um dos grupos de maior relevância para a cultura, pois podem comprometer o rendimento, a qualidade e a sanidade dos grãos. As perdas no rendimento da cultura devido ao ataque por percevejos são superiores a 30%, e o comprometimento no valor germinativo das sementes pode ser superior a 50%. Este trabalho teve como objetivo identificar QTLs (Quantitative Trait Loci), a partir de um conjunto de fenótipos associados à resistência aos percevejos e a caracteres agronômicos, utilizando a abordagem de mapeamento multivariado. Uma população de 228 indivíduos F2, obtida a partir do cruzamento entre as cultivares IAC-100 e CD-215, foi utilizada para a obtenção dos dados genotípicos. Os caracteres agronômicos avaliados na geração F2:3 foram: número de dias para o florescimento (NDF), altura da planta no florescimento (APF), número de dias para a maturidade (NDM), altura da planta na maturidade (APM), acamamento (AC), valor agronômico (VA) e produtividade de grãos (PG). Oito caracteres associados à resistência aos percevejos foram avaliados: período de granação (PEG), retenção foliar (RF), número de vagens por planta (NVP), índice percentual de dano nas vagens (IPDV), número de sementes (NS), peso de cem sementes (PCS), peso de sementes boas (PSB) e peso de sementes manchadas (PSM). O mapa genético obtido, representando os 20 grupos de ligação (GLs) da soja, foi constituído por 417 marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism), 61 SSR (Simple Sequence Repeat), 30 AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) e 8 marcadores TRAP (Target Region Amplification Polymorphism). A cobertura do genoma da soja foi de 2.814,82 centiMorgans (cM), com um intervalo médio de 5,46 cM entre marcadores adjacentes. A identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci) para os caracteres fenotípicos foi realizada utilizando-se o mapeamento de intervalos múltiplos univariado (MIM) e multivariado (MT-MIM), com estimativa dos efeitos principais dos QTLs. A abordagem MIM revelou um total de 60 QTLs, distribuídos por 13 GLs da soja, sendo 29 QTLs associados a caracteres de resistência aos percevejos e 31 QTLs relacionados a caracteres agronômicos. A percentagem da variação fenotípica explicada pelos QTLs (R2) variou de 14,27% para AC a 65,45% para NDM. Na abordagem MT-MIM, foram selecionados nove conjuntos de variáveis, de acordo com a correlação entre as mesmas. Foram reveladas 20 regiões genômicas distintas, com uma alta tendência de concentração de QTLs em posições similares. No geral, para a maioria das características, os valores marginais de R2 obtidos para os modelos MT-MIM foram superiores em relação aos modelos MIM, variando de 27,98% para APF a 65,30% para NDM. A abordagem MT-MIM permitiu a identificação de 13 novas posições genômicas, com efeito em pelo menos uma das variáveis analisadas, que não foram reveladas nos modelos MIM. Uma comparação com o banco de dados do Soybase forneceu evidências de que muitos QTLs, identificados nesta população em estudo, coincidem com QTLs descritos em outros backgrounds genéticos. No entanto, 56 QTLs identificados no presente estudo ainda não foram descritos na literatura. A maioria dos QTLs identificados explicam, individualmente, até 10% da variação fenotípica das características avaliadas. No entanto, QTLs presentes em oito novas regiões identificadas pela abordagem MT-MIM e oito novos QTLs identificados pela abordagem MIM contribuíram para explicar uma maior percentagem da variação dos fenótipos estudados. Esses QTLs devem ser melhor investigados considerando sua relevância para a seleção simultânea de características de interesse, permitindo uma maior eficiência de seleção e um maior ganho genético. Os resultados obtidos no presente estudo forneceram informações para auxiliar na melhor compreensão da arquitetura genética dos caracteres quantitativos analisados, bem como sobre a relação genética entre os mesmos. / Soybean is the Brazilian crop with the most expansion along the past three decades. Currently, it is a commodity commercialized in large scale as grain, bran and oil. Because it is an important source of protein, it plays a fundamental role in the food industry, both human and animal. Soybean monoculture in large areas has increased crop vulnerability to pathogens and insect pests, with significant consequences on grain production. Among such pest insects, stink bugs are considered a major pest of soybean crop, feeding directly on seeds, reducing yield and seed quality. Losses in crop yield due to stink bugs attack are greater than 30% and seed germination compromising can be greater than 50%. This study aimed to identify QTL (Quantitative Trait Loci), for stink bug resistance traits and agronomic traits using the multivariate multiple interval mapping. An F2 mapping population of 228 plants derived from a biparental cross between IAC-100 and CD-215 was used for genotyping. An F2:3 population was developed to evaluate eight stink bug resistant traits such as graining period, leaf retention, pod number per plant, percentage of pod damage, number of seeds, hundred seed weight, weight of healthy seeds and spotted seed weight. Other seven agronomic traits were evaluated such as number of days to flowering, plant height at flowering, number of days to maturity, plant height at maturity, lodging, agronomic value and grain yield. A total of 417 SNP (Single Nucleotide Polymorphism) markers, 61 SSR (Simple Sequence Repeat), 30 AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) and 8 TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) markers were mapped into 20 soybean linkage groups. The total map length was 2,814.82 cM with an average of 5.46 cM between markers. QTL mapping for those traits was performed using univariate (MIM) and multivariate (MT-MIM) multiple interval mapping, with main QTL effects estimates. MIM analysis identified a total of 60 QTL, through 13 soybean linkage groups, with 29 QTL related to stink bug resistant traits and 31 QTL related to agronomic traits. Phenotypic variation explained by QTL ranged from 14.27% for lodging to 65.45% for number of days to maturity. The traits were divided into nine groups for MT-MIM analysis considering their correlation coefficient. Twenty different genomic regions were identified showing a very high QTL clustering. For most of the traits phenotypic variation estimates for MT-MIM models were higher than MIM models, ranging from 27.98% to 65.30% for plant height at flowering and number of days to maturity, respectively. MT-MIM analysis showed 13 genomic regions controlling at least one of the evaluated traits which were not identified at MIM analysis. Comparison between identified QTL and QTL database at Soybase demonstrated that some QTL were similar to those described in different genetic background. However, 56 QTL detected in the present study were described for the first time in literature. Most of the QTL identified explain, individually, less than 10% of phenotypic variation. However, eight genomic regions identified with MT-MIM analysis and eight QTL identified with MIM analysis explain a great amount of phenotypic variation. These QTL should be investigated considering their importance for simultaneous selection for a high genetic gain. Results obtained in the present study provided information for a better understand of genetics architecture underlying quantitative traits studied and the genetic relation among them.

As análises biplot que utilizam os modelos de efeitos principais aditivos com inter- ação multiplicativa (AMMI) requerem matrizes de dados completas, mas, frequentemente os ensaios multiambientais apresentam dados faltantes. Nesta tese são propostas novas metodologias de imputação simples e múltipla que podem ser usadas para analisar da- dos desbalanceados em experimentos com interação genótipo por ambiente (G×E). A primeira, é uma nova extensão do método de validação cruzada por autovetor (Bro et al, 2008). A segunda, corresponde a um novo algoritmo não-paramétrico obtido por meio de modificações no método de imputação simples desenvolvido por Yan (2013). Também é incluído um estudo que considera sistemas de imputação recentemente relatados na literatura e os compara com o procedimento clássico recomendado para imputação em ensaios (G×E), ou seja, a combinação do algoritmo de Esperança-Maximização com os modelos AMMI ou EM-AMMI. Por último, são fornecidas generalizações da imputação simples descrita por Arciniegas-Alarcón et al. (2010) que mistura regressão com aproximação de posto inferior de uma matriz. Todas as metodologias têm como base a decomposição por valores singulares (DVS), portanto, são livres de pressuposições distribucionais ou estruturais. Para determinar o desempenho dos novos esquemas de imputação foram realizadas simulações baseadas em conjuntos de dados reais de diferentes espécies, com valores re- tirados aleatoriamente em diferentes porcentagens e a qualidade das imputações avaliada com distintas estatísticas. Concluiu-se que a DVS constitui uma ferramenta útil e flexível na construção de técnicas eficientes que contornem o problema de perda de informação em matrizes experimentais. / The biplot analysis using the additive main effects and multiplicative interaction models (AMMI) require complete data matrix, but often multi-environments trials have missing values. This thesis proposed new methods of single and multiple imputation that can be used to analyze unbalanced data in experiments with genotype by environment interaction (G×E). The first is a new extension of the cross-validation method by eigenvector (Bro et al., 2008). The second, corresponds to a new non-parametric algorithm obtained through modifications of the simple imputation method developed by Yan (2013). Also is included a study that considers imputation systems recently reported in the literature and compares them with the classic procedure recommended for imputation in trials (G×E), it means, the combination of the Expectation-Maximization (EM) algorithm with the additive main effects and multiplicative interaction (AMMI) model or EM-AMMI. Finally, are supplied generalizations of simple imputation described by Arciniegas-Alarcón et al. (2010) that combines regression with lower-rank approximation of a matrix. All methodologies are based on singular value decomposition (SVD), so, are free of any distributional or structural assumptions. In order to determine the performance of the new imputation schemes were performed simulations based on real data set of different species, with values deleted randomly at different percentages and the quality of the imputations was evaluated using different statistics. It was concluded that SVD provides a useful and flexible tool for the construction of efficient techniques that circumvent the problem of missing data in experimental matrices.

Orientador: Rinaldo Cesar de Paula / Resumo: RESUMO – O eucalipto é a cultura de maior destaque para o setor florestal brasileiro. No entanto, a expansão do setor para áreas com condições climáticas limitantes ao desenvolvimento da cultura e a instabilidade climática atual, são alguns dos fatores que têm comprometido o desenvolvimento desta cultura no país nos últimos anos. Assim, é importante a busca contínua por ferramentas que possibilitem a prognose de crescimento, a seleção de indivíduos e famílias e a análise do comportamento de genótipos de eucalipto frente às variações ambientais de forma cada vez mais acurada. Desta forma, o objetivo geral deste trabalho foi testar o desempenho das Redes Neurais Artificiais (RNA) na modelagem de crescimento de clones de eucalipto, na predição de valores genéticos de indivíduos e famílias, e na seleção quanto à produtividade, estabilidade e adaptabilidade de progênies de Eucalyptus sp. Para a prognose de crescimento foram utilizados dados de 18 clones comerciais de Eucalyptus em diferentes estados do Brasil, e para a estimação de valor genético e análise de produtividade, estabilidade e adaptabilidade foram utilizados dados de testes de progênies de Eucalyptus grandis. Neste trabalho foram testadas diferentes arquiteturas de RNA do tipo múltiplas camadas com o algoritmo de aprendizado de retropropagação do erro e função de ativação do tipo tangente hiperbólica. O modelo desenvolvido para prognose do diâmetro à altura do peito (DAP) de árvores individuais em um local foi capaz de... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: ABSTRACT – Eucalyptus is the most important crop of the most important for the Brazilian forest sector. However, the expansion of the sector to areas with climatic conditions limiting the development of the crop and current climate instability are some of the factors that have compromised the development of this culture in the country in recent years. Thus, it is important to continuously search for tools that allow the prognosis of growth, the selection of individuals and families and the analysis of the behavior of eucalyptus genotypes in the face of environmental changes in an increasingly accurate way. Thus, the general objective of this work was to test the performance of artificial neural networks (ANN) in the modeling of growth of eucalyptus clones, prediction of genetic values of individuals and families, and selection of productivity, stability and adaptability of progenies of Eucalyptus sp. For the prognosis of growth, data from 18 commercial Eucalyptus clones were used in different states of Brazil, and for genetic value estimation and productivity, stability and adaptability analysis data from Eucalyptus grandis progenies were used. In this work, different ANN architectures of the multilayer type were tested with the backpropagation error algorithm and hyperbolic tangent activation function. The model developed for prognosis of the diameter at breast height (DBH) individual trees in one place was able to maintain good accuracy when applied at other sites. The thre... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Potato is cultivated in subtropical, during spring and autumn, and temperate conditions, during summer, of the Southern area of Brazil. These different growing conditions affect tuber yield and processing quality. The objectives of this work were to select potato clones with high tuber yield and processing quality and adapted to subtropical and temperate growing conditions; and to develop a breeding strategy to early identify superior clones. We made crosses to develop and early select clones adapted to two growing seasons. Advanced clones were selected for adaptation to subtropical and temperate conditions of the Southern region of Brazil. Yield per hill, tuber appearance, chip color and dry matter and reduced sugar content were evaluated in all experiments. The experiments were a factorial (clones x seasons) in a complete random design, with two or three replications. The highest yield per hill was gotten during summer season of template conditions. Tuber appearance was not affected by season and site growing conditions. The unfavorable conditions of autumn resulted in dark chip color and high content of reduced sugars. Dry matter content varies among environments, but the lowest content was during autumn season. High genetic variability was gotten for all evaluated traits, which enable to select clones better than the check varieties. The first clonal selection should be done during summer season to identify potential clones adapted to subtropical and temperate conditions. Autumn growing conditions are not favorable to high yield and quality and increase dormancy period of the tubers, but this kind of environment is necessary to select clones adapted to two seasons. The clones SJSM01274-4, SJSM01212-2, SJSM00211-3, SJSM99159-8 and SJSM03478-37 have high yield and processing quality in both subtropical and temperate conditions of the Southern area of Brazil. / Na região Sul do Brasil, a batata é cultivada em condições subtropical, durante a primavera e outono, e temperada, durante o verão, que afetam a produtividade e a qualidade para processamento industrial. Os objetivos deste trabalho foram selecionar clones de batata com alta produtividade e qualidade para processamento e adaptados às condições subtropical e temperada de cultivo e desenvolver uma estratégia de melhoramento para a identificação precoce de clones superiores. Foram realizados cruzamentos e efetuada a seleção precoce de clones adaptados para dois cultivos anuais e clones avançados foram selecionados para ampla adaptação à condições subtropical e temperada de cultivo da região Sul do Brasil. A produtividade por cova, a aparência dos tubérculos, a cor de chips e os teores de massa seca e açúcares redutores foram avaliados nos diferentes experimentos. Os experimentos foram conduzidos em um fatorial (clones x épocas de cultivo) em blocos ao acaso, com duas ou três repetições. A produtividade por cova foi mais elevada no cultivo de verão, em condição temperada de cultivo. A aparência dos tubérculos foi similar entre as épocas e locais de cultivo. A cor de chips e o teor de açúcares redutores foram inferiores no cultivo de outono, pela condição menos favorável. O teor de massa seca foi variável entre os ambientes, com menores teores no cultivo de outono. Para todos os caracteres avaliados houve alta variabilidade genética, que possibilitou a seleção de clones superiores à melhor testemunha. A primeira geração de seleção realizada no cultivo de verão possibilita a identificação precoce de clones, com potencial de adaptação para as condições subtropical e temperada. As condições de cultivo de outono são menos favoráveis para a produtividade e qualidade e prolongam o período de dormência dos tubérculos, porém esse ambiente é necessário para a seleção de clones para dois cultivos anuais. Os clones SJSM01274-4, SJSM01212-2, SJSM00211-3, SJSM99159-8 e SJSM03478-37 reúnem, de forma equilibrada, os caracteres de produtividade e qualidade de processamento industrial para as condições subtropicais e temperadas de cultivo do Sul do Brasil.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Sowing date is one of the factors that most affect soybean (Glycine max (L.) Merrill) performance due to changes in climate variables to which the culture is very sensitive. This study evaluated the effect of three sowing dates on soybean genotypes yield and oil contents, in Uberlândia-MG. The experimental design was randomized blocks, with split plots, with three repetitions. The experimental units were attributed to sowing dates (31 October, 22 November, and 14 December 2006) and the split plots to the genotypes (Impacta, Guarani, Riqueza, Milionária, Xavante, UFU-6, UFU-7, UFU- 8, UFU-9, UFU-10, Conquista and Garantia). The randomized experimental unit (plot) was composed of the genotypes, also randomly. The split plot consisted of a 5-m row sown, with 4 m used for the evaluations. The parameters evaluated were: flower color, number of days for flowering (NDF), plant height at flowering (APF), plant height at maturation (APM), stand, leaf retention (RF), lodging (ACM), height of first pod insertion (AIPV), rust severity (SF), weight of 100 beans (PCG) and yield. The oil contents was evaluated only in genotypes Impacta, Guarani, Riqueza, Milionária, Xavante, Conquista and Garantia. The parameters evaluated were SF, PCG, oil contents, yield and oil yield. Sowing in December gave the lowest bean yield. The genotypes Milionária, UFU-6, UFU-7 and UFU-8 had the greatest yield. The cultivars Guarani, Milionária and Xavante, were the most promising genotypes for oil yield. CHAPTER 3: The performance of soybean (Glycine max (L.) Merrill) genotypes subjected to different sowing dates can have great changes due to the major effect of climatic conditions on the culture. This study evaluated the agricultural performance of different soybean genotypes in three sowing dates, in Uberlândia-MG. The experimental design was randomized blocks, with split plots, with three repetitions. The experimental units were attributed to sowing dates (31 October, 22 November, and 14 December 2006) and the split plots to the genotypes (Impacta, Guarani, Riqueza, Milionária, Xavante, UFU6, UFU-7, UFU-8, UFU-9, UFU-10, Conquista and Garantia). The randomized experimental unit (plot) was composed of the genotypes, also randomly. The split plot consisted of a 5-m row sown, with 4 m used for the evaluations. The parameters evaluated were: flower color, number of days for flowering (NDF), plant height at flowering (APF), plant height at maturation (APM), stand, leaf retention (RF), lodging (ACM), height of first pod insertion (AIPV), rust severity (SF), weight of 100 beans (PCG) and yield. Sowing in December gave the lowest bean yield. The genotypes Milionária, UFU-6, UFU-7 and UFU-8 had the greatest yield. CHAPTER 4: The performance of soybean (Glycine max (L.) Merrill) genotypes subjected to different sowing dates can have great changes due to the major effect of climatic conditions on the culture. This study evaluated the effect of three sowing dates on the oil contents of different soybean genotypes, in Uberlândia-MG. The experimental design was randomized blocks, with split plots, with three repetitions. The experimental units were attributed to sowing dates (31 October, 22 November, and 14 December 2006) and the split plots to the genotypes (Impacta, Guarani, Riqueza, Milionária, Xavante, UFU-6, UFU-7, UFU-8, UFU-9, UFU-10, Conquista and Garantia). The randomized experimental unit (plot) was composed of the genotypes, also randomly. The split plot consisted of a 5-m row sown, with 4 m used for the evaluations. Theparameters evaluated were: rust severity (SF), weight of 100 beans (PCG) oil contents, yield and oil yield. Sowing in December gave the lowest oil yield. The cultivars Guarani, Milionária and Xavante, were the most promising genotypes for acceptable oil yield per area. / A época de semeadura é um dos fatores que mais influencia no desempenho da soja (Glycine max (L.) Merrill), em função de alterações nas variáveis climáticas das quais a cultura é sensível. Objetivou-se estudar o efeito de três épocas de semeadura na produtividade e no teor de óleo para genótipos de soja, nas condições de Uberlândia- MG. O delineamento foi o de blocos casualizados, em esquema de parcela subdividida, com três repetições. As parcelas foram atribuídas às épocas de semeadura (31/10, 22/11 e 14/12/06) e as subparcelas aos genótipos (Impacta, Guarani, Riqueza, Milionária, Xavante, UFU-6, UFU-7, UFU-8, UFU-9, UFU- 10, Conquista e Garantia). A unidade experimental (parcela) casualizada foi composta pelos genótipos dispostos também de forma casualizada. A subparcela foi constituída por uma fileira de semeadura de 5 m, aproveitando-se os 4 m centrais. Foram avaliados: cor de flor, número de dias para floração (NDF), altura da planta na floração (APF), altura da planta na maturação (APM), stand , retenção foliar (RF), acamamento (ACM), altura de inserção da primeira vagem (AIPV), severidade de ferrugem (SF), peso de 100 grãos (PCG) e produtividade. Quanto ao teor de óleo, foram considerados somente os genótipos Impacta, Guarani, Riqueza, Milionária, Xavante, Conquista e Garantia. Nestes, avaliou-se SF, PCG, teor de óleo, produtividade e produtividade de óleo. Constatou-se que a semeadura realizada em dezembro, foi a que proporcionou menor rendimento de grãos. Os genótipos Milionária, UFU-6, UFU- 7, UFU-8, resultaram nas maiores produtividades. As variedades Guarani, Milionária e Xavante, apresentaram-se como os genótipos mais promissores para o rendimento de óleo. CAPITULO 3: O comportamento de genótipos de soja (Glycine max (L.) Merrill) submetidos à diferentes épocas de semeadura pode sofrer grandes alterações, devido a grande influência das condições climáticas sobre a cultura. Objetivou-se com este trabalho verificar o comportamento agronômico de diferentes genótipos de soja em três épocas de semeadura, nas condições de Uberlândia-MG. O delineamento foi o de blocos casualizados, em esquema de parcela subdividida, com três repetições. As parcelas foram atribuídas às épocas de semeadura (31/10, 22/11 e 14/12/06) e as subparcelas aos genótipos (Impacta, Guarani, Riqueza, Milionária, Xavante, UFU-6, UFU-7, UFU-8, UFU-9, UFU-10, Conquista e Garantia). A unidade experimental (parcela) foi composta pelos genótipos. A subparcela foi constituída por uma fileira de semeadura de 5 m, aproveitando-se os 4 m centrais. Foram avaliados: número de dias para floração (NDF), altura da planta na floração (APF), altura da planta na maturação (APM), stand , retenção foliar (RF), acamamento (ACM), altura de inserção da primeira vagem (AIPV), severidade de ferrugem (SF), peso de 100 grãos (PCG) e produtividade. Verificou-se que a semeadura realizada em dezembro foi a que proporcionou menor produtividade de grãos. Os genótipos Milionária, UFU-6, UFU-7, UFU-8, resultaram nas maiores produtividades. CAPITULO 4: A época de semeadura é um dos fatores que mais influencia no desempenho da soja (Glycine max (L.) Merrill), em função das alterações das variáveis climáticas das quais a cultura é sensível. Este trabalho teve o objetivo de estudar o efeito de três épocas de semeadura no teor de óleo para genótipos de soja, nas condições de Uberlândia-MG. O delineamento foi o de blocos casualizados, em esquema de parcela subdividida, com três repetições. As parcelas foram atribuídas às épocas de semeadura (31/10, 22/11 e 14/12/06) e as subparcelas aos genótipos (Impacta, Guarani, Riqueza, Milionária, Xavante, Conquista e Garantia). A unidade experimental (parcela) foi composta pelos genótipos. A subparcela foi constituída por uma linha de semeadura de 5 m, aproveitando-se os 4 m centrais. Foram avaliados: severidade de ferrugem (SF), peso de 100 grãos (PCG), teor de óleo, produtividade e produtividade de óleo. A semeadura realizada nos mês de dezembro proporcionou um menor rendimento do teor de óleo. As variedades Guarani, Milionária e Xavante apresentaram-se como as mais promissoras para a obtenção satisfatória da quantidade de óleo por área. / Mestre em Agronomia