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Soil microbial community function and structure as assessment criteria for the rehabilitation of coal discard sites in South Africa / Sarina ClaassensClaassens, Sarina January 2003 (has links)
Mining activities cause severe disturbance to the soil environment in terms of soil quality
and productivity and are of serious concern worldwide. Under South African legislation,
developers are required to ecologically rehabilitate damaged environments. The application
of agronomic approaches for the rehabilitation of coal discard sites has failed dismally in
the arid areas of southern Africa. It is obvious that compliance with mitigation and
rehabilitation requirements cannot be enforced without a thorough understanding of the
ecological principles that ensure ecological stability and subsequent sustainability of soil
ecosystems. Soil micro organisms are crucial role-players in the processes that make energy
and nutrients available for recycling in the soil ecosystem. Poor management practices and
other negative impacts on soil ecosystems affect both the physical and chemical properties
of soil, as well as the functional and structural properties of soil microbial communities.
Disturbances of soil ecosystems that impact on the normal functioning of microbial
communities are potentially detrimental to soil formation, energy transfers, nutrient
cycling, plant reestablishment and long-term stability. In this regard, an extensive overview
of soil properties and processes indicated that the use of microbiological and biochemical
soil properties, such as microbial biomass, enzymatic activity and the analysis of microbial
community structure by the quantification of specific signature lipid biomarkers are useful
as indicators of soil ecological stress or restoration properties because they are more
responsive to small changes than physical and chemical characteristics. In this study, the
relationship between the physical and chemical characteristics and different biological
indicators of soil quality in the topsoil covers of seven coal discard sites under
rehabilitation in South Africa, as well as three reference sites was investigated. Through the
assimilation of basic quantitative data and the assessment of certain physical, chemical and
biological properties of the topsoil covers obtained from the various coal discard sites as
well as the reference sites, the relative success or progress of rehabilitation and the possible
correlation between the biological indicators of soil quality and the establishment of self sustaining
vegetation covers was determined. Results from soil physical and chemical
analyses and percentage vegetation cover were correlated with the results obtained for the
functional and structural diversity of microbial communities at the various sites. All results
were investigated through statistical and multivariate analysis and the most prominent
physical and chemical parameters that influence the biological and biochemical properties
of the soil and possibly the establishment of self-sustainable vegetation cover on these
mine-tailing sites were identified. Results obtained from this study indicated no significant
difference (p>0.05) between the various discard sites based on conventional
microbiological enumeration techniques. However, significant differences (p<0.05) could
be observed between the three reference sites. All enzymatic activities assayed for the
rehabilitation sites, with the exception of urease and alkaline phosphatase displayed a
strong, positive association with the organic carbon content (%C). Ammonium
concentration had a weak association with all the enzymes studied and pH only showed a
negative association with acid phosphatase activity. A positive association was observed
between the viable microbial biomass, vegetation cover and the organic carbon content,
ammonium, nitrate and phosphorus concentrations of the soil. The various rehabilitation
and reference sites could be differentiated based on the microbial community structure as
determined by phospholipid fatty acid (PLFA) analysis. It is hypothesised that the
microbial community structure of the Hendrina site is not sustainable when classified along
an r-K gradient and that the high percentage of vegetation cover and high levels of
estimated viable microbial biomass are an artificial reflection of the current management
practices being employed at this site. Results obtained during this study, suggest that an
absence or low percentage of vegetation cover and associated lower organic matter content
of the soil have a significant negative impact on soil biochemical properties (enzymatic
activity) as well as microbial population size. Furthermore, prevailing environmental
physico-chemical and management characteristics significantly influences the vegetation
cover and subsequently the microbial community structure. The results indicate that the
microbial ecosystems in the coal discard sites could become more stable and ecologically
self-regulating, provided effective management to enhance the organic carbon content of
the soil. This could enhance nutrient cycling, resulting in changes of soil structure and
eventually an improved soil quality which could facilitate the establishment of self sustaining
vegetation cover. Results obtained during this study suggest that a polyphasic
assessment of physical and chemical properties; microbial activities by enzymatic analysis;
the characterisation of microbial community structure by analysis of phospholipid fatty
acids; and the multifactorial analysis of the data obtained can be used as complementary
assessment criteria for the evaluation of the trend of rehabilitation of mine tailings and
discard sites. Strategic management criteria are recommended based on the soil
quality environmental sustainability indices to facilitate the establishment of self sustainable
vegetation covers. The contribution of this research to soil ecology is
significant with regards to the intensive investigation and explanation of characteristics and
processes that drive ecological rehabilitation and determine the quality of the soil
environment. The multidisciplinary approach that is proposed could, furthermore, assist in
the successful rehabilitation and establishment of self-sustaining vegetation covers at
industrially disturbed areas, as well as assist in improving degraded soil quality associated
with both intensive and informal agriculture. Additionally, this approach could negate the
negative social and environmental impacts frequently associated with these activities. / Thesis (M. Environmental Science)--North-West University, Potchefstroom Campus, 2004.
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Characterization of nutrient release and greenhouse gas emission from Chernozemic soils amended with anaerobically digested cattle manureChiyoka, Waraidzo 20 April 2011 (has links)
Two laboratory incubation studies and a growth room bioassay of forage barley were conducted to investigate nitrogen (N) and phosphorus (P) mineralization, and nitrous oxide emission from two contrasting agricultural soils amended with anaerobically digested cattle manure (ADM). The ADM is a nutrient-rich co-product from manure-based biogas plants which is applied to cropland at rates used for raw manure since scientific information on nutrient release from ADM is lacking. Application of the separated solids fraction of ADM (SS) reduced nitrous oxide emission but resulted in lower N mineralization compared to raw manure in both soils. Raw manure- and SS- treatments had similar biomass yields and P supply capacities while the application of pelletized SS (PSS) caused net N immobilization, lower P release than manure and SS, and depressed barley yields relative to non-amended (control) soils.
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Biodegradação de resíduos oleosos provenientes de refinaria de petróleo através do sistema de biopilhasMorais, Eduardo Beraldo de [UNESP] 18 August 2005 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2005-08-18Bitstream added on 2014-06-13T20:16:40Z : No. of bitstreams: 1
morais_eb_me_rcla.pdf: 581837 bytes, checksum: 6b02ac6c5a3ca7b0528f8a1f3afc5d7e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O potencial de um sistema de biopilhas em degradar resíduos oleosos provenientes de refinaria de petróleo também chamado de borra de óleo foi estudado, assim como a possibilidade de otimizar o mesmo através da bioestimulação (adição de fertilizantes) e bioenriquecimento (adição de inóculo). Primeiramente, verificou-se a biodegradabilidade do resíduo através do método respirométrico de Bartha, quantificando o CO2 emitido, observando os efeitos do uso de inóculo e de fertilizantes neste processo. Os microrganismos utilizados na produção do inóculo, fungos e bactérias, foram isolados de landfarming da Refinaria de Paulínia, REPLAN, estado de São Paulo, por serem adaptados ao ambiente de estresse ocasionado pelo resíduo oleoso e por terem demonstrado capacidade em biodegradar hidrocarbonetos de petróleo, em ensaios prévios realizados em laboratório. Foram construídas cinco biopilhas contendo solo poluído pela borra de óleo, nas constituições: 1 controle do experimento; 2 adicionada com inóculo; 3 com inóculo e fertilizante para plantas; 4 com inóculo e palha de arroz; 5 com inóculo, fertilizante e palha de arroz. Os resultados após 350 dias demonstraram redução da quantidade de resíduo em todas as biopilhas: 67%, 70%, 75%, 82% e 79% nas biopilhas 1, 2, 3, 4 e 5 respectivamente. As biopilhas contendo palha de arroz demonstraram degradação mais rápida do resíduo, principalmente nos dois primeiros meses deste estudo, provavelmente devido ao maior número de microrganismos que foram observados nas mesmas decorrente da adição do inóculo ou estimulação da microbiota natural. Nas condições de estudo, o inóculo adicionado nas biopilhas 2 e 3 não sobreviveram ao novo ambiente não influenciando a degradação do resíduo assim como a...
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Biodegradação de resíduos oleosos provenientes de refinaria de petróleo através do sistema de biopilhas /Morais, Eduardo Beraldo de. January 2005 (has links)
O potencial de um sistema de biopilhas em degradar resíduos oleosos provenientes de refinaria de petróleo também chamado de borra de óleo foi estudado, assim como a possibilidade de otimizar o mesmo através da bioestimulação (adição de fertilizantes) e bioenriquecimento (adição de inóculo). Primeiramente, verificou-se a biodegradabilidade do resíduo através do método respirométrico de Bartha, quantificando o CO2 emitido, observando os efeitos do uso de inóculo e de fertilizantes neste processo. Os microrganismos utilizados na produção do inóculo, fungos e bactérias, foram isolados de "landfarming" da Refinaria de Paulínia, REPLAN, estado de São Paulo, por serem adaptados ao ambiente de estresse ocasionado pelo resíduo oleoso e por terem demonstrado capacidade em biodegradar hidrocarbonetos de petróleo, em ensaios prévios realizados em laboratório. Foram construídas cinco biopilhas contendo solo poluído pela borra de óleo, nas constituições: 1 controle do experimento; 2 adicionada com inóculo; 3 com inóculo e fertilizante para plantas; 4 com inóculo e palha de arroz; 5 com inóculo, fertilizante e palha de arroz. Os resultados após 350 dias demonstraram redução da quantidade de resíduo em todas as biopilhas: 67%, 70%, 75%, 82% e 79% nas biopilhas 1, 2, 3, 4 e 5 respectivamente. As biopilhas contendo palha de arroz demonstraram degradação mais rápida do resíduo, principalmente nos dois primeiros meses deste estudo, provavelmente devido ao maior número de microrganismos que foram observados nas mesmas decorrente da adição do inóculo ou estimulação da microbiota natural. Nas condições de estudo, o inóculo adicionado nas biopilhas 2 e 3 não sobreviveram ao novo ambiente não influenciando a degradação do resíduo assim como a... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / The potential of a biopile system to degradate oily residues from a petroleum refinery also called oil sludge was studied, as well as the possibility of its optimization through biostimulation (fertilizers addition) and bioaugmentation (inoculum addition). First, the biodegradability of the residue was verified through the Bartha flasks, quantifying the CO2 emitted, observing the effects of the inoculum and fertilizer use in this process. The microorganisms used in the inoculum production were isolated from the landfarming of Refinery of Paulínia, REPLAN, São Paulo State, as they are adapted to the environmental stress provoked by the oily residue showed the capacity to degradate petroleum hydrocarbons in previous assays in laboratory. Five biopiles were built with the soil polluted by the oil sludge, they were constituted by: 1 experimental control, 2 with inoculum; 3 with inoculum and plant fertilizer; 4 with inoculum and rice straw; 5 with inoculum, fertilizer and rice straw. The results after 350 days showed a reduction of the residue quantity in all the biopiles: 67%, 70%, 75%, 82% and 79% in the biopiles 1, 2, 3, 4 and 5 respectively. The biopiles containing rice straw showed a faster degradation of the residue mainly during the first two months of this study, probably due to the higher number of microorganisms provoked by the addition of the inoculum or stimulation natural microorganisms. At the conditions of this study, the addition of the inoculum to the biopiles 2 and 3 did not survive in the new environment not influencing the residue degradation, as well as the fertilizer addition did not have any influence to the biopiles 3 and 5. It was clear the importance of the addition of materials and aggregated such as the rice straw, to improve the soil characteristics regarding to aeration and permeability... (Complete abstract, access undermentioned electronic address) / Orientador: Sâmia Maria Tauk-Tornisielo / Coorientador: Ana Paula de Arruda Geraldes Kataoka / Banca: Ariovaldo José da Silva / Banca: Roberto Naves Domingos / Mestre
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Produtividade do milho e atividade biológica do solo sob influência de fungos micorrízicos arbusculares e de adubação orgânicaLino, Ingrid Alexssandra Neris 25 February 2014 (has links)
Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-04-01T15:00:43Z
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Ingrid Alexssandra Neris Lino Dissertação PPGBF 2014.pdf: 662209 bytes, checksum: 777a9730d26a1dfaa03734a7ee039358 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-01T15:00:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2
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Ingrid Alexssandra Neris Lino Dissertação PPGBF 2014.pdf: 662209 bytes, checksum: 777a9730d26a1dfaa03734a7ee039358 (MD5)
Previous issue date: 2014-02-25 / O uso combinado de inóculos micorrízicos e esterco bovino pode incrementar a produtividade vegetal e a fertilidade do solo. O objetivo do presente trabalho foi determinar se a aplicação de inóculos micorrízicos, com e sem adubação orgânica, influenciam positivamente a produtividade da cultura do milho e a atividade biológica do solo. A influência foi determinada em experimentos de campo conduzidos em 2012 e 2013 no município de São João, PE, com quatro tratamentos de inoculação (três inoculados e um sem inoculação) e dois de adubação orgânica (com e sem esterco bovino). Nas condições testadas, a inoculação com fungos micorrízicos arbusculares não foi suficiente para aumentar a produtividade e a composição mineral de plantas de milho em condições de campo, independente da adubação. A aplicação do esterco bovino em plantios de milho influenciou positivamente a produtividade, enquanto o efeito na composição mineral das plantas variou conforme o nutriente analisado e as condições hídricas às quais a cultura foi submetida. Os teores de proteínas relacionadas à glomalina e a atividade microbiana do solo não foram influenciados significativamente pela adubação orgânica e pela inoculação com FMA, o que pode estar relacionado ao tempo de duração do experimento, considerado insuficiente para permitir a mensuração dos efeitos do adubo e dos inóculos. A inoculação com FMA em sistemas agrícolas pode trazer benefícios significativos em longo prazo, uma vez que contribui com o potencial infectivo do solo, verificado pela maior densidade de glomerosporos no solo e maior colonização micorrízica nas plantas inoculadas. Doses maiores de inóculos micorrízicos devem ser analisadas em associação com doses menores de esterco bovino, visando aumento da produtividade da cultura. / The combined use of mycorrhizal inoculants and manure can increase crop productivity and soil fertility. The objective of this study was to determine whether the application of mycorrhizal inoculum, with and without fertilization, positively influence productivity of maize under field conditions, and soil biological activity. The influence was determined in field experiments conducted in 2012 and 2013 in the city of São João, PE, with four inoculation treatments (three inoculated and one non-inoculated) and two fertilization treatments organic manure (with and without manure). Under the conditions tested, inoculation with mycorrhizal fungi did not affect productivity and mineral composition of corn plants under field conditions, independent of fertilization. The application of manure in maize positively influenced productivity, while the effect on the mineral composition of the plants varied according to the nutriente analyzed and moisture conditions to which the culture was submitted. The levels of proteins related to glomalin and soil microbial activity were not significantly influenced by organic fertilization and the inoculation with AMF, which may be related to the duration of the experiment, considered insufficient to allow measurement of the effects of fertilizer and inoculants. Inoculation with AMF in agricultural systems can bring significant long-term benefits, as it helps with the infective potential of the soil, verified by the higher density glomerosporos the soil and greater mycorrhizal colonization in the inoculated plants. Higher doses of mycorrhizal inoculants should be analyzed in combination with lower doses of manure, aiming to increase crop productivity.
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Avaliação comparativa, via calorimetria, da atividade microbiana de um latossolo vermelho, cultivado por cana-de-açúcar, citros e de mata natural / Comparative evaluation of microbial activity of red latosol cultivated with sugarcane, citrus and natural forest using calorimetryBertelli, Amanda Carolina Covizzi 18 August 2018 (has links)
Orientador: José de Alencar Simoni / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química / Made available in DSpace on 2018-08-18T09:26:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2011 / Resumo: Este estudo investiga a influência de práticas agrícolas na atividade microbiana de solos, utilizando-se a calorimetria. Foram estudados solos sobre três diferentes condições de manejo. Os solos foram retirados da região de Pirassununga, Estado de São Paulo e são de condições: solo de mata natural, cultivado com citros e cultivado com cana-de-açúcar. As coordenadas: mata natural (21°56'33,54"S; 47°19'51,85"O), citros (21°56'25,14"S; 47°19'53,31"O) e cana-de-açúcar (21°56'35,25"S; 47°;9'54,64"O). O estudo calorimétrico corresponde ao registro da energia dissipada em função do tempo, utilizando-se glicose como substrato. As amostras de foram também caracterizadas por diversas análises químicas (teor de carbono, pH e acidez total), e biológica (contagem de microorganismos), além das técnicas térmicas como TGA e DSC. Os resultados de calorimetria evidenciam diferenças entre os diferentes manejos em relação a parâmetros como: eficiência de assimilação da matéria orgânica (hH), constante de crescimento microbiano (k), e a quantidade biomassa viva formada (DX). O valor de "peak time" obedeceu a ordem citros<cana-de-açúcar<mata natural, tanto aos 3, 8 meses ou 1 ano de coleta. Após a adição de fenol esses valores se tornaram mais próximos um dos outros e após a adição do 4-clorofenol esses valores se tornaram bem mais elevados, mas a ordem permaneceu inalterada. Os três tipos de solo apresentaram microorganismos capazes de metabolizar o fenol. Após a adição de fenol, houve um aumento da quantidade de energia desprendida para os três solos, quando se comparam os metabolismos de glicose. Consequentemente, houve uma diminuição da biomassa acumulada hH %, e um aumento da emissão de CO2. Após a adição de 4-clorofenol foi observado efeito térmico com a adição da glicose apenas para o solo de citros e mata natural e também foi observado um aumento da energia liberada em comparação à situação sem adição prévia de 4-clorofenol / Abstract: This study investigates the influence of agricultural practices on soil microbial activity, using calorimetry. Soils were studied under three different management conditions. The soils were obtained from the region of Pirassununga, State of São Paulo and the conditions are: soil of natural forests, cultivated with citrus and cultivated with sugarcane. The coordinates were: natural forest (21 ° 56'33,54 "S; 47 ° 19'51,85" O), citrus ((21 ° 56'25, 14 "S; 47 ° 19'53, 31" O) and sugarcane (21 ° 56'35, 25 "S; 47 ° 19'54, 64" O). The calorimetry study corresponds to the record of the dissipated energy versus time, using glucose as substrate. The samples were also characterized by various chemical analyses (carbon content, pH and total acidity) and biological (microbial count), and thermal techniques such as TGA and DSC. The calorimetric results revealed differences between the different management systems in relation to parameters such as efficiency of assimilation of organic matter (hH), microbial growth constant (k), living biomass formed and the amount (DX). The value of peak time obeyed the order citrus<sugarcane<natural forest, both at 3, 8 months and 1 year of collection. After the addition of phenol these values become closer to each other and after the addition of 4-chlorophenol these values became much higher, but the order remained unchanged. The three types of soil microorganisms were able to metabolize phenol. After the addition of phenol, there was an increased amount of energy given off by the three soils, when comparing the metabolism of glucose. Consequently, there was a decrease of the biomass, hH% and an increase in CO2 emissions. After addition of 4-chlorophenol a thermal effect waas observed with the addition of glucose only for the citrus and forest soils together an increasing of the energy given off when compared to the situation where the 4-chlorophenol waas not previously added / Mestrado / Físico-Química / Mestre em Química
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Avaliação da interação da ovalbumina, principal alérgeno natural da clara de ovo, com sulfonamidas através de estudos espectroscópicos e de atividade biológica / Evaluation of the interaction of ovalbumin, main natural allergy of egg white, with sulfonamides through spectroscopic studies and biological activityLyra, Ana Carolina Fradique de 21 July 2017 (has links)
The interaction between ovalbumin (OVA) and four sulphonamides named sulfathiazole (S1), sulfaquinoxaline (S2), sulfadimethoxine (S3) and sulfamethazine (S4) was investigated employing spectroscopic techniques (molecular fluorescence, UV-Vis and 1H NMR) emulating in natura egg conditions. For the interaction study, the intrinsic fluorescence of the protein (λex = 280 nm / λem= 336 nm) was explored in the ligand’s presence and absence (SFs). The OVA spectrometric titrations (2 μM) with different ligands (0-200 μM) were performed in pH 7.4 (Tris-HCl buffer solution 50 mM, NaCl 100 mM). For the evaluation of the interaction process, it was noticed a decrease in the OVA fluorescent emission as SFs excess was added, due to an energy transfer process (quenching). By using these data, the Stern Volmer constant (Ksv), binding constant (Kb) and stoichiometric ratio (n) were calculated. The Kb values ranged from 3.98 to 27.4 x 105 L mol-1 (30 ºC) and by applying these information, it was observed that the interaction magnitude followed the order: S3 < S4 < S2 < S1. The number of binding sites in every condition applied was close to one. For all SFs evaluated the increase in temperature lead to a decrease in both Ksv and Kb values, indicating that the static quenching mechanism is preferable, with the formation of a non-fluorescent molecular complexes. This result was further confirmed by UV-Vis studies with formation of a fundamental state complex. According to thermodynamic parameters, ΔG < 0 was obtained for all SFs evaluated, indicating that the interaction is thermodynamically spontaneous. For S2 and S3, the main forces acting in the interaction are hydrogen bonds and Van der Waals forces, whereas S1 and S4 have electrostatic forces, predominantly. Through 3D fluorescence studies, it was observed a decrease in the fluorescence intensity of peak 2 and 3, which is related to the tyrosine and tryptophan residue emissions associated with the protein secondary structure in the presence of SFs, respectively. This result indicates that there were conformational changes in the protein native structure. By using synchronized fluorescence, it was possible to deduce that the interaction with OVA exposes the tyrosine and tryptophan residues, increasing the polarity of the micro–environment of those amino acids. Through studies based on FRET (Fluorescence resonance energy transfer), it was possible to calculate the intermolecular distance between the SFs (energy acceptors) and OVA (energy donor), which were smaller than 10 nm. The competition assay with ANS probe, which control the protein hydrophobic regions, indicates that only S2 was capable to shift this marker. Metallic ions were also evaluated and it was observed that Ca(II), Mg(II) and Fe(III) can facilitate the interaction between sulphonamides (S1 and S2) and OVA. The 1H NMR studies showed a signal shift for aromatic hydrogens present in S2 and S3. In nature ovalbumin (from egg white) interacts more effectively with SFs than commercial ovalbumin. Biological studies have shown that E. coli and B. megaterium are sensitive to the sulfonamides tested and the MIC values of these antibiotics in the absence and presence of OVA do not present significant difference. This way, the results indicate that there was interaction between SFs and macromolecule and, thus, conformational changes in the protein structure were identified. So, the presence of SFs in aliments shows a risk to food security, since the OVA has its polypeptide chain modified and can act/treat as a foreigner and cause allergic reactions. / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A interação da ovalbumina (OVA) com quatro sulfonamidas, nomeadamente sulfatiazol (S1), sulfaquinoxalina (S2), sulfadimetoxina (S3) e sulfametazina (S4) foi investigada empregando técnicas espectroscópicas (fluorescência molecular, UV-vis e RMN 1H) simulando as condições in natura do ovo. Para o estudo de interação, explorou-se a fluorescência intrínseca da proteína (λex = 280 nm / λem = 336 nm) na ausência e presença dos ligantes (SFs). As titulações espectrofluorimétricas da OVA (2 μM) com os diferentes ligantes (0-200 μM) foram realizadas em pH 7,4 (tampão Tris 50 mM, NaCl 100 mM). Na avaliação do processo de interação notou-se diminuição na intensidade da emissão da fluorescência da OVA à medida que os excessos das SFs foram adicionados, devido ao processo de transferência de energia (quenching). Por meio destes resultados foi possível calcular a constante de Stern Volmer (Ksv), constante de ligação (Kb) e proporção estequiométrica (n). Os valores de Kb variaram de 3,98 a 27,4x105 L mol-1 (30 ºC) e a partir destes dados observou-se que a magnitude da interação seguiu a seguinte ordem: S1 > S2 > S4 > S3. O número de sítios de ligação em todas as condições foi próximo à unidade. Para todas as SFs avaliadas o aumento da temperatura levou a diminuição dos valores de Ksv e Kb, indicando que o mecanismo de quenching preferencial é estático, com formação de complexos supramoleculares não-fluorescentes. Este resultado foi confirmado pelos estudos de UV-vis com formação do complexo no estado fundamental. Quanto aos parâmetros termodinâmicos, obteve-se ΔG < 0 para todas as SFs avaliadas, indicando que a interação é termodinamicamente espontânea. Para S2 e S3, as forças predominantes na interação são ligações de hidrogênio e forças de Van der Waals, enquanto que para S1 e S4 as forças preferenciais foram eletrostáticas. Através dos estudos por fluorescência 3D observou-se a redução na intensidade de fluorescência dos picos 2 e 3, relativos à emissão dos resíduos de tirosina e triptofano e emissão associada a estrutura secundária da proteína na presença das SFs, respectivamente. Este resultado indica que houve mudanças na estrutura nativa da proteína. Por meio de fluorescência sincronizada foi possível inferir que a interação com a OVA expõe os resíduos de triptofano e tirosina aumentando a polaridade do microambiente destes aminoácidos. Através de estudos baseados em FRET (Fluorescence resonance energy transfer), foi possível calcular a distância intermolecular entre as SFs (receptoras de energia) e a OVA (doadora de energia), as quais foram inferiores a 10 nm. Os estudos de competição com a sonda ANS que monitora regiões hidrofóbicas da proteína indicaram que S2 foi a única sulfa capaz de deslocar este marcador. Já com os íons metálicos, observa-se que Ca(II), Mg(II) e Fe (III) favorecem a interação das sulfonamidas (S1 e S2) com a OVA. A partir dos estudos por ressonância magnética nuclear de hidrogênio (RMN 1H) verificou-se deslocamento dos sinais para os hidrogênios aromáticos presentes em S2 e S3. Além disto, foi verificado que a ovalbumina in natura (obtida da clara do ovo) interage com as SFs em maior magnitude quando comparado com a OVA comercial. Por meio de estudos biológicos constatou-se que a E. Coli e B. megaterium são sensíveis as sulfonamidas testadas e que os valores de MIC destes antibióticos na ausência e presença da OVA não diferem. Dessa forma, os resultados obtidos indicam que houve interação entre as SFs e a macromolécula e, consequentemente, mudanças conformacionais na estrutura da proteína foram identificadas. Logo, a presença das SFs em alimentos pode apresentar um risco a segurança alimentar, pois uma vez que há mudança conformacional na cadeia polipeptídica da OVA, esta pode comportar-se como um corpo estranho no organismo e causar/potencializar reações alérgicas.
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Alterações químicas e biológicas em solo de área de mineração de carvão submetido a diferentes cultivos / Chemical and biological changes in coal mining soil submitted to different cultivationSantos, Daiane Carvalho dos 28 July 2006 (has links)
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Previous issue date: 2006-07-28 / The coal deposits in Brazil comprehend 32 billion tons, being 89% in Rio Grande do
Sul. Even though it is an important energy resource, the coal extraction, processing
and use create great soil transformation, specially the open pil mining, causing
relevant physical, chemical and biological properties alterations. The re-vegetation
aims to re-establish the area original characteristics, avoid erosion process allowing
the soil restructure. This work intends to evaluate the chemical and biological
attribute changes in the recovered soil according to vegetal covering from different
species. The study was developed in a recovered coal mining soil in Candiota - RS,
with a block lining at random, with four repetitions, with the following treatments:
Hemartria altíssima, Cynodon dactilum, Paspalum lourai, Combination Hemartria
altíssima + Arachis pintoi, Combination Cynodon dactilum + Arachis pintoi and
Combination Paspalum lourai + Arachis pintoi. The results were compared with
analyses of a natural soil adjacent to the mining area. The results allowed the
following conclusions: the Hemartria altíssima + Arachis pintoi cultivations in the
recovered soil presented the higher dry material productions, with amounts similar to
the culture productivity in natural conditions; the nutrients and lime applications in the
cultivation area, in general terms, increased the electrical conduction and changeable
sodium amount, these amounts presented a decrease as the time went by turning
equalized to ones observed in natural soil; after 562 days of different cultivation
implantation, the levels of organic carbonic and total nitrogen are much lower than
ones observed in natural soil, adjacent to the mining area; the treatments with
Hemartria altíssima, Cynodon dactilum, Paspalum lourai and Cynodon dactilum +
Arachis pintoi, maintained the microbial biomass carbon levels, after 380 days of
cultivation implantation, higher than observed in natural soil; after 562 of cultivation
the microbial biomass nitrogen levels continued lower than natural soil determined
levels; the microbial activity in all studied cultivation became higher with the soil
recovering period; the activity with Cynodon dactilum + Arachis pintoi, cultivation,
after 562 days of experiment implantation was similar to natural soil microbial activity
and after 562 days of cultivation, the CO2 intense liberation, in all treatments,
increased the qCO2 to amounts higher than observed in natural soil.
PDF Creator / As reservas de carvão no Brasil atingem 32 bilhões de toneladas, sendo que 89%
encontram-se no Rio Grande do Sul. Apesar de importante recurso energético, a
extração, o beneficiamento e a utilização do carvão mineral são atividades que
originam grandes transformações no solo, principalmente quando a mineração é
realizada a céu aberto, causando profundas alterações em suas propriedades
físicas, químicas e biológicas. A revegetação restabelece as características originais
da área e evita processos erosivos, permitindo a reestruturação do solo. O presente
trabalho teve por objetivo avaliar as modificações de atributos químicos e biológicos
de um solo construído em função de diferentes espécies de cobertura vegetal. O
estudo foi desenvolvido em um solo construído na área de mineração de carvão no
município de Candiota RS. Utilizou-se um delineamento em blocos ao acaso com 4
repetições, com os seguintes tratamentos: Hemártria (Hemartria altissima), Tifton
(Cynodon dactilum), Pensacola (Paspalum lourai), Consórcio Hemártria + Amendoim
Forrageiro (Arachis pintoi), Consórcio Tifton + Amendoim Forrageiro e Consórcio
Pensacola + Amendoim Forrageiro. Foram realizadas coletas de plantas e de solo,
aos 198, 380 e 562 dias de cultivo, respectivamente, para as determinações de
matéria seca, propriedades químicas e biológicas do solo. Os resultados foram
comparados com análises de um solo natural adjacente a área de mineração. Os
resultados permitiram concluir que: os cultivos Hemártria e Hemártria + Amendoim
forrageiro no solo construído, foram aqueles que apresentaram os maiores
rendimentos de matéria seca, com valores semelhantes à produtividade dessas
culturas em condições normais; as aplicações de nutrientes e de calcário na área de
cultivo, de modo geral, aumentaram os valores de condutividade elétrica e de sódio
trocável, esses valores apresentaram um decréscimo ao longo do tempo
equiparando-se aos observados no solo natural; após 562 dias de implantação dos
diferentes cultivos, os teores de carbono orgânico total e nitrogênio total são muito
inferiores aos observados no solo natural, adjacente à área de mineração; os
tratamentos com Hemártria, Tifton, Pensacola e Tifton + Amendoim forrageiro,
mantiveram os teores de carbono da biomassa microbiana após 380 dias de
implantação dos cultivos, superiores aos observados no solo natural; após 562 dias
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de cultivo: os teores de nitrogênio da biomassa microbiana continuaram abaixo dos
teores determinados no solo natural; a atividade microbiana em todos os cultivos
estudados, aumentou com o tempo de construção do solo; a atividade com o cultivo
de Tifton + Amendoim forrageiro, foi semelhante à atividade microbiana do solo
natural e a intensa liberação de CO2 em todos os tratamentos, aumentou o qCO2 a
valores superiores ao observado no solo natural.
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Biomassa, atividade microbiana e produtividade de trigo e milho em solo com histórico de aplicação de fontes orgânicas e mineralDantas, Max Kleber Laurentino 15 February 2016 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The use of organic waste arising from the production of pigs and cattle is commonly used to fertilize crops. Successive applications of these sources in the same areas over time promote changes in physical, chemical and biological soil, they can play some influence on biomass and activity of soil microbes, which may reflect the availability of nutrients and consequently in crop productivity. This study aimed to evaluate how the activity and microbial biomass can be changed in soil under no-tillage system and with a history of successive applications of organic and mineral sources.The experiment was established in 2004 and has been conducted in the experimental area of the Department of UFSM soils under a Ultisol and design of randomized blocks. The results of this study correspond to the period of the agricultural year 2014/2015 which was grown wheat succession (winter) and maize (summer) .The treatments consist of application of pig slurry (PS), liquid cattle manure (CS) , pig deep-litter (PL), mineral fertilizers (NPK) and a treatment without nutrient source application (TEST), the quantity applied these sources based fertilizer recommendation to the state of RS and determined by the dose N required by the crop When he turned up 11 years of applying treatments, soil samples were collected at 0-10 cm during the wheat crops and corn, in both the flowering period and after harvesting crops . Part of the samples followed for chemical characterization and part was stored at 4 °C for determination of C, N and P of the microbial biomass, respiration rate and activity of B-glucosidase enzyme, urease, aryl sulphatase, acid phosphatase, and hydrolysis of FDA. The results showed differences from organic sources with each other and with respect to TEST and NPK. In wheat cultivation there was no difference between treatments for C-BIO variable. The N-BIO did not differentiate between organic sources, but these were higher compared to TEST and NPK treatments. PL and CS treatments also had higher values for P-BIO. Already maize cultivation PL and CS stood out in relation to other treatments for C, N and P-BIO. These same treatments was observed the highest respiration rates in both the wheat crop as corn, but also had higher qCO2 values. In general for all the enzymes evaluated in this study the PL and CS were the treatments with the highest activities. / A utilização de resíduos orgânicos oriundo da criação de suínos e bovinos é comumente utilizada para fertilização de lavouras. Sucessivas aplicações dessas fontes nas mesmas áreas ao longo do tempo promovem alterações de ordem física, química e biológica no solo, estas podem desempenhar certa influência sobre a biomassa e a atividade da microbiota do solo, o que pode refletir na disponibilidade de nutrientes e consequentemente na produtividade de culturas. Este trabalho objetivou avaliar como a atividade e a biomassa microbiana do solo podem ser alteradas em solo cultivado sob sistema de plantio direto e com histórico de sucessivas aplicações de fontes orgânicas e mineral. O experimento foi implantado no ano de 2004 e vem sendo conduzido em área do Departamento de solos da UFSM, sob um Argissolo Vermelho Distrófico arênico e em delineamento de blocos ao acaso. Os resultados do presente trabalho correspondem ao período do ano agrícola 2014/2015 onde foi cultivado a sucessão trigo (inverno) e milho (verão). Os tratamentos consistem da aplicação de dejetos líquidos de suínos (DLS), dejetos líquidos de bovinos (DLB), cama sobreposta de suínos (CSS), adubação mineral (NPK) e um tratamento sem aplicação de fonte de nutrientes (TEST), sendo a quantidade aplicada dessas fontes determinada em função da dose de N requerida pela cultura. Após 11 anos de aplicações sucessivas dos tratamentos, amostras de solo foram coletadas na camada de 0-10 cm, durante os cultivos do trigo e do milho, em ambos, no período do florescimento e após a colheita das culturas. Parte das amostras seguiram para caracterização química e parte foi armazenada a 4ºC para as determinação do C, N e P da biomassa microbiana, respiração basal e atividade das enzimas β-glicosidase, urease, aril-sulfatase, fosfatase ácida, e hidrólise do FDA. Os resultados evidenciaram diferenças das fontes orgânicas entre si e em relação a TEST e NPK. No cultivo do trigo não houve diferença entre os tratamentos para variável C-BIO. O N-BIO não se diferenciou entre as fontes orgânicas, mas estas foram maiores em relação aos tratamentos TEST e NPK. Os tratamentos CSS e DLB também obtiveram maiores valores para P-BIO. Já no cultivo do milho a CSS e DLB se destacaram em relação aos demais tratamentos para C, N e P-BIO. Nesses mesmos tratamentos se observou as maiores taxas de respiração tanto no cultivo do trigo quanto no milho, entretanto também obtiveram maiores valores de qCO2. De maneira geral para todas as enzimas avaliadas neste estudo a CSS e DLB foram os tratamentos que apresentaram as maiores atividades.
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Estudo calorimetrico da atividade microbiana de solo canavieiro, manejado sob diferentes condições / Calorimetric study of the soil microbial activity from sugarcane plant region, tilled under different conditionsCurti, Gabriel Jeronymo, 1984- 14 August 2018 (has links)
Orientador: Jose de Alencar Simoni / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-14T14:10:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2009 / Resumo: Esse estudo investiga a influência de práticas agrícolas na atividade microbiana de solos, utilizando-se a calorimetria. Quatro amostras de solo foram coletadas no município de Pradópolis, São Paulo, Brasil (21°19'8'' S 48°7'16' ' W), onde se praticavam dois diferentes tipos de manejo: solo sujeito à queima periódica, e solos não sujeitos à queima, em que, 2, 4, e 7 cortes consecutivos da cultura de cana foram observados. Nesses solos também houve contínuo incremento de cobertura vegetal. O estudo calorimétrico corresponde ao registro da energia dissipada em função do tempo, utilizando-se glicose como substrato. As amostras foram também caracterizadas por diversas análises químicas (teor de carbono total e acidez), físicas (porosidade, densidade, argila dispersa), biológica (número de microorganismos), e por técnicas de análise térmica como TGA, e DSC. Os resultados de calorimetria evidenciam diferenças entre os diferentes manejos em relação a parâmetros como: eficiência de assimilação da matéria orgânica (hH), constante de crescimento microbiano (k), e a quantidade biomassa viva formada (DX). O solo associado a práticas de queimada apresentou uma baixa eficiência percentual de assimilação de matéria orgânica (hH = 53 %), um valor só comparável ao solo com 4 cortes. Também foi o solo que apresentou a menor constante de crescimento (k = 2,09 x 10 min) e um dos maiores valores de peak time (598 minutos). Embora o crescimento microbiano tenha sido mais lento para o solo com queima, o valor de energia anabolizada ficou em torno de 50 %. Por outro lado, a anabolização como matéria orgânica viva (DX) foi a mais baixa de todas (181 mg ou 34% de hH), enquanto que para os outros solos DX foi praticamente igual a hH. / Abstract: This study investigates the influence of tilling practices on the soil microbial activity, through the use of calorimetric techniques. Four soil samples were collected at the municipality of Pradópolis, São Paulo, Brazil (21°1 9'8''S 48°7'16''W), where two kinds of different agricultural managements were used: a soil subjected to periodical burning, and soils do not subject to burning, where subsequent 2, 4, and 7 cuts of the sugarcane plantation were done, with continuous increase of the vegetal covering. The calorimetric study corresponds to follow the heat flow versus time curves, for a mass of glucose amended to the soil. The sample soils were characterized through chemical analysis (total carbon and acidity), physical analysis (porosity, density, disperse clay), biological analysis (microorganism numbers) and more specifically by TGA, DSC and microcalorimetry. The calorimetric results show differences depending on the tilling practice, respect to some parameters evaluated: efficiency of organic material assimilation (hH), specific microbial growth constant (k), and the amount of live biomass formed (DX). The soil where the burning is used showed a low percentual efficiency of organic material (hH = 53 %), a value close to the soil with 4 cuts. It was verified to the burning condition the smallest value of growing rate (k = 2.09 x 10 min) and a relatively great value of peak time (598 minutes) for this sample. For the burning soil the microbial growth constant was the lowest one but the percentual of assimilated energy stayed close to 50% to this sample. Similarly, the live organic material anabolism (DX) was the lowest value registered (181 mg ou 34% of hH ), while this parameter was practically equal to hH for the other soil samples. / Mestrado / Físico-Química / Mestre em Química
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