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Análise transcricional de genes relacionados à formação de biofilme e virulência em cepas de Listerua Monocytogenes cultivadas em diferentes temperaturas / Transcriptional analysis of genes related to biofilm formation and virulence in Listeria monocytogenes strains grown at different temperatures

Pieta, Luiza January 2013 (has links)
Dentre as oito espécies do gênero Listeria, a única transmitida por alimentos, patogênica para humanos, é a Listeria monocytogenes. De grande preocupação para a indústria alimentícia, este microrganismo pode ser encontrado em diversas superfícies de plantas processadoras de alimentos, sendo capaz de se aderir e formar persistentes biofilmes. No presente trabalho, foi estudada a influência da concentração de glicose e do tempo de incubação na formação de biofilme por uma cepa de L. monocytogenes, sorotipo 1/2a, cultivada em três diferentes temperaturas, 7°C, 25°C e 37°C, através de planejamento experimental utilizando a Metodologia de Superfície de Resposta. As duas variáveis testadas, para os intervalos estudados, foram significativas (p<0,05) na formação de biofilme somente na temperatura de 37°C e, tanto concentrações de glicose tendendo a zero combinadas com tempos de incubação próximos a 26 h, como maiores concentrações de glicose combinadas com menores tempos de incubação, dentro da faixa de estudo aplicada, representaram boas condições para a formação de biofilme. Foi também realizada a análise transcricional de genes relacionados à formação de biofilme e virulência em duas cepas de L. monocytogenes, sorotipos 1/2a e 4b, cultivadas a 7°C e 37°C (condição controle), pela técnica de PCR quantitativo em tempo real (RT-qPCR). Para ambas as cepas, os genes sigB, prfA, luxS, sufS, sufU, ltrC e flaA apresentaram transcrição significativamente aumentada (p<0,05) a 7°C, em comparação aos resultados para a condição de cultivo a 37°C, enquanto que o gene hly não variou significativamente a sua transcrição entre as duas temperaturas. O gene actA foi mais transcrito a 7°C para a cepa denominada 55, do sorotipo 1/2a, enquanto que não variou significativamente a sua transcrição entre as duas condições de crescimento para a cepa denominada 47, do sorotipo 4b. No entanto, para a cepa 55, o gene degU não demonstrou diferença estatisticamente significativa entre seus níveis de transcrição nas duas temperaturas estudadas, mas para a cepa 47, apresentou transcrição significativamente aumentada a 7°C. Interessantemente, a presença do gene agrA não foi detectada na cepa 47, e os seus níveis de transcrição foram menores a 7°C para a cepa 55. Estes resultados demonstram que os dois sorotipos estudados, responsáveis por muitos dos casos humanos de listeriose, apresentam mecanismos moleculares diferentes, nas temperaturas de 7°C e 37°C. / Among the eight species of genus Listeria, the only transmitted by food, pathogenic for humans, is Listeria monocytogenes. Of great concern to the food industry, this microorganism can be found in various areas of food processing plants, being able to adhere and form persistent biofilms. In the present work, the influence of glucose concentration and incubation time on biofilm formation by a strain of L. monocytogenes, serotype 1/2a, grown in three different temperatures, 7°C, 25°C and 37°C, have been studied, through an experimental design using the Response Surface Methodology. The two variables tested, for the studied intervals, were significant (p<0,05) in the biofilm formation only at a temperature of 37°C and, both glucose concentrations tending to zero combined with incubation times near to 26 h, and higher glucose concentrations combined with lower incubation times, within the applied range study, represented good conditions for biofilm formation. Transcriptional analysis of genes related to biofilm formation and virulence in two strains of L. monocytogenes, serotypes 1/2a and 4b, grown at 7°C and 37°C (control condition), was also performed, by real-time quantitative PCR (RT-qPCR). For both strains, sigB, prfA, luxS, sufS, sufU, ltrC and flaA genes showed significantly increased transcription (p<0,05) at 7°C, in comparison with results for the growth condition at 37°C, whereas hly gene did not varied significantly its transcription between the two temperatures. The actA gene was more transcribed at 7°C for the 55 strain, serotype 1/2a, while did not varied significantly its transcription between the two growth conditions for the 47 strain, serotype 4b. However, for 55 strain, the degU gene did not showed statistically significant difference for its transcription levels between the two studied temperatures, but for 47 strain, presented significantly increased transcription at 7°C. Interestingly, the presence of agrA gene was not detected in 47 strain, and its transcription levels were lower at 7°C for 55 strain. These results demonstrate that the two studied serotypes, responsible for many of the human listeriosis cases, have different molecular mechanisms, at temperatures of 7 and 37°C.
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Frequência do HCV-RNA em Amostras de Soro e Saliva de Pacientes Anti-HCV Positivos

Simões, Cristiane Araújo 02 May 2012 (has links)
Submitted by Lucelia Lucena (lucelia.lucena@ufpe.br) on 2015-03-13T17:37:58Z No. of bitstreams: 2 dissertacao Cristiane Araujo Simoes.pdf: 819117 bytes, checksum: 0a57c0b1fda36c45fbb123fbb3de1e94 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T17:37:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 dissertacao Cristiane Araujo Simoes.pdf: 819117 bytes, checksum: 0a57c0b1fda36c45fbb123fbb3de1e94 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-05-02 / A pesquisa do vírus da Hepatite C (HCV) em outros fluidos corporais além do sangue é importante quando se avalia a existência de outras possíveis vias de transmissão, afinal cerca de 40% dos pacientes contaminados não apresentam história de exposição por via parenteral. A presença do RNA do HCV (RNA-HCV) na saliva de indivíduos infectados foi observada em alguns trabalhos e esta vem sendo sugerida como uma possível via de transmissão. No entanto, o papel dos fluidos orais na transmissão do HCV permanece controverso. O objetivo deste trabalho foi identificar o HCV-RNA na saliva e no soro de pacientes anti-HCV positivos. Foi realizado um estudo transversal com uma amostra de conveniência composta por 50 pacientes atendidos no Setor de Gastroenterologia do Hospital das Clínicas de Pernambuco (HC-UFPE) no período de junho a setembro de 2011. Amostras de sangue e saliva foram coletadas e processadas. O HCV-RNA foi extraído e uma alíquota utilizada na RT-PCR. O HCV-RNA foi detectado em 82% (41/50) das amostras de soro e em 0% das amostras de saliva. Pela metodologia empregada neste trabalho, não houve presença do HCV-RNA em saliva.
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Quantificação de mediadores dos perfis Th1, Th2, Th17 e Treg na resposta imune contra Leishmaniose Tegumentar Americana ativa e após cura clínica

Souza, Marina de Assis 21 February 2014 (has links)
Submitted by Daniella Sodre (daniella.sodre@ufpe.br) on 2015-03-18T14:24:33Z No. of bitstreams: 2 TESE Marina de Assis Souza.pdf: 5668024 bytes, checksum: 0e33397511d45e0f461e61a5893b8f99 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-18T14:24:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE Marina de Assis Souza.pdf: 5668024 bytes, checksum: 0e33397511d45e0f461e61a5893b8f99 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / FACEPE e CNPq / O modelo clássico de susceptibilidade e resistência à leishmaniose sugere que a expansão de células Th1 ou Th2 direcione o resultado da infecção. Recentemente, o perfil Th17 foi relacionado à doença e parece ser antagônico às células T regulatórias (Treg). Assim, este estudo teve como objetivo quantificar, por ELISA de captura ou qPCR, alguns mediadores dos perfis Th1, Th2, Th17 e Treg (IFN-γ, TNF-α, IL-10, IL-4, TGF-β, IL-6, IL-17, IL-22, RORC, Foxp3 e iNOS) em pacientes com leishmaniose tegumentar americana (LTA) ativa (AD) e após a cura clínica, tratados (AT) ou não (cura espontânea; SH). Os pacientes foram capazes de apresentar resposta imunológica específica frente aos antígenos solúvel (AgSol) e insolúvel (AgIns) de L. (V.) braziliensis em relação ao grupo controle. O primeiro artigo demonstrou que, em resposta ao AgSol, houve a predominância de IFN-γ (P = 0,0061) e TNF-α (P = 0,008) durante a doença ativa, indicando a presença de uma resposta inflamatória; IL-17 também é evidenciada nesse estado clínico (P = 0,04). Um aumento na secreção de NO foi observado em SH (P = 0,023), enquanto que IL-17 foi observada em baixos níveis nesses pacientes, sugerindo que esta parece ser regulada pelo NO. A presença de IL-10 e IL-22 foi observada em todos os grupos (P > 0,05). No segundo artigo, o AgIns estimulou produção significativa de IFN- γ em todos os grupos (P < 0,05). AD (P = 0,007) e AT (P = 0,003) produziram TNF-α. Em contrapartida, o grupo SH apresentou baixos níveis da citocina. De forma interessante, a secreção de NO foi significativa nesses indivíduos (P = 0,04), enquanto que IL-17 foi observada em baixos níveis. Produção significativa de IL-17 foi observada no grupo AT (P = 0,04). Embora IL-22 tenha sido detectada em AD (P = 0,02), seu papel é questionável. A presença de IL-10 em todos os grupos de pacientes sugere que a citocina desempenhe diferentes papéis na doença (P > 0,05). No terceiro artigo, PBMC de pacientes com lesões ativas expressaram mRNA para IFN-γ (AgSol: P = 0,017; AgIns: P = 0,0004) e TNF-α (AgSol: 0,0306; AgIns: P = 0,027), reforçando a possível presença de uma resposta inflamatória. A ausência de mRNA para a iNOS nesses pacientes pode ser devido à presença de NO secretado, representando um mecanismo de compensação. Este evento pode ajudar a evitar a exacerbação da resposta imune. Além disso, a presença significativa de mRNA para IL-10 (AgSol: P = 0,0119; AgIns: P = 0,0114) sugere que mecanismos imunomodulatórios favoreçam uma resposta imune efetiva contra a Leishmania. A expressão de Foxp3 frente ao AgIns (P = 0,0208) indica que células T regulatórias estejam presentes na resposta de pacientes com lesões ativas. Embora IL-17 e IL-22 pareçam ser importantes na resposta imune efetiva na LTA, Os níveis de mRNA para estas citocinas não foram significativos (P > 0,05).Entretanto, os níveis de IL-6 expressos pelos pacientes (AgSol: P = 0,0189) com doença ativa parecem ter sido insuficientes para induzir um perfil Th17 juntamente com TGF-β (P > 0,05), dada a expressão não significativa de RORC (P > 0,05). A expressão de TGF- β pode ter contribuído para a regulação da resposta imune pelas células Treg, o que reforça o suposto antagonismo entre este e o perfil Th17. Assim, a secreção/expressão desses mediadores reforça a complexidade da resposta imune celular no combate à Leishmania, e traz informações para o desenvolvimento de vacinas e esquemas imunoterapêuticos.
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Desenvolvimento rigoroso com Uml-Rt

Teixeira Ramos, Rodrigo January 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T16:01:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo7289_1.pdf: 2013918 bytes, checksum: e3f26e432c831b7c299664b62269fd01 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Petróleo Brasileiro S.A. / Como outros métodos visuais orientados a objetos, UML tem influenciado tremendamente a prática de modelagem na engenharia de software com ricos mecanismos de estruturação. Porém, apesar de suas vantagens e adoção em larga escala, na prática, a falta de uma semântica formal tem dificultado o desenvolvimento rigoroso baseado em modelos de aplicações não triviais (aplicações que por sua natureza necessitam de ênfase na especificação e na verificação de seus componentes). A razão para isto é que transformações de modelos podem não preservar a semântica e, como conseqüência, o comportamento do modelo. Este problema é ainda mais sério em transformações que envolvem diferentes visões do modelo. Limitações similares podem ser encontradas durante o desenvolvimento com UML-RT. Esta linguagem é uma extensão conservativa de UML que provê a noção de objetos ativos (objetos com um comportamento próprio, independente do fluxo de execução do restante do sistema) para descrever aplicações concorrentes e distribuídas. Neste tipo de desenvolvimento, transformações devem lidar simultaneamente com as diferentes visões estáticas e dinâmicas do modelo, representadas por seus diagramas e propriedades. Por estes motivos, este trabalho propõe uma semântica para UML-RT, mapeando suas construções em OhCircus, uma linguagem formal, orientada a objetos, que combina CSP e Z, e que suporta o cálculo de refinamentos de Morgan. A partir desta semântica, bem como das noções e leis de refinamentos de OhCircus, é possível propor leis de transformação de modelos passíveis de demonstração e que preservam o comportamento do sistema. Estas leis de transformação são propostas em duas categorias: a primeira delas é um conjunto abrangente de leis básicas que expressam pequenas mudanças nas principais visões do modelo, como a declaração ou remoção de elementos do modelo; já a segunda representa leis de transformação de maior granularidade, derivadas a partir da composição de leis básicas, como a decomposição de uma cápsulas em cápsulas operando em paralelo. Tais transformações derivadas podem ser vistas como refatoramentos (refactorings) corretos sobre o modelo, facilmente aplicáveis durante um processo de desenvolvimento rigoroso, sem que o desenvolvedor tenha conhecimento do formalismo que o suporta. Finalmente, a abrangência deste conjunto de leis é discutida particularmente através dos principais passos de uma estratégia de redução de modelos UML-RT a um modelo UML estendido com um único objeto ativo, responsável por todas as interações com o ambiente e por conservar o comportamento dinâmico do sistema modelado. Este modelo UML estendido pode ser visto como uma forma normal, e, portanto, nossa estratégia pode ser vista como uma contribuição para uma estratégia mais global de completude capturada por redução a esta forma normal
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Expressão diferencial de genes envolvidos na virulência durante a germinação, conidiogenese e patogênese em Metarhizium anisoplae var. anisoplae e Metarhizium anisoplae var. acridum

Porto Carneiro Leão, Mariele 31 January 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6499_1.pdf: 2052434 bytes, checksum: 0d0ed4c819168b93a4f1be887b9da045 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Metarhizium anisopliae é um patógeno de insetos economicamente importante usado em todo o mundo no controle biológico de insetos-praga. Porém, sua utlização é limitada devido ao tempo de mortalidade ser relativamente alto quando comparado aos inseticidas químicos. A análise das expressões de genes envolvidos na virulência é um passo importante na identificação de métodos para aumentar a sua eficácia. Neste trabalho foi investigado pela técnica de RT-qPCR o nível de expressão relativa do gene cag8 (regulador da sinalização da proteína G) e do nrr1 (regulador da resposta ao nitrogênio) durante a germinação, conidiogenese e em diferentes fases de patogênese de M. anisopliae var. anisopliae e de M. anisopliae var. acridum. A expressão relativa do gene pr1A (codificador da protease subtilisina) foi analisado em M. anisopliae var. anisopliae e em M. anisopliae var. acrdum durante o crescimento em diferentes meios de cultura e durante a patogênese. Em ambas as variedades, o gene cag8 foi reprimido durante a germinação e induzido durante a conidiogenese e patogênese, o gene nrr1 apresentou-se constitutivamente expresso durante a germinação, conidiogenese e patogênese e o gene pr1A foi induzido nos diferentes meios de cultura e induzido e reprimido durante as fases de patogênese. Considerando as diferenças entre as duas variedades, M. anisopliae var. anisopliae apresentou maior expressão em todos os genes analisados durante a patogênese, isso pode justificar o fato dessa linhagem ter apresentado maior potencial para o controle de Diatraea saccharalis no teste de patogenicidade demonstrando que M. anisopliae pode apresentar variações na ativação de genes ligados à virulência para determinados ambientes e hospedeiros
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Frequência e distribuição dos sorotipos da dengue circulantes no estado de Sergipe no primeiro semestre de 2016 / Frequency and distribution of dengue fever cases serotypes in 2016 at state of Sergipe - Brazil

Café, Lilian Pinheiro January 2016 (has links)
The diagnosis of dengue cases in Central Laboratories of Public Health (LACEN) of the country includes the research of NS1 protein and only in positive cases, diagnostic confirmation occurs by identifying the serotype. Data provided by the Epidemiological Surveillance of Sergipe revealed that the first half of 2016 all suspected cases that reached the LACEN / SE were negative on screening tests, even in the thirty-first epidemiological week of the same year, Sergipe has reached the seventh place in the racking of dengue cases in the Northeast region and the third in the Quick Survey Infestation Index by Aedes aegypti. This study aimed to identify the serotypes and the epidemiological profile of suspected dengue cases in the first half of 2016. The 437 suspected dengue patients from January to June of this year were registered in LACEN / SE. After exclusion criteria, 382 serum samples of these patients diagnosed and negative for dengue by ELISA NS1 Antigen Platelia kit method were analyzed by RT-PCR in real time on the multiplex system for confirmation of suspected cases of dengue. The distribution of patients according to epidemiological and demographic variables revealed that there was a predominance of cases in the south central region of the state and large Aracaju (53.5%) inferring the ease in access to outpatient and laboratory service in the region the most affected gender was female (62.8%) and the age group of highest incidence was 20-59 years (59.3%). The highest rate was in urban areas (84.9%) and the first three days of symptoms (63.9%) with higher sampling rate. The prevalence of dengue in cases initially presented as a suspect was 22.5% (86) distributed among serotypes DENV4 82.5% (71), DENV1 9.3% (8) and DENV3 8.1% (7). Compared to official data reported that there were no cases of dengue in the period, this study reveals the positive for dengue with cocirculation of three distinct serotypes being DEV4 the predominant. As also, reports the first evidence of the last ten years of DENV3 serotype circulating in the state. Data analysis enabled to view an underreporting of cases screened and thus suggest a reassessment of the methods used as diagnostic screening so that they can take control measures to the potential for severe disease in a population. / O diagnóstico de casos de dengue nos Laboratórios Centrais de Saúde Pública (LACEN) do país contempla a pesquisa da proteína NS1 e, somente em casos positivos, a confirmação diagnóstica ocorre pela identificação do sorotipo. Dados disponibilizados pela Vigilância epidemiológica de Sergipe revelaram que no primeiro semestre de 2016 todos os casos suspeitos que chegaram ao LACEN/SE foram considerados negativos nos testes de triagem, ainda que na trigésima primeira semana epidemiológica do mesmo ano, Sergipe tenha alcançado o sétimo lugar no racking de casos de dengue da região Nordeste e o terceiro no Levantamento Rápido do Índice de Infestação por Aedes aegypti. O presente trabalho teve como objetivo conhecer da dengue no estado de Sergipe no primeiro semestre de 2016 relacionando-os com alguns parâmetros epidemiológicos. Os 437 pacientes suspeitos de dengue, de janeiro a junho do presente ano, foram cadastrados no LACEN/SE. Após critérios de exclusão, 382 amostras séricas destes pacientes com diagnóstico e resultado negativo para dengue através da metodologia ELISA NS1 Antígeno do kit Platelia foram analisadas pela técnica de RT-PCR em tempo real no sistema multiplex para a confirmação dos casos suspeitos de dengue. A distribuição dos pacientes de acordo com as variáveis epidemiológicas e demográficas revelou que houve predominância dos casos na região centro-sul do estado e da grande Aracaju (53,5%) podendo-se inferir a facilidade no acesso ao atendimento ambulatorial e laboratorial nessa região, o gênero mais acometido foi o feminino (62,8%) e a faixa etária de maior incidência foi 20 a 59 anos (59,3%). A maior frequência foi na zona urbana (84,9%) e os três primeiros dias dos sintomas (63,9%) com maior índice de coletas. A incidência de dengue nos casos que incialmente se apresentaram como suspeita foi de 22,5% (86) distribuídas entre os sorotipos DENV4 82,5% (71), DENV1 9,3% (8) e DENV3 8,1% (7). Em comparação aos dados oficias que informavam que não houve casos de dengue no referido período, este estudo revela a positividade para dengue com co-circulação de três sorotipos distintos sendo o DENV4 o predominante. Ademias, relata a primeira evidência, dos últimos dez anos, de circulação do sorotipo DENV3 no estado. A análise dos dados permitiu visualizar uma subnotificação dos casos triados e, assim, sugerir uma reavaliação dos métodos utilizados como triagem diagnóstica para que se possam tomar medidas de controle para riscos potenciais de formas graves da doença numa população. / Lagarto, SE
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Analise dos niveis de expressão dos membros da familia HOX de genes homeobox localizados nos loci B e C em mucosa oral normal e carcinoma espinocelular oral / Expression of HOX homeobox genes of loci B and C in cell lines and oral tissues from normal mucosa and squamous cell carcinoma

Destro, Maria Fernanda de Sousa Setubal 25 April 2008 (has links)
Orientador: Ricardo Della Coletta / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-11T04:25:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Destro_MariaFernandadeSousaSetubal_M.pdf: 4049997 bytes, checksum: c65b11d1e2e17169065f897077fbfb75 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: Genes homeobox transcrevem fatores de transcrição com participação importante na organogênese através do controle da proliferação e diferenciação celular. Dentre estes genes destacam-se os membros da família HOX de genes homeobox, os quais estão envolvidos em processos celulares cruciais como controle do ciclo celular, diferenciação e apoptose. Os genes HOX estão relacionados com o surgimento de diferentes tipos de neoplasias, incluindo cânceres de mama, ovário, próstata, rins, pulmão, pele e leucemias. Na cavidade oral a participação destes genes é desconhecida. O objetivo deste estudo foi comparar os níveis de expressão dos membros da família HOX de genes homeobox dos loci B e C entre amostras orais de mucosa normal e carcinoma espinocelular (CEC). Para a realização deste trabalho, amostras de mucosa oral normal de pacientes não expostos aos principais fatores de risco para o câncer oral (hábito de fumar e consumir bebidas alcoólicas) e amostras orais de mucosa normal e CEC provenientes do mesmo paciente foram submetidos a ensaios semi-quantitativos de transcriptase reversa-reação em cadeia da polimerase (RT-PCR) ¿duplex¿, utilizando-se primers para o gene controle GAPDH e primers específicos para cada um dos membros dos loci B e C. Em adição, os níveis de expressão destes genes foram analisados em uma linhagem de queratinócito normal (HaCAT) e em 4 linhagens celulares derivadas de CEC oral. As linhagens celulares de CEC oral expressaram todos os membros do loci C, sendo que os genes HOXC4, HOXC5 e HOXC6 apresentaram maiores níveis de expressão quando comparado com a linhagem HaCAT. HOXB13 foi expresso por todas as linhagens celulares de CEC oral. Os genes HOXB1, HOXB3, HOXB5, HOXB8 e HOXC12 não foram expressos por nenhuma das amostras de mucosa oral normal, independente da origem, e de CEC oral. O padrão de expressão dos genes HOX foi muito similar entre os dois grupos de mucosa oral normal. As expressões dos membros HOXB7, HOXC4, HOXC5, HOXC6, HOXC8, HOXC9, HOXC10 e HOXC11 foram significantemente maiores nas amostras de CEC oral comparado com amostras de mucosa oral normal. Os níveis de expressão dos membros HOXB2 e HOXC13 foram significantemente maiores nas amostras de CEC oral quando comparado com os níveis de expressão encontrados nas amostras de mucosa normal de pacientes livres de fatores de risco. Estes resultados sugerem que a expressão alterada de alguns membros da família HOX de genes homeobox pode estar associada com o desenvolvimento e/ou progressão do CEC oral / Abstract: Homeobox genes encode transcription factors with an important role during normal development by controlling cellular proliferation and differentiation. Among those genes, the HOX family is involved in crucial biological processes such as the control of the cell cycle, differentiation and apoptosis. HOX genes are related to many cancers, including those of the breast, ovary, prostate, kidney, lung, skin and leukemias. In the oral cavity, the role of those genes is unclear. The aim of this study was to compare the expression levels of HOX genes from loci B and C between normal oral mucosa and oral squamous cell carcinoma (SCC). Samples of normal oral mucosa and oral SCC obtained from the same patient, and samples of normal oral mucosa from patients without history of exposition to risk factors related to oral SCC (smoking habit and alcohol consumption) were analyzed by semi-quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) duplex method with specific primers for the control gene GAPDH and for each of the HOXB and HOXC members. Additionally, we analyzed the expression profile of those genes in a normal keratinocyte cell line (HaCAT) and 4 oral SCC cell lines. Oral SCC cell lines expressed all members of the locus C, and the expression of HOXC4, HOXC5 and HOXC6 was higher in those cell lines compared with HaCAT. Only HOXB13 was expressed for all oral SCC cell lines. None of the normal oral mucosa and oral SCC samples expressed HOXB1, HOXB3, HOXB5, HOXB8 and HOXC12. The HOX expression profile of the 2 groups of normal oral mucosa was quite similar. Regardless of the oral normal mucosa source, the expression of HOXB7, HOXC4, HOXC5, HOXC6, HOXC8, HOXC9, HOXC10 and HOXC11 was statistically higher in oral SCC samples. HOXB2 and HOXC13 were significantly overexpressed in oral SCC when compared with normal oral mucosa from patients without risk factors related to oral SCC. These results suggest that a dysregulated expression of HOX genes from clusters B and C may be related to the tumorigenesis and/or tumor progression of oral SCCs / Mestrado / Patologia / Mestre em Estomatopatologia
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Encefalomielite na cinomose canina : estudo prospectivo dos achados clinicos, histologicos e da RT-PCR / Encephalomyelitis in canine distemper : prospective study of clinical, histological and RT-PCR findings

Scarpelli, Edson Martins 11 August 2018 (has links)
Orientador: Maria Leticia Cintra / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-11T19:11:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Scarpelli_EdsonMartins_M.pdf: 3928334 bytes, checksum: 3ef78d4f7a3f4ec5c95969a5e584a0e9 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: A cinomose canina (CC) é uma doença viral sistêmica de carnívoros, cujo diagnóstico é embasado em sinais neurológicos e extra-neurais. A desmielinização que ocorre nesta doença assemelha-se à das doenças desmielinizantes humanas, o que a torna um modelo animal para estudo de doenças neurodegenerativas humanas. Lesões iniciais do SNC caracterizam-se por desmielinização sem considerável inflamação e lesões tardias por um processo inflamatório crônico. Vários métodos são empregados para o diagnóstico da CC, destacando-se a RT-PCR como precisa e sensível. Estudar, prospectivamente, os achados clínicos e histopatológicos do cérebro de 49 cães com cinomose diagnosticada clinicamente, e confrontá-los com os resultados da RT-PCR foi o nosso objetivo. A presença de sinais neurológicos foi significante para o diagnóstico da doença, especialmente a mioclonia e ataxia. O comprometimento inflamatório era significante no cerebelo, hipocampo e diencéfalo sendo que a reação inflamatória era maior no diencéfalo. Quanto maior o peso cerebral, menor era a desmielinização. Nos animais na fase clínica aguda, a freqüência de desmielinização cerebelar foi maior. Foi significante a localização linização, mas, também, havia forte comprometimento cortical, embasando os comemorativos clínicos. A pesquisa do vírus da CC pela RT-PCR foi negativa em 34% dos animais doentes; 88% deles encontravam-se na fase crônica, onde o vírus esta praticamente ausente. Em todos os cães sadios, a RT-PCR resultou positiva, provavelmente por vacinação ou doença prévia. Nossos achados ressaltam a importância da avaliação clínica para o diagnóstico da CC e dos achados anatomopatológicos respaldando a clínica / Abstract: Introduction: canine distemper (CD) is a carnivores viral systemic disease whose clinical diagnosis is based on neurological and extra neural signs. The CD demyelination resembles those of human demyelinating diseases; therefore it becomes an animal model for human neurodegenerative diseases study. Central nervous system (CNS) initial lesions are characterized by demyelination with no considerable inflammation and late lesions by a chronic inflammatory process. Several methods are used for the diagnosis of CD; and RT-PCR stands out for being precise and sensitive. Purpose: to study, prospectively, clinical and histopathologic signs of 49 dogs' brains with distemper clinically diagnosed, and compare them to RT-PCR results. Results and Conclusions: the presence of neurological signs was significant for the diagnosis of the disease, especially myoclonus and ataxia. The inflammatory reaction was significant in the cerebellum, the hippocampus and the diencephalons; the inflammatory reaction was larger in the diencephalon. The higher the cerebral weight the lowest the demyelination. In animals on the acute clinical form, the demyelination frequency in the cerebellum was higher. Cerebellum and diencephalons localization in the demyelination was significant, but there was also strong cortical compromising, embasing clinical observations. RT-PCR for CD virus tested negative in 34% of the sick animals; 88% of them were in the chronic phase, in which the virus is practically non-existent. In all healthy dogs, RT-PCR resulted positive, probably due to vaccination or previous disease. Our findings stress the importance of clinical evaluation for CD diagnosis and histopathological examination supporting clinical findings / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Ciências Médicas
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Expressão gênica no baço associada ao mecanismo de resistência a coccidiose em Gallus gallus

ALMEIDA, Erik Amazonas de 31 January 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:02:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo9512_1.pdf: 2655908 bytes, checksum: b137ac1305ca5bc02534e3f38e5c8db1 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2012 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A avicultura brasileira gera grandes divisas para o país e fornece alimento a baixo custo para a população. Entretanto, os problemas sanitários que acometem a indústria avícola afetam todo o sistema produtivo, podendo acarretar perdas no mercado mundial ou elevação dos preços do produto final. Dentre as enfermidades mais frequentes na avicultura mundial e brasileira está a coccidiose, causada por diferentes espécies de protozoários do gênero Eimeria spp., sendo E. maxima, E. acervulina e E. tenella os agentes causadores mais comuns. Este estudo avaliou a expressão gênica em resposta à infecção por E. tenella no baço de três linhagens de galinhas: uma selecionada para altas taxas de crescimento e desenvolvimento muscular (TT), outra selecionada para altas taxas de fertilidade e postura de ovos (CC), e uma terceira linhagem não selecionada geneticamente (CCc), um controle genético de CC. As duas linhagens selecionadas (TT e CC) apresentaram, em estudo anterior, diferenças na resistência/susceptibilidade à coccidiose. As aves foram inoculadas com E. tenella e seus tecidos foram colhidos aos dias 0 (pré-infecção), 2, 6 e 9 pós-infecção. O perfil de expressão gênica no baço das aves foi avaliado por meio de microarranjos de DNA contendo 13.000 pontos de genes impressos, oriundos de tecido linfóide de aves. RT-PCR quantitativo em tempo real foi realizado para avaliar o perfil de expressão de NK-lisina uma citocina produzida por linfócitos T e células natural killer, e responsável pelo recrutamento e ativação de outras citocinas e células de defesa. O estudo de microarranjos revelou importantes conjuntos de genes diferencialmente expressos entre as linhagens. Aves da linhagem mais resistente CC apresentaram um padrão de expressão de genes que codificam imunoglobulinas e citocinas maior do que os animais TT. Dentre esses genes, encontram-se galinacina, uma &#946;-defensina de aves, e IRF-10. Ambas atuam no combate a patógenos intracelulares. Já a linhagem TT apresentou maior expressão de IL1-F5, uma citocina antagônica de IL-1, que atua inibindo NF-&#954;B, um fator importante na diferenciação de linfócitos e estímulo de IRF10 e IFN-&#947;. Entre as linhagens que compartilham uma maior proximidade genética, CC e CCc, as diferenças foram quantitativa e qualitativamente mais sutis. Consistente com esse padrão, os níveis de expressão de NK-lisina foram maiores na linhagem CC durante o período pré-infecção. Já no segundo dia após a infecção, TT mostrou uma expressão muito superior a CC e CCc, possivelmente devido à sua inabilidade em prontamente combater a doença. Ao avançar da infecção, a expressão gênica foi homogênea entre as linhagens. É possível que a seleção genética para características de postura possa ter favorecido a expressão basal de genes envolvidos com defesa celular, promovendo maior condição de resistência a doenças aos animais
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Role of misfolded prion protein in neurodegeneration

Alibhai, James David January 2015 (has links)
Chronic neurodegenerative diseases, such as Alzheimer’s disease, prion diseases and many others are unified by the aberrant folding of a host encoded protein to a disease-associated isoform and the predictable cell-to-cell spread of disease-associated misfolded proteins via a putative prion-like mechanism. Prion diseases, for example, are associated with the aberrant folding of host encoded prion protein (PrPC) to a disease-associated isoform, which acts as a seed for the further conversion of PrPC to misfolded protein species. The role of misfolded prion protein in neurodegeneration remains unclear. Accumulation and spread of misfolded prion protein is typically slow and progressive, correlating with neurodegeneration. A number of studies show that mice are susceptible to prion disease with characteristic hallmarks of prion pathology but in the presence of little detectable misfolded prion protein (e.g. the GSS/101LL model). In this thesis I test the hypothesis that detectable species of misfolded prion protein correlate with neurodegeneration and spreads in a predictable, progressive fashion from one anatomically distinct brain region to the next. Using the GSS/101LL model, misfolded prion protein was detected as mostly PK-sensitive isoforms (PrPsen). The progression and pathological presentation is comparable to other prion diseases with larger quantities of PK resistant prion isoforms. A highly sensitive in vitro assay system (the QuIC assay) was subsequently used to establish the extent that misfolded protein was present within the brain. Amyloidogenic prion seeds were found to be widespread throughout the brain from an early stage and spread rapidly throughout the brain. Absence of neurodegeneration in certain brain regions is not due to differing quantities of prion seeds between regions or time exposed to prion seeds, as unaffected regions are exposed to comparative quantities of prion seeds for the same time-period as regions of the brain which eventually succumb to neurodegeneration. These results indicate a clear dissociation between prion seeds and neurotoxicity. They highlight the need to understand regional host responses to prion seeds that may evoke neurodegeneration in some but resilience in others. To test this, transcriptomic analysis was carried out on brain samples from regions undergoing neurodegeneration and unaffected regions. A gene profile signature of hybrid pro-and anti-inflammatory response was observed in regions undergoing neurodegeneration. However, large cohorts of genes were down-regulated across all regions tested, including pro-inflammatory genes and a large proportion of genes involved within transcriptional and translational regulation and function. These results highlight the possible molecular pathways in response to the presence of misfolded protein. In summary, misfolded prion protein accumulates rapidly across the CNS but only specific brain regions undergo neurodegeneration. In the presence of the misfolded protein, the host elicits a robust molecular response. The additional activation of glial cells within regions undergoing neurodegeneration highlights their importance in disease. It is therefore proposed that misfolded prion protein, alone, is not sufficient to trigger neurodegeneration. This gives rise to a “multi-hit” hypothesis whereby two or more factors, for example the accumulation of misfolded protein and glial cell response, are required to trigger neurodegeneration.

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