Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-17T09:30:03Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 971904 bytes, checksum: 6fba372a708197c45ace38066444f048 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-17T09:30:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 971904 bytes, checksum: 6fba372a708197c45ace38066444f048 (MD5) Previous issue date: 2015-07-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Prochilodus argenteus, a curimatá-pacu, juntamente com a sua espécie irmã, Prochilodus costatus, representam cerca de 50% da biomassa total da pesca, sendo as espécies migratórias mais abundantes na região de Três Marias e ambas endêmicas da bacia do rio São Francisco. A construção de hidrelétricas altera o ambiente e o fluxo gênico entre populações que podiam não estar isoladas no passado. Desta forma, o objetivo deste estudo foi verifica se existem diferenças citogenéticas entre populações de Prochilodus argenteus que podem ter ficado isoladas pela barragem de Três Marias, bacia do rio São Francisco, Minas Gerais, Brasil, desde final da década de 1950. Foram coletados 44 espécimes: 14 a montante da represa, perto da cidade de Iguatama, e 30 a jusante (24 no Refugio Estadual da Vida Silvestre do rio Pandeiros e seis no município de Três Marias). O número diploide de 2n=54 e a fórmula cariotípica 40m + 14sm foram encontrados em todos os indivíduos. Em ambas as populações foram encontrados os seguintes padrões: a banda C apresentou blocos heterocromáticos centroméricos em todos os cromossomos, além de um bloco adicional pericentromérico no segundo par metacêntrico; a Ag-NOR evidenciou marcações simples no segundo par metacêntrico, coincidindo com a constrição secundária. Em aproximadamente 5% das metáfases ocorreu uma terceira marcação na região terminal de apenas um cromossomo. A técnica de Fluorescent in situ Hybridization (FISH) utilizando as sondas 18S e 5S rDNA evidenciou sintenia destas regiões no segundo par metacêntrico, coincidentes com a NOR e a constrição secundária. As sondas repetitivas (GA) 15 e (CA) 15 apresentaram marcações na região telomérica de todos os cromossomos e a sonda (CA) 15 evidenciou blocos na região pericentromérica no quarto par metacêntrico, sugerindo a ocorrência de inversão cromossômica. As sondas (CAA) 10 e (CAT) 10 apresentaram marcação na região telomérica na maioria dos braços cromossômicos e, de forma mais difusa, ao longo de alguns cromossomos. Com base nestes padrões, conclui-se que as populações, hoje isoladas pela UHE de Três Marias desde a década de 50, não sofreram diferenciação citogenética e podem ser consideradas como uma população única. / Prochilodus argenteus, the curimatá-pacu, along with its sister species, Prochilodus costatus represent about 50% of the total biomass of fish, and migratory species more abundant in the area of Three Marias, both endemic to the São Francisco River basin. The construction of hydroelectric dams changes the environment and precludes gene flow between populations that were not isolated in the past. Thus, the aim of this study was to determine if there cytogenetic differences between populations of Prochilodus argenteus that became isolated by the Três Marias Dam, São Francisco Basin, Minas Gerais, Brazil, since late 1950s. Forty-four specimens were collected: 14 upstream of the dam, near the city of Iguatama, and 30 downstream (24 in the Refugio Estadual da Vida Silvestre do rio Pandeiros and six in the Três Marias Dam channel). We found a stable karyotype formula of 40m + 14sm, 2n=54. The following patterns were observed in both populations: The C banding showed centromeric heterochromatin blocks in all chromosomes, plus an additional pericentromeric block in the second chromosome metacentric pair. The nucleolus organizer regions (Ag-NOR) occurred on the second metacentric pair, coinciding with the secondary constriction. About 5% of the metaphases showed a third mark in the telomeric region of only one chromosome complements. The Fluorescent in situ Hybridization (FISH) with the 18S and 5S rDNA probes revealed synteny of these regions on the second metacentric pair, coinciding with the NOR and the secondary constriction. The (GA) 15 and (CA) 15 repetitive DNA probes showed markings on the terminal region of most chromosomes, and the (CA) 15 repetitive DNA probe hybridized in the pericentromeric region of the fourth chromosome pair, suggesting a chromosomal inversion. The (CAA) 10 and (CAT) 10 repetitive DNA probes hybridized on the terminal region of most chromosome arms and along some chromosomes. Based on these cytogenetic patterns, we concluded that the populations now isolated by UHE Três Marias since the 50’s did not suffer cytogenetic differentiation and should be considered as a single population.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2545.pdf: 1510669 bytes, checksum: 0034bf644a7b69173de2cb87cd612f3e (MD5) Previous issue date: 2009-07-24 / Financiadora de Estudos e Projetos / Introduction of hatchery fish in river has been the major using strategy for river fishery rehabilitation, working to attenuate river damage in short time. But there are effective risks about their efficiency and results, concerning the pool gene preservation and illness proliferation, beyond others ecologies and economics aspects. At São Francisco river, during two decades it was used this kind of procedure with some species of fish, but there are no quantitative data about their efficiency. Prochilodus argenteus, popular known as Curimatápacu, is pointed as the most important economic specie at São Francisco basin, responsible for 50% of all fishery production. Therefore, this project goals to trace the genetic profile of a Prochilodus argenteus hatchery population, looking for identify stock genetic variability through 13 SSR loci previous described, and to compare theses data with others described in literature from wild stocks. Tests made with Microchecker, Genepop, and Fsat softwares detected low homozygosis; reduced allelic variability when compared with wild population; increase in heterozygosis when compared with expected; and negative inbreed coefficient, these data got a trace for bottleneck phenomena in a cultured population, and Bottleneck software tests confirm this hypothesis. When the same test was ruled with wild population data results very far from those found in hatchery populations, give a high reliability. To conclude, at cultured and/or management programs are necessary the knowledge of genetic profile population (hatchery or wild) to prevent damaging introgression in wild population and consequently extinction. These data can be used to made fishery river rehabilitation program more efficient, and so, adding with information to fish procreation, industrial fishery and biologic fish conservation studies. / O repovoamento de rios é uma das estratégias que vem sendo frequentemente usada para a reabilitação pesqueira, atuando como uma medida mitigadora de curto prazo, embora envolva riscos relativos à eficiência do programa quanto aos seus resultados, à preservação do pool genético e à possibilidade de introdução de doenças, além de outros aspectos ecológicos e econômicos. No rio São Francisco, esta prática vem sendo realizada há mais de duas décadas com algumas espécies de peixes. No entanto, não existem relatos quantitativos de sua eficiência. Prochilodus argenteus, conhecido popularmente como curimatã-pacu, constitui uma espécie de relevante valor econômico para a bacia do São Francisco, representando cerca de 50% de toda produção de pescado. O presente trabalho teve como objetivo traçar o perfil genético de uma população de cultivo de Prochilodus argenteus, visando identificar a variabilidade genética deste estoque. Foram utilizados 13 loci de microssatélites previamente descritos na literatura e seus dados foram comparados com os de população selvagem de trabalhos anteriores. Testes feitos com os programas Microchecker, Genepop e Fstat detectaram baixa homozigose, redução da variabilidade alélica quando comparada a estoques naturais, um número aumentado de heterozigotos quando comparado com o esperado e coeficiente de endogamia negativo, tais dados apontam para um possível efeito gargalo (bottleneck) recente na população cultivada. Testes feitos com o programa Bottleneck confirmaram essa hipótese. Resultado de tais teste se tornaram muito expressivos, quando o mesmo teste foi feito com dados de uma população selvagem para parâmetros de comparação. Os dados obtidos no presente trabalho demonstram que programas de manejo e cultivo do Prochilodus argenteus necessitam de um conhecimento do perfil genético da população (de cultivo ou selvagem), para que não haja introgressão deletéria na população selvagem com seu posterior declínio. Discussões sobre recuperação de ambientes aquáticos mostram que ações integradas são necessárias para que de fato se tenha uma efetiva recuperação desses ambientes. Dados genéticos poderão subsidiar e viabilizar programas de peixamentos mais eficientes e, assim, contribuir com estudos relacionados ao manejo de pesca, piscicultura e conservação biológica deste peixe.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-15T12:02:47Z No. of bitstreams: 1 Jose Claudio Epaminondas dos Santos.pdf: 477106 bytes, checksum: 9fe2414fc5dd066fea0a90a2204c85f8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-15T12:02:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose Claudio Epaminondas dos Santos.pdf: 477106 bytes, checksum: 9fe2414fc5dd066fea0a90a2204c85f8 (MD5) Previous issue date: 2004-02-03 / The objective of the present work was to compare two hypophysation techniques in the induction to the ovulation of curimatã-pacu Prochilodus argenteus. The treatment 1 (T1) it consisted of the application of only dose of crude carp hypophysis extract, while the treatment 2 (T2) it consisted of two doses. The experiment was accomplished in two stages. In the first, the following data were verified: rates of spawned females, hour-degree, rate of fertilization, rate of deformed larvas, and the consumptions of time, water and energy. In the second stage, the glucose concentrations and cortisol were verified in the plasma sanguine of the treated fish. Besides those you varied, the weights and lengths total, weight of the oocyte extrudido, and weigh of the fish extrudido, were taken. After statistical treatment it was verified that there was not significant difference (P> 0,05) among the treatments with relationship to the rates of spawned females, of fertilization and of deformed larvas, and the weight and the length total just influenced those you varied.There was difference statistics (P <0,05) among the hour-degree of the treatments, where T1 elevated to corresponding hour-degree. The treatments just influenced to hour-degree. T2 increased the consumptions of time, water and energy. Data preliminaries of the glucose and of cortisol concentrations of the plasma sanguine were presented. Finally, it is ended that treatment with only dose presents the same efficiency that treatment with two doses in the induction to the curimatã-pacu ovulation. / O objetivo do presente trabalho foi comparar duas técnicas de hipofisação na indução à ovulação de curimatã-pacu Prochilodus argenteus. O tratamento 1 (T1) constou da aplicação de dose única de extrato bruto de hipófise de carpa (EBHC), enquanto o tratamento 2 (T2) constou de duas doses de EBHC. O experimento foi realizado em duas etapas. Na primeira, foram verificados os seguintes dados: taxa de fêmeas desovadas, hora-grau, taxa de fertilização, taxa de larvas deformadas, e os consumos de tempo, água e energia. Na segunda etapa, foram verificadas as concentrações de glicose e cortisol no plasma sangüíneo dos peixes tratados. Além dessas variáveis, foram tomados os pesos e comprimentos totais, peso do ovócito extrudido, e peso do peixe extrudido. Após tratamento estatístico verificou-se que não houve diferença significativa (P> 0,05) entre os tratamentos com relação às taxas de fêmeas desovadas, de fertilização e de larvas deformadas, e apenas peso e comprimento total influenciaram essas variáveis. Houve diferença estatística (P< 0,05) entre as horas-grau dos tratamentos, onde o T1 elevou à hora-grau correspondente. Apenas os tratamentos influenciaram a hora-grau. O T2 incrementou os consumos de tempo, água e energia. Foram apresentados dados preliminares das concentrações de glicose e de cortisol do plasma sangüíneo. Finalmente, conclui-se que tratamento com dose única apresenta a mesma eficiência que tratamento com duas doses na indução à ovulação de curimatã-pacu.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 1814.pdf: 769331 bytes, checksum: eea2f2d52c718aafb2beca6a1ffc226b (MD5) Previous issue date: 2008-04-23 / Universidade Federal de Sao Carlos / Genetic studies have been performed for an endemic species from São Francisco River basin, Prochilodus argenteus, which has a great importance in the artisanal and subsistence fishing in the region. The linkage mapping and the genetic variability studies were made with AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) dominants markers and with 189 specimens from a F1 cross, that was also used for restocking the upstream area from Três Marias hydroelectric dam. All the analyses were carried out with 15 primer pairs combinations and the linkage map was made using the pseudo-testcross mapping strategy. Forty six heterozygous marks were found for the genitors, with mendelian segregation of 1:1. The female genitor map had 3 linkage groups and the lenght of the analysed genome was 128,45 cM, the male genitor map had the same number of linkage groups and the total length of 192,67 cM. Common markers for both genitors, with mendelian segregation ratio of 3:1, served as bridge between the maps, for the construction of an integrated map. This map had 9 linkage groups, and the total map length was 442,08 cM. Additionally, the genetic variability was assessed and an expected heterozygosity mean was of 0,32082, with a Jaccard s similarity coefficient of 0,72564 + 0,00451. These preliminary values show that the cultured sample has a higher similarity coefficient than that obtained for the wild populations. Hence, the present results suggest that genetic studies and management restocking practices should be simultaneously performed for the maintenance of the genetic patrimony of this species at the São Francisco River basin. The results also showed that AFLP marks were suitable and effective to identify linkage marks in Prochilodus argenteus and for genetic variability studies in cultivar samples. / Estudos genéticos foram realizados em uma espécie endêmica da bacia do rio São Francisco, Prochilodus argenteus, a qual possui grande importância na pesca artesanal e de subsistência da região. Os estudos do mapa de ligação e de variabilidade genética foram realizados com o uso do marcador dominante AFLP (Polimorfismo de Comprimento de Fragmentos Amplificados) e com 189 indivíduos de um cruzamento F1, utilizado também para o repovoamento do rio São Francisco, à montante da barragem de Três Marias (MG). Todas as análises foram realizadas com 15 combinações de primers. Para a construção dos mapas de ligação foi utilizada a abordagem pseudocruzamento teste. Os primers utilizados geraram 46 marcas heterozigóticas para os genitores, com segregação mendeliana de 1:1. O mapa referente ao genitor feminino apresentou 3 grupos de ligação e o comprimento do genoma analisado foi de 128,45 cM, e o mapa do genitor masculino também consistiu em 3 grupos de ligação com comprimento total de 192,67 cM. Marcadores comuns aos dois genitores, com segregação mendeliana de 3:1, foram utilizados como pontes na integração dos mapas. O mapa integrado foi formado por 9 grupos de ligação, o que correspondeu a 442,08 cM de genoma analisado. Adicionalmente, a variabilidade genética foi estudada por meio da média da heterozigosidade esperada (He), a qual foi de 0,32082 e pela análise do coeficiente de similaridade de Jaccard, que foi igual a 0,72564 + 0,00451. Estes valores, ainda que preliminares, mostraram que essa amostragem cultivada possui o coeficiente de similaridade maior quando comparado com os de populações selvagens. Desta forma, sugere-se no presente trabalho que estudos genéticos devam ser realizados juntamente com a prática de repovoamento de rios, visando conservar o patrimônio genético desta espécie na bacia do São Francisco. Os resultados mostraram também que os marcadores AFLP foram adequados e eficientes para a identificação de marcas ligadas em Prochilodus argenteus e no estudo da variabilidade genética de amostras cultivadas.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2646.pdf: 870244 bytes, checksum: b88bf96aa8cafe0798c953895db021a7 (MD5) Previous issue date: 2009-08-28 / Financiadora de Estudos e Projetos / A preliminary genetic linkage map was constructed for the species Prochilodus argenteus, an endemic fish from the São Francisco river basin, using 23 microsatellite markers in a progeny with 95 individuals from a single cross by the pseudo-testcross strategy. The male and female parents were collected in different regions, downstream of the dam of the Três Marias (MG). Only 11 (52.4%) markers grouped in some linkage group and the the remaining was unlinked. Twenty-one (91.5%) markers appeared to segregate according to Mendelian inheritance, and only two (8.7%) showed segregation distortion. The map covered 297.58 cM of the genome, according to the Kosambi s function. The number of linkage groups (3) found in this study was much lower than expected for the species (equivalent to the haploid number of chromosomes, n = 27), demonstrating the importance of using a larger number of molecular markers in future studies. The data obtained in this work will be compiled with the marks obtained by AFLP by Rojas (2008) in order to obtain a denser genetic map. Although the number of linkage groups found have been lower than expected for the species, the results can be considered promising for the Brazillian Fish Genetics, since genetic mapping studies are virtually absent in Neotropical fish. / Um mapa genético preliminar foi construído para a espécie Prochilodus argenteus, um peixe endêmico da bacia hidrográfica do rio São Francisco, através de 23 marcadores moleculares microssatélites em uma progênie com 95 indivíduos provenientes de um único cruzamento através da estratégia pseudo-testcross . Os genitores masculino e feminino foram coletados em diferentes regiões, à jusante da barragem de Três Marias (MG). Apenas 11 (52.4%) marcadores foram alocados em algum grupo de ligação e os restantes não estavam ligados. Vinte e um (91.5%) marcadores segregaram de acordo com a herança mendeliana e apenas dois (8.7%) apresentaram distorção da segregação. O mapa cobriu 297.58 cM do genoma, de acordo com a função de Kosambi. O número de grupos de ligação (3) encontrado no presente trabalho foi muito inferior ao esperado para a espécie (equivalente ao número de cromossomos haplóides, n = 27), demonstrando a importância da utilização de um número maior de marcadores moleculares em estudos futuros. Os dados obtidos no presente trabalho serão compilados com as marcas AFLP obtidas por Rojas (2008), visando um mapa genético mais denso. Embora o número de grupos de ligação encontrado tenha sido inferior ao esperado para a espécie, os resultados podem ser considerados como promissores na área de Genética de Peixes do Brasil, já que estudos de mapeamento genético são praticamente inexistentes em peixes neotropicais.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-08-11T13:55:38Z No. of bitstreams: 1 Larissa Monteiro de Vasconcelos.pdf: 1926749 bytes, checksum: 46a22f2473b8fc34a3db7c3549b55a03 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-11T13:55:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Larissa Monteiro de Vasconcelos.pdf: 1926749 bytes, checksum: 46a22f2473b8fc34a3db7c3549b55a03 (MD5) Previous issue date: 2017-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Chromosomal set manipulation is a promising tool for breeding programs and biological conservation. Triploidy induction provides benefits that increase fish production and reduces the impact of escapes from fish farming on wild populations. These benefits are due to the most probable characteristics of triploid fish: sterility; because of its assumed ability to increase yield by conducting the energy required from gonadal development to somatic growth, leading to better growth rates and fillet quality. The curimatã-pacu (Prochilodus argenteus) is an endemic migratory fish species of the São Francisco River, which abundance have been compromising by the hydroelectric dams along the river and is known for its highly appreciated meat, with a great potential for extensive aquaculture, In this study, the efficiency of thermal shocks (cold and heat) to triploid production was evaluated. Cold shocks (0-4ºC) were tested at 2.5 min, 5 min, 10 and 12 min postfertilization (mpf), lasting for 10, 15, 20 and 25 minutes. Heat shocks were alsoinvestigated at 5 mpf, lasting for three minutes at 39 and at 41ºC. In each treatment, a control group was maintained to analyze egg quality. No hatches were observed for the heat shock treatments. For cold shock treatment applied at 5mpf and lasting for 25 minutes, 100% triploids were obtained. For others cold shock treatments also applied at 5mpf, but lasting for 20, 15 and 10 minutes, triploid rates were 89.12, 76.92 and 63.33%, respectively. Although fertilization rates were statistically different between diploid and triploid, survival, weigh and size were similar between triploids and control groups after being reared for 21 days in tanks. This is the second protocol for a Brazilian native species with 100% triploidization yield and the first one to achieve this by means of thermal shocks. / A manipulação cromossômica apresenta-se como uma ferramenta promissora nos programas de criação de peixes e de conservação biológica. Dentre elas, a indução à triploidia apresenta benefícios que vão desde a otimização da produção à minimização dos impactos causados na natureza pelos escapes de peixes cultivados. Tais benefícios ocorrem, principalmente, em virtude da característica mais provável dos triploides: a esterilidade; que permite que o gasto energético antes empregado no desenvolvimento gonadal seja realocado para o crescimento somático, podendo resultar em taxas de crescimento mais elevadas e na melhoria da qualidade do filé. A curimatã-pacu (Prochilodus argenteus) é um peixe endêmico do rio São Francisco muito apreciado por sua carne, que tem sua abundância comprometida pelos barramentos das hidrelétricas dessa bacia, e que apresenta grande potencial para a aquicultura extensiva. Nesse trabalho foi avaliado a eficiência de choques térmicos quentes e frios para indução à triploidia em curimatã-pacu. Para os choques frios (0 – 4 ºC), foram testadas aplicações aos 2,5 min, 5 min, 10 e 12 min pós-fertilização (mpf), com durações de 10, 15, 20 e 25 minutos. Os testes com choques quentes (39 e 41ºC) foram aplicados também aos 5 mpf com duração de três minutos. Para cada um dos choques testados foi mantido um grupo controle para avaliação da qualidade gamética. Nenhuma eclosão foi observada para os choques quentes. Para os choques frios, embora as taxas de triploidização não tenham sido obtidas para os testes realizados aos 2,5 e 12 mpf, os choques aplicados aos 5 mpf com duração de 25 minutos produziram 100% de triploides. Para os demais choques com 20, 15 e 10 minutos de duração, as taxas de triploidização obtidas foram de 89,12, 76,92 e 63,33%, respectivamente. Os animais foram mantidos em aquários por um período de 21 dias, no qual à exceção das taxas de fertilização e sobrevivência inicial, peso e tamanho não foram significativas entre diploides e triploides. Esse é o segundo protocolo com 100% de produção de triploides para uma espécie nativa brasileira e, o primeiro a conseguir esse feito com o uso de choques térmicos.