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Identification de nouveaux déterminants génétiques de la tolérance au gel chez Pisum sativum / Identification of new genetic determinants of frost tolerance in Pisum sativum

Beji, Sana 05 March 2019 (has links)
Chez le pois (Pisum sativum L.) la tolérance au gel est contrôlée par un nombre relativement restreint de loci quantitatifs (QTL, Quantitative Trait loci) mis en évidence par analyse de liaison dans des populations biparentales de cartographie. Le développement récent de SNP en grand nombre et d'outils de génotypage à haut débit offre la possibilité d’approfondir les études du déterminisme génétique responsables de la variation phénotypique du caractère d’intérêt. Au cours de cette thèse, nous avons étudié le déterminisme génétique de la tolérance au gel chez le pois par deux approches de génétique quantitative à savoir la cartographie de QTL par analyse de liaison, et la génétique d'association ou GWAS (Genome Wide Association Study). Une re-détection de QTL de tolérance au gel a été réalisée sur un sous-ensemble de 76 lignées recombinantes (RILs, Recombinant Inbred Lines) issues de la population Champagne x Térèse (Pop2,164 RILs) avec 6486 marqueurs. L’analyse a permis de préciser l'intervalle de confiance des QTL détectés précédemment et d’identifier des marqueurs utilisables pour la cartographie fine. Une cartographie fine de l’un des principaux QTL préalablement identifié (WFD6.1), a été réalisée en utilisant un matériel quasi-isogénique (NILs, Near Isogenic Lines) à ce QTL, dont la création par rétrocroisements assistés par marqueurs avait été préalablement initiée. Les NILs étudiées ont montré un faible taux de recombinaison au niveau du locus ciblé, ce qui a réduit la résolution de la cartographie fine. En parallèle, une analyse de génétique d’association, à partir d’une collection de 365 accessions de pois génotypés avec 11366 marqueurs SNP, a permis d’identifier 62 marqueurs en association significative avec la tolérance au gel. Ces résultats ont confirmé 3 QTL déjà détectés par analyse de liaison, dans de multiples environnements, sur les groupes de liaison (LG, Linkage Groups) III, V et VI. Ils ont également permis d'identifier un nouveau locus sur le LG II et deux loci sur les LGs I et VII, qui n'avaient auparavant été détectés que dans un seul environnement. De plus, nous avons identifié des haplotypes favorables à la tolérance au gel ainsi que les accessions représentatives de ces haplotypes. L’annotation des marqueurs candidats a permis d’identifier 50 gènes sous-jacents aux loci détectés par GWAS et ceux qui sont en déséquilibre de liaison fort (DL (r2) > 0.8) avec les marqueurs significatifs en GWAS. Parmi ces gènes, un CBF (C-repeat Binding Factor), situé sur le groupe de liaison VI au niveau du QTL WFD6.1 a été identifié. En nous basant sur la synténie avec Medicago truncatula, nous avons émis l’hypothèse qu’il existerait un cluster de gènes CBF à cet endroit. Par conséquent, nous avons construit deux banques BAC (Bacterial Artificial Chromosome) à partir de l'ADN de Champagne et Térèse qui présentent des niveaux contrastés de tolérance au gel. Ces banques ont été criblées par des marqueurs dessinés sur les séquences des gènes CBF repérées dans le génome de référence Caméor. Les clones BAC porteurs des marqueurs cibles ont été ensuite séquencées par la technologie de séquençage PacBio®. La caractérisation des séquences obtenues fait partie des perspectives de ce travail. / In pea (Pisum sativum L.), frost tolerance is controlled by a relatively small number of Quantitative Trait Loci (QTLs) identified by linkage analyses studies within biparental mapping populations. The recent discovery of high numbers of SNP and the development of high throughput genotyping tools offers the opportunity to further study the genetic determinism responsible for the phenotypic variation of the targeted trait. During this thesis, we investigated the genetic determinism of frost tolerance in pea by two quantitative genetic approaches namely linkage analysis QTL mapping and Genome Wide Association Study (GWAS). A re-detection of frost tolerance QTLs was performed on a subset of 76 recombinant inbred lines extracted from the Champagne x Térèse population (Pop2, 164 RILs) and genotyped with 6486 markers. The analyses allowed to refine the confidence intervals of previously detected QTLs and to identify markers to be used in a fine mapping approach. Fine mapping of one of the formerly identified QTLs (WFD6.1) has been carried out using NILs (Near Isogenic Lines) for the targeted QTL, which creation by marker-assisted backcrossing has previously been initiated. Studied NILs showed a low rate of recombination at the targeted locus, which reduced the resolution of fine mapping. Parallely, a genome wide association mapping, performed within a collection of 365 pea accessions genotyped with 11366 SNP markers, revealed 62 markers in significant association with frost tolerance. Results confirmed 3 QTLs already detected by linkage analyses studies on linkage groups (LGs) III, V and VI, in multiple environmental conditions. They also allowed to identify a new locus on LG II and two loci on LGs I and VII, which have formerly been detected in only one environment. In addition, GWAS allowed to identify favourable haplotypes for frost tolerance and representative accessions carrying these haplotypes. Annotation of candidate markers identified 50 genes underlying the GWAS-detected loci and markers in high linkage disequilibrium (LD (r2) > 0.8) with associated markers. Among these genes, a particular interest for a CBF gene (C-repeat binding factor), located on the linking group VI at a position corresponding to the WFD6.1 QTL, was mentioned. On the basis of the syntenic relationship with Medicago truncatula, we hypothesized the presence of a cluster of CBF genes at this position. Therefore, we constructed two BAC (Bacterial Artificial Chromosome) libraries from the DNA of Champagne and Térèse, characterized by contrasted levels of frost tolerance. These libraries were screened by markers designed from the sequences of the CBF genes identified from the reference genome of Caméor. BAC clones carrying targeted markers were then sequenced by the PacBio® sequencing technology. Further characterization of the obtained sequences obtained is part of the perspectives of this work.
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Rôles et représentations des proches de la personne âgée dont on détermine l'inaptitude une étude selon la perspective des professionnels engagés dans le processus

Canuel, Catherine January 2008 (has links)
Dans le processus de détermination de l'inaptitude, différents acteurs sont impliqués. On pense notamment aux médecins et aux intervenants psychosociaux, qui doivent procéder à l'évaluation de la personne âgée qu'on présume inapte. Il y a également les juristes, qui agissent à différents niveaux. Mais un autre acteur, sur lequel on connaît très peu de choses, est aussi interpellé: les proches de la personne âgée dont on détermine l'inaptitude. Quels sont les rôles joués par les proches dans ce processus? Quels rôles jouent les professionnels à l'égard des proches? Quelles représentations sociales se fait-on de ces proches? Pour répondre à ces questions, une analyse secondaire de 42 entrevues de professionnels (médecins, intervenants psychosociaux et juristes) qui procèdent à la détermination de l'inaptitude, recueillies dans le cadre d'une recherche menée par le Groupe de recherche en droit de la santé de l'Université de Sherbrooke (GREDSUS) a été réalisée. L'utilisation d'une méthodologie qualitative misant sur une analyse thématique a été privilégiée. L'analyse des données révèle d'une part que les proches de la personne âgée sont impliqués tout au long du processus et un inventaire de 13 rôles qui peuvent être joués par ces derniers a été élaboré. En outre, on a dégagé quatre principaux types de rôles que les professionnels jouent à l'égard des proches de la personne âgée présumée inapte. Ainsi, les professionnels assurent le bon déroulement [de] la procédure, évaluent les proches, infléchissent le rôle de ces mêmes proches et leur donnent du soutien. Enfin, en ce qui a trait aux représentations sociales, il ressort des analyses que ces représentations se dessinent autour de la trame de l'adéquation des proches à assumer le rôle de représentant légal de la personne âgée dont on détermine l'inaptitude. Ainsi, les professionnels, dans leur acte d'évaluation clinique, se réfèrent principalement à deux critères pour conclure à l'adéquation ou à l'inadéquation du proche à assumer ce rôle, soit l'intérêt du majeur et la capacité à compenser l'inaptitude.
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Développement de la version québécoise du "Montgomery Borgatta Caregiver Burden Scale"

Farley, Nathalie January 2006 (has links)
Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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Moments magnétiques de noyaux proches de Z=40, 50 et 82 mesures par orientation nucleaire

Haroutunian, Roger 12 October 1978 (has links) (PDF)
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Autour de l'irrégularité des connexions méromorphes.

Teyssier, Jean-Baptiste 23 September 2013 (has links) (PDF)
Les deux premières parties de cette thèse s'inscrivent dans le contexte des analogies entre l'irrégularité pour les connexions méromorphes et la ramification sauvage des faisceaux l-adiques. On y développe l'analogue pour les connexions méromorphes de la construction d'Abbes et Saito, tout d'abord dans le cas d'un trait, puis en dimension supérieure. En première partie, on prouve une formule explicite reliant les invariants produits par la construction d'Abbes et Saito appliquée à un module différentiel M aux parties les plus polaires des formes différentielles intervenant dans la décomposition de Levelt-Turrittin de M. Dans la seconde, on généralise en dimension supérieure l'observation issue de la première partie que sur un corps algébriquement clos, les modules produits par la construction d'Abbes et Saito sont des sommes finies de modules exponentiels associés à des formes linéaires. Dans la dernière partie de cette thèse, on montre que le lieu des points stables d'une connexion méromorphe M le long d'un diviseur lisse est un sous-ensemble de l'intersection des lieux où les faisceaux d'irrégularité de M et End M sont des systèmes locaux. Enfin, on discute d'une stratégie d'attaque de l'inclusion réciproque, et on démontre à l'aide d'un critère d'André pour les points stables que si elle est vraie en dimension 2, alors elle est vraie en toute dimension.
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Les besoins des proches de personnes assassinées ou disparues : une évaluation des services d’un organisme communautaire œuvrant auprès de ces clientèles

Matte, Delphine 08 1900 (has links)
Évaluation des services d'un organisme communautaire venant en aide aux proches de personnes assassinées et disparues / Le but de la recherche est d’identifier les besoins des proches de personnes assassinées et disparues afin de comparer les similitudes et les différences entre les deux groupes de proches de personnes victimes. À l’aide d’un questionnaire construit conjointement avec un organisme d’aide aux familles des victimes, deux conclusions peuvent être tirées. Les proches de personnes assassinées seraient plutôt à la recherche de services axés sur le soutien psychologique et émotionnel, alors que les proches de personnes disparues prioriseraient les services visant à combler des besoins plus pratiques, pour gérer la crise engendrée par la disparition d’un proche. Ces résultats sont cohérents avec la recherche sur les proches de personnes assassinées et disparues. Toutefois, les résultats sont influencés par des limites importantes, dont la petite taille de l’échantillon. / The objective of the research is to identify the needs of families of murdered and missing people. This would allow to compare similarities and differences between the needs of these groups of victims. A questionnaire was buit in cooperation with an organization helping families of missing or murdered victims. Two conclusions were drawn from the results. Families and friends of murdered people were looking for psychological and emotional support services. In comparison, families and friends of missing people were looking to fill more practical needs, such as managing the crisis following the disappearance of a member of their family. These results are consistent with research on family and friends of murdered and missing people. However, these conclusions are limited by important gaps in the research, such as a small sample.
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Toward the Comprehension of the Infrared to Submillimeter View of the Interstellar Medium of Nearby Galaxies

Galametz, Maud 30 September 2010 (has links) (PDF)
Cette thèse s'attache à l'étude du milieu interstellaire (MIS) des galaxies proches afin de mieux comprendre les processus physiques de ses composantes de gaz et de poussière. Nous nous sommes principalement concentrés sur les galaxies de faible métallicité pour étudier l'influence de l'enrichissement en métaux sur les propriétés du MIS. Les études précédentes ont montré que les densités spectrales d'énergie (SED) des galaxies à faible métallicité présentaient des différences notables avec celles des galaxies plus massives. Le rapport en masse poussière sur gaz (D/G) semble d'ailleurs dépendre de la métallicité. L'observation de ces galaxies conduit souvent à la détection d'un excès submm qui n'est pas pris en compte dans la modélisation actuelle des SEDs. Des études complémentaires sont donc nécessaires pour comprendre les phénomènes physiques liés aux différentes populations de grains de poussière responsables de l'émission IR/submm et d'en sonder les composantes froides. Nous avons adopté une approche multi-longueur d'onde pour modéliser les SEDs de 4 galaxies à faible métallicité observées avec LABOCA (870 μm). La fraction de poussière froide de ces galaxies semble être importante au regard de leur masse totale. Certains D/Gs ne correspondent pas aux prédictions des modèles d'évolution chimique et suggérent la présence de réservoirs de gaz moléculaire non détecté par les observations actuelles en HI et CO. Nous avons élargi cet échantillon à un intervalle plus varié de métallicité et montré que les contraintes submm affectent significativement la masse de poussière totale. La modélisation des galaxies riches en poussière dont les SEDs piquent généralement à grande longueur d'onde nécessite des contraintes submm pour échantillonner à la fois le pic et la pente submm de leur SED. Les galaxies à faible métallicité, quant à elles, peuvent présenter un excès en submm. Cet excès a des conséquences importantes sur la quantification de la masse de poussière et sur la caractérisation de cette poussière froide. Il nous fallait maintenant faire l'inventaire complet de cette population froide de grains et résoudre les principaux acteurs de l'émission IR et submm dans les régions massives de formation d'étoiles et dans les nuages moléculaires. Nous avons obtenu des observations LABOCA du complexe N158/N159/N160, une région intense de formation d'étoiles dans le Grand Nuage de Magellan, située au sud de 30 Doradus. La proximité du nuage de Magellan nous permet de résoudre des structures de quelques parsecs à 870 μm avec LABOCA. Cela permet d'effectuer une étude spatiale de l'évolution des SEDs à travers le complexe afin d'étudier la distribution de température des grains. Je compare également la distribution IR et submm avec les observations déjà disponibles en HI, CO et Hα afin notamment de réaliser une étude spatiale du D/G. Je présente enfin les premières images Herschel des galaxies NGC 6822 et NGC 1705 observées lors de la phase SD du télescope lancé en mai 2009. Pour NGC 6822, nous avons modélisé les SEDs de régions HII ainsi que de régions moins actives. Les SEDs des régions HII présentent des intervalles de températures plus chauds. Nous obtenons des masses de poussières importantes lorsque les graphites sont utilisés pour décrire la poussière carbonnée. L'utilisation de grains de carbone amorphe diminue ces masses de poussière. Cela semble indiquer que les modèles de SED incluant des données Herschel nécessitent l'utilisation des propriétés différentes des poussière.
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Participation sociale consécutive à un accident vasculaire cérébral avec déficits cognitifs chez des personnes âgées et aide apportée par leurs proches-aidants

Viscogliosi, Chantal January 2009 (has links)
L'AVC entraîne des séquelles qui incluent les déficits cognitifs pouvant nuire à la reprise des activités. Les objectifs de cette thèse étaient de: 1) comparer le niveau de participation sociale et de 2) suivre son évolution chez des personnes âgées ayant subi un AVC en fonction de la présence de déficits cognitifs; ainsi que 3) d'explorer le type d'aide apporté par les proches-aidants pour optimiser la participation sociale en fonction des déficits cognitifs présents. Cette étude suit un devis mixte. Pour le volet quantitatif (objectifs 1 et 2), 197 personnes âgées ayant subi un AVC ont été évaluées à trois moments après leur retour à domicile, soit trois semaines, trois mois et six mois suivant le congé d'une des structures de services suivantes: centre hospitalier de courte durée (CHCD), unité de réadaptation fonctionnelle intensive (URFI) ou hôpital de jour (HJ). La participation sociale a été mesurée avec la version abrégée de la Mesure des habitudes de vie (MHAVIE 3.1). La présence de déficits cognitifs a été déterminée à partir des résultats obtenus aux tests de mémoire (Weschler), perception visuelle (Motor Free Visual Perceptual Test - version verticale (MVPT-V)), fonctions exécutives (Stroop version Victoria: inhibition), attention visuelle (Test des cloches), et langage (Boston Naming Test: dénomination; version abrégée du Token Test: compréhension et Test de lecture du protocole Montréal-Toulouse: lecture). Des ANOVAS, tests-t, Mann-Whitney et ANCOVAS ont été utilisés. Des entrevues semi-structurées avec 12 proches-aidants ont permis d'identifier les types d'aide apportés et leurs motifs pour optimiser la participation sociale. Les analyses ont été faites selon l'approche de Miles et Huberman (2003). Après ajustement pour les symptômes dépressifs, le temps écoulé depuis l'AVC et les comorbidités, les données prouvent que les déficits de mémoire affectent la communication (p=0,006) et les loisirs (p=0,032). Pour leur part, les déficits de perception visuelle restreignent la nutrition (p=0,019), la communication (p=0,004) et les responsabilités (p<0,0005). Le niveau de réalisation des domaines de la communication (p<0,0005), des responsabilités (p<0,0005), de la vie communautaire (p=0,001) et des loisirs (p=1,021) est limité par les déficits de langage. Enfin, les résultats suggèrent que l'attention visuelle et la composante d'inhibition des fonctions exécutives ne restreignent pas la participation sociale. Par ailleurs, au cours des six premiers mois suivant le retour à domicile, l'évolution de la participation sociale ne diffère entre les personnes intactes et atteintes que pour le langage et les fonctions exécutives et ce, pour trois domaines des rôles sociaux: relations interpersonnelles, vie communautaire et responsabilités. Une grande variété de types d'aide a été décrite par les proches-aidants pour optimiser la participation sociale en fonction des déficits cognitifs présents chez la personne ayant subi un AVC. Les types d'aide apportés par les proches-aidants incluent la stimulation, la supervision, l'enseignement, la réparation, le soutien émotionnel, l'assistance physique, l'évitement de situations, la substitution et la non-intervention volontaire. Cette étude contribue à cibler les domaines de participation sociale pouvant être restreints par des déficits cognitifs et optimiser le partenariat entre les proches-aidants et les intervenants de réadaptation pour promouvoir la participation des personnes ayant des déficits cognitifs consécutifs à un AVC.
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La recherche de naines brunes et d'exoplanètes : développement d'une technique d'imagerie multibande

Marois, Christian January 2004 (has links)
Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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Etudes des propriétés physiques des galaxies par Herschel

Ciesla, Laure 29 November 2012 (has links)
Le Herschel Reference Survey (Boselli et al. 2010) est un programme clé à temps garanti conçu pour étudier les propriétés physiques du milieu interstellaire (MIS) de 323 galaxies proches, dotées de données multi-fréquences. Cet échantillon sélectionné en bande K et limité en volume est composé de galaxies couvrant tous les types de morphologies (des elliptiques aux galaxies spirales) et tous les types d'environnement (des galaxies de champs aux galaxies du centre de l'amas de la Vierge). Mon travail de thèse consiste à effectuer une photométrie submillimétrique précise de ces 323 galaxies, et de conduire une analyse statistique des propriétés du MIS de ces galaxies proches basée sur leur distribution spectrale d'énergie. Dans ce but, j'ai utilisé les modèles de Draine & Li (2007) que j'ai ajusté aux données. Les paramètres de sorties de ces modèles sont l'intensité du champ de radiation, l'abondance des PAH, la contribution des régions de photo-dissociation dans le chauffage de la poussière, et la masse de poussière. J'étudie les relations entre ces paramètres de sorties et les propriétés physiques telles que la masse stellaire, le taux de formation stellaire spécifique, la métallicité ou encore le type morphologique.Je vais présenter les études préliminaires liées à ces relations, entrainant une meilleur compréhension des processus en jeu dans le MIS, et procurer de nouveaux modèles infrarouges et submillimétriques paramétrés par les quantités physiques que je viens de citer. Ces modèles, calibrés sur les galaxies proches, seront déterminant pour l'étude des propriétés du MIS des galaxies à haut redshifts. / The Herschel Reference Survey (Boselli et al. 2010) is a guaranteed time key project aimed at studying the physical properties of the interstellar medium (ISM) of 323 nearby galaxies, covered by multi-wavelength data. This volume limited, K-band selected sample is composed of galaxies spanning the whole range of morphological types (from ellipticals to late-type spirals) and environments (from the field to the centre of the Virgo Cluster). My PhD work consists in performing a precise submillimeter photometry of every galaxies of the survey, and conducting a statistical study on the ISM properties of nearby galaxies based on the analysis of their spectral energy distributions. To achieve this goal I fit the data with the models of Draine & Li 2007. The output of Draine & Li (2007) models are the intensity of the interstellar radiation field, the PAH abundance, the contribution of photodissociation regions, the total mass of dust. I study the relations between these outputs and the physical properties such as the stellar mass, the specific star formation rate, the metallicity or the morphological type. I will present a preliminary analysis of these relations leading to a better understanding of the processes at play in the ISM and provide new infrared sets of templates from 8 to 500 microns parameterized by all the physical parameters just cited. These templates calibrated on nearby galaxies will be a benchmark for the study of the ISM properties of high redshift galaxies.

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