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Seleção genômica para características categóricas em eucalipto / Genomic selection to categorical trait in eucalyptusSilveira, Lucas Souza da 17 February 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-25T14:18:50Z
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Previous issue date: 2017-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Atualmente muitas metodologias têm sido propostas para melhoria da predição de valores genéticos genômicos, no entanto, muitas delas assumem a pressuposição de que as variáveis respostas possuem distribuição gaussiana. Contudo, existem características como resistência a doença, bifurcação em árvores de eucalipto, estágios de florescimento e acamamento em plantas, entre outras, que são classificadas como categóricas, não possuindo distribuição gaussiana para os dados. Diante do exposto, objetivou-se comparar o modelo linear generalizado com o modelo linear de Gauss-Markov, obtendo os valores genéticos genômicos de indivíduos com fenótipos categóricos referentes a resistência à ferrugem do eucalipto, causada pelo patógeno Puccinia psidii Winter. Ambos os modelos foram aplicados quando a característica fenotípica possuía quatro classes de infecção (planta imune ou com reação de hipersensibilidade, pequenas pústulas, pústulas medianas e pústulas grandes) e quando estava categorizada como tipos de reação (resistente ou suscetível). O critério de informação da deviance (DIC - Deviance Information Criterion) foi utilizado para seleção do modelo adequado para descrever a característica fenotípica. O procedimento de validação cruzada via Jacknife foi utilizado para validação das estimativas. A acurácia preditiva e o viés foram utilizados para comparação dos modelos. Quando a característica foi categorizada com quatro classes de infecção, os valores de acurácia foram semelhantes para os dois modelos (diferença menor que 0,03). No entanto, quando a categorização foi realizada com duas classes, estas diferenças foram maiores que 0,03 para apenas um dos estimadores de acurácia. O viés na predição de valores genéticos genômicos foi melhor no modelo linear de Gauss- Markov em ambos os tipos de categorização. / Currently many methodologies have been proposed for improvement on the prediction of genomic breeding values, but many of them assume that the response variables have Gaussian distribution. However, there are trait such as resistance to disease in plants, bifurcation in eucalyptus trees, flowering of plants and others, which are classified as categorical data. In view of the above, the objective was to compare the use of generalized linear model with the linear Gauss-Markov model to obtain genomic breeding values of the categorical phenotypes related to resistance to rust in eucalyptus caused by Puccinia psidii Winter pathogen. Both models were applied when the trait had four infection levels (four classes) and when the trait was classified as reaction types (in this case, having two classes). The DIC (Deviation Information Criterion) was used to choose a model, which the effects explained better the variation of the trait. The cross validation procedure via Jacknife was used to validate the estimates of the models. The predictive accuracy and bias were used to compare the models when the evaluated traits had two and four classes. When trait had four classes, the models had similar accuracy values (difference less than 0.03) and when the trait was classified in two classes, the models presented different accuracy values for only one of the accuracy estimators applied. The bias in the prediction of genomic breeding values was better in the linear Gauss-Markov model.
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Caracterização molecular do loco Red associado a resistência ao oídio da soja / Molecular characterization of the Red locus associated with resistance to soybean powdery mildewPereira, Alan Alves 10 July 2015 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-04-13T10:50:25Z
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Previous issue date: 2015-07-10 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Diante da importância da cultura da soja e da severidade do oídio em causar danos, este estudo teve como principais objetivos avaliar linhagens endogâmicas recombinantes de soja para resistência a este patógeno e caracterizar molecularmente os genes de resistência localizados na região de mapeamento do loco Red, que confere resistência ao oídio em soja. Avaliações fenotípicas realizadas em 109 famílias derivadas do cruzamento entre o acesso BRI01-22106 (Resistente) e o acesso PI200487 (Suscetível) resultaram em uma discriminação distinta entre a resistência e suscetibilidade ao oídio da soja, dentre essas, 29 famílias apresentaram característica de imunidade e foram consideradas promissoras para o desenvolvimento de cultivares resistentes ao oídio. Por meio do sequenciamento do genoma da PI229358, acesso resistente ao oídio e que deu origem ao parental resistente da população em estudo, foi possível identificar 19 potenciais SNPs, exclusivos de plantas resistentes ao oídio, localizados em uma região de 2 Mb, compreendendo o loco Red, contendo oito genes com similaridades a genes de resistência, tais como a presença dos domínio TIR-NBS-LRR. O perfil de expressão diferencial dos genes candidatos à resistência ao oídio frente à infecção com o patógeno ao longo do ciclo infeccioso permitiu constatar a expressão diferencial dos genes candidatos, nos acessos resistentes e suscetível, presentes no loco Red que estão envolvidos no mecanismo de resistência da soja ao oídio. Por meio da técnica de VIGS foi possível obter o silenciamento gênico dos quatro grupos de genes candidatos nos dois acessos resistentes avaliados, evidenciando o envolvimento desses nos mecanismos de resistência da soja ao oídio. / Given the importance of soybean and severity of powdery mildew, the main objectives of this study are to evaluate recombinant inbred lines of soybean for resistance to this pathogen and to characterize resistance genes located on the mapping region Red, which confers resistance to soybean powdery mildew. Phenotypic assessments conducted in 109 families derived from the cross between BRI01-22106 (resistant) and PI200487 (susceptible) resulted in a distinct discrimination between resistance and susceptibility to soybean powdery mildew. Among these, 29 families had an immunity feature and they were considered promising for the development of cultivars resistant to powdery mildew. Through genome sequencing of PI229358, resistant to powdery mildew and parental of the study population, it was possible to identify 19 potential single nucleotide polymorphisms (SNPs). The SNPs are located in a 2 Mb region, comprising the region Red and containing eight genes with similarity to resistance genes, such as the presence of the TIR-NBS-LRR domain. The profile of candidate genes expression for resistance to powdery mildew revealed the differential expression of candidate genes in the resistant and susceptible accesses present in Red locus involved in the mechanism of resistance of soybean powdery mildew. Using virus induced gene silencing (VIGS) it was possible to obtain the gene silencing of the four groups of candidate genes in both resistant accessions, indicating their involvement in mechanisms of resistance to soybean powdery mildew.
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Ocorrência da resinose do cajueiro afetada pelas condições edafoclimáticas. / OCCURRENCE OF CASHEW GUMMOSIS AFFECTED BY SOIL AND CLIMATIC CONDITIONS.Alves, Edson Souza January 2012 (has links)
ALVES, E. S. Ocorrência da resinose do cajueiro afetada pelas condições edafoclimáticas. 2012. 65 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Fitotecnia) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2014-07-01T19:43:03Z
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Previous issue date: 2012 / The cashew plant is an anacardeaceae commonly found all over tropical regions of the world. The cashew crop is a highly important source of income and social development in northeast Brazil. Cashew nut production have been oscillating in recent years mainly due to heterogeneity of population, climatic variations and the lack of inadequate cropping practices. Disease epidemics also play a very important role in this scenery. The cashew gummosis, caused by Lasiodiplodia theobromae, is recognized as the most important disease of cashew plant in northeast Brazil, which may bring about the complete decline of orchards within few years. The knowledge of environmental conditions associated with gummosis occurrence will surely contribute to the understanding of host-pathogen interaction. Based on that, this work aimed to establish the relationship among the environmental factors in regions characterized by different levels of gummosis with disease incidence. Data of rainfall, maximum and minimum temperature, temperature range, soil, and altitude of 13 regions characterized by four different levels of gummosis incidence (0 = no report, 1 = rare, 2 = frequent, 3 = always present) were used in this study. The Mann-Whitney test was used in addition to correlation analyses, admitting 5% significance level. Maximum, minimum, temperature range, altitude, and deep and well-drained soils were associated with high incidence of gummosis. / O cajueiro é uma anacardiácea encontrado em praticamente todo o mundo tropical. A cajucultura é de enorme relevância social para o Nordeste brasileiro já que é responsável pela geração de renda para a população. A produção vem oscilando muito nos últimos anos devido à heterogeneidade dos pomares antigos e a ausência de manejo adequado para a cultura. As doenças acabam por desempenharem importante papel nesse cenário. A resinose do cajueiro causada pelo fungo Lasiodiplodia theobromae é tida como a principal doença no semiárido nordestino e caracteriza-se pela inviabilização do pomar em poucos anos. O conhecimento das condições de ambiente que possam ser associados a processos infecciosos poderá contribuir para elucidação da interação patógeno-hospedeiro. Nesse sentido, este trabalho tem como objetivo estabelecer associações de fatores edafoclimáticos a diferentes zonas de severidade para o patossistema da resinose do cajueiro. Foram comparados dados climáticos, tais como, precipitação pluviométrica, temperatura máxima, mínima, amplitude térmica, como também características de solo, clima e altitude, de 13 municípios nordestinos classificadas em quatro zonas de severidade para a resinose: 0 (sem observação), 1 (observação rara), 2 (observação frequente) e 3 (ocorrência generaliza). Para tanto, utilizou-se do teste de Mann-Whitney além de correlações sendo admitidos 5% de nível de significância. A temperatura máxima, mínima, amplitude térmica, a altitude, além de solos profundos e bem drenados foram associadas às diferentes áreas de ocorrência da resinose.
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Mecanismos de ação do ácido salicílico no controle do bolor azul (Penicillium expansum) em frutos de maçãRocha Neto, Argus Cezar da January 2014 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T18:07:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2014 / O bolor azul causado por P. expansum é uma doença de grande importância em pós-colheita de frutos de maçã, sendo considerada nos países produtores a doença mais importante na perda da qualidade e quantidade dos frutos armazenados. A aplicação de ácido salicílico (AS) em pós-colheita de frutos pode representar uma eficiente forma de controle alternativo de doenças. Este trabalho objetivou avaliar o efeito do AS no desenvolvimento do fitopatógeno e da doença visando a proteção dos frutos de maçã cv. Fuji das categorias 1, 2 e 3 contra o bolor azul, além de elucidar os mecanismos de ação pelo qual o AS poderia atuar. In vitro, esporos de P. expansum tiveram sua germinação reduzida em 80% quando o AS foi aplicado a 0,5 mM, chegando a 100% de inibição a uma dose de 2,5 mM em contato com os esporos por 60 minutos, equivalendo-se ao cloro ativo. A atividade antimicrobiana do AS foi dependente do pH da solução, com maior redução da germinação de P. expansum em pH em torno de 3 e perda total da atividade quando o pH foi elevado a 6. Com o aumento do tempo de contato do AS a 2,5 mM com os esporos, notou-se um aumento linear na liberação de espécies reativas de ácido tiobabitúrico (ATB), atingindo um valor máximo de 6000 pmol de ATB por mg de proteína após 120 minutos de contato. De forma semelhante, após a exposição do micélio de P. expansum ao AS (2,5 mM) por 120 minutos, observou-se um extravasamento de 3,2 µg de proteína solúvel por g de micélio, duas vezes maior do que o apresentado pelo micélio do fungo submetido ao tratamento com água destilada. Tais resultados corroboraram os obtidos por microscopia de fluorescência e eletrônica de transmissão, evidenciando danos do AS associados à membrana plasmática do fungo sem, por outro lado, afetar sua parede celular. Quando aplicado nos frutos de maçã, o AS apresentou apenas efeito erradicante, reduzindo a incidência do bolor azul em até 100% no tratamento em que os esporos de P. expansum permanecerem em contato por 30 min em solução de AS (2,5 mM) antes da imersão dos frutos. A atividade de peroxidases, polifenoloxidases e glucanases dos frutos, assim como o teor de compostos fenólicos e de flavonóides foram pouco influenciados pelo tratamento com o AS a 2,5 mM ou pela inoculação com o fitopatógeno durante as primeiras 80 h, sem diferir também entre as
categorias de maçã. Nas características físico-químicas dos frutos, o AS a 2,5 mM promoveu a manutenção da massa, dos teores de sólidos solúveis e da acidez titulável nas maçãs a valores próximos àqueles encontrados no início do experimento, contra alterações de até 50% nos frutos da testemunha. Os resultados do presente estudo mostram a capacidade do AS de controlar doenças pós-colheita como o bolor azul, principalmente através dos danos à membrana plasmática de P. expansum, e de proporcionar a manutenção das características fisiológicas dos frutos de maçã, possibilitando um aumento no tempo de prateleira.<br> / Abstract : The blue mold caused by P. expansum is a disease of great importance in apple post-harvest, being considered the most important disease in the loss of quality and quantity of stored fruits in producing countries. The application of salicylic acid (SA) in postharvest fruit can be an efficient form of control the disease alternatively. This study evaluated the effect of AS on the pathogen and disease development, by protecting the apple fruit of categories 1, 2 and 3 against the blue mold, besides elucidating the mechanisms by which AS could act. In vitro, spores of P. expansum had their germination reduced by 80 % when AS was applied at 0.5 mM, reaching 100 % of inhibition at a dose of 2.5 mM in contact with the spores for 60 minutes, equivalent to the active chlorine. The antimicrobial activity of AS depends of the pH of the solution, exhibiting total reduction of the P. expansum germination in pH around 3 and a total waste of activity when the pH was raised to 6. With the increase of the time of contact between the spores and AS (2.5 mM), a linear increase in the release of thiobabituric acid reactive species was noted, reaching a maximum of 6000 thiobabituric acid per pmol per mg protein after 120 minutes of contact. Similarly, after exposure with AS at 2.5 mM for 120 minutes, there was a leakage of 3.2 mg of soluble protein per g of the mycelium of P. expansum, twice greater than that presented by mycelia treated with distilled water. These results corroborate to those obtained from fluorescence and transmission electron microscopy, showing that the damage was associated with the plasma membrane of the fungus without, moreover, damaging its cell wall. When applied in apple fruit, AS (2.5 mM) only showed eradicative effect, reducing the incidence of the blue mold by up to 100% in the treatment in which the spores of P. expansum remain in contact for 30 minutes in a AS (2.5 mM) solution after the fruits immersion. The activity of peroxidases, polyphenoloxidases, glucanases and accumulation of phenolic compounds and flavonoids were little influenced by AS treatment or inoculation with the pathogen during the first 80 hours without differ between apple categories. Considering the physico-chemical characteristics of fruits, AS at 2.5 mM promoted the maintenance of mass, soluble solids and titratable acidity util the end of
the experiments, against changes of 50% in the fruits treated with control-treatment. The results of this study show the ability of AS to control postharvest diseases such as blue mold, mainly through damage to the plasma membrane of P. expansum and providing maintenance of the physiological characteristics of apple fruit, allowing an increased shelf life.
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Ação do Acibenzolar-S-Metil na resposta bioquímica de defesa do melão desafiado pelo Fusarium pallidoroseum e do meloeiro var. Orange Flesh. / Effects of acibenzolar-S-methyl on the biochemical defense response of melon fruits challenged with Fusarium pallidoroseum and of melon fruits var. Orange flesh.Gondim, Darcy Mayra Furtado January 2006 (has links)
GONDIM, D. M. F. Ação do Acibenzolar-S-Metil na resposta bioquímica de defesa do melão desafiado pelo Fusarium pallidoroseum e do meloeiro var. Orange Flesh. 2006. 85 f. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2006. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2014-11-25T20:27:22Z
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Previous issue date: 2006 / Melon fruit constitutes one of the main segments of the Brazilian economy. Its production is exported particularly to countries in the European Union. Thus it is fundamental the control of postharvest diseases of melon. Fusarium pallidoroseum is an important phytopathogen which provokes rot in melon fruits. This disease represents a serious obstacle in its commercialization as a foreign commodity. In this present work the effects of BTH, a structural and functional analogue of salicylic acid, on the biochemical defense responses of melon fruits challenged with F. pallidoroseum and of unchallenged melon plants were assessed. Twelve hours after harvesting melon fruits were immersed in BTH (0.5, 1.0, and 2.0 mM concentrations of active ingredient) and 60 hours later inoculated with the fungus. Fruit cuts (2 cm diameter x 1 cm deep), close to the inoculation sites, were excised at 3, 7, and 10 days after fungal inoculation, weighed and kept at -84 ○C until used. Eight day-old melon plants were sprayed with 300 µL BTH at 0.3, 0.5, and 1.0 mM concentrations. Secondary leaves were harvested at 2, 4, 6, 8, 10, 12, and 14 hours after sprayings. Besides to symptom evaluation in melon fruits, crude extracts from the fruit cuts and leaves were prepared with 50 mM acetate buffer, pH 5.2, containing 150 mM NaCl, and the protein contents and enzymatic activities of peroxidase (POX), phenylalanine ammonia lyase (PAL), β-1,3-glucanase (GLU), ascorbate peroxidase (APX), and superoxide dismutase (SOD) were measured. It was observed that BTH did not reduce significantly the incidence and severity of the rot caused by the pathogen. Neither 2 mM BTH significantly modify the activities of defense-related enzymes in melon fruits. Contrary, in the melon plants, BTH increased the activities of POX, GLU, and SOD, but did not modify PAL and further inhibited APX. These results suggest that BTH did not work as an inductor of biochemical defenses in melon fruits, but it induced defense responses in the melon plants. Therefore it is suggested that BTH could be used as a technological strategy for protection of melon fruits from the rot caused by F. pallidoroseum by means of induction of biochemical defense responses of the melon plant itself which will likely be transferring these traits to its fruits. However, this hypothesis that is being proposed needs to be assessed. / O melão tem grande importância para a economia brasileira, sendo sua produção exportada principalmente para os países da União Européia. Assim, é fundamental o controle de doenças pós-colheita deste fruto. O Fusarium pallidoroseum é um importante fitopatógeno que provoca podridões no melão. Esta doença representa um obstáculo sério em sua comercialização. Este trabalho avaliou os efeitos do BTH, um análogo estrutural e funcional do ácido salicílico, nas respostas bioquímicas da defesa do melão desafiado com o F. pallidoroseum e do meloeiro não desafiado. Doze horas depois de colhidos, os melões foram mergulhados em soluções de BTH (concentrações de 0,5, 1,0, e 2,0 mM de ingrediente ativo) e, depois 60 horas, foram inoculados com o fungo. Amostras dos frutos (2 cm diâmetro x 1 cm de profundidade), próximos ao local de infecção, foram retiradas em 3, 7 e 10 dias após inoculação, pesadas e armazenadas à -84 ºC até serem utilizadas. Plantas do melão de 8 dias foram borrifadas com 300 µL de BTH nas concentrações de 0,3, 0,5, e 1,0 mM. As folhas secundárias foram colhidas em 2, 4, 6, 8, 10, 12, e 14 dias após tratamento. Além da avaliação do sintoma nos frutos, extratos totais do fruto e das folhas secundárias foram preparados com tampão acetato 50 mM, pH 5.2, contendo 150 mM de NaCl, e os índices de proteína e as atividades enzimáticas da peroxidase (POX), da fenilalanina amônia liase (PAL), da β-1,3-glucanase (GLU), da peroxidase do ascorbato (APX) e da superoxide dismutase (SOD) foram medidos. Observou-se que BTH não reduziu significativamente a incidência e a severidade da podridão causada pelo patógeno. Nem 2 mM de BTH modificou significativamente as atividades de enzimas relacionadas a defesa do fruto. Ao contrário, nas plantas do melão, BTH aumentou as atividades da POX, GLU e da SOD, mas não modificou a PAL e APX foi inibida. Estes resultados sugerem que BTH não trabalhou como um indutor de defesas bioquímicas no melão, mas induziu respostas de defesa nas plantas. Conseqüentemente, sugere-se que BTH poderia ser usado como uma estratégia tecnológica para a proteção de frutas do melão contra a podridão causada pelo F. pallidoroseum através da indução das respostas bioquímicas de defesa da própria planta, que, provavelmente, estará transferindo estas características aos frutos. Entretanto, esta hipótese que está sendo proposta necessita ser avaliada.
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Opções de Manejo de Neoleucinodes Elegantalis (guenée) (lepidoptera: Crambidae) Com Bases Bioecológicas e Controle Mecânico, Biológico e Extrato de PlantasMELO, D. F. 18 March 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-03-18 / A broca-pequena-do-fruto, Neoleucinodes elegantalis (Guenée) (Lepidoptera: Crambidae) é uma praga de grande importância na cultura do tomateiro. Desta forma, métodos de manejo que auxiliem no controle dessa praga e que reduzam a aplicação de agrotóxicos devem ser estudados. O objetivo do presente trabalho foi avaliar métodos alternativos de manejo da broca-pequena-do-fruto, como: o controle biológico, através da utilização de parasitoides do gênero Trichogramma e nematoides entompatogênicos (Heterorhabditis indica e Sterneneima carpocapsae); o controle físico, por meio do ensacamento de cachos de tomate com o tecido-não-tecido (TNT); e o controle químico através do estudo da atividade inseticida de plantas como a pimenta, o fumo, o alho e a mamona nas fases embrionárias, larval, pupal e adulta. Desta forma, por meio das análises foi possível verificar que a espécie e/ou linhagem de Trichogramma que mais se destacou foi T. galloi (Tg1) com características biológicas favoráveis ao manejo de N. elegantalis. Para os nematoides entomopatogênicos, S. carpocapsae, foi o mais efetivo, causando uma mortalidade de 82,93% a uma concentração de 65 juvenis infectivos por pré-pupa da broca-pequena-do-fruto. Através do ensacamento dos frutos, foi possível verificar a redução na oviposição da praga em frutos do tomateiro para quase zero com sacolas de TNT com fundo fechado, não ocorrendo alteração no peso, pH e graus brix do fruto, enquanto que no controle químico através de inseticidas botânicos foi possível verificar o destaque do extrato aquoso de fumo, reduzindo a oviposição, entrada e saída das lagartas nos frutos; causando mortalidade na fase embrionária, lagarta, pré-pupa e pupa da broca-pequena-do-fruto.
Palavras-chave: Manejo Fitossanitário de Pragas. Tomate. Controle biológico. Ensacamento. Inseticidas botânicos.
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Estrutura genética de Colletotrichum fructicola e mecanismos de defesa da macieira (Malus domestica Borkh.) à mancha foliar de GlomerellaRockenbach, Mathias Ferrari January 2016 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-02-21T04:56:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2016 / Colletotrichum fructicola é a principal espécie causadora de podridão amarga (PA) na macieira e da Mancha foliar de Glomerella (MFG) no Sul do Brasil e PA no Uruguai, país onde a MFG não tem sido reportada até então. Este trabalho teve como primeiro objetivo geral determinar a estrutura genética do C. fructicola proveniente de ambos os países. Vinte e oito (90.3%) dos 31 isolados brasileiros incluídos neste trabalho causaram sintomas típicos da MFG, enquanto apenas seis de 25 (24%) isolados uruguaios foram capazes de colonizar folhas de mudas de macieira suscetíveis (cv. Gala) à MFG, mas causando sintomas atípicos. Ambas as populações mostraram níveis similares de diversidade genética de Nei (h = 0.088 e h = 0.079 para a população brasileira e uruguaia, respectivamente) e a análise Bayesiana inferiu dois blocos genéticos que mostraram correlação com a distribuição geográfica dos isolados. Da mesma forma, a análise de coordenadas principais e o cladograma UPGMA também segregaram os isolados brasileiros e uruguaios em dois grupos. Todos os isolados uruguaios foram agrupados em um único Grupo de Compatibilidade Vegetativa (GCV) (GCV 1), enquanto que os isolados brasileiros foram agrupados em 4 GCV (GCV 1-4). Os resultados demonstraram que as populações brasileiras e uruguaias de C. fructicola são geneticamente diferentes e sugerem que a população brasileira causadora de MFG evoluiu independentemente da população uruguaia causadora de PA. Por outro lado, o segundo objetivo deste trabalho foi determinar se a resistência completa da macieira à MFG está associada com indução de reação de hipersensibilidade (RH), aumento da atividade enzimática antioxidante e indução da expressão dos genes PR-1 e PR-10. Plantas suscetíveis apresentaram um incremento na severidade da doença das folhas mais velhas às mais jovens, demonstrando a existência na macieira de um grau de resistência do tipo ontogênica para o C. fructicola. Por outro lado, a germinação dos conídios e formação de apressórios tenderam a localizar-se nas junções das células epidérmicas, tanto em folhas resistentes quanto suscetíveis, sugerindo uma penetração do tipo intramural por parte deste fungo. O acúmulo de peróxido de hidrogênio nas paredes celulares anticlinais e o associado com a RH foi relativamente baixo e não esteve associado à resistência ao C. fructicola. Por outro lado, as atividades enzimáticas da ascorbato peroxidase, guaiacol peroxidase e superóxido dismutase não variaram nas plantas resistentes e suscetíveis após a inoculação. Em contraste, a enzima glutationa reductase apresentou incrementos significativos nas folhas resistentes inoculados com C. fructicola às 12 e 48 h.a.i. Finalmente, a expressão do gene PR-1 não variou ao longo do tempo nas plantas resistentes, nem nas suscetíveis inoculadas com o patógeno. No entanto, a expressão do gene PR-10 aumentou em duas, e três vezes nas plantas resistentes e suscetíveis às 24 h.a.i., respectivamente; e em quatro vezes nas plantas suscetíveis às 48 h.a.i., em relação ao controle. Em conjunto, os resultados sugerem que a resistência recessiva da macieira à MFG não está associada com o acúmulo foliar de peróxido de hidrogênio, indução da RH e incremento na expressão do gene PR-1.<br> / Abstract : C. fructicola is the main species causing apple bitter rot (ABR) and Glomerella leaf spot (GLS) in southern Brazil, and ABR in Uruguay where GLS remains unnoticed. This work aimed firstly to determine the genetic structure of C. fructicola species causing ABR and GLS in both countries. Twenty-eight from 31 brazilian isolates caused typical symptoms of GLS, while only six of 25 uruguayan isolates originating from fruits were able to infect leaves, but causing atypical symptoms. Both populations showed similar levels of Nei´s gene diversity (h = 0.088 and h = 0.079, for brazilian and uruguayan populations, respectively), and Bayesian cluster analysis inferred two genetic clusters correlated with the geographical origin of isolates. A principal coordinates analysis (PCoA) scatter plot, and a (UPGMA)-based dendrogram, also grouped brazilian and uruguayan isolates into two groups. By pairwise comparison of nitrate-non-utilizing (nit) mutants with a proposed set of testers, all uruguayan isolates were grouped into a unique vegetative compatibility group (namely VCG1), while brazilian into four VCGs (VCG1-4). Brazilian and uruguayan populations of C. fructicola were revealed to be genetically distinct, and suggest that isolates of C. fructicola from Brazil capable of causing GLS and ABR arose independently of those from Uruguay. By other hand, the second objective of this work was to asses if complete resistance of apple to GLS is associated to leaf accumulation of hydrogen peroxide, induction of hypersensitive responses (HR), and expression of PR-1 and PR-10 genes. Susceptible plants showed increasing leaf necrosis from older to younger leaves, demonstrating the expression of an ontogenic resistance to GLS. Most conidia and appressoria were developed on anticlinal cell walls, and the number of attempted penetration sites was similar in resistant and susceptible leaves. Enzymatic activity of ascorbate peroxidase, guaiacol peroxidase and superoxide dismutase were similar in resistant and susceptible leaves inoculated with C. fructicola, and accordingly, leaf accumulation of hydrogen peroxide was low and not associated with resistance. However, enzymatic activity of glutathione reductase was increased in resistant leaves at 12 and at 48 h.a.i with pathogen. Finally, the PR-1 gene showed a constitutive expression in the both resistant and susceptible leaves that was not affected by inoculation with C. fructicola. However, relative expression of PR-10 was up-regulated in the both resistant and susceptible leaves at 24, and in susceptible ones at 48 h.a.i. Results suggest that recessive resistance of apple to leaf infection by C. fructicola acts independently of hypersensitive reaction and expression of PR-1 gene.
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Exopolissacarídeos de Lactobacillus plantarum na indução de resistência em tomateiro contra mancha bacterianaBlainski, Juliane Mendes Lemos January 2016 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-02-28T04:12:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2016 / A mancha bacteriana é uma doença de grande importância em plantações de tomate. A produtividade das plantas atacadas por esta fitomoléstia é comprometida principalmente pela redução da área foliar. A aplicação de exopolissacarídeos (EPS) de Lactobacillus plantarum pode representar uma forma alternativa de controle de doenças em plantas de tomate. Esse trabalho objetivou avaliar o potencial do EPS de L. plantarum para controlar a mancha bacteriana causada por Xanthomonas gardneri em plantas de tomate. Após o crescimento de L. plantarum em biorreator, extraiu-se o EPS do meio de cultura livre de células. O EPS foi caracterizado por FTIR e aplicado em plantas de tomateiro (0; 0,5; 1,5 e 3,0 mg mL-1), e a inoculação do patógeno foi realizada 3 ou 7 dias depois. Verificou-se também o efeito protetor local e sistêmico do elicitor. In vitro, testou-se a atividade antimicrobiana do EPS contra X. gardneri. Mecanismos de defesa bioquímicos (teor de compostos fenólicos totais e de flavonoides, atividade da fenilalanina amônia liase (FAL), lipoxigenase (LOX), glutationa redutase (GR), peroxidases (POX), polifenoloxidases (PFO), catalase (CAT), superóxido dismutase (SOD) e reação de hipersensibilidade (acúmulo de H2O2)), alterações fisiológicas (taxa fotossintética, condutância estomática, transpiração, rendimento fotoquímico do fotossitema II e índice SPAD) e morfológicas (microscopia de luz e fluorescência) foram analisados a partir de plantas de tomateiro tratadas com água destilada, EPS (1,5 mg mL-1) ou ASM (0,05 mg mL-1), inoculadas ou não com X. gardneri. Verificou-se redução de mais de 70% na severidade da mancha bacteriana em plantas de tomateiro tratadas com o EPS (1,5 mg mL-1) em relação à testemunha. O EPS de L. plantarum foi capaz de induzir resistência quando aplicado 3 dias antes da introdução do patógeno e apresentou efeito protetor local. In vitro, o EPS não apresentou atividade antimicrobiana sobre o agente patogênico. Alterações no perfil espectrofotométrico, na concentração dos ácidos ascórbico e elágico, e na atividade das enzimas FAL, LOX, GR, PFO, CAT e SOD foram observados em plantas tratadas com EPS ou ASM, desafiadas com o patógeno. Observou-se acúmulo de H2O2 nas células estomáticas e acúmulos celulósicos na epiderme das folhas tratadas com EPS. A taxa fotossintética aumentou nas plantas previamente pulverizadas com EPS e desafiadas com o patógeno, e diferentemente do observado nas plantas tratadas com ASM, o biopolímero reduziu a condutância estomática e a transpiração dos vegetais. Os parâmetros de rendimento fotoquímico e o índice SPAD não foram alterados com a aplicação do EPS. A aplicação do EPS altera o metabolismo de defesa das plantas e pode ser considerada uma alternativa para o controle da mancha bacteriana. O modo de ação é discutido em termos das alterações fisiólogicas, morfológicas e bioquímicas em plantas de tomate.<br> / Abstract : Bacterial spot is a disease of great importance in tomato crops. The productivity of plants attacked by this disease is mainly compromised by the reduction in leaf area. The application of exopolysaccharides (EPS) of Lactobacillus plantarum may represent an alternative form of disease control in tomato plants. This study aimed to evaluate the potential of EPS from L. plantarum to control bacterial spot caused by Xanthomonas gardneri in tomato plants. After growth of L. plantarum in a bioreactor, the EPS was extracted from cell-free culture medium. The EPS was characterized through FTIR and applied to tomato plants (0, 0.5, 1.5 and 3.0 mg mL-1) and inoculation of the pathogen was performed 3 or 7 days later. We also tested the local and systemic effect of the elicitor. In vitro, we tested the antimicrobial activity of EPS against X. gardneri. Biochemical defense mechanisms (phenolics compouds and flavonoids content, PAL, LOX, GR, POX, PPO, CAT, SOD activities and hypersensitivity reaction (accumulation of H2O2)), physiological (photosynthetic rate, stomatal conductance, transpiration, photochemical of fotossitema II and SPAD) and morphological (light and fluorescence microscopy) changes were analyzed from tomato plants treated with distilled water, EPS (1.5 mg mL-1) or ASM (0.05 mg mL-1), inoculated or not with X. gardneri. The EPS (1.5 mg mL-1) of L. plantarum was able to induce resistance when applied 3 days before the introduction of the pathogen and showed effect of local protection. In vitro, the EPS did not present antimicrobial activity against the pathogen. Changes in the spectrophotometric profile, ascorbic and ellagic acid concentration and in FAL, LOX, GR, PFO, CAT and SOD activities were observed in plants treated with EPS or ASM and challenged with the pathogen. It was observed accumulation of H2O2 in stomatal cells and alterations in the epidermis of the leaves treated with EPS. The photosynthetic rate increased in the plants previously sprayed with EPS and challenged with the pathogen, and different from that observed in the plants treated with ASM the biopolymer was able to reduce stomatal conductance and transpiration rates of plants. The photochemical performance parameters and the SPAD index didn?t change with the application of EPS. The application of EPS triggered the defense metabolism of tomato plants and can be an alternative to protect plants against bacterial spot. The mode of action is discussed in terms of physiological, morphological and biochemical changes in tomato plants.
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Bioecologia comparada de duas linhagens de Telenomus remus Nixon (Hymenoptera: Platygastridae) parasitando ovos de Spodoptera frugiperda (J. E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae)Naranjo Guevara, Natalia [UNESP] 14 February 2013 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2013-02-14Bitstream added on 2014-06-13T20:32:40Z : No. of bitstreams: 1
naranjoguevara_n_me_jabo.pdf: 1094961 bytes, checksum: abebabbc7d6d55795ac30c24a5d2bb13 (MD5) / A criação massal em condições de laboratório afeta a atividade e vigor dos parasitoides e,consequentemente, opotential como agentes de controle biológico. No Brasil, Telenomus remus foi introduzido em1986 e obtiveram-se altos níveis de parasitismo sobre Spodoptera frugiperda em testes de laboratório. Entretanto, estes níveis não foram obtidos em condições de campo.Assim, para ampliar abasegenéticadas linhagens e determinar possíveisdiferenças naatividade e vigor, opresente estudo objetivou: (1) realizara introdução deuma nova linhagem de T. remus no Brasil, a partir da Venezuela; (2) comparar a biologia das duas linhagens (uma coletada em culturas de milho e introduzida e outra,criadapor cerca de 600 gerações em laboratório) por meio da avaliaçãode parâmetros reprodutivos etabela de vida de fecundidade; (3) comparar as respostas funcionais; (4) avaliar a qualidade das linhagens utilizando-se a atividadede voo e a emergência como critérios. A espécie foi confirmada por taxonomista e foi confirmadaa sua especificidade porS. frugiperda. As duas linhagens demostraram similaridade genética em padrõesde restrição para asregiões 16S e ITS1, embora a linhagem importada apresentasse qualidadesuperior. Osparâmetros de fecundidadedemostraram que alinhagem introduzida temum potencial de aumento populacional maior e éintrinsecamente mais agressiva. As duas linhagens apresentaram resposta funcional tipo III, comestabilizaçãodo parasitismo apartirde 200 ovosdohospedeiro. Infere-se que a criaçãoem laboratório de T. remus requer cuidados que limitem a perda do potencial para controle biológico. Avaliaçõessubsequentes de qualidade bem como ametodologia atual de criação precisam ser revistas.O presente estudo resultou numimportante aporte para auxiliar na implementação de programas de controle biológico para a lagarta-do-cartucho. / Mass rearing in laboratory conditions affects the activity and vigor of parasitoids and consequentlytheir potentialas biological agents. In Brazil, Telenomus remus was introduced in 1986 and high levels of parasitism on Spodoptera frugiperda were obtained in laboratory tests. However, theselevels were notobtained infield conditions. Thus, tobroaden thegeneticbases of laboratorymaintained strains and to determine possible differencesin activity and vigor, this study aimed to:(1) introduce a new strain ofT. remus from Venezuela in Brazil;(2) compare the biology of two strains of T.remus (one collected in maizefields and introduced, and the other, maintained by over 600generations in laboratory conditions) by evaluatingreproductive parameters and fertilitylife tables, (3)compare the functional responses; (4) evaluate thequality ofthestrains using flightacitivity and emergence as criteria. The introduced species was confirmed by a taxonomist and their specificity for S. frugiperda was confirmed.Both strains demonstrated genetic similarity in restriction patterns for the 16S and ITS1 regions, although the imported strain showed superior quality as biological control agent. The fertility parameters showed thattheintroduced strain has a greater potentialfor population increaseand is inherently more aggressive. The two strains exhibited type IIIfunctional response, with stabilization of parasitism at 200 hosteggs. It is inferred that the laboratory rearingof T. remus requires efforts toprevent lossof biological control potential. Further evaluations of quality must be made and the currentmass rearing methodology should bere-designed. This study resulted in an important contribution that could aid the implementation of biological control programs for fall armyworm.
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Percepção química de Grapholita molesta (Busck) (lepidoptera: Tortricidae) a substâncias alimentares e voláteis de maçãStrapasson, Priscila 20 December 2012 (has links)
Resumo: O monitoramento é uma etapa fundamental do Manejo Integrado de Pragas e tem a finalidade de verificar a presença de um inseto e sua intensidade, fornecendo subsídios para tomada de decisões para aplicação de uma medida de controle. Grapholita molesta (Busck, 1916), é uma importante praga de fruteiras de clima temperado e a eficiência do monitoramento desta espécie, realizado com armadilhas a base de feromônio, é prejudicada em áreas onde se utiliza a técnica de confusão sexual como controle, devido à similaridade dos feromônios envolvidos. O objetivo deste trabalho foi identificar novos compostos atrativos para G. molesta, visando sua utilização no monitoramento deste tortricídeo em pomares com confusão sexual. Atrativos alimentares foram testados em campo para a captura de mariposas, utilizando armadilhas do tipo McPhail iscadas com suco e vinho de uva em pomares de maçã. Também foram realizados experimentos em laboratório para identificar os voláteis emitidos por frutos de 'Eva' e 'Gala' em diferentes estágios de desenvolvimento, através da coleta dos voláteis por headspace e análise em cromatografia gasosa, assim como a resposta eletrofisiológica e comportamental de G. molesta a estes compostos. Por fim, o efeito da interação entre os voláteis liberados por maçã madura e feromônio sintético foi avaliado para a captura de machos de G. molesta em experimentos de campo. Verificou-se que o vinho foi o atrativo mais eficiente para a captura de G. molesta em pomares com confusão sexual, superando as capturas com feromônio sintético. Além disso, atrativos alimentares capturaram fêmeas copuladas, o que pode explicar a ocorrência de danos mesmo quando há baixas capturas em armadilhas com feromônio durante a eficiência da formulação de confusão sexual. Em relação à avaliação de resposta de G. molesta aos voláteis de maçã em diferentes estágios de maturação, não foram detectadas repostas eletrofisiológicas da mariposa-oriental aos voláteis emitidos em estágio imaturo de ambas cultivares. Adultos responderam eletrofisiologicamente a dois compostos de 'Eva' em estágio de processo de maturação: hexanoato de isoamila e ? -farneseno. Dentre os voláteis liberados em estágio de maturação fisiológica, doze elicitaram respostas em adultos. Fêmeas virgens não responderam aos voláteis em olfatômetro e fêmeas acasaladas foram atraídas por voláteis liberados por frutos em estágio de maturação fisiológica, o que sugere uma maior sensibilidade de fêmeas acasaladas, estimuladas pela necessidade de localizar sítios de oviposição. Machos também foram atraídos por voláteis de frutos em estágio de processo de maturação e em maturação fisiológica, possivelmente estes utilizam o odor como pista química em busca de parceiras para o acasalamento. Quanto ao efeito de voláteis de maçã madura e feromônio sintético, não foi observado incremento na atração de adultos em bioensaios em olfatômetro "Y" e nas capturas de machos em campo.
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