O cultivo de anteras de soja [Glycine max (L.) Merrill, 2n=40] iniciou na década de 1970 visando à obtenção de plantas androgenéticas haplóides e duplo-haplóides. Contudo, foram raras as ocasiões em que as condições de cultivo favoreceram o desenvolvimento embriogênico até a regeneração de plantas. No presente trabalho, pelo cultivo de anteras heterozigotas para um marcador molecular codominante, foi registrado que alguns genótipos segregantes originaram estruturas embriogênicas tanto a partir dos micrósporos quanto a partir dos tecidos diplóides da antera. Subseqüentemente, por meio de análises histológicas, foram registradas calogênese e embriogênese a partir do tecido conectivo, das camadas médias e da epiderme em anteras de quatro cultivares, sob as condições de cultivo até então recomendadas para desencadear androgênese. Estes eventos foram favorecidos pela presença do ácido 2,4-diclorofenoxiacético (2,4-D) e pela indução na luz. A constatação do potencial embriogênico do conectivo levantou a possibilidade de usar tecidos estaminais como uma nova fonte de explantes, a partir de indivíduos que já alcançaram a fase reprodutiva, quando a resposta morfogênica é considerada sem sucesso em soja. A formação de grãos de pólen multinucleados não foi uma resposta exclusiva ao cultivo: tanto o cultivo de anteras quanto o tratamento a 4oC aumentaram as freqüências de núcleos simétricos e extranumerários em grãos de pólen, incluindo núcleos com formato fragmentado. De forma geral, os resultados comprovaram que, nas condições recomendadas, o cultivo de anteras é um sistema limitado para desencadear androgênese em soja. Por isso, uma seqüência de testes foi conduzida para o estabelecimento in vitro de micrósporos isolados. Foi desenvolvida uma técnica de isolamento que permitiu a obtenção de suspensões de micrósporos viáveis com densidade adequada e, em seguida, o estabelecimento de cultivos. Nestes cultivos, foram testados os efeitos de meios nutritivos e de genótipos. A técnica desenvolvida será útil para futuros testes visando identificar fatores que desencadeiam androgênese em soja. Neste trabalho, foram identificadas limitações e potencialidades morfogênicas do cultivo de anteras de soja. Em conseqüência, é proposta uma nova abordagem ao estudo da androgênese, pelo cultivo de micrósporos e grãos de pólen isolados. / Soybean [Glycine max (L.) Merrill, 2n=40] anther culture began in the 1970’s in order to obtain haploids and double-haploids androgenic plants. However, only in rare occasions, culture conditions allowed embryogenic development to proceed as far as plant regeneration. In the present study, culturing heterozygous anthers to a codominant molecular marker, it was recorded that some segregating genotypes originated embryo-like structures from either microspores or anther diploid tissues. Subsequently, through histological analysis, it was recorded callogenesis and somatic embryogenesis from the connective, middle layer and epidermis in cultured anthers of four soybean cultivars, under culture conditions known to trigger an androgenic response. Morphogenic responses from anther walls and connective tissue was favoured by 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D) and induction under light. Embryogenic potential of the connective tissue provided the possibility of using staminal tissue as a new source of explants, from individuals that have reached the reproductive phase, when the morphogenic response has been considered unsuccessful in soybean. Multinucleate pollen grains formation was not an exclusive response to culture: both anther culture and 4oC treatment increased symmetrical and extra nuclei frequencies in pollen grains, including atypical extra nuclei with a fragmented shape. On the whole, results indicated that, under recommended conditions, anther culture is a limited system to trigger androgenesis in soybean. Thus, a sequence of tests was carried out aiming to establish isolated microspores in vitro. It was developed a technique that allowed to obtain viable microspores suspensions at appropriate density and, subsequently, to establish cultures. The effects of medium constitution and genotypes were tested. This technique may be useful for further studies aiming to identify factors that are important to stimulate soybean androgenesis. In this study, morphogenic limitations and potentialities of soybean anther culture were identified. In consequence, it is proposed a new approach to study androgenesis, through the culture of isolated microspores and pollen grains.

A pecuária leiteira brasileira caracteriza-se por grande heterogeneidade dos sistemas produtivos e pluralidades de fatores que constituem barreiras para o seu desenvolvimento. A região sul se destaca por possuir maior eficiência produtiva entre as regiões do país. Assim, o entendimento dos diferentes fatores que explicam esta produção torna-se importante para maximizar ainda mais esta produção e propor alternativas para o seu incremento. Objetivou-se discriminar a produção leiteira pelos fatores produtivos e ambientais; avaliar o impacto do uso da inseminação artificial; e determinar valores econômicos para características produtivas, funcionais e de fertilidade, em rebanhos leiteiros das regiões político administrativas dos Estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina. Para isso foram utilizadas análises univariada e multivariada e, também, modelos bioeconômicos. As análises evidenciaram distinções entre as regiões político administrativas do Rio Grande do Sul e Santa Catarina. As variáveis produtivas (quantidade de leite, produtividade e vacas ordenhadas) e ambientais (manejo agropecuário com rotação de pastagem) foram as mais importantes na discriminação entre os clusters de regiões político administrativas. Os sistemas produtivos da Mesorregião Noroeste Rio-grandense são classificados como especializados e intensivos, e a sua produção está associada com o uso da inseminação artificial. Os valores econômicos para as características produtivas, funcionais e de fertilidade, podem ser usados na seleção para maior lucro pelos produtores de bovinos leiteiros, da Microrregião de Passo Fundo. / The Brazilian dairy production is characterized by great heterogeneity of production systems and pluralities of factors that are barriers to its development. The southern region stands out for having greater productive efficiency among regions of the country. Thus, understanding the different factors that explain this production become important to further maximize this production and propose alternatives to its increase. This study aimed to discriminate milk production by productive and environmental factors, assess the impact of the use of artificial insemination, and determine economic values for productive, functional and fertility traits in dairy herds of administrative political regions in the states of Rio Grande do Sul and Santa Catarina. For this, univariate and multivariate analysis, and also bioeconomic models were used. The analyzes showed distinctions between the political-administrative regions of Rio Grande do Sul and Santa Catarina. The productive (amount of milk, productivity and milked cows) and environmental (agricultural management with pasture rotation) factors were those that best explained the differences between clusters of political-administrative regions. The productive systems of Mesoregion Northwestern Rio-grandense are classified as specialized and intensive, and its production is associated with the use of artificial insemination. Economic values for production and functional fertility traits can be used in selection for higher profits by dairy cattle producers, in the Microregion of Passo Fundo.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2013-07-16T01:18:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 225447.pdf: 1924169 bytes, checksum: ac3ec7ab64c86f8a12faefe9644bca54 (MD5)

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2012-10-21T01:31:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / O presente trabalho objetiva a construção de um mapa genético baseado numa população de mapeamento composta de 93 indivíduos F2, resultantes do cruzamento interespecífico entre a linhagem CNPH-679 (C. chinense), resistente à doença virótica "tomato spotted wild virus" (TSWV), e a linhagem suscetível AG-672 (C. annuum). Dos 229 pares de iniciadores microssatélites que foram utilizados para genotipar os genitores, 160 (69,9%) revelaram polimorfismo, 51 (22,3%) revelaram monomorfismo e 18 (7,8%) amplificaram apenas em C. annuum. Dentre os marcadores polimórficos, 127 foram empregados para genotipar a população de mapeamento, sendo que destes, 97 puderam ser interpretados. Estes marcadores foram submetidos ao teste do X2, demonstrando que 88,7% dos marcadores apresentaram distorção de segregação em relação à proporção Mendeliana esperada 1:2:1 (p<0,01). Apesar da elevada distorção de segregação, os 97 marcadores foram utilizados na construção do mapa genético, dos quais 89 foram ordenados em seis grupos de ligação. O comprimento total do mapa obtido foi de 220,6 cM, correspondendo a apenas 9,73% a 14,73% do comprimento total estimado para o genoma de Capsicum. O baixo comprimento total do presente mapa é resultado, em parte, do elevado número de marcadores microssatélites (46) que agruparam em pontos específicos, geralmente intermediários, dos grupos de ligação. Quando considerados apenas os alelos amplificados, na população de mapeamento, pelos marcadores que foram localizados em pontos diferentes dos grupos de ligação, o teste do X2 desvendou um desvio de segregação em favor do genitor C. chinense, sendo que, 56% dos alelos amplificados foram doados por este (p<0,01). A análise individual destes marcadores revelou que pelo menos oito regiões genômicas estão associadas com a distorção de segregação e a direção dos desvios de segregação é variável de acordo com a região analisada. Três destas regiões são afetadas pela seleção gamética, sendo duas em favor do alelo C. chinense e uma em favor do alelo C. annuum. As cinco regiões restantes foram influenciadas pela seleção zigótica, três delas favoráveis aos indivíduos heterozigotos, uma favorável aos indivíduos com genótipo C. annuum e uma favorável aos indivíduos com os genótipos C. chinense e heterozigoto, simultaneamente. Com o estudo observou-se ainda uma evidência significativa de ligação entre o marcador microssatélite CA50 e o loco Tsw, que confere resistência ao vírus TSWV, com distância genética estimada em 18 cM.

Made available in DSpace on 2016-03-07T19:20:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-31. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:23:57Z : No. of bitstreams: 1 000858103.pdf: 6986071 bytes, checksum: 61cc82fb4f22cd71ec70c868dc8f37e5 (MD5) / Objetivou-se com este estudo realizar associação genômica ampla, visando detectar regiões cromossômicas associadas a características indicadoras de precocidade sexual de bovinos da raça Nelore, bem como avaliar metodologias para a predição de valores genômicos visando à seleção destas características. Foram utilizados dados de animais da raça Nelore, pertencentes a fazendas que integram os programas de melhoramento genético da DeltaGen® e Paint® (CRV Lagoa). As características associadas à precocidade sexual utilizadas neste estudo foram a idade ao primeiro parto (IPP), a ocorrência de prenhez precoce de novilhas (P16) e o perímetro escrotal (PE). Após o controle de qualidade e consistência dos dados fenotípicos, permaneceram para as análises informações de 68.170, 72.675 e 83.911 animais com fenótipo e de 1.738, 1.770 e 1.680 animais genotipados para IPP, P16 e PE, respectivamente, e 412.993 SNPs. No Capítulo 2, as estimativas dos efeitos dos SNPs foram obtidas utilizando-se a metodologia single-step (WssGBLUP). Todos os animais foram utilizados aplicando-se modelo animal unicaracterística para predizer os valores genéticos e, posteriormente, as soluções dos efeitos dos SNPs foram obtidas a partir destes valores genéticos. Foram identificadas as 10 janelas de 150 SNPs que capturaram a maior proporção da variância explicada pelos marcadores. As 10 janelas de maior efeito obtidas para a P16 estão localizadas nos cromossomos 5, 6, 7, 14, 18, 21 e 27 e somadas explicaram 7,91% da variância genética total. Para o PE, estas janelas estão nos cromossomos 4, 8, 11, 13, 14, 19, 22 e 23, explicando 6,78% da variância total. Com as análises de GWAS foi possível identificar regiões cromossômicas associadas com P16 e PE. A identificação dessas regiões possibilita o melhor entendimento e avaliação destas características, além de indicar genes candidatos para estudos futuros de investigação de... / The objective of this study was to perform genome-wide association to detect chromosomal regions associated with indicator traits of sexual precocity of Nellore cattle, and evaluating methodologies for prediction of genomic values to use for selection of these traits. Data from Nellore animals belonging to farms integrating animal breeding programs of DeltaGen® and Paint® (CRV Lagoa), were used. Age at first calving (AFC), the occurrence of early pregnancy of heifers (EP) and scrotal circumference (SC) were used as traits associated with sexual precocity. After quality control and consistency of phenotypic data, information of 68,170; 72,675 and 83,911 animals with phenotype, and of 1,738; 1,770 and 1,680 genotypes for AFC, EP and SC, respectively, and 412,993 SNPs, remained for analysis. In chapter 2, the estimates of the SNP effects were obtained using the single-step method (WssGBLUP). All animals were used applying single trait animal model to predict the genetic values and, subsequently, the solutions of the SNP effects were obtained from these genetic values. The 10 windows of 150 SNPs that captured the greatest proportion of variance explained by markers were identified. The 10 windows with greater effect obtained for EP are located on chromosomes 5, 6, 7, 14, 18, 21 and 27 and together explained 7.91% of the total genetic variance. For SC, these windows are on chromosomes 4, 8, 11, 13, 14, 19, 22 and 23, explaining 6.78% of the total variance. With GWAS analysis it was possible to identify chromosomal regions associated with EP and SC. Identifying these regions enables better understanding and evaluation of these traits, besides indicating candidate genes for future research studies of causal mutations. In Chapter 3, two multi-step methods were used to estimate the marker effects - GBLUP and IBLASSO; besides the single-step method (ssGBLUP). Observed phenotype was used as the dependent variable to estimate the genomic value ...

Made available in DSpace on 2016-03-07T19:20:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-29. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:24:25Z : No. of bitstreams: 1 000858097.pdf: 325868 bytes, checksum: b5d70c189e8328bfce207cd5135d7627 (MD5) / Para o capítulo 2 o objetivo do trabalho foram avaliar a qualidade das predições de mérito genético entre os métodos BLUP e GBLUP na presença de imprecisão nos dados. Para o capítulo 3 o objetivo do trabalho foi comparar os métodos BLUP, GBLUP e BAYESR considerando ou não a interação genótipoambiente em ovinos multirraciais. Os dados utilizados para a realização do capítulo 2 foram simulados com três níveis de imprecisão nos dados fenotípicos, 0%, 25% e 50% em três características com magnitude de herdabilidade de 0,02, 0,15 e 0,30, respectivamente, as metodologias BLUP e GBLUP foram aplicadas nesse dados e seus desempenhos foram comparados. Para a comparação das metodologias os parâmetros de erro quadrático médio, variância do erro de predição, viés, acurácia e eficiência de seleção foram utilizados. Melhores resultados foram obtidos pelo método BLUP em relação ao método GBLUP. O método GBLUP não apresentou vantagem em relação ao método BLUP, exceto quando a magnitude da herdabilidade foi de 0,02 e não houve imprecisão nos dados fenotípicos. Para o capítulo 3 foram utilizados 4.288 fenótipos e genótipos de dois rebanhos núcleos de informação (Information Nucleus Flock) oriundos do Australian Sheep Cooperative Research Center program (CRC). Para acessar a acurácia das estimativas, foi utilizada a validação cruzada. Os métodos BLUP, GBLUP e BAYESR, foram utilizados para estimar os valores genéticos sob dois modelos, univariado, o qual não considera a interação genótipo-ambiente e o modelo bivariado com o efeito da interação é considerado. As acurácias dos modelos univariados variaram de 0,17 à 0,27 para o ambiente 1 e de 0,19 à 0,20 para o ambiente 2. As acurácias dos modelos bivariados variam de 0,14 à 0,23 para o ambiente 1 e para o ambiente 2 as acurácias foram de 0,19. Não houve benefício da aplicação da seleção genômica sobre o método BLUP no ambiente 2 para... / In Chapter 2 the objective of the work was to evaluate the quality of the genetic merit of predictions between BLUP and GBLUP methods in the presence of uncertainty in the data. In chapter 3 the objective was to compare the BLUP methods, GBLUP and BAYESR considering whether or not to genotypeenvironment interaction in multi-racial sheep. The data used for the realization of Chapter 2 were simulated with three levels of inaccuracy in phenotypic data, 0%, 25% and 50% in three features with magnitude of heritability of 0.02, 0.15 and 0.30, respectively, the BLUP and GBLUP methodologies were applied this data and their performances were compared. To compare the methodologies the mean square error parameters, prediction error variance, bias, accuracy and selection efficiency were used. Better results were obtained by BLUP method over the GBLUP method. The GBLUP method showed no advantage over the BLUP method, except when the magnitude of heritability was 0.02 and there was no inaccuracy in phenotypic data. For chapter 3 we were used 4,288 phenotypes and genotypes dual-core herds of information (Information Nucleus Flock) coming from the Australian Sheep Cooperative Research Center program (CRC). To access the accuracy of the estimates, cross-validation was used. Methods BLUP, GBLUP and BAYESR, were used to estimate breeding values under two models, univariate, which does not consider the genotype-environment interaction and the bivariate model with the interaction effect is considered. The accuracies of the univariate models ranged from 0.17 to 0.27 for the environment 1 and 0.19 to 0.20 for the environment 2. The accuracies of bivariate models ranging from 0.14 to 0.23 for the environment 1 to the environment and the accuracies were 0.19. There was no benefit from the application of genomic selection on BLUP method in environment 2 for gastrointestinal resistance feature. On the other hand, for the application of 1 atmosphere genomic ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-06-30Bitstream added on 2014-06-13T19:32:30Z : No. of bitstreams: 1 guerra_dm_me_botib.pdf: 2345678 bytes, checksum: 3a29cbd28a1d454f240afad94975996e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A compreensão dos mecanismos moleculares controladores do desenvolvimento, função e regressão do CL bovino é necessária para o aprimoramento da manipulação hormonal ovariana. Fortes evidências sugerem o envolvimento de fatores de crescimento fibroblástico (FGFs) na regulação do crescimento e regressão do CL. “Splicing” alternativo de 4 genes formam sete subtipos de FGFRs com afinidade variável por diferentes FGFs. Os membros da subfamília do FGF8 (FGF8, 17 e 18) ativam eficientemente o FGFR3C e 4 e podem atuar em cooperação nos tecidos que expressão estes receptores. O objetivo deste trabalho foi determinar o padrão de expressão dos FGFRs e dos membros da subfamília do FGF8 no CL bovino (CL). Os CLs foram obtidos de ovários de abatedouro e classificados em 4 estádios de desenvolvimento (estádio/1= corpo hemorrágico, estádio/2= CL em desenvolvimento, estádio/3= CL maduro/início da luteólise funcional e estádio/4= luteólise estrutural). O RNAm foi mensurado por PCR semiquantitativo e a proteína localizada por imunohistoquímica. A expressão do RNAm codificante das isoformas ‘B’ e ‘C’ de FGFR1 e FGFR2 foi detectada no CL bovino por PCR associado à eletroforese e foi acompanhada pela localização da proteína nas pequenas e grandes células luteínicas. A expressão do RNAm do FGFR1C e 2C não variou durante o desenvolvimento luteínico, distintamente a expressão do FGFR1B aumentou no estádio 3. Embora os FGFRs 3B, 3C e 4 tenham sido detectados de forma inconsistente por PCR associado à eletroforese, o RNAm do FGFR3C e FGFR4 foram detectados por PCR em tempo real em todos os estádios do desenvolvimento luteínico. O RNAm do FGF18 foi detectado por PCR em tempo real em todos os estádios do desenvolvimento luteínico e sua abundancia do RNAm do FGF18 foi maior no estádio 3 comparado com os estádios 1, 2 e 4. Em contraste, os RNAm do FGF8 e 17... / The molecular mechanisms controlling the development, function and regression of the bovine corpus luteum are necessary for the improvement of reproductive biotechnologies. Strong evidence suggests the involvement of fibroblast growth factors (FGFs) in the regulation of growth, and regression of the corpus luteum (CL). Alternative splicing of 4 genes give rise to seven subtypes of FGFRs with varying affinity for different FGFs. FGF8 subfamily members (FGF8, 17 and 18) efficiently activate FGFR3C and FGFR4 and may act in cooperation in tissues expressing these receptors. The objective of the present study was to determine the pattern of expression of FGF8 subfamily members and FGFRs in the bovine CL. Bovine CLs were obtained from abattoir ovaries and classed into four stages of development (stage 1= corpus hemorragicum, stage 2= developing CL, stage 3= mature/early functional luteolysis CL, and stage 4= structural luteolysis). Expression of mRNA was measured by semiquantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) followed by gel analysis (FGFR1-4) and real time RT-PCR (FGF8 subfamily members, FGFR3C and FGFR4) and proteins were localized by immunohistochemistry. Expression of mRNA encoding ‘B’ and ‘C’ spliced forms of FGFR1 and FGFR2 was readily detected in the bovine CL and was accompanied by isoform non-specific protein localization. FGFR1C and FGFR2C mRNA expression did not vary throughout CL lifespan, whereas FGFR1B was upregulated in the mature CL (stage III). FGFR3B, FGFR3C and FGFR4 expression was inconsistent in the bovine CL as assessed by PCR associated with gel analysis. FGF18, FGFR3C and FGFR4 mRNA was detected by real time PCR in all four developmental stages, and FGF18 mRNA abundance was higher in stage 3 (2.89  0.05; mean ± SEM) compared with stages 1 (0.3  0.27), 2 (0.56  1.27) and 4 (0.99  0.32). The m RNA expression ... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-12-17Bitstream added on 2014-06-13T20:53:58Z : No. of bitstreams: 1 martin_lc_me_botib.pdf: 1513851 bytes, checksum: b337e010131dce6a4e203f7b96730b8f (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Estresses abióticos, como a seca, podem reduzir significativamente os rendimentos no cultivo de espécies comercialmente importantes, tais como o eucalipto na produção de celulose e papel. Quando submetidas às condições de déficit hídrico, as plantas desenvolvem alguns mecanismos de defesa. As betaínas participam destes mecanismos, sendo seu soluto mais comum a glicina betaína. Esta é uma amina quaternária distribuída extensamente em diversas espécies de plantas superiores, sintetizada em elevadas taxas, tendo como função, manter a turgescência celular. A identificação e estudo de genes relacionados à tolerância à seca são importantes para os programas de melhoramento florestal. Este estudo teve por objetivo identificar SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) no gene colina monooxigenase relacionado ao metabolismo da glicina betaína em Eucalyptus. A sequência do gene em estudo foi encontrada em genomas de plantas modelos através do banco de dados GenBank, sendo as mesmas, utilizadas para a procura de similaridades no banco de dados de ESTs de eucalipto FORESTs – FAPESP. Após a constatação de homologia no banco de dados de eucalipto, foram confeccionados oito pares de “primers” para flanquear essas regiões, sendo estes, avaliados, amplificando fragmentos únicos. Depois de realizado o seqüenciamento do gene colina monooxigenase, foi utilizado a ferramenta BLAST no GenBank, confirmando com sucesso a identidade da sequência. Em seguida, as sequências foram alinhadas e os SNPs encontrados. No total, foram identificados 49 SNPs, sendo 12 em regiões codificantes e 37 em regiões UTRs e íntrons. Somente os SNPs localizados nas regiões codificantes foram utilizados neste trabalho, sendo 83,3% deles possuindo mutações sinônimas e 16,7% não-sinônimas. Em seguida, foi utilizada uma população mais abrangente composta de E. grandis... / Abiotic stress, such as drought, can reduce significantly the yield in the important commercially species crop, such as the eucalyptus in the cellulose and paper. When submitted to the water stress conditions, the plants develop some defense mechanisms. The betaines are part of these mechanisms , being their solute more common to the glycine betaine. This is a quaternary amine extensively distributed in several species of higher plants synthesized in high taxes with the function of maintaining the cellular turgescence. Identifying and studying the genes related to the drought tolerance are important for the forest improvement programs. This work aimed at identifying SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) in choline monooxygenase related to the glycine betaine in Eucalyptus. The gene sequence was found in model plants genomes through the databank GenBank, being used for searching similarities in the databank ESTs of eucalyptus FORESTs – FAPESP. After noticing homology in the eucalyptus databank, eight pairs of primers were made to amplify these regions, being evaluated, amplifying unique fragments. After the choline monooxygenase sequencing was performed, it was used the BLAST in the GenBank, confirming successfully the sequence identity. Then, the sequences were aligned and the SNPs were found. In the total, 49 SNPs were identified, being 12 in coding regions and 37 in UTRs and intron regions. Only the SNPs located in coding regions were used in this work, being 83.3% of the SNPs with synonymous mutation and 16.7% non-synonymous. Following, it was used a wider population made up of de E. grandis, E. Urophylla and the hybrid “Urograndis” to perform the SNPs genotyping, establishing the formation of 18 haplotypes and 16 possible haplotypical combinations which revealed that some genotypes were exclusive for the species E. grandis and E. urophylla. With the objective of decreasing costs... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-07-27Bitstream added on 2014-06-13T19:54:01Z : No. of bitstreams: 1 irano_n_me_jabo.pdf: 187304 bytes, checksum: 9f2cf22f2fa39eab86ecdfc75843adfe (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Objetivou-se com este trabalho estimar parâmetros genéticos para produção de leite, habilidade de permanência da vaca no rebanho e ocorrência de mastite clínica de vacas da raça Holandesa, bem como estudar as associações genéticas entre elas, com intuito de fornecer subsídios para a avaliação genética destas características. Foram analisados dados de 5.090 vacas da raça Holandesa que pariram no período de 1991 a 2010, pertencentes à Agropecuária Agrindus S.A.. Foram feitas duas análises multicaracterísticas, uma contendo as características produção de leite acumulada até 305 dias na primeira lactação (PL1), habilidade de permanência das vacas no rebanho (HP) até a terceira lactação e ocorrência de mastite clínica (OM) e, a outra, produção de leite acumulada até 305 dias (P305), HP e OM, ambas sob modelos animal e considerando as três primeiras lactações como medidas repetidas para P305 e OM. Os componentes de covariância foram obtidos por abordagem Bayesiana, utilizando o programa THRGIBBS1F90. As estimativas de herdabilidade, obtidas pela análise multicaracterísticas com a PL1, foram de 0,19; 0,28 e 0,13 para a PL1, HP e OM, respectivamente, enquanto que, na análise multicaracterísticas com a P305, as estimativas foram de 0,19; 0,31 e 0,14, respectivamente. As correlações genéticas foram de 0,38 entre PL1 e HP, 0,12 entre PL1 e OM e -0,49 entre HP e OM, em análise multicaracterísticas com a PL1 e, de 0,66 entre P305 e HP, -0,25 entre P305 e OM e - 0,52 entre HP e OM, em análise multicaracterísticas com a P305 / The objective of this study was to estimate genetic parameters for milk yield, stayability and the occurrence of clinical mastitis in Holstein cows, as well as studying the genetic relationship between them, in order to provide subsidies for the genetic evaluation these traits. Records from 5,090 Holstein cows with calving varying from 1991 to 2010, belonging to the Agropecuária Agrindus S.A. Two standard multivariate analyses were carried out, one containing the trait of accumulated 305 day milk yields in first lactation (MY1), stayability (SA) to the third lactation and clinical mastitis (CM) and the other, accumulated 305 day milk yields (MY), SA and CM, considering the first three lactations as repeated measures for MY and CM. The covariance components were obtained by Bayesian approach using the program THRGIBBS1F90. The heritability estimates obtained by multivariate analysis with MY1, were 0.19, 0.28 and 0.13 for MY1, SA and CM, respectively, whereas the multivariate analysis with the MY, the estimates were 0.19, 0.31 and 0.14, respectively. The genetic correlations between MY1 and SA, MY1 and CM, SA and CM, respectively, were 0.38, 0.12, and -0.49. The genetic correlations between MY and SA, MY and CM, SA and CM, respectively, were 0.66, -0.25, and -0.52

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-09-29Bitstream added on 2014-06-13T19:33:18Z : No. of bitstreams: 1 bilhassi_tb_me_jabo.pdf: 379095 bytes, checksum: 3bd49b1b7fc38271d3eda65b601048f6 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A Reação em Cadeia da Polimerase Quantitativa em Tempo Real (qPCR) foi utilizada para avaliar o nível de infecção por Babesia bovis e Babesia bigemina em bovinos de corte. Foram utilizados 149 animais, sendo 74 bezerros e 75 vacas de três grupos genéticos diferentes (puros Bos indicus, ½ Bos indicus + ½ Bos taurus e puros Bos taurus). Os resultados obtidos foram analisados com o objetivo de verificar se ocorrem variações entre os grupos genéticos e faixas etárias estudadas quanto ao nível de infecção por babesias. De cada bovino foram colhidas amostras de sangue da veia jugular e vasos periféricos, para extração de DNA, determinação do volume globular (VG) e confecção de esfregaços sanguíneos. As amostras de DNA extraídas de sangue venoso, colhidas com anticoagulante EDTA foram submetidas à amplificação pela técnica de qPCR, utilizando sequências iniciadoras específicas para B. bovis e B.bigemina. Pelo exame microscópico de esfregaços sanguíneos verificou-se que, nenhum animal adulto apresentou parasitemia patente por Babesia spp. Nos bezerros foram diagnosticados 10,8% de infecção por B. bigemina (8/74), sendo 26,1%, 3,8% e 4% para os grupos genéticos Angus, cruzados e Nelore, respectivamente. A taxa de infecção por B. bovis diagnosticados pela técnica de qPCR nos bovinos estudados foi de 98,0% (146/149), sendo 100,0%, 98,0% e 96,0% para os grupos genéticos Angus, cruzados e Nelore, respectivamente. As análises estatísticas do nível de infecção medido pelo número de cópias de DNA alvo nas amostras mostraram significância (P<0,05) dos três fatores avaliados: grupo genético, categoria e a interação entre eles. Foi possível observar ainda que bovinos Bos taurus apresentaram maior suscetibilidade às infecções por Babesia bovis e que a quantidade de DNA alvo desta... / The Polymerase Chain Reaction Quantitative Real Time (qPCR) was used to assess the level of infection with Babesia bovis and Babesia bigemina in beef cattle. We used 149 animals, 74 calves and 75 cows from three different genetic groups (Bos indicus pure, ½ Bos indicus + ½ Bos taurus and Bos taurus pure). The results were analyzed with the objective of determining if there are variations between genotypes and age groups in the level of infection with babesias. Each calf was sampled blood from the jugular vein and peripheral vessels for DNA extraction, packed cell volume (VG) and preparation of blood smears. DNA samples extracted from venous blood collected with EDTA anticoagulant were subjected to qPCR amplification technique using sequence specific primers for B. bovis and B.bigemina. By microscopic examination of blood smears showed that no adult animals presented patent parasitemia by Babesia spp. Calves were diagnosed in 10.8% of infection by B. bigemina (8/74), and 26.1%, 3.8% and 4% for the Angus genetic groups, crossbred and Nellore, respectively. The rate of infection by B. bovis diagnosed by qPCR technique in cattle studied was 98.0% (146/149), and 100.0%, 98.0% and 96.0% for Angus genetic groups, crossbred and Nellore, respectively. Statistical analysis of the level of infection measured by the number of copies of target DNA in the samples showed significant (P <0.05) evaluated the three factors: genetic group, category and the interaction between them. It was also possible to observe that Bos taurus cattle showed greater susceptibility to infections by Babesia bovis and the amount of target DNA of this species of protozoa in calves, was significantly (P <0.05) higher than in cows. To B. bigemina, only DNA samples from cattle ½ Bos indicus + ½ Bos taurus and Bos taurus pure technique were assessed by qPCR, due to low concentration... (Complete abstract click electronic access below)