CNPQ / Physalis pubescens L., ou camapu, é uma planta herbácea, cujos frutos são comestíveis e folhas, caules e raízes utilizados na medicina tradicional, contra diversas enfermidades. Como os estudos referentes a esta espécie são escassos o presente trabalho teve como objetivos: 1) avaliar os aspectos agronômicos de plantas cultivadas por diferentes métodos e substratos, 2) descrever anatomicamente as principais estruturas da plantas e 3) detectar a presença de compostos de interesse do metabolismo secundário. Para tanto, no primeiro ensaio foram avaliadas plantas produzidas a partir de sementes e estacas herbáceas. Como substratos foram utilizados: (SA) Solo + areia; (SV) Solo + vermiculita; (SP) Solo + Plantmax; (SAV); Solo + areia + vermiculita e (S) Solo. Foram avaliados os comprimentos da parte aérea e da maior raiz; área foliar; massas fresca e seca das folhas, caules e raízes; e volume radicular. O delineamento experimental utilizado foi inteiramente casualizado, em um esquema fatorial de 2x5, com 10 repetições por tratamento. No segundo ensaio, folhas, caules e flores foram submetidos a cortes paradérmicos e transversais, fixados em FAA 70%, armazenados em etanol a 70% e posteriormente, analisados por microscopia ótica e eletrônica de varredura. No terceiro ensaio, folhas oriundas de plantas cultivadas em vasos mantidos em casa de vegetação foram secas, moídas e extraídas com hexano. O resíduo seco hexânico foi aplicado em coluna cromatográfica, tendo como solventes de partição diclorometano, acetato de etila, metanol e água destilada. As frações foram submetidas à cromatografia em camada delgada (TLC) e ressonância magnética de prótons (RMN 1H). O extrato bruto foi submetido à cromatografia a gás acoplada à espectrometria de massas (CG/EM). Para o primeiro ensaio observou-se interação significativa entre os fatores substrato e método de propagação somente para massa fresca e seca dos caules, com destaque para o método estaquia e os substratos S, SA, SP. Para as demais variáveis não foram constatadas diferenças significativas. Em relação aos aspectos anatômicos constatou-se que P. pubescens apresenta lâmina foliar hipoestomática, mesófilo com a presença de drusas; idioblastos de areia cristalina dispersos aleatoriamente pelo pecíolo, e tricomas glandulares e eglandulares ao longo de toda a lâmina foliar, caule, pecíolo e pétalas. O estudo fitoquímico por CG/EM revelou a possível presença do alcalóide epistefamiersina (86% de probabilidade); também foram observados as presenças de cumarinas, fisalinas, óleo essencial, saponinas, triterpenóides e taninos por TLC, além de triterpenos e compostos aromáticos de baixa intensidade por RMN 1H. Diante destes resultados, conclui-se que P. pubescens possui características anatômicas que auxiliam a diferenciá-la das demais espécies do gênero, e que a mesma sintetiza uma grande variedade de metabólitos secundários, com a estaquia sendo o melhor método de propagação, independente do tipo de substrato. / Physalis pubescens L., or Winter Cherry, is a herbaceous plant, whose fruits are edible and the leaves, stems and roots used in traditional medicine against various diseases. As the studies for this species are scarce this study aimed to 1) assess the agronomic features of crops grown by different methods and substrates, 2) describe the main anatomical structures of plants and 3) the presence of compounds of interest secondary metabolism. For this, the first trials were evaluated plants grown from seed and cuttings. The substrates were used: (SA) Soil + sand; (SV) Soil + vermiculite, (SP) Soil + Plantmax; (SAV) Soil + sand + vermiculite and (S) Soil. We evaluated the length of shoot and main root, leaf area, fresh and dry weight of leaves, stems and roots and root volume. The experimental design was completely randomized in a factorial scheme 2x5, with 10 replicates per treatment. In the second trial leaves, stems and flowers were sectioned transverse paradermic and fixed in FAA 70%, stored in 70% ethanol and subsequently analyzed by optical microscopy and scanning electron microscopy. In the third essay leaves from plants grown in pots in a greenhouse, were dried and extracted with hexane. The hexanic dry residue was applied to the extraction chromatographic column, and as solvents for the partition dichloromethane, ethyl acetate, methanol and distilled water. The fractions were subjected to thin layer chromatography (TLC) and proton magnetic resonance (NMR 1H). The crude extract was subjected to gas chromatography-mass spectrometry (GC / MS). For the first test there was significant interaction between the factors substrate and method of propagation only for fresh and dry weight of stems, especially the cutting method and the substrate S, SA, SP. For the other variables were not significantly different. Regarding the anatomy it was found that P. pubescens leaf presents hypostomatic mesophyll with the presence of drusen, crystalline sand idioblasts scattered randomly around the petiole, and glandular and eglandular throughout the leaf, stem, petiole and flower petals. Phytochemical study by GC / MS revealed the possible presence of alkali epistephamiersine (86% probability) were also observed the presence of coumarins, physalins, essential oil, saponins, triterpenoids and tannins by TLC, and triterpenes and aromatic compounds of low NMR 1H intensity. Given these results it is concluded that P.pubescens has anatomical features that help differentiate it from other species of the genus, and that it synthetizes a wide variety of secondary metabolites also that the cutting is the best method of propagation, independent of substrate type.

CNPQ / Physalis pubescens L., ou camapu, é uma planta herbácea, cujos frutos são comestíveis e folhas, caules e raízes utilizados na medicina tradicional, contra diversas enfermidades. Como os estudos referentes a esta espécie são escassos o presente trabalho teve como objetivos: 1) avaliar os aspectos agronômicos de plantas cultivadas por diferentes métodos e substratos, 2) descrever anatomicamente as principais estruturas da plantas e 3) detectar a presença de compostos de interesse do metabolismo secundário. Para tanto, no primeiro ensaio foram avaliadas plantas produzidas a partir de sementes e estacas herbáceas. Como substratos foram utilizados: (SA) Solo + areia; (SV) Solo + vermiculita; (SP) Solo + Plantmax; (SAV); Solo + areia + vermiculita e (S) Solo. Foram avaliados os comprimentos da parte aérea e da maior raiz; área foliar; massas fresca e seca das folhas, caules e raízes; e volume radicular. O delineamento experimental utilizado foi inteiramente casualizado, em um esquema fatorial de 2x5, com 10 repetições por tratamento. No segundo ensaio, folhas, caules e flores foram submetidos a cortes paradérmicos e transversais, fixados em FAA 70%, armazenados em etanol a 70% e posteriormente, analisados por microscopia ótica e eletrônica de varredura. No terceiro ensaio, folhas oriundas de plantas cultivadas em vasos mantidos em casa de vegetação foram secas, moídas e extraídas com hexano. O resíduo seco hexânico foi aplicado em coluna cromatográfica, tendo como solventes de partição diclorometano, acetato de etila, metanol e água destilada. As frações foram submetidas à cromatografia em camada delgada (TLC) e ressonância magnética de prótons (RMN 1H). O extrato bruto foi submetido à cromatografia a gás acoplada à espectrometria de massas (CG/EM). Para o primeiro ensaio observou-se interação significativa entre os fatores substrato e método de propagação somente para massa fresca e seca dos caules, com destaque para o método estaquia e os substratos S, SA, SP. Para as demais variáveis não foram constatadas diferenças significativas. Em relação aos aspectos anatômicos constatou-se que P. pubescens apresenta lâmina foliar hipoestomática, mesófilo com a presença de drusas; idioblastos de areia cristalina dispersos aleatoriamente pelo pecíolo, e tricomas glandulares e eglandulares ao longo de toda a lâmina foliar, caule, pecíolo e pétalas. O estudo fitoquímico por CG/EM revelou a possível presença do alcalóide epistefamiersina (86% de probabilidade); também foram observados as presenças de cumarinas, fisalinas, óleo essencial, saponinas, triterpenóides e taninos por TLC, além de triterpenos e compostos aromáticos de baixa intensidade por RMN 1H. Diante destes resultados, conclui-se que P. pubescens possui características anatômicas que auxiliam a diferenciá-la das demais espécies do gênero, e que a mesma sintetiza uma grande variedade de metabólitos secundários, com a estaquia sendo o melhor método de propagação, independente do tipo de substrato. / Physalis pubescens L., or Winter Cherry, is a herbaceous plant, whose fruits are edible and the leaves, stems and roots used in traditional medicine against various diseases. As the studies for this species are scarce this study aimed to 1) assess the agronomic features of crops grown by different methods and substrates, 2) describe the main anatomical structures of plants and 3) the presence of compounds of interest secondary metabolism. For this, the first trials were evaluated plants grown from seed and cuttings. The substrates were used: (SA) Soil + sand; (SV) Soil + vermiculite, (SP) Soil + Plantmax; (SAV) Soil + sand + vermiculite and (S) Soil. We evaluated the length of shoot and main root, leaf area, fresh and dry weight of leaves, stems and roots and root volume. The experimental design was completely randomized in a factorial scheme 2x5, with 10 replicates per treatment. In the second trial leaves, stems and flowers were sectioned transverse paradermic and fixed in FAA 70%, stored in 70% ethanol and subsequently analyzed by optical microscopy and scanning electron microscopy. In the third essay leaves from plants grown in pots in a greenhouse, were dried and extracted with hexane. The hexanic dry residue was applied to the extraction chromatographic column, and as solvents for the partition dichloromethane, ethyl acetate, methanol and distilled water. The fractions were subjected to thin layer chromatography (TLC) and proton magnetic resonance (NMR 1H). The crude extract was subjected to gas chromatography-mass spectrometry (GC / MS). For the first test there was significant interaction between the factors substrate and method of propagation only for fresh and dry weight of stems, especially the cutting method and the substrate S, SA, SP. For the other variables were not significantly different. Regarding the anatomy it was found that P. pubescens leaf presents hypostomatic mesophyll with the presence of drusen, crystalline sand idioblasts scattered randomly around the petiole, and glandular and eglandular throughout the leaf, stem, petiole and flower petals. Phytochemical study by GC / MS revealed the possible presence of alkali epistephamiersine (86% probability) were also observed the presence of coumarins, physalins, essential oil, saponins, triterpenoids and tannins by TLC, and triterpenes and aromatic compounds of low NMR 1H intensity. Given these results it is concluded that P.pubescens has anatomical features that help differentiate it from other species of the genus, and that it synthetizes a wide variety of secondary metabolites also that the cutting is the best method of propagation, independent of substrate type.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-01Bitstream added on 2014-06-13T20:39:12Z : No. of bitstreams: 1 fernandesjunior_ar_me_ilha.pdf: 353041 bytes, checksum: 24615fb9c4cb2e7357d03d6db98b28cc (MD5) / A interação genótipos com ambientes (GxA) representa uma das principais dificuldades para a seleção nos programas de melhoramento genético de qualquer espécie, seja na fase de seleção ou na recomendação de cultivares, onde os pesquisadores buscam alternativas para minimizar seus efeitos. Entre as alternativas está a escolha de cultivares com ampla adaptação e boa estabilidade. Os resultados de vários ambientes podem ser sintetizados por estudos de adaptabilidade e estabilidade fenotípica, permitindo conhecer melhor a capacidade produtiva e adaptação frente às variações ambientais de novos genótipos. O objetivo deste trabalho foi verificar a adaptabilidade e estabilidade de clones de cana-de- açúcar, além da estabilidade dos ambientes, quanto à produtividade em toneladas de colmos por ha (TCH) e toneladas de pol por ha (TPH) no Estado de São Paulo. Foram avaliados 10 clones e duas testemunhas comerciais de maturação média- tardia em primeira soca em 10 experimentos colhidos em agosto de 2008, utilizando o método de regressão bissegmentada e o método AMMI (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction Analysis). A interação GxA para o caráter Pol%cana (PC) não foi significativa e TCH e TPH foram altamente correlacionados (r=0,97), apresentando resultados similares para todas as análises realizadas. Por isso, apenas os resultados de TCH foram apresentados e discutidos. Os resultados dos dois métodos foram comparados e evidenciaram que os clones RB975201, RB975157, RB975932, RB975242 e RB975162 são os mais promissores devido à produtividade acima das testemunhas, a alta estabilidade verificada em um ou nos dois métodos e adaptabilidade ampla ou específica. Os ambientes Tarumã, Guariba e Piracicaba, foram os mais estáveis, podendo servir de referência para recomendações em outras áreas / The genotype x environment interaction (GE) is one of the main difficulties for selection in breeding programs of any species, either at the stage of selection or recommendation of cultivars, where researchers seek alternatives to minimize their effects. Between the alternatives is the choice of cultivars with wide adaptability and good stability. The results of various environments can be synthesized by studies of phenotypic adaptability and stability allowing better understand the production capacity and adaptation to environmental variations ahead of new genotypes. The objective of this study was to verify the adaptability and stability of sugar cane clones, in addition the stability of environments, for productivity in tons of cane per hectare (TCH) and tons pol per hectare (TPH) in São Paulo State, Brazil. Were evaluated 10 clones and two commercial checks of medium-late maturation in first-ratoon of experiments harvested in August 2008, utilizing bissegmented regression method and analysis AMMI (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction Analysis). The interaction for the character Pol%cane (PC) was not significant and TCH and TPH were highly correlated (r = 0.97), with similar results for all analyzes. Therefore, only the results of TCH were presented and discussed. The results of two methods were compared and evidenced that clones RB975201, RB975157, RB975932, RB975242 and RB975162 are the most promising due to yield above checks, high stability observed in one or both methods and broad or specific adaptability. The environments Tarumã, Guariba and Piracicaba, are the most stable and may use as reference for recommendations in other areas

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, Brasília, 2014. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2014-08-12T13:27:23Z No. of bitstreams: 1 2014_RafaelaCristinaFerreiraBorges_Parcial.pdf: 2768328 bytes, checksum: 7e1025646edc62fe1a390d6722f2f79a (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2014-08-12T16:34:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_RafaelaCristinaFerreiraBorges_Parcial.pdf: 2768328 bytes, checksum: 7e1025646edc62fe1a390d6722f2f79a (MD5) / Made available in DSpace on 2014-08-12T16:34:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_RafaelaCristinaFerreiraBorges_Parcial.pdf: 2768328 bytes, checksum: 7e1025646edc62fe1a390d6722f2f79a (MD5) / A teca (Tectona grandis) é uma espécie florestal nativa do subcontinente Índico e do Sudeste Asiático que foi introduzida no Centro-Oeste Brasileiro a partir da década de 1970. Essa espécie possui alto valor comercial por apresentar madeira de alta durabilidade e resistência. A madeira pode ser usada para a confecção de móveis finos, esquadrias, pisos, construção naval e painéis. As duas principais doenças que afetam a cultura da teca são de etiologia fúngica: a ferrugem causada por (Olivea tectonae) e o cancro da teca. Nos últimos anos, o cancro da teca vem ganhando importância pelo grande número de árvores afetadas. Assim, considerando a importância desta doença, é necessária a busca de alternativas de controle, a partir de conhecimentos básicos sobre a enfermidade como: etiologia, variabilidade genética da população do patógeno e caracterização morfocultural, molecular e patogênica de isolados do fungo L. theobromae, identificado como o agente causal. Assim, discos de madeira com sintomas de escurecimento em povoamento de Teca foram coletados no estado do Mato Grosso, dos quais foram obtidos isolados de L. theobromae. As colônias fúngicas foram caracterizadas morfologicamente e a identificação de L. theobromae foi confirmada. Os isolados estudados foram caracterizados morfologicamente em culturais, avaliados quanto ao crescimento micelial em BDA, MEA, V8, Aveia-ágar e Cenoura-ágar, nas temperaturas de 25, 30 e 35°C. Para a caracterização molecular, realizou-se a extração do DNA de todos os isolados estudados através do método CTAB modificado. O DNA total foi submetido à reação de PCR para amplificação das regiões intergênicas do DNA ribossomal (regiões ITS1 e ITS2) e fator de elongação, a partir dos primers ITS1, ITS4 e TEF1-F, EF1-728F. A fim de comprovar a patogenicidade, mudas de teca foram inoculadas com dois isolados de L. theobromae (RB01) e (RB05) em três clones designados A, B e C. As inoculações foram unidirecionais quando se usou isolados de outras hospedeiras no clone A de teca. Os isolados de L. theobromae cresceram melhor em BDA, MEA e V8 a partir de 25°C com temperatura ótima da 35°C. As análises de sequencia das regiões do fator de elongação da tradução e do DNA ribosomal confirmaram a classificação dos isolados de teca como Lasiodiplodia theobromae. De acordo com o teste de patogenicidade, verificou-se que os clones A, B e C mostraram-se susceptíveis aos dois isolados de L. theobromae estudados. O clone A, proveniente de plantas seminais foi o que apresentou maior susceptibilidade ao isolado de L. theobromae, seguido do clone B, enquanto o clone C apresentou maior resistência. Quando realizada a inoculação unidirecional no clone A, verificou-se que esse clone foi susceptível a todos os isolados estudados, independentemente de origem, diferindo apenas em nível de severidade. Os isolados originários de hospedeiras distintas de teca proporcionaram maiores níveis de doença. A diversidade genética dos isolados foi estudada usando-se marcadores moleculares RAPD (“Random amplified polymorphic DNA”), resultando em quatro grupos e quatorze subgrupos com alta variabilidade dentro dos subgrupos. A similaridade dos isolados variou de 50% a 100%, sendo que estes com 100% de similaridade são isolados obtidos de teca. / Teak (Tectona grandis) is a forest species native to the Indian subcontinent and Southeast Asia, and it was introduced in Brazil’s midwestern region in the 1970s. This species has a high commercial value, because its timber is highly durable and resistant. The wood may be used to make fine furniture, door and window frames, floors, naval constructions and panels. The two main diseases that affect teak plantations are of fungal etiology; they are rust caused by Olivea tectonae and teak canker. In recent years, teak canker has been increasingly important in that it affects a large number of trees. Thus, considering the importance of this disease, alternatives for its control need to be sought, using basic knowledge about the disease such as its etiology, the genetic variability of the pathogen population, and the morphocultural, molecular and pathogenic characterization of isolates of the fungus L. theobromae, identified as the causal agent. To this end, discs of wood with darkening symptoms were collected in a teak plantation in the state of Mato Grosso and, from these, isolates of L. theobromae were obtained. The fungal colonies were morphologically characterized, and the identification of L. theobromae was confirmed. The isolates studied were morphologically characterized in culture media and evaluated for mycelial growth in PDA, MEA, V8, oatmeal-agar and carrot-agar, at temperatures of 25, 30 and 35°C. For molecular characterization, extraction of DNA was carried out for all isolates studied, using the modified CTAB method. Total DNA was submitted to PCR for amplification of the intergene regions of ribosomal DNA (regions ITS1 and ITS2) and elongation factor, from the primers ITS1, ITS4 and TEF1-F, EF1-728F. To prove the pathogenicity, teak seedlings were inoculated with two isolates of L. theobromae (RB01) and (RB05) in three clones designated A, B and C. The inoculations were unidirectional when isolates were used from other hosts in clone A of teak. The isolates of L. theobromae grew better on PDA, MEA and V8 from 25°C upwards, with an optimum temperature of 35°C. The isolates studied were not clearly distinguished when only sequences of ITS and TEF were used. In accordance with the pathogenicity test, it was confirmed that clones A, B and C were susceptible to the two isolates of L. theobromae studied. Clone A from the seminal plants was the one that presented the greatest susceptibility to the isolate of L. theobromae, followed by clone B, while clone C presented greatest resistance. When unidirectional inoculation of clone A was done, it was confirmed that this clone was susceptible to all the isolates studied, independent of their origin, differing only in level of severity. The original isolates from non-teak hosts provided the highest disease levels. The genetic diversity of the isolates was studied using RAPD molecular markers (Random amplified polymorphic DNA), resulting in four groups and 14 subgroups with high variability within the subgroups. The similarity of the isolates varied from 50% to 100%, and those with 100% similarity were isolates obtained from teak.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronegócios, 2014. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2014-10-13T14:37:59Z No. of bitstreams: 1 2014_HelioSabinoSa.pdf: 1432784 bytes, checksum: 97f6964cf46fbe53a65739b3a573f321 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-10-14T12:33:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_HelioSabinoSa.pdf: 1432784 bytes, checksum: 97f6964cf46fbe53a65739b3a573f321 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-14T12:33:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_HelioSabinoSa.pdf: 1432784 bytes, checksum: 97f6964cf46fbe53a65739b3a573f321 (MD5) / Este estudo exploratório e descritivo, baseado em revisão de literatura e pesquisa de campo na modalidade estudo de caso coletivo, com aplicação de survey interseccional, adotou como referenciais teóricos a análise econômica dos direitos de propriedade no contexto da Nova Economia Institucional, em conjunto com as ideias de Joseph Schumpeter sobre inovação como fator determinante do desenvolvimento econômico. Com base nesse referencial, buscou avaliar a percepção dos agricultores quanto aos riscos econômicos decorrentes da violação dos direitos de propriedade intelectual sobre sementes de alto desempenho produtivo, pertencentes às organizações de pesquisa e aos melhoristas, e que são utilizadas como insumo essencial da agricultura contemporânea. Buscou ainda, avaliar a existência real e as causas desse fenômeno entre os agentes componentes da amostra estudada. O estudo de caso coletivo adotou a metodologia de seleção de amostra não randômica do tipo bola de neve, na qual o respondente indica a localização do próximo potencial participante. Foram visitadas 186 glebas rurais na microrregião agrícola do Distrito Federal resultando na aplicação de sessenta instrumentos estruturados de pesquisa. A análise do conjunto de dados obtidos: na revisão de literatura empreendida, nas inferências ambientais de campo e dos dados tabulados extraídos dos formulários estruturados respondidos, revelam a existência da prática de violações de propriedade intelectual sobre sementes certificadas entre os participantes do estudo, entretanto em níveis e sob conformação diferenciada da apontada na literatura, restringindo-se modo relevante às sementes certificadas de soja. Quanto à percepção dos participantes do estudo sobre os riscos econômicos para o agronegócio que possam decorrer de tais violações, os dados apontam que esses agricultores possuem bom nível de percepção quanto ao conjunto de riscos apontados no instrumento de pesquisa, excetuado o risco para a segurança alimentar global, que restou prejudicado pela inserção do substantivo fome na formulação do quesito. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / This exploratory and descriptive study, based on literature review and field research in the form of collective case study, with application of intersectional survey, adopts the economic analysis of property rights in the context of the New Institutional Economics as a theoretical referential, coupled with the ideas of Joseph Schumpeter about innovation as a determinant of economic development. Based on this theoretical referential, it sought to assess the perceptions of farmers about the economic risks of infringement of intellectual property rights on seeds with high yield performance, pertaining to research organizations and plant breeders, and what are used as an essential ingredient of modern agriculture. It has also sought to assess the actual existence and causes of this phenomenon among the agents sample components. The collective case study adopted the methodology of selection of nonrandom sample of the snowball kind, in which the respondent indicates the localization of the next potential participant. 186 rural properties were visited in the agricultural microregion of Federal District resulting in the application of sixty structured research instruments. The analysis of the data obtained in the literature review undertaken, during and field research and of inferences obtained from the tabulated data extracted of the answers of structured instrument reveal the existence of the practice of intellectual property violations on certified seeds among the study participants, however at levels and under different conformation of reported in the literature, mainly limited to certified seed of soybean. Regarding the perception of the study participants about the economic risks to agribusiness that may result from such violations, the data indicate that those farmers have a good level of awareness on the set of risks mentioned in the survey instrument, with exception of the risk to global food security, which was affected by the inclusion of substantive hunger in the formulation of this question.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-05-15T16:00:40Z No. of bitstreams: 1 2014_ElianeAmaraldeSouzaArmando_Parcial.pdf: 681202 bytes, checksum: 5366c3e8b5f9c5f259cdccf132b15022 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-05-15T18:54:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_ElianeAmaraldeSouzaArmando_Parcial.pdf: 681202 bytes, checksum: 5366c3e8b5f9c5f259cdccf132b15022 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-15T18:54:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_ElianeAmaraldeSouzaArmando_Parcial.pdf: 681202 bytes, checksum: 5366c3e8b5f9c5f259cdccf132b15022 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnologia (CNPq) e Coordenação de Aperfeiçoamento de Professores de Nível Superior (CAPES). / Foram estudados cinquenta fungos associados a espécies hospedeiras pertencentes a vinte e duas famílias diferentes, distribuídas em 30 gêneros de plantas com potencial para uso medicinal, todas nativas do Cerrado brasileiro. Entre os fungos estudados, vinte e três são prováveis gêneros novos e vinte e uma prováveis espécies novas foram descritas, assim distribuídas: treze prováveis gêneros novos de hifomicetos, 10 prováveis espécies novas de fungos cercosporóides, quatro prováveis espécies novas do gênero Alternaria, quatro prováveis gêneros novos de celomicetos, quatro prováveis gêneros novos de ascomicetos e uma provável espécie nova do gênero Schizothyrium e um provável gênero novo de basidiomiceto, além de seis espécies já descritas na literatura. Em folhas de Anacardium humile St. Hil. (Anacardiaceae) foram identificados três hifomicetos, um celomiceto e dois ascomicetos prováveis gêneros novos. Em Schefflera macrocarpa (Araliaceae) foi estudado um provável gênero novo de basidiomiceto, um hifomiceto e um celomiceto. Em membros das famílias Cecropiaceae, Fabaceae, Guttiferae, Lythraceae, Malpighiaceae, Rubiaceae, Styracaceae e Verbenaceae foram estudadas em cada uma delas uma provável espécie nova de Pseudocercospora. Já em Vellozia squamata foi identificada uma provável espécie nova de Passalora. As prováveis espécies novas do gênero Alternaria foram estudadas nas famílias Fabaceae, Moraceae e Tiliaceae, sendo que em Fabaceae foram identificadas duas em Acosmium dasycarpum e em Bauhinia sp. Além disso, foram ainda descritas prováveis espécies novas dos seguintes gêneros: Asterostomella, Camarosporium, Janetia, Leprieurina, Periconia e Sirosporium, sendo a provável espécie nova do gênero Janetia provavelmente a fase conidial de um ascomiceto inédito encontrado agora em A. dasycarpum. / Fifty fungi were studied on host plants belonging in twenty-two different families, distributed in thirty genera of native plants from the Cerrado with potential for medicinal use. All fungi studied are here only preliminarily described here potential new taxa to be published according to the requirements of the International Code for Nomenclature of Algae, Fungi and Plants. Among the them twenty-three belong in new genera, and twenty-one are new fungal species. Thirteen species will be allocated in new genera of hyphomycetes, ten in new species of cercosporoid fungi, four are new Alternaria species, four are new coelomycete genera, four are new ascomycete genera. Additionally a new Schizothyrium species, a new basidiomycete genus, and six known fungal species. On leaves of Anacardium humile (Anacardiaceae), three potentially new hyphomycetes, one coelomycete, and two new ascomycete genera were found. On Schefflera macrocarpa (Araliaceae) the fallowing taxa were found one species belonging to a new basidiomycete genus, and two asexual morphs of ascomycetes, one new genus of coelomycete, and a new hyphomycete genus. A new Pseudocercospora species was found in one member of each of the following host families: Cecropiaceae, Fabaceae, Guttiferae, Lythraceae, Malpighiaceae, Rubiaceae, Styracaceae and Verbenaceae. A new Passsalora species was found growing on Vellozia squamata (Velloziaceae). Four novel Alternaria species were described causing leaf spots on hosts belonging the Fabaceae, Moraceae e Tiliaceae. On fabaceous hosts there were new species are on Acosmium dasycarpum and another on Bauhinia sp. Furthermore, new species were described belonging to the fallow genera Asterostomella, Camarosporium in Hymenaea stignocarpa, Janetia in Acosmium dasycarpum, Leprieurina in Brosimum gaudichaudii, Periconia in Aegyphilla lhokstana, and Sirosporium in Senna micrantha. Finally, another Janetia species was described as the asexual morph of a new ascomycete found on Acosmium dasycarpum (Fabaceae).

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Florestal, 2012. / Submitted by Elna Araújo (elna@bce.unb.br) on 2012-06-28T19:43:00Z No. of bitstreams: 1 2012_MarcusViniciusPradoAlves.pdf: 2492099 bytes, checksum: 8cb1aee90c8c0698bde7dd262378b590 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-06-29T10:31:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_MarcusViniciusPradoAlves.pdf: 2492099 bytes, checksum: 8cb1aee90c8c0698bde7dd262378b590 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-06-29T10:31:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_MarcusViniciusPradoAlves.pdf: 2492099 bytes, checksum: 8cb1aee90c8c0698bde7dd262378b590 (MD5) / Emmotum nitens (Icacinaceae) é uma das espécies do bioma Cerrado com os maiores valores de índice de importância entre as ocorrentes em Cerradões de Latossolos distróficos, porém pouco é conhecido sobre a sua reprodução. Este trabalho foi realizado em dez indivíduos adultos nas proximidades da Reserva Ecológica Cerradão, onde as árvores foram georreferênciadas com auxílio de um aparelho GPS; Laboratório de Biologia Vegetal e Viveiro da Embrapa Cerrados, Planaltina – DF. Os objetivos deste trabalho foram: 1) Verificar o ciclo reprodutivo da espécie através de suas fenofases. Os frutos de Emmotum nitens permaneceram por um longo período nos indivíduos adultos, com um efeito aparente de frutificação contínua, embora o que tenha ocorrido foram diferentes estádios de desenvolvimento, tamanho, amadurecimento e dispersão. 2) Realizar um protocolo de coleta e beneficiamento de frutos para a obtenção de diásporos e sementes isoladas. A imersão em água dos frutos por 48 horas proporcionou uma alteração da consistência do exocarpo (polpa) facilitando a remoção do mesmo. O tempo médio para beneficiar uma amostra de 100 frutos foi de ±15 min. ou 2 horas e trinta minutos para beneficiar (1000) mil frutos; o uso de um dispositivo metálico desenvolvido para a extração de sementes propiciou que estas fossem retiradas do interior dos diásporos intactas. 3) Verificar o efeito das condições fitossanitárias de diásporos e a viabilidade de sementes armazenadas em dois diferentes ambientes (câmara fria – CF e temperatura ambiente de laboratório - TA). Após o período de oito meses de armazenagem, através do teste de tetrazólio (1%), as sementes apresentaram uma viabilidade de 94 e 86% para TA e CF, respectivamente. 4) Avaliar através de experimentos em laboratório a emergência e desenvolvimento de plântulas a partir de diásporos e sementes isoladas. A porcentagem média de emergência a partir de sementes isoladas foi de 3 e 4% e 9 e 8%, para o primeiro e segundo experimentos montados em câmara de germinação a 25 °C, já a partir de diásporos nas mesmas condições, a germinação e emergência não ocorreu. 5) Ilustrar e caracterizar os aspectos morfométricos de frutos, diásporos, sementes e plântulas; onde foi caracterizado no fruto, diásporo e semente: O tamanho (comprimento, largura e espessura), características externas e internas, morfologia e tipo de germinação. Os frutos são do tipo drupóide, mesocarpos lenhosos, semente com embrião axial, cotilédones foliáceos e germinação fanerocotiledonar. As plântulas possuem protófilos simples, alternos e sistema radicular axial. As plântulas aos 180 dias atingiram uma média de 23,6 cm de altura e diâmetro do coleto de 2,36 mm. 6) Avaliar o crescimento em diferentes substratos (Solo de Cerradão; Solo de Cerradão + Areia e Solo Cerradão + Areia + Adubo); para a produção de mudas de Emmotum nitens. O delineamento experimental utilizado foi o DBC com 8 blocos x 3 tratamentos x 10 repetições. Foram avaliadas as medidas alométricas da parte aérea, da raiz, número de folhas, diâmetro do caule e a razão raiz/parte aérea. Na produção de matéria seca foi avaliada a massa seca da parte aérea, da raiz e a massa seca total. A emergência das plântulas de Emmotum nitens iniciou aos 28 dias após o plantio, estendo até os 95 dias. Não houve diferença significativa entre os tratamentos em relação às medidas de crescimento, número de folhas, diâmetro do coleto e na produção de massa seca total. O investimento de crescimento em raiz foi maior que o da parte aérea, porém, na produção de massa seca, o investimento na parte aérea foi o dobro em relação ao investimento na raiz. A espécie Emmotum nitens apresentou neste trabalho a produção de plântulas anômalas a partir de sementes isoladas; mas quando o plantio foi feito por diásporos (mesocarpos lenhosos + sementes) em condições de viveiro, obteve-se plantas normais. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Emmotum nitens (Icacinacea) is a species of the Cerrado biome with the highest importance index values among Cerradões occurring in the dystrophic Oxisols, but little is known about their reproduction. This work was carried out near Cerradão Ecological Reserve, where trees have been georeferenced with the aid of a GPS; Plant Biology Laboratory and Embrapa Cerrados Nursery, Planaltina - DF. Our objectives were: 1) Check the reproductive cycle of the species through their phenophases. The fruits of Emmotum nitens are remained for a long period in the adults, with an apparent effect of continuous fruiting, although that occurred were different stages of development, size, maturation and dispersal. 2) Undertake collection and processing of fruit to obtain seeds and diaspores isolated. The immersion of the fruits in water for 48 hours afforded a change exocarp consistency (pulp) facilitating is removal. The average time to receive a sample of 100 fruits was ± 15 min. or two hours and thirty minutes for receiving (1000) thousand fruits and a metallic device was developed to diaspores extract seeds provided they were removed intact from the interior of the seeds. 3) Check the plant health and viability of the seeds stored in two different environments (cold - CF and laboratory temperature - TA). After eight months of storage, through the tetrazolium test (1%), the seeds had a viability of 94 and 86% for TA and CF, respectively. 4) evaluate through experiments in the laboratory the emergence and development of seedlings from diaspores and isolated seeds. The average emergency percentage the isolated from 3 to 4% and 8 and 9%, for the first and second experiments in a germination chamber at 25 ° C, while the diasporas in the same conditions, no germination occurred. 5) Illustrate and characterize the morphometric aspects of fruits, diaspores, seeds and seedlings, which were characterized in the fruit, seed diaspore: The size (length, width and thickness), external and internal characteristics, morphology and germination type. The fruits are of the dripe type, woody mesocarps, seed with axial embryo foliaceous cotyledons and phanerocotylar germination. Seedlings have protophilus simple, alternate and root axial. The seedlings at 180 days averaged 23.6 cm in height and stem diameter of 2.36 mm. 6) Evaluate the seedlings growth E. nitens in different substrates (Solo Savana, Savana Soil and Soil + Sand + Sand + Savana fertilizer). The experimental design was a randomized block design with 8 blocks x 3 treatments x 10 replicates. Measures were evaluated for growth of shoot, root, leaf number, stem diameter and root / shoot. The dry weight of shoot, root and total dry mass was assessed. The seedling emergence Emmotum nitens began 28 days after planting, extended up to 95 days. There was no significant difference between treatments in relation to measures of growth, leaf number, stem diameter and total dry matter production. The investment in root growth was greater than that of the shoot, but in dry matter production, investment in the shoot was over twice the investment in the root. The species Emmotum nitens presented the anomalous production of seedlings from seeds isolated, but when the diaspores (woody mesocarps + seeds) in nursery conditions, were normal plants obtained.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-04-04T16:13:01Z No. of bitstreams: 1 2012_LeonardoCunhadeAlbuquerque.PDF: 3251557 bytes, checksum: 30b5d66dd563e940f160263b12ed9580 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-04-05T12:04:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_LeonardoCunhadeAlbuquerque.PDF: 3251557 bytes, checksum: 30b5d66dd563e940f160263b12ed9580 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-04-05T12:04:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_LeonardoCunhadeAlbuquerque.PDF: 3251557 bytes, checksum: 30b5d66dd563e940f160263b12ed9580 (MD5) / Os begomovírus (família Geminiviridae, gênero Begomovirus) possuem genoma constituído por DNA circular de fita simples, apresentam um (monopartido) ou dois (bipartido, DNA-A e DNA-B) componentes genômicos e são transmitidos naturalmente a diversas espécies de dicotiledôneas por moscas-brancas (Bemisia tabaci). Este grupo de vírus é conhecido pelos danos que causa em diversas plantas de importância econômica, incluindo duas das principais culturas do Brasil, o tomateiro (Solanum lycopersicum) e a batateira-doce (Ipomoea batatas). O objetivo deste trabalho foi realizar um estudo de diversidade genética de begomovírus que infectam o tomateiro e a batateira-doce. Neste estudo, o DNA viral de diversas amostras de tomateiro coletadas em 2003/04 foi analisado com o objetivo de caracterizar e estudar a diversidade genética desses begomovírus em três regiões do Brasil (Sudeste, Centro-Oeste e Nordeste). Como resultado, foram descritas as sequências completas de três begomovírus: uma nova espécie, Tomato interveinal chlorosis virus (ToICV), e duas espécies anteriormente descritas, porém apenas com sequências parciais do DNA-A disponíveis, Tomato mottle leaf curl virus (TMoLCV) e Tomato golden vein virus (TGVV). As sequências completas do DNA-B de TMoLCV e TGVV e do DNA-A de variantes de Tomato severe rugose virus (ToSRV) também são descritas. Como segunda parte do trabalho, em batateira-doce, o estudo foi realizado a partir de amostras coletadas do banco de germoplasma da Embrapa Hortaliças e do campo de produção de quatro estados do Brasil (Rio Grande do Sul, São Paulo, Pernambuco e Paraíba). Um total de 36 sequências completas foram determinadas e comparadas com outras sequências obtidas de bancos de dados públicos (GenBank) afim de fornecer uma visão geral da diversidade genética de sweepovírus (nome proposto para os begomovírus que infectam plantas do gênero Ipomoea) do Brasil. Também foi proposta uma revisão na classificação e nomenclatura desses vírus de acordo com os critérios taxonômicos atuais para a família Geminiviridae adotados pelo Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV). Do total de 36 sequências determinadas aqui, uma nova espécie foi identificada e nomeada Sweet potato leaf curl Sao Paulo virus (SPLCSPV) e os demais isolados foram classificados como novas estirpes ou variantes de Sweet potato leaf curl virus (SPLCV), Sweet potato golden vein-associated virus (SPGVaV) e Sweet potato leaf curl Spain virus (SPLCESV). Além dos estudos de caracterização molecular e diversidade genética, as sequências dos isolados de tomateiro e batateira-doce foram analisadas para detectar possíveis eventos de recombinação e os resultados demonstraram que uma série de eventos de recombinação inter e intra-espécies ocorreu na região intergênica (RI) e na metade da ORF C1 (open reading frame C1). Estes resultados demonstram que algumas espécies de begomovírus que infectam tomateiro são predominantes em regiões específicas do país e que estes vírus estão evoluindo continuamente por meio de mecanismos de variabilidade genética, entre eles a recombinação, como mostrado neste estudo. Em batateira-doce, os resultados apresentados indicam que a diversidade genética de begomovírus é maior que a anteriormente descrita e que o acúmulo viral, favorecido pela propagação vegetativa da cultura, resulta em eventos de recombinação levando ao surgimento de novas espécies e estirpes. _______________________________________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Begomovirus) have a circular, single strand DNA with one (monopartite) or two (bipartite, DNA-A and DNA-B) genomic components and are naturally transmitted by whiteflies (Bemisia tabaci) to several dicotyledonous species. This group of viruses is known to cause damage in several economically important crops, including two of the main crops in Brazil, tomato (Solanum lycopersicum) and sweet potato (Ipomoea batatas) plants. The aim of this work was to study genetic diversity of begomovirus infecting tomato and sweet potato plants. In this study, viral DNA of various tomato samples collected in 2003/04 was analyzed in order to characterize and study the genetic diversity of begomoviruses in three regions of Brazil (southeast, central- west and northeast). As a result, the full DNA-A sequences of three begomoviruses were described for the first time: a new tomato-infecting begomovirus, Tomato interveinal chlorosis virus (ToICV), and two previously described begomoviruses for which only partial DNA-A sequences were available, Tomato mottle leaf curl virus (TMoLCV) and Tomato golden vein virus (TGVV). The complete sequences of the DNA-B components of TMoLCV e TGVV and the DNA-A components of a number of Tomato severe rugose virus variants are also presented. As the second part of the work, in sweet potato plants, the study was conducted from samples collected in the sweet potato germplasm bank of Embrapa Vegetables and in commercial fields across four Brazilian states (Rio Grande do Sul, São Paulo, Pernambuco and Paraíba). A total of 36 complete genome sequences was determined and compared with others from public nucleotide sequence databases (GenBank) to provide an overview of the sweepovírus (proposed name to the begomoviruses that infect plants of Ipomoea genus) genetic diversity in Brazil. Adittionally, it is proposed a review in the classification and nomenclature of these viruses in accordance with the study group on the taxonomy of geminiviruses of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). From the 36 complete genome sequences determined in this work, a novel species was identified and named Sweet potato leaf curl Sao Paulo virus (SPLCSPV) and the other isolates were classified as new strains or variants of Sweet potato leaf curl virus (SPLCV), Sweet potato golden vein-associated virus (SPGVaV) and Sweet potato leaf curl Spain virus (SPLCESV). In addition to studies of molecular characterization and genetic diversity, the tomato and sweet potato-infecting sweepovirus sequences were analyzed to detect possible recombination events and it was demonstrated that most of the inter and intra-species recombination events occurred in the intergenic region (IR) and in the middle of C1 open reading frame (ORF). These results demonstrated that some tomato-infecting begomovíruses are prevalent in specific regions of Brazil and that these viruses are continually evolving though mechanism of genetic variability, including recombination, as showed in this study. In sweet potato, the results showed here indicate that the genetic diversity of begomoviruses is considerably greater than previously reported and that the accumulation of viruses, favored by vegetative propagation of culture, result in recombination events leading to the emergence of new species and strans.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2011. / Submitted by Rafael Barcelos Santos (rafabarcelosdf@hotmail.com) on 2011-06-21T20:10:44Z No. of bitstreams: 1 2011_Athos Silva de Oliveira.pdf: 1005468 bytes, checksum: 4f0942fa66ae15543a3e4bb01c8f944f (MD5) / Approved for entry into archive by Eveline Gonçalves(eveline@bce.unb.br) on 2011-06-22T13:03:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_Athos Silva de Oliveira.pdf: 1005468 bytes, checksum: 4f0942fa66ae15543a3e4bb01c8f944f (MD5) / Made available in DSpace on 2011-06-22T13:03:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_Athos Silva de Oliveira.pdf: 1005468 bytes, checksum: 4f0942fa66ae15543a3e4bb01c8f944f (MD5) / Os tospovírus (família Bunyaviridae) são fitopatógenos que possuem genoma de RNA fita simples tripartido, denominados S (Small), M (Medium) e L (Large). Os dois primeiros possuem polaridade ambisenso e o último polaridade negativa. São vírus envelopados e transmitidos por tripes, insetos da ordem Thysanoptera, de maneira circulativa e propagativa. Além disso, acarretam significantes perdas na produção e qualidade de vegetais de interesse econômico em diversas partes do mundo. Neste trabalho um novo e distinto tospovírus foi isolado em plantas de feijão apresentando mosaico com áreas necróticas. Após experimentos de caráter biológico, sorológico e molecular, este foi caracterizado e nomeado tentativamente de Bean necrotic mosaic virus (BeNMV). No processo de caracterização biológica o BeNMV apresentou um estreito espectro de hospedeiros, replicando-se sistemicamente somente em três plantas indicadoras (Datura stramonium L, Physalis pubescens L. e Phaseolus vulgaris L. cv. Santana) após transmissão por inoculação mecânica. Diferentemente do esperado, os sintomas visualizados no campo não foram reproduzidos em Phaseolus vulgaris em casa de vegetação. BeNMV mostrou-se sorologicamente diferente quando comparado com outras espécies brasileiras em ensaio de diferenciação sorológica realizado após produção de anticorpo policlonal anti-BeNMV. Entretanto, uma fraca reação cruzada foi observada entre Tomato spotted wilt virus (TSWV), Groundnut ringspot virus (GRSV) e este novo tospovírus. Na caracterização molecular duas proteínas estruturais foram elucidadas, o precursor das glicoproteínas do envelope Gn e Gc e a RNA polimerase dependente de RNA ou proteína L. Ambas apresentaram o maior tamanho entre as já caracterizadas, tendo 1141aa e 2932aa, respectivamente. Também, apresentaram uma baixa identidade com as demais, indicando, após estudos filogenéticos, a descoberta de uma provável nova ramificação evolutiva do gênero Tospovírus. Curiosamente, talvez por suas características intrínsecas e significativamente divergentes quando comparado as demais espécies do gênero, ainda não foi possível caracterizar a proteína estrutural do nucleocapsídeo (N) viral. Trabalhos estão em andamento para concluir a caracterização deste novo e distinto tospovírus. _________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Tospoviruses (family Bunyaviridae) are plant-infecting pathogens with a tripartite RNA genome, named S (Small), M (Medium) and L (Large). The latter has a negative polarity, while the other two have ambisense polarity. These viruses have enveloped particles and are transmitted by thrips insects (order Thysanoptera) in a circulative-propagative manner. Moreover, tospoviruses cause significant quality and yielding losses to economically important cultures worldwide. In this study a new and distinct tospovirus was isolated from bean plants (Phaseolus vulgaris L.) showing necrotic mosaic symptoms. After biological, serological and molecular assays, the new virus was characterized and tentatively named Bean necrotic mosaic virus (BeNMV). BeNMV showed a narrow host-range, presenting systemic infection, after mechanical inoculation, on three different indicator host-species (Datura stramonium L,. Physalis Pubescens L. and Phaseolus vulgaris L., cv. Santana). Alternate from what could be expected, field-observed symptoms were not reproducible on greenhouse grown beans. As demonstrated in serological differentiation assays utilizing specific polyclonal anti-sera, BeNMV was distinct from other known tospoviruses common in Brazil. Weak cross-reaction was detected between Tomato spotted wilt virus (TSWV), Groundnut ringspot virus (GRSV) and the new tospovirus. Two viral structural proteins were resolved, being the largest ones known among the tospoviruses so far - the glycoprotein precursor of Gn and Gc envelope proteins and the RNA-dependent RNA polymerase (L protein) with 1141aa and 2932aa, respectively. Both proteins showed little identity with available sequences from other tospovirus species in phylogeny assays, indicating that BeNMV constitutes a new evolutionary branch in the genus Tospovirus. Due to BeNMV's discrete genome coding and significant divergence from other tospovirus species, the nucleocapsid structural protein (N) could not be characterized. Further efforts are being made to achieve complete characterization of this new and distinct tospovirus.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-08-13T15:19:40Z No. of bitstreams: 1 2013_LeydyLorenaMendozaTobar.pdf: 2616918 bytes, checksum: 6590982254752b2aa82977414720ad55 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-08-15T14:04:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_LeydyLorenaMendozaTobar.pdf: 2616918 bytes, checksum: 6590982254752b2aa82977414720ad55 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-15T14:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_LeydyLorenaMendozaTobar.pdf: 2616918 bytes, checksum: 6590982254752b2aa82977414720ad55 (MD5) / A cultura de tomate no Brasil é uma das mais importantes do ponto de vista econômico e social. Estudos publicados pela FAO em 2011 posicionam o Brasil no oitavo lugar do ranking mundial de produção. O cultivo de tomateiro no Brasil é feito em diferentes estados e durante grande parte dos meses do ano, favorecendo a ocorrência de diferentes doenças de importância econômica, dentre elas, destacam-se aquelas causadas por espécies do gênero Begomovirus. O gênero Begomovirus encontra-se composto por espécies com partículas geminadas formadas por dois icosaedros incompletos e ácido nucleico do tipo ssDNA encapsidado em um componente ou dois componentes genômicos (DNA A e B), denominadas de monopartidas ou bipartidas, respectivamente. Até o presente momento no Brasil, em tomateiro, não foram relatadas espécies de begomovírus de genoma monopartido. Espécies de Begomovirus são transmitidas com grande eficiência pelo vetor Bemisia tabaci. Para controle das doenças causadas por espécies de Begomovirus esforços vêm sendo concentrados no desenvolvimento de materiais elite através da introgressão de genes de resistência, muitas vezes, provenientes de acessos selvagens do gênero Solanum. Um exemplo é a linhagem LAM 144R que contém o gene dominante Ty-1 caracterizado por conferir resistência a diferentes espécies de Begomovirus. Neste trabalho a linhagem LAM 144R foi avaliada com o objetivo de elucidar os mecanismos virais da resistência conferida pelo Ty-1 e a amplitude da resistência deste gene frente às espécies de Begomovirus bipartidos encontrados no Brasil: Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV), Tomato rugose mosaic virus (ToRMV), Tomato severe rugose virus (ToSRV) e Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV). A avaliação da replicação viral foi realizada mediante experimentos de agroinfiltação do componente A de ToCMoV na linhagem resistente LAM 144R e na isolinha suscetível LAM 144S. A quantificação da carga viral foi realizada por PCR quantitativa em tempo real (qPCR), usando primers específicos para capa proteica (CP1). Os dados foram analisados pelo teste não paramétrico Kruskal-Wallis. O título viral foi significativamente menor nas plantas da isolinha LAM 144R em comparação com LAM 144S, mostrando uma quantidade duas vezes menor de carga viral na linhagem resistente no décimo dia após a infiltração. Para avaliar o efeito deste gene no movimento a longa distância de Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV) na linhagem LAM 144R duplas enxertias foram realizadas. Plantas LAM 144S (suscetível) foram inoculadas com ToCMoV. Duplas enxertias foram realizadas utilizando como enxerto segmentos de LAM 144R ou LAM144S e como sobre-enxerto, LAM 144S. Amostras foram coletadas em diferentes tempos após as enxertias e a detecção de ToCMoV por PCR e Southern blot mostraram uma restrição no movimento viral a longa distância quando foram usadas as plantas LAM 144R contendo o gene Ty-1 como enxerto Para o estudo da amplitude da resistência conferida pelo gene Ty-1 na linhagem LAM 144R, plantas foram inoculadas via biobalística com DNA das quatro espécies de Begomovirus mencionadas acima. Como controle positivo utilizou-se plantas de LAM 144S. As avaliações de sintomas foram realizadas aos 21 e 40 dias após inoculação (dai) e a acumulação viral foi avaliada aos 30 (dai) mediante Southern Blot usando sondas para o componente A de Begomovirus. Como resultado as plantas de LAM 144R inoculadas com ToCMoV apresentaram sintomas leves e baixa acumulação viral. Para ToSRV observou-se ausência de sintomas ou sintomas leves e baixa acumulação viral. Para ToRMV poucas plantas apresentaram sintomas leves e não foi detectada acumulação viral. Para ToYVSV observou-se sintomas leves em algumas plantas, um baixa acumulação viral em cinco delas e uma forte acumulação em duas amostras. Os resultados encontrados neste estudo demonstram que LAM 144R pode ser considerada promissora para uso em programas de melhoramento no desenvolvimento de diferentes cultivares comerciais. _____________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The tomato crop in Brazil is important economically and socially. FAO placed, Brazil in the 8th position in the world rank of tomato production. Tomatoes in Brazil are grown in different states and during most months of the year, what favors the appearance of different diseases of economic importance, such as those caused by begomoviruses. Begomoviruses are transmitted very efficiently by the vector Bemisia tabaci. The genome can be either monopartite or bipartite (DNA A and DNA B). So far, only bipartite tomato begomoviruses have been reported in Brazil. To control diseases caused by begomovirus include the development of elite materials through introgression of resistance genes from wild Solanum accessions. An example is the line LAM 144R that contains the dominant gene Ty-1 which confer resistance to different Begomovirus species. This line LAM 144R was here evaluated in order to elucidate the mechanisms of viral resistance conferred by Ty-1. The breadth of this resistance was tested by inoculation with four bipartite Begomovirus-especies found in Brazil: Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV), Tomato rugose mosaic virus (ToRMV), Tomato severe rugose virus (ToSRV), and Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV). As positive control LAM 144S were used plants. Symptoms were scored at 21 and 40 days after inoculation (dai) and viral accumulation was evaluated at 30 (dai) by Southern blot. As a result LAM 144R mild symptoms and low or no viral accumulation was observed with ToCMoV, ToSRV, ToRMV and ToYVSV. The evaluation of virus replication was carried out by agronfiltration experiments of ToCMoV DNA-A in the resistance LAM 144R and susceptible LAM 144S isolines. Quantification of the viral load was performed by quantitative polymerase chain reaction (qPCR) using primers specific for coat protein (CP1). Data were analyzed by nonparametric Kruskal-Wallis test. The viral titer was significantly lower in plants LAM 144R compared to the isoline LAM 144S, showing 2 times lower viral load in the resistant lineage ten days after agroinfiltration. To avaluate the effect of this gene on the long-distance movement of Tomato chlorotic mottel virus , in near isogening lines LAM 144R and LAM 144S, double grafts were performed. Plants LAM 144S (susceptible) were inoculated with ToCMoV. Double grafts were performed using graft segments of LAM 144R and LAM 144S and as overgraft, LAM 144S plants. Samples were collected at different times after grafting and ToCMoV was detected by PCR, Southern blot, and tissue blott showing a restriction in long-distance viral movement when plants LAM 144R containing the Ty-1 gene was used as graft. The results of this study demonstrate that LAM 144R can be considered promising for the use in breeding programs for the development of new resistent cultivars. The evaluation of virus replication was carried out by agronfiltration of ToCMoV DNA-A in the resistant LAM 144R and susceptible LAM 144S isolines. Quantification of viral load was performed by quantitative polymerase chain reaction (qPCR) using primers specific for the coat protein (CP1). Data was analyzed by nonparametric Kruskal-Wallis test. The viral titer was significantly lower in plants LAM 144R compared to the LAM 144S, showing 2 times lower viral load in the resistant line at tenth day after agroinfiltration. To evaluate the effect of this gene on the long-distance movement of Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV) in the near isogenig lines LAM 144R and LAM 144S, double grafts were performed. Plants LAM 144S (susceptible) were inoculated with ToCMoV. Double grafts were performed using as grafts LAM 144R or LAM 144S segments and as overgrafts, LAM 144S plants. Samples were collected at different times ToCMoV was detected by PCR and Southern blot showing a restriction in long-distance viral movement when plants LAM 144R containing the Ty-1 gene was used as grafts. The results of this study demonstrate that LAM 144-R can be considered promising for the use in breeding programs for the development of new resistent cultivars to different Begomovirus species.