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Mapeamento de QTLs para teor de proteína em feijoeirocomum (Phaseolus vulgaris L.) / Mapping QTLs for protein content in common beans (Phaseolus vulgaris L.)LEÃO, Ariane Castro Mendes 15 December 2006 (has links)
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Previous issue date: 2006-12-15 / The common bean besides being one of the basic meals of brazilian´s
population, it is one of the main products that provide protein in the nutritional
diet from the society share which is economically less favorable. The
identification of molecular markers linked to controlling genes of the protein
content in common beans (Phaseolus vulgaris L.) is a very important tool to
help breeding programs, raising the efficiency and agility. This way, this work
was made with two main goals: a) to map SSR and RAPD markers linked to loci
(QTLs) that control protein content in two generations of a segregating
population of common beans and b) to compare detection procedures of
markers linked to QTLs using the ANOVA method and the process of interval
mapping. For that reason, 94 families were taken from the F2 generation and 90
families from the F2:3 generation derived from the cross of genitors CNFC 7812
e CNFC 8056. Results indicated that there is the possibility of identifying
molecular markers related to protein content in common beans, utilizing both
detection procedures. The ANOVA method identified a greater number of QTLslinked
markers than the process of interval mapping in both generations. There
was coincidence between the identified loci obtained with the two methods for
each generation. Loci that were associated with protein content were different
for the F2 and F2:3 generations. However, there was a stable detection of a
genomic region of the linkage group 4, indicating a possible role of this region of
the common bean genome in the control of seed protein content. The proportion
of the trait s phenotypic variation explained by QTLs varied from 5,5% to 9,5%,
considering both generation. / O feijão, além de se constituir um dos alimentos básicos da população
brasileira, é um dos principais produtos fornecedores de proteína na dieta
alimentar dos estratos sociais economicamente menos favorecidos. A
identificação de marcadores moleculares ligados a genes controladores de teor de
proteína em feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma importante ferramenta
para auxiliar os programas de melhoramento, aumentando sua eficiência e
agilidade. Desta forma, este trabalho foi realizado com os objetivos: a) mapear
marcadores SSR e RAPD ligados aos locos gênicos (QTLs) controladores de teor
de proteína em duas gerações de uma população segregante de feijoeiro-comum
e b) comparar os processos de detecção dos marcadores ligados aos QTLs
utilizando o método de ANOVA e o método de mapeamento por intervalo. Para
tanto, foram utilizadas 94 famílias da geração F2 e 90 famílias da geração F2:3
provenientes do cruzamento entre os genitores CNFC 7812 e CNFC 8056. Os
resultados mostraram a possibilidade de identificar marcadores moleculares
ligados ao teor de proteína em feijoeiro, utilizando ambos os métodos. O método
de ANOVA identificou mais marcadores ligados a QTLs do que o processo de
mapeamento por intervalo em ambas as gerações. Houve concordância entre os
locos identificados pelos dois métodos para cada geração. Os locos que foram
associados com o teor de proteína foram distintos para as gerações F2 e F2:3.
Entretanto, houve uma detecção estável de uma região genômica do grupo de
ligação 4, indicando um possível papel desta região do genoma do feijoeiro no
controle do teor de proteína no grão. A proporção da variância fenotípica desta
característica explicada pelos QTLs variou de 5,5% a 9,5%, considerando as duas
gerações.
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Emissão de fluorescência e produção de massa seca em feijão e soja em função da aplicação de nitrogênio em cobertura / Emission of the fluorescence and production dry matter in bean and soybean a function of application of nitrogen in covareageMAFEI, Maloní Montanini 29 June 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-06-29 / Nitrogen is considered an essential element for plants, since it is involved in the composition of various biomolecules such as ATP, NADH, NADPH, proteins, enzymes and chlorophyll. The chlorophyll is a pigment from the leaves of plants, which is
directly associated with the potential of photosynthetic activity, as well as the nutritional status of the plant. The use of the variable fluorescence of chlorophyll has been
widespread, especially in the study of photosynthetic capacity of plants, as a nondestructive method that allows qualitative and quantitative analysis of the absorption
and utilization of light energy by photosynthetic apparatus. The objective of this research was to quantify the emission of the chlorophyll a fluorescence (F0, initial fluorescence; Variable-Fv, Fm-Maximum, Terminal-Ft and Efficiency Fotoquímica- Fv/Fm) in photosystem II and the dry matter in bean (Phaseolus vulgaris L .) and soybean (Glycine max (L.) Merr.) submitted the application of nitrogen in the form of
ammonium sulfate in coverage. The experimental design was completely randomized in factorial formed by two legumes, two readings and two levels of nitrogen N0 = 0.000 g.kg-1 (control) and N1 = 0,060 g.kg-1. Nitrogen fertilization with ammonium sulfate in coverage influenced the minimum fluorescence (F0) and not influenced by other variables of fluorescence in bean and soybean. Increased the dry mass of branches for the bean, to have influenced the increase in soybean dry masses of shells of pods and number of pods / O nitrogênio é considerado um elemento essencial para as plantas, visto que ele está envolvido na composição de várias biomoléculas como ATP, NADH, NADPH, proteínas, enzimas e clorofila. A clorofila está diretamente associado com o potencial da atividade fotossintética, assim como, o estado nutricional da planta. O uso de variáveis da fluorescência das clorofilas tem sido difundido, principalmente no estudo da
capacidade fotossintética das plantas, por ser um método não-destrutivo que permite a análise qualitativa e quantitativa da absorção e aproveitamento da energia luminosa pelo aparelho fotossintético. O objetivo desta pesquisa foi quantificar a emissão de fluorescência pela clorofila a (Fluorescência Inicial (F0); Variável (Fv); Máxima (Fm); Terminal (Ft) e Máxima Eficiência Fotoquímica (Fv/Fm) no fotossistema II e a massa seca em feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) e soja (Glycine max (L.) Merr.), submetidos à
aplicação de nitrogênio na forma de sulfato de amônio, em cobertura. O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado, em fatorial formado pelas duas leguminosas, duas leituras e dois níveis de nitrogênio N0 = 0,000 g.kg-1
(testemunha) e N1 = 0,060 g.kg-1. A adubação nitrogenada com sulfato de amônio em cobertura influenciou a fluorescência mínima (F0) e não influenciou nas demais variáveis da fluorescência em feijoeiro e soja. Proporcionou aumento das massa seca dos ramos para o feijoeiro, já para soja influenciou no aumento das massas secas das cascas das vagens e número de vagens
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Manejo da irrigação do feijoeiro cultivado em plantio direto no sistema integração lavoura-pecuária / Irrigation management of no-tillage common bean crop in farming-livestock systemCUNHA, Paulo César Ribeiro da 26 February 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-02-26 / The water is becoming a resource more and more scarce, with growing strategic importance in the sections environmental, economical, social and political. The irrigated agriculture is responsible for considerable portion of the agricultural production, however, it is the activity that more it demands water. In the irrigated areas, one of the most important factors is the determination of the water levels for replacement of the losses happened in function of the evapotranspiration, with consequent it gets better of the productive efficiency. Inside of this context he becomes evident the need of administration of the applied water for the irrigation. The objective of this work was to evaluate the acting of three irrigation management methods in beans crop cultivated in direct planting in the system integration farming-cattle; the methods were appraised as for the estimate of the evapotranspiration, levels and irrigation frequency, productivity of grains and their components. It was also evaluated in the periods annual, dry and rainy season, the acting of methods of determination of the coefficient of the class A pan (Kp), and still, the possibility of adoption of a fixed value for such variable. The evaluation was made within the dear evapotranspiração with class A pan using the appraised coefficients and the dear for the standard method Penman-Monteith (FAO 56). The work was driven in the experimental area of Capivara farm, Rice and Beans Research Center in Santo Antônio de Goiás, Goiás State, Brazil. In the evaluation of the irrigation management methods the common bean crop was used (Phaseolus vulgaris L.) cv. BRS Supremo; the appraised methods were tensiometry, class A pan and Penman-Monteith. There were significant differences as for the productivity, number of grains for plant and height of plants in relation to the irrigation management methods, tends the class A pan propitiated the obtaining of larger yield, due to the largest total water, and of the largest irrigation frequencies, the management for tensiometry caused reduction of 40% in the total demand of water of the beans crop, however, with significant reductions in the productivity, tends the class A pan overestimated and of the underestimated tensiometry the total water esteemed by the standard method FAO 56 Penman-Monteith. Independent of Kp, the method of the class A pan overestimated the evapotranspiration obtained with Penman-Monteith. For the climatic conditions in which he took place the work, the best method of determination of Kp, for the estimate of ET0 in the annual period was it of Pereira et al. (1995). For the dry season it was it proposed by Cuenca (1989). In the rainy season all of the methods presented low actings, however, Pereira et al. (1995) method it was shown more efficient. It was observed that the method of the class A pan is not efficient to esteem ET0 in the rainy season. The analyses showed that the adoption of a fixed and constant Kp in 0,70 showed in high acting, mainly in the annual and dry seasons. / A água está se tornando um recurso cada vez mais escasso, com importância estratégica crescente nos setores ambiental, econômico, social e político. A agricultura irrigada é responsável por considerável parcela da produção agrícola, entretanto, é a atividade que mais demanda água. Nos cultivos irrigados, um dos fatores mais importantes é a determinação das lâminas de água para reposição das perdas ocorridas em função da evapotranspiração, com consequente melhora da eficiência produtiva. Dentro deste contexto torna-se evidente a necessidade de gerenciamento da água aplicada pela irrigação. O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho de três métodos de manejo da irrigação no feijoeiro cultivado em plantio direto no sistema integração lavoura-pecuária; os métodos foram avaliados quanto à estimativa da evapotranspiração, lâminas e freqüência de irrigação, produtividade de grãos e seus componentes. Também se avaliou nos períodos anual, seco e chuvoso, o desempenho de métodos de determinação do coeficiente do tanque Classe A (Kp), e ainda, a possibilidade de adoção de um valor fixo para tal variável. A avaliação foi feita com base na evapotranspiração estimada com tanque Classe A usando os coeficientes avaliados e a estimada pelo método padrão Penman-Monteith (FAO 56). O trabalho foi conduzido na área experimental da Fazenda Capivara da Embrapa Arroz e Feijão em Santo Antônio de Goiás, Goiás, Brasil. Na avaliação dos métodos de manejo utilizou-se o feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) cv. BRS Supremo; os métodos avaliados foram tensiometria, tanque Classe A e Penman-Monteith. Houve diferenças significativas quanto à produtividade, número de grãos por vagem e altura da planta em relação aos métodos de manejo, tendo o tanque Classe A propiciado a obtenção de maiores produtividades, em decorrência da maior lâmina total, e das maiores frequências de irrigação. O manejo por tensiometria ocasionou redução de 40% na demanda total de água do feijoeiro, porém, com reduções significativas na produtividade. O tanque Classe A estimou lâminas maiores e da tensiometria lâminas menores em relação às lâminas totais estimadas pelo método padrão FAO 56 Penman-Monteith. Independente do Kp, o método do tanque Classe A estimou maior evapotranspiração em relação ao método de Penman-Monteith. Para as condições climáticas nas quais se realizou o trabalho, o melhor método de determinação do Kp, para a estimativa da ET0 no período anual foi o de Pereira et al. (1995). Para o período seco foi o proposto por Cuenca (1989). No período chuvoso todos os métodos apresentaram baixos desempenhos, no entanto, o método de Pereira et al. (1995) mostrou-se mais eficiente. Observou-se que o método do tanque Classe A não é eficiente para estimar a ET0 no período chuvoso. As análises mostraram que a adoção de um Kp fixo e constante em 0,70 resultou em elevado desempenho, principalmente nos períodos anual e seco.
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Estado nutricional e normas DRIS para o feijoeiro irrigado em Cristalina, Goiás / Nutritional status and DRIS norms for irrigated beans in Cristalina, GoiásMesquita, Marcos Antonio Machado 30 August 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-08-30 / The cultivation of irrigated common bean is an important economic activity for the city
of Cristalina, Goias. The proper management of manure promotes the production of safer,
contributing to the economic and environmental sustainability. The Diagnosis and
Recommendation Integrated System (DRIS) was developed to provide a diagnosis of the
nutritional status of cultivated plants, helping the decision on fertilizer recommendation for crops,
being based on the balance of essential nutrients to plants. However, this study aimed to establish
reference standards DRIS and assess the nutritional status of irrigated common bean grown in the
municipality of Cristalina, GO. In this, there were 86 samples of soil samples, 86 samples from leaf
samples and 82 samples of common bean yield in 2009/2010. With the data organized into a
database. The database was analyzed from two aspects known as the traditional methods of Critical
Levels and Concentration Ranges, and also by the method of DRIS. The attributes B, S, MO and T
were considered insufficient, while nutrients Cu, Fe, Mn, Zn, K and P were considered excessive in
the soil. Fe, Zn and Mo were the nutrients in the leaves with smaller amplitudes located within the
range considered appropriate, nutrients S, Ca and Cu were considered insufficient, and the P, N,
and K have been considered excessive in the plant, comparing the criteria established. The DRIS
method was more sensitive to diagnose nutritional problems, especially for micronutrients / O cultivo do feijoeiro comum irrigado representa uma importante atividade econômica
para o município de Cristalina em Goiás. O manejo adequado da adubação propicia a produção de
alimentos mais seguros, contribuindo com a sustentabilidade econômica e ambiental. O Sistema
Integrado de Diagnose e Recomendação (DRIS) foi desenvolvido para fornecer um diagnóstico do
estado nutricional de plantas cultivadas, auxiliando na decisão sobre a recomendação de adubação
para culturas agrícolas, sendo baseado no balanço dos nutrientes essenciais aos vegetais. Este
trabalho teve por objetivo estabelecer as normas de referência DRIS e avaliar o estado nutricional
do feijoeiro comum irrigado cultivado no município de Cristalina, GO. Foram realizadas 86 coletas
de amostras de solo, 86 coletas de amostras de folhas e 82 amostras de produtividade do feijoeiro
comum na safra 2009/2010. Com os dados obtidos organizou-se um banco de dados. O banco de
dados foi analisado sob duas vertentes, o método tradicional conhecido como métodos dos Níveis
Críticos ou Faixas de Concentração, e também, pela metodologia do DRIS. Os atributos B, S, MO
e T foram considerados deficientes, enquanto que os nutrientes Cu, Fe, Mn, Zn, K e P foram
considerados excessivos no solo. O Fe, Zn e Mo foram os nutrientes nas folhas com menores
amplitudes, situadas nas faixas consideradas adequadas; os nutrientes S, Ca e Cu foram considerados
deficientes, e o P, N, e K foram considerados excessivos na planta, comparando aos critérios
estabelecidos. O método DRIS apresentou maior sensibilidade para diagnosticar problemas
nutricionais, especialmente, para micronutrientes.
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Caracterização fenotípica e molecular de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli e Xanthomonas fuscans subsp. fuscans procedentes de regiões produtoras de feijoeiro-comum no Brasil / Phenotypic and molecular characterization of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli and Xanthomonas fuscans subps. fuscans coming of producing regions of common bean plant in BrazilPaiva, Bruna Alicia Rafael de 25 February 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Common bacterial blight caused by Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) and
Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff), is one of most important bacterial etiology diseases from
the common bean plant. This pathogen causes a great loss in the production, mainly in the “water”
harvest, when the environmental conditions are helpful to the development of this disease and to its
dissemination. Among the strategies about integrated handling of diseases, the genetic resistance is the
main measure of control and, for obtaining some cultivate with lasting resistance and of notorious
specter, it is important to the know the genetic pathogen diversity. The present work has the goal of
studying the diversity and the genetic structure around and inside the population of Xap and Xff using
the markers rep-PCR; to connect the genetic pathogen diversity with its geographical distribution inside
Brazilian producing common bean plant regions. There were obtained 42 Xap and Xff isolated and four
Xanthomonas isolated not pathogens of to the bean plant, originated in the States of São Paulo, Goiás,
Paraná and Rio Grande do Sul. The genetic profiles obtained by primers BOX, ERIC and REP
produced 12 haplotipes matched (HC), where the HC 3, specific xff, was more frequent in PR and GO,
and was not found in RS. The dendrogram produced through the analysis showed that Xap, Xff and
isolated not pathogens are genetically different. In the analysis of genetic structure, the total genetic
diversity (Ht), among three populations was 0,2385 revealing that there was variability from a
population to the other one. Higher values of the Shannon rate (0,3648) show that Xap population is
more different genetically. From a total of 51 locos, 94,12 % are polymorphic, inside Xap population
they are all polymorphicand inside Xff, only 18,18 % are polymorphic. The genetic differentiation
coefficient (Gst = 0,5194) revealed diversity inside and among the patogenic populations, confirming
AMOVA’s result, where 51,98 % of the diversity was among the populations and 48,06 % inside them.
Then, the technique helped how to find differences between Xap and Xff and measure the values of
genetic diversity among and inside populations. The results of this study give us much information
about the pathogens diversity, which is considered useful to identify and to characterize the resistant
germoplasm in a more efficient way. / O crestamento bacteriano comum, causado por Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) e
Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff), é uma das doenças de etiologia bacteriana mais importantes
do feijoeiro-comum. Este patógeno provoca grandes perdas na produção, principalmente na safra das
“águas”, quando as condições ambientais são favoráveis ao desenvolvimento da doença e à
disseminação do patógeno. Dentro das estratégias do manejo integrado de doenças, a resistência
genética é a principal medida de controle, e para a obtenção de cultivares com resistência duradoura e
de amplo espectro é necessário o conhecimento da diversidade genética do patógeno. O presente
trabalho teve como objetivos, estudar a diversidade e a estrutura genética entre e dentro das populações
de Xap e Xff usando marcadores rep-PCR; relacionar a diversidade genética do patógeno com sua
distribuição geográfica dentro das regiões produtoras de feijoeiro-comum no Brasil. Foram obtidos 42
isolados de Xap e Xff, e quatro isolados de Xanthomonas não patogênicas ao feijoeiro, oriundos dos
estados de São Paulo, Goiás, Paraná e Rio Grande do Sul. Os perfis genéticos obtidos pelos primers
BOX, ERIC e REP geraram 12 haplótipos combinados (HC), em que o HC 3, específico de Xff, foi
mais frequente nos estados do PR e GO , porém não foi identificado no RS. O dendrograma gerado
através da análise conjunta mostrou que Xap, Xff e isolados não patogênicos foram geneticamente
distintos. Na análise de estruturação genética, a diversidade genética total (Ht) entre as populações foi
de 0,2385, mostrando que houve variabilidade entre as populações. Valores mais altos do índice de
Shannon (0,3648) revelam que a população de Xap é mais diversa geneticamente. De um total de 51
locos em todas populações, 94,12% foram polimórficos, sendo que, dentro de Xap todos foram
polimórficos, e dentro de Xff apenas 18,18% foram polimórficos. O coeficiente de diferenciação
genética (GST = 0,5194) revelou diversidade tanto dentro como entre as populações patogênicas,
confirmando o resultado obtido pela AMOVA, em que 51,98% da diversidade está distribuída entre as
populações e 48,06% dentro destas. Portanto, o uso da técnica rep-PCR permitiu diferenciar Xap e Xff
e mensurar os valores de diversidade genética entre e dentro de populações. Os resultados deste estudo
fornecem informações sobre a diversidade dos patógenos, o que auxiliará para melhor identificar e
caracterizar o germoplasma resistente.
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Potencial genético de linhagens elite de feijoeiro-comum para fixação biológica de nitrogênio / Genetic potential of common bean elite lines for biological nitrogen fixationDias, Polianna Alves Silva 07 April 2017 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-08T12:00:17Z
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Previous issue date: 2017-04-07 / In species rich in protein, like common bean, the nitrogen is considered as the most limiting nutrient in the development of the crop. One way to acquire the N by common bean is through biological nitrogen fixation (BNF). Despite its importance, there are no studies aiming the selection of common bean genotypes under rhizobia inoculation in multiple environments. Thus, the objectives of this studies were: to study the effect of interaction (GxF) of common bean elite lines with nitrogen fertilization and/or rhizobia inoculation; to select lines with high grain yield adaptability and stability and high agronomic performance when inoculated with rhizobia; to assess the variability of the elite lines for the nodulation traits; and to identify lines with superior nodulation traits under BNF cultivation. They were evaluated 19 carioca genotypes and 15 of the black group, in trials conducted separately by grain group. At first, experiments for the evaluation of agronomic traits were conducted at the states of Goiás, Paraná, Mato Grosso and at Distrito Federal, in three sowing seasons (rainy, winter and dry), in 2011 and 2012. Two trials were installed at each environment (location/sowing season/year), one with mineral nitrogen fertilization (80 kg N ha-1) and another with the inoculation of the seeds with Rhizobium tropici and R. freirei strains. The grain yield, sieve yield, 100 grains weight, plant architecture, lodging tolerance and the reaction to anthracnose and angular leaf spot were evaluated. Then, the lines were evaluated during rainy/2013 and winter/2014 seasons, at Santo Antônio de Goiás/GO, under rhizobia inoculation and nitrogen fertilization, in which they were assessed the nodule number, nodule dry and specific weight, nodules activity and shoot dry weight. The relative nodulation index was used on the selection of lines for the nodulation traits. Individual and combined analyses of variance were performed and they were estimated the Spearman correlations and the coincidence index on the selection of the best 30% lines with inoculation and with N fertilization. Grain yield adaptability and stability analyses were performed by the Nunes graphical method. Even though the interaction GxF was significant for some traits in both grain groups, it did not influence on the selection of the best genotypes. The lines of both groups are more productive when fertilized with mineral N, however, the carioca lines lodge less under BNF. The carioca line CNFC 15086 and the cultivars of black group BRS FP403 and BRS Esteio are indicated for cultivation under both N sources. The lines of both grain groups show higher performance for nodulation traits when inoculated. The genotypes BRS Sublime, CNFC 15010 and CNFC 15003 of the carioca group, and BRS Campeiro and CNFP 15177 of the black group are selected for the nodulation traits. / Em espécies ricas em proteína, como o feijoeiro-comum, o nitrogênio é tido como o nutriente mais limitante ao desenvolvimento da cultura. Uma das formas de aquisição do N pelo feijoeiro-comum é via fixação biológica de nitrogênio (FBN). Apesar de sua importância, inexistem estudos para seleção de genótipos de feijoeiro-comum sob inoculação com rizóbio em múltiplos ambientes para cultivo. Os objetivos do trabalho foram: estudar o efeito da interação (GxF) de linhagens elite de feijoeiro-comum com a adubação nitrogenada mineral e/ou inoculação com rizóbio; selecionar linhagens com alta adaptabilidade e estabilidade produtiva e alto desempenho agronômico quando inoculadas com rizóbio; avaliar a variabilidade das linhagens para os caracteres relativos à nodulação; e identificar linhagens com características de nodulação superiores para utilização em cultivo sob FBN. Foram avaliados 19 genótipos do grupo carioca e 15 do grupo preto, em ensaios separados por grupo de grão. Inicialmente foram feitos experimentos para avaliação de caracteres agronômicos, nos Estados de Goiás, Paraná, Mato Grosso e no Distrito Federal, em três épocas de semeadura (águas, inverno e seca), em 2011 e 2012. Foram instalados dois ensaios em cada ambiente (local/época de semeadura/ano), um com adubação nitrogenada mineral (80 kg ha-1 de N) e outro com inoculação das sementes com estirpes de Rhizobium tropici e R. freirei. Foram avaliadas a produtividade de grãos, rendimento de peneira, massa de 100 grãos, arquitetura de plantas, tolerância ao acamamento e a reação à antracnose e mancha-angular. Posteriormente, as linhagens foram avaliadas nas safras das águas/2013 e inverno/2014, em Santo Antônio de Goiás/GO, com inoculação de rizóbio e adubação com N mineral, em que foram avaliados o número de nódulos, a massa de nódulos secos e a específica, atividade de nódulos e massa da parte aérea seca. O índice de nodulação relativa foi utilizado na seleção de linhagens quanto aos caracteres de nodulação. Foram realizadas análises de variância individuais e conjuntas e estimadas as correlações de Spearman e o índice de coincidência da seleção das 30% melhores linhagens com inoculação e com N mineral. Foram feitas análises de adaptabilidade e estabilidade produtiva pelo método gráfico de Nunes. A interação GxF foi significativa para alguns caracteres em ambos os grupos de cores, porém não influenciaram na seleção das melhores linhagens. As linhagens de ambos os grupos são mais produtivas sob adubação com N mineral, porém, as do grupo carioca acamam menos sob FBN. A linhagem carioca CNFC 15086 e as cultivares do grupo preto BRS FP403 e BRS Esteio são indicadas para o cultivo em ambas as fontes de N. As linhagens de ambos os grupos apresentam melhor desempenho para os caracteres de nodulação quando inoculadas. Os genótipos do grupo carioca BRS Sublime, CNFC 15010 e CNFC 15003 e, os do grupo preto, BRS Campeiro e CNFP 15177 são selecionados quanto aos caracteres de nodulação.
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Melhoramento genético para altos teores de ferro e zinco em feijoeiro-comum / Genetic breeding for high iron and zinc contents in common beanDi Prado, Poliana Regina Carloni 30 March 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-03-30 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / The iron and zinc deficiency reaches millions of people worldwide, generating public health problems. One of the most viable alternatives to minimize this issue is the biofortification and the common bean stands out as a crop with wide potential to be biofortified. The objectives of this work were: i) to verify the importance of genetic (G), environmental (E) and G x E interaction effects for iron content (FeC) and zinc content (ZnC) in common bean grains and to identify the cultivars/lines that associate high potential for FeC, ZnC, protein content (PtC), yield and weight of 100 grains (W100); ii) to verify if exists genetic relation between these traits; iii) to obtain, evaluate and select promising common bean segregating populations for high FeC and ZnC, yield and W100; iv) to estimate parental general (GCA) and specific (SCA) combining ability for FeC and ZnC, aiming the understanding of genetic control and the selection of parental lines; v) to estimate genetic parameters and to select lines for FeC, ZnC, yield and W100; vi) to validate microsatellites molecular markers (SSR), previously identified as linked to QTLs for FeC and ZnC in common bean, in breeding populations, with high mean. On the first study, to verify the importance of G x E interaction, 34 genotypes were evaluated at 19 environments, assessing the FeC, ZnC, PtC, yield and W100. Combined analyses of variance, adaptability and stability analyses by Nunes graphical method were performed, in addition to the estimation of genetic correlations between the traits. There were significant differences between genotypes for all traits. The environment and interaction effects were significant, and the environment represented the most of total variation, 63% (FeC) and 65% (ZnC), followed by G x E interaction effect, 18% (FeC) and 15% (ZnC). The cultivar BRS Sublime, with carioca grains type, combined high FeC, ZnC, PtC, yield and grains with commercial size, in addition to wide adaptability and stability. The genetic correlations between FeC x ZnC, FeC x PtC and ZnC x PtC were significant and positive, indicating, likely, the occurrence of pleiotropy or that some genes that control these traits are linked. It is concluded that, due to the great environmental effect influencing FeC and ZnC the evaluation trials of these traits should be performed in multiple environments. On the second study, 15 segregating populations were obtained and evaluated from crosses on complete diallel design between six parental lines selected for high FeC and ZnC. The populations were assessed at Santo Antônio de Goiás-GO, on winter/2012 (F2), winter/2013 (F3) and rainy/2013 (F4) seasons, and at Brasília-DF, on rainy/2013 (F4) season. The traits evaluated were FeC and ZnC, yield and W100. Significant differences were detected between the populations for all traits. Based on the combine analysis, for FeC additive effects were more important and the line G 2358 stood out by its high GCA (5.63). For ZnC, both additive and non additive effects were important, however no parental line showed significant GCA. The populations selected simultaneously for all four traits, based on combined analysis, were Porto Real x G 2358, BRSMG Majestoso x G 2358, BRS Requinte x BRSMG Majestoso, Porto Real x BRS Requinte and Porto Real x BRSMG Majestoso. The population BRS Requinte x G 2358 is indicated for extraction of lines with high FeC and ZnC. It is concluded that the parental G 2358 has great potential and must be used in new crosses to increase FeC in common bean grains. The population BRS Requinte x G 2358, that presented excellent performance for FeC and ZnC, and the population BRS Requinte x Porto Real, selected simultaneously for all traits, must follow on the breeding program for lines extraction. On the third step of this work, 116 lines of these two populations and five controls were assessed, in a triple lattice experimental design 11x11, at three environments and FeC, ZnC, yield and W100 were evaluated. Analyses of variance and the estimation of genetic parameters were performed. It was also performed the genotyping of the parental lines and lines of these populations with 20 SSR previously identified as linked to FeC and ZnC QTLs and, later, it was performed the single marker mapping analysis. Differences were identified between the lines at all environments for all traits. The estimates of heritability and expected gain from selection indicated the possibility of obtaining genetic gains for each trait individually. On simultaneous selection of lines for the four traits, based on combined analysis, the expected gains from selection of the best 24 lines were 4.7% for FeC, 2.8% for ZnC, 3.9% for yield and 0.9% for W100. Only the marker BM 154 was polymorphic and only on population BRS Requinte x Porto Real. The single marker mapping analysis showed association only between BM 154 and FeC, at one environment, explaining 14.5% of the phenotypic variation. It is concluded that there is possibility on selecting lines that combine desired phenotypes for the four traits of interest and that, likely, the QTLs linked to the tested markers are already fixed and that there is the presence of QTLs x environments interaction. / A deficiência de ferro e de zinco atinge milhões de pessoas em todo o mundo e gera problemas de saúde pública. Uma das alternativas mais viáveis para minimizar este problema é a biofortificação e o feijoeiro-comum se destaca com uma cultura com amplo potencial para ser biofortificada. Os objetivos deste trabalho foram: i) verificar a importância do efeito genético (G), ambiental (E) e da interação G x E para teor de ferro (TFe) e teor de zinco (TZn) nos grãos de feijoeiro-comum e identificar as cultivares/linhagens que associem alto potencial para TFe, TZn, teor de proteína (TPt), produtividade (Prod) e massa de 100 grãos (M100); ii) verificar se existe relação genética entre estes caracteres; iii) obter, avaliar e selecionar populações segregantes de feijoeiro-comum promissoras para alto TFe e TZn, Prod e M100, iv) estimar a capacidade geral (CGC) e específica (CEC) de combinação de genitores para TFe e TZn, entender o controle genético e selecionar genitores; v) estimar parâmetros genéticos e selecionar linhagens para TFe, TZn, Prod e M100; vi) validar marcadores moleculares microssatélites (SSR), previamente identificados como ligados a QTLs para TFe e TZn em feijoeiro-comum, em populações de melhoramento, com alta média. No primeiro estudo, para verificar a importância da interação G x E, avaliou-se o TFe, TZn, TPt, Prod e M100 de 34 genótipos em 19 ambientes. Realizaram-se análises de variância, análises de adaptabilidade e estabilidade pelo método de Nunes, além da estimação de correlações genéticas entre os caracteres. Houve diferenças significativas entre os genótipos para todos os caracteres. Os efeitos de ambientes e de interação foram significativos, sendo que o de ambientes representou a maior parte da variação total, 63% (TFe) e 65% (TZn), seguido pelo efeito de interação G x E, 18% (TFe) e 15% (TZn). A cultivar BRS Sublime, de grãos tipo carioca, reuniu altos TFe, TZn, TPt, Prod e grãos com tamanho comercial, além de ampla adaptabilidade e estabilidade. As correlações genéticas entre TFe x TZn, TFe x TPt e TZn x TPt foram significativas e positivas, o que indica provavelmente a ocorrência de pleiotropia ou que alguns genes que controlam esses caracteres estejam ligados. Conclui-se que devido ao grande efeito ambiental influenciando TFe e TZn os ensaios de avaliação desses caracteres devem ser realizados em vários ambientes. No segundo estudo, foram obtidas e avaliadas 15 populações segregantes a partir de cruzamentos no esquema de dialelo completo entre seis genitores selecionados para altos TFe e TZn. As populações foram avaliadas em Santo Antônio de Goiás-GO, nas safras de inverno/2012 (F2), inverno/2013 (F3) e águas/2013 (F4), e em Brasília-DF, na safra das águas/2013 (F4). Os caracteres avaliados foram TFe e TZn, Prod e M100. Foram detectadas diferenças significativas entre as populações para todos os caracteres. Com base na análise conjunta, para TFe os efeitos aditivos foram mais importantes e a linhagem G 2358 se destacou pela alta CGC (5,63). Para TZn, tanto os efeitos aditivos como os não aditivos foram importantes, entretanto nenhum genitor apresentou CGC significativa. As populações selecionadas simultaneamente para os quatro caracteres, com base na análise conjunta, foram Porto Real x G 2358, BRSMG Majestoso x G 2358, BRS Requinte x BRSMG Majestoso, Porto Real x BRS Requinte e Porto Real x BRSMG Majestoso. A população BRS Requinte x G 2358 é indicada para extração de linhagens com altos TFe e TZn. Conclui-se que o genitor G 2358 possui grande potencial e deve ser utilizado em novos cruzamentos para aumentar o TFe nos grãos de feijoeiro-comum. A população BRS Requinte x G 2358, que apresentou ótimo desempenho para TFe e TZn, e a população BRS Requinte x Porto Real, selecionada simultaneamente para todos os caracteres, devem seguir no programa de melhoramento para extração de linhagens. Na terceira etapa do trabalho, foram avaliadas 116 linhagens destas duas populações e cinco testemunhas, em delineamento experimental látice triplo 11x11, em três ambientes e foram avaliados TFe, TZn, Prod e M100. Foram realizadas análises de variância e estimação de parâmetros genéticos. Também foi realizada a genotipagem dos genitores e das linhagens destas populações com 20 SSR previamente identificados como ligados a QTLs de TFe e TZn e, posteriormente, realizada a análise de mapeamento por marca simples. Foram identificadas diferenças entre as linhagens em todos os ambientes para todos os caracteres. As estimativas de herdabilidade e de ganho esperado com a seleção indicaram a possibilidade de obtenção de ganhos genéticos para cada caráter isoladamente. Na seleção simultânea das linhagens para os quatro caracteres, com base na análise conjunta, os ganhos esperados com a seleção das 24 melhores linhagens foram de 4,7% para TFe, 2,8% para TZn, 3,9% para Prod e 0,9% para M100. Somente o marcador BM 154 foi polimórfico e apenas na população BRS Requinte x Porto Real. A análise de mapeamento por marca simples mostrou associação apenas entre BM 154 e TFe, em um ambiente, que explica 14,5% da variação fenotípica. Conclui-se que há possibilidade selecionar linhagens que reúnam fenótipos desejáveis para os quatro caracteres de interesse e que, provavelmente os QTLs ligados aos marcadores testados já estão fixados e que há presença de interação de QTLs com ambientes.
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Caracterização química de feijão para produção de material de referência certificado / Chemical characterization of beans for production of certified reference materialLilian Seiko Kato 08 September 2014 (has links)
Alimento base da dieta dos brasileiros, o feijão é a leguminosa de maior importância para consumo direto no mundo. Inúmeras pesquisas em relação às propriedades nutricionais do feijão comum e também do feijão de corda têm sido realizadas, no intuito de avaliar sua composição centesimal, mineral e fatores antinutricionais. Em relação à qualidade das determinações analíticas, sabe-se que os materiais de referência certificados (CRMs) estão se tornando cada vez mais necessários em procedimentos de medição. Contudo, ainda há escassez de CRMs para atender às demandas em todos os setores produtivos, especialmente na agricultura. O domínio da tecnologia para sua produção representa, portanto, um avanço estratégico, por colocar o país em condições de fornecer materiais específicos às próprias necessidades. Dessa forma, este trabalho envolveu a primeira etapa para elaboração de um material de referência certificado de feijão, com a caracterização química e nutricional dos principais tipos comerciais disponíveis no mercado, das espécies Phaseolus vulgaris L. (feijão comum) e Vigna unguiculata (feijão caupi), buscando atender demandas metrológicas específicas da pesquisa e da indústria alimentícia. Foram coletadas 55 amostras de feijão de dez tipos comerciais diferentes no varejo da cidade de Piracicaba. Determinaram-se os elementos químicos Br, Ca, Co, Cs, Fe, K, Mo, Na, Rb, Sc e Zn utilizando análise por ativação neutrônica, a composição centesimal empregando metodologia preconizada pela AOAC e o fator antinutricional ácido fítico segundo o método descrito por Grynspan e Cheryan (1989). Os resultados mostraram diferença significativa entre os tipos comerciais de feijão (p<0,05) para Br, Cs, Co, K, Mo, Na e Zn, e também para os teores de proteínas, cinzas, umidade e ácido fítico. O feijão fradinho, da espécie Vigna unguiculata, apresentou diferenças consideráveis em relação ao feijão comum da espécie Phaseolus vulgaris L., tendo a maior concentração média de Na e as menores concentrações médias de Ca, Co, K e cinzas (p<0,05). O feijão preto apresentou as maiores concentrações médias de Ca, Co, Fe, proteínas e ácido fítico, enquanto o feijão cavalo as maiores concentrações médias de K, Mo e Zn (p<0,05). O feijão carioca apresentou valores médios próximos à média global para todos os parâmetros avaliados, exceto para ácido fítico. Alta variabilidade foi identificada para Br, Cs, Mo, Na, Rb e Sc dentro de um mesmo tipo comercial, enquanto baixa variabilidade foi observada para K, Zn, cinzas e proteínas. O conjunto de dados resultantes da caracterização química das 55 amostras de feijão mostra que os tipos comerciais carioca, preto e fradinho são os mais indicados para produção de material de referência certificado. Considerando o critério de comutatividade, o feijão carioca pode ser utilizado para produzir um material de referência que represente todos os tipos comerciais estudados / Basic food of the Brazilian diet, beans are the most important leguminous for direct consumption in the world. Numerous researches on the nutritional properties of common bean and string bean have been performed in order to assess their centesimal and mineral composition as well the antinutritional factors. Regarding the quality of the analytical determinations, it is known that the certified reference materials (CRMs) are becoming increasingly necessary in measurement procedures. However, there is still lack of CRMs to meet the demands from all productive sectors, especially agriculture. Mastering the technology for their production therefore represents a strategic step forward, to put the country in a position to provide specific materials to own needs. Thus, this work involved the first step in developing a bean certified reference material, with chemical and nutritional characterization of the main commercial types available in the market, from the species Phaseolus vulgaris L. (common bean) and Vigna unguiculata (cowpea), meeting the specific metrological demand of research and food industry. In the retail market of the city of Piracicaba, 55 bean samples from ten different commercial types were collected. The chemical elements Br, Ca, Co, Cs, Fe, K, Mo, Na, Rb, Sc and Zn were determined by nêutron activation analysis, the proximate composition using methodology recommended by the AOAC and the anti-nutritional factor phytic acid, according to the method described by Grynspan and Cheryan (1989). The results showed significant differences between commercial bean types (p<0.05) for Br, Cs, Co, K, Mo, Na and Zn, and also for protein, ash, moisture and phytic acid. The black-eyed pea from Vigna unguiculata species showed considerable differences from the common bean Phaseolus vulgaris L. species, having the highest average concentration of Na and the lowest average concentrations of Ca, Co, K and ash (p<0.05). The black bean had the highest average concentrations of Ca, Co, Fe, proteins and phytic acid, while horse bean the highest average concentrations of K, Mo and Zn (p<0.05). The common bean showed mean values close to the global average for all parameters, except for the phytic acid. High variability has been identified for Br, Cs, Mo, Na, Rb and Sc within a commercial type, while low variability was observed for K, Zn, ash, and proteins. The data set resulting from the chemical characterization of 55 samples indicates that the commercial types common bean, black bean and black-eyed pea are more indicated for the production of the certified reference material. Considering the commutability criteria, the common beans could be used to produce a reference material representative of all commercial types studied
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Comportamento fisiológico e bioquímico de sementes e grãos de feijão durante o armazenamento.Cassol, Flavia Danieli Rech 07 February 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-02-07 / Beans are one of the foods used to supply the energy needs of the Brazilian diet, so it is
necessary that farmers use high seed physiological potential, capable of increasing crop
productivity. Thus, the aim of this study was to evaluate the physiological and biochemical
changes occurring in beans stored for 360 days. Analyses were performed at 0, 30, 90, 180,
270, and 360 days after receiving the seeds (S1 and S2) and grains (G1 and G2) of BRS
Radiance, coming from two producers. Tests of germination, accelerated aging, cold, and
index of germination speed (IVG), average length of shoot (CMPA) and of root (CMR),
electrical conductivity and the electrical conductivity of the leachate were quantified in levels
of sugars and amino acids, in addition to Ca, K, Mg, Mn, Fe, and Zn. The experimental
design was completely randomized split-plot in time and the means were compared by the
Tukey test at 5% probability. Seed germination was not affected in S2, while S1 and G1
showed a significant fall. The grains from field 1 had a greater influence on heat, stress, and
cold, with its vigor decreasing from 91 to 50% and from 93 to 76%, respectively, after 360
days. The IVG tests presented decreased during the experiment. The CMPA and CMR
samples showed variations during the experiment, and G1 had the lowest means. In
electrical conductivity greater loss of solutes occurred at 90 days of evaluation. Up to 180
days of storage, G1 presented higher amount of amino acids and at 360 days the greatest
value S1. Larger amount of soluble sugars were found in samples from field 1. The amount
of calcium ions, manganese, iron, and zinc found in the samples were very small. The
amounts of potassium decreased until 360 days of storage, and G1 showed the highest
value. After 90 days the amounts of magnesium of the samples increased considerably. The
grains from field 1 had lower physiological quality. The tests of accelerated aging, cold, and
IVG showed a drop in vigor of the Splendor BRS, whereas the electrical conductivity test was
not sensitive enough to detect this decrease. This test did not present association with the
quantification of the ions investigated. The amount and behavior of amino acids, sugars the
ions studied in this work, failed to relate these variables to the decrease in vigor of the bean
samples. The storage period influenced the physiological quality of the beans tested. / O feijão é um dos alimentos mais utilizados para suprir as necessidades energéticas da
dieta dos brasileiros. Assim, é necessário que os agricultores utilizem sementes de alto
potencial fisiológico, capazes de aumentar a produtividade da cultura. Desta forma, o
objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade fisiológica e as mudanças bioquímicas
ocorridas em feijões armazenados por 360 dias. As análises foram realizadas nos tempos 0,
30, 90, 180, 270 e 360 dias após o recebimento dos lotes de sementes (S1 e S2) e dos
grãos (G1 e G2) da cultivar BRS Esplendor vindas de dois produtores. Foram realizados os
teste de germinação, de envelhecimento acelerado, de frio, além de índice de velocidade de
germinação (IVG), comprimento médio da parte aérea (CMPA) e da raiz (CMR),
condutividade elétrica e do lixiviado da condutividade elétrica foram quantificados os teores
de açúcares e aminoácidos, além dos íons Ca, K, Mg, Mn, Fe e Zn. O delineamento foi
inteiramente casualizado em esquema de parcelas subdivididas no tempo e as médias
comparadas pelo teste de Tukey, ao nível de 5% de probabilidade. A porcentagem de
germinação não foi afetada para S2, enquanto que nas S1 e G1 a queda foi significativa. Os
grãos do campo 1 sofreram maior influência sobre estresse de calor e frio, tendo seu vigor
diminuído de 91 para 50% e de 93 para 76%, respectivamente, após 360 dias. O IVG dos
testes realizados apresentaram queda durante o experimento. O CMPA e o CMR das
amostras apresentaram variações ao longo do experimento, sendo que G1 apresentou as
menores médias. No teste de condutividade elétrica maior perda de solutos ocorreu aos 90
dias de avaliação. Até os 180 dias de armazenamento, G1 apresentou maior quantidade de
aminoácidos e aos 360 dias S1, o maior valor. Maiores quantidade de açúcares solúveis
foram evidenciadas nas amostras do campo 1. A quantidade dos íons cálcio, manganês,
ferro e zinco encontrados nas amostras foram muito pequenas. As quantidades de potássio
diminuíram até os 360 dias de armazenamento, quando G1 apresentou o maior valor. Após
90 dias, as quantidades de magnésio das amostras aumentaram consideravelmente. Os
grãos do campo 1 apresentaram menor qualidade fisiológica. Os testes de envelhecimento
acelerado, frio e IVG evidenciaram a queda do vigor da cultivar BRS Esplendor, enquanto
que o teste de condutividade elétrica não foi sensível para detectar esta diminuição. Este
teste não apresentou relação com a quantificação dos íons investigados. A quantidade e o
comportamento dos aminoácidos, açúcares e dos íons estudados não permitiram relacionar
estas variáveis com a queda do vigor das amostras de feijão. O período de armazenamento
influenciou a qualidade fisiológica dos feijões testados.
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Análise, via RNAseq, do transcritoma do feijoeiro e identificação de genes expressos em resposta à infecção pelo nematoide das galhas / RNA-Seq based transcriptome analysis and identification of common bean genes expressed in response to root-knot nematode infectionLuciane Santini 01 September 2014 (has links)
O feijão-comum (Phaseolus vulgaris) é atacado por uma gama de patógenos que afetam a produtividade das lavouras e a qualidade dos grãos. Dentre os patógenos de importância econômica para a cultura no Brasil, destaca-se o nematoide das galhas (Meloidogyne incognita). Embora haja relatos sobre a avaliação de cultivares na presença de M. incognita, as fontes de resistência tem se mostrado pouco efetivas. Por isso, pesquisas que possibilitem um melhor entendimento sobre a interação planta-nematoide são de extrema valia e devem nortear novas estratégias para o melhoramento do feijoeiro. Assim, no presente estudo, 18 cultivares de P. vulgaris foram avaliadas quanto à resistência a M. incognita raça 3, sendo que quatro comportaram-se como pouco suscetíveis, 11 como moderadamente suscetíveis e três altamente suscetíveis. A cultivar IPR Saracura mostrou menor grau de suscetibilidade e foi, então, usada na construção de 12 bibliotecas de RNAseq, visando à identificação dos genes envolvidos na reposta à infecção pelo nematoide. Foram adotados dois tratamentos, 4 e 10 DAI (dias após inoculação), compostos de plantas inoculadas e controles. Primeiramente, realizou-se o mapeamento dos transcritos de cada biblioteca, tomando como referência o genoma de P. vulgaris (G19833), o que resultou na identificação de 27.195 unigenes. Em seguida, foi realizada a quantificação da expressão dos transcritos mapeados e genes diferencialmente expressos foram identificados. No total, 191 genes do hospedeiro apresentaram expressão diferencial, considerando-se: i) o tratamento inoculado em relação ao controle; ii) a razão de expressão (Fold Change - FC) mínima absoluta igual a 4; iii) o nível de significância ? = 0,05. Do total, 120 genes foram identificados aos 4 DAI e 71 aos 10 DAI. As sequências mapeadas foram contrastadas àquelas dos bancos de dados NCBI e TAIR, usando a ferramenta BLASTx e, posteriormente, anotadas usando os softwares Blast2GO e MapMan. Detectou-se similaridade com genes codificadores de proteínas conhecidas para 90% (24.604/27.195) dos unigenes, sendo que 69% (16.991/24.604) deles foram anotados. Quanto à expressão diferencial, 98% (188/191) dos transcritos mostraram similaridade com proteínas conhecidas e 67% (127/188) puderam ser anotados. Os transcritos foram atribuídos a diferentes categorias funcionais putativas, predominando o termo ontológico \'processos metabólicos\', em ambas as plataformas. A anotação dos genes na plataforma MapMan mostrou abundância das categorias da via de resposta a estresse, com predominância de genes de defesa superexpressos aos 4 DAI e reprimidos aos 10 DAI. Por fim, 10 genes mostraram expressão diferencial tanto aos 4 como aos 10 DAI: sete deles foram estáveis, sendo superexpressos nas plantas inoculadas, e três apresentaram comportamentos opostos nos momentos avaliados. Ênfase foi dada a um gene que codifica uma \'probable inactive ADP-ribosyltransferase\' e a quatro genes de resposta a ferimento. / The common bean (Phaseolus vulgaris) is attacked by a range of pathogens, which affect crop yield and the quality of grains. Among the pathogens of economic significance to the crop in Brazil, the root-knot nematodes (Meloidogyne incognita) deserve attention. Though there are some reports on cultivar evaluation in presence of M. incognita, the resistance sources have not being effective. Therefore, it is of valuable importance research projects that could lead to a better understanding of plant-nematode interaction and to indicate new strategies for common bean breeding. In the present study, 18 cultivars of P. vulgaris were evaluated in regard to their resistance to M. incognita race 3; four were less susceptible, 11 moderately susceptible, and three were highly susceptible. \'IPR Saracura\' behaved as the less susceptible cultivar and then was selected for the construction of 12 RNAseq libraries, aiming at the identification of genes differentially expressed in response to nematode infection. Two treatments were adopted, 4 and 10 days after inoculation (DAI), each comprised of inoculated and control plants. Firstly, the transcripts were mapped to the reference genome of P. vulgaris (G19833), resulting in the identification of 27,195 unigenes. Then, the mapped transcript\'s expression was quantified and differentially expressed genes were identified. In total, 191 genes of the host plant showed differential expression taking into consideration: i) the inoculated treatments in relation to their control; ii) an absolute fold change (FC) >= 4; iii) a level of significance ? = 0,05. Of the total, 120 genes were detected at 4 DAI and 71 at 10 DAI. The mapped sequences were compared against those deposited in NCBI and TAIR databanks using BLASTx and subsequently annotated using Blast2GO and MapMan softwares. Similarity to known proteins was detected for 90% of the unigenes (24,604/27,195) and 69% (16,991/24,604) of them were annotated. Regarding assessing differential expression, 98% (188/191) of the transcripts showed similarity to known proteins and 67% (127/188) were annotated. Transcripts were attributed to different putative functional categories and the ontological term \'metabolic process\' was predominant within both platforms. Gene annotation within MapMan platform showed predominance of stress-related pathway categories, with prevalence of defense genes overexpressed at 4 DAI and repressed at 10 DAI. Finally, 10 genes showed differential expression at both 4 and 10 DAI: seven were stably overexpressed in the inoculated plants, and three showed an opposite behavior regarding the evaluation periods. Attention was given to a gene encoding a probable inactive ADP-ribosyltransferase and four genes related to wound response.
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