Sinais de pressão seletiva têm sido descritos em vários genes. Dentre esses, os genes do sistema imune parecem ser um importante alvo de seleção natural. Diversos estudos têm demonstrado a atuação de pressões seletivas também modulando o padrão de diversidade de regiões reguladoras. Populações Ameríndias possuem uma história evolutiva relativamente recente, com processos demográficos marcantes e novos desafios ambientais trazendo diferentes pressões seletivas. Dessa forma, elas oferecem ótimas oportunidades para estudos de seleção natural. Com o intuito de ampliar os conhecimentos sobre como a seleção natural vem atuando nas populações humanas, o presente estudo propôs uma análise populacional de três loci de função imunológica, caracterizados previamente como alvos de seleção, em populações Ameríndias: dois pertencentes ao complexo KIR (KIR2DL4 e KIR3DL1/S1) e regiões regulatórias do gene HLA-G. Evidências de ação de seleção balanceadora em populações Ameríndias foram encontradas para os genes KIR2DL4 e KIR3DL1/S1. Para KIR3DL1/S1 foram observadas evidências de seleção natural atuando em dois níveis diferentes de variação: (1) para a ausência e presença dos alótipos KIR3DL1 e KIR3DL1/S1 e (2) para a manutenção de diferentes linhagens do alótipo KIR3DL1/S1. Comparações da diversidade do gene KIR2DL4 com marcadores autossômicos mostram que os processos demográficos têm um importante papel na modulação da variabilidade genética observada nessas populações, mas não explicam todos os padrões de variação encontrados. Os resultados de análises das regiões promotora e 3\'UTR do gene HLA-G mostraram evidências de seleção balanceadora atuando na região promotora em populações Ameríndias e na região 3\'UTR em uma população européia. Além disso, análises dessas duas regiões conjuntas mostraram que essas estão altamente associadas e dois haplótipos divergentes em alta freqüência foram encontrados, os quais podem estar relacionados com diferentes atividades reguladoras. Análises dos SNPs encontrados nas regiões reguladoras do HLA-G não mostraram associação com diferenças nos níveis de expressão da molécula. Esse resultado sugere que mais do que SNPs individuais, a combinação desses SNPs em diferentes haplótipos é responsável pela variação dos níveis de expressão da molécula HLA-G. / The diversity of several genes has been explained by the action of natural selection. Among them, the immune system genes are highlighted. In addition, several studies have demonstrated the action of selective pressure modulating the diversity of regulatory regions. Amerindian populations have a relatively recent evolutionary history, with remarkable demographic processes and new environmental challenges with different selection pressures. Therefore, those populations are excellent candidates for studies of natural selection. In order to broaden the knowledge of how natural selection has been acting in human populations, this study proposed a population analysis of three loci, previously characterized as targets of selection in Amerindian populations: two from the KIR complex (KIR2DL4 and KIR3DL1/S1) and regulatory regions of HLA-G. Evidence of action of balancing selection in Amerindian populations was found for KIR2DL4 and KIR3DL1/S1 genes. For KIR3DL1/S1 gene were observed evidences of natural selection acting on two different levels of variation: (1) absence and presence of KIR3DL1 and KIR3DL1/S1 allotypes and (2) maintenance of different strains of KIR3DL1 allotype. Correlations between the diversity of KIR2DL4 and autosomal markers show that the demographic processes have an important role in modulating the genetic variation observed in these populations, but do not explain all the variation patterns found. The results of analysis of promoter regions and 3\'UTR of the HLA-G gene revealed evidence of balancing selection acting at the promoter region in Amerindian populations and at the 3\'UTR region in a European population. Furthermore, the analysis of these two regions together showed that t both are highly related and divergent haplotypes at high frequency were found, which may be related to different regulatory activities to maintain a balance of high and low expression of the gene. Analyses of SNPs found in the regulatory regions of HLA-G were not associated with differences in expression levels of the molecule. Together, these results suggest that the effetcs

Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2016-08-30T18:10:58Z No. of bitstreams: 2 ROSIMEIREGASSI.pdf: 293845 bytes, checksum: c4b1aaea4995957cbf4d00215b3917cc (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-30T18:10:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 ROSIMEIREGASSI.pdf: 293845 bytes, checksum: c4b1aaea4995957cbf4d00215b3917cc (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2010-02-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The aim of this work was evaluate the agroeconomic production of tannia, in function of spacing among plants (10 and 15 cm among plants) and mulching with semi-decomposed chicken manure (0; 10 and 20 t ha-1). The treatments were arranged as 2 x 3 factorial, in experimental design randomized block, with four replications. The harvest was performed at 225 days after planting, when more than 50% of plants shoot showed symptoms of senescence. The maximum height was 35,56 cm, achieved at 164 days after planting with 10 cm among plants and 20 t ha-1 of semi-decomposed chicken manure and the lower maximum height was 29,17 cm, achieved at 157 days after planting with 15 cm among plants and 20 t ha-1 of semi-decomposed chicken manure. There was significant effect of interaction between spacing among plants and doses of chicken manure to production of fresh weight of average cormels, where the higher yield (2,71 t ha-1) were without the use of chicken manure in soil and 15 cm among plants. The highest productions of fresh weight of shoot (1,43 t ha-1), small cormels (3,10 t ha-1), larger diameter of cormels (15,27mm) were obtained under spacing of 10 cm among plants and the greatest length of cormels (25,93 mm) and diameter of small cormels (11,91 mm) were in soil covered with 10 t ha-1 and 0 t ha-1, respectively. The highest yield of marketable corms (6,42 t ha-1) was of plants with spacing of 15 cm and 10 t ha-1 of chicken manure in mulching. By calculated values for production costs (R$ 5.137,55) and liquid income (R$ 4.042,00), the grower can produce the tannia, using the spacing of 15 cm among plants and without the use of chicken manure. / O objetivo do trabalho foi avaliar a produção agroeconômia do mangarito, em função de espaçamentos entre plantas (10 e 15 cm entre plantas) e da cobertura do solo com cama-de-frango semidecomposta (0; 10 e 20 t ha-1). Os tratamentos foram arranjados como fatorial 2x3, no delineamento experimental de blocos casualizados, com quatro repetições. A colheita foi realizada aos 225 dias após o plantio, quando mais de 50% da parte aérea das plantas apresentavam sintomas de senescência. A maior altura máxima das plantas foi de 35,56 cm, atingida aos 164 dias após o plantio no espaçamento de 10 cm entre plantas e com 20 t ha-1 de cama-de-frango e a menor altura máxima foi de 29,17 cm alcançada aos 157 dias após o plantio, com 15 cm entre plantas e 20 t ha-1 de cama-de-frango. Houve efeito significativo da interação espaçamentos entre plantas e doses de cama-de-frango para a produção de massa fresca de rizomasfilho médios, sendo as maiores produções (2,71 t ha-1) sob 15 cm entre plantas sem o uso de cama-de-frango no solo. As maiores produções de massa fresca da parte aérea (1,43 t ha-1), rizomas-filho pequeno (3,10 t ha-1), maior diâmetro dos rizomas-filho médios (15,27mm) foram obtidos sob espaçamento de 10 cm entre plantas, independente da cama e os maiores comprimento dos rizomas-filho médios (25,93 mm) e diâmetro dos rizomas-filho pequenos (11,91 mm) foram em solo coberto com 10 t ha-1 e 0 t ha-1 de cama-de-frango, respectivamente, independente do espaçamento. A maior produção de rizomas comercializáveis (6,42 t ha-1) foi das plantas sob espaçamento de 15 cm e 10 t ha-1 de cama-de- frango na cobertura do solo. Pelos valores calculados para os custos de produção (R$ 5.137,55) e a renda líquida obtida (R$ 4.042,00), o produtor pode cultivar o mangarito, utilizando o espaçamento de 15 cm entre plantas e sem o uso de cama-de- frango.

Zoobotryon verticillatum (delle Chiaje, 1822) é um briozoário cosmopolita amplamente distribuído em regiões tropicais e temperadas em todos os oceanos. Por possuir meios de distribuição natural restritos, é possível supor que o táxon se trate de um complexo de espécies crípticas ou de uma espécie vastamente introduzida por ação antrópica. Para elucidar essa questão, foram realizadas análises populacionais e filogenéticas utilizando-se dois genes mitocôndrias, citocromo c oxidase subunidade 1 região 3\' (COI-3P) e subunidade ribossomal RNA 16S (16S). As análises filogenéticas suportaram o monofiletismo de Z. verticillatum e, juntamente com as análises populacionais, indicam que é uma única espécie distribuída mundialmente. A falta de uma estrutura geográfica evidente nas redes haplotípicas, a ausência majoritária de relacionamentos dicotômicos e clados altamente suportados (pp >= 5%) nas árvores filogenéticas, a falta de resultados significativos na maioria dos teste D e Fs realizados, a baixa diversidade genética em nível populacional e a falta de diferenciação genética entre a maioria das populações comparadas são compatíveis com um processo distribuição antrópico para Z. verticillatum. No entanto, com base nos resultados obtidos durante esta pesquisa, não é possível inferir um possível centro de dispersão ou local de origem para a espécie. / Zoobotryon verticillatum (delle Chiaje, 1822) is a cosmopolitan bryozoan largely distributed in tropical and temperate waters of all oceans. With limited natural dispersal capabilities, it is reasonable to suppose that the taxon is a complex of cryptic species or a widespread species due to anthropogenic activity. In order to elucidate this question, analyses of two mitochondrial genes, cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) and ribosomal RNA subunit (16S) were conducted. Phylogenetic data supported the monophyletism of Z. verticillatum and, together with the population analysis, indicated that it is one species with worldwide distribution. The absence of geographical structure in the haplotype networks, the majority absence of dichotomous relationships, and highly supported clades (pp >= 5%) in phylogenetic trees, the lack of significance in the D test and Fs statistics, the low genetic diversity at the population level and the lack of genetic differentiation between most of the population comparison are consistent with anthropogenic introduction process for Z. verticillatum. However, based on the results obtained during this study, it is not yet possible to infer the center of dispersion for the species.

Orientadores: Renato Goldenberg, Eric de Camargo Smidt / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T20:23:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lima_DuaneFernandesdeSouza_M.pdf: 1493288 bytes, checksum: 566fff6ad040de8b43cce900a2078622 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Myrtaceae é conhecida como uma das mais complexas famílias de angiospermas. Myrcia teve sua última revisão taxonômica realizada há 153 anos e desde então inúmeras espécies novas foram descritas, deixando Myrcia como o segundo maior gênero da tribo Myrteae. O elevado número de espécies no gênero e a falta de uma revisão taxonômica completa e atualizada fez com que vários complexos de espécies mal delimitadas fossem formados em Myrcia. Um destes complexos é abordado no presente trabalho e inclui quatro espécies (M. laruotteana, M. lajeana, M. selloi e M. tomentosa) de ampla distribuição e grande variação morfológica, tornando difícil a separação entre os táxons. Neste estudo foram usados marcadores ISSR para investigar a correlação entre a variabilidade genética de populações destas espécies com aspectos morfológicos, geográficos, fitogeográficos e taxonômicos, a fim de esclarecer a delimitação das espécies. Levando em conta os resultados obtidos nestas análises, uma nova proposta de classificação específica é apresentada, com descrições dos táxons aceitos, dados de distribuição geográfica, floração e frutificação, e chave de identificação. No estudo de genética de populações com ISSR, o valor de diversidade genética encontrado (He = 0,215) foi mais baixo que o valor para espécies perenes, de distribuição ampla e fecundação cruzada. Isto pode ser explicado em partes pela auto-compatibilidade que as espécies do complexo M. laruotteana podem apresentar, como já relatado na literatura. Nenhum dos grupos que refletem aspectos morfológicos, geográficos e fitogeográficos testados apresentou boa estruturação genética, ou seja, nenhum deles mostrou alguma descontinuidade genética que pudesse representar os táxons envolvidos no complexo. Os grupos testados que representam a circunscrição taxonômica atual do complexo também não apresentaram boa estruturação genética. Os grupos formados a partir da análise Bayesiana mostraram melhor estruturação genética a partir da AMOVA (12% de variação entre as populações dentro dos grupos e 27% de variação entre os grupos). A análise Bayesiana juntamente com o dendrograma formado demonstra uma separação em dois grandes grupos, o primeiro formado por todas as populações de M. tomentosa, e o segundo contendo as populações das outras espécies misturadas. A partir destes resultados e levando em consideração toda a variação existente entre os extremos morfológicos das espécies, é proposta uma nova classificação para o complexo, com sinonimização de M. lajeana sob M. laruotteana. Myrcia tomentosa e M. laruotteana podem ser reconhecidas principalmente pelo indumento, geralmente denso na primeira e quase ausente na segunda. Myrcia selloi pode ser reconhecida pela queda dos remanescentes do hipanto e do cálice, deixando os frutos com uma cicatriz circular apical / Abstract: Myrtaceae is known as one of the most complex families of angiosperms. The last taxonomic revision of Myrcia was made 153 years ago and since then many new species were described, leaving Myrcia as the second largest genus of the tribe Myrteae. The high number of species in the genus and the lack of a complete and updated taxonomic revision resulted in many species complexes in Myrcia. One of these complexes is investigated in this work and includes four species (M. laruotteana, M. lajeana, M. selloi and M. tomentosa) with wide distribution and a lot of morphological variation, making it difficult to distinguish these taxa. This study used ISSR markers to investigate the correlation between the genetic variability of populations of these species with morphological, geographical, phytogeographic and taxonomic aspects, in order to clarify the delimitation of species. Taking into account the results obtained in these analyzes, a new proposal of specific classification is presented with descriptions of accepted taxa, geographical, flowering and fruiting data, and identification key. In the study of population genetics with ISSR, the value of genetic diversity (He = 0.215) was lower than the value for perennial, widely distributed and cross-fertilization species. This can be explained in part by self-compatibility that species within M. laruotteana complex apparently present, as previously reported in the literature. None of the groups that reflect morphological, geographical and phytogeographic aspects showed good genetic structure, i.e., none of them showed any genetic discontinuity that could represent the taxa involved in the complex. The groups represented by the current taxonomic circumscription of the complex also did not show good genetic structure. The groups formed from the Bayesian analysis showed better genetic structure from the AMOVA (12% variation among populations within groups and 27% variation between groups). The Bayesian analysis with the dendrogram formed showed two major groups, the first with all populations of M. tomentosa, and the second containing mixed populations from other species. From these results and taking into account the large amount of variation between the morphological extremes of the species, we propose a new classification for the complex, with the synonymization of M. lajeana under M. laruotteana. Myrcia tomentosa and M. laruotteana differ from each other mainly by the indumenta, which is dense in the former and almost absent in the latter. Myrcia selloi differs from the others by the caduceus remnants of the hypanthium and calyx, leaving circular apical scar on the fruit / Mestrado / Biologia Vegetal / Mestra em Biologia Vegetal

Orientadores: Hildete Prisco Pinheiro, Cibele Queiroz da Silva / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-08-02T18:55:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Souza_Robertade_M.pdf: 505447 bytes, checksum: a6bcef03248fd6806d13b3e8b0f300b8 (MD5) Previous issue date: 2002 / Mestrado / Mestre em Estatística

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-05T12:21:35Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Anne Karolline Ribeiro Costa.pdf: 1297682 bytes, checksum: 58e8b0b77590115f541c1eaa30f32d1d (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-05T12:21:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Anne Karolline Ribeiro Costa.pdf: 1297682 bytes, checksum: 58e8b0b77590115f541c1eaa30f32d1d (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / CNPq / Entender os fatores e interações que afetam a estrutura de comunidade em um ambiente recifal é importante para a compreensão e elaboração de propostas de manejo que visem a resiliência e conservação de populações instáveis no ambiente. Algumas estratégias de conservação e manutenção destes ecossistemas são as criações de áreas protegidas marinhas que vêm se tornando locais de recuperação e conservação de várias espécies restritas nestes ambientes. O trabalho procurou avaliar o efeito do fechamento da área recifal de Tamandaré, litoral Sul pernambucano após 14 anos de exclusão da pesca, na estrutura de comunidades bentônicas, especialmente em populações de ouriços Echinometra lucunter, abundância de corais e cobertura algal viva. Foram comparados dois recifes, dentro e fora da área fechada através de técnicas de censo visual subaquático com mergulhos livres, utilizando o método conjugado de linha de transects e quadrats no topo recifal durante três períodos do ano (Verão 2011; Outono 2012; verão 2012) empregados para avaliar a estimativa da densidade populacional de ouriços e corais; e a técnica de fotoquadrats para a estimativa de cobertura viva dos mesmos. Os resultados mostraram densidade média de ouriços E. lucunter sete vezes maior no recife aberto à pesca (Pirambu) em comparação ao recife fechado (Ilha da Barra) indicando que o efeito da pesca intensiva de seus predadores e a falta de organismos competidores por espaço e disponibilidade de alimento na área impactada, afeta diretamente a sua abundancia e distribuição, modificando a composição de outros organismos, complexidade topográfica e os processos ecológicos do local. Colônias do hidrocoral do gênero Millepora sp. apresentaram maior densidade populacional na área fechada, onde foram treze vezes mais abundantes neste recife em comparação ao recife adjacente. Para os corais escleractinios, as espécies Agaricia humilis e Favia gravida apresentaram maior densidade no recife do Pirambu, enquanto que Siderastrea stellata apresentou maior abundancia na Ilha da Barra. Apesar das diferenças encontradas entre as espécies, a cobertura geral viva geral destes organismos foi três vezes maior no recife fechado à pesca, indicando um ambiente mais propício para o crescimento destes corais neste recife. A cobertura algal viva apresentou diferenças significativas entre as duas áreas, onde foram mais abundantes na Ilha da Barra, cobrindo cerca de 80% do topo recifal, com exceção das algas calcarias incrustantes que apresentaram maior abundância no recife do Pirambu. Os resultados mostraram que a exclusão do uso de pesca no recife da Ilha da Barra, na área fechada de Tamandaré, vem mostrando capacidade de resiliência do ecossistema recifal, importante para a reestruturação e conservação do ecossistema marinho.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-10T08:50:58Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 982150 bytes, checksum: 8872406e51980e3f5e6b68d2f3485322 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-10T08:50:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 982150 bytes, checksum: 8872406e51980e3f5e6b68d2f3485322 (MD5) Previous issue date: 2014-02-24 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O gênero Anadenanthera (Leguminosae–Mimosoideae) está atualmente circunscrito como duas espécies com duas variedades cada uma de acordo com Altschul 1964: A. colubrina (Vell.) Brenan var. colubrina; A. colubrina var. cebil (Griseb.) Altschul; A. peregrina (L.) Speg. var. peregrina; e A. peregrina var. falcata (Benthan) Altschul, mas já foram consideradas como quatro espécies distintas segundo a classificação de Brenan 1955: A. colubrina (Vell.) Brenan, A. macrocarpa (Benth.) Brenan, A. peregrina (L.) Speg. e A. falcata (Benth.) Speg. Espécies de Anadenanthera Speg. ocorrem na maioria dos núcleos disjuntos das florestas estacionais, sendo a espécie A. colubrina var. cebil (Griseb.) Altschul mais amplamente distribuída nessas áreas e, por isso, considerada como espécie modelo para estudo da história evolutiva dessas florestas. O objetivo desse estudo foi caracterizar a diversidade genética de espécies do gênero Anadenanthera Speg. Doze marcadores microssatélites foram utilizados para genotipar 283 espécimes. Os resultados de três análises (STRUCTURE, NJ e PCoA) foram concordantes e mostraram claramente quatro grupos genéticos para o gênero Anadenanthera. A diferenciação de A. colubrina foi observada com microssatélites e ITS, mostrando congruência parcial entre os resultados desses marcadores. A diversidade genética em termos de riqueza alélica e heterozigosidade mostraram valores mais elevados e similares nas espécies A. macrocarpa, A. peregrina e A. falcata em comparação ao valor particularmente baixo encontrado para a espécie A. colubrina. Análises de pares de FST e número médio de migrantes entre populações de cada espécie sensu Altschul 1964 mostraram fluxo gênico restrito entre variedades. A diversificação de A. colubrina foi provavelmente anterior à diversificação das demais espécies. A baixa diversidade em A. colubrina foi possivelmente consequência da sua distribuição mais restrita e da elevada endogamia. A miscigenação das populações de A. falcata refletiu um cenário de expansão recente para essa espécie. Os resultados sugerem que a circunscrição das espécies de Anadenanthera proposta por Brenan é a mais adequada. / The Anadenanthera genus (Leguminosae - Mimosoideae) is currently circumscribed into two species with two varieties each according to Altschul 1964: A. colubrina (Vell.) Brenan var. colubrina; A. colubrina var. cebil (Griseb.) Altschul; A. peregrina (L.) Speg. var. peregrina; and A. peregrina var. falcata (Bentham) Altschul. However, they were already considered as four distinct species according to the classification of Brenan 1955: A. colubrina (Vell.) Brenan, A. macrocarpa (Benth.) Brenan, A. peregrina (L.) Speg. e A. falcata (Benth.) Speg. The Anadenanthera Speg. species occur in most of seasonal forests disjunct nucleus. The specie A. colubrina var. cebil (Griseb.) Altschul is more widely distributed in these areas and therefore considered as a model species for studying the evolutionary history of the seasonal forests. The aim of this study was to characterize the genetic diversity of the genus Anadenanthera Speg. Twelve microsatellite markers were used to genotype 283 specimens. The results of three analyzes (STRUCTURE, NJ and PCoA) were concordant and showed clearly four genetic groups in the Anadenanthera genus. The differentiation of A. colubrina was observed with microsatellites and ITS and showed partial congruence between the results of these markers. The genetic diversity under allelic richness and heterozygosity showed higher and similar values in the species A. macrocarpa, A. peregrina and A. falcata, compared to the lowest values found for the species A. colubrina. Analyzes of pairs of FST and mean number of migrants between populations of each species sensu Altschul 1964 showed restricted gene flow between varieties. The diversification of A. colubrina was probably before the diversification of other species. The low diversity in A. colubrina was possibly a consequence of its more restricted distribution and high inbreeding. The admixure of populations of A. falcata reflected a scenario of recent expansion of this species. The results suggest that the division of the species of Anadenanthera proposed by Brenan is the most suitable.

Orientador: Anete Pereira de Souza / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-27T05:05:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Francisco_PatriciaMara_D.pdf: 7911618 bytes, checksum: f90010b3ff20ba6416b899bcfb99b443 (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: Manguezais são ecossistemas com uma variedade incomum de animais e plantas adaptados às condições de alta salinidade, inundações frequentes e solo lodoso e anaeróbico. Ocorrem em locais onde há o encontro de águas de rios com a do mar. Diversos fatores bióticos e abióticos influenciam os padrões de diversidade de espécies de manguezais, como oceanografia, clima, topografia e condições do solo. A diversidade de plantas de mangue é muito reduzida, quando comparada com outros ecossistemas tropicais. O Brasil possui uma das maiores areas de manguezal do mundo e apresenta três gêneros de angiospermas de mangue. Um deles é Rhizophora, composto pelas espécies Rhizophora mangle, Rhizophora racemosa e, um possível híbrido, Rhizophora harrisonii. O objetivo da presente tese foi isolar e caracterizar locos microssatélites para essas espécies e estimar parâmetros populacionais como fluxo gênico, estruturação populacional, diversidade gênica e tamanho efetivo de população, além de estudar outros aspectos da biologia de Rhizophora, como uma possível zona de hibridação na região norte do país, taxa de cruzamento e o sistema reprodutivo. Com este propósito, foram coletados 318 indivíduos de R. mangle de 11 localidades ao longo da costa brasileira, e 33 indivíduos de R. racemosa e 37 indivíduos de R. harrisonii ambas coletadas de duas localidades no litoral brasileiro. Para identificar e caracterizar locos de microssatélites foram desenvolvidas bibliotecas enriquecidas em microssatélites para as três espécies. Utilizando os marcadores desenvolvidos na presente tese, bem como outros que já publicados, observou-se uma diferença significativa entre as populações no padrão de variação genética. A riqueza de alelos, heterozigosidades esperada e observada foram maiores na região norte. Os resultados sugerem que as espécies de Rhizophora não compõe apenas uma população panmítica ao longo do litoral brasileiro, devido à diferenciação existente entre as regiões norte e sul da costa. A análise do sistema reprodutivo de R. mangle de uma população do estado do Pará, encontramos valores que indicariam um sistema de reprodução misto. Em relação à hibridação contínua, não foram encontradas evidências de hibridação introgressiva entre as espécies de Rhizophora. Concluímos que com os resultados obtidos na presente tese foi possível contribuir para o maior conhecimento genético das espécies de Rhizophora spp. do litoral brasileiro / Abstract: Mangrove are ecosystems with an unusual variety of animals and plants adapted to conditions of high salinity and frequent floods and muddy anaerobic soil. Several abiotic factors influence the patterns of mangrove species diversity, such as oceanography, climate, topographic and soil conditions. The number of mangrove plant species is much reduced compared with other tropical ecosystems. Brazil has the second largest mangrove area in the world and has three genera of mangrove angiosperms. One genera is Rhizophora, composed of Rhizophora mangle, Rhizophora racemosa and a possible hybrid, Rhizophora harrisonii. The aim of this thesis was to isolate and characterize microsatellite loci for these species and estimate population parameters such as gene flow, population structure, genetic diversity and effective population size, and study other aspects of Rhizophora biology, as a possible hybrid zone in the north region of the Brazilian coast, crossing rate and the reproductive system. For this purpose, 318 individuals of R. mangle of 11 locations along the Brazilian coast, 33 individuals of R. racemosa and 37 individuals of R. harrisonii from two locations were collected. To identify and characterize the microsatellite loci, enriched microsatellite libraries for the three species were developed. Using the developed markers, and some others already published, we observed a significant difference between the populations in the pattern of genetic variation. Alleles richness, expected and observed heterozygosity were higher in the north. The results suggest that the species of R. mangle is not only composed of a single panmitic population due to differentiation found among the population from locales north and south of the Brazilian Coast. The reproductive system was evaluated studing a population of R. mangle from the state of Pará and we find values that would indicate a mixed mating system. Regarding the ongoing hybridization, we found no evidence of introgressive hybridization among the species leading to a hybrid species. We concluded that with this results it was possible to contribute to further genetic knowledge of Rhizophora spp. from the Brazilian coast / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutora em Genética e Biologia Molecular

Orientador: Edson Seizo Mori / Banca: Simey Thuruy Vieira Fisch / Banca: Mário Luiz Teixiera de Moraes / Resumo: O guapuruvu Schizolobium parahyba (Vell.) S. F. Blake é uma espécie pioneira de rápido crescimento da família Fabaceae (Leguminosae) de grande importância em projetos de restauração. Com o objetivo de verificar a variabilidade genética de progênies Schizolobium parahyba da região de Botucatu - SP foram estimados os parâmetros genéticos das características quantitativas de 10 locais. As mudas foram produzidas no viveiro do Departamento de Ciência Florestal - UNESP/Campus de Botucatu. O teste de progênies de polinização aberta foi instalado na Fazenda Experimental Lageado, UNESP/Campus de Botucatu e disposto no delineamento experimental em blocos casualizados com 60 progênies, três repetições, quatro plantas por parcelas lineares e em espaçamento 3 x 2 m. Os caracteres avaliados foram: diâmetro na altura do peito (DAP) e altura de plantas (H), em quatro idades: 2, 7, 14 e 20 meses, assim como a porcentagem de sobrevivência, aos 20 meses. Os dados foram analisados pelo software Selegen-REML-BLUP. Em média, as progênies de guapuruvu, aos 14 meses, atingiram 2,23 m de altura e 2,96 m aos 20 meses, com 6,0 e 7,5 cm de DAP, aos 14 e 20 meses, respectivamente. Os coeficientes de variação genética individual, variação genotípica entre progênies e variação relativa, mostraram uma variabilidade genética um pouco restrita e muito influenciada pelo ambiente, mesmo em condições onde os coeficientes de variação residual estão aceitáveis entre 12,8 e 21,1%, sendo um comportamento típico de caracteres altamente poligênicos, sugerindo o uso de seleção recorrente para a espécie. Os coeficientes de herdabilidade ao nível individual foram maiores para altura (0,32, 0,01, 0,25 e 0,39) em relação ao DAP (0,13, 0,01, 0,02 e 0,02) ... / Abstract: Guapuruvu Schizolobium parahyba (Vell.) S.F. Blake is a species of rapid growth belonging to the Family Fabaceae (Leguminosae), highly important for restoration programs. Aiming to verify the genetic variability of S. parayba progenies from Botucatu region, SP, Brazil, we estimate quantitative genetic parameters of 10 different provenances. Seedlings were done in nursery of Department of Forest Science (DCF) - São Paulo State University (UNESP) - Botucatu, São Paulo, Brazil. The open pollinated progeny trial was set up in Lageado Experimental Station of São Paulo State University (UNESP) - Botucatu through statistical design of randomized blocks, with 60 progenies, three replications, four plants per linear plots, and by 3 x 2 m of plant spacing. The studied traits were diameter of breast height (Dbh) and plant height (H) for four ages: 02, 07, 14, and 20 months old, and for plant survival we only studied by the 20 months old. Data were analyzed though Selegen-REML-BLUP software. In average, guapuruvu progenies by the 14 months old, reached 2.23 m of height and 2.96 m by the 20 months old, with 6.0 and 7.5 cm of Dbh, through 14 and 20 months old, respectively. Coefficients of individual genetic variation, genotypic variation among progenies, and relative variation have shown low genetic variability, and therefore, high environmental influence, even with coefficients of residual variation in acceptable levels from 12.8 to 21.1%. The presented coefficients are the typically occurrence by the polygenic traits, showing the necessity of use of recurrent selection in breeding programs. Heritability coefficients by the individual levels were higher for plant height (0.32, 0.01, 0.25, and 0.39) than Dbh (0.13, 0.01, 0.02, and 0.02) through the 02, 07, 14, and 20 months old, respectively. Similar values were found for additive heritability within progenies. Close results were obtained for heritability ... / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-03-30Bitstream added on 2014-06-13T19:01:07Z : No. of bitstreams: 1 carniello_ma_dr_rcla.pdf: 2423998 bytes, checksum: 79a82d4e4382e6ed19d8a27a10132b1d (MD5) / O presente estudo envolveu três comunidades, Porto Limão, Porto Alambrado e Campo Alegre, localizadas no continnum territorial do pantanal de Cáceres, na região fronteiriça entre o estado Mato Grosso e a Bolívia. Foi registrado o conhecimento da população em relação ao componente vegetal percebido, utilizado e acessado nas unidades de paisagem locais. Enfocou-se os quintais e as áreas adjacentes a estes com fontes fornecedoras dos recursos vegetais. A coleta dos dados envolveu a aplicação de métodos próprios da área de etnobotânica filiados à antropologia e aos estudos clássicos de taxonomia vegetal. Foram aplicados formulários estruturados e semi-estruturados, para o registro do perfil sócioeconômico e cultural da população. As unidades de paisagem indicadas pela população foram georreferenciadas e elaborados mapas das áreas fornecedoras de recursos vegetais. Os 77 moradores das três comunidades representam 91% dos domicílios locais, sendo 25% de Campo Alegre, 83% de Porto limão e 100% de Porto Alambrado. Essa população apresenta uma miscigenação que envolve: povos naturais da região, remanescentes de povos das nações indígenas Guató, Bororo, Chiquitano e Terena e migrantes, principalmente do Sul, Sudeste e Nordeste do Brasil. A população utiliza, com certa freqüência, produtos extraídos das plantas nativas na medicina e alimentação local, assim como nas atividades produtivas de pesca e criação de animais. Na agricultura estão presentes, com maior freqüência, espécies introduzidas, excetuando-se a mandioca (Manihot esculenta Crantz) que foi a mais citada nas três comunidades. O material botânico indicado e coletado compreende um acervo de 6.212 citações correspondentes a 628 táxons pertencentes a 118 famílias botânicas com 583 espécies e 416 gêneros (conforme o Angiosperms Phylogeny Group). Seis famílias destacaram-se... / The present study involved three communities, Porto Limão, Porto Alambrado, and Campo Alegre, located in the territorial continuum of the Pantanal et Cáceres, along the border between Mato Grosso State, Brazil, and Bolivia. Records were made of the population s knowledge with respect to their perceptions and uses of the plant community, in the local units of landscape, focusing on yards and adjacent areas that serve as sources of plant resources. Data collection involved application of methods from the field of ethnobotany, associated with anthropology and classic studies of plant taxonomy. Structured and semistructured forms were used to record the socio-economic and cultural profile of the population. The landscape units indicated by the population were geo-referenced, and maps were generated of the areas that provide plant resources. The 77 residents of the three communities represent 91% of local households: 25%, 83%, and 100% of households in Campo Alegre, Porto Limão, and Porto Alambrado, respectively. The population reflects the miscegenation of populations native to the region, descendents of the indigenous nations Guató, Bororo, Chiquitano and Terena, and migrants mainly from southern, southeastern and northeastern Brazil. The population often uses products extracted from native plants which are used directly in medicine and in the local diet, as well as in fishing activities and animalraising. Introduced species are more commonly found in agricultural activities, with the exception of manioc (Manihot esculenta Crantz), which was the species most often cited in the three communities. The botanical material indicated and collected composes a collection of 6,212 citations corresponding to 628 taxa belonging to 118 botanical families, with 583 species and 416 genera (according to the Angiosperms Phylogeny Group). Six families are noteworthy with respect to the number of species cited... (Complete abstract click electronic access below)