A maioria das espécies marinhas possui um ciclo de vida complexo em que a fase adulta é precedida por uma fase larval pelágica. Os adultos produzem larvas que são soltas na coluna d'água onde elas são influenciadas por processos hidrodinâmicos como advecção e difusão turbulenta. Para os organismos que na maturidade são fixos a um substrato, como as cracas em particular, estudos mostram que estes processos podem afetar diretamente o assentamento das larvas e a dinâmica das populações de adultos. Neste trabalho apresentamos um modelo em Elementos Finitos que permite estudar as interações entre os processos biológicos e oceanográficos na dinâmica de um organismo marinho (craca Balanus glandula) com uma fase adulta séssil restrita à linha costeira e uma fase larval planctônica. Alguns cenários são investigados no estudo da variação, ao longo do tempo e do espaço, do número de indivíduos e da distribuição desta população, com o objetivo de entender, explicar e predizer como os fatores abióticos e bióticos afetam tais variações. O modelo considerou a dinâmica da população estágio-estruturada tanto de uma única espécie quanto de duas espécies, diferentes padrões idealizados de correntes marinhas, qualidade do habitat, influência da temperatura e reconstrução do campo de velocidades a partir de dados locais. / Most marine benthic invertebrates have a complex life cycle in which the adult phase is preceded by a planktonic larval phase. The passive nature of larval dispersal of these species results in a larval transport governed by hydrodynamic processes like advection and eddy diffusion. The recruitment depends on a variety of physical and biological factors, which include spawning, larval dispersal and survival, larval settlement, metamorphosis, post-settlement events, inter-specific and intra-specific competitions. In order to assess interactions between oceanographic and biological processes that determine the population dynamics of marine organisms with a sessile adult phase restricted to the coastline and a planktonic larval phase, we develop a stage-structured finite element model for the barnacle Balanus glandula that inhabits the rocky intertidal zone of central California, USA. As the larval dispersal depends on knowing the flow pattern, we also develop a numerical procedure to couple physical and biological models in a very simple way when the velocity flow field is known of some discrete points of the domain of interest and at a given time. We investigate the effects of different flow patterns and velocity speeds on the abundance and the distribution of this organism as well as the influence of other abiotic interactions such as temperature and habitat quality. The interplay of different intra- and inter-specific competitions is also addressed.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The present study investigated the effect of different strata of tide on the abundance, size, sex ratio, population structure, relative growth, morphological sexual maturity, amount of ovigerous females and reproductive burrows in U. leptodactylus. To this end, monthly collections were made from January to December 2013 in two strata of the intertidal, estuaries of Sergipe river and Vaza-barris river, using a square with internal area of 90cm², launched ten times randomly within each strata. For each stratum monthly measures air temperature, substrate temperature, water temperature, salinity and samples episubstrate for the determination of particle size and composition of organic matter were taken. In the laboratory, crabs were sexed, measured and preserved in 70% alcohol. The monthly results were statistically compared between strata and estuaries, there are similarities in environmental factors analyzed between strata, with an analysis of the abundance, size, relative growth and sexual maturity divergent between the same strata.The abundance and size of crabs were higher in the open strata of both estuaries, with the estuary of Vaza-barris river more abundant than estuary of Sergipe river, which in turn showed higher crabs. The sex ratio was not significantly different between the strata of the estuary of Vaza-barris river, but presented to the estuary of Sergipe river, where in the open strata occurred more males and more females in the vegetated strata. Population structure showed 19 classes of size 0.5 mm with modal distribution of recent juveniles for vegetated strata and adults to open strata. Juvenile and adult crabs showed positive allometric growth between carapace width and length of the propodus and width of the abdomen, separately for each sex. The fiddler crabs vegetated strata matured in smaller sizes than that observed for the open strata in both estuaries, in the estuary of Vaza-barris river males and females matured with 6.18 and 5.26 mm and 4.94 and 4.91 mm carapace width in open and vegetated strata, respectively. In the estuary of Sergipe river males and females matured with 5.61 and 5.36 and 5.24 mm and 4.39 mm carapace width in open and vegetated strata respectively. The similarity in abiotic factors between open and vegetated strata, and differences in the abundance, population structure and reproductive biology have led to the consideration of the reproductive behavior of lekking for U. leptodactylus. Ovigerous females and reproductive burrows occurred primarily in the open strata, so these areas were considered reproductive arenas, while vegetated strata were considered priority areas in recruitment. / O presente trabalho investigou o efeito de diferentes estratos de maré sobre a abundância, tamanho, razão sexual, estrutura populacional, crescimento relativo, maturidade sexual morfológica, quantidade de fêmeas ovígeras e tocas reprodutivas em U. leptodactylus. Para tal, foram realizadas coletas mensais no período de Janeiro à Dezembro de 2013 em dois estratos do entremarés, nos estuários do rio Sergipe e rio Vaza-barris, utilizando-se um quadrado com área interna de 90cm², lançado dez vezes aleatoriamente em cada estrato. Para cada estrato mensalmente foram tomadas as medidas de temperatura do ar, temperatura do substrato, temperatura da água, salinidade e amostras do episubstrato, para a determinação do teor de matéria orgânica e composição granulometria. Em laboratório, os caranguejos foram sexados, medidos e conservados em álcool 70%. Os resultados obtidos mensalmente foram comparados estatisticamente entre estratos e estuários, observou-se semelhança nos fatores ambientais analisado entre os estratos, sendo a análise da abundância, tamanho, crescimento relativo e maturidade sexual divergente entre os mesmos estratos. A abundância e o tamanho dos caranguejos foram maiores nos estratos abertos de ambos os estuários, sendo o estuário do rio Vaza-barris mais abundante do que o estuário do rio Sergipe, que por sua vez apresentou caranguejos maiores. A razão sexual não apresentou diferença significativa entre os estratos para o estuário do rio Vaza-barris, porém apresentou para o estuário do rio Sergipe, onde no estrato aberto ocorreram mais machos e nos estratos vegetados mais fêmeas. A estrutura populacional apresentou 19 classes de tamanho de 0,5 mm, com distribuição modal de juvenis recentes para os estratos vegetados e de adultos para os estratos abertos. Os caranguejos juvenis e adultos apresentaram crescimento alométrico positivo entre a largura da carapaça e comprimento do própodo e largura do abdômen, separadamente para cada sexo. Os chama-marés dos estratos vegetados maturaram em tamanhos menores do que o observado para os estratos abertos de ambos os estuários, no estuários do rio Vaza-barris os machos e fêmeas maturaram com 6,18 e 5,26 mm e 4,94 e 4,91 mm de largura da carapaça nos estratos aberto e vegetado, respectivamente. No estuário do rio Sergipe os machos e fêmeas maturaram com 5,61 e 5,36 mm e 5,24 e 4,39 mm de largura da carapaça nos estratos aberto e vegetado, respectivamente. A semelhança nos fatores abióticos entre os estratos abertos e vegetados, e as divergências na abundância, estrutura populacional e biologia reprodutiva, levaram à consideração do comportamento reprodutivo de lekking para U. leptodactylus. As fêmeas ovígeras e tocas reprodutivas ocorreram prioritariamente nos estratos abertos, portanto essas áreas foram consideradas arenas reprodutivas, enquanto os estratos vegetados foram considerados áreas prioritárias no recrutamento.

Novos marcadores genéticos foram caracterizados para jacaré-de-papo-amarelo (Caiman latirostris) pela construção de bibliotecas enriquecidas de DNA microssatélite. Um microssatélite foi desenvolvido a partir de uma biblioteca enriquecida de DNA microssatélite (ACC/TGG)n e 12 a partir de uma biblioteca enriquecida de DNA microssatélite (AC/TG)n. Esses marcadores foram testados em indivíduos da espécie Caiman latirostris e resultaram em sete novos microssatélites polimórficos. Adicionalmente quatro marcadores microssatélites de Alligator mississipiensis previamente transferidos para Caiman latirostris foram utilizados. Amostras de sangue jacarés-de-papo-amarelo originárias de várzeas associadas ao Rio Piracicaba e alguns de seus tributários no estado de São Paulo, Brasil, foram avaliadas quanto à variação genética entre populações e o parentesco entre indivíduos. Foi detectada variabilidade entre indivíduos originários de sitos diferentes, mesmo entre aqueles com pequena distância geográfica. Os resultados sugerem que os grupos amostrados em cada sítio são compostos predominantemente por indivíduos aparentados. Uma possível combinação de alta taxa de mortalidade e baixa taxa de natalidade pode ser a explicação do baixo número de indivíduos dispersos com sucesso por geração entre os sítios estudados. Esses marcadores podem auxiliar na compreensão dos processos metapopulacionais que aparentemente ocorrem na espécie. / New genetic markers were characterized for the broad-snouted caiman (Caiman latirostris) by constructing libraries enriched for microsatellite DNA. One microsatellite was developed from a (ACC/TGG)n enriched microsatellite DNA library and 12 from a (AC/TG)n enriched microsatellite DNA library. These markers were tested in Caiman latirostris individuals and resulted in seven new polymorphic microsatellites for the specie. Additionally four Alligator mississipiensis microsatellite markers previously transferred for Caiman latirostris were used. Samples from broad-snouted caimans from small wetlands associated with the Piracicaba River and some of its tributaries in the state of São Paulo, Brazil were used to study the genetic variation between populations and parentage between individuals. Genetic variability was detected among individuals from different sites, even those within a small geographic distance. The results suggest that the groups sampled at each site are composed predominantly of related individuals. A possible combination of high mortality and low natality rates in the fragmented Caiman latirostris populations may explain the low number of successfully dispersed individuals per generation observed between the sites studied. These markers might help to understand the metapopulation processes that are occurring within this species.

Made available in DSpace on 2015-03-04T18:51:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese-anariodoce.pdf: 2089941 bytes, checksum: e12d7ae40046ae6cfc796af142908753 (MD5) Previous issue date: 2008-05-19 / Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / Most marine benthic invertebrates have a complex life cycle in which the adult phase is preceded by a planktonic larval phase. The passive nature of larval dispersal of these species results in a larval transport governed by hydrodynamic processes like advection and eddy diffusion. The recruitment depends on a variety of physical and biological factors, which include spawning, larval dispersal and survival, larval settlement, metamorphosis, post-settlement events, inter-specific and intra-specific competitions. In order to assess interactions between oceanographic and biological processes that determine the population dynamics of marine organisms with a sessile adult phase restricted to the coastline and a planktonic larval phase, we develop a stage-structured finite element model for the barnacle Balanus glandula that inhabits the rocky intertidal zone of central California, USA. As the larval dispersal depends on knowing the flow pattern, we also develop a numerical procedure to couple physical and biological models in a very simple way when the velocity flow field is known of some discrete points of the domain of interest and at a given time. We investigate the effects of different flow patterns and velocity speeds on the abundance and the distribution of this organism as well as the influence of other abiotic interactions such as temperature and habitat quality. The interplay of different intra- and inter-specific competitions is also addressed. / A maioria das espécies marinhas possui um ciclo de vida complexo em que a fase adulta é precedida por uma fase larval pelágica. Os adultos produzem larvas que são soltas na coluna d'água onde elas são influenciadas por processos hidrodinâmicos como advecção e difusão turbulenta. Para os organismos que na maturidade são fixos a um substrato, como as cracas em particular, estudos mostram que estes processos podem afetar diretamente o assentamento das larvas e a dinâmica das populações de adultos. Neste trabalho apresentamos um modelo em Elementos Finitos que permite estudar as interações entre os processos biológicos e oceanográficos na dinâmica de um organismo marinho (craca Balanus glandula) com uma fase adulta séssil restrita à linha costeira e uma fase larval planctônica. Alguns cenários são investigados no estudo da variação, ao longo do tempo e do espaço, do número de indivíduos e da distribuição desta população, com o objetivo de entender, explicar e predizer como os fatores abióticos e bióticos afetam tais variações. O modelo considerou a dinâmica da população estágio-estruturada tanto de uma única espécie quanto de duas espécies, diferentes padrões idealizados de correntes marinhas, qualidade do habitat, influência da temperatura e reconstrução do campo de velocidades a partir de dados locais.

Seleção balanceadora é um processo evolutivo que engloba diversos mecanismos: vantagem do heterozigoto, seleção dependente de frequência, pressões seletivas que variam ao longo do tempo ou do espaço, e alguns casos de pleiotropia. O estudo desses mecanismos em si foi e ainda é um tópico de grande interesse para os biólogos evolutivos, e moldou o estudo da evolução ao longo do último século. Antes de a teoria neutra ter sido proposta, acreditava-se que a seleção balanceadora fosse comum. A descoberta de que muita da diversidade genética observada podia ser explicada por evolução neutra motivou, portanto, uma melhor compreensão da seleção balanceadora como um regime seletivo capaz de manter variantes vantajosas nas populações. O estudo da seleção balanceadora, em seus primórdios, foi restrito a organismos que podiam ser manipulados em laboratório. Com o advento de métodos que permitiam quantificar a variabilidade genética - tais como a eletroforese de proteínas, sequenciamento em pequena escala e re-sequenciamento genômico de milhares de indivíduos -, a variabilidade genética humana passou a ser ativamente estudada e interpretada. Diversos estudos buscaram por assinaturas de seleção natural - i.e., padrões de variação genômica deixadas por tais regimes seletivos - e avaliaram seu significado comparando-as com o que seria esperado sob um cenário estritamente neutro. A maior parte desses esforços foram concentrados no estudo da seleção positiva, tida como o principal mecanismo responsável pela evolução adaptativa. Poucos estudos buscaram assinaturas de seleção balanceadora no genoma humano. Isso se deve em parte à escassez de métodos com alto poder para detectar tais assinaturas. Adicionalmente, estudos prévios não analisaram dados em escala genômica, ou se concentraram principalmente nas regiões codificadoras de proteínas. Aqui, nós descrevemos um método simples e com alto poder para detectar assinaturas de seleção balanceadora. Em humanos, esse método supera outros comumente usados para a detecção de tais assinaturas e, em teoria, poderia ser usado para detectá-las em outras espécies, desde que seu poder seja avaliado caso-a-caso através de simulações neutras. Nosso método (\"Non-Central Deviation\", NCD) é apresentado em duas versões: NCD2, que requer informação acerca dos polimorfismos da espécie analisada e das substituições entre essa espécie e um grupo externo, e NCD1, que requer apenas informação acerca dos polimorfismos da espécie analisada. Embora em humanos NCD2 supere NCD1, este último pode ser utilizado para espécies para as quais não haja informação de um grupo externo. Quando aplicamos NCD2 a dados humanos, usando chimpanzé como grupo ex- terno, encontramos mais de 200 genes codificadores de proteínas com forte assinatura de seleção balanceadora, dos quais apenas 1/3 tinha evidência prévia de seleção balanceadora. Encontramos também um enriquecimento para diversas categorias de ontologia gênica, das quais cerca da metade é relacionada à imunidade. Verificamos que dentre os genes com evidências de seleção balanceadora há um excesso de casos de expressão preferencial em tecidos tais como \"adrenal\" e \"pulmão\", e também um excesso de genes com expressão mono-alélica. No geral, vimos que as regiões selecionadas no genoma humano incluem tanto sítios codificadores quanto regulatórios. Não encontramos um excesso de assinaturas de seleção balanceadora em regiões regulatórias, ao contrário do que reportaram outros estudos. Finalmente, encontramos um excesso de polimorfismos não-sinônimos em relação aos sinônimos nos genes selecionados. Tendo documentado a ocorrência de seleção balanceadora no genoma humano e identificado genes que foram potencialmente alvos deste regime seletivo, nós investi- gamos as consequências evolutivas desse processo. Nós partimos da hipótese que a seleção balanceadora sobre um sítio reduz a eficiência com a qual a seleção purificadora elimina variantes deletérias em sítios vizinhos. Esse processo é uma consequência do quanto a seleção sobre um loco afeta, através de ligação genética, as frequências de sítios não-neutros adjacentes. Testamos essa hipótese examinando se os genes sob seleção balanceadora apresentam um excesso de variantes deletérias em relação a expectativas derivadas a partir do restante do genoma. Usando três diferentes métricas para determinadas se e/ou o quão deletéria é uma dada variante, identificamos um excesso de variantes deletérias dentro dos genes sob seleção balanceadora, e mostramos que tal padrão não pode ser atribuído a efeitos confundidores. Esse achado mostra que, juntamente com os benefícios associados à variação adaptativa, a seleção balanceadora aumenta o fardo de mutações deletérias no genoma humano. De forma geral, nossos achados sugerem que a seleção balanceadora provavelmente mantém variantes genéticas envolvidas em uma miríade de processos biológicos além da imunidade e que ela foi mais comum no genoma humano do que se acreditava anteriormente, afetando entre 1-8% dos genes codificadores de proteínas, bem como diversas regiões não-codificadoras. Adicionalmente, a seleção balanceadora parece ser importante para a evolução humana não apenas por seu efeito sobre a aptidão, mas também por ter sido uma importante força capaz de moldar a diversidade genética observada atualmente em humanos e a susceptibilidade a doenças / Balancing selection is an evolutionary process that encompasses several mechanisms: heterozygote advantage, negative frequency dependent selection, selective pressure that fluctuates in time or in space, and some cases of pleiotropy. The study of these mechanisms .per se has been and still is a topic of great interest for evolutionary biologists, and has shaped the study of evolution throughout the last century. Before the proposition of the neutral theory of molecular evolution, it was believed that balancing selection was pervasive. The realization that much of the observed genetic diversity could be explained by neutral evolution thus motivated a better understanding of balancing selection as a selective regime capable of maintaining adaptive variants in populations. The study of balancing selection, in its early stages, was restricted to organisms that could be manipulated in the laboratory. With the advent of methods that allowed quantification of genetic variation - such as protein electrophoresis, small scale sequencing and genome-wide re-sequencing of thousands of individuals - human variation started to be actively studied and interpreted. Several studies have looked for signatures of natural selection - i.e., patterns of genomic variation that selective regimes leave in the genome - and evaluated their significance by comparing them to what would be expected under a strictly neutral scenario. Most of these efforts focused on the study of positive selection, thought of as the prime mechanism responsible for adaptive evolution. Only a few studies looked for signatures of balancing selection in the human genome. This is partially due to the paucity of powerful methods to detect its signatures. Moreover, previous studies either did not analyze data on genomic scale or focused primarily on protein-coding regions. Here, we describe a powerful and simple method to detect signatures of balancing selection. In humans, it outperforms other methods commonly used to detect such signatures and could in theory be used for other species, provided that its power is evaluated for each species through neutral simulations. Our method (\"Non-Central Deviation\", NCD) has two versions: NCD2, which requires polymorphism information on the ingroup species, as well as divergence information between the ingroup and an outgroup species, and NCD1, which only requires the ingroup information. Although NCD2 is more powerful for humans, NCD1 can be used for species that lack information from an outgroup. When applying NCD2 to human data, using chimpanzee as the outgroup, we found more than 200 protein-coding regions with strong signatures of balancing selection, only 1/3 of which had prior evidence for balancing selection. There was also an enrichment for several gene ontology categories, approximately half of which are related to immunity. We also found that among genes with evidence for balancing selection there was an excess of cases of preferential expression in specific tissues, such as \"adrenal\" and \"lung\", and an excess of genes with mono-allelic expression. Overall, we found that selected regions of the genome include both coding and regulatory sites. We failed to find a marked excess of balancing selection in regulatory regions, as reported in previous studies. Finally, we found an excess of nonsynonymous versus synonymous polymorphisms within the selected genes. Having documented the occurrence of balancing selection in the human genome and identified genes which were potential targets of this selective regime, we next investigated evolutionary consequences of this process. We hypothesized that balancing selection acting on a site reduces the efficiency with which purifying selection purges deleterious variants at nearby sites. This process is a consequence of how the dynamics of selection at one locus, mediated by linkage, can interfere with the frequencies of adjacent non-neutral sites. We tested this hypothesis by examining if the genes under balancing selection show an excess of deleterious variants with respect to expectations derived from the remainder of the genome. Using three different metrics to determine deleteriousness, we identified a significant excess of deleterious variants within balanced genes, and we show that this pattern cannot be attributed to confounding factors. This finding shows that together with the benefits associated with adaptive variation, balancing selection is increasing the burden of deleterious mutations in the human genome. Overall, our findings suggest that balancing selection likely maintains variation in a myriad of biological processes other than immunity and that it has been more common in the human genome than previously thought, affecting between 1-8% of human protein-coding genes, as well as a number of non-protein coding regions. Moreover, balancing selection appears to be important to human evolution not only because of its influence on fitness, but also because it has been an important force shaping current human genetic diversity and susceptibility to disease

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O objetivo primou por suas análises, com foco nos processos de decisão e nos impactos que reverberam sobre as populações tradicionais. Para averiguação, os Planos de Utilização das Áreas de Proteção das Nações Unidas (APNU) Reserva Extrativista do Rio Cajari, no Brasil e a Reserva Nacional Allpahuayo Mishana, no Peru foram analisados. Diante disso, as hipóteses são que os idealizadores dos empreendimentos consideram que a opinião das populações tradicionais em nada contribui, que as mesmas impedem o “desenvolvimento” da sociedade, ou ainda, não querem gastar tempo com a articulação e participação. Estas constatações podem levar a submissão das populações às regras exógenas de convívio na região, que inibem, por exemplo, as atividades econômicas tradicionalmente realizadas, como a proibição da retirada de qualquer bem da natureza para uso comercial. Às disputas políticas nas organizações e as expectativas criadas e não atendidas são outras teorias verificadas. Para tal, o estado da arte sobre política pública, biodiversidade e sustentabilidade foi construído. A metodologia que possibilitou o caminho para pensar foi a interdisciplinaridade apoiada pela análise de conteúdo e a comparação, uma combinação de condições possíveis de serem examinadas a fundo. Os resultados mostram escassa participação das comunidades tradicionais e acentuada presença das decisões pelas instituições governamentais. Tanto os projetos deixam evidencias quanto nas reservas visitadas a prática que implica em diferentes impactos. Conclusão, o fato fragiliza as comunidades tradicionais política e economicamente e as reservas ficam sob constante desafio de permanecerem como unidade territorial a ser conservada. A tese está dividida em capítulo 1 Introdução, onde o objetivo, objeto do estudo, problemas, hipóteses, justificativa, metodologia são apresentados. No capítulo 2, o marco teórico conceitual está organizado analiticamente sobre as categorias políticas, política pública, política pública ambiental, biodiversidade, populações tradicionais, sustentabilidade, processo de tomada de decisão e impacto. Nos capítulos 3 e 4 trabalha-se com a história ambiental brasileira e peruana e as políticas públicas ambientais implementadas nestes países. No capítulo 5 o PROBIO é descrito e analisado, assim como o projeto de utilização da reserva extrativista do rio Cajari, Amapá. O mesmo é feito com a Estratégia e Plano de Ação do Peru, bem como o Plano Mestre da reserva nacional Allpahuayo Mishana, Loreto. No capítulo 6 apresenta a análise de conteúdo dos projetos constante no capítulo anterior, bem como a avaliação comparativa. E por fim, no capítulo 7 a conclusão traz a verificação de que as populações tradicionais ficam ausente do processo decisório de acordo com diferentes situações e que isto impacta suas vidas nos resultados e na consolidação do processo de decisão sociocultural, política e econômica. / Projects of the Convention on Biological Diversity (CBD): Analyzes of the Public Policies of Brazil and Peru is the title of this thesis. It deals with two projects approved by the Global Environment Facility (GEF) called the Project for the Conservation and Sustainable Use of Brazilian Biodiversity (PROBIO) and the Strategy and Plan of Action for the Conservation and Sustainable Use of Biological Diversity in Peru (Strategy and Action Plan from Peru). The two were developed by the Ministries of the Environment of the two countries in partnership with regional public institutions and non-governmental organizations. The objective was based on the analysis, focusing on the decision processes and the impacts that reverberate on the traditional populations. The United Nations Protection Areas Utilization Plans (UNPA) Extractive Reserve of the Cajari River in Brazil and the Allpahuayo Mishana National Reserve in Peru were analyzed. In view of this, the hypotheses are that the idealizers of the enterprises consider that the opinion of the traditional populations does not contribute anything, that they prevent the "development" of the society, or even, do not want to spend time with the articulation and participation. These findings may lead to the submission of populations to the exogenous rules of living in the region, which inhibit, for example, traditional economic activities such as the prohibition of the withdrawal of any good from nature for commercial use. Political theories in organizations and expectations created and missed are other theories. To this end, the state of the art on public policy, biodiversity and sustainability has been built. The methodology that enabled the way to think was interdisciplinarity supported by content analysis and comparison, a combination of conditions that could be examined in depth. The results show little participation of the traditional communities and the presence of decisions by governmental institutions. Both the projects leave evidence and in the reservations visited the practice that implies in different impacts. Conclusion, the fact weakens the traditional communities politically and economically and the reserves are under constant challenge to remain as territorial unit to be conserved. The thesis is divided in chapter 1 Introduction, where the objective, object of the study, problems, hypotheses, justification, methodology are presented. In chapter 2, the conceptual framework is organized analytically on the political categories, public policy, environmental public policy, biodiversity, traditional populations, sustainability, decision making and impact. In chapters 3 and 4 we work on the Brazilian and Peruvian environmental history and the environmental public policies implemented in these countries. In chapter 5 the PROBIO is described and analyzed, as well as the project to use the extractive reserve of the river Cajari, Amapá. The same is done with the Strategy and Plan of Action of Peru, as well as the Master Plan of the national reserve Allpahuayo Mishana, Loreto. Chapter 6 presents the analysis of project content in the previous chapter, as well as comparative evaluation. Finally, in chapter 7, the conclusion shows that traditional populations are absent from the decision-making process according to different situations and that this impacts their lives on the results and consolidation of the socio-cultural, political and economic decision-making process. / Proyectos de la Convención sobre Diversidad Biológica (CDB): Análisis de las Políticas Públicas de Brasil y Perú es el título de esta tesis. La misma trata sobre dos proyectos aprobados por el Global Environment Facility (GEF) denominados Proyecto de Conservación y Uso Sostenible de la Biodiversidad Brasileña (PROBIO) y Estrategia y Plan de Acción para la Conservación y Utilización Sostenible de la Diversidad Biológica en Perú (Plan de Estrategia y Acción Del Perú). Los dos fueron desarrollados por los Ministerios de Medio Ambiente de los dos países en asociación con instituciones públicas regionales y organismos no gubernamentales. El objetivo primó por sus análisis, con foco en los procesos de decisión y en los impactos que reverberan sobre las poblaciones tradicionales. Para la investigación, los Planes de Utilización de las Áreas de Protección de las Naciones Unidas (APNU) Reserva Extractiva del Río Cajari, en Brasil y la Reserva Nacional Allpahuayo Mishana, en el Perú, fueron analizados. Por lo tanto, las hipótesis son que los idealizadores de los emprendimientos consideran que la opinión de las poblaciones tradicionales en nada contribuye, que las mismas impiden el "desarrollo" de la sociedad, o aún, no quieren pasar tiempo con la articulación y la participación. Estas constataciones pueden llevar a la sumisión de las poblaciones a las reglas exógenas de convivencia en la región, que inhiben, por ejemplo, las actividades económicas tradicionalmente realizadas, como la prohibición de la retirada de cualquier bien de la naturaleza para uso comercial. A las disputas políticas en las organizaciones y las expectativas creadas y no atendidas son otras teorías verificadas. Para ello, el estado del arte sobre política pública, biodiversidad y sostenibilidad fue construido. La metodología que posibilitó el camino para pensar fue la interdisciplinaridad apoyada por el análisis de contenido y la comparación, una combinación de condiciones posibles de ser examinadas a fondo. Los resultados muestran escasa participación de las comunidades tradicionales y acentuada presencia de las decisiones por las instituciones gubernamentales. Tanto los proyectos dejan evidencias como en las reservas visitadas la práctica que implica en diferentes impactos. Conclusión, el hecho fragiliza a las comunidades tradicionales política y económicamente y las reservas quedan en constante desafío de permanecer como unidad territorial a ser conservada. La tesis está dividida en el capítulo 1 Introducción, donde el objetivo, objeto del estudio, problemas, hipótesis, justificación, metodología se presentan. En el capítulo 2, el marco teórico conceptual está organizado analíticamente sobre las categorías políticas, política pública, política pública ambiental, biodiversidad, poblaciones tradicionales, sostenibilidad, proceso de toma de decisión e impacto. En los capítulos 3 y 4 se trabaja con la história ambiental brasileña y peruana y las políticas públicas ambientales implementadas en estos países. En el capítulo 5 el PROBIO se describe y analiza, así como el proyecto de utilización de la reserva extractivista del río Cajari, Amapá. Lo mismo se hace con la Estrategia y Plan de Acción de Perú, así como el Plan Maestro de la reserva nacional Allpahuayo Mishana, Loreto. En el capítulo 6 presenta el análisis de contenido de los proyectos que figura en el capítulo anterior, así como la evaluación comparativa. Por último, en el capítulo 7 la conclusión trae la verificación de que las poblaciones tradicionales quedan ausentes del proceso decisorio de acuerdo con diferentes situaciones y que esto impacta sus vidas en los resultados y en la consolidación del proceso de decisión sociocultural, política y económica.

Made available in DSpace on 2016-04-20T12:32:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 2013azevedo-alm.pdf: 1111872 bytes, checksum: 946f32004c35716d59b4d03f6603b524 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2013 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães.Recife, PE, Brasil / Na esteira das mudanças no sistema público de saúde brasileiro, foi criado, em 1999, o Subsistema de Saúde Indígena, hoje gerido pela Secretaria Especial de Saúde Indígena do Ministério da Saúde. No estudo da política de saúde indígena o acesso constitui um importante aspecto a ser abordado, uma vez que características fenotípicas em países com forte sistema de classes e hierarquias sociais, como no caso brasileiro, podem significar maiores dificuldades de acesso aos serviços de saúde, bem como a outros bens e serviços coletivos. Os Xukuru do Ororubá têm uma longa história de contato com sociedades nacionais brasileiras e apresentam uma organização sociopolítica própria, decorrente em grande parte da luta que protagonizaram pela retomada de suas terras e reconhecimento de sua identidade étnica. A presente pesquisa objetivou analisar o acesso à saúde na Terra Indígena (TI) Xukuru do Ororubá, buscando caracterizar as relações de poder como fator dinâmico associado ao acesso. Com base na sociologia de Pierre Bourdieu, foi realizado um estudo de caso, utilizando-se entrevistas, grupos focais, análise documental e observação direta. Como resultado, foi observado que as relações de poder no campo micro e macro da saúde indígena constituíram elementos importantes na garantia do acesso à saúde. Neste sentido, foi observado que a posição ocupada pelos indígenas nesse campo, resultado de longos anos de relações de contato conflituosas com a sociedade envolvente e o Estado, alterna entre a subalternidade e a busca de autonomia, aspectos constituintes de um habitus que orienta suas práticas frente às necessidades de acessar a atenção à saúde que procuram. Em diversas situações foi observado o exercício do poder no acesso à saúde associado ao diferentes tipos de capital ativos no campo da saúde indígena, sendo eles o cultural, o econômico, o social e o capital simbólico. Também se evidenciou a importância do capital étnico, seja como elemento facilitador, seja dificultador do acesso, dependendo dos fatores dinâmicos e o espaço de relações que o requereram

Novos marcadores genéticos foram caracterizados para jacaré-de-papo-amarelo (Caiman latirostris) pela construção de bibliotecas enriquecidas de DNA microssatélite. Um microssatélite foi desenvolvido a partir de uma biblioteca enriquecida de DNA microssatélite (ACC/TGG)n e 12 a partir de uma biblioteca enriquecida de DNA microssatélite (AC/TG)n. Esses marcadores foram testados em indivíduos da espécie Caiman latirostris e resultaram em sete novos microssatélites polimórficos. Adicionalmente quatro marcadores microssatélites de Alligator mississipiensis previamente transferidos para Caiman latirostris foram utilizados. Amostras de sangue jacarés-de-papo-amarelo originárias de várzeas associadas ao Rio Piracicaba e alguns de seus tributários no estado de São Paulo, Brasil, foram avaliadas quanto à variação genética entre populações e o parentesco entre indivíduos. Foi detectada variabilidade entre indivíduos originários de sitos diferentes, mesmo entre aqueles com pequena distância geográfica. Os resultados sugerem que os grupos amostrados em cada sítio são compostos predominantemente por indivíduos aparentados. Uma possível combinação de alta taxa de mortalidade e baixa taxa de natalidade pode ser a explicação do baixo número de indivíduos dispersos com sucesso por geração entre os sítios estudados. Esses marcadores podem auxiliar na compreensão dos processos metapopulacionais que aparentemente ocorrem na espécie. / New genetic markers were characterized for the broad-snouted caiman (Caiman latirostris) by constructing libraries enriched for microsatellite DNA. One microsatellite was developed from a (ACC/TGG)n enriched microsatellite DNA library and 12 from a (AC/TG)n enriched microsatellite DNA library. These markers were tested in Caiman latirostris individuals and resulted in seven new polymorphic microsatellites for the specie. Additionally four Alligator mississipiensis microsatellite markers previously transferred for Caiman latirostris were used. Samples from broad-snouted caimans from small wetlands associated with the Piracicaba River and some of its tributaries in the state of São Paulo, Brazil were used to study the genetic variation between populations and parentage between individuals. Genetic variability was detected among individuals from different sites, even those within a small geographic distance. The results suggest that the groups sampled at each site are composed predominantly of related individuals. A possible combination of high mortality and low natality rates in the fragmented Caiman latirostris populations may explain the low number of successfully dispersed individuals per generation observed between the sites studied. These markers might help to understand the metapopulation processes that are occurring within this species.

Orientadores: Flavio Antonio Maës dos Santos, Anete Pereira de Souza / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-23T14:51:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Baldauf_Cristina_D.pdf: 5411904 bytes, checksum: 0b452c576f0ddde99b1c88164de1b175 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: O resumo poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The abstract is available with the full electronic document / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutora em Biologia Vegetal

Orientador: Alexandre Magno Sebbenn / Co-orientador: Miguel Luiz Menezes Freitas / Banca: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Banca: João Antonio da Costa Andrade / Banca: Ana Aparecida Bandini Rossi / Banca: Rinaldo Cesar de Paula / Resumo: Genipa americana L., popularmente conhecida como jenipapo, é uma espécie arbórea neotropical cuja sobrevivência encontra-se ameaçada devido aos processos de destruição, fragmentação e degradação de seus ambientes naturais. Visando contribuir para a conservação in situ e ex situ dessa espécie, o objetivo deste trabalho foi investigar a diversidade genética, a estrutura genética espacial intrapopulacional (EGE), o sistema de reprodução e o fluxo gênico contemporâneo de G. americana em um pequeno remanescente florestal (7,2 ha) localizado na Mata da Figueira, na Estação Ecológica de Mogi-Guaçu, Mogi-Guaçú (SP). Na população estudada foram encontradas 188 árvores adultas e sementes foram colhidas e amostradas hierarquicamente entre e dentro de frutos diretamente da copa de 15 árvores matrizes em dois eventos reprodutivos consecutivos. Trinta e dois locos microssatélites foram desenvolvidos e validados em 40 indivíduos de G. americana. Destes, dezessete foram polimórficos, revelando de três a sete alelos por loco. Utilizando os genótipos das árvores-matrizes e progênies, foi investigada a herança mendeliana, ligação genética e o desequilíbrio genotípico de seis locos isolados de G. americana, não sendo detectado desequilíbrio genotípico. No entanto, foram detectados desvios significativos da segregação mendeliana em 20,4% e 36,7% e ligação genética entre os locos em 53% e 68% dos testes realizados nos eventos reprodutivos de 2010 e 2011, respectivamente. A riqueza alélica média dos adultos foi de 8,8, para os juvenis de 7,0 e para as sementes de 2010 e 2011, de 7,2 e 8,4, respectivamente. A heterozigosidade média esperada para os adultos foi de 0,581, para os juvenis de 0,568 e para as sementes de 2010 e 2011, de 0,576 e 0,735, respectivamente. A heterozigosidade média observada para os adultos foi de 0,499, juvenis de 0,356 e sementes de 2010 e 2011, 0,476 e 0,542, respectivamente. O índice ... / Abstract: Genipa americana L., popularly known as jenipapo is a neotropical tree species whose survival is threatened due to the processes of destruction, fragmentation and degradation of their natural habitats. To contribute to the conservation in situ and ex situ this species, the objective of this study was to investigate the genetic diversity, intrapopulation spatial genetic structure (SGS), the mating system and contemporary gene flow of G. americana in a small remnant forest (7.2 ha) located in the Mata da Figueira, in Mogi Guaçu Ecological Station, Mogi Guaçú (SP). In the population studied we found 188 adult trees and seeds were collected and sampled hierarchically within and among fruits directly from the tree canopy of 15 seed-trees on two consecutive reproductive events. Thirty-two microsatellite loci were developed and validated in 40 individuals of G. americana. Of these, seventeen were polymorphic, revealing of three to seven alleles per locus. Using the genotypes os seed-trees and progenies, was investigated Mendelian inheritance, genetic linkage and genotypic disequilibrium of six loci isolated of G. americana, not detecting genotypic disequilibrium. However, significant deviations from Mendelian segregation were found in 20.4% and 36.7 and genetic linkage between the loci in 53% and 68% of the tests performed in the reproductive events of 2010 and 2011, respectively. The average allelic richness of adults was of 8.8, for juvenile of 7.0 and seeds of 2010 and 2011, 7.2 and 8.4, respectively. The average expected heterozygosity for adults was of 0.581, for juvenile of 0.568 and seeds of 2010 and 2011, 0.576 and 0.735, respectively. The average observed heterozygosity for adults was of 0.499, for juvenile of 0.356 and seeds of 2010 and 2011, 0.476 and 0.542, respectively. The average fixation index was significantly different from zero for all samples, suggesting the occurrence of inbreeding. The multilocus crossing rate ( t m ) in ... / Doutor