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Estudo probabilístico da evolução adaptativa em populações estruturadas

GONÇALVES, Edilson de Araújo 13 June 2007 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-05T12:45:54Z No. of bitstreams: 1 Edilson de Araujo Goncalves.pdf: 586732 bytes, checksum: a681dd9d8537af4fa4a8e2cd099b6bb3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-05T12:45:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Edilson de Araujo Goncalves.pdf: 586732 bytes, checksum: a681dd9d8537af4fa4a8e2cd099b6bb3 (MD5) Previous issue date: 2007-06-13 / Adaptation of populations takes place with the occurrence and subsequent fixation of mutations that confer some selective advantage to the individuals that acquire it. For that reason, the study of the process of advantageous mutations fixation has a long history in the population genetics literature. Particularly, the previous investigations aimed to find out the main evolutionary forces affecting the strength of natural selection in the populations. In the current work, we investigate the dynamics of fixation of bene cial mutations in a subdivided population. The subpopulations (demes) can exchange migrants among their neighbors. The migration network is assumed to have either a random graph or a scale-free topology. We have seen that the migration rate drastically affect the dynamics of mutation fixation, despite of the fact that the probability of fixation is invariant on the migration rate, accordingly to Maruyama's conjecture.In addition, we have observed that a topological dependence of the adaptive evolution of the population exists when clonal interference becomes effective. / A adaptação de populações decorre do surgimento e posterior fixação de mutações benéficas que conferem alguma vantagem seletiva aos indivíduos que as adquirem. Por esta razão, o estudo do processo de fixação de mutações benéficas tem uma longa história na literatura de genética de populações. Particularmente, tais investigações objetivaram encontrar as principais forças evolucionárias que afetam a atuação da seleção natural nas populações. No presente trabalho, nós investigamos a dinâmica de fixação de mutações benéficas em uma população subdividida. As subpopulações, denominadas de demes, podem permutar migrantes entre seus vizinhos. Consideramos duas topologias para a rede de migração, uma tipo grafo aleatório e uma outra para rede livre de escala. Nós verificamos que a taxa de migração afeta drasticamente a dinâmica de fixação de mutações, apesar do fato da probabilidade de fixação ser independente da taxa de migração de acordo com a conjectura de Maruyama. Além disso, observamos uma influência da topologia da rede migratória na evolução adaptativa quando a interferência clonalse torna relevante.
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Separação de grupos produzidos em bovinos leiteiros através de técnicas multivariadas

SANTOS, Eucymara França Nunes 27 February 2009 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-05T16:18:11Z No. of bitstreams: 1 Eucymara Franca Nunes Santos.pdf: 2135134 bytes, checksum: 354f01bbca88dd1f124ff70f799207db (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-05T16:18:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eucymara Franca Nunes Santos.pdf: 2135134 bytes, checksum: 354f01bbca88dd1f124ff70f799207db (MD5) Previous issue date: 2009-02-27 / Many varieties of techniques were used: analysis of main components, analysis of grouping and discriminant analysis with the objective of separating the productive groups genetically divergents, using data regarded to the production of milk from three different genetic groups: 1/2 HG; 3/4 HG; 7/8 HG. The used variables were: group genetic, weigh of the milk (kg) produced in the day of the control, weight of the milk (kg) produced in the first it milks, weigh of the milk (kg) produced in the second it milks, weigh of the milk (kg) produced in the third it milks, the age of the cow (days) in the date of the control, the age of the cow to the childbirth and interval of childbirths. The objectives of the analysis of main components were: proposing the use of the most appropriate data and verifing the most important variables. Providing the explanation of 92,84% of the variability of the data with the transformed data and the elimination of five no significants variables. Four distance measures and five methods of groupings were used in the analysis of groupings aiming at the indication of the best distance and the best method. It was verified that the distance of Mahalanobis taken together to the methods of medium connection, simple connection and centroid are the most suitable to contain the differents genetic groups. The discriminant analysis was used to select the most important variables and to establish discriminant equations that makes possible the new animals inclusion. Two variables were selected, and one was eliminated, the group 1/2 HG has got more correct classifications and the presented function was regarding to the standardized data for its better classifications. / Foram utilizadas as técnicas multivariada: análise de componentes principais, análise de agrupamentos e análise discriminante com o objetivo de separar os grupos produtivos geneticamente divergentes, utilizando dados referente a produção de leite de três diferentes grupos genéticos: 1/2 HG; 3/4 HG; 7/8 HG. As variáveis utilizadas foram: grupo genético, peso do leite (kg) produzido no dia do controle, peso do leite (kg) produzido na primeira ordenha, peso do leite (kg) produzido na segunda ordenha, peso do leite (kg) produzido na terceira ordenha, idade da vaca (dias) na data do controle, idade da vaca ao parto e intervalo de partos. Os objetivos da análise de componentes principais foram: propor a utilização dos dados mais adequados e verificar as variáveis mais importantes. Proporcionando a explicação de 92,84% da variabilidade dos dados com os dados transformados e a eliminação de cinco variáveis não significativas. Foram utilizadas quatro medidas de distância e cinco métodos de agrupamentos na análise de agrupamentos objetivando indicar a melhor distância e o melhor método. Constatou-se que a distância de Mahalanobis juntamente aos métodos de ligação média, ligação simples e centróide são os mais indicados para agrupar os diferentes grupos genéticos. A análise discriminante foi utilizada para selecionar as variáveis mais importantes e estabelecer equações discriminantes que possibilite a inclusão de novos indivíduos. Foram selecionadas duas variáveis, e eliminada uma, o grupo 1/2 HG obteve mais classificações corretas e a função apresentada foi referente aos dados padronizados por possuir melhores classificações.
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Agrupamento de dados superparamagnético

ALMEIDA, Evert Elvis Batista de 26 February 2009 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-05T16:55:56Z No. of bitstreams: 1 Evert Elvis Batista Almeida.pdf: 8214568 bytes, checksum: 34db767d9a38f53b7b60aaf92ca37a20 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-05T16:55:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Evert Elvis Batista Almeida.pdf: 8214568 bytes, checksum: 34db767d9a38f53b7b60aaf92ca37a20 (MD5) Previous issue date: 2009-02-26 / We applied a non-supervisioned data clustering technique based on a map of the problem into an inhomogeneous granular magnet problem. The physical behavior of the magnet is studied through the usual Monte Carlo method. Each data item is described by a set of numerical attributes, interpreted as points in a multiple-dimensional Euclidian space. The mapping consists in associating a Potts spin to each data point. The physical system is described by a disordered Potts Hamiltonian with several states with an exponentially decaying interaction among spins. The magnet reaches a superparamagnetic state at high temperatures in which the spins in certain grains are strongly correlated whereas the grains are loosely linked. In this way, each grain corresponds to a group or cluster. We implemented the method in a microcanonical ensemble where the conserved total energy is the control parameter. The temperature is calculated during the simulation and, besides thermodynamic stable states, it is possible to sample unstable and metastable state as well. We work with three artificial multiple-dimensional data set and a four-dimensional real data set. We obtained good results in all cases and discuss some issues concerning the microcanonical implementation of the superparamagnetic data clustering. / Aplicamos um método não supervisionado de agrupamento de dados para identificar padrões em vários conjuntos dados. A técnica baseia-se em um mapeamento do problema em um sistema magnético granular heterogêneo, cujo comportamento é investigado através de métodos Monte Carlo comumente empregado no campo da física estatística. Cada objeto é descrito por um conjunto de atributos de valores numéricos, interpretados como um ponto em um espaço euclidiano de dimensão apropriada. O mapeamento consiste em associar a cada item do conjunto, um ponto no espaço, um spin de Potts. O sistema físico é descrito por um hamiltoniano de Potts de muitos estados, no qual a interação entre os spins decai exponencialmente com a distância entre eles. Itens semelhantes, próximos, interagem fortemente enquanto que aqueles mais distantes entre si interagem apenas fracamente. O magneto atinge um estado superparamagnético para temperaturas suficientemente altas, no qual os spins de alguns grãos permanecem fortemente correlacionados, porém, os grãos estão fracamente ligados entre si. Cada grão corresponde a um grupo. Implementamos o método no ensemble microcanônico, no qual a energia total é conservada e constitui o parâmetro de controle. Nesse caso, a temperatura é calculada ao longo do processo e podemos acessar estados termodinamicamente estáveis, metaestáveis, bem como, instáveis. Trabalhamos com três conjuntos artificiais de dados, em duas e três dimensões, e um conjunto de dados reais com quatro dimensões. O desempenho do método foi satisfatório em todos os casos investigados.
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Modelos lineares generalizados aplicados à filariose bancroftiana

PEREIRA, Fábio Cavalcanti 22 February 2006 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-05T18:07:15Z No. of bitstreams: 1 Fabio Cavalcanti Pereira.pdf: 280467 bytes, checksum: 8086a624ad0323f2488ae7dfba5c17d2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-05T18:07:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fabio Cavalcanti Pereira.pdf: 280467 bytes, checksum: 8086a624ad0323f2488ae7dfba5c17d2 (MD5) Previous issue date: 2006-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Bancroftian filariasis is a major public health problem in the tropics with 100 millions of people infected. It is a vector born infection and it is cause by Wuchereria bancrofti a parasite that lives in the human lymphatic vessels and lymph nodes affecting all ages and gender. The basic damage of the lymphatic system is lymphangiectasia which leads to lymphatic dysfunction producing lymphedema (elephantiasis), hydroecele and fistulization syndromes (chyluria, chylocele and lymph scrotum). The aim of this investigation was to study the relationship between the risk of developing fistulation syndrome and several parameters, such a amount of fat on the diet of patients assisted at Center for Teaching, Research and Tertiary Referral for bancroftian filariasis (NEPAF - Federal University of Pernambuco) in Recife, Brazil. The present study was carried out using the generalized linear models (GLMs) for the fitting of logistic model with the statistic program S-PLUS. / A Filariose Bancroftiana, ocorre como um dos maiores problemas de saúde púbica nos trópicos e afeta cerca de 100 milhões de indivíduos. Ë transmitida por um mosquito e causada pela Wuchereria bancrofti que vive nos vasos linfáticos e linfonodos dos seres humanos de todas as idades e ambos os sexos. O substrato anátomo-patológico da doença é a linfangiectasia que leva a uma disfunção linfática produzindo o linfedema (elefantíase), a hidrocele, e as síndromes de fistulização (quilúria, quilocele e linfoescroto). O objetivo dessa investigação se foi estudar a relação entre o risco de desenvolvimento das síndromes fistulizantes e vários parâmetros, tais como a quantidade de gordura na dieta de pacientes atendidos no Núcleo de Ensino, Pesquisa e Assistência em Filariose – NEPAF, Centro de Ciências da Saúde, UFPE. O presente estudo foi realizado usando-se a teoria dos modelos lineares generalizados (MLGs) para ajustar um modelo logístico para os dados da doença usando o programa estatístico S-PLUS.
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Estimativa de crescimento em altura de Leucena [Leucaena leucocephala (Lam.) de Wit.] por meio do modelo ARIMA

SILVA, Janilson Alves da 31 March 2008 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-06T18:24:51Z No. of bitstreams: 1 Janilson Alves da Silva.pdf: 842304 bytes, checksum: 7b8a55eb0872b15792c1c68f9f36475b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-06T18:24:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Janilson Alves da Silva.pdf: 842304 bytes, checksum: 7b8a55eb0872b15792c1c68f9f36475b (MD5) Previous issue date: 2008-03-31 / The main objective of this work is to use models ARIMA to adjust the estimates of growth in height of leucaena ( emph () Leucaena leucocephala (Lam.) de Wit.) Agreste of Pernambuco. The experiment was conducted at the Experimental Station Company Research Pernambuco Agropecuária - IPA, the municipality of Caruaru - PE. 544 trees were used to leucaena variety, of Hawaii (cv. K8), divided into 24 treatments with 24 repetitions. The sources of variations were: levels of phosphorus, organic compounds and urban waste inoculation with rhizobia (NFB 466 and 473) applied alone. Were considered for this study 5 years of measurements and used the Chapman-Richards model to remove the trend in the series study, after removal of the new trend set S(t) was modeled using models ARIMA (1,1,0), (1,1,1) (1,1,2) and (1,1,3). However, the results were not superior to traditional non-linear models, often used in modeling the growth of forests. / O principal objetivo deste trabalho é utilizar modelos ARIMA para o ajuste das estimativas de crescimento em altura de leucena (Leucaena leucocephala (Lam.) de Wit.), no Agreste de Pernambuco. O experimento foi conduzido na Estação Experimental da Empresa Pernambucana de Pesquisa Agropecuária - IPA, no município de Caruaru - PE. Foram utilizadas 544 árvores de leucena, da variedade Hawaii (cv. K8), divididas em 24 tratamentos com 24 repetições. As fontes de variações estudadas foram: níveis de adubação fosfatada composto orgânico de resíduo urbano e inoculação de rizóbio (NFB 466 e 473) aplicadas isoladamente. Foram consideradas para esse estudo 5 anos de medições e utilizado o Modelo de Chapman-Richards para remover a tendência da série em estudo, após remoção da tendência a nova série St foi modelada utilizando modelos ARIMA (1,1,0);(1,1,1)(1,1,2) e (1,1,3). Entretanto, os resultados não foram superiores aos dos modelos não-lineares tradicionais, frequentemente usados na modelagem do crescimento de florestas.
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Análise de sobrevivência: uma visão de risco comportamental na utilização de cartão de crédito

FERREIRA, Joanne Medeiros 30 March 2007 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-06T18:43:41Z No. of bitstreams: 1 Joanne Medeiros Ferreira.pdf: 461109 bytes, checksum: 7e0630c612cd2bf45e62ee0e52183ac4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-06T18:43:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joanne Medeiros Ferreira.pdf: 461109 bytes, checksum: 7e0630c612cd2bf45e62ee0e52183ac4 (MD5) Previous issue date: 2007-03-30 / Through the use of statistical techniques, this paper aims to present the behavior of credit card consumers, as well as to add value to the process of strategical marketing in a financial institution. For doing so, we present methodologies based on the techniques of logistical regression and survival analysis. Such tools are capable of foreseeing the behavior of customers, and thus focus on certain strategies in order to place resources that may hinder their migration to other financial institutions. The use of survival analysis methods makes it possible to analyze which variant presents evidence of customer migration; the logistical regression technique will be used in order to compare and validate the models hereby proposed, besides showing whether there are other variants that also demonstrate the closing of credit card accounts by the customers. / Este trabalho visa, através de técnicas estatísticas, apresentar metodologicamente o comportamento dos consumidores do produto cartão de crédito e agregar valor ao processo de marketing estratégico de uma instituição financeira. Apresentam-se metodologias, baseadas em técnicas como analise de sobrevivência e regressão logísticas. Estas ferramentas são capazes de prever o comportamento de clientes e assim focar estratégias de modo a alocar recursos para impedir a migração dos mesmos para instituições concorrentes. Com a técnica de Analise de Sobrevivência clássica será possível analisar o tempo de vida da conta cartão e as variáveis que apresentam indícios de migração para concorrência e com a técnica de regressão logística será feita uma comparação afim de validação do modelo, além de mostrar se existem outras variáveis que também demonstram o encerramento do produto cartão por parte do cliente.
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Discriminação de espécies do gênero Selene (Carangidae) da costa Nordeste do Brasil,utilizando técnicas de morfometria geométrica / Discrimination of Selene species (Family Carangidae) from Northeastern brazilian coast, using techniques of geometric morphometry

LIMA FILHO, José de Melo 23 February 2004 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-06T19:02:58Z No. of bitstreams: 1 Jose de Melo Lima Filho.pdf: 1580839 bytes, checksum: 922a898621f152e5c160d41a8f459629 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-06T19:02:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose de Melo Lima Filho.pdf: 1580839 bytes, checksum: 922a898621f152e5c160d41a8f459629 (MD5) Previous issue date: 2004-02-23 / Species of the Carangidae family are important components of fish fauna during all phases of the life span. Both Selene spixii (full moon fish) Spix and Agassiz (1831) and Selene Vomer (Atlantic look down) Linnaeus (1758) range in the Western Atlantic Ocean from New Scotia (Canada) to South America including the Gulf of Mexico. They are found in coastal shallow waters, either on hard or sandy bottoms. They usually establish schoals, but are also observed in small groups or pairs. They feed on small crustaceans, shrimps, fish and worms. Their flesh tastes good; these species are trade fresh. They can also be reared, they are highly prized in sport fishing. Both species are very similar in early phases of their life cycle, which renders the identification at the species level quite difficult. The aim of the present study was to carry out analyses of the pattern of morphological differentiation between the above mentioned species of Selene genre, using as method 1, techniques of multivariate analysis of the 16 distances between landmarks, defined in the truss net; and as method 2, the relative warps analysis (thin plate spline function) on the coordinates of 9 landmarks. Morphometric data were obtained from scanner digitalized images and the coordinates of the landmarks by using tpsdigw program, the distances were obtained from a program developed in language C and the relative warps analysis from tpsRelw program. Similarities were discriminated between the studied species using both Principal Components Analysis, Canonic as well as Discriminant Analyses based on morphometric features. The landmarks usedwere: 1. tip of the nose, 2. base of pelvic fin, 3. beginning of the first dorsal fin, 4. beginning of anal fin, 5. beginning of the second dorsal fin, 6. end of anal fin, 7.end of the second dorsal fin, 8. beginning of lower caudal fin, 9. beginning of upper caudal fin. According to method 1, measures D 1-3 and D 3-4 were the most important whereas for method 2, among shape variations, the one which contributes the most was the component x. / Os Carangidae são importantes componentes da ictiofauna em todas as fases da vida e as espécies Selene spixii (Lua-do-Caribe) Spix e Agassiz (1831) e Selene vomer (galo–de-penacho) Linnaeus (1758) estão distribuídas pelo Atlântico Oeste de Nova Escócia (Canadá) ao longo das costas do Golfo do México até a América do Sul. Esses peixes são encontrados em águas rasas costeiras, sobre fundos duros ou arenosos. Vivem em cardumes, mas também podem ser observados em pequenos grupos ou em pares. Alimentam-se de pequenos caranguejos, camarões, peixes e poliquetas. Sua carne apresenta um sabor excelente, sendo comercializado fresco. Estes peixes podem ser cultivados em aquários, são valorizados na pesca esportiva, e ambas espécies apresentam grande semelhança na fase jovem o que dificulta a identificação. O objetivo deste trabalho foi analisar os padrões de diferenciação morfológicos entre as espécies do gênero Selene, utilizando como método 1, técnicas de análise multivariada das 16 distâncias entre marcos anatômicos, definidas na rede de treliças; e como método 2, a análise de deformações relativas (função thin plate spline) sobre as coordenadas de 9 marcos anatômicos. Os dados morfométricos foram obtidos em imagens digitalizadas por scanner, as coordenadas dos marcos anatômicos pelo programa tpsDig, as distâncias obtidas por programa desenvolvido em linguagem C e a análise de deformações relativas através do programa tpsRelw. Pretendeu-se discriminar similaridades entre as duas espécies por meio de Componentes Principais, Análise de Variáveis Canônicas e Análise Discriminante com base em características morfométricas. Foram utilizados os seguintes marcos anatômicos: 1. ponta do focinho; 2. base da nadadeira ventral (pélvica); 3. início da primeira nadadeira dorsal; 4. início da nadadeira anal; 5. início da segunda nadadeira dorsal; 6. final da nadadeira anal; 7. final da segunda nadadeira dorsal; 8. início da nadadeira caudal inferior; 9. início da nadadeira caudal superior. No método 1, as medidas D 1-3 e D 3-4 foram as mais importantes, enquanto que no método 2, dentre as variações de forma, a que mais contribuiu foi a componente uniforme x.
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Avaliação de autocorrelações e complexidade de séries temporais climáticas no Brasil

SILVA, José Rodrigo Santos 19 September 2014 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-07T11:52:38Z No. of bitstreams: 1 Jose Rodrigo Santos Silva.pdf: 13129069 bytes, checksum: b427ff42ec7918c3d0cf7f63798ed648 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-07T11:52:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose Rodrigo Santos Silva.pdf: 13129069 bytes, checksum: b427ff42ec7918c3d0cf7f63798ed648 (MD5) Previous issue date: 2014-09-19 / The objective of this study was to uncloak the dynamic of climate of Brazil, seeking to measure the regularity and the long range autocorrelation of daily climate series of temperature of air (average, maximum, minimum, and temperature range), relative humidity of air average and wind speed average. The data were obtained by Instituto Nacional de Meteorologia (INMET), at 264 meteorological stations, in the period from January 1990 to December 2012. We use the Detrended Fluctuation Analysis to realize the estimation of the Hurst exponent, the Multiscale Sample Entropy to estimating the entropy of series and the Kriging to interpolate the estimates made. We observed that higher latitudes tend to attenuate the mean of temperatures of air maximum, minimum and average, but increase the variability of the same. This inversion of the magnitudes of the mean and standard deviation is also observed in the relative humidity of air. The means of the estimated Hurst exponents estimated for Brazil were 0.81, 0.79, 0.81, 0.77, 0.83 and 0.64, and the estimated Sample Entropy, 1.39, 1.78, 1.46, 1.41, 1.56 and 1.66, respectively for average, maximum and minimum temperatures of air, temperature range, relative humidity of air average and wind speed average. The values of the estimated Hurst exponents showed a positive correlation with latitude in the temperature variables studied. Such a correlation was not observed in other variables. This a correlation was not observed in other variables. The regularities of climate series in Brazil were medians. Spatially, the greatest changes occurred in estimates of entropies in the scale 1 to 2 of , in the Multiscale Sample Entropy. As from ≥2 the changes observed were more subtle. We observe the influence of the Equatorial Continental air mass in entropy of temperatures daily average and maximum of air. The climatic factor of altitude influenced with more frequently in the observed results, mainly on temperature variables. In some cases, the continentality and the air masses were also identified as important factors in characterizing the spatial distribution of estimates made. / O objetivo deste estudo foi desvendar a dinâmica climática do Brasil, buscando mensurar a regularidade e a autocorrelação de longo alcance em séries climáticas diárias de temperatura do ar (média, máxima, mínima, e amplitude térmica), umidade relativa média do ar e velocidade média diária do vento. Os dados foram obtidos pelo Instituto Nacional de Meteorologia, em 264 estações meteorológicas, no período de janeiro de 1990 a dezembro de 2012. Utilizamos o Detrended Fluctuation Analysis para realizar a estimativa do expoente de Hurst, o Multiscale Sample Entropy para as estimativas da entropia das séries e o Kriging para a interpolação das estimativas realizadas. Observamos que maiores latitudes tendem a atenuar as médias das temperaturas máxima, mínima e média do ar, porém aumentam a variabilidade das mesmas. Esta inversão entre as magnitudes da média e do desvio padrão também é observado na umidade relativa média do ar. As médias dos expoentes de Hurst estimados para todo o Brasil foram 0,81; 0,79; 0,81; 0,77; 0,83 e 0,64; e do Sample Entropy estimado, 1,39; 1,78; 1,46; 1,41; 1,56 e 1,66, respectivamente para séries diárias de temperatura média, máxima e mínima do ar, amplitude térmica do ar, umidade relativa média do ar e velocidade média do vento. Os valores do expoentes de Hurst estimados apresentaram uma correlação positiva com a latitude nas variáveis de temperatura do ar estudadas. Tal correlação não foi observada nas demais variáveis. As regularidades das séries climáticas no Brasil foram medianas. Espacialmente, as maiores alterações nas estimativas das entropias ocorreram na escala 1 para a 2 de , no Multiscale Sample Entropy. A partir de ≥2 as mudanças observadas foram mais sutis. Observamos influência da massa de ar Equatorial Continental na entropia das temperaturas do ar média e máxima diárias. O fator climático da altitude atuou com maior frequência sob os resultados observados, principalmente nas variáveis de temperatura. Em alguns casos, a continentalidade e as massas de ar também foram apontados como fatores importantes na caracterização da distribuição espacial das estimativas realizadas.
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Otimização do método área-velocidade para estimação de vazão fluvial usando MCMC

SILVA, José Rodrigo Santos 18 February 2011 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-07T12:07:15Z No. of bitstreams: 1 Jose Rodrigo Santos Silva.pdf: 4054411 bytes, checksum: c22cd915da573fd5a5ce7b45feb85a0f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-07T12:07:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose Rodrigo Santos Silva.pdf: 4054411 bytes, checksum: c22cd915da573fd5a5ce7b45feb85a0f (MD5) Previous issue date: 2011-02-18 / The velocity-area method is a standard procedure for measurement of river discharge, with wide application in hydrometric studies, standardized at the international level by the norm ISO 748:2007 of the International Standards Organization. This method requires measurement of velocity at several verticals of the river, at different depths for each vertical. In general, a relatively high number of measurements is necessary do determine the discharge. Recently a technique was proposed which results in a robust estimate of river discharge using a reduced number of measurement points, based on elementary properties of fluid dynamics, stemming from the Navier-Stokes equations, and the use of continuous interpolation between the verticals for calculating velocity across the entire river cross section. In the present work the Monte Carlo Markov Chain (MCMC) method is used to search for the optimum positions for velocity measurement, with the objective of reducing the number of measurement points without significant loss of precision, and therefore maximizing the efficiency of the estimate. A dedicated computer algorithm was developed in C programming language and applied to measurements collected on the river Exu, state of Pernambuco, Brazil, in April 2008. It is found that the discharge estimates with three or more measurement points exhibit variations well within uncertainty limits corresponding to the full 27 point estimate using the traditional velocity-area method. Simulation results indicate that the best positions for velocity measurement are close to the surface, and that significant savings in cost and labor may be accomplished by positioning the measurements at strategic points, without precision loss. / O método área-velocidade é um procedimento utilizado para medir a descarga de rios. Esta é uma técnica bastante difundida na hidrometria, e é normatizada internacionalmente pela ISO 748:2007 da International Standard Organization. Este método requer a medição da velocidade em diversas verticais do rio, e em diferentes profundidades de cada vertical. Em geral é necessário um número relativamente elevado de medições para determinar a vazão. Recentemente foi proposta uma técnica que resulta em uma estimativa robusta da descarga fluvial com reduzido número de pontos de medida, que se baseia nas propriedades básicas da dinâmica de fluidos e nas equações de Navier- Stokes, além de utilizar uma interpolação continua para o cálculo das velocidades em toda a seção vertical. No presente trabalho, o método Monte Carlo Markov Chain (MCMC) é utilizado na busca da melhor posição das medidas de velocidade a serem realizados na seção vertical do rio, tal que seja possível reduzir o número de medições e maximizar a eficiência da estimativa. O algoritmo foi desenvolvido em linguagem C e aplicado em medidas de velocidade colhidas no riacho Exu, no estado de Pernanbuco, em abril de 2008. Estimativas de vazão realizadas a partir de 3 medidas de velocidade sobre a seção vertical mostraram-se eficientes, apresentando diferenças da estimativa obtida com 27 pontos através do método área-velocidade tradicional dentro de limites de incerteza. Os resultados de simulação indicam que os melhores locais de medição da velocidade sob a seção vertical situam-se perto da superfície do rio, e que uma economia significativa no custo e no trabalho pode ser conseguida através posicionamento dos pontos de medição em locais estratégicos, sem perda da precisão da estimativa.
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Uma abordagem estocástica da evolução do sexo e recombinação

SILVA, Juliana Kátia da 16 February 2009 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-07T12:58:08Z No. of bitstreams: 1 Juliana Katia da Silva.pdf: 2299995 bytes, checksum: 786d6f38a091474c4b7f97d00ef069a9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-07T12:58:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Juliana Katia da Silva.pdf: 2299995 bytes, checksum: 786d6f38a091474c4b7f97d00ef069a9 (MD5) Previous issue date: 2009-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The understanding of the central mechanisms favouring sex and recombination in real populations is one of the fundamental issues in evolutionary biology. Based on a previous stochastic formulation to the study of sex, here we aim to investigate the conditions under which epistasis favours the fixation of the sexual mode of reproduction in a given population. Besides, we try to identify the evolutionary forces which contribute to this process. Our model considers a finite population model which assumes the existence of a recombination modifier allele which can activate the recombination mechanism. We have found that sex is very little favoured in a scenario of antagonistic epistasis, and this advantage only takes place in a narrow range of values of the selection coefficient, sd. On the other hand, synergistic epistasis favours recombination in a very broad domain. However, the major mechanism contributing to the spreading of the modifier allele depends on the range of values of sd. At large sd background selection favours recombination since it increases the efficacy of selection, while at low sd Muller’s ratchet is the leading mechanism. / O entendimento dos mecanismos centrais que favorecem o sexo e a recombinação nas populações é um das questões fundamentais, e que ainda se encontra indefinida, na Biologia Evolucionária. Diversos modelos e teorias têm sido propostos de forma a melhor compreender a predominância do sexo e recombinação na natureza. Uma teoria de sucesso deve ser capaz de mostrar que existem mecanismos que contrabalanceiem os custos imediatos associados à reprodução sexuada. Aqui nesta dissertação de mestrado fazemos uma extensão de um modelo estocástico para o estudo do sexo, de forma agora a verificarmos em que condições a epistasia (interação entre genes) favorece a fixação do modo de reprodução sexuado, e que mecanismos evolucionários contribuem para isto. Consideramos um modelo de população finita que assume a existência de um alelo modificador de recombinação que é então inserido em uma população inicialmente assexuada. O destino desse alelo é então analisado. Verificamos que o sexo é pouco favorecido quando consideramos o relevo com epistasia antagonística, tornando-se vantajoso em um pequeno intervalo de valores do parâmetro seletivo sd. Já no caso da epistasia sinergística, observamos uma grande vantagem para a recombinação em duas regiões distintas: uma para pequenos valores de sd, e neste caso é a Catraca de Muller o mecanismo responsável pela vantagem; e na segunda região para grandes valores de sd, o mecanismo responsável é o efeito Hill-Robertson, em que a recombinação atua de forma a aumentar a eficácia da seleção purificadora.

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