Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas, Programa de Pós-Graduação em Física, Florianópolis, 2009. / Made available in DSpace on 2012-10-24T21:12:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 268021.pdf: 484581 bytes, checksum: e28e79cc09fdc6a1ecd8f9792c17a16c (MD5) / Neste trabalho apresentamos estudos teoricos sobre a colisao de pósitrons com moleculas de qualquer geometria. Realizamos os cálculos para determinar as seçoes de choque elasticas para as moleculas N2O, H2O, NH3 e CH4, utilizando o metodo das fraçoes continuadas, no qual utilizamos um potencial de correlacao-polarizaçao local. Os resultados apresentados aqui estao em excelente concordancia com dados teoricos e experimentais contidos na literatura. / In this work we present positron molecule scattering theoretical studies, using molecules with any geometry. We accomplished calculations in order to determine the elastic cross sections for the molecules N2O, H2O, NH3 and CH4, using the method of continued fractions, in wich we incorporate a local correlation-polarization potential. The results presented here are in excelent agreement with theorical and experimental data from literature.

Resumo: As propriedades termodinâmicas podem ser obtidas experimentalmente ou através de uma variedade de métodos semi-empíricos ou preditivos. O método de contribuição de grupo tem sido amplamente empregado nos últimos anos. Neste método as moléculas são formadas por grupos livres com contribuição individual numa determinada propriedade. Neste trabalho um novo método de cálculo de propriedades termodinâmicas é apresentado. O conceito de índice de conectividade baseado na topologia molecular, proposto por Randic e estendido por Kier e Hall foi utilizado para estimar as propriedades termodinâmicas de famílias de compostos que incluem alcanos lineares e ramificados, alcoóis, alcenos, alcinos, cetonas, ésteres e ácidos carboxílicos. Seis correlações lineares e quadráticas foram propostas para cálculos do calor de formação, da capacidade calorífica a pressão constante de gás ideal, da capacidade calorífica a pressão constante de líquidos, da entalpia de vaporização e da energia livre de Gibbs de formação. Os cálculos dos índices para várias ordens foram feitos com o uso do programa TOP.. Os resultados obtidos mostram que boas correlações tendo como variável o somatório dos índices de conectividades e o somatório dos índices de conectividade de valência, foram obtidas para todas as famílias de compostos investigados, com erro médio relativo inferior a 10%, quando comparados a dados da literatura. A inclusão de um termo quadrático não trouxe melhorias significativas no modelo linear. As correlações propostas foram utilizadas para determinar propriedades termodinâmicas de substâncias para as quais não existem dados experimentais, como é o caso dos alquil ésteres que formam o biodiesel e dos ácidos carboxílicos de cadeia longa.

Orientador : Prof. Dr. Silvio Marques Zanata / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ciencias Biológicas (Microbiologia, Parasitologia e Patologia Básica). Defesa: Curitiba, 2017 / Inclui referências : f. 55-60 / Resumo: A proteína STI1 foi descrita como uma molécula relacionada ao estresse térmico de leveduras, e por isso é denominada Stress-Inducible Protein 1. Sua homóloga humana é a Hop (Heat-shock organizing protein). Ela tem expressão praticamente ubíqua e é encontrada em vesículas intracelulares, complexo de Golgi ou dispersa no citoplasma. Estudos indicam que esta proteína participa de vários eventos celulares como desenvolvimento de astrócitos, diferenciação de neurônios, neuroproteção, neuritogênese, formação da memória em ratos e proliferação celular em tumor de ovário. Além disso, a STI1 foi também recentemente caracterizada como ligante da GTPase Rnd1. As GTPases de baixa massa molecular são um grupo de moléculas que ciclam entre as formas ativa e inativa. Aquelas pertencentes à subfamília Rnd possuem pouca atividade GTPásica intrínseca, encontrando-se constitutivamente ativas, sendo desse modo diferentes das outras Rho GTPases. A proteína Rnd1 é encontrada principalmente no cérebro, e está envolvida em vários mecanismos celulares, como a inibição de fibras de estresse e a indução da desorganização do citoesqueleto de actina e adesão focal. Além disso, Rnd1 está presente na extensão inicial de neuritos em células PC-12, e no desenvolvimento de dendritos em neurônios hipocampais de ratos. Foi demonstrada que a interação da STI1 com a Rnd1 pode interferir na fenomenologia (colapso do cone de crescimento) desencadeada pelo eixo Sema3A/Plexina-A1. Por outro lado ainda não foi determinado quais são as vias de sinalização que estão a jusante da interação STI1- Rnd1, responsáveis por esta interferência. Desse modo, as proteínas recombinantes GST, GST-RhoA G14V e GST-RBD foram expressas para a realização de ensaios de pulldown visando elucidar o papel de STI1 na atividade de p190RhoGAP e seu substrato RhoA. Primeiramente foi possível detectar que a presença de STI1 ao inativar Rnd1, leva também a inativação de sua ligante p190RhoGAP. Porém, não foi possível esclarecer o papel desta proteína na atividade de RhoA bem como sua atuação na atividade de cofilina. A produção de anticorpo monoclonal anti-Rnd1 também foi um objetivo do presente trabalho, porém apesar da indicação da presença de anticorpos anti-Rnd1 em soro policlonal, não foi possível detectar a clone positivo para este anticorpo na produção de hibridomas. Palavras-chave: GTPases, Rnd1, STI1, atividade. / Abstract: STI1 protein has been described as a yeast thermal stress-related molecule, and is therefore called Stress-Inducible Protein 1. Its human counterpart is Hop (Heat-shock organizing protein). It has virtually ubiquitous expression and is found in intracellular vesicles, Golgi complex or dispersed in the cytoplasm. Studies indicate that this protein participates in several cellular events such as astrocyte development, differentiation of neurons, neuroprotection, neuritogenesis, memory formation in rats and cell proliferation in ovarian tumor. In addition, STI1 has also recently been characterized as GTPase Rnd1 linker. Low molecular weight GTPases are a group of molecules that cycle between active and inactive forms. Those belonging to the subfamily Rnd have little intrinsic GTPase activity, being constitutively active, thus being different from the other Rho GTPases. Rnd1 protein is found primarily in the brain, and it is involved in several cellular mechanisms, such as inhibition of stress fibers and induction of actin cytoskeleton disorganization and focal adhesion. In addition, Rnd1 is present in the initial extension of neurites in PC-12 cells, and in the development of dendrites in hippocampal neurons of rats. It has been shown that the interaction of STI1 with Rnd1 can interfere in the phenomenology (growth cone collapse) triggered by the Sema3A / Plexin-A1 axis. On the other hand, it has not yet been determined which are the signaling pathways that are downstream of the STI1-Rnd1 interaction, responsible for this interference. Thus, the recombinant GST, GST-RhoA G14V and GST-RBD proteins were expressed for pulldown assays to elucidate the role of STI1 in p190RhoGAP activity and its RhoA substrate. First, it was possible to detect that the presence of STI1 when inactivating Rnd1 also leads to the inactivation of its p190RhoGAP ligand. However, it was not possible to clarify the role of this protein in RhoA activity as well in cofilin activity. The production of anti-Rnd1 monoclonal antibody was also an objective of the present work, but despite the presence of anti-Rnd1 antibodies in polyclonal serum, it was not possible to detect the positive clone for this antibody in the production of hybridomas. Key words: GTPases, Rnd1, STI1, activity.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas, Programa de Pós-Graduação em Química, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T04:47:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 296869.pdf: 4811314 bytes, checksum: d95c74392d82fee3febbcbb2fd6873c8 (MD5) / Neste estudo, a síntese, caracterização e propriedades mesomórficas de dezenove novas moléculas, com estrutura curvada contendo duas unidades de 1,2,4-oxadiazol ou 1,3,4-oxadiazol, são relatadas. A fim de compreender a relação entre a estrutura molecular e o comportamento mesomórfico, moléculas contendo uma variedade de substituintes polares (por exemplo, -I, -NO2, -NH2, -OH) no núcleo rígido central foram preparadas. O mesomorfismo foi caracterizado por DSC e MOLP e a natureza das mesofases foi estabelecida através de estudos de DRX. Quatro compostos da série 1,2,4-oxadiazol exibiram a fase Colh, por outro lado a série 1,3,4-oxadiazol apresentou um composto com fase SmA e quatro com fase Colh. A força motriz para a auto-montagem das mesofases discóticas observadas pode ser explicada pela microssegregação entre as partes polares e as partes alifáticas, produzindo um dímero, trímero ou tetrâmero dentro de um único disco. As propriedades fotofísicas dos compostos foram avaliadas em solução e em estado sólido. Os compostos contendo 1,2,4-oxadiazol apresentaram fraca fluorescência azul em solução (.em max = 350-450 nm) com rendimentos quânticos de fluorescência (FF) de 0,03 a 0,19 e deslocamento de Stokes entre 85 e 189 nm. Por outro lado, os compostos contendo 1,3,4-oxadiazol exibiram melhores resultados de fluorescência azul em solução (.em max = 369-409 nm) com rendimentos quânticos de fluorescência (FF) de 0,02 a 0,64 e deslocamento de Stokes entre 59 e 92 nm. / In this study, the synthesis, characterization, and mesomorphic properties of nineteen new molecules with curved structure, containing two units of 1,2,4-oxadiazoles or 1,3,4- oxadiazoles are reported. In order to understand the relationship between molecular structure and mesomorphic behavior of these novel materials containing a variety of polar substituents (i.e., -I, -NO2, -NH2, -OH) on the central rigid core were prepared. The mesomorphism was characterized by DSC and POM and the nature of the mesophases was established through XRD studies. Four compounds of 1,2,4-oxadiazole series exhibited Colh phase, on the other hand, 1,3,4-oxadiazole series presented one compound with SmA phase and four with Colh phase. The driving force for self-assembly of discotic mesophases observed can be explained by microsegregation between the aliphatic parts and the polar parts, producing a dimer, trimer or tetramer inside a single disc. The photophysical properties of the compounds, in solution and in solid state, were evaluated. The compounds, containing 1,2,4-oxadiazole showed weak blue emission in solution (ëem max = 350-450 nm) with quantum fluorescence yields (ÖF) from 0.03 to 0.19 and Stokes shifts between 85 and 189 nm. On the other hand, compounds containing 1,3,4-oxadiazole showed better results for blue fluorescence in solution (ëem max = 369-409 nm) and fluorescence quantum yields (ÖF) from 0.02 to 0.64 and Stokes shifts between 59 and 92 nm.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas. Programa de Pós-Graduação em Física. / Made available in DSpace on 2012-10-20T12:59:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 196653.pdf: 505951 bytes, checksum: 64254e8eb6ac68c2cd7e1294582360e5 (MD5) / Cálculo das seções de choque para o espalhamento de elétrons por moléculas de acetileno, para as transições e , na faixa de energias de 300-800 eV . Aplicamos o método da onda distorcida (MOD) combinado com o método variacional iterativo de Schwinger (SVIM).

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas. Programa de Pós-Graduação em Física. / Made available in DSpace on 2012-10-20T15:35:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 207186.pdf: 1348489 bytes, checksum: d7e2a9b4de5929319bb9285529ca55b3 (MD5) / Neste trabalho, aplicamos o método da onda distorcida (MOD) combinado com o método variacional iterativo de Schwinger (SVIM) para calcular as seções de choque diferenciais DCS´s e as seções de choque integrais ICS´s para excitações eletrônicas a partir de camadas internas K dos átomos de carbono (1s) para as moléculas de CO2, OCS e CS2 na faixa de energia de 300 a 800eV. Foram calculadas as DCS's e ICS´s pertencentes às respectivas moléculas. Em seguida calculamos as razões, RI (1:3), entre as ICS´s e as razões, RD (1:3), entre as DCS´s que conduzem aos estados finais singleto e tripleto respectivamente. Foram observados alguns pontos de máximo, ressonâncias, nas curvas para as ICS´s em todas as moléculas. Porém nas RI (1:3), somente para a molécula de CO2 foram observados dois picos pronunciados próximo ao limiar de excitação. Este comportamento é discutido no presente trabalho, onde sugerimos qual o motivo destas ressonâncias aparecerem ou não nas RI (1:3). Os dados obtidos estão em bom acordo com os poucos dados experimentais encontrados.

Resumo: Neste trabalho apresentamos seções de choque de espalhamento elástico de elétrons pelos isômeros C2H2Cl2, C4H4N2 e C3H3NX (onde X=NH, O, S). Os cálculos de espalhamento foram efetuados na aproximação de núcleos fixos, com uso do método multicanal de Schwinger implementado com pseudopotenciais de Bachelet, Hamann e Schl¨uter, e nas aproximações estático-troca e estático-troca mais polarização. Para os três isômeros C2H2Cl2 apresentamos seções de choque integrais, de trasferência de momento e diferenciais. O procedimento Born-closure é empregado a fim de levar em conta o efeito do momento de dipolo. As ressonâncias encontradas tiveram suas posições comparadas aos valores experimentais. Discutimos ainda o efeito isômero, que consiste em diferenças apresentadas pelas seções de choque de cada molécula. Para os três isômeros C4H4N2 apresentamos seções de choque integrais. As ressonâncias são identificadas e caracterizadas. Suas posições são comparadas com os resultados encontrados na literatura. Cálculos de estrutura eletrôncia também são efetuados para ajudar na interpretação dos resultados. Os seis sistemas C3H3NX, onde X=NH, O, S tiveram suas seções de choque integrais apresentadas. As ressonâncias são identificadas e comparadas ao resultado experimental existente. Também discutimos as diferenças nas características das ressonâncias de cada molécula. Para todos os sistemas estudados, nossos resultados concordam bem com os reportados experimentalmente. Foi desenvolvido ainda um novo esquema para a construção do espaço de configurações.

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:24:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-11-27. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:47:35Z : No. of bitstreams: 1 000843902.pdf: 526265 bytes, checksum: 54002f2d209b43c762ae304c70ae8e85 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / No presente trabalho estudamos a energia eletrônica e a polarizabilidade da molécula de hidrogênio ionizada confinada em cavidades de diferentes volumes. Usamos o Método Variacional para realizar os cálculos de energia. O objetivo principal deste trabalho é ampliar o tratamento matemático já existente na literatura. Introduzimos uma função de onda molecular alternativa, que faz uso de apenas um parâmetro variacional para resolver o problema da molécula de hidrogênio ionizada confinada numa cavidade elíptica / In this work, we study the electronic energy and the polarizability of ion hydrogen molecule under confinement in different volumes of cavities. We use the Variational Method for estimate the energy. The aim of this work is to extend the mathematical treatment reported in the existing literature. We introduce an alternative molecular wave function, this wave function has only a variational parameter to solve the problem of ion hydrogen molecule under confinement in an elliptical cavity

Resumo: Esta tese será apresentada em duas partes: na primeira delas vamos mostrar o estudo da densidade de estados e da correlação energética em dois modelos para sistemas orgânicos desordenados. O transporte de portadores de carga nesses sistemas é caracterizado pela localização dos estados eletrônicos e pela desordem posicional e energética desses estados. A interação dos portadores de carga com os dipolos elétricos induzidos nas moléculas vizinhas, combinada a desordem posicional, dá origem a desordem energética. O primeiro sistema a ser tratado e baseado em uma rede cúbica simples, com adição de um pequeno vetor de deslocamento em cada sítio, sendo que este vetor de deslocamento é distribuído de acordo com uma distribuição Gaussiana. O segundo sistema é baseado em uma distribui¸c˜ao de esferas rígidas, geradas através de uma simulação de Monte Carlo. Nos dois casos, as energias dos sítios são definidas pela interação dos portadores de carga com dipolos elétricos induzidos nas moléculas vizinhas. Também modelamos o experimento de tempo de vôo usando uma equação mestra para obter a mobilidade em um sistema representado por esferas rígidas; com as energias devido a interação das cargas com dipolos elétricos induzidos. Analisamos a dependência da mobilidade com o campo elétrico aplicado. A segunda parte desta tese abordará o estudo do experimento do transiente de foto voltagem de superfície em TiO2 nano estruturado contendo moléculas de corantes adsorvidas na superfície. Um modelo usando uma equação mestra foi construído para descrever esse experimento. Este modelo envolve fenômenos de difusão de elétrons, recombinação de elétrons E íons bem como a presença de potencial eletrostático devido aos elétrons e íons.

Orientador: Elso Drigo Filho / Banca: João Ruggiero Neto / Banca: Frederico Vasconcellos Prudente / Resumo: No presente trabalho estudamos a energia eletrônica e a polarizabilidade da molécula de hidrogênio ionizada confinada em cavidades de diferentes volumes. Usamos o Método Variacional para realizar os cálculos de energia. O objetivo principal deste trabalho é ampliar o tratamento matemático já existente na literatura. Introduzimos uma função de onda molecular alternativa, que faz uso de apenas um parâmetro variacional para resolver o problema da molécula de hidrogênio ionizada confinada numa cavidade elíptica / Abstract: In this work, we study the electronic energy and the polarizability of ion hydrogen molecule under confinement in different volumes of cavities. We use the Variational Method for estimate the energy. The aim of this work is to extend the mathematical treatment reported in the existing literature. We introduce an alternative molecular wave function, this wave function has only a variational parameter to solve the problem of ion hydrogen molecule under confinement in an elliptical cavity / Mestre