Spelling suggestions: "subject:"deação dda cadeia dda polimerase"" "subject:"deação dda cadeia daa polimerase""
361 |
Investigação da presença de Leishmania em lesões cutâneas cicatrizadas e pele sadia de pacientes com Leishmaniose tegumentar americana clinicamente curadosPaula, Cíntia Cristiane de January 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-11T12:37:21Z (GMT). No. of bitstreams: 4
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
cintia_paula_ipec_mest_2013.pdf: 1050545 bytes, checksum: 214327e202e5f77522b5e0c404d3b245 (MD5)
cintia_paula_ipec_mest_2013.pdf.txt: 135213 bytes, checksum: 5eb01e27d296b3812060dc1731d17b03 (MD5)
cintia_paula_ipec_mest_2013.pdf.jpg: 1359 bytes, checksum: cdb43a52a4259c711a5d91bfbc82d127 (MD5)
Previous issue date: 2013-11-21 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A Leishmaniose Tegumentar Americana (LTA) é uma doença endêmica, causada por diferentes espécies de Leishmania e distribuída por todos os estados brasileiros. No entanto, não estão estabelecidos os critérios de cura clínica definitiva, nem a participação da resposta imunológica na manutenção do estado de cura, na reativação de lesões e no desenvolvimento da forma mucosa. A persistência parasitária após a cura clínica, já demonstrada anteriormente, poderia estar relacionada a estes fenômenos. Este estudo objetivou identificar DNA de Leishmania e a presença de parasitas através do cultivo, do exame direto e do exame histopatológico, em cicatrizes cutâneas e em pele sadia de pacientes com LTA tratados e clinicamente curados. Cinquenta pacientes com LTA e 30 com esporotricose (grupo controle) foram submetidos a avaliação dermatológica, avaliação otorrinolaringológica com fibra óptica, intradermorreação de Montenegro (IDRM), e sorologia para leishmaniose por ensaio imunoenzimático indireto (ELISA) e por reação de imunofluorescência indireta (RIFI)
Após consentimento livre e esclarecido, fragmentos de cicatriz e de pele sadia foram obtidos por biópsia, com o auxílio de "punch" 6mm. O tempo mediano decorrido entre a cicatrização da lesão e entrada no projeto foi de 25 (LTA) e 46 meses (controle) respectivamente. Os fragmentos teciduais, cujo peso mediano foi de 7,1mg, foram subdivididos em pequenas amostras submetidas à: a) extração de DNA e amplificação genérica e subgenérica por reação em cadeia da polimerase (PCR) com revelação em gel de agarose dos produtos amplificados; b) isolamento de formas promastigotas em meio de cultura bifásico (NNN enriquecido com meio Schneider e soro fetal bovino); c) investigação de formas amastigotas por exame direto corado pelo Giemsa; e d) exame histopatológico. Todos os pacientes encontravam-se clinicamente curados, com lesões cutâneas cicatrizadas e sem lesões mucosas em atividade. A IDRM foi positiva em 88% dos pacientes, a sorologia por ELISA em 44% e a RIFI em 26%. Foram encontradas duas amostras de cicatriz cutânea positivas para Leishmania, uma na PCR e outra no "imprint", ambas do grupo de LTA. As demais amostras de cicatriz e de pele sadia foram negativas
Os presentes resultados confirmam achados anteriores que Leishmania pode persistir em lesões cicatrizadas. A negatividade para Leishmania nas amostras de pele sadia não apóia a hipótese do ser humano como fonte de infecção. A baixa frequência de positividade encontrada nas cicatrizes pode ser parcialmente explicada pela realização das biópsias no bordo da cicatriz, região por onde se inicia o processo de cicatrização durante o tratamento, pelo tamanho diminuto dos fragmentos cutâneos estudados e pela baixa carga parasitária / American Cutaneous Leishmaniasis (ACL) is an
endemic disease caused by different species
of Leishmania
and distributed in all Brazilian states. However, there are neither established
criteria for definitive clinical cure, nor on the immune response participation in the
maintenance of the state of cu
re, in the reactivation of the lesions, and in the development of
the mucosal form. The parasite persistence after clinical cure, previously demonstrated, could
be related to these phenomena. This study aimed to identify
Leishmania
DNA and the
presence of
parasites through cultivation, direct examination and histopathology studies on
skin scars and healthy skin of patients with ACL treated and clinically cured. Fifty patients
with ACL and 30 with
s
porotrichosis (control group) underwent dermatologic assessm
ent,
EENT fiber optics evaluation, Montenegro skin test (MST), and leishmaniasis serology by
enzyme immunoassay (ELISA) and indirect immunofluorescence assay (IFA). After informed
consent, fragments of scarred and healthy skin were obtained by punch 6 mm b
iopsy. The
median time
between the
healing
of the lesion and study entry
was 25
(ACL)
and 46 months
(control)
respectively.
The tissue samples, whose average weight was 7.1 mg, were further
divided into small samples submitted to: a) DNA extraction and gen
eric and subgeneric
amplification by polymerase chain reaction (PCR) with in agarose gel revelation of amplified
products, b) isolation of promastigotes in biphasic medium (NNN medium enriched with fetal
calf serum in Schneider media), c) investigation of
amastigotes forms by Giemsa
-
stained
direct examination, and d) histopathological studies. All patients were clinically cured, with
healed skin lesions and no mucosal lesions in activity. The MST was positive in 88% of
patients, ELISA serology in 44% and IF
AT in 26%. Two cutaneous scarring samples were
found positive for
Leishmania
, one by PCR and one in the "imprint"
, both ACL group
.
Additional samples of scarred and healthy skin were negative. The present results confirm
earlier findings that
Leishmania
ma
y persist in healed lesions.
The samples negative for
Leishmania in the healthy skin does not support the hypothesis of human beings as a source of
infection.
The low frequency of positivity found in the scarred tissues may be partially
explained by the pe
rformance of biopsies at the edge of the scarred region, where the healing
process begins during treatment, and the extremely small size of the skin fragments studied
and low parasite load
|
362 |
Análise molecular de vírus da raiva circulante no Estado do Rio de Janeiro entre 1999 e 2004 / The genetic analysis of circulating rabies virus in Rio de Janeiro state between 1994 and 2004Dantas Junior, Joeler Vargas January 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-26T17:15:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
136.pdf: 882256 bytes, checksum: 9ae92b0a5f442228c4bb16e69b70145b (MD5)
Previous issue date: 2006 / Neste estudo foram utilizadas 70 amostras de tecido encefálico congelado de animais,com o diagnóstico positivo para vírus da raiva pela imunofluorescência direta (IFD) e pelo teste biológico (TB), enviados ao Banco de Germoplasma do Laboratório de Biologia Animal (LBA)da Empresa de Pesquisa Agropecuária do Estado do Rio de Janeiro (PESAGRO RIO). Estas amostras foram provenientes de diversos municípios do estado do Rio de Janeiro. Das 70 amostras analisadas 50 foram utilizadas para testar um protocolo de RT-PCR e 33 utilizadas naanálise genética do vírus da raiva circulantes no estado do Rio de Janeiro.O protocolo testado de amplificação genômica, precedida de transcrição reversa (RTPCR)para o gene da nucleoproteína de vírus da raiva e vírus relacionados ao vírus da raiva, teve como objetivo a utilização desta metodologia em laboratórios onde são realizadas investigações para a detecção de vírus da raiva. Foram utilizadas 50 amostras de tecido encefálico de animais (44 bovinos, 5 eqüinos e 1 quiróptero). Nas 50 amostras analisadas pela RT-PCR se observou os amplicons de 606 pb, correspondendo a região da nucleoproteína (N) investigada e demonstraram a especificidade do protocolo. Houve concordância nas três provas de diagnósticas utilizadas. Uma amostra negativa na prova de imunofluorescência direta, apresentou positividade tanto na prova biológica e quanto na RT-PCR. Trinta e três amostras isoladas de 27 bovinos, 05 eqüinos e 01 quiróptero, foram analisadas com base no seqüenciamento direto de amplicons de 514 pb da região codificadora danucleoproteína (N). As seqüências foram verificadas quanto ao seu parentesco genético e evolucionário. Os dados indicam que não existem diferenças genéticas significativas entre as amostras isoladas de diferentes hospedeiros e regiões geográficas do estado do Rio de Janeiro, durante os últimos seis anos. Os resultados indicam, provavelmente, que a variabilidade observada ocorre em virtude de modificações sinônimas. Apesar da estabilidade genética do gene da nucleoproteína (N) é importante um continuo esforço de monitoração da diversidade dos genes das amostras de campo de vírus da raiva, pois modificações genéticas podem acarretar eventuais falhas vacinais. / In this study were used 70 samples of animal frozen encephalic tissue, with positive diagnosis for Rabies Virus by Direct Immunofluorescence (DIF) and by biological test, sent to Germoplasm Bank of Animal Biology Laboratory (ABL) belonged to the Empresa de Pesquisa Agropecuária do Estado do Rio de Janeiro (PESAGRO – RIO). These samples were provenient of many countys of Rio de Janeiro State. From 70 analyzed samples, 50 were used to test an RT-PCR protocol and 33 were used in the genetic analysis of circulating Rabies Virus in Rio de Janeiro State. The genomic amplification preceded of Reverse Transcription (RT-PCR) protocol tested for the Rabies Virus and Rabies related viruses nucleoprotein gene had as purpose the use of this methodology in laboratories where are made investigations for the detection of Rabies Virus. A total of 50 samples of animal encephalic tissue were used (44 cattle, 05 horses and 01 bat). In the 50 samples analysed by RT-PCR was observed amplicons of 606 bp, corresponding to the investigated nucleoprotein region and showing the protocol specificity. There was an agreement in the three diagnostic probes used. One sample, negative for the direct immunofluorescence, presented positivity for both biological probe and RT-PCR. A total of 33 samples isolated of 27 cattle, 05 horses and 01 bat were analyzed based on the direct sequencing of the 514 bp amplicons, provenient of the nucleoprotein (N) coding region. The sequences had their genetic and evolutionary relationship studied. Data indicate that there are no significant genetic differences among the samples isolated from different hosts and geographic regions of Rio de Janeiro State, during the last six years. The results indicate, probably, that the observed variability occur due to synonymous modifications. Although the genetic stability of the nucleoprotein (N) gene is important, a continuous effort in monitoring of the countryside Rabies Virus samples genes, because genetic modifications may cause eventual vaccine-failure.
|
363 |
Caracterização taxonômica e susceptibilidade a antifúngicos de leveduras isoladas de infecção hospitalar / Taxinomical characterization and antifungal susceptibility of yeasts isolated from hospital infectionNeufeld, Paulo Murillo January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-26T17:15:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
86.pdf: 4313185 bytes, checksum: 841992629bd3bcc0ae5285c8796f0995 (MD5)
Previous issue date: 2009 / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Farmácia, Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Infecções invasivas são um problema crescente em hospitais terciários no Brasil e no mundo. Dentre os diversos agentes etiológicos encontrados no ambiente hospitalar, o gênero Candida tem sido o terceiro ou quarto patógeno mais isolado. De maneira geral, infecções fúngicas invasivas estão associadas a altas taxas de morbidade e mortalidade, dificuldades de diagnóstico, resistência a antimicrobianos, extensão do tempo de internação e aumento dos custos hospitalares. O presente trabalho objetivou avaliar o desempenho de métodos fenotípicos e moleculares na identificação de espécies de Candida recuperadas de casos de infecção hospitalar e descrever seus perfis de susceptibilidade a drogas antifúngicas através de metodologias de referência e comerciais. Para tanto, 113 isolados clínicos (108 Candida spp., 2 Rhodotorula glutinis e 1Trichosporon sp.) de 100 pacientes hospitalizados no estado do Rio de Janeiro foram submetidos a provas em CHROMagar, do tubo germinativo e do clamidósporo, análises bioquímicas em aparelho VITEK e identificação molecular por multiplex-PCR. A susceptibilidade ao fluconazol, itraconazol e anfotericina B foi avaliada conjuntamente pelos métodos de difusão em ágar (CLSI/M44-A e CECON) e microdiluição em caldo (CLSI/M27-A2 e EUCAST/E.Dis.7.1) conforme os protocolos de referência do CLSI e EUCAST, bem como pelas instruções do fabricante do método comercial CECON. Com relação às características demográficas dos pacientes, 47% eram do sexo masculino e 37% do sexo feminino, a maioria se encontrava na faixa de 0-20 anos (33%) e as leucemias foram os principais processos de base (20%). Candida albicans (41,5%), C. parapsilosis (29,2%), C. guilliermondii (10,6%) e C. tropicalis (9,7%) foram as espécies mais isoladas, considerando a totalidade dos espécimens clínicos. Em cultura de sangue, C. albicans (38,4%) também foi preponderante. A identificação cromogênica mostrou 100% de sensibilidade e especificidade para C. albicans, C. tropicalis e C. krusei. As provas do tubo germinativo e do clamidósporo para identificação de C. albicans apresentaram 89,4% de sensibilidade e 100% de especificidade. Os testes bioquímicos permitiram a detecção correta e completa de 78,8% dos isolados. A multiplex-PCR identificou adequadamente todas as espécies para os quais primers tinham sido desenhados. Alta taxas (≥92,9%) de susceptibilidade aos 3 antifúngicos testados foram observadas em todas as metodologias empregadas. Resistência foi verificada apenas em C. krusei e Rhodotorula glutinis frente ao fluconazol. No entanto, concentrações inibitórias mínimas (CIM) mais elevadas foram, igualmente, encontradas em itraconazol. O cálculo do coeficiente de correlação intraclasse (CCI) demonstrou alta correlação (0,88-0,97) entre todos os métodos utilizados para avaliação das susceptibilidades aos antifúngicos. Os resultados apresentados demonstraram que C. albicans foi a espécie mais prevalente e também que, depois de C. albicans, C. glabrata, C. krusei e C. lambica foram as espécies menos susceptíveis aos antifúngicos azólicos. Além disto, o CHROMagar e a multiplex-PCR foram os mais efetivos na identificação preliminar e na identificação definitiva dos isolados clínicos, respectivamente. As metodologias de difusão em ágar e microdiluição em caldo foram também efetivas tanto na triagem quanto na confirmação das susceptibilidades. / Invasive infections are a increasing problem in tertiary care hospital in the Brazil and in the world. The predominant etiologic agents in the nosocomial environment include the genus Candida that is the third ou fourth most common isolate. In generaly, invasive fungal infections are associated with high morbidity and mortality, difficulties in the diagnosis, acquisition of resistance, prolonged hospital stay, and high hospitalar costs. The aim of the present work was to evaluate the performance of phenotypic and molecular methods in the identification of Candida spp. isolated from nosocomial infection cases as well as to describe their antifungal drug susceptibility profliles by reference and commercial methodologies. For this, 113 clinical isolates (108 Candida spp., 1 Rhodotorula glutinis, 1 Trichosporon sp.) from 100 hospitalized patients in the Rio de Janeiro state were submmited to CHROMagar, germ tube and chlamydospore testing, biochemistry analysis in VITEK equipament, and molecular identification by multiplex-PCR. The susceptibility to fluconazole, itraconazol, and amphotericin B was evaluated by disk-diffusion method (CLSI/M44-A, CECON) and broth microdilution method (CLS/M27-A2, EUCAST/E.Dis.7.1.) according to the CLSI and EUCAST reference protocols and the manufacturer’s instructions, in case of CECON. Relatively of the demographic patient characteristics, 47% were male, 37% were female, the majority was between 0-20 years (33%), and leukemias were the main base diseases (20%). Candida albicans (41,5%), C. parapsilosis (29,2%), C. guilliermondii (10,6%) e C. tropicalis (9,7%) were the most frequently isolated Candida species from all clinical specimens. In hemoculture C. albicans (38,4%) was prevalent. The chromogenic identification showed susceptibility and specificity of 100% to C. albicans, C. tropicalis, and C. krusei. The germ tube and chlamydospore formation to C. albicans identification presented sensibility of 89,4% and specificity of 100%. The biochemistry tests were capable to correct and complete detection of 78% of the isolates. All Candida species could be accuracely identified by using the designed species-specific primers by multiplex-PCR analysis. High rates (≥92,9%) of susceptibility to 3 antifungal drug tested were verified for all methodologies. Resistance was found only in C. krusei and Rhodotorula glutinis to fluconazole. However high minimum inhibitory concentrations (MIC) were found to itraconazole as well. The intraclass correlation coefficient (ICC) showed high correlation (0,88-0,97) between all methods used to antifungal susceptibility evaluation. The results demonstrated that C. albicans was the most predominant specie, and also that after C. albicans, C. glabrata, C. krusei and C. lambica were the less susceptibility to azoles drug. Besides this, CHROMagar and multiplex-PCR were more effective in the preliminar and definitive identification of clinical isolates, respectively. The disk-diffusion and broth microdilution methods were effective to screening and confirm the susceptibilities.
|
364 |
Estudo da quantificação de soja geneticamente modificada em alimentos pela técnica da reação em cadeia pela polimerase em tempo real: desenvolvimento de método evento específico / Quantitative evaluation of genetically modified soya in food by real-time polymerase chain reaction: development of an event-specific methodBranquinho, Maria Regina January 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-09-09T12:30:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
78.pdf: 966313 bytes, checksum: c413bb917dd566382f90432606995490 (MD5)
Previous issue date: 2010 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / A técnica de PCR em Tempo Real é uma poderosa ferramenta de quantificação de OGM em alimentos, mas ainda é muito influenciada por fatores como amostragem, eficiência daextração do DNA, presença de substâncias inibidoras da reação de PCR, pelo nível de degradação do DNA e pelo próprio genoma vegetal. Atualmente, a quantificação de soja GM está relativamente limitada ao uso de kits sendo um dos mais utilizados, o que tem como sequência alvo o promotor p35S. A quantificação de soja RR em matrizes complexas que possam conter esse elemento genético oriundo de outros vegetais pode resultar em falso positivos ou em níveis superestimados de OGM. O desenvolvimento de métodos evento específicos visa à quantificação dessas matrizes com maior confiabilidade. Este trabalho teve como objetivos principais o desenvolvimento de um método evento específico que tem com alvo a região de integração do p35S e o genoma da soja; a avaliação de alguns indicadores de desempenho e quantificação de duas matrizes com o método desenvolvido; a avaliação do desempenho do kit TaqMan GMO 35S Soy Detection que tem como alvo o p35S, utilizado na rotina; a determinação do conteúdo de OGM em alimentos processsados pelo kit; e a avaliação do efeito de dois protocolos de extração de DNA na reação de PCR em tempo real. Os resultados mostraram que tanto o método de extração pelo CTAB como o kit DNeasy® (Qiagen) foram eficientes na extração de DNA das amostras de diferentes graus de processamento e que as análises comparativas das curvas analíticas da amplificação da lectina e do p35S não revelaram influência significativa dos métodos de extração na eficiência da PCR em tempo real. Os parâmetros de desempenho do kit de quantificação demonstraram linearidade, eficiência e sensibilidade e LOD em torno de 0,0125% e LOQ de 0,05%. / Real-Time PCR is a powerful tool for GMO quantification in food, but is influenced by factors such as sampling, DNA extraction methods, presence of PCR inhibitors, the degree of DNA degradation and by the plant genome. Currently, the quantification of GM soybean is relatively limited to the use of kits and one of the most used has as target sequence the promoter p35S. The quantification of RR soy in complex matrices that may contain this genetic element originated from other plants may result in false positives or overestimated levels of GMOs. The development of methods event specific aims at quantifying these matrices reliably. This work had as main goals the development of an event specific method targeting the p35S integration region/soybean genome; the evaluation of some performance criteria and quantification of some matrices using the developed method; the performance evaluation of the "TaqMan® GMO 35S Soy Detection kit”, targeting the p35S, used in the routine; the determination of the GMO content in foods using this kit; and the evaluation of the influence of two DNA extraction methods on the real time PCR. The results showed that either the extraction method by CTAB or DNeasy® kit (Qiagen) were efficient providing DNA from samples with different degree of processing, and the comparative analysis of lectin and p35S calibration curves did not reveal significant influence of the DNA extraction method on real time PCR efficiency. The performance criteria of the TaqMan® GMO 35S Soy Detection kit indicated linearity, efficiency and sensitivity, LOD around 0.0125% and LOQ of 0.05%. Analysis of food samples revealed GMO contents ranging from 0.05 to 1% in 63.2% and more than 1% in 36.8% of samples. The event specific method developed for the quantification of RR soybeans was linear, showed PCR efficiency ranging from 86% to 109%, accuracy in quantifying the number of copies of the MRC from 3.6% to 12.7%, and the Cts values were highly reproducible. The results of the quantification of GMO content in samples of biscuit, mixture of flours and MRC 0.5%, using the primers and probes designed, demonstrated accuracy of the developed method indicating that studies should be continued with other matrices with different contents of RR soy for further validation. This method will enable the differential quantification between RR soybeans and the two others events of soybeans tolerant to ammonium glifosinate herbicide, approved in Brazil, since the method used in INCQS is based on the amplification of p35S, used in the construction of these three events.
|
365 |
Estudo da freqüência de enterovírus associados a surtos e casos esporádicos de meningite viral ocorridos no Brasil, no período de dezembro de 1998 a dezembro de 2003, e análise do perfil dos pacientes / Frequency of occurence of enterovirus in both outbreaks and sporadic cases of viral meningitis occurred in Brazil during the period of December 1998 to December 2003 and patient profile analysisSantos, Gina Peres Lima dos January 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-07T19:33:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
151.pdf: 1034631 bytes, checksum: 4633720fcfb8cd5c7e25a06a27819fe0 (MD5)
Previous issue date: 2005 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Infecções virais agudas do Sistema Nervoso Central (SNC), como as meningites e encefalites, são responsáveis por uma elevada morbidade, especialmente em crianças. Os enterovírus não-polio (EVNP) são responsáveis por mais de 80 por cento dos casos de meningite viral em que o agente etiológico é identificado. No presente estudo nós mostramos a freqüência de ocorrência de enterovírus em surtos e casos esporádicos de meningite viral no Brasil no período de dezembro de 1998 a dezembro de 2003. Das 1022 amostras de Líquido Cefalorraquidiano (LCR) analisadas pelo Laboratório de Enterovírus -FIOCRUZ, 162 (162/1022 -15,85 por cento) apresentaram isolamento viral em culturas de células RD e/ou HEp2. Destas, 139 (139/163 -85,27 por cento) foram identificadas por sequenciamento genômico parcial como echovírus 30. Outros enterovírus identificados foram: coxsackievírus B5 (6/162- 3,70 por cento), echovírus 13 (6/162- 3,70 por cento), echovírus 18 (5/162- 3,08 por cento), echovírus 6 (2/162- 1,23 por cento), echovírus 25 (2/162- 1,23 por cento), echovírus 1 (1/162- 0,61 por cento) e echovírus 4 (1/162- 0,61 por cento). A idade dos pacientes variou de 28 dias de vida a 68 anos. Os sintomas mais frequentes foram febre (77,00 por cento), cefaléia (69,51 por cento), ânsia de vômito (71,30 por cento), rigidez na nuca (41,35 por cento), convulsão (7,13 por cento) e diarréia (3,74 por cento). Durante o período de estudo, cinco surtos de meningite viral foram identificados e confirmados, sendo três no estado do Paraná (sul do Brasil), um em Pemambuco (nordeste do Brasil) e um no Rio Grande do Sul (sul do Brasil). Echovirus 30 causou quatro dos cinco surtos, e echovírus 13 foi responsável pelo último surto. Além dos surtos, 734 casos esporádicos também foram identificados durante o período de estudo e 59 destes casos apresentaram isolamento viral (59/734 -8,03 por cento). Echovírus 30 foi responsável pela maioria destes casos esporádicos (42/59 -71,18 por cento). Este estudo chama a atenção para o echovírus 30 como o principal agente etiológico envolvido em casos esporádicos e em surtos de meningite viral ocorridos no Brasil durante o período de estudo. / Acute viral infections of the Central Nervous System (CNS), as meningitis and encephalitis, are responsible for a high morbidity, particularly in children. Non-polio enteroviruses (NPEV) are responsible for over 80% of viral meningitis in which the etiologic agent is identified. In the present study we show the frequency of occurrence of enteroviruses in both outbreaks and sporadic cases of viral meningitis occurred in Brazil during the period of December 1998 to December 2003. From 1022 samples of Cerebrospinal Fluid (CSF) analyzed at the Enterovirus Laboratory, FIOCRUZ, 162 162/1022 - 15,85%) were positive regarding viral isolation in RD and/or HEp2 cells. From this total, 139 (139/162 - 85,27%) were identified by partial genome sequencing as being echovirus 30. Other identified enteroviruses were: coxsackievirus B5 (6/162 – 3,70%), echovirus 13 (6/162 - 3,70%), echovirus 18 (5/162 - 3,08%), echovirus 6 (2/162 - 1,23%), echovirus 25 (2/162 - 1,23%), echovirus 1 (1/162 - 0,61%) and echovirus 4 (1/162 0,61%). The age of the patients ranged from 28 days to 68 years old. The most frequent symptoms were fever (77,00%), headache (69,51%), vomiting (71,30%), neck stiffness 41,35%), convulsion (7,13%) and diarrhea (3,74%). Throughout the surveillance period, ive viral meningitis outbreaks were identified and confirmed, being three at Paraná State southern Brazil), one at Pernambuco (northeast Brazil) and one at Rio Grande do Sul southern Brazil). Echovirus 30 caused four out of the five outbreaks, and echovirus 13 caused the last one. Besides the outbreaks, 734 sporadic clinical cases were also identified during the period of study and 59 of these were positive with regard viral isolation (59/734 8,03%). Echovirus 30 accounted for the majority of these sporadic cases (42/59 – 71,18%). This study calls the attention to the echovirus 30 as the most prevalent etiological agent involved in both sporadic cases and outbreaks of viral meningitis occurred in Brazil during the period of study.
|
366 |
Aplicação de metodologia de concentração viral para detecção de astrovírus em águas ambientais / Application of viral concentration methodology for astrovirus detection in environmental watersGuimarães, Flávia Ramos January 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-05T18:34:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
101.pdf: 12703986 bytes, checksum: b3d8bcb5c201aa863f8d9d57acdab347 (MD5)
Previous issue date: 2007 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / A utilização e a manutenção dos recursos hídricos são temas que apresentam uma importância crescente nas discussões mundiais, devido à preocupação com a futura escassez de água dentro dos padrões de qualidade aceitáveis para o consumo. Entre os maiores problemas na utilização da água, destaca-se a sua poluição por resíduos biológicos e químicos, tornando as águas contaminadas um importante meio de transmissão de várias doenças, entre estas, as gastroenterites de etiologia viral. Este estudo teve como objetivo implementar e analisar uma metodologia para concentração de astrovirus humano (HAstV) em águas ambientais, associada a métodos moleculares de detecção, caracterização e quantificação. Foi realizado um estudo experimental com amostras de diferentes matrizes aquáticas, incluindo água de rio, mar, consumo e esgoto (efluente e afluente) para avaliação da metodologia empregada e dois estudos de campo com um total de 100 amostras ambientais (48 provenientes de uma Estação de Tratamento de Esgoto [ETE] e 52 de água de rio). Foi utilizado o método de concentração por adsorção/eluição com membrana carregada negativamente seguido de ultrafiltração associada à detecção por reação em cadeia pela polimerase precedida da transcrição reversa (RT-PCR) e a quantificação pela PCR em tempo real quantitativa (qPCR). A caracterização molecular do vírus detectado foi realizada por sequenciamento parcial do genoma da segunda fase aberta de leitura. Experimentalmente, a taxa de recuperação variou de 2,4 por cento a 65 por cento entre os diferentes tipos de amostras de água. No estudo de campo, foram detectados 16 por cento de HAstV no total de amostras ambientais, 17,3 por cento em amostras de águas de igarapés e 16,7 por cento na ETE. Uma amostra de rio foi caracterizada como HAstV-1 [...] / The use and maintenance of water resources are issues that present increasing significance in world debates, due to concern with the future scarcity of water acceptable for consuming according to quality standards. Among the major problems of water use, the more important is the pollution by biological and chemical wastes, which makes contaminated water a significant transmission route of several diseases, as gastroenteritis of viral etiology. This study aimed to implement and analyze a methodology for human astrovirus (HAstV) concentration from environmental waters, associated with molecular methods of detection, characterization and quantification. An experimental research was performed with different aquatic sources samples, including river water, seawater, potable water and sewage (inflow and outflow) to evaluate the methodology used, and two field’s research with a total of 100 environmental samples (48 from a Sewage Treatment Plant [STP] and 52 from river water). A method of concentration by adsorption/elution into an electronegative membrane followed by ultrafiltration combined to reverse transcriptase – polymerase chain reaction (RT-PCR) and real time PCR (qPCR) quantification was utilized. The molecular characterization of the detected virus was performed by genome partial sequencing of the second open reading frame (ORF-2). Experimentally, the recovery rate ranged from 2.4% to 65% among the different matrices of water samples. In field research, 16% of HAstV were detected of the total environmental samples, 17,3% from river water samples, and 16,7% from STP. One river water sample was characterized as HAstV-1. The qPCR method exhibited an 18 copies/reaction sensibility and the comparative analysis of the results showed a low detection (2%) in comparison with RT-PCR (15%). The association of the methods used proved the presence of HAstV in environmental waters, being an important tool for water quality assessment, for viral particle removal efficiency assessment in different treatment water methods and to elucidate the epidemiology HAstV waterborne outbreaks
|
367 |
Efeito do fator de crescimento do nervo (NGF) sobre a replicação do HIV-1 em células primárias humanasRodrigues, Diego Queiroz January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-05T18:40:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
diego_rodrigues_ioc_mest_2009.pdf: 6237150 bytes, checksum: 6688132dca9a5eef5cf8d01c0a302000 (MD5)
Previous issue date: 2014-11-18 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1), agente etiológico da síndrome da imunodeficiência adquirida (AIDS), representa um dos patógenos de maior interesse clínico das últimas décadas. Durante a infecção pelo HIV-1 muitas células CD4+ morrem; enquanto outras, como os macrófagos, sobrevivem e sustentam a replicação do HIV-1 por longos períodos, transformando-se em reservatórios virais. Desta forma, o reconhecimento de fatores que possam manter esses reservatórios celulares vivos e influenciar a replicação do HIV-1 é uma das maiores tarefas para o desenvolvimento de uma estratégia terapêutica mais eficaz. Uma vez demonstrado que a infecção pelo HIV-1 aumenta a secreção do fator de crescimento do nervo (NGF) e que esta molécula é crucial para a sobrevivência de macrófagos, nós analisamos se o NGF poderia modular a replicação do HIV-1 em PBMCs e macrófagos e os mecanismos relacionados a esse fenômeno. Células mononucleares de sangue periférico (PBMCs) e macrófagos infectados in vitro com HIV-1 foram tratadas com NGF. A replicação viral foi medida por ELISA para p24 em sobrenadantes de cultura. Diferentes inibidores farmacológicos foram utilizados para a análise de possíveis vias de sinalização intracelular envolvidas com a replicação de HIV-1 induzida por NGF. A participação de APOBEC3G foi avaliada em macrófagos expostos ao NGF, utilizando RT-PCR e \201Cimmunoblotting\201D. Infecções com HIV-1 sincronizadas foram utilizadas para estudar se o NGF poderia influenciar a ligação e entrada do vírus. A integração e a transcrição do HIV-1 foram avaliadas por PCR e real-time PCR, respectivamente.
Nossos resultados demonstraram que o NGF estimulou a replicação do HIV-1 em macrófagos mas não em PBMCs atingindo um aumento de até 20 vezes em relação ao controle quando tratado com 10ng/mL. Esta neurotrofina não afetou a adsorção, a penetração, nem a integração do DNA proviral. Desta forma, o NGF deve atuar através da estimulação da transcrição das proteínas virais. A via disparada por NGF que estimula a transcrição do HIV-1 é dependente do receptor TrKA, que leva a mobilização de cálcio intracelular derivado do reticulo endoplasmático e na ativação de PKC. Uma vez disparado, PKC ativa ERK1/2, p38quinase e NFkB. A diminuição da produção de APOBEC3G em macrófagos tratados com NGF, também foi observada, inclusive quando tratado com interferon-y. Em conjunto, nossos resultados sugerem que o NGF estimula a produção de HIV-1 em macrófagos. Esse efeito envolve o receptor TrKA e está associado com a regulação negativa de APOBEC3G. Nosso estudo evidencia uma nova forma de interação entre o HIV-1 e a célula hospedeira, trazendo bases para uma melhor compreensão sobre esta complexa reação / The human immunodeficiency virus type 1 (HIV
-
1), the e
tiological agent of the
acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), represents one of the main pathogens
of clinical interest of the last decades.
During HIV
-
1 infection many
CD4
+
cells die;
while others, such as macrophages, survive and sustain HIV
-
1 repli
cation for long
periods, becoming viral reservoirs. Therefore, the recognition of factors that can
maintain these reservoir cells alive and influence HIV
-
1 replication is one of the main
tasks for the development of a more efficient therapeutic strategy. S
ince it has been
shown that HIV
-
1 infection
increases
nerve growth factor (NGF)
secretion
, and that
this molecule is crucial for macrophage survival, we further analyzed whether NGF
could modulate HIV
-
1 replication in PBMCs and macrophages and the mechanis
ms
underlying this phenomenon.
Peripheral blood mononuclear cells (PBMC) and
macrophages infected i
n vitro
by HIV
-
1 were treated with recombinant human NGF.
Viral replication was measured by p24
-
ELISA in culture supernatants. Different
pharmacological inhi
bitors were employed to analyze the possible signaling pathway
involved in NGF
-
induced HIV
-
1 replication. Participation of APOBEC3G was
evaluated in macrophages exposed to NGF, using RT
-
PCR and immunoblotting
assays. Synchronized HIV
-
1 infections were also
used to study whether NGF would
influence HIV
-
1 biding/entry. HIV
-
1 integration and transcription were evaluated by
PCR and real
-
time PCR, respectively.
Our results demonstrated
that NGF stimulated
HIV
-
1 replication in macrophages, but not in PBMCs reach
ing as much as a 20
-
fold
increase at 10 ng/mL. This neurotrophin did not affect viral adsorption and
penetration, nor integration of proviral DNA. Therefore, NGF probably act trough the
stimulation of viral transcription. The pathway triggered by NGF to st
imulate HIV
-
1
transcription was dependent on the engagement of high affinity receptor TrKA, which
led to a mobilization of intracellular calcium, derived from endoplasmatic reticulum,
and to PKC signaling. Once triggered, PKC activated ERK1/2, p38kinase, a
nd NF
-
kB. We also observed a decrease of
APOBEC3G production in NGF
-
treated
macrophages, even when they were stimulated with interferon
-
.
All together, o
ur
results suggest that NGF stimulates HIV
-
1 production in an important HIV
-
1 reservoir,
such as macro
phages. This effect involves TrKA engagement and is associated with
APOBEC3G down
-
regulation. Our study evidences a new
feature of HIV
-
1/cell host
interaction, providing basis for a better comprehension of this complex interaction
|
368 |
Epidemiologia genética da hipertensão arterial primária em populações brasileiras estudo de polimorfismos em genes do sistema renina-angiotensina-aldotesterona e fatores clínicos/antropométricosFreitas, Silvia Regina Sampaio January 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-05T18:41:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
silvia_freitas_ioc_dout_2006.pdf: 3551773 bytes, checksum: 52ef4c6e19aa2a11b6ec96ba18acbc3f (MD5)
Previous issue date: 2014-11-18 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A hipertensão arterial (HA) é uma doença multifatorial cuja presença de fatores genéticos e ambientais contribuem para a sua expressão. Estudos epidemiológicos sugerem que variantes genéticas, principalmente as descritas nos genes do angiotensinogênio (AGT), enzima conversora de angiotensina (ECA), receptor tipo 1 de angiotensina II (AGTR1), aldosterona sintetase (CYP11B2) e do receptor de mineralocorticóide (RM), podem contribuir para o desenvolvimento da HA. Entretanto, estudos de associação de polimorfismos genéticos e a HA têm apresentado resultados conflitantes em diferentes populações. Este cenário pode se um reflexo da modulação variável do fenótipo, causado pela interação entre o perfil genético do indivíduo e fatores ambientais. Neste trabalho, estabelecemos como objetivos avaliar a associação entre os polimorfismos AGT*M235T, ECA*AluI/D, AGTR1*A1166C, CYP11B2*C344T, RM*G3514C e RM*A4582C; e fatores clínicos/antropométricos (gênero, idade, etnia, índice de massa corporal [IMC], fumo e consumo de bebidas alcoólicas), para o desenvolvimento do quadro hipertensivo em duas populações brasileiras
Para este estudo foram avaliados 205 indivíduos (90 hipertensos e 115 normotensos) provenientes do município do Rio de Janeiro/RJ e 160 indivíduos (82 hipertensos e 78 normotensos) do município de Santa Isabel do Rio Negro/AM. A caracterização genotípica foi conduzida com auxílio da técnica de reação em cadeia da polimerase, enquanto que a caracterização clínica foi realizada através de entrevista e exame clínico. A contribuição dos polimorfismos genéticos e dos fatores clínico-antropométricos na variação da pressão arterial foi avaliada pelo cálculo de ODDS Ratio e por regressão linear \2013 stepwise. Os resultados obtidos no Rio de Janeiro indicaram que os genótipos AGT*235T/235T, AGTR1*1166A/1166A, AGTR1*1166A/1166A, CYP11B2*344T/344T e RM*4582C/4582C apresentam maior suscetibilidade para a hipertensão (p < 0,05). Além disso, combinações haplotípicas entre estes polimorfismos contribuem para um aumento gradual no risco de desenvolver HA (p < 0,05). Nesta população, os fatores idade, IMC e etnia também foram relacionados com elevados níveis pressóricos (p < 0,05)
As análises clínicas e genéticas realizadas na amostra de Santa Isabel do Rio Negro/Amazonas mostraram que a elevação da pressão arterial foi favorecida pelos genótipos ECA*AluD/AluD, RM*4582C/4582C, e pela idade e o consumo de bebidas alcoólicas (p < 0,05). Com base nestes resultados concluímos que o perfil genético associado a fatores antropométricos contribui para o desenvolvimento da HA, entretanto o peso individual destes fatores varia entre diferentes populações / Essential hypertension (EH) is a m
u
ltifactorial disease triggered by several genetic and
m
u
ltiple environm
ental factors. Epidem
iological studies have suggested that genetic
variants, including those of the genes for a
ngiotensinogen (AGT), angiotensin-converting
enzym
e
(ACE), angiotensin II receptor type 1 (AGTR
1
), aldosterone synthase (CYP11B2)
and m
i
neralocorticoid receptor (MR), can incr
ease the risk for EH. However, associative
studies am
ong polym
orphic form
s of these gene
s and EH have showed conflicting results
in different populations. This scenario m
a
y be
reflecting the variable im
pact of the genetic
background of populations and the interaction of environm
ental factors, which can be
m
odulating this m
o
lecular background. In this work, we aim
e
d to investigate the
association am
ong AGT*M235T, ACE*A
lu
I/D, AGTR
1
*A1166C, CYP11B2*C344T,
MR*G3514C and MR*A4582C genetic m
a
rkers
and clinical/anthropom
etrical factors
(gender, age, ethnical profile, body m
a
ss inde
x [BMI], sm
oking and alcohol consum
ption),
with essential hypertension in two Brazilian population. In this study, 221 individuals from
Rio de Janeiro/RJ (106 hypertensives and 115
norm
o
tensives), and 160 from
Santa Isabel
do Rio Negro/AM (82 hyperten
sives and 78 norm
o
tensives) were evaluated. Genetic
determ
ination was conduced by polym
erase chai
n reaction, while clinical/anthropom
etrical
characterization was realized through clini
cal exam
ination. The influence of genetic
polym
orphism
s on blood pressure variation wa
s assessed by analysis of ODDS Ratio and
stepwise linear regression. Results from
Rio de Janeiro sam
p
le indicated an increase in risk
for hypertension associated with AGT*235T/235T, AGTR
1
*1166A/1166A,
AGTR
1
*1166A/1166C, CYP11B2*344T/344T, MR*4582C
/4582C genotypes (p < 0.05).
Moreover, genotype com
b
inations contribute to
an increased EH risk (p < 0.05). In RJ
sam
p
le, clinical/anthropom
etrical factors as ag
e, BMI and ethnical profile were associated
to raise blood pressure (p < 0.05). The clinical
-genetics analysis in Santa Isabel do Rio
Negro/Am
azon sam
p
le indicates that in
crease of blood pressure was favoured by
ACE*
Alu
D/
Alu
D and MR*4582C/4582C genotypes, a
nd advanced age and alcohol
v
consum
ption (p < 0.05). Our findings suggest that unfavorable genetic patterns com
b
ined
with clinical/anthropom
etrical factors contri
bute to EH developm
ent, however, the single
influence im
pact of each factor vary am
ong populations.
|
369 |
Antígeno NS1 dos Vírus Dengue desempenho de testes disponíveis comercialmente e aplicações alternativas para o diagnóstico precoce das infecções por dengueLima, Monique da Rocha Queiroz January 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-05T18:42:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
monique_lima_ipec_dout_2014.pdf: 5463834 bytes, checksum: 3fce9836524ae3941506c5f46b82718e (MD5)
Previous issue date: 2014-11-18 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A utilidade da proteína NS1 para o diagnóstico precoce e seu papel como uma ferramenta de diagnóstico adicional às abordagens existentes para a identificação das infecções por dengue já foi demonstrada. No ano de 2008, o Ministério da Saúde implantou unidades sentinelas em municípios estratégicos do país, utilizando testes de captura de antígeno (Ag) NS1 como um método de triagem e de diagnóstico precoce de casos suspeitos, contudo sem avaliações prévias. O presente estudo visou atender às demandas de avaliação e confirmação do papel destes testes na investigação de casos de dengue no país. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho e as aplicações alternativas dos testes de captura de NS1 disponíveis comercialmente. O desempenho dos testes Platelia NS1 ELISA (BioRad Laboratories) e pan-E Early ELISA, primeira geração (PanBio Diagnostics) e do teste rápido Ag Strip (BioRad Laboratories) disponíveis no mercado após a introdução destes no país, foi avaliado com um painel de 450 amostras. Dentre os três kits analisados, o teste NS1 Ag Strip foi o mais sensível (89%, 197/220), seguido pelo Platelia NS1 ELISA (84%, 184/220). O menos sensível foi pan-E Early ELISA com 72% (159/220) de sensibilidade. Uma menor sensibilidade foi observada em casos de DENV-3 por todos os três kits analisados
A comparação de duas gerações do ELISA para a captura de NS1 do fabricante PanBio Diagnostics (pan-E Dengue Early ELISA e Early ELISA Dengue, segunda geração), após o aperfeiçoamento do teste pelo fabricante, demonstrou um aumento significativo na sensibilidade, de 72,3% (159/220) para 80% (176/220), p=0.05, respectivamente. As sensibilidades dos testes pan-E Dengue Early ELISA, Platelia NS1 ELISA e o NS1 Ag Strip utilizados como uma ferramenta alternativa para o diagnóstico de dengue em fragmentos de tecidos de casos fatais (n=23) foi de 34,7% (08/23), 60,8% (14/23) e 91,3% (21/23), respectivamente. Na análise de 74 fragmentos tecidos provenientes dos casos fatais, o teste NS1 Ag Strip apresentou uma sensibilidade significativamente maior (78,3%, 58/74 [p<0.05]). Este teste foi mais sensível na análise do fígado (91,3%; 21/23), pulmão (71,4%; 10/14), rim (100%, 4/4), cérebro (80%; 8/10), baço (66,6%, 10/15) e timo (100%, 3/3), quando comparado com os testes de ELISA avaliados. A utilidade dos testes de captura de NS1 também foi avaliada nas vigilâncias epidemiológica e entomológica após introdução do DENV-4 no Rio de Janeiro em 2011. Tanto o teste rápido NS1 Ag Strip quanto o Platelia NS1 ELISA confirmaram 4/9 (44,4%) dos casos suspeitos ocorridos na época e confirmaram a infecção em mosquitos Ae. aegypti coletados no campo. Relatos de uma baixa sensibilidade do teste de captura de NS1 no diagnóstico de casos de DENV-4, ocorridos após a introdução deste sorotipo no país, resultou na investigação de metodologias que visassem um aumento das sensibilidades obtidas
Para tal, dois métodos de dissociação de imunocomplexos antígeno-anticorpo por calor e por dissociação ácida, foram testados. Foi observado um aumento significativo na sensibilidade do teste de 46,6% (217/466), quando as amostras não sofreram dissociação, para 70,4% (328/466) e 77,5% (361/466), p=0,017, quando sofreram dissociação ácida e térmica, respectivamente. Visando estabelecer a utilização de sangue coletado por punção digital em papel de filtro como espécime alternativo para a utilização em testes de captura de NS1, cinco protocolos, para a eluição do soro do papel de filtro foram avaliados. O protocolo descrito por Matheus et al. (2007), a utilização de 6mm de papel de filtro contendo a amostra e a eluição da amostra utilizando o próprio tampão do kit comercial, foi o protocolo mas sensível para a confirmação dos casos testados. Os resultados obtidos neste trabalho corroboram àqueles que demostram a utilidade da proteína NS1 no diagnóstico precoce das infecções por dengue e demonstram a aplicação alternativa na confirmação de casos fatais, detecção dos vírus em vetores e, potencialmente, sua utilização combinada com métodos menos invasivos de coleta de sangue / The usefulness of the NS1 protein for early diagnosis of dengue infections and its
role as an additional tool to existing
diagnostic approaches has been demonstrated. In 2008,
the
Brazilian
Ministry of Health established sentinel units in strategic cities of
Brazil
, using
NS1 antigen (Ag) capture tests as a screening method and early diagnosis of suspected
cases, however wit
hout a
previous
evaluation. The present study aimed to meet the
demands of evaluating and confirming the role of these tests in investigating dengue cases
in the country. In this context, the goal of this study was to evaluate the performance and
alternati
ve applications of NS1 capture tests commercially available. The performance of the
Platelia NS1 ELISA (BioRad Laboratories) and pan
-
E Early ELISA, first generation (PanBio
Diagnostics) and rapid test NS1 Ag Strip (BioRad Laboratories) available in the mar
ket after
the introduction of these in the country, was evaluated with a panel of 450 samples. Among
the three kits analyzed, the NS1 Ag Strip test was the most sensitive (89%, 197/220),
followed by the Platelia NS1 ELISA (84%, 184/220). The least sensitiv
e was the pan
-
E Early
ELISA with 72% (159 /220) of sensitivity. A lower sensitivity was observed in DENV
-
3 cases
by all three kits analyzed. The comparison of two generations of the NS1 Ag capture ELISA
from PanBio Diagnostics (pan
-
E
Dengue
Early ELISA an
d Early ELISA
Dengue,
second
generation) after a test improvement by the manufacturer, showed a significant increase in
the sensitivity, from 72.3% (159 /220) to 80% (176/220), p=0.05, respectively. The sensitivity
of the pan
-
E Dengue Early ELISA, Platelia
NS1 ELISA and NS1 Ag Strip tests used as an
alternative tool for the diagnosis of dengue in tissues of fatal cases (n=23), were 34.7%
(08/23), 60.8% (14/23) and 91.3% (21/23), respectively. In the analysis of 74 tissues from
dengue fatal cases, the NS1 Ag
Strip test showed a significantly higher sensitivity (78.3%,
58/74 [p <0,05]) . This assay was more sensitive in the analysis of the liver (91.3%, 21/23),
lung (71.4%, 10 /14), kidney (100%, 4/4), brain (80 %, 8/10), spleen (66.6%, 10 /15), and
thymus (10
0%,3/3), when compared to the ELISA tests evaluated. The usefulness of the
NS1 capture tests was also evaluated in the epidemiological and entomological surveillance
after DENV
-
4 introduction in Rio de Janeiro in 2011. Both the rapid test NS1 Ag Strip and
the Platelia NS1 ELISA confirmed 4/9 (44.4%) of the suspected cases occurred at the time
and confirmed the infection in
Ae. aegypti
collected in the field. Reports of a low sensitivity of
the NS1 capture tests in diagnosing DENV
-
4 cases occurred after the
introduction of this
serotype in the country and resulted in the investigation of methodologies to increase the
sensitivities obtained. In that scenario, two methods for antigen
-
antibody immune complexes
dissociation (heat and acid dissociations) were test
ed. The sensitivity observed with the
samples non
-
dissociated (46.6%; 217/466) was significantly improved when the samples
were submitted to acid dissociation (70.4%
; 328/466)
and heat dissociation (77.5
%;
361/466), p
=0.017.
To establish the use of fingers
tick blood collection on filter paper
specimens as an alternative specimen to use on NS1 tests, five protocols for eluting the
serum
from
the filter paper were evaluated. The protocol described by Mat
heus
et al.
(2007),
using 6 mm of filter paper containin
g the sample and the elution of the sample using the
commercial kit buffer
was
itself, the most effective. The results of this study support those
that demonstrate the usefulness of the NS1 protein in the early diagnosis of dengue
infections and demonstrat
e the alternative applications in confirming fatal cases, in the
surveillance of the virus in the vectors and the potentially combined with less invasive
methods of blood collection use.
|
370 |
Avaliação de um protocolo visando o diagnóstico rápido dos enterovírus associados a casos de paralisia flácida aguda / Evaluation of a protocol for the rapid diagnosis of enterovirus associated with acute flaccid paralysis casesDias, Aline Peçanha Muzy^ract January 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-28T18:10:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
97.pdf: 1747812 bytes, checksum: ac9891f962a8dc55e948eb9245ec6dc5 (MD5)
Previous issue date: 2008 / Made available in DSpace on 2014-12-22T16:56:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2
97.pdf: 1747812 bytes, checksum: ac9891f962a8dc55e948eb9245ec6dc5 (MD5)
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
Previous issue date: 2008 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / Os enterovírus estão entre os mais comuns vírus humanos e são de grande interesse devido à ampla variedade de infecções que podem causar. A vigilância das Paralisias Flácidas Agudas (PFAs) e o diagnóstico laboratorial dos enterovírus são partes críticas da iniciativa da Organização Mundial de Saúde para erradicação mundial da poliomielite, assim como a necessidade de disponibilizar técnicas rápida para o diagnóstico diferencial destes vírus. A caracterização dos enterovírus é importante para a investigação da diversidade de vírus co-circulantes, para determinar a correlação entre dados celulares e bioquímicos durante a infecção,para relacionar o tipo de sintoma clínico com o sorotipo enteroviral, incluindo a investigação de vias de transmissão de enterovírus durante épocas de surtos. Além disso, a caracterização dos enterovírus é de extrema relevância para distinguir as infecções provocadas pelos Poliovirus dos enterovírus não-pólio no contexto do Programa de Erradicação da Poliomielite da OMS. O presente estudo teve como objetivo principal identificar, através da técnica de RT-PCR e seqüenciamento nucleotídico, a presença de enterovírus diretamente das amostras de primeira passagem de cultura celular a fim de diminuir o custo e o tempo de liberação do diagnóstico. Para isso, foram analisadas 221 amostras de casos suspeitos de PFA, inoculadas em primeira passagem de cultura de células RD. Destas, 17 foram positivas para enterovírus. A comparação da técnica com a indicada pela OMS mostrou alta sensibilidade e especificidade, indicando que a nova metodologia pode ser seguramente empregada como forma de garantia de um diagnóstico mais rápido. / The enterovirus are among the most common human viruses, and are of great interest because of the wide variety of infections that can cause. The surveillance of Acute Flaccid Paralysis (AFP) and laboratory diagnosis of enterovirus are critical parts of the initiative of the World Health Organization (WHO) to eradicate polio worldwide, as well as the availability of rapid completion of techniques are needed for the differential diagnosis of these viruses. The characterization of enterovirus is important for the research of the diversity of virus co-circulating, to determine the correlation between cellular and biochemical data during infection, relate to the type of clinical symptoms with the serotype enteroviral, including investigation of routes of transmission of enterovirus during times of outbreaks. Moreover, the characterization of enterovirus is of extreme importance to distinguish Poliovirus infections caused by the enterovirus non pólio in the context of the Program for the Eradication of Poliomyelitis of WHO. The aim of this study is to identify, through RT-PCR and nucleotide sequencing, the presence of enterovírus genome directly from first passage of cell culture in order to reduce the cost and time of release of diagnosis. For that, were analyzed 221 samples of suspected cases of FAP, inoculated in first passage of RD cell culture. Seventeen samples were positive for enterovirus. The comparison this technique with the indicated by the WHO showed high sensitivity and specificity, indicating that the new method can be safely employed as a way of ensuring a faster diagnosis.
|
Page generated in 0.1242 seconds