Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-10-15T15:16:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação-Leandro.S.Fernandes.pdf: 1359976 bytes, checksum: 6a343537d69f7467ed412811332b1c45 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-10-15T15:16:59Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação-Leandro.S.Fernandes.pdf: 1359976 bytes, checksum: 6a343537d69f7467ed412811332b1c45 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-15T15:16:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação-Leandro.S.Fernandes.pdf: 1359976 bytes, checksum: 6a343537d69f7467ed412811332b1c45 (MD5) Previous issue date: 2018-06-04 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Seed dispersal is an extremely important process in the population dynamics of plants. This process can be mediated by dispersing agents as in the case of primates. During feeding these animals can spit or swallow the seeds of the fruits. When swallowing the seeds, a process known as endozoochory, these animals can increase germination, or even move seeds away from the parent plant, this can favor plants by avoiding competition, predation and disease on seeds and seedlings. We performed experiments such as the free-living tamarim (Saguinus bicolor) primate in the laboratory, using 23 species of fruits that are part of its diet, to test the effect of the passage of seeds through the digestive tract and which factors influence the time of seed retention. Tamarins favor most defecated seeds, increasing germination (50%) and speed of emergence (38,88%). The retention time was not influenced by the characteristics of the seeds or the amount of fiber in the fruit pulp, and the first appearance of the seeds in the feces was correlated with the quantities of swallowed seeds. Thus, tamarim can be considered an effective dispersant potential because the seeds remain viable after being defecated and the time the seeds are retained possibly favors dispersion. Therefore, seed dispersion mediated by tamarins may be beneficial for the maintenance and recovery of environments where these animals transit. / A dispersão de sementes é um processo extremamente importante na dinâmica populacional das plantas. Esse processo pode ser intermediado por agentes dispersores como no caso dos primatas. Durante a alimentação esses animais podem cuspir ou engolir as sementes dos frutos. Ao engolirem as sementes, processo conhecido como endozoocoria, esses animais podem aumentar a germinação, ou até mesmo, deslocar as sementes para longe da planta progenitora, isso pode favorecer as plantas por evitar a competição, predação e doenças sobre as sementes e plântulas. Realizamos experimentos com o primata sauim-de-coleira (Saguinus bicolor) em laboratório, usando 23 espécies de frutos que fazem parte da sua dieta, para testar o efeito da passagem das sementes através do trato digestório e quais fatores influenciam o tempo de retenção das sementes. Os sauins favorecem a maioria das sementes defecadas, aumentado a germinação (50%) e a velocidade de emergência (38,88%). O tempo de retenção não foi influenciado pelas caraterísticas das sementes ou quantidade de fibras na polpa dos frutos, entretanto, o primeiro aparecimento das sementes nas fezes mostrou-se correlacionado com a quantidades de sementes engolidas. Dessa forma, o sauim pode ser considerado um potencial dispersor eficaz, porque as sementes permanecem viáveis após serem defecadas e o tempo que as sementes ficam retidas possivelmente favorece a dispersão. Portanto, a dispersão de sementes mediada pelos sauins pode ser benéfica para a manutenção e recuperação de ambientes onde estes animais transitam.

A moderna suinocultura vem nos últimos anos avançando no desenvolvimento e no emprego de tecnologias que visam o aumento da performance produtiva e econômica do segmento. As inovações associadas aos métodos de castração e modificadores metabólicos têm sido avaliadas, em particular o uso da imunocastração e dos repartidores de energia (ractopamina). Embora os ganhos zootécnicos e industriais destas tecnologias já estejam bem discutidos, o real impacto do emprego juntas ou isoladas sobre a qualidade tecnológica da carne pelo seu efeito na matriz bioquímica, necessita de estudos mais aprofundados. Desta forma, esta pesquisa científica foi direcionada para avaliar os efeitos, focando nas alterações dos perfis eletroforéticos da carne, advinda de animais produzidos comercialmente, utilizando concomitantemente ractopamina e imunocastração. Foram utilizados 48 suínos, criados comercialmente, sendo 8 suínos por tratamento (machos castrados cirurgicamente - CC, machos imunocastrados - IM, e fêmeas - F) recebendo dietas suplementadas com (CR) ou sem (SR) ractopamina na fase final da terminação. Avaliaram-se as características qualitativas da carne, tais como o pH, a cor objetiva, a capacidade de retenção de água (perda de água por gotejamento - drip loss, perda por cocção - PCOC, e perda por descongelamento - PDESC), maciez objetiva (força de cisalhamento) e perfil eletroforético. A utilização conjunta da imunocastração com a ractopamina influenciou o pH 24 horas do lombo suíno, a luminosidade (L*) e a força de cisalhamento, sendo que o pH e a força de cisalhamento foram maiores e a luminosidade menor em IC-CR na dieta. Porém, essa influência não foi verificada na análise eletroforética unidimensional. O perfil proteico foi significativamente influenciado pelo fornecimento do β-agonista adrenérgico. Diferenças na abundância de peptídeos foram verificadas para as variáveis qualitativas da carne maciez, capacidade de retenção de água (drip loss e descongelamento) e luminosidade. Aumento nos volumes normalizados dos peptídeos reduziu a PDESC e melhorou a maciez objetiva, enquanto que o drip loss aumentou quando não houve a suplementação com ractopamina na dieta. Os resultados demonstraram que somente o β-agonista adrenérgico foi o responsável pelas diferenças verificadas no perfil proteico. O efeito simultâneo imunocastração com a inclusão da ractopamina na dieta não propociou impactos na qualidade tecnológica da carne. / The modern swine industry has in recent years to advance the development and use of technologies aimed at increasing production and economic performance of the segment. Innovations associated methods of castration and metabolic modifiers have been evaluated, in special the use of immunocastration and feed additive (ractopamine). Although the production growth and industrial gains of these technologies are already well discussed, the real impact of employment together or isolated on the technological quality of meat by its effect on the biochemical matrix, requires further study. Therefore, this scientific research was directed to evaluate the effects, concentrating on changes in electrophoretic profiles of meat, resulting animals commercially produced concurrently using ractopamine and immunocastration. 48 animals were used commercially created, 8 per treatment (castrates - CC, immunocastrated - IM, and female - F) fed diets supplemented with (CR) or without (SR) ractopamine at the final stage of finishing. We evaluated the qualitative characteristics of meat, such as pH, color, water-holding capacity (drip loss, cooking loss - PCOC, and loss defrosting - PDESC) objective tenderness (shear force) and electrophoretic profile. The combined use of immunocastration with ractopamine influence pH 24h swine loin, the lightness (L*) and shear force, and pH, and shear force were higher and lower luminosity in IC-CR in the diet. However, this effect wasn\'t seen in the one-dimensional electrophoretic analysis. The protein profile was significantly influenced by the supply of β-adrenergic agonist. Differences in the abundance of peptides were checked for qualitative variables of meat tenderness, water retention capacity (drip loss and defrosting) and luminosity. The increase in the volume of standard peptides pDesc reduced and improved objective tenderness, while the drip loss increased when no supplementation with dietary ractopamine. The results demonstrate that only the β-adrenergic agonist was responsible for the observed differences in the protein profile. The effect simultaneously immunocastration with the addition of ractopamine in the diet not influence impacts on technological meat quality.

O estudo teve como objetivos analisar as evidências disponíveis na literatura sobre o processo de contagem cirúrgica (compressas, instrumentos cirúrgicos e perfurocortantes) e analisar como ocorre o processo de contagem cirúrgica, segundo a opinião dos enfermeiros que atuam em unidades de centro cirúrgico de hospitais de uma cidade localizada no interior do Estado de São Paulo. Para alcançar os objetivos propostos, a pesquisa foi conduzida em duas fases: a elaboração de revisão integrativa e a condução de estudo descritivo. A busca dos estudos primários para inclusão na revisão integrativa foi realizada nas bases de dados PubMed, CINAHL e LILACS. A amostra da revisão integrativa foi composta de 28 estudos primários, agrupados em três categorias: fatores de risco para retenção de itens cirúrgicos, processo de contagem cirúrgica e uso de tecnologias para o aprimoramento do processo de contagem cirúrgica. A elaboração da revisão integrativa possibilitou a síntese de evidências sobre o processo de contagem cirúrgica, na qual foi possível detectar os fatores de risco para retenção de itens cirúrgicos, como o processo de contagem cirúrgica deve ser realizado, bem como por quem e quando; além do conhecimento das tecnologias adjuntas que podem aprimorar o processo de contagem manual. O estudo descritivo foi conduzido em 16 unidades de centro cirúrgico, com a participação de 55 enfermeiros que atuavam diretamente neste setor dos hospitais selecionados. Para a coleta de dados, foi elaborado instrumento submetido à validação aparente e de conteúdo por cinco juízes. Os participantes do estudo responderam a questões sobre o processo de contagem cirúrgica (compressas, instrumentos cirúrgicos e perfurocortantes): como era realizado, por quem e quando. Quando o enfermeiro indicou que, no serviço de saúde, não era executada a contagem de algum dos itens cirúrgicos investigados, solicitou-se a sua opinião de como deveria ser realizado determinado processo. Assim, 52 (94,5%) participantes responderam que o processo de contagem cirúrgica era realizado no seu local de trabalho e três (5,5%) não. A contagem de instrumentos cirúrgicos era realizada, de acordo com 55,8% dos enfermeiros (n=29); 88,5% (n=46) dos participantes afirmaram que o processo de contagem de compressas era executado e 48,1% (n=25) dos enfermeiros informaram a realização do processo de contagem de perfurocortantes. A Organização Mundial de Saúde preconiza como item para a segurança do paciente que o processo de contagem cirúrgica seja realizado em qualquer cirurgia, e o enfermeiro perioperatório tem papel fundamental neste processo e na prevenção de retenção de itens cirúrgicos. Esse profissional deve implementar protocolos de execução desse processo pautados em evidências recentes, na unidade de centro cirúrgico. Entretanto, para o processo de contagem cirúrgica ocorrer efetivamente na prática clínica, há necessidade de recursos humanos treinados e de dispositivos que auxiliem na contagem, como lousa na sala de operação, recipientes exclusivos para colocação de compressas e perfurocortantes, além do uso adequado de tecnologias como raios-X, compressas com código de barras e compressas com marcadores de radiofrequência. Assim, a instituição de saúde deve dar o suporte necessário para a adequada realização do processo de contagem cirúrgica / The aims of this study were to analyze the evidence of surgical count process (sponges, surgical instruments and sharps) available in literature and examine how the surgical count process takes place, according to the opinion of nurses working in surgical units of hospitals of a city in upstate São Paulo. The study was conducted in two phases: an integrative review and a descriptive study. The search for primary studies to be included in the integrative review was conducted in PubMed, CINAHL and LILACS databases. The integrative review sample consisted of 28 primary studies, grouped into three categories: risk factors for retained surgical items, surgical count process and using technologies to improve the surgical count. The integrative review allowed synthesizing the evidence on the surgical count process, which enabled to detect the risk factors for retained surgical items, how the process should be performed, as well as who should perform it and when; in addition to the identifying the knowledge of supporting technologies that could improve the manual counting process. The descriptive study was performed in 16 surgical units, counting with the participation of 55 nurses working directly in the referred unit of the selected hospitals. Data collection was performed using an instrument previously submitted to apparent and content validation by five judges. The participants answered questions regarding the surgical count process (sponges, surgical instruments and sharps): who performed it, how and when. Whenever nurses indicated that, at their health service, there were flaws in counting any of the investigated surgical items, they were asked about their opinion as to how the process should be performed. Fifty-two (94.5%) participants answered that the surgical count process was performed at their workplace whereas three (5.5%) stated it was not. According to 55.8% of nurses (n=29) surgical instruments were counted; 88.5% (n=46) of participant reported that the sponges count process was performed, and 48.1% (n=25) informed that sharps were counted. The World Health Organization recommends the surgical count process as a patient safety item, and that it should be performed in every surgery, with the perioperative nurse playing a key role in this process as well as in avoiding the retained surgical items. Nurses should implement protocols for performing this procedure in the surgical unit, supported by recent evidence. Nevertheless, to ensure the surgical count process is effective, the staff must be properly trained and specific devices to assist the counting procedure must be made available, such as keeping whiteboards operating room, as well as exclusive containers for placing sponges and sharps, in addition to an appropriate utilization of supporting technologies such as X- rays, bar-coded sponges and radio frequency tagged sponges. Thus, health institutions should provide the necessary support for an effective surgical count process

Tem sido reportado que os danos induzidos pela radiação ultravioleta (RUV) são devidos principalmente pela geração de espécies reativas de oxigênio (EROs). Assim, compostos capazes de inibir a ação e a formação destas EROs, são capazes de proteger a pele dos danos induzidos pela RUV. O objetivo deste trabalho foi obter o extrato padronizado de calêndula (calendula officinalis), avaliar sua toxicidade em cultura de células e sua eficácia antioxidante. Além disso, formulações tópicas contendo este extrato foram desenvolvidas e sua capacidade de penetração na pele foi avaliada. Foi avaliado também, o efeito protetor do extrato de calêndula e de formulações tópicas adicionadas deste extrato contra os danos induzidos pela radiação UVB na pele, em camundongos sem pêlos irradiados com radiação UVB. O conteúdo de polifenóis, flavonóides, rutina e narcissina encontrado no extrato de calêndula foram 0,46%, 0,29%, 239 µg/mL e 1,83 mg/mL, respectivamente. A avaliação da eficácia antioxidante demonstrou o efeito dose-dependente do extrato de calêndula contra diferentes radicais. O experimento de citotoxicidade demonstrou que o extrato de calêndula não foi tóxico para fibroblastos de camundongo (L929), células de hepatoma humano (HepG2) e células de melanoma de camundongo (B16F10) em concentrações abaixo ou iguais a 100 µL/mL. Entretanto, em concentrações maiores ou iguais a 200 µL/mL foi observado efeito tóxico. Todas as formulações foram estáveis fisicamente e funcionalmente. A formulação tipo gel foi mais eficiente para reter o extrato de calêndula na pele, uma vez que foram detectados 0,21 µg/cm2 de narcissina e 0,07 µg/cm2 de rutina na epiderme viável. O extrato de calêndula e a formulação gel foram capazes de manter os níveis de GSH próximos aos níveis de animais não irradiados. Entretanto, o extrato de calêndula e a formulação gel não foram capazes de inibir a atividade de metaloproteinases e mieloperoxidases aumentadas pela irradiação UVB. Além disso, a formulação gel adicionada de extrato de calêndula reduziu modificações histológicas induzidas pela radiação UVB na pele, como modificações das fibras de colágeno. A aplicação tópica de extrato de calêndula em formulações tipo gel promoveu efeito fotoprotetor em camundongos sem pêlo, provavelmente devido a uma possível melhoria da síntese de colágeno no tecido conjuntivo subepidermal. Estes resultados dão boas perspectivas para utilizar o extrato de calêndula topicamente ou oralmente para prevenir e/ou tratar os danos induzidos pela radiação UV na pele. / It has been reported that UV-induced damage is due mainly to the generation of reactive oxygen species (ROS). Then, compounds able to inhibit the action and the formation of these ROS, will be able to protect the skin from UV-induced damage. Thus, the purpose of this work was to obtain standardized marigold extract (calendula officinalis), to evaluate their toxicity in cell culture and their antioxidant efficacy. In addition, topical formulations added with this extract were developed and their penetration skin capacity was evaluated. It was also investigated, the protective effect of the marigold extract and of the topical formulations added with this extract against UVB-induced damages in skin, in ultraviolet-irradiated hairless mice. The polyphenols, flavonoids, rutin and narcissin contents found in marigold extract were 0.46%, 0.29%, 239 µg/mL and 1.83 mg/mL, respectively. The evaluation of antioxidant efficacy demonstrated the dose-dependent effect of marigold extract against different radicals. Cytoxicity experiments demonstrated that marigold extract was not cytotoxic for mice fibroblasts (L929), human hepatoma cells (HepG2) and mouse melanoma cells (B16F10) at concentrations less than or equal to 100 µL/mL. However, at concentrations greater than or equal to 200 µL/mL were observed toxic effects. All formulations were physical and functionally stable. Gel formulation was the most effective for delivery of marigold extract in skin, since it was detected 0.21 µg/cm2 of narcissin and 0.07 µg/cm2 of rutin in the viable epidermis. Marigold extract and gel formulation were able to maintain glutathione reduced levels close to non-irradiated animals. However, marigold extract and gel formulation were not able to inhibit the gelatinase-9 and myeloperoxidase activities increased by UVB irradiation. In addition, gel formulation added to marigold extract reduced the histological skin changes induced by UVB-irradiation, as modifications of collagen fibrils. Topical application of marigold extract in gel formulation provided photoprotective effect in hairless mice, probably related to a possible improvement of the collagen synthesis in the subepidermal connective tissue. These results give good perspectives to apply marigold extract topically and orally in order to prevent and/or treat UV-damaged skin.

The water is the most important factor and, at the same time, the more limitant than the plant needs for its development. Short periods of hidric stress can reduce crop productivity. In this way, the importance of knowing the rainfall amount that is retained in plant, straw and soil is fundamental to calculating the exact amount of water requested by the plant in their different growth stages. The objective of this work was to determine the water retention in the straw, in the soil and in the plants dossal after a precipitation, in the initial phase of growth of corn and bean crops. The drybeans (cv Rio Tibagi) and corn (hybrid Pioneer 30R53) were sowed in no-till (2, 4 and 6 t straw ha-1) and conventional (0 t of straw in covering) during 2006 agricultural year. The experimental design for corn was a bifatorial (2x4) and 3 replications, and for bean was a factorial and 3 replications. For corn two row spacings were tested (45 and 75 cm). Artificial rains were applied using a portable simulator of multiple nozzles, which applied 4 to 8 mm, with 30 mm h-1 rain intensity. They were made ridges in the area, (with steepness to drain the water) and a plastic canvas covered the soil surface, so that water that arrived to the plastic drained for the surface until a collector placed among two plants rows. Straw rugs were made with different amounts of straw (0, 2, 4 and 6 t ha-1) and put among the plants rows above soil surface (plastic canvas). The determination of the amount of water retained was made through the differences of weightings. The amount of applied water with the simulator was known using pluviometers; the straw rugs were weighed before and after rain simulation (for difference, it was obtained the value of water retention in straw). The water that passed through straw and was drained until the plastic was collected after the rain, in the collector placed between the plants lines and measured with a test tube, and obtained the amount of water that arrived to the soil, that in practice corresponds to the water that infiltrates in the soil. For difference, was obtained the water that was retained in the dossal. Statistical analysis the variance analysis, with regression in level of 5%. Water retention in the initial phase of corn was larger in the soil, for all straw amounts, and, in the final phase, water retention in plants dossal was increased. The largest water retention in straw was with 6 t ha-1, being the largest retention in the spacing of 45 cm among rows. In the dossal, the retention was smaller in the beginning and larger at the end, with the plants development (larger leaf area index). In the soil, water retention was larger where there was less straw in the initial phase. The retention was larger where there was more straw covering and in the smallest spacing (45 cm), being the soil retention larger without covering and with 75 cm among lines. In the dossal, retention was larger in the spacing 45 cm. In the black bean, water retention in straw was larger in the initial phase and with larger amount of straw, and in soil the largest water retention happened without covering (7,4mm). In the plants dossal water retention increased according to crop development. / A água é o fator mais importante e, ao mesmo tempo, o mais limitante que a planta necessita para o seu desenvolvimento. Curtos períodos de deficiência hídrica podem reduzir a produtividade das culturas. Assim, a importância de saber a quantidade de água que fica retida na planta, na palha e no solo é fundamental na hora de calcular a quantidade exata de água requerida pela planta nos seus diferentes estágios de crescimento. O objetivo deste trabalho foi determinar a retenção de água no solo, na palha e no dossel de plantas após uma precipitação, na fase inicial de crescimento das culturas do milho e feijão. O feijão (cv Rio Tibagi) e o milho (híbrido Pioneer 30R53) foram semeados no sistema plantio direto (2, 4 e 6 t palha ha-1) e convencional (0 t de palha em cobertura) durante o ano agrícola de 2006. O delineamento experimental para o milho foi um bifatorial (2 x 4) e três repetições, e o do feijão foi um fatorial com três repetições. No milho foram testados dois espaçamentos entre linhas (45 e 75 cm). As chuvas artificiais foram aplicadas utilizando-se um simulador estacionário de bicos múltiplos e oscilantes, o qual aplicou de 4 a 8 mm, numa intensidade de 30 mm h-1. Foram feitos camalhões na área, (com declividade para dar escoamento a água) e na superfície do solo foi colocada uma lona plástica para que a água escoasse pela superfície do solo até um coletor colocado entre duas linhas de plantas. Foram confeccionados tapetes de palha com diferentes quantidades de palha (0, 2, 4 e 6 t ha-1) e colocados entre as linhas de plantas acima da superfície do solo (lona plástica). A determinação da quantidade de água retida foi feita através das diferenças de pesagens. A quantidade de água aplicada pelo simulador era conhecida através de pluviômetros; os tapetes de palha eram pesados antes de serem colocados entre as linhas de plantas e após a chuva simulada (por diferença, era obtido o valor da água retida na palha); a água que passava pela palha e escoava até o plástico era coletada após a chuva no coletor colocado entre as linhas de plantas e medida com proveta, e, assim obtido o valor da quantidade de água que chegava ao solo, que na prática corresponde a água que infiltra no solo. Por diferença foi calculada a água que ficou retida no dossel. Foi realizada análise da variância, com regressão em nível de 5%. A retenção de água na fase inicial da cultura do milho foi maior no solo, para todas as quantidades de palha, e, na fase final aumentou a retenção no dossel de plantas. A maior retenção de água na palha foi na quantidade de 6 t ha-1, sendo a maior retenção no espaçamento de 45 cm entre linhas. No dossel, a retenção foi menor no início e maior no final, com o desenvolvimento da mesma (maior Índice de área foliar). No solo, a retenção foi maior onde havia menos palha na fase inicial. A retenção foi maior onde havia mais palha na cobertura e no menor espaçamento (45 cm), sendo a retenção no solo maior onde não havia cobertura e a 75 cm entre linhas. No dossel, a retenção foi maior no espaçamento 45 cm, com menor quantidade de palha em cobertura. No feijão, a retenção na palha foi maior na fase inicial e com maior quantidade de palha em cobertura, sendo que no solo a maior quantidade de água chegou onde não havia cobertura. No dossel de plantas a retenção de água foi aumentando conforme o desenvolvimento da cultura.

O splicing alternativo é um processo no qual moléculas idênticas de pré-mRNA são processadas de diferentes formas. Ele é fundamental em organismos complexos, pois é responsável por criar uma ampla diversidade de proteínas a partir de um número relativamente pequeno de genes. Contudo, poucas proteínas advindas do splicing alternativo já foram identificadas, visto que a maioria dos espectros de espectrometria de massa em tandem (MS/MS) não encontra sequências correspondentes nos diversos bancos de dados de proteínas disponíveis. Entre diversos fatores, isso ocorre porque um número reduzido de eventos de splicing alternativo (ASEs) são conhecidos e devidamente estudados. Nesse trabalho, o espectro de eventos observáveis foi ampliado por meio da análise de eventos complexos de splicing alternativo (CASEs), que consideram múltiplos ASEs em um ou diferentes transcritos. Foi desenvolvido um novo método de análise utilizando expressões regulares (regexes) associada a uma sintaxe baseada em caracteres intuitivos. O método de análise e a sintaxe foram implementados em uma ferramenta web denominada de SPLOOCE (http://www.bioinformatics-brazil.org/splooce) que também apresenta ferramentas extras de análise. Adicionalmente, os subestimados eventos do tipo retenção de íntron (IR) foram explorados em busca de evidências funcionais por meio de análises de MS/MS. Como resultado, eventos bastante incomuns foram observados no proteoma humano, sugerindo que muito pouco ainda é conhecido sobre a complexidade transcriptômica e proteômica humana. Portanto, com base nesses dados, esse trabalho representa um grande avanço no estudo de fenômenos de splicing alternativo ainda pouco explorados. / Alternative splicing is defined, basically, as a process in which identical pre-mRNA molecules are processed in different ways in terms of usage of exon/introns borders. It is a fundamental process in complex organisms, and is responsible for creating a large diversity of proteins from a relatively small number of genes. However, just a few proteins resulted from alternative splicing were already identified, since only a small part of \\emph mass spectrometry (MS/MS) spetras match proteins in sequence databases. Among different factors, it occurs because a reduced number of alternative splicing events (ASEs) are known and properly studied. In this work, the landscape of observable events was amplified through the analysis of complex alternative splicing events (CASEs), which consider different ASEs within the same or different transcripts. A method of analysis was developed using regular expressions (regexes) associated with a syntax composed of intuitive characters. Those features were implemented in a web tool called SPLOOCE (http://www.bioinformatics-brazil.org/splooce) that also has extra analysis tools.Furthermore, the understudied events known as intron retention (IR) were explored using MS/MS analyses as a strategy to identify functional roles. As result, very uncommon events were observed in human proteome, suggesting that little is currently known about the complexity of the human proteome and transcriptome. Based on those data, it can be concluded that this work represents a significant advance in the study of uncommon and understudied alternative splicing events.

Submitted by Nadir Basilio (nadirsb@uninove.br) on 2016-06-21T14:15:01Z No. of bitstreams: 1 Marcius Koehler.pdf: 733203 bytes, checksum: 9a6d64929fe7426744bc83e9d23505e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-21T14:15:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcius Koehler.pdf: 733203 bytes, checksum: 9a6d64929fe7426744bc83e9d23505e5 (MD5) Previous issue date: 2016-03-30 / This work dealt with the topic networks in the basic context of Brazilian football. The study addressed small organizations involved in the Brazilian Base Football Movement - MFBB initiated by the Brazilian Football Confederation - CBF returned to discuss the problems of basic categories, mainly of harassment and "theft" of young talent and generate improvement proposals . This movement resulted in the formation of a network of grassroots clubs organized later by the Brazilian Football Association Executives - ABEX Football. The research was a multi-case study, qualitative, exploratory type, in order to explain how the network training contributed to the retention of talent in small clubs of Brazilian football. Processing of the data was collected mainly with semi-structured interviews and analyzed in tables (Word). We interviewed two representatives of ABEX, representatives of three clubs entered the network and three bookies entrepreneurs soccer athletes. It was based on intra-case analysis and inter-case performed to compare the data and obtain search results valid for the whole sample. As a result of research, it was found that the network interface of the base club has great influence on the retention of young athletes. They were identified and analyzed other elements that helped in the study for the research goal was reached. In addition, it was noticed that the relationship network, particularly for small clubs studied played an important role in young talent retention or receipt of compensation from its output. / Esta dissertação tratou do tema redes no contexto do futebol brasileiro de base. O estudo abordou pequenas organizações envolvidas no Movimento de Futebol de Base Brasileiro - MFBB iniciado pela própria Confederação Brasileira de Futebol – CBF voltado para discutir os problemas das categorias de base, principalmente os de assédio e “roubo” de jovens talentos e gerar propostas de melhorias. Este movimento resultou na formação de uma rede de clubes de base organizados mais tarde pela Associação Brasileira de Executivos do Futebol – ABEX Futebol. A pesquisa realizada foi um estudo multi-caso, de natureza qualitativa, do tipo exploratório, com o objetivo de explicitar como a formação em rede contribuiu para a retenção de talentos em pequenos clubes do futebol brasileiro. O tratamento dos dados foi coletado principalmente com entrevistas semi-estruturadas em profundidade e analisados em tabelas (Word). Foram entrevistados dois representantes da ABEX, representantes de três clubes inseridos na rede e três empresários agenciadores de atletas de futebol. Baseou-se em análises intra-caso e inter-caso realizadas para se comparar os dados e obter resultados de pesquisa válidos para o conjunto da amostra. Como resultado de pesquisa, constatou-se que a rede de relação dos clubes de base tem grande influencia na retenção de jovens atletas. Foram identificados e analisados outros elementos no estudo que auxiliaram para que o objetivo de pesquisa fosse atingido. Além disto, percebeu-se que a rede de relação, principalmente para os pequenos clubes estudados tiveram papel importante na retenção do jovem talento ou no recebimento da indenização proveniente da sua saída.

O edentulismo acomete grande parcela da população mundial, especialmente os idosos, gerando perda da função mastigatória, desordens nutricionais, estética desfavorável e redução da qualidade de vida. Como alternativa a esses problemas, as overdentures implanto retidas tem representado uma modalidade de tratamento eficiente para reabilitação da mandíbula. Assim, o presente estudo teve por objetivo desenvolver e avaliar a efetividade de dois modelos de mini-implantes dentários e um componente protético, cápsula de retenção para overdentures mini-implante retidas. Para tal, um total de 30 mini-implantes (n=10) foram utilizados: modelo comercial Intra-Lock® System, experimental rosqueado e experimental helicoidal. Ambos os mini-implantes desenvolvidos no estudo foram confeccionados em titânio Grau IV, nas dimensões de Ø 2,0 mm x 10 mm de comprimento e submetidos a tratamento de superfície nanométrico. O desempenho dos mesmos foi comparado ao modelo comercial selecionado quanto à estabilidade primária, por meio de torque de inserção e ensaio de arrancamento e à distribuição de tensões, através dos métodos fotoelástico e de correlação de imagens digitais (CID). Foram realizados carregamentos puntiformes axiais e oblíquos (inclinação de 30º do modelo), com cargas de 100 N para a fotoelasticidade e de 250 N axial e 100 N oblíquo para a CID. Para análise do componente protético foi utilizado o teste de resistência à fadiga. 60 cápsulas (n=20): Poliacetal, Politetrafluoretileno (PTFE) e o-ring convencional (Intra-Lock®) foram capturadas aos pares, com resina acrílica e submetidas a 3625 ciclos de inserção/remoção, simulando 30 meses de uso da overdenture. A deformação interna e externa dos componentes foi avaliada por meio de Estereomicroscópio Óptico. Os dados obtidos foram submetidos a ANOVA e teste de Tukey (&alpha;=0,05). O torque de inserção (TI) e ensaio de arrancamento apresentaram significância estatística para todos os modelos (p<0,05), sendo o TI maior para o mini-implante rosqueado e a força máxima de arrancamento para o modelo Intra-Lock®. Quanto à análise de tensões por meio da fotoelasticidade verificou-se de maneira geral, maiores tensões no terço médio e apical dos mini-implantes. O mesmo padrão foi observado para a CID, porém, neste caso, com tensões significativamente maiores (p<0,05) para os mini-implantes rosqueados na condição de carregamento axial, para o oblíquo não foram encontradas diferenças significativas (p>0,05). Quanto à análise dos componentes protéticos, a cápsula de poliacetal apresentou a maior retenção (p<0,05), seguida do o-ring e PTFE. Menor deformação foi observada para o o-ring (p<0,05) e maior deformação interna (p<0,05), após a realização da fadiga, para o poliacetal. O mini-implante rosqueado apresentou de modo geral estabilidade primária e distribuição de tensões comparável ao modelo comercial avaliado. O componente protético de poliacetal demonstrou superioridade em relação ao o-ring da Intra-Lock® quanto à força de retenção e apesar da maior deformação interna sofrida, sugere-se sua substituição após no mínimo 30 meses de uso da overdenture / Edentulism affects a large part of the world population, especially the elderly, generating loss of masticatory function, nutritional disorders, unfavorable esthetics and reduction of quality of life. As an alternative to these problems, overdentures implant retained have represented an efficient treatment modality for mandibular rehabilitation. Thus, the present study aimed to develop and evaluate the effectiveness of two models of dental mini-implants and a prosthetic component, retention caps for overdentures mini-implant retained. To do this, a total of 30 mini-implants (n=10) were used: Intra-Lock® System commercial model, experimental threaded and experimental helical. Both mini-implants developed in the study were made in Titanium Grade IV, in the dimensions of Ø 2.0 mm x 10 mm in length and submitted to a nanometric surface treatment. Their performance were compared to the commercial model selected for primary stability by means of insertion torque and pullout test and stress distribution using photoelastic and digital image correlation (DIC) methods. Axial and oblique punctiform loads (30º inclination of the model) were performed, with loads of 100 N for photoelasticity and 250 N axial and 100 N oblique for DIC. For the analysis of the prosthetic component, the fatigue strength test was used. 60 capsules (n=20): Polyacetal, Polytetrafluoroethylene (PTFE) and conventional O-ring (Intra-Lock®) were captured in pairs with acrylic resin and subjected to 3625 insertion/removal cycles, simulating 30 months of overdenture use. The internal and external deformation of the components was evaluated using an Optical Stereomicroscope. Data were submitted to ANOVA and Tukey\'s test (&alpha;=0.05). The insertion torque (IT) and pullout test were statistically significant for all models (p<0.05), with IT being highest for the threaded mini-implant and maximum pulling force for the Intra-Lock® model. As for stress analysis by photoelasticity, it was generally observed that there were higher tensions in the middle and apical third of the mini-implants. The same pattern was observed for the DIC, but in this case, with significantly higher stresses (p<0.05) for the mini-implants threaded in the axial loading condition, no significant differences were found for the oblique (p>0.05). As for the analysis of prosthetic components, the polyacetal caps presented the highest retention (p<0.05), followed by o-ring and PTFE. Lower deformation was observed for o-ring (p<0.05) and greater internal deformation (p<0.05), after fatigue, for polyacetal. The threaded mini-implant generally showed primary stability and strain distribution comparable to the commercial model evaluated. The polyacetal prosthetic component showed superiority over the Intra-Lock® o-ring for the retention force and despite the greater internal deformation suffered, it is suggested to replace it after at least 30 months of overdenture use

A função condutividade hidráulica é um dos parâmetros essenciais para o estudo do fluxo em solos não saturados, permitindo abordar, dentre outros, o avanço da frente de umedecimento e questões como a irrigação e drenagem de solos. Para determinar a condutividade hidráulica não saturada de um solo típico da região Centro-Oeste do Estado de São Paulo, utilizou-se o infiltrômetro de disco. Este equipamento permite conduzir a infiltração de água, estando esta sujeita a um potencial negativo. Com os dados de infiltração acumulada e tempo acumulado obtidos em cada ensaio, foi possível determinar os valores da condutividade hidráulica não saturada e sortividade. Os cálculos foram feitos por diferentes métodos para cada ensaio realizado com o infiltrômetro de disco e comparadas com resultados de ensaios utilizando o permeâmetro Guelph. Observou-se que as condutividades hidráulica não saturadas obtidas com o infiltrômetro de disco tenderam a valores próximos das fornecidas indiretamente por meio do permeâmetro Guelph, com dispersão de aproximadamente uma ordem de grandeza para cada sucção. Também se observou que a condutividade hidráulica não saturada tende a diminuir conforme aumenta a sucção imposta ao solo, mesmo considerando a estreita faixa de sucções usadas nos ensaios. Notou-se ainda pequena variação nas condutividades hidráulicas saturadas calculadas por meio do infiltrômetro de disco, por meio de medidas diretas utilizando o permeâmetro Guelph e ensaios de permeabilidade realizados em laboratório. / The hydraulic conductivity function is essential to the study of water flow in unsaturated soils. From function there can be derived the advancement of the humidification (saturation) front, among other parameters, which is essential to projects of irrigation and drainage of soils. A disk infiltrometer was used to determine the unsaturated hydraulic conductivity of a sample of typical soil from central São Paulo, Brazil. The disk infiltrometer apparatus conducts the infiltration water, which is held at negative potential. Data for cumulative infiltration and elapsed time for each test was used to determine values of unsaturated hydraulic conductivity and sorptivity. Different methodology was applied in the calculations. Data for each experiment carried out utilizing the disk infiltrometer was compared to data obtained utilizing the permeameter of Guelph. It was observed that the unsaturated hydraulic conductivity obtained through the disk infiltrometer yielded values near those obtained indirectly by the permeameter of Guelph, which showed dispersion approximately within one order of magnitude for each suctioning performed. Furthermore, it was observed that the unsaturated hydraulic conductivity tends to diminish in magnitude in an inverse relation to the suction pressure subjected by the soil, even after considering the narrow band of suction pressures carried out in the tests. It was further observed a small variation in the saturated hydraulic conductivities computed from data obtained directly from the infiltrometer disk, the permeameter of Guelph, and other permeability tests done in laboratory.

A hipovitaminose de vitamina D é um problema global de saúde e a sua deficiência compromete funções importantes ao corpo humano. A suplementação oral, políticas de fortificação em alimentos e mudanças dos hábitos de vida são medidas efetivas para solucionar este problema. Porém, pessoas com doença de Crohn, celíaca, fibrose cística, bypass gástrico e que fazem uso de medicamentos sequestradores de ácido biliares possuem a absorção intestinal de vitamina D comprometida. A via transdérmica pode ser uma alternativa de administração de vitamina D3, porém poucas referências bibliográficas abordam sobre o assunto. A proposta do presente estudo é o desenvolvimento de sistemas transdérmicos com a combinação de promotores de permeação químicos: lecitina de soja, palmitato de isopropila, etoxidiglicol (Transcutol® CG), propilenoglicol e etanol, acrescidos do ingrediente ativo vitamina D3, a validação analítica para quantificação do ativo em Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE), a avaliação da estabilidade, segurança, retenção e permeação cutânea. A validação do método analítico de quantificação da vitamina D3 em CLAE foi considerada específica, linear, precisa e exata. O limite de detecção foi 20 ng/mL e de quantificação 40 ng/mL. Os testes de estabilidade foram realizados (preliminar, acelerado e normal) e a melhor condição de armazenamento foi a geladeira (5,0 ± 2,0 ºC) durante 90 dias. A condição de radiação luminosa foi a menos adequada, o que indica que o armazenamento deve ser realizado em frascos protegidos da luz (âmbar). No teste de segurança de irritação (HET-CAM) as formulações testadas foram consideradas não irritantes. No teste de retenção e permeação cutânea a solubilidade da vitamina D3 foi avaliada para garantir a sink condition do líquido receptor escolhido: Phosfate Buffer Saline (PBS) com etanol a 50% e a integridade da pele foi garantida com o teste de perda de água transepidérmica (TEWL). A formulação desenvolvida com a presença de todos os promotores de permeação avaliados (F1) e o controle, apenas com a presença do etanol e o propilenoglicol, foram avaliados. A F1 permaneceu na superfície da pele, por possuir maior afinidade com a fase oleosa da formulação e houve tendência de hidratação desta formulação. O controle demonstrou uma retenção cutânea em 4 h no estrato córneo e em 24 h na epiderme e derme. Concluiu-se que a formulação desenvolvida é estável, segura e a vitamina D3 ficou retida na pele, o que indica o uso tópico da mesma. A alta lipofilicidade foi a justificativa dos resultados apresentados e futuros estudos podem ser realizados com derivados menos lipofílicos da vitamina D para avaliar a via transdérmica. / Hypovitaminosis D is a global health issue and vitamin D deficiency compromises important functions to the human body. Oral supplementation, fortification food and changes in live style are effective measures to solve this problem. However, people with Crohn\'s disease, celiac disease, cystic fibrosis, gastric bypass and who use bile acid-binding medications have compromised intestinal vitamin D absorption. The transdermal route may be an alternative for vitamin D3 administration, but few references refer to the subject. The purpose of the present study is the development of transdermal systems with the combination of penetrations enhancers (soybean lecithin, isopropyl palmitate, ethoxydiglycol (Transcutol® CG), propylene glycol and ethanol) with vitamin D3, the analytical validation for quantification of the active in High Performance Liquid Chromatography (HPLC), stability assessment, safety, skin retention and permeation. The validation of the analytical method for quantification of vitamin D3 in HPLC was considered specific, linear, precise and accurate. The limit of detection was 20 ng/mL and 40 ng/mL. Stability assessment was performed and the appropriate storage condition was the refrigerator (5.0 ± 2.0 ° C) for 90 days. The indirect solar radiation condition was not adequate, which indicates that the storage should be performed in light-protected bottles (amber). In the irritation safety test (HET-CAM) the formulations tested were considered non-irritant. In the skin permeation and retention test the solubility of vitamin D3 was evaluated to guarantee the sink condition of the receptor fluid: Phosfate Buffer Saline (PBS) with 50% ethanol and skin integrity was guaranteed with Transepidermal Water Loss (TEWL). The developed formulation with the presence of all penetrations enhancers evaluated (F1) and the control formulation with the presence of ethanol and propylene glycol were assessed. F1 remained on the surface of the skin, because it had greater affinity with the oily phase of the formulation and there was tendency of hydration to this formulation. The control formulation demonstrated skin retention in 4 hours in the stratum corneum and in 24 hours in the epidermis and dermis. The study concluded that the formulation developed is stable, safe and vitamin D3 was retained in the skin, which indicates the topical use. High lipophilicity was the explanation of the presented results and future studies can be carried out with less lipophilic derivatives of vitamin D to evaluate the transdermal route.