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BIODISTRIBUIÇÃO DE NANOPARTÍCULAS MAGNÉTICAS UTILIZANDO CAMPO MAGNÉTICO EM RATOS

Paula, Valnir de 15 December 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2018-06-27T18:56:28Z (GMT). No. of bitstreams: 3 Valnir de Paula.pdf: 2329033 bytes, checksum: 989bd5d1109793d5b0ba4e36a71ad934 (MD5) Valnir de Paula.pdf.txt: 111221 bytes, checksum: e193938f84364f16942c08f8c27a80b8 (MD5) Valnir de Paula.pdf.jpg: 3313 bytes, checksum: b9abaf2a3f9be69ba98dca42617b7fef (MD5) Previous issue date: 2011-12-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The use of nanoscale products in several areas, including medicine, is a growing reality. The magnetic nanoparticles (MNPs) for being able to present a significant effect of magnetization when exposed to an external magnetic field, have been the focus of several studies, and among their applications is their use as contrast agent in magnetic resonance images. This technique provides images based on the nuclear behavior of the atoms of anatomical structures, which can be best highlighted by the use of contrast agents, usually paramagnetic. The MNPs represent an alternative to the current class of paramagnetic contrast agents for nuclear magnetic resonance, used for a long time, with advantages from a physical point of view, because they highlight even more the magnetic behavior of protons in different tissues, especially liver, spleen and lymphatic system, whose defense cells endocyte these MNPs, making healthy parenchyma dark (hyposignal), so that any injuries stand out in the images, facilitating their identification. This study has aimed to assess the contrast degree of the organs of the phagocyte system, injecting NPMs doses ranging from 0.46 to 7.2 mg/kg in rats, by caudal intravenous flow and subjecting them to nuclear magnetic resonance imaging. The MNPs was divided into two groups, both with a core of magnetite, varying the coating, which has been dextran in group 1, and oleic acid in group 2. The expected effect was that the organs of the phagocyte system would have some degree of signal loss in the images, indicating that the NPMs were internalized by the cells of these organs. With the usual contrast agent, paramagnetic, which does not enter cells, the effect is the hypersignal in the vascular system and in hypervascularized organs. We have compared the images obtained from T1 TSE and T2 TSE sequences with the control obtained before injection. The results have shown that both dextran coated MNPs and the ones coated with oleic acid have caused the hyposignal effect in the images, ranging from weak to strong, depending on the administered dose, especially in T2 TSE sequences. The dextran coated MNPs have shown higher efficiency, considering that the hyposignal effects have occurred with lowers doses, compared to the effects caused by NPMs coated with oleic acid. It can be concluded, given the evident hyposignal effect presented by the organs of the phagocyte system, the potential application of MNPs as a contrast agent in magnetic resonance studies. / A utilização de produtos de escala nanométrica nas mais diversas áreas, inclusive na medicina, é uma realidade crescente. As nanopartículas magnéticas (NPMs), por serem capazes de apresentar efeito expressivo de magnetização quando expostas a um campo magnético externo, têm sido foco de vários estudos e, entre as suas aplicações está o uso como agente de contraste em imagens de ressonância magnética nuclear. Esta técnica fornece imagens baseadas no comportamento nuclear dos átomos das estruturas anatômicas, as quais podem ser melhor destacadas pelo uso de agentes de contraste. As NPMs representam uma classe alternativa aos atuais agentes de contraste, paramagnéticos, com vantagens do ponto de vista físico, pois destacam ainda mais o comportamento magnético dos prótons de diferentes tecidos. Isto é mais evidente no fígado, baço e sistema linfático, cujas células de defesa endocitam estas NPMs, tornando o parênquima sadio escuro (hipossinal), de forma que eventuais lesões se sobressaeam nas imagens, facilitando a sua identificação. O objetivo deste trabalho foi avaliar o grau de contrastação dos órgãos do sistema fagocitário, injetando-se doses de NPMs que variaram de 0,46 a 7,2 mg/Kg em ratos, por via endovenosa caudal e submetendo-os a imageamento por ressonância magnética nuclear. As NPMs foram divididas em 2 grupos, ambos com núcleo de magnetita, variando-se o revestimento, que no grupo 1 foi de dextrana e o do grupo 2, de ácido oléico. O efeito desejado foi que os órgãos do sistema fagocitário apresentassem algum grau de perda de sinal nas imagens, indicando que as NPMs foram internalizadas pelas células desses órgãos. Com o agente de contraste usual, paramagnético, que não entra nas células, o efeito é de hiperssinal no sistema vascular e em órgãos hipervascularizados. Comparou-se as imagens obtidas de sequências T1 TSE e T2 TSE com as de controle, obtidas antes da injeção. Os resultados obtidos evidenciaram que, tanto as NPMs revestidas com dextrana, quanto às revestidas com ácido oléico causaram efeito de hipossinal nas imagens, que variaram de fraco a acentuado, dependendo da dose administrada, principalmente em sequências T2 TSE. As NPMs revestidas com dextrana apresentaram maior eficiência, considerando que os efeitos de hipossinal ocorreram com doses menores do que as revestidas com ácido oléico. Pode-se concluir, considerando o evidente efeito de hipossinal apresentado pelos órgãos do sistema fagocitário, que há potencial de aplicação destas NPMs como agente de contraste em estudos de ressonância magnética.
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Adapatação de métodos de estrutura eletrônica em cálculos de propriedades de ressonância magnética nuclear e barreiras de rotação interna / Adaptation of electronic structure methods in calculations of nuclear magnetic resonance properties and internal rotation barriers

Ducati, Lucas Colucci 10 January 2010 (has links)
Orientadores: Roberto Rittner Neto, Rogério Custodio / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química / Made available in DSpace on 2018-08-17T00:18:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ducati_LucasColucci_D.pdf: 3255811 bytes, checksum: 27c6109cd34321e5c9ae4c505fbdc255 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: A avaliação de funcionais de densidade no cálculo de constante de acoplamento spi-spin, mostrou que o funcional híbrido meio a meio BHandH apresenta precisão similar aos métodos ab initio, como SOPPA(CCSD) e LR-CCSD. A variação E nos funcionais testados melhorou a precisão das constantes de acoplamento spin-spin para a maioria dos casos, sendo que a inclusão de 50% de E no funcional B98 levou aos valores mais precisos. A otimização da função de base Huz-IIIsu3-J para o P em relação à constante de acoplamento, energia e vetor campo elétrico nos núcleos, apresentou a mesma precisão em relação à base original para todos os tipos de acoplamento JPH, JPC e JPP avaliados. Entretanto, a precisão da nova base de P se mostrou superior para os acoplamentos JPC e principalmente para JPP. Os métodos G3 e G3CEP usados para determinar as barreiras de rotação de algumas moléculas simples (H2O2, H2S2, N2H4, H3COH, H3CNH2 e C2H6) apresentaram desvios menores que 0,53 kcal mol e 0,86 kcal mol, com respeito aos dados experimentais e que são similares ao desvios obtidos em níveis teóricos como CCSD(T)/aug-cc-pVTZ. As componentes G3 e G3CEP mostraram que a energia MP4/6-31G(d) ou MP4/CEP- 31G(d) é refinada de acordo com a sequência: DEG3Large > DE2df,p > DE+ > DEQCI. Contudo, a energia relativa para as moléculas com pares de elétrons não ligantes nos dois átomos da ligação que sofre rotação, e que apresentam altas barreiras de rotação é sensível às contribuições das funções de polarização e difusas. Moléculas com apenas um par de elétrons não ligante ou pares de ligação nos átomos da ligação que sofre rotação, e que apresentam barreiras pequenas, além de sensíveis às componentes DE2df,p e DE+, também dependem da melhoria de base através da correção DEG3Large / Abstract: The hybrid functional ¿half and half¿ BHandH showed similar accuracy with SOPPA (CCSD) and LR-CCSD ab initio methods on the evaluation of density functionals in spin-spin coupling constants calculations. The variation of E in the studied density functions increased the accuracy of spin-spin coupling constants calculations in most cases, where the 50% value for E in B98 functional led to the most accurate values. The optimization of Huz-IIIsu3-J basis function for P with respect to the spin-spin coupling constants, energy and electric field vector on the nuclei showed the same quality in relation to the original basis set for all tested JPH, JPC and JPP spin-spin coupling constants. However, the new basis set presented the best accuracy for JPC and JPP. The internal rotational barrier of some simple molecules (H2O2, H2S2, N2H4, H3COH, H3CNH2 e C2H6) calculated using G3 and G3CEP methods showed deviations smaller than 0.53 kcal mol and 0.86 kcal mol with respect to experimental data and similar quality in relation to CCSD(T)/aug-cc-pVTZ level of theory. The G3 and G3CEP energy components showed that MP4/6-31G(d) or MP4/CEP-31G(d) energy is refined following the sequence: DEG3Large > DE2df,p > DE+ > DEQCI. The relative energy is sensitive to the diffuse and the polarization functions for molecules which contain lone pairs in the atoms of the rotating bond and show a higher rotation barrier. Molecules presenting just one lone pair or bond pair and showing low rotation barriers depend also on an improvement of basis set by the DEG3Large correction as well as DE2df,p and DE+ corrections / Doutorado / Físico-Química / Doutor em Ciências
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Determinação e análise da influência angular e eletrônica nas constantes de acoplamento nJCH em 2-X-4-t-butilcicloexanonas e 2-X-4-t-butilcicloexanóis (X=H, Me, F, Cl, Br) / Determination of NMR nJCH spin-spin coupling constants and analysis of their angular and electronic dependence in 2-X-4-t-butylcycloexanonas and 2-X-4-t-butylcycloexanols (X=H, Me, F, Cl, Br)

Favaro, Denize Cristina, 1987- 17 August 2018 (has links)
Orientador: Claudio Francisco Tormena / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química / Made available in DSpace on 2018-08-17T19:41:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Favaro_DenizeCristina_M.pdf: 2968237 bytes, checksum: 07a91d8f375b71e3ddc4d4c9b7818162 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: A dissertação consiste de uma parte introdutória que versa sobre constantes de acoplamento JXH que seguem ou não uma relação de estrita dependência com o ângulo diedro, proposta por Karplus para JHH e por Aydin e Günther para JCH; apresentando como as interações hiperconjugativas afetam os valores das mesmas. Seguindo a estrutura da dissertação temos os resultados e discussão. Primeiro apresentamos a metodologia de HSQC-TOCSY-IPAP utilizada para determinação das constantes de acoplamento JCH. Posteriormente apresentamos uma racionalização para a diferença entre os acoplamentos JC2H6e para as cetonas cis/trans-2-X-4-t-butilcicloexanonas (X = H, Me, F, Cl e Br) e entre os alcoóis derivados. Mostramos, também, qual a influência do ângulo de ligação C2-C1-C6 na constante de acoplamento JC2H6e onde observamos que para a maioria dos compostos o valor de JC2H6e possui uma relação inversa com esse ângulo interno. Além disso, analisou-se o efeito das interações hiperconjugativas sC1-C6s*C2-Br, LP2(O)s*C1-C2 e LP3(X)s*C1-C2, onde as duas primeiras interações tornam mais efetiva a transmissão do acoplamento e a última retira densidade eletrônica do caminho a três ligações. Por fim, observamos a aplicabilidade das regras propostas por Marshall, Contreras e col. na racionalização da diferença dos valores de JC2H3a quando o heteroátomo ligado ao C2 se encontra na orientação axial ou equatorial / Abstract: It is presented an overview about heteronuclear coupling constants JXH and their strict dependence with the dihedral angle, as proposed by Karplus for JHH and by Aydin and Günther for JCH. It is also presented descriptions about the effects of hyperconjugative interactions on coupling constants and also on the HSQC-TOCSY-IPAP methodology for the measurements of long range heteronuclear coupling constants (JCH). The experimental values for JCH couplings obtained from HSQC-TOCSY-IPAP and rationalization of the difference between the JC2H6e for cis/trans-2-X-4-t-butylcyclohexanones and 2-X-4-t-butylcyclohexanols (X = H, Me, F, Cl and Br) based on the effects of bond angle C2-C1-C6 and hyperconjugative interactions involving the sC1-C6, LP2(O) and LP3(X) has been presented and discussed. The hyperconjugative interactions were studied with the Natural Bond Orbital (NBO) analyses. It was observed that interactions such as, sC1-C6s*C2-Br and LP2(O)s*C1-C2 increase the JC2H6e values and LP3(X)s*C1-C2 decreases this coupling constant values. Furthermore, we observed the applicability of the rules proposed by Marshall and Contreras in the rationalization of the difference between values of JC2H3a when heteroatom on carbon C2 is in the axial or equatorial orientation / Mestrado / Quimica Organica / Mestre em Química
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Determinação da toxicidade in vitro e in vivo de novos organofosforados e ressonancia magnetica nuclear do cloreto de acetilcolina / Determination of toxicity of the new organophosphorus and nuclear magnetic resonance of acetylcholine chloride

Sega, Estela Munhoz 27 April 2006 (has links)
Orientadores: Nelci Fenalti Hoerhr, Roberto Rittner Neto / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-06T21:30:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sega_EstelaMunhoz_M.pdf: 1403353 bytes, checksum: 0aec5b888298032d359cc1b3cf0905b6 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: Esse estudo analisou as propriedades toxicológicas de novos compostos organofosforados. Foram realizados experimentos para avaliar a atividade anticolinesterásica desses organofosforados, in vitro, no sangue total através do método de Ellman modificado. Para determinar a sua citotoxicidade foram utilizadas células PC 12, com as quais avaliamos a viabilidade celular após contato com os organofosforados e determinamos a IC 50, encontrando valores muito diferentes para os diversos organofosforados estudados. Estudos de toxicidade aguda in vivo foram realizados com camundongos, através da metodologia recomendada pela OECD nos quais determinamos a DL50 para três dos organofosforados estudados, sendo que um apresentou toxidade moderada. Foram analisados os efeitos dos solventes nas constantes de acoplamento JHH, JHH, JNC e 2Jnc em espectros de RMN de LH e 13C do cloreto de acetilcolina. Os valores das constantes de acoplamento em solventes de diferentes constantes dielétricas (s) não sofreram variações, indicando uma ausência de efeitos de solvente no equilíbrio conformacional do cloreto de acetilcolina (ACh). As constantes de acoplamento mostram que o sistema OCH2CH2N+ tem uma conformação gaúche (sinclinal). O Jnh e Jkc são observados na maioria dos solventes, mas não em solventes clorados e não são dependentes da viscosidade do solvente, esse comportamento foi explicado usando dados de medidas de Ti. Os valores dos coeficientes de difusão de RMN mostraram que a ACh tem uma grande tendência de se agregar quando dissolvida em solventes clorados, fato que pode explicar as diferenças observadas em valores de T1 para o 14N / Abstract: This study analyzed the properties of the news organophosphorus. Experiments had been carried through to evaluate the inhibition of acetylcholinesterase of these organophosphorus, in vitro, through the modified EUman's method. In order to determine its cytotoxicity cells PC 12 had been used, with which we evaluate the cellular viability after contact with the organophosphorus and determined the IC50, different values were found for the diverse organophosphorus. Studies of acute toxicity had been carried through with mice, following the methodology recommended by the OECD in which determine the DL50 for three of the organophosphorus studied, being that one presented moderate toxicity. Coupling constants values ( Jhh and Jnc) obtained from the 'H and 13 C NMR spectra of acetylcholine chloride (ACh) in several solvents with a wide range of dielectric constants (e) are remarkably invariant, indicating an absence of solvent effects in the conformational equilibrium of this compound. Those values show that the OCH2CH2N+ system occurs in a synclinal conformation. The Jnh and Jnc are observable in most solvents, but not in chlorine-containing solvents and are not dependent on solvent viscosity. This behavior was explained using data from Ti measurements. The measurement of NMR diffusion coefficients show that ACh has a greater tendency to aggregate when dissolved in chlorinated solvents, a fact that could explain the observed differences in 14N T1 / Mestrado / Patologia Clinica / Mestre em Ciências Médicas
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Efeito dos substituintes nos deslocamentos quimicos de carbono-13 de benzenos 1,4-dissubstituidos

Canto, Eduardo Leite do, 1966- 20 July 2018 (has links)
Orientadores: Roberto Rittner Neto e Roy Edward Bruns / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-20T23:48:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Canto_EduardoLeitedo_D.pdf: 11050890 bytes, checksum: c8dd8a1e48aaa544d16528ef147e1fd1 (MD5) Previous issue date: 1996 / Doutorado
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Estudos estruturais e dinamicos da proteina elicitora cerato-platanina / Structural and dynamics studies of the protein elicitor cerato-platanin

Oliveira, Aline Lima de 12 August 2018 (has links)
Orientadores: Thelma de Aguiar Pertinhez, Celso Eduardo Benedetti / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-12T14:11:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_AlineLimade_D.pdf: 9722926 bytes, checksum: ed4754fa74fbf62fbf6092d5ec8dfd53 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: Um dos desafios que envolvem a patologia de plantas é determinar as bases moleculares que relacionam a patogenicidade do fungo na planta hospedeira. Em geral, o mecanismo pelo qual a planta se defende contra uma variedade de patógenos envolve o reconhecimento de moléculas específicas codificadas por esses microorganismos. A ceratoplatanina (CP) é uma proteína moderadamente hidrofóbica que é secretada, porém também está localizada na parede celular do fungo ascomiceto Ceratocystis fimbriata. Esse fungo é o agente causador de severas doenças de cancro que atinge um grande número de plantas como Platanus acerifolia, Theobroma cacao, Coffea Arabic, entre outras. A proteína secretada por culturas de Ceratocystis fimbriata f. sp. platani é capaz de elicitar a síntese de fitoalexinas em folhas de Platanus acerifolia e causar morte celular. De acordo com o banco de dados de família de proteínas CP é indicada como a fundadora da "Família Cerato-Platanina", que inclui outras várias proteínas secretadas por fungos envolvidos em fenômenos fitopatológicos e/ou reações imunológicas. Buscas em banco de dados de proteínas mostram que não existe nenhuma proteína similar a CP com estrutura conhecida. Assim, a elucidação estrutural de moléculas possivelmente envolvidas interação fungohospedeiro é de primária importância para a compreensão dos eventos iniciais que levam às respostas de defesa. A CP foi clonada e expressa em sistema eucariótico e marcada isotópicamente com 13C e 15N. Experimentos de ressonância magnética nuclear multinucleares e muiltidimensionais foram usados para determinar sua estrutura 3D em solução. A estrutura da CP é composta por duas fitas-ß paralelas e cinco fitas-ß antiparalelas, reunidas em uma única folha-ß, e três elementos helicoidais. A dinâmica da CP foi determinada e os dados experimentais mostraram que a proteína apresenta uma estrutura caracterizada por uma limitada mobilidade interna. Além disso, a proteína apresenta alta estabilidade, mantendo a sua conformação mesmo em temperaturas elevadas ou em uma larga escala de pH e de concentração de uréia. Com o objetivo de procurar outras proteínas ou domínios conformacionalmente similares ao da CP, sua estrutura foi submetida a análises estruturais utilizando-se a ferramenta ProFunc. Os resultados de alinhamento estrutural mostram que a CP não possui similaridade conformacional a nenhuma proteína conhecida envolvida em avirulência de microorganismos ou a proteínas elicitoras de fungos ou bactérias patógenas. Porém, surpreendentemente, o enovelamento da CP mostrou-se similar a moléculas pertencentes às famílias das quimiocinas e do complexo de histocompatibilidade principal de classe I (MHC-I). De fato, a estrutura de menor energia da CP se sobrepõe melhor a forma dimérica da interleucina-8 (IL-8) e do peptídeo ativador de neutrófilos-2 (NAP-2), da família de quimiomicinas, e aos domínios a1, a2 da proteína MHC-I. Interessante notar que ambas famílias de proteínas que possuem enovelamento similar ao da CP estão relacionadas com respostas de defesa a patógenos em animais. A semelhança estrutural entre CP e essas moléculas sinalizadoras de defesa sugere que, na célula do hospedeiro, o alvo da CP pode ter similaridade estrutural aos receptores das proteínas IL-8/NAP-2 ou MHC-I. Buscas no genoma de Arabdopsis usando a sequência desses receptores forneceram alguns potenciais alvos. A maioria desses alvos são proteínas intracelulares ou de membrana que estão envolvidos na percepção de proteínas de avirulência e de padrões moleculares associados a patógenos, corroborando com a hipótese de que a CP agiria como um elicitor de respostas de defesa e poderia interagir com essas classes de receptores. Embora a função da CP ainda seja desconhecida, com a elucidação da sua estrutura 3D surgiram novas hipóteses sobre o mecanismo molecular pelo qual a CP interagiria com seus hospedeiros. / Abstract: One of the most challenging problems facing plant pathology is to understand the molecular basis of the interaction between fungal plant pathogens and their host. Often, the mechanisms by which plants defend themselves against a variety of pathogens involve the recognition of specific molecules encoded by these microorganisms. Cerato-platanin (CP) is a moderately hydrophobic protein that is secreted and localized in the cell wall of Ceratocystis fimbriata produced by the ascomycete fungus Ceratocystis fimbriata, which is the causative agent of canker stain, a severe disease with incidence in a great number of plants, such as Platanus acerifolia, Theobroma cacao, Coffea Arabic, among others. The protein secreted by culture of Ceratocystis fimbriata f. sp. platani in the medium is able to elicit phytoalexin synthesis in Platanus acerifolia leaves and to enhance cell death. According to protein family database CP has been indicated as the founder of the "Cerato-Platanin Family" that includes other secreted fungal proteins involved in a variety of phytopathological phenomena and/or immunological reactions. The search in the Protein Data Bank revealed this protein family is not structurally characterized. In this way, the resolution of 3D structure of molecules involved in the host-fungus interaction is important to the comprehension of the initial events in the plant defence response. CP has been cloned and expressed in eukaryotic systems in its 13C, 15N isotopically labelled form. Multinuclear and multidimensional nuclear magnetic resonance has been used to determine its 3D solution structure. The CP structure is composed of two ß-strand parallel and five ß-strands antiparallel, assembled in a seven-stranded ß-sheet, facing three helical elements. The CP dynamics has been determined and the experimental data reveal that CP shows a structure characterized by limited internal mobility. Moreover, the protein has a good stability, keeping its conformation even at high temperature or in a wide rage of both pH and urea concentration. With the aim to search for other protein or domains conformationally similar to the CP, its 3D structure was submitted to structural analysis using ProFunc Server. The results of structure alignment show that CP does not share 3D structural similarity with any known avirulence proteins or elicitors from bacterial or fungal pathogens. However, surprisingly, the core of CP has a fold similar to molecules belonging to the chemokines and to the major histocompatibility complex class I (MHC-I) families. Indeed, the minimum energy CP structure superposes better to the dimeric form of interleunkin-8 (IL-8) and of the neutrophil activating peptide-2 (NAP-2), from the chemokines family, and to the a1, a2- domains of MHC-I protein. Interestingly, both families of proteins which have a similar fold to CP are related with defense response to pathogens in animals. The structural resemblance between CP and these defense signaling molecules suggests that, in the host cells, CP targets might have structural similarities to the human IL-8/NAP-2 or MHC-I proteins receptors and a search in the Arabidopsis genome with them produced a few hits. Not surprisingly, most of these proteins are surface or intracellular receptors implicated in the recognition of molecular patterns associated to pathogens or avirulence, a finding consistent with the hypothesis that CP, acting as an elicitor, should interact with such class of receptor proteins. In summary, although the biological function of the CP is still unknown, the elucidation of its 3D structure provides some insights about the molecular mechanism by which CP interact with their hosts. / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular
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Aplicações das Tecnicas de Espectrometria de Massas e Ressonancia Magnetica Nuclear na Detecção e Caracterização de Intermediarios Chave de Reações Organicas / Application of mass spectrometry and nuclear magnetic ressonance for the detection and characterization of key intermediates in organic reactions

Cabrini, Liliane Girotto 02 September 2007 (has links)
Orientador: Marcos Nogueira Eberlin / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-08T11:34:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cabrini_LilianeGirotto_M.pdf: 4710376 bytes, checksum: d7e2a14030bf7b1a4a9e90a9a50031ad (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: Esta dissertação de mestrado e dividida em duas partes. A primeira parte, visa, através da técnica de RMN, detectar e estudar a reatividade dos íons N-acilimínios endo- e exocíclicos de 5 e 6 membros, com a finalidade de verificar se o tamanho do anel, a presença de anel aromático e se a diferença entre o grupo acila endo- ou exocíclicos afetam a estabilidade do íon N-acilimínio. Experimentos realizados com a N-carbometoxi-1-metoxi-tetraidroisoquinolina (38), em CDCl3, à - 30.°C e na presença de BF3.OEt2, mostrou a presença no espectro de RMN de H um sinal bastante intenso na região de d 9, referente ao hidrogênio metínico do íon N-acilimínio (H-1), bem como um sinal a d 171,1 no espectro de RMN de C referente ao C-1 característicos da formação do íon N-acilimínio. A segunda parte descreve experimentos desenvolvidos no laboratório Thomson de espectrometria de Massas, no estudo de diferenciação de isômeros através do aparelho Pentaquadrupolo e a determinação do mecanismo de olefinação de Takeda por Electrospray. A diferenciação de isômeros em espectrometria de massas sempre foi um grande desafio. No presente trabalho, através de reações íon-molécula no espectrômetro de massas pentaquadrupolar, íons acílios (acilpirrol e acilpiridina) reagiram com diferentes classes de compostos, como acetal cíclico, epóxido, nitrila e dieno. Como resultado destas reações íon-molecula foi possível detectar e diferenciar a classe de isômeros N-, 2- e 3-acilpirróis e 2-, 3- e 4-acilpirridinas. A preparação de olefinas altamente substituídas através da olefinação de carbonilas utilizando sistemas gem-dicloro- Cp2Ti[P(OEt)3]2 foram estudadas por Takeda, e o mecanismo desta reação foi por nos elucidado, onde pode-se observar a formação de intermediários titanoceno e do titanociclo / Abstract: This master's thesis is divided in two parts. The first one had the objective to investigate via the NMR technique the reactivity of endo- and exocyclic N-acyliminium ions of 5 and 6 member-rings as a function of ring size, the presence of an aromatic ring and endo or exocyclics acyl groups. For all substracts we observed a deshielding of all the signals in the H-NMR spectra in the presence of Lewis acid. This dishielding was attributed to formation of a Lewis complex. One of such substrates (38) displayed in the H-NMR spectrum an intense singlet at d 9 which was assigned to the methyne hydrogen of the corresponding N-acyliminium ion. This dishielding was also detectable in the C-NMR spectrum (d 171,1). The second part of this thesis describes mass spectrometric (MS) experiments applied in the differentiation of isomers via pentaquadrupole MS, and for the determination of the mechanism of Takeda's olefination via electrospray-MS (ESI/MS). Using ion/molecule reactions of acyl ions (acylpyrrol and acylpiridine) with molecules of different classes such as cyclical acetals, epoxides, nitriles and dienes, it was possible to distinguish the N -, 2- and 3-acylpyrrol and the 2 -, 3- and 4-acylpiridine isomers. The preparation of olefins highly substituted via the carbonyl olefination using gem-dicloro-Cp2Ti[P(OEt)3]2 had been studied by Takeda, and the present ESI-MS results provide insights into its mechanism via the characterization of titanocene and titanocycle intermediates / Mestrado / Quimica Organica / Mestre em Química
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Determinação da toxidade in vitro e vivo de compostos quinazolinicos e identificação do acido homovanilico por espectrometria de ressonancia magnetica nuclear de hidrogenio (1 ANTPOT. H) / In vivo and in vitro toxicity determination of quinazolinic compounds and identification of homovanilic acid by hydrogen (1 ANTPOT. H) nuclear magnetic resonance spectrometry

Oliveira, Andre Nazario de 14 August 2018 (has links)
Orientadores: Nelci Fenalti Hoehr, Roberto Rittner / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-14T17:11:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_AndreNazariode_M.pdf: 1693019 bytes, checksum: c0e1f56be54157760e94e4822c8d9f5f (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Este projeto tem a finalidade de analisar as características toxicológicas de novos compostos quinazolínicos, que foram sintetizados recentemente no Instituto de Química-UNICAMP. Uma série de derivados de 4-fenilamino quinazolinas foi sintetizada como potentes inibidores da proteína quinase e sua citotoxicidade foi demonstrada através de técnicas de Inibição de Crescimento de 50% da população celular, onde procuramos estabelecer alguns efeitos biológicos desses novos compostos quinazolínicos, através de cultura de células PC12 e de cultura de células tumorais humanas, recomendadas pelo NCI (The U.S. National Cancer Institute) para ensaios anti-proliferiativos para estudos do câncer. A utilização da metodologia de "docking molecular" nos levou ao descobrimento do sítio de ação dos compostos quinazolínicos em células tumorais de mama (MCF07). Estudos com camundongos foram realizados, utilizando a metodologia recomendada pela OECD (Organisation for Economic Co-operation and Development), para determinação in vivo da toxicidade aguda pelos compostos quinazolínicos, descrevendo os efeitos causados pelas diferentes concentrações dos compostos quinazolínicos em estudo aplicadas aos animais. Através da Espectrometria de Ressonância Magnética Nuclear de Hidrogênio (¹H) pôde-se identificar o metabólito final das catecolaminas, o ácido homovanílico em urina, escolhido por ser um composto que aparece em grandes concentrações na urina e por ser de excelente precisão diagnóstica em algumas doenças neurológicas. / Abstract: This project aims to analyze the toxicological characteristics of new quinazoline compounds, which were summarized recently in the Institute of Chemistry-UNICAMP. The compound 4-phenylamino quinazoline was synthesized as a potent inhibitor of protein kinase and its cytotoxicity was demonstrated by an inhibitory activity on growth of human tumor cell lines. Through techniques of 50% Growth Inhibition of cell lines we provide some biological effects of these new quinazoline compounds through PC12 cell culture and culture of human tumor cells, as recommended by the NCI (The U.S. National Cancer Institute) for testing anti-proliferative for studies of cancer. The use of the methodology of "molecular docking" has led to the discovery the binding site of action of quianzoline compounds in breast tumor cells (MCF07). Studies with mice were performed, using the methodology recommended by the OECD (Organisation for Economic Co-operation and Development), to determine in vivo toxicity of the quinazoline compounds, describing the effects caused by different concentrations of quinazoline compounds under study applied to animals. Through the Nuclear Magnetic Resonance Spectrometry of Hydrogen (¹H) was able to identify the final metabolite of catecholamines, the acid in urine homovanílico, chosen to be a compound that appears in high concentrations in urine and to be an excellent diagnostic marker in some neurological diseases. / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Ciências Médicas
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Estudos estruturais de agonistas de acetilcolina pela espectroscopia de RMN e calculos teoricos / Structural studies of acetylcholine agonists by NMR spectroscopy and theoretical calculations

da Silva, Julio Cesar Araujo, 1974- 13 February 2008 (has links)
Orientador: Roberto Rittner / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-11T06:54:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 daSilva_JulioCesarAraujo_M.pdf: 2287772 bytes, checksum: ee8613d61a9f9feb9fa6894b5197e36f (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: Neste trabalho é apresentado o estudo conformacional dos agonistas muscarinicos da acetilcolina (ACh+): carbacol, metacolina e pilocarpina. O estudo baseou-se na análise das constantes de acoplamento 3JHH e nos dados obtidos pelos cálculos teóricos ab initio. O comportamento conformacional destes compostos é descrito principalmente por apenas dois dos seus ângulos diedros. Os resultados dos cálculos teóricos realizados com o nível teórico B3LYP/6- 311+G(d,p), bem como os dados experimentais, apontaram a conformação gauche como a predominante para todos os compostos estudados para o diedro responsável pela atividade farmacológica dos agonistas independente do solvente utilizado. Atribui-se a estabilização da forma gauche a interação eletrostática entre o atomo de nitrogênio positivamente carregado e o átomo de oxigênio da porção éster (OCH2). Os cálculos teóricos mostraram que os conformeros mais estáveis possuem uma distância N+/O menor. Em adição, estudos de NBO mostraram a importância das interações hiperconjugativas sC5H5 s* C6N7 e sC5H5s* O4C5 na maior estabilização dos conformeros gauche. Os conformeros mais estáveis para cada composto sao: aceticolina, TG-; carbacol, AG+; metacolina, TG+; pilocarpina, TG+C / Abstract: This work describes the conformational analysis of muscarine agonists of acetylcholine (ACh+): carbachol, metacholine and pilocarpine. It was performed from the analysis of 3JHH coupling constants and from ab initio theoretical calculations. Their conformational behavior is discussed taking into account the most important dihedral angles. Both the results from theoretical calculations at B3LYP/6-311+G(d,p) as the experimental data indicated that the gauche conformer is predominant, considering the dihedral angle wich is responsible by their pharmacological activity regardless the solvente employed. The stabilization of the gauche conformer was ascribed to the eletrostatic interaction between the positively charged nitrogen atom and the (OCH2) oxygen atom of the ester fragment. This was confirmed by the N+/O smaller distance for the most stable conformers. In addition, NBO data showed the relevant role of sC5H5 s* C6N7 e sC5H5s* O4C5 hyperconjugative interactions of the gauche conformers. The most stable conformers for the above compounds are: : acetycholine, TG-; carbachol, AG+; methacholine, TG+; pilocarpine, TG+C / Mestrado / Quimica Organica / Mestre em Química
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Diferenciação química e determinação das atividades antioxidantes de duas espécies botânicas semelhantes: Eugenia adenocalyx e Eugenia lisboae (Myrtaceae)

Neves, Kidney de Oliveira Gomes, 92-99180-1406 28 July 2017 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-10-16T18:06:21Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Rejected by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br), reason: on 2017-10-16T18:06:46Z (GMT) / Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-10-16T18:07:27Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-10-16T18:07:41Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-16T18:07:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2017-07-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Eugenia genus belongs to the Myrtaceae family and comprises approximately 1038 species with wide distribution in the Amazônia biome. In the Adolpho Ducke Forest Reserve (RFAD), a representative sample of the Terra-Firme ecosystem of Amazônia located in the Amazonas State, it is possible to find species of this genus, such as Eugenia adenocalyx and Eugenia lisboae. The Eugenia presents a botanical complexity and morphological similarity. This work has aimed to characterize the chemical composition and evaluate the antioxidant activities of Eugenia adenocalyx and E. lisboae in order to discriminate the chemical composition and corroborate with morphological studies of these species. The extracts obtained from these two Eugenia were analyzed using spectrometric methods assisted by chemometric tools. This methodology has proved to be efficient in chemical differentiation of these species, since it directs to isolation of the substances responsible for the chemical differentiation. The use of chromatographic and spectrometric techniques has resulted in the isolation and identification of rotundioic acid (1), di-hydro-kaempferol (2) and of di-hydro-kaempferol-3-O-[-xylopyranosyl-(12)]--rhamnopyranoside (3) and from the ethanolic leaves extract of E. lisboae, besides five alkylresorcinols glycosides, 3-O-methyl-5-(1’-hydroxypentyl)-resorcinol-4-O--glucopyranoside (4), 3-O-methyl-5-(1’-hydroxypentyl)-resorcinol-4-O-’’-galloyl)-glucopyranoside (5), 3-O-methyl-5-(1’-hydroxypentyl)-resorcinol-4-O--’’, 6’’-di-galloyl)-glucopyranoside (6), 4-hydroxy-3-O-methyl-5-pentylresorcinol-1-O-[-xylopyranosyl-(16)]--glucopyranoside (7), 4-hydroxy-3-O-methyl-5-pentyl-resorcinol-1-O-[-xylopyranosyl-(16)]--(4’’-galloyl)-glucopyranoside (8) and from the ethanolic leaves extract of E. adenocalyx. Among eight substances described, (3-5) and (8) have not yet been described in the literature. The identification of these substances permitted to verify which chemical composition is related to each species. The statistical analysis of the results from DPPH and ABTS methods have demonstrated that the ethanolic extracts of E. adenocalyx (EF4-3, IC50 = 90.4 g.mL1, EC4-3, mEqT = 1,914.7 g.mL1) have showed the best antioxidant activities. Being this extract slightly rich in alkylresorcinols derivative in their composition. The alkylresorcinol (5) presents range of values of IC50 = 59.37 g.mL1 and mEqT = 1,879.0 g.mL1, and (8) indicates range of IC50 = 59.33 g.mL1 and mEqT = 1,802.3 g.mL1. Therefore, this chemical study has contributed with the chemical knowledge about the Eugenia genus, as well as corroborated with the taxonomic studies of both two similar Amazon species. / O gênero Eugenia pertencente à família Myrtaceae e compreende aproximadamente 1.038 espécies com ampla distribuição no bioma Amazônia. Na Reserva Florestal Adolpho Ducke (RFAD), uma amostra representativa do ecossistema Amazônia de Terra Firme localizada no estado do Amazonas, é possível encontrar espécies desse gênero, como as Eugenia adenocalyx e Eugenia lisboae. Devido à complexidade do ponto de vista botânico e semelhanças entre tais espécies, este trabalho visou caracterizar a composição química e avaliar as atividades antioxidante de Eugenia adenocalyx e Eugenia lisboae, afim de discriminar a composição química e corroborar na identificação morfológica dessas espécies. Os extratos obtidos dessas duas espécies de Eugenia foram analisados empregando-se métodos espectrométricos auxiliados por ferramentas quimiométricas. Essa metodologia mostrou-se eficiente na diferenciação da composição química entre as duas espécies semelhantes, pois direcionou o isolamento das substâncias responsáveis pela diferenciação química entre as espécies. A utilização de técnicas cromatográficas e espectrométricas hifenadas ou não, resultou na identificação do ácido rotundióico (1), dihidro-kempferol (2) e do dihridro-kampferol-3-O-[-xilopiranosil-(12)]--raminopiranosídeo (3) a partir do extrato etanólico de folhas de Eugenia lisboae, e de cinco alquilresorcinois glicosilados, 3-O-metil-5-(1’-hidroxipentil)-resorcinol-4-O--glucopiranosídeo (4), 3-O-metil-5-(1’-hidroxipentil)-resorcinol-4-O-’’-galoil)-glucopiranosídeo (5), 3-O-metil-5-(1’-hidroxipentil)-resorcinol-4-O--’’, 6’’-digaloil)-glucopiranosídeo (6), 4-hidroxi-3-O-metil-5-pentilresorcinol-1-O-[-xilopiranosil-(16)]--glucopiranosídeo (7), 4-hidroxi-3-O-metil-5-pentilresorcinol-1-O-[-xilopiranosil-(16)]--(4’’-galoil)-glucopiranosídeo (8), a partir do extrato etanólico de folhas de Eugenia adenocalyx. Dentre as oitos substâncias descritas nesse estudo, 3, 4, 5 e 8 ainda não foram descritas na literatura. A identificação dessas substâncias possibilitou constatar qual a composição química está relacionada a cada espécie. A análise estatística dos resultados da capacidade sequestrante frente ao radical livre DPPH• e o cátion radical ABTS+• evidenciou que os extratos etanólicos de Eugenia adenocalyx (EF4-3, CI50= 90,4 g.mL-1; EC4-3, mEqT= 1914,7 g.mL-1) apresentam a melhor atividade antioxidante. Esses potenciais antioxidantes se devem a presença dos alquilresorcinois em sua composição, cujas respostas antioxidantes para os alquilresorcinois 5 são CI50 = 59,37 g.mL-1 e mEqT = 1879,0 g.mL-1, e 8 são CI50= 59,33 g.mL-1 e mEqT= 1802,3 g.mL-1. Portanto, este trabalho contribui com o conhecimento químico acerca do gênero Eugenia, bem como corroborou com os estudos taxonômicos dessas duas espécies semelhantes amazônicas.

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