Orientador: Adjair Antonio do Nascimento / Banca: Rosangela Zacarias Machado / Banca: Milton Hissashi Yamamura / Resumo: A espécie Kerodon rupestris, popularmente conhecida como mocó, é um roedor da Família Caviidae. Poucas pesquisas foram realizadas com essa espécie, principalmente as relacionadas aos seus parasitos. Dessa forma, este trabalho objetivou conhecer a fauna helmintológica de mocós criados na região semi-árida do Rio Grande do Norte. Foram utilizados 16 animais (sete machos e nove fêmeas), sendo sete jovens e nove adultos. Nove animais foram capturados no seu habitat natural e sete procedentes do cativeiro localizado no Centro de Multiplicação de Animais Silvestres da Escola Superior de Agricultura de Mossoró. Após o sacrifício, os animais foram necropsiados e o conteúdo resultante de cada segmento do trato digestório foi fixado e envasado em frascos individuais, identificados e enviados ao Laboratório de Helmintologia da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias da Universidade Estadual Paulista - Câmpus de Jaboticabal. Ainda foram observados quanto à presença de parasitos a traquéia, coração, pulmão, fígado e rins. Para classificação dos helmintos seguiu-se a metodologia descrita na literatura, além de cortes histológicos para o estudo da sínlofe. Dos 16 animais necropsiados, foram coletados 113 helmintos, sendo cinco espécies de nematódeos (Paraspidodera uncinata, Trichostrongylus colubriformis, Trichuris gracilis, Trichuris muris e Vianella lenti) e uma de cestódeo (Thysanotaenia congolensis), sendo o T. colubriformis o nematódeo mais prevalente. Não houve relação significativa entre os parasitos e a idade do hospedeiro (p>0,05). Em relação à carga parasitária e espécies de helmintos os animais de vida livre estavam mais parasitados. / Abstract: The brazilian rodent rock cavy (Kerodon rupestris) belongs to the Family Caviidae. Only a few researches were accomplished with this species, and just a little is known about its parasites. This paper aims to study the helminthfauna of free ranging and captivity Kerodon rupestris growth in the semi-arid area of Rio Grande do Norte state, Brazil. Sixteen animals, (seven male and nine females), seven immature and nine adults, were studied. The nine free-ranging animals were caught in their natural habitat, and the seven captivity animals were procedent from the Centro de Multiplicação de Animais Silvestres da Escola Superior de Agricultura de Mossoró, Rio Grande do Norte State, Brazil. These animals were necropsied and the gastrointestinal content of each segment was fixed and bottled in individual flasks and sent to the Laboratório de Helmintologia da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias da Universidade Estadual Paulista - Câmpus de Jaboticabal. Also, trachea, heart, lung and liver were examined in search of worms. The classification of the helminths was based in methodology found in literature and in histological sections for synlophe study. From the sixteen animals necropsied, were collected 113 helminths, five nematode species (Paraspidodera uncinata, Trichostrongylus colubriformis, Trichuris gracilis, Trichuris muris and Vianella lenti) and one cestode (Thysanotaenia congolensis). T. colubriformis was the most prevalent species. There was not statistical relationship between the parasites and the age of the host (p>0,05). Free-ranging animals were more intensely parasitized than the captive ones, as much for number of worms as for diversity of species. / Mestre

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Pós-Graduação em Ecologia, 2011. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-20T12:24:38Z No. of bitstreams: 1 2011_ClarisseRezendeRocha.pdf: 4520251 bytes, checksum: 21f93ed1268b3f571a6bc8b8ee0b0ace (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-20T12:24:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_ClarisseRezendeRocha.pdf: 4520251 bytes, checksum: 21f93ed1268b3f571a6bc8b8ee0b0ace (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-20T12:24:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_ClarisseRezendeRocha.pdf: 4520251 bytes, checksum: 21f93ed1268b3f571a6bc8b8ee0b0ace (MD5) / A estrutura de uma população é determinada por fatores como densidade, distribuição de indivíduos no habitat, proporções de indivíduos em diferentes classes etárias, razão sexual, área de vida e comportamento. Esse estudo teve como objetivo caracterizar os parâmetros populacionais e os fatores que afetam as variações nas densidades de roedores no Cerrado (Myomorpha, Muroidea, Cricetidae). O estudo foi realizado em áreas de campo na Estação Ecológica de Águas Emendadas, Planaltina, DF, entre 2004 e 2009. Duas grades foram montadas em áreas de campo, onde foram colocadas mensalmente 50 armadilhas do tipo Sherman durante seis noites consecutivas. O tamanho da área de vida dos roedores foi diferente entre os sexos, mas não foi relacionada à reprodução, estações do ano e massa corporal. A abundância da espécie Thalpomys lasiotis influenciou no tamanho da área de vida dos indivíduos. Entretanto, a sobreposição dos indivíduos das três espécies foi influenciada pela abundância. A sobreposição foi maior entre indivíduos machos do que entre as fêmeas. As variáveis ambientais explicaram 21% da composição da comunidade. A variação no adensamento de gramíneas e no número de cupinzeiros e murundus foram as variáveis que mais influenciaram as populações destes roedores. Necromys lasiurus ocorreu em ambientes com maior adensamento de gramíneas, enquanto as espécies T. lasiotis e Calomys tener ocorreram nos ambientes com o menor adensamento de gramíneas. Para as espécies C. tener e T. lasiotis a estação seca foi o período de maior recrutamento de jovens. Os jovens de N. lasiurus foram encontrados durante todo ano. A menor massa corporal encontrada para os roedores na estação seca foi atribuída a fatores biológicos como idade dos indivíduos e fatores ambientais, como a menor oferta de recursos durante esta estação. Em geral, os roedores destas áreas de campo, apresentaram reprodução sazonal, com maiores picos na estação chuvosa. Calomys tener e T. lasiotis apresentaram padrões sazonais, com variação no tamanho da população entre as estações seca e chuvosa. A variação anual também foi importante na abundância para duas das três espécies estudadas. Necromys lasiurus apresentou flutuações, em média, bianuais e T. lasiotis apresentou declínio nas densidades populacionais ao longo dos seis anos de estudo. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The structure of a population is determined by factors such as density, distribution of individuals in the habitat, proportions of individuals in different age groups, sex ratio, home range and behavior. This study intended to characterize the factors and their determinants affecting the variation of three cricetid rodent population density in the Brazilian cerrado. This study was conducted in two grassland areas at the Estação Ecológica de Águas Emendadas in the Distrito Federal, Brazil, from 2004 to 2009. Fifty Sherman traps were monthly baited during six consecutive nights at each grid.The size of rodents’ home range differed between sexes, but it was not related to reproduction, seasons or body masses. The abundance of Thalpomys lasiotis influenced the home range size of that species. However, abundance influenced overlapping for the three species individual. Male overlapping was higher than females’. The environmental variables explained 21% of the community composition. The variation in grasses density and in the number of “termite mounds” and “murundus” were the variables that most influenced the rodents’ populations. Necromys lasiurus occurred in places with higher density of grasses, while T. lasiotis and Calomys tener occurred in environments with lower density of grasses. The dry season was the period of increased recruitment of juveniles of C. tener and T. lasiotis. Necromys lasiurus juveniles were found throughout the year. Their lower body mass in the dry season was attributed to biological factors such as age of individuals and environmental factors such as the lower supply of resources during the season. In general, the grassland rodents, showed seasonal reproduction, with higher peaks in the rainy season.Calomys tener and T. lasiotis showed distinct seasonal variation in population size between the dry and rain seasons. The abundance annual variation was also important for two of the three species. Necromys lasiurus showed population fluctuations, on average, every two years and T. lasiurus presented a decline in population densities over the six years of the study.

Orientador: Walter August Hadler / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia / Made available in DSpace on 2018-07-20T13:36:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Munhoz_CassioOdneiGarcia_D.pdf: 3318865 bytes, checksum: 042dffe2cc5c23b1d71b7e2596aff7ca (MD5) Previous issue date: 1967 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed. / Doutorado / Doutor em Ciências

Orientador: Augusto Shynia Abe / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-17T18:20:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vieira_MarcusVinicius_M.pdf: 1705001 bytes, checksum: 0a4fc91b7765455831c3426e515acb2a (MD5) Previous issue date: 1989 / Resumo: A disponibilidade de alimento pode regular o tamanho das populações naturais por flutuação sazonal, estocástica ou relacionada com a densidade populacional. Em todos esses casos a regulação pode ocorrer pelo aumento da mortalidade, dispersão ou pela redução da atividade reprodutiva nos períodos de escassez de alimento. A flutuação populacional é dependente das características de história de vida (life-history), que por sua vez são relacionadas com o tamanho do corpo. Nesse trabalho analiso a variação de densidade, a sazonal idade da reprodução e a importância da mortalidade e dispersão na regulação das populações de uma comunidade de quatro espécies de roedores de vegetação de cerrado em Itirapina. SP, Brasil. Analiso também a relação desses parâmetros com o tamanho de corpo. Os roedores foram marcados e recapturados em períodos mensais de 6 noites de captura, durante 13 meses, de setembro de 1985 a setembro de 1986. em uma grade de pontos de captura com 1,32 ha. A maior atividade reprodutiva ocorreu do meio da estação das chuvas até a metade da estação sêca em Clyomys bishopi e Oryzomys subflavus, as espécies de maior tamanho de corpo e de dieta mais especializada em partes vegetativas de mono e dicotiledôneas respectivamente. Oryzomys eliurus e Bolomys lasiurus, espécies de menor tamanho de corpo e com maior proporção de sementes na dieta, tiveram maior atividade reprodutiva do início à metade da estação sêca. A maior atividade reprodutiva parece ocorrer em épocas de maior disponibilidade de alimento. Houve uma queda brusca no tamanho das populações do meio da estação sêca até o início das chuvas, pelo aumento da dispersão dos indivíduos / Abstract: Resource availability can regulate population size through seasonal, stochastic, or density dependent fluctuations. In all these cases the regulationcan act by increasing mortality dispersal or by reducing reproductive activity during the periods of resource shortage. The population fluctuation is dependent on life-history characteristics, which in turn are dependent on body size. Here, I analize the density variation, the seasonality of reproductive activity, and the importance of mortality and dispersal to the regulation of populations in a community of four species of cerrado vegetation rodents, in Itirapina, SP, Brasil. I also analize the relationships between these factors and body size. The rodents were marked and recaptured in monthly sessions of 6 consecutive capture nights, during 13 months, from september 1985 until september 1986, in a 1.32 ha grid. The greatest reproductive activity occurred from the middle of the rainy season until the middle of the dry season in Clyomys bishopi and Oryzomys subflavus, species with greater body sizes and diets more specialized in vegetative parts of mono and dicotiledons, respectively. Oryzomys eliurus and Bolomys lasiurus, species with smaller body size and greater proportion of seeds in their diets, had greater reproductive activity from the begining until the middle of the dry season. The greater reproductive activity seems to occur at times of greater resource availability. There was a sharp decrease in the size of the populations from the middle of the dry season until the begining of the rains due to the increase of dispersal / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ciências Biológicas

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2015. / No presente estudo, investigamos diferentes aspectos da estratificação vertical de pequenos mamíferos em ambientes florestais do Cerrado. Além de descrevermos padrões gerais no uso do espaço vertical de marsupiais e roedores, investigamos possíveis variações na utilização dos estratos verticais (solo, sub-bosque [1-4 m de altura] e dossel [> 7m de altura]) pelos animais, levando em consideração duas diferentes fitofisionomias (mata de galeria e cerradão), estações do ano (seca e chuva) e disponibilidade de recursos (artrópodes e frutos). Além disso, nós comparamos a seleção de hábitat de seis espécies de roedores e três espécies de marsupiais em ambas fitofisionomias, avaliando variáveis relacionadas com a complexidade do hábitat. Para isso, consideramos a microescala (estações de captura), a mesoescala (transecções de estações de captura) e as capturas em cada um dos estratos verticais amostrados. Também descrevemos e comparamos a habilidade de locomoção arborícola de sete espécies de roedores sigmodontíneos do Cerrado. Para tanto, realizamos testes por meio de suportes cilíndricos horizontais (nicho fundamental) e relacionamos os resultados com dados de arborealidade obtidos em campo desses animais (nicho realizado). Das 11 espécies capturadas, o marsupial Caluromys lanatus foi capturado somente no dossel em ambas fitofisionomias. O marsupial Monodelphis americana e o roedor Calomys expulsus em cerradão, e o roedor Proechimys roberti em mata de galeria, foram capturados somente no solo. Dentre as espécies que utilizaram somente o solo e o sub-bosque (em ambas fitofisionomias), estavam os roedores Hylaeamys megacephalus (primariamente terrestre), Oligoryzomys nigripes e O. fornesi (escansoriais). As espécies que utilizaram os três estratos verticais (em diferentes intensidades) foram os marsupiais Didelphis albiventris, Gracilinanus agilis, e os roedores Oecomys cf. roberti e Rhipidomys macrurus. Nossos resultados indicaram que R. macrurus utiliza mais o dossel em cerradão, e que o G. agilis utiliza com maior intensidade o solo e o sub-bosque na estação seca em ambas fitofisionomias. Além disso, verificamos associações entre a utilização dos estratos verticais e a disponibilidade de frutos (G. agilis, O. cf. roberti e R. macrurus), e a biomassa de artrópodes (R. macrurus), coleópteros (O. cf. roberti e R. macrurus) e lepidópteros (G. agilis). Também verificamos que, em mata de galeria, existe a tendência de um acréscimo de espécies quando os diferentes estratos verticais são considerados, e que a diversidade beta entre estratos verticais é maior do que entre áreas. Adicionalmente, nossos resultados de seleção de hábitat indicaram que na microescala, a seleção do hábitat diferiu entre as duas fitofisionomias, e que os animais tenderam a selecionar caraterísticas importantes para a locomoção arborícola (e.g., densidade de lianas em mata e número de estratos verticais em cerradão). Também verificamos que, para a mesoescala, a seleção de variáveis do hábitat foi importante somente no cerradão, onde animais arborícolas selecionaram áreas com maior densidade de ramos. Já os resultados de seleção do hábitat, levando em consideração estratos verticais, indicaram que as espécies que utilizam o dossel e o sub-bosque tendem a selecionar características mais relacionadas à locomoção arborícola (número de estratos verticais e densidade de ramos em cerradão, e densidade de lianas em mata de galeria), enquanto que animais que utilizam o solo selecionaram características relacionadas à proteção contra predadores (principalmente profundidade da serapilheira e densidade de ramos em ambas fitofisionomias). Nossos resultados de habilidade de locomoção de roedores revelaram que animais predominantemente arborícolas apresentaram maiores velocidades em comparação com roedores terrestres. Tal velocidade se deu por meio do aumento da frequência de passos e diminuição do tamanho de passos. Adicionalmente, verificamos uma forte associação entre capturas acima do solo e o tamanho e frequência de passos. Contudo, tais aspectos da habilidade de locomoção tiveram fraca relação com a massa corporal e não tiveram relação com a filogenia das espécies analisadas. / In the present study, we investigated different aspects of vertical stratification of small mammals in forest formations of the Cerrado. In addition to describing general patterns of vertical use by marsupials and rodents, we also investigated possible variations in use of the vertical strata (ground, understory [1-4 m high] and canopy [> 7m high]) by the animals, taking into consideration different two phytophysiognomies (gallery forest and dry woodland - cerradão), seasons (cool-dry and warm-wet) and resource availability (arthropods and fruits). Additionally, we verified habitat selection by six rodents and three marsupials in both forest formations, evaluating variables related to habitat complexity. In this context, we considered the micro-habitat scale (capture stations), the meso-habitat scale (transects of capture stations), and captures in each sampled vertical strata. We also described and compared arboreal locomotion ability of seven sigmodontine rodent species of the Cerrado. For that, we performed tests using horizontal cylindrical supports (fundamental niche), and associated these results with arboreality data of the animals captured in the field (realized niche). Among the 11 captured species, the marsupial Caluromys lanatus was captured, in both physiognomies, only in the canopy. The marsupial Monodelphis americana and the rodent Calomys expulsus were captured in the dry woodland, and the rodent Proechimys roberti in the gallery forest, were captured only on the ground. Among the species that used the ground and understory, were the rodent Hylaeamys megacephalus (mainly terrestrial) and Oligoryzomys nigripes and O. fornesi (scansorials). The species that used the three vertical strata (in different intensities) were the marsupials Didelphis albiventris and Gracilinanus agilis, and the rodents Oecomys cf. roberti and Rhipidomys macrurus. Our results showed that R. macrurus used the canopy more intensely in the dry woodland compared to gallery forest, and G. agilis used the ground and understory in higher intensity in the cool-dry season in both physiognomies. Additionally, we verified a relation between vertical strata utilization and availability of fruits (G. agilis, O. cf. roberti e R. macrurus), and biomass of arthropods (R. macrurus), coleopterans (O. cf. roberti e R. macrurus), and lepidopterans (G. agilis). We also verified that in gallery forest, there is an increase in species considering different vertical strata, and also that beta diversity is higher among strata than among areas. Our results related to habitat selection showed that at micro-habitat scale, habitat selection differed between the two forest formations, and the animals tended to select habitat features that are important for arboreal locomotion (e.g., density of lianas in gallery forest and number of vertical layers in dry woodland). We also verified habitat selection in the meso-habitat scale only in the dry woodland by more arboreal animals, preferring areas with higher density of branches. We also found that animals captured in the canopy and understory tended to select habitat variables more related to arboreal locomotion (number of vertical layers and density of branches in dry woodland, and density of lianas in gallery forest), while animals captured on the ground selected habitat variables more related to protection against predators (mainly litter depth and density of branches in both forest formations). Our results on locomotion ability of rodents showed that arboreal species generally present higher velocities in comparison with terrestrial species. Such velocities were obtained by the animals by increasing stride frequency and decreasing stride length. Additionally, our results also showed a strong association between above-ground captures and stride length and frequency. However, these performance aspects were weakly related to body mass and had no relation to phylogeny of the studied species.

Resumo: Roedores e Marsupiais são mamíferos de grande importância no cenário Neotropical, possuindo elevado número de espécies e de endemismos e imprescindível papel ecológico. No estado do Paraná, até o momento são registradas 18 espécies de marsupiais e 40 de roedores. Na Floresta com Araucária por sua vez, os esforços são reduzidos, havendo ainda muito a ser feito. Este trabalho teve como objetivo conhecer as espécies desta fauna presentes na Floresta Nacional de Piraí do Sul, Paraná, contribuindo com aspectos taxonômicos, morfológicos (externos e de crânio), citogenéticos e de diversidade de cada uma delas e das principais fitofisionomias amostradas. A Unidade de Conservação está localizada na região centro-leste do estado, e possui aproximadamente 153 ha, dos quais 7,2 ha são reflorestamentos de Araucária e Imbuia, 39 ha são Pinus, 13 ha são aceiros, e cerca de 93 ha representados por formações nativas de Floresta com Araucária em diferentes estádios sucessionais. Oito fitofisionomias foram amostradas, totalizando um esforço de 5892 armadilhas.noite. Foram capturados 801 indivíduos de 16 espécies, incluindo o primeiro registro de uma espécie para a região sul do país, primeiro registro de uma espécie e um gênero para o Paraná e primeiro registro de duas espécies e um gênero para a Floresta com Araucária. Além disso, os resultados apontam para a importância de se levar em conta a complexidade e heterogeneidade ambiental e da utilização de diversos métodos de amostragem nos inventários de mastofauna de pequeno porte. Adicionalmente, as espécies Akodon montensis, Brucepattersonius iheringi, Oligoryzomys nigripes, Oxymycterus nasutus, Sooretamys angouya e Thaptomys nigrita foram mais uma vez registradas juntas em área de Floresta com Araucária. Ainda, importantes informações referentes à utilização das fitofisionomias amostradas pelas espécies capturadas foram obtidas, como por exemplo a menor diversidade encontrada em talhões de reflorestamento de Pinus elliotti em relação à Floresta com Araucária secundária, em regeneração natural. Em suma, os resultados encontrados trouxeram à tona o quanto ainda há para ser feito quando o assunto é pequenos mamíferos não voadores do Brasil meridional.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2014. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2014-08-12T13:11:06Z No. of bitstreams: 1 2014_IngridMattos.pdf: 3140221 bytes, checksum: 0a74749bea109d560d05a2c10acf6bca (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-08-14T12:57:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_IngridMattos.pdf: 3140221 bytes, checksum: 0a74749bea109d560d05a2c10acf6bca (MD5) / Made available in DSpace on 2014-08-14T12:57:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_IngridMattos.pdf: 3140221 bytes, checksum: 0a74749bea109d560d05a2c10acf6bca (MD5) / A abundância das espécies pode ser influenciada por fatores como condições climáticas, físicas e químicas do ambiente, disponibilidade de recursos, ciclo de vida de organismo e interações com competidores, predadores e parasitos, que agem nas suas taxas de natalidade, mortalidade e migração. A dinâmica entre recursos e consumidores é um processo que pode determinar e influenciar a abundância dos consumidores e logo, age sobre a estruturação das comunidades. Este trabalho teve por objetivo verificar se a disponibilidade de alimento é um fator importante na dinâmica populacional de duas espécies de roedores de áreas abertas, relacionando seus parâmetros e padrões populacionais com a disponibilidade e a variação sazonal de recursos alimentares. A sazonalidade se mostrou um fator importante para a dinâmica das espécies, direta ou indiretamente. A abundância e sobrevivência de Calomys tener foram positivamente influenciadas pela disponibilidade de frutos, e sua probabilidade de captura foi constante ao longo do ano. Por outro lado, a abundância de Necromys lasiurus foi positivamente influenciada pela disponibilidade de sementes de gramíneas, enquanto sua sobrevivência foi constante ao longo do estudo, sugerindo que há outros fatores importantes para a dinâmica dessa espécie, além de recurso alimentar. A probabilidade de captura desta espécie foi maior na área onde houve menor disponibilidade de recurso ao longo do ano, sugerindo que pode haver uma redução na capturabilidade da espécie devido a menor atratividade da isca onde há maior disponibilidade de alimento. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Species abundances can be influenced by many factors, such as environmental climatic, physical and chemical conditions, food availability, biological characteristics of the organisms and their interactions with competitors, predators and parasites, which act on their birth, death and migration rates. The consumer-resource dynamics is a process that can regulate and determine the abundance of consumers, and therefore, act on community structure. The aim of this work was to evaluate if seasonal food availability is an important driver of population changes in abundance, survival and encounter probability of two rodent species from a grassland cerrado. Seasonality showed direct and indirect importance in both species dynamics. Abundance and survival of Calomys tener were both positively influenced by fruit availability, and its capture probability did not change year around. In the other hand, abundance of Necromys lasiurus was positively influenced by seed availability, while its survival was constant over the year, suggesting that there are other factors besides food driving population changes in this species. Its encounter probability was lower in the area with more food availability, suggesting that the bait may be less attractive to rodents, therefore, influencing the encounter parameter of N. lasiurus.

Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-09-21T22:00:44Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Érika de Cássia Vieira da Costa.pdf: 3098520 bytes, checksum: 9f66bcd3ae386544e4137fed8bbdcddd (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-09-24T17:20:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Érika de Cássia Vieira da Costa.pdf: 3098520 bytes, checksum: 9f66bcd3ae386544e4137fed8bbdcddd (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-24T17:20:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Érika de Cássia Vieira da Costa.pdf: 3098520 bytes, checksum: 9f66bcd3ae386544e4137fed8bbdcddd (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / A peste, infecção por Yersinia pestis, é uma zoonose de grande importância epidemiológica mundial e no Brasil. A peste é uma doença principalmente de roedores silvestres e suas pulgas/vetores, mas pode afetar os seres humanos e outros mamíferos. Mais de 200 espécies de roedores são hospedeiros/reservatórios da infecção. No Brasil, a infecção permanece em focos naturais localizados em vários complexos ecológicos da região Nordeste, norte de Minas Gerais e na Serra dos Órgãos, no Rio de Janeiro. Os conhecimentos atuais sobre as populações de roedores e suas pulgas/ectoparasitas nas áreas focais de peste assim como a prevalência da infecção entre roedores e pulgas são insuficientes. O monitoramento das áreas focais da peste exige a disponibilidade de métodos de diagnóstico rápidos, simples e eficientes utilizando técnicas sensíveis e específicas aplicáveis às diversas amostras biológicas de diferentes origens (homem, roedores, carnívoros domésticos e selvagens). Nosso objetivo foi atualizar as informações sobre os roedores e outros pequenos mamíferos nos focos de peste do Nordeste do Brasil, desenvolver e avaliar uma técnica imunoenzimática (ELISAProteinA) para aplicação nas atividades de diagnóstico e vigilância da peste. No período de 2013-2015 foram realizadas nove expedições de uma semana cada, às áreas focais de peste historicamente mais importantes nos estados de Pernambuco, Ceará e Bahia, onde foram coletados 392 roedores e outros pequenos mamíferos (marsupiais). As análises bacteriológicas e moleculares realizadas nas amostras de tecidos dos animais foram negativas para a Y. pestis e apenas um animal se revelou positivo nas análises sorológicas. Apesar da baixa prevalência da infecção encontrada, a densidade e a diversidade de reservatórios/hospedeiros nas áreas focais evidencia a necessidade de incrementar os estudos nesses locais. Conjugados formados pela proteína A do Staphylococcus aureus (ProteinA) ligada a enzimas representam uma alternativa no desenvolvimento de testes sorológicos, já que essa proteína possui afinidade universal com imunoglobulinas de diversas espécies de mamíferos domésticos e selvagens. Visando otimizar a metodologia das atividades de vigilância e controle da peste no Brasil, ensaios foram realizados para avaliar o desempenho da técnica imunoenzimática ELISA proteína-A utilizando um conjugado composto pela proteína A ligada a peroxidase. Os resultados mostraram que pela sensibilidade e especificidade o teste permite descartar as amostras com reações inespecíficas ou falso positivas desde a triagem o que repercute em grande ganho de tempo e economia de material. / The plague, Yersinia pestis infection, is a zoonosis of major epidemiological importance worldwide. Plague is primarily a disease of wild rodents and their flea/vectors, but can affect humans and other mammals. More than 200 species of rodents are hosts/reservoirs of the infection. In Brazil, the infection remains in natural foci located in several ecological complexes of Northeast, north of Minas Gerais and in the Serra dos Órgãos, in Rio de Janeiro. Current knowledge on the rodent and flea/ectoparasite populations from plague focal areas, as well as, the prevalence of infection among rodents and fleas are wanting. The monitoring of the plague focal areas requires the availability of quick, simple and efficient diagnosis methods using sensitive and specific techniques suited to various biological samples of different origins (human, rodents, domestic and wild carnivores). Our aim was to update the information on rodents and other small mammals from plague foci in the Northeast of Brazil, to develop and evaluate an enzyme immunoassay (ELISA protein-A) for use in plague diagnostic and surveillance activities. In the period of 2013-2015 nine one week each expeditions were held to the historically most important plague areas in the states of Pernambuco, Ceará and Bahia, where 392 rodents and other small mammals (marsupials) were collected. Bacteriological and molecular analyzes of animal tissue samples were negative for Y. pestis and only one animal proved positive in serological tests. Despite this low infection prevalence, the density and diversity of reservoir/hosts in the focal areas highlights the need for strengthen research in these areas. Conjugates of Staphylococcus aureus protein A linked to enzymes represent an alternative in the development of serological tests, since this protein has universal affinity with immunoglobulins from various species of domestic and wild mammals. To optimize the methodology of plague monitoring and control activities in Brazil essays were conducted to evaluate the performance of an enzyme immunoassay (ELISA protein A) using a conjugate composed of protein A linked to peroxidase. By the sensitivity and specificity observed the test allows discarding non-specific or false positive samples since from the screening, which constitutes time and material savings.

Orientador: L. A. Magalhães / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-19T01:56:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bastos_OthondeCarvalho_M.pdf: 3157673 bytes, checksum: d759eca7fcc66ef1c9008030b1ec3e94 (MD5) Previous issue date: 1975 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informado / Mestrado / Mestre em Ciências Biológicas

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2015-12-18T15:29:29Z No. of bitstreams: 2 Dissertaçao_Arielli Fabrício Machado.pdf: 1670342 bytes, checksum: b9c2284ff1dbc504885975b0a32d93e2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-18T15:29:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertaçao_Arielli Fabrício Machado.pdf: 1670342 bytes, checksum: b9c2284ff1dbc504885975b0a32d93e2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-08-21 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Historical and ecological factors affect distribution and diversification of species. Hylaeamys megacephalus is a rodent from Amazonian forests and Cerrado, with distinctive lineages to the north and south of Amazonas River. Previous studies suggested allopatric divergence by the Amazonas River for northern Amazonia, and parapatric between southern Amazonia and Cerrado. We investigated the evolutionary history of the species integrating phylogeography and ecological niche models (ENMs). Through cytochrome b mitochondrial gene, we constructed a phylogenetic tree, haplotype network, estimating divergence time, historical demography, ancestor areas and dispersion and vicariance events. We ran ENMs of the species and its lineages, projecting it to the past. We analyzed niche similarity and habitat corridors. Our results show the three structured lineages, revealing sharing haplotypes only between south of the Amazon and Cerrado. All lineages diverged by vicariance in Pleistocene, however individuals with associated haplotypes diverged by dispersion and vicariance. We found low niche similarity between northern and southern Amazonia, but high between southern Amazonia and Cerrado. We corroborate vicariant diversification in northern Amazonia, associated with the establishment of Amazon river. However, due to the wide distribution of ancestral species, we suggest that environmental factors have also influenced this process, causing ecological variation between north and south of the Amazon before the rise of the barrier. About the lineages of the southern Amazon and Cerrado, previous studies have suggested diversification Parapatric, however, these lines showed high similarity ecological and model Parapatric Speciation requires selective variation. We suggest that these lineages diverged by the emergence of Xingu River, going through successive dispersion and vicariance events caused by change of the river’s water level during the Pleistocene. / Fatores históricos e ecológicos influenciam na distribuição e diversificação das espécies. Hylaeamys megacephalus é um roedor que apresenta linhagens divergentes entre o norte e sul do rio Amazonas e também no Cerrado. Estudos prévios sugeriram diversificação alopátrica entre o norte e sul do rio Amazonas e parapátrica entre o sul da Amazônia e Cerrado. Investigamos a história evolutiva da espécie e as hipóteses de diversificação sugeridas para suas linhagens, integrando filogeografia e modelos de nicho ecológico (ENMs). Utilizando um marcador mitocondrial, construímos uma árvore filogenética e uma rede de haplótipos, estimando tempo de divergência, demografia histórica, áreas de distribuição ancestral e eventos de dispersão e vicariância. Rodamos ENMs para a espécie e suas linhagens projetando-os para o passado. Avaliamos a similaridade de nicho ecológico e corredores de habitat entre as linhagens. Nossos resultados corroboram a existência das três linhagens e revelam compartilhamento de haplótipos apenas entre as linhagens do sul da Amazônia e do Cerrado. Todas as linhagens divergiram por vicariância durante o Pleistoceno, porém indivíduos com haplótipos relacionados divergiram por dispersão e vicariância. Houve baixa similaridade de nicho entre o norte e sul da Amazônia, mas alta entre sul e Cerrado. Corroboramos diversificação vicariante para o norte da Amazônia, associado ao estabelecimento do rio Amazonas. Porém, devido à ampla distribuição ancestral da espécie, sugerimos que fatores ecológicos também tenham influenciado neste processo, causando variação ecológica entre norte e sul da Amazônia antes do surgimento da barreira. Quanto às linhagens do sul da Amazônia e do Cerrado, estudos prévios sugeriram diversificação parapátrica, entretanto, estas linhagens apresentaram alta similaridade ecológica e o modelo de especiação parapátrica requer variação seletiva. Sugerimos que estas linhagens divergiram pelo surgimento do rio Xingu, passando por eventos sucessivos de dispersão e vicariância causados pela alteração do curso deste rio durante o Pleistoceno.