Submitted by Aycon Tinoco Lisboa Frazao (aycon.lisboa@ifma.edu.br) on 2018-08-16T14:11:15Z No. of bitstreams: 1 Dissertaçao Aycon Final definitiva.pdf: 2201663 bytes, checksum: b6724c23672b5427d5ff9d96216e92ab (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-08-17T17:11:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 frazao_atl_me_jabo.pdf: 2201663 bytes, checksum: b6724c23672b5427d5ff9d96216e92ab (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-17T17:11:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 frazao_atl_me_jabo.pdf: 2201663 bytes, checksum: b6724c23672b5427d5ff9d96216e92ab (MD5) Previous issue date: 2018-07-23 / Outra / O processo de colheita mecanizada de mudas de cana-de-açúcar é decisivo na operação seguinte, a de plantio mecanizado da cultura, principalmente nos meses de outubro/novembro, nos quais há maior estresse hídrico e temperatura elevadas. Assim, a quantidade de palha retida no rebolo durante o processo de colheita mecanizada, pode reduzir a quantidade de gemas inviáveis por danos mecânicos e proteger as gemas das condições climáticas adversas. Objetivou-se, avaliar a qualidade de operação de plantio de cana-de-açúcar utilizando mudas com e sem palhada, com utilização de plantadoras e distribuidoras de cana-de-açúcar picada comparados ao plantio semi-mecanizado. O experimento foi conduzido na Fazenda Santa Clara, localizada no município de Pradópolis - SP, com cinco tratamentos sendo, plantadora mecanizada sem palha na muda, plantadora mecanizada com palha na muda, distribuidora mecanizada sem palha na muda, distribuidora mecanizada com palha na muda e plantio semi-mecanizado. A coleta de dados foi realizada em 50 pontos amostrais para cada tratamento, de acordo com as premissas do Controle Estatístico de Processo. A quantidade de gemas inviáveis e as falhas no estande reduziram com a presença de palha no rebolo. A presença de palha no rebolo possibilita o aumento do potencial da área plantada. Dessa forma, a presença de palha na muda melhorou a qualidade do plantio de cana de açúcar. / The process of sugarcane seedlings mechanized harvesting is decisive in the next operation, which is the mechanized crop planting, mainly in the months of October/November, when the plants experience higher water stress and elevated temperatures. Thus, the amount of straw retained in the stalk during the mechanized harvesting process can reduce the number of non-viable buds due to mechanical damage and protect the buds from adverse climatic conditions. The objective of this study was to evaluate the quality of the sugarcane planting operation using seedlings with and without straw, employing planters and distributors of chopped sugarcane compared to semi-mechanized planting. The experiment was carried out at Santa Clara Farm, located in the city of Pradópolis, SP, Brazil, with five treatments, being: mechanized planter without straw in the seedling, mechanized planter with straw in the seedling, mechanized distributor without straw in the seedling, mechanized distributor with straw in the seedling and semi-mechanized planting. The data collection was performed in 50 sample points for each treatment, according to the premises of the Statistical Process Control. The amount of unviable gems and faults in the stand reduced with the presence of straw on the stalk. The presence of straw in the stalk makes it possible to increase the potential of the planted area. Thus, the presence of straw in the seedling improved the quality of sugarcane cropping. / Minter: 834320

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2013. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-01-12T15:15:53Z No. of bitstreams: 1 2013_JoseAvelinoCardoso.pdf: 1916984 bytes, checksum: 14996b21512789ce7c07f7c3e4cb9d7a (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2016-01-12T15:56:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_JoseAvelinoCardoso.pdf: 1916984 bytes, checksum: 14996b21512789ce7c07f7c3e4cb9d7a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-12T15:56:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_JoseAvelinoCardoso.pdf: 1916984 bytes, checksum: 14996b21512789ce7c07f7c3e4cb9d7a (MD5) / A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma planta pertencente à família Poaceae e à classe das monocotiledôneas. A área cultivada com a cultura da cana-de-açúcar tem aumentado na região do Cerrado é fruto do clima propício e menores preços de terras para o cultivo. Contudo, a região possui, também, fatores limitantes e necessita do emprego de todas as tecnologias, relativas à condução da cultura, para a obtenção de altas produtividades na cultura da cana-de-açúcar. A fertilidade dos solos da região é um dos fatores limitantes para a produção, e a tecnologia de adubação assume papel importante para o aumento da produtividade da cana-de-açúcar. A fim de definir recomendações econômicas de fertilizantes e corretivos, a análises de solo passa ser uma importante ferramenta utilizada pelos produtores. A amostragem é uma das etapas mais importantes no processo de correção da fertilidade do solo, por isso, deve ser bem conduzida, respeitando cada área em particular, pois implicará em todo o sucesso da nutrição das plantas cultivadas. Para determinar uma amostragem representativa, deve- se considerar a variabilidade do solo em relação as suas características químicas e físicas, e a sua influência sobre o número e a distribuição das amostras a serem coletadas por área de cultivo, visando à determinação da sua fertilidade média. A aplicação de adubos minerais na cultura da cana-de-açúcar, no geral, ocorre no sulco de plantio da cana-planta e ao lado das linhas das soqueiras, o que promove uma distribuição heterogênea dos nutrientes na área total cultivada, ocasionado aumento da variabilidade dos atributos de fertilidade e uma demanda de maior de subamostras para a sua estimativa. No entanto o objetivo do trabalho foi estudar a variabilidade dos atributos de fertilidade do solo cultivado com cana-de-açúcar, em duas áreas de renovação de plantio na Usina Goiasa, no município de Goiatuba - GO. Avaliando a fertilidade do solo em duas profundidades, nas linhas e entrelinhas de plantio da cana- de-açúcar em duas áreas de renovação desta cultura. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The sugar cane (Saccharum spp.) is a plant belonging to the family Poaceae and the class of monocots. The area cultivated with the crop sugar cane has increased in the Cerrado region is a result of climate favorable and lower prices of land for cultivation. However, the region has also limiting factors and requires the use of all technologies concerning the of crop management, for obtaining high yields in the culture of sugar cane. To define economic recommendations of fertilizers and correctives, the soil analysis shall be an important tool used by farmers. Sampling is one of the most important stages in the process of correcting soil fertility, so it must be well conducted, observing each area in particular, it will result in the entire success of the nutrition of cultivated plants. To determine a representative sampling, should consider the variability of the soil in relation to their chemical and physical characteristics, and their influence on the number and distribution of samples to be collected by area of cultivation aiming to determine their medium fertility. Application of mineral fertilizers in the culture of sugar cane, in general, occurs in the planting furrow sugar cane plant and beside of the lines of ratoon cane, which fosters a heterogeneous distribution of nutrients in the total cultivated area, caused an increase in variability fertility attributes and a more demand for subsamples of its estimate. However the aim was to study the variability of the attributes of fertility of soils under sugar cane in two renewal areas in planting Goiasa Mill in the municipality of Goiatuba - GO. Evaluating soil fertility in two depth, row and inter-row of planting sugar cane in two areas of renovation of this culture.

Submitted by LUANA JANDHY MANTOVANINI (lumantovanini@gmail.com) on 2017-08-29T19:11:30Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Luana_Jandhy_Mantovanini.pdf: 1646514 bytes, checksum: 4c536d5f2d4ac50ce5a852c9b10ce27c (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-08-29T19:18:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 mantovanini_lj_me_jabo.pdf: 1646514 bytes, checksum: 4c536d5f2d4ac50ce5a852c9b10ce27c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-29T19:18:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 mantovanini_lj_me_jabo.pdf: 1646514 bytes, checksum: 4c536d5f2d4ac50ce5a852c9b10ce27c (MD5) Previous issue date: 2017-05-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A cana-de-açúcar é atualmente uma das principais culturas da agroindústria mundial. Devido à ampla expansão de seu plantio é submetida constantemente a solos não produtivos. A presença de moléculas tóxicas no solo, como o alumínio (Al3+), interfere diretamente no desenvolvimento radicular ocasionando baixa absorção de água e nutrientes levando a pouca produtividade e desenvolvimento das plantas. Os microRNAs tem sido descritos como um dos fatores responsáveis pela regulação gênica e a descoberta dessas moléculas abre um novo caminho para a elucidação da tolerância e adaptação das plantas aos estresses abióticos. Este estudo visou avaliar em duas cultivares de cana-de-açúcar (CTC-2 e RB855453) a expressão dos microRNAs miR159, miR164 e miR168, associados à resposta ao alumínio em espécies como Arabidopsis thaliana, arroz (Oriza sativa) e tabaco (Nicotiana tabacum). Algumas características foram avaliadas, como densidade de raízes (DS), área foliar (AR), produção de massa seca (MS) e teor de prolina nas folhas, em quatro cultivares de cana-de-açúcar submetidas a diferentes concentrações de alumínio. A cultivar CTC 2 foi classificada como tolerante e a RB855453 como sensível ao estresse. Ambas foram selecionadas e em sistema de hidroponia submetidas novamente ao estresse pela toxidez de alumínio na concentração de 221 μmol L -1 . Parâmetros fisiológicos foram mensurados (área foliar, potencial osmótico, taxa de fotossíntese, transpiração, condutância estomática) e a expressão dos miRNAs 159, 164 e 168 avaliada por PCR em tempo real. Plantas das duas cultivares apresentaram alterações fisiológicas e morfológicas ao longo do estresse, com redução significativa para a área foliar da cultivar RB855453. O miR164 e 159 foram induzidos nas duas cultivares, principalmente após 72 horas de estresse, e o miR168 diferencialmente expresso. Esses miRNAs regulam genes e fatores de transcrição que estão envolvidos na resposta e desenvolvimento da planta diante ao estresse por alumínio. / The sugarcane is currently one of the main crops of global agribusiness. Due to the wide expansion of its plantation is constantly subjected unproductive soils. The presence of toxic molecules in the soil, such as aluminum (Al3+), directly affects root development, leading to poor absorption of nutrients and water leading to low productivity and development of plants. Studies of the interactions of plants with the environment are being conducted to clarify the resistance or susceptibility of various cultures, favoring the discovery of important mechanisms that participate in physiological and molecular responses to environmental stresses. MicroRNAs have been described as one of the factors responsible for gene regulation and the discovery of these molecules opens a new path for the elucidation of tolerance and adaptation of plants to abiotic stresses. This study evaluated in two sugarcane varieties the expression of microRNA miR159, miR164 and miR168, associated with the response to the aluminum species such as Arabidopsis thaliana, rice (Oryza sativa) and tobacco (Nicotiana tabacum). Some characteristics were evaluated, such as density (DS), area (AR), dry mass production (DM) and proline content, in four sugarcane cultivars submitted to different concentrations of aluminum. CTC 2 cultivar was classified as tolerant and RB855453 as stress sensitive. Both were selected and in a hydroponics system again submitted to stress by the aluminum toxicity in the concentration of 221 μmol L-1. Physiological parameters were measured (leaf area, osmotic potential, photosynthesis rate, transpiration, stomatal conductance) and the expression of miRNAs 159, 164 and 168 evaluated by real-time PCR. Plants of both cultivars presented physiological and morphological changes along the stress, with a significant reduction for the leaf area of cultivar RB855453. The miR164 and 159 were induced in the two cultivars, mainly after 72 hours of stress, and the miR168 differentially expressed. These miRNAs regulate genes and transcription factors that are involved in the response and development of the plant in the face of aluminum stress.

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2018-11-06T12:22:50Z No. of bitstreams: 2 Ivonei_Perego.pdf: 599331 bytes, checksum: db51bf2ad5740f4e90a8484fc8e48a32 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-06T12:22:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Ivonei_Perego.pdf: 599331 bytes, checksum: db51bf2ad5740f4e90a8484fc8e48a32 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-08-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Weed management in sugarcane is very frequent and knowledge of the phytotoxic effects of herbicides becomes very important. The objective of this work was to evaluate the phytotoxicity caused by herbicides in the agronomic components of two sugarcane cultivars in two growing seasons. The experimental design was a randomized complete block with four replicates, in a 10x2 factorial scheme, with nine herbicides (tembotrione, mesotrione, clomazone, saflufenac, 2,4 dichlorophenoxyacetic, fluroxypyr + picloram, metribuzim, isoxaflutol, sulfentrazone) and one control, two sugarcane cultivars (RB006995 and RB036153) and five evaluation periods (7, 14, 21, 28, 35 DAA), two experiments were carried out in a cultivation period of cane year-and-half and another in cane of year. The cultivar RB006995 obtained a superior performance to RB036153 for aerial shoot mass, plant height, stem diameter and number of leaves. The most phytotoxic herbicides for cane of the year in cultivars RB036153 and RB006995 were clomazone and sulfentrazone. For cane yearand-medium the herbicides isoxaflutol, clomazone and sulfentrazone were the most phytotoxic mainly in cultivar RB006995. For most herbicides, phytotoxicity decreased with the passage of days after application. The most selective herbicides for both cultivars and cultivation periods were tembotrione, mesotrione and fluroxypyr + picloram. / O manejo de plantas daninhas na cultura da cana-de-açúcar é muito frequente e o conhecimento dos efeitos fitotóxicos proporcionada pelos herbicidas se torna muito importante. O objetivo da realização deste trabalho foi avaliar a fitotoxidez causada pelos herbicidas nos componentes agronômicos de duas cultivares de cana-de-açúcar, em dois períodos de cultivo. O delineamento experimental utilizado foi de blocos casualizados com quatro repetições, num esquema fatorial 10x2, sendo os fatores compostos por nove herbicidas (tembotriona, mesotriona, clomazona, saflufenacil, 2,4 diclorofenoxiacético, fluroxipir + picloram, metribuzim, isoxaflutol, sulfentrazona) e uma testemunha, duas cultivares de cana-de-açúcar (RB006995 e RB036153) e cinco épocas de avaliação (7, 14, 21, 28, 35 DAA), foram realizados dois experimentos, um em período de cultivo de cana-de-anoe-meio e outro em cana-de-ano. A cultivar RB006995 obteve um desempenho superior à RB036153 para massa seca de parte aérea, altura de plantas, diâmetro do caule e número de folhas. Os herbicidas mais fitotóxicos para cana de ano nas cultivares RB036153 e RB006995 foram clomazona e sulfentrazona. Para cana de ano-e-meio os herbicidas isoxaflutol, clomazona e sulfentrazona foram os mais fitotóxicos principalmente na cultivar RB006995. Para a maioria dos herbicidas houve decréscimo da fitotoxidez com o passar dos dias após a aplicação. Os herbicidas mais seletivos para ambas as cultivares e períodos de cultivo foram tembotriona, mesotriona e fluroxipir + picloram.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6196_1.pdf: 2969003 bytes, checksum: 8f50bcbdb2b65d6db740defdd69758a0 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / Estresses abióticos são os principais responsáveis por provocar alterações no crescimento e desenvolvimento vegetal. As plantas, em contrapartida, lançam mão de uma variedade de respostas a fim de manter seus processos metabólicos e fisiológicos. Uma das principais respostas das plantas às alterações das condições ambientais é a regulação adicional da expressão. Além desta, são de grande importância a síntese de osmoprotetores, transportadores iônicos, chaperonas, proteínas de choque térmico, aquaporinas, proteínas LEA, entre outras. Este trabalho buscou identificar genes que codificam fatores de transcrição (DREB, ERF, MYB, bHLH, bZIP, HSF, WRKY, NAC, ZincFinger e Homeodomínio) em eucalipto, cana-de-açúcar e arroz através de ferramentas in silico. Os resultados obtidos revelaram a presença de fatores de transcrição em todos os genomas estudados, revelando a importância dos mesmos nas respostas aos estresses abióticos. De uma forma geral, as proteínas pertencentes à uma mesma família mostraram características (ponto isoelétrico e massa molecular) bastante similares, indicando o alto grau de conservação das mesmas. Os dendrogramas gerados refletiram uma relação muito mais adaptativa do que filogenética entre os organismos. Além disso, também a estrutura gênica parece ser conservada em eucalipto e cana, como observado nas análises comparativas entre as ORFs destas culturas e as de seqüências genômicas de Arabidopsis e Oryza sativa. O padrão de expressão encontrado reflete o envolvimento destes fatores tanto no estresse biótico, quanto no estresse abiótico, com grande número de transcritos em tecidos infectados por bactérias, caule, raiz e região de transição raiz-caule. Em suma, os resultados apontam para a conservação dos principais mecanismos de controle da transcrição envolvidos na resistência/tolerância aos estresses, como a seca, salinidade e congelamento, em eucalipto, cana e arroz. No entanto, estudos adicionais, in vivo e in vitro, darão maiores subsídios para o melhor esclarecimento da funcionalidade destas proteínas e das vias em que participam estes genes

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-03T14:19:43Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 610443 bytes, checksum: ee9a2789ba69f40b8cb321b2bbde487a (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-03T14:19:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 610443 bytes, checksum: ee9a2789ba69f40b8cb321b2bbde487a (MD5) Previous issue date: 2015-06-03 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho teve o objetivo de avaliar diferentes níveis de cama de frango e esterco bovino na produção de cana-de-açúcar, com o intuito de possibilitar ao produtor rural um manejo com a utilização dos insumos produzidos em sua propriedade, preservar o meio ambiente e reduzir custos na produção. Neste sentido, foram desenvolvidos dois experimentos: no primeiro, foi utilizado delineamento experimental em blocos casualizados, com cinco tratamentos e quatro repetições, sendo os tratamentos 0, 3, 6, 9 e 12 t/ha de cama de frango. A calagem (4 t/ha) foi feita após análise do solo, à lanço, seguida de aração profunda (0,30 m) e gradagem, dois meses antes do plantio. Em outubro de 2013, sulcagem foi feita por ocasião do plantio, com 0,30 m de profundidade e espaçamento de 1,00 m. A cama de frango foi colocada no fundo do sulco, coberta com um pouco de terra, seguido do plantio da cana, variedade RB 867515, em espaçamento de 1,00 m entre linhas e duas fileiras de cana por sulco, sendo picada em tamanhos de 0,20 m. O controle de plantas espontâneas foi feito por capina manual. Os resultados não evidenciaram diferença entre os níveis de cama de frango sobre as variáveis avaliadas, aos quatro meses pós-plantio. O maior benefício foi observado no número de plantas emergidas, em que o nível de 6 t/ha proporcionou 39% mais plantas emergidas que o tratamento-controle. No período de corte, o efeito mais evidente da cama de frango sobre a cana foi sobre a produtividade de massa verde aos 12 meses após o plantio, que aumentou de forma linear com o aumento do nível da cama de frango. Portanto, constatou-se que podem ser usadas até 12 t/ha de cama de frango para maximizar o desempenho da cultura. O acúmulo de açúcar solúvel, representado pelo grau Brix, obtido no presente estudo, foi adequado quanto ao aspecto nutricional, com vistas ao uso na alimentação animal. No segundo experimento foi utilizado delineamento experimental em blocos casualizados, com cinco tratamentos e quatro repetições, sendo os tratamentos 0, 4,5, 9,0, 13,5 e 18,0 t/ha de esterco bovino. A calagem (4 t/ha) foi feita após análise do solo, à lanço, seguida de aração profunda (0,30 m) e gradagem, dois meses antes do plantio. Em outubro de 2013, a sulcagem foi feita por ocasião do plantio, com 0,30 m de profundidade e espaçamento de 1,00 m. O esterco bovino foi colocado no fundo do sulco, seguido do plantio da cana, variedade RB 867515, em espaçamento de 1,00 m entre linhas e duas fileiras de cana por sulco, sendo picada em tamanhos de 0,20 m. O controle de plantas espontâneas foi feito por capina manual. Aos quatro meses após o plantio da cana, houve efeito linear positivo do esterco bovino sobre altura da planta e diâmetro do colmo e quadrático positivo sobre largura e comprimento da maior folha. Não houve efeito do esterco bovino sobre o número de plantas/m linear e o número de folhas/planta. Houve efeito quadrático positivo do esterco bovino sobre a altura de plantas aos dez meses e linear positivo sobre a produção de massa verde aos 12 meses. Não houve efeito do esterco bovino sobre número das plantas, diâmetro do colmo, largura e comprimento da maior folha e número de folhas/planta aos dez meses. Não foi observada mudança de composição química, em função dos diferentes níveis de adubação. O efeito mais evidente do esterco bovino sobre a cana, no momento do corte, foi sobre o parâmetro mais desejável, que foi a produtividade de massa verde. / Two trials were performed in order to evaluate different levels of poultry litter and cow manure in sugarcane production, making possible to the producer a management using organic compounds produced in the farm, aiming to preserve the environment and with low cost of production of sugarcane. In the first trial, it was used a randomized blocks design, with five treatments and four replications, being the treatments 0.00, 3.00, 6.00, 9.00 and 12.00 t/ha of poultry litter. The limestone (4.00 t/ha) was applied after soil analysis, followed by deep tilling (0.30 m), two months before planting. The groove was done in October 2013, with 0.30 m deep and 1.00 m spacing. The poultry litter was placed at the bottom of the groove, covered with land, followed by planting sugarcane variety RB 867515, in 1.00 m spacing between grooves and two sugar cane side by side per groove line, being cut in 0.20 m sizes. The control of spontaneous plants was by hand weeding. The results showed big differences between levels of poultry litter on the evaluated variables at four months after planting. The greatest benefit was observed in the number of emerged plants, in which the level of 6.00 t/ha provided 39% greater number that the control treatment. The most evident effect of the poultry litter in the cutting period of sugarcane was on the productivity of green mass at 12 months after planting, which increased linearly. Therefore, up to 12.00 t/ha of poultry litter can be used to maximize the performance of sugarcane. The accumulation of soluble sugar, represented by the Brix degree, obtained in the present study is adequate nutritionaly to be used in animal feeding. In the second trial, it was used a randomized blocks design, with five treatments and four replications, being the treatments 0.00, 4.50, 9.00, 13.50 and 18.00 t/ha of cow manure. The limestone (4.00 t/ha) was applied after soil analysis, followed by deep tilling (0.30 m), two months before planting. The groove was done in October 2013, with 0.30 m deep and 1.00 m spacing. The cow manure was placed at the bottom of the groove, followed by planting sugarcane variety RB 867515, in 1.00 m spacing between grooves and two sugar cane side by side per groove line, being cut in 0.20 m sizes. The control of spontaneous plants was by hand weeding. Four months after planting the sugar cane, there was positive linear effect of cow manure on plant height and culm diameter, and quadratic positive effect on width and length of the largest leaf. There was no effect of cow manure on number of plants/m linear and the number of leaves/plant. There was quadratic positive effect of cow manure on plant height at 10 months and linear positive effect on the production of green mass at 12 months. There was no effect of cow manure on number of plants, culm diameter, width and length of the largest leaf and number of leaves/plant at ten months. It was not observed change of chemical composition as a function of the different levels of fertilization. In conclusion, the most important effect of cow manure at the time of the cut was on the most desirable parameter: the productivity of green mass.

A cana-de-açúcar é uma gramínea C4 cuja principal característica é o acúmulo de altas concentrações de sacarose no colmo. As variedades comerciais são derivadas de cruzamentos de S. officinarum, que possui colmos grossos com alto teor de açúcar, e S. spontaneum, que apresenta colmos finos, fibrosos, com baixo teor de açúcar, mas com maior perfilhamento e resistência a estresses. O desenvolvimento da tecnologia do bioetanol celulósico, no qual o bagaço é utilizado para produção de bioetanol, tem gerado o interesse no desenvolvimento da cana energia, que possui mais fibra e biomassa, porém menos sacarose. Para isso, é importante o entendimento das vias regulatórias de biossíntese de parede celular, principal constituinte da biomassa vegetal. Ainda, as variedades comerciais possuem uma base genética estreita, que pode ser um dos fatores responsáveis pela diminuição dos ganhos de produtividade que vem sendo observada a cada variedade lançada. Isso mostra a importância de se voltar aos genótipos ancestrais para identificar genes que possam ser importantes para o melhoramento da cana-de-açúcar, incluindo o desenvolvimento da cana energia. Assim, o presente trabalho analisou o transcriptoma de três genótipos ancestrais e dois híbridos comerciais, juntamente com a caracterização de dados morfo-fisiológicos. Essa abordagem permitiu ligar padrões de expressão gênica aos fenótipos e identificar genes e vias regulatórias que estão possivelmente relacionadas aos mecanismos que determinam características como produtividade, acúmulo de sacarose e lignina, principalmente genes de regulação da estrutura da cromatina, metabolismo de parede celular e algumas famílias de fatores de transcrição. A expressão desses genes apresentou maior correlação com acúmulo de sacarose do que a expressão dos próprios genes do metabolismo de sacarose. S. spontaneum foi o genótipo que apresentou perfil de expressão e fenótipos mais distintos, mostrando um potencial biotecnológico para produção de biomassa. A integração dos resultados sugere que o acúmulo de sacarose compete com o de lignina e que o controle do crescimento em entrenós mais jovens pode ser importante para a maior produtividade. Também foram construídas bibliotecas de cDNA full length e estas apresentaram 90% de insertos completos. O sequenciamento dessas bibliotecas revelou uma grande quantidade de transcritos novos e específicos do gênero Saccharum, juntamente com um número significativo de transcritos antissense e milhares de genes diferencialmente expressos que podem estar associados, principalmente, às diferenças de resistência a estresses de S. officinarum e S. spontaneum. Essas bibliotecas fornecem uma grande plataforma para estudos posteriores para descoberta de polimorfismos, splicing alternativo e alelos que possam ser importantes nas características dos genótipos. Ainda, foram identificadas sequências promotoras de genes do metabolismo de parede celular e de alguns candidatos a estarem envolvidos nesse processo; vários apresentaram sítios de ligação conservados responsivos a fatores de transcrição da biossíntese de parede celular, mas algumas diferenças importantes foram identificadas, evidenciando divergências evolutivas entre cana-de-açúcar e outras espécies. Nossos dados mostram-se importantes por avançar no entendimento das vias envolvidas no metabolismo de parede celular em cana-de-açúcar assim como por caracterizar parte da variabilidade dos genótipos ancestrais. / Sugarcane is C4 grass whose main characteristic is the accumulation of high concentrations of sucrose in its stem. Commercial varieties are derived from crosses between S. officinarum, which has thick culms with high sugar content, and S. spontaneum, which has thin fibrous culms, with low sugar content, but presents high tillering and stress tolerance. The development of cellulosic bioethanol technology, on which the bagasse is used to produce bioethanol, has raised the interest to produce the energy cane, which has high fiber content and biomass yield instead of sucrose. For this purpose, it is important to obtain knowledge on the regulatory pathways of the biosynthesis of the cell wall, the main component of plant biomass. Still, commercial varieties have a narrow genetic basis and this could be one of the reasons for the reduction on yield gains that has been noticed for new varieties released. This shows the importance to return to ancestor genotypes to identify genes that might be important for sugarcane improvement, as well as for energy cane development. The present work analyzed the transcriptome of three ancestor genotypes and two commercial hybrids, together with the characterization of morphophysiological traits. This approach allowed us to link gene expression pattern and phenotypes to identify genes and regulatory pathways that might be related to the mechanisms determining traits, such as yield, sugar and lignin content, especially genes related to chromatin structure regulation, cell wall metabolism and some transcription factors families. The expression of those genes showed a greater correlation to sucrose content than expression of sucrose metabolism genes itself. S. spontaneum is the genotype with the most distinct expression profile and phenotype, showing a biotechnological potential for biomass production. The integration of the results suggests that sucrose accumulation competes with lignin and the control of growth in younger internodes might be important in determining higher yield. In addition, full length cDNA library has been constructed and they showed 90% full length inserts confirmed. High-throughput sequencing revealed a large number of new and specific Saccharum transcripts, as well as a significant number of antisense transcripts and thousands of differentially expressed genes that might be related to, especially, the differences of stress tolerance of S. officinarum and S. spontaneum. These libraries provide a large platform for future studies to discover polymorphisms, splicing variants and alleles that might be important to genotype\'s traits. We also identify promoter sequences from cell wall-related genes and some candidates to be involved in this process; several of them showed conserved binding sites responsive to cell wall-related transcription factors, however, some differences were also identified, showing an evolutionary divergence among sugarcane and other species. Our data are important for advancing knowledge on cell wall-related pathways in sugarcane as well as for the characterization of genetic variability of ancestor genotypes.

Sorgo sacarino e cana-de-açúcar são duas importantes gramíneas com fins potencialmente bioenergéticos. No entanto, apesar do conhecido relacionamento evolutivo, os genomas dessas espécies diferem em complexidade e tamanho. O sorgo, Sorghum bicolor, é diploide, com número básico de cromossomos igual a dez, os quais totalizam ~ 726 Mb já sequenciadas. Já a cana cultivada, Saccharum × officinarum, é um autopoliploide com frequente aneuploidia, e apresenta genoma monoploide estimado em ~ 1 Gb. Provavelmente, decorre deste fato, e dos cruzamentos interespecíficos que originaram as variedades atuais, a relativa dificuldade em se realizar estudos genéticos em cana, e, como consequência, em se incrementar os trabalhos de melhoramento na espécie. Nesse contexto, a possibilidade de integrar estudos de mapeamento entre sorgo e cana torna-se viável dado o emprego de metodologias apropriadas. O presente trabalho objetivou mapear e comparar QTLs para caracteres agro-industriais nos genomas de ambas as espécies, baseando-se no relacionamento evolutivo existente entre elas. Para tanto, foram utilizadas duas populações de mapeamento. A população de sorgo sacarino foi constituída por 223 RILs genotipadas por mais de cem mil marcadores baseados em GBS fisicamente mapeados contra o genoma da espécie. A população de cana-de-açúcar constituiu-se de uma progênie F1 segregante com 153 indivíduos genotipados por 500 marcadores baseados em géis (SSR e TRAP) e 7.049 marcadores baseados em GBS, segregando em dose única. Esses marcadores possibilitaram a construção de um mapa genético informativo e saturado, com 993 marcadores distribuídos ao longo de 223 grupos de ligação, totalizando 3.682,05 cM. Ambas as populações foram avaliadas para quatro caracteres de interesse bioenergético: altura de colmos, toneladas de colmos ou de massa verde por hectare, e porcentagens de pol de caldo e de fibra. Modelos mistos foram utilizados para a análise dos dados fenotípicos, evidenciando a existência de interação genótipo-ambiente a partir da estruturação de matrizes de variâncias-covariâncias genéticas. As médias ajustadas conjunta e marginalmente foram utilizadas na descoberta de QTLs. Para este fim, modelos de mapeamento de múltiplos intervalos uni- e multivariados foram utilizados e determinaram a descoberta de 53 e 36 regiões contendo QTLs para as populações de sorgo e cana, respectivamente, para o conjunto dos quatro caracteres. Os genomas foram comparados utilizando os marcadores baseados em GBS de cana com informação posicional em relação ao genoma do sorgo. Um total de 16 regiões sintênicas identificadas entre as espécies possibilitaram inferências a respeito do controle evolutivamente conservado dos caracteres relacionados. Mais oito regiões foram adicionadas a estas após análise de marcadores individualmente para a população de cana. A descoberta dessas regiões subjacente à variação de caracteres bioenergéticos sugere aplicações na clonagem de genes e na seleção assistida por marcadores, beneficiando os programas de melhoramento de ambas as espécies. / Sweet sorghum and sugarcane are two important grasses for bioenergy purposes. However, despite their known evolutionary relationship, the genomes of these species differ in complexity and size. Sorghum bicolor is a diploid species, with basic chromosome number of ten and ~ 726 Mb completely sequenced, whereas Saccharum × officinarum has a autopolyploid genome with frequent aneuploidy and monoploid size estimated at ~ 1 Gb. Therefore, genetic studies and breeding in sugarcane is challenging. In this context, the possibility of integrating mapping studies between sorghum and sugarcane becomes feasible given the recent development of appropriate methodologies. In this work, we aimed to map and compare QTLs for bioenergy traits in both species. To do this, two mapping populations were used. The population of sorghum consisted of 223 RILs genotyped by more than one hundred thousand GBS-based markers, which were physically mapped against the species genome. The population of sugarcane is an F1 segregating progeny with 153 individuals genotyped by 500 gel-based (SSR and TRAP) and 7,049 GBS-based single-dose markers. These markers allowed the construction of an informative and dense genetic map with 993 markers belonging to 223 linkage groups and spanning 3,682.05 cM. Both populations were evaluated for four bioenergy traits: stalk height, prodution in tons per hectare, and percentages of pol and fiber. Mixed models were used to analyze phenotypic data and showed genotype-by-environment interaction on their genetic variance-covariance structures. Joint and marginal adjusted means were used for QTL discovery. Toward this end, univariate and multivariate multiple interval mapping models were used, and a total of 53 and 36 QTLs were found for sorghum and sugarcane, respectively. Comparison of the genomes were based on GBS markers in sugarcane with relative sorghum chromosome information. A total of 16 syntenic regions were identified between the species, allowing inferences in relation to evolutionary conserved control of the related traits. In addition, eight regions were also identified by considering single marker analyses. The discovery of QTLs underlying such bioenergy traits may suggest further applications in gene cloning and marker assisted selection for both sweet sorghum and sugarcane species.

A cana-de-açúcar é uma das principais culturas agroindustriais do Brasil. Como outras culturas de importância econômica, é também afetada por diversos patógenos como fungos, bactérias, vírus e fitoplasmas que podem limitar sua produção. A bactéria fastidiosa Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx) é o agente causal do raquitismo-da-soqueira da cana-de-açúcar (RSD). Esta doença não apresenta sintomas externos característicos de fácil reconhecimento. Dessa forma, a incidência do RSD pode não ser perceptível durante inspeções visuais de campo e, assim, ser facilmente disseminado de uma região para outra. A bactéria restrita ao xilema é transmitida mecanicamente de plantas infectadas para plantas saudáveis por meio da seiva presente em ferramentas de corte e em outros equipamentos durante o plantio, o cultivo e a colheita da cultura. Em razão da importância da cana-de-açúcar e do dano causado por Lxx, este trabalho visou avaliar a termoterapia e o cultivo in vitro em dois experimentos direcionados à obtenção de plantas de cana-de-açúcar da variedade SP80-3280 livres de Leifsonia xyli subsp. xyli e, assim, fornecer subsídio para o aprimoramento das medidas atuais de controle. O primeiro experimento combinou a termoterapia de toletes de uma gema (52 °C por 30 minutos) com o cultivo de meristemas apicais de três tamanhos (0,5 mm, 1,0 mm e 1,5 mm); o segundo combinou três tempos de termoterapia (1 hora, 2 horas e 3 horas) a 50 °C em gemas laterais imaturas isoladas do tolete com o cultivo in vitro. No primeiro experimento, os resultados de RT-PCR das amostras coletadas aos 15 dias na casa de vegetação mostraram que os três tamanhos de meristemas produziram plantas com títulos bacterianos em média 25 vezes mais baixos que suas genitoras, mas não as isentaram completamente de Lxx, com exceção de 8 plantas que não apresentaram Lxx com 90 dias de cultivo (4 plantas provenientes do cultivo de meristemas de 0,5 mm, 1 planta de meristema de 1,0 mm e 3 plantas de meristemas de 1,5 mm). Além disso, os meristemas de 0,5 mm não necessariamente regeneraram plantas com títulos mais baixos da bactéria quando comparados com os meristemas de 1,0 mm e 1,5 mm, mostrando que estes tamanhos testados não apresentaram correlação direta com o nível de infecção da planta regenerada por eles. Em relação ao segundo experimento, os resultados de RT-PCR mostraram que o incremento no tempo de termoterapia proporcionou maior redução nos títulos bacterianos, sendo os tratamentos de 2 horas e 3 horas os mais bem sucedidos com média de redução de 80,08% e 81,73%, respectivamente, mas não foi capaz de eliminar a bactéria. Portanto, estes experimentos demonstram que a termoterapia associada ao cultivo de tecidos é uma metodologia promissora, pois apresentaram redução da presença da bactéria Lxx em plantas de cana-de-açúcar, mas por não terem sido totalmente efetivos na eliminação da mesma, reforça a necessidade de estudos complementares. / Sugarcane is one of the major agro-industrial crops of Brazil. Like other crops of economic importance, it\'s also affected by several pathogens such as fungus, bacteria, viruses and phytoplasmas that may limit its production. The fastidious bacterium Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx) is the causal agent of ratoon stunting disease in sugarcane (RSD). This disease shows no external symptoms characteristic of easy recognition. Thus, the incidence of RSD may not be noticeable during visual inspection in the field and be easily spread from one region to another. The xylem-limited bacterium is transmitted mechanically from infected plants to healthy plants by the sap present in cutting tools and others equipments for planting, growing and harvesting the crop. Due to the importance of sugarcane and the damage caused by Lxx, this work aimed to evaluate thermotherapy and in vitro culture in two experiments in order to obtain sugarcane plants of variety SP80-3280 free from Leifsonia xyli subsp. xyli and thus provide subsidy for the improvement of current control methods. The first experiment combined thermotherapy on the individual bud (52 °C for 30 minutes) and the cultivation of apical meristems of three sizes (0,5 mm, 1,0 mm and 1,5 mm); the second combined three period of thermotherapy (1 hour, 2 hours and 3 hours) at 50 °C in immature lateral buds totally isolated from the tissue source followed by in vitro culture. In the first experiment, the results of RT-PCR samples collected at 15 days in the greenhouse showed that the three sizes of meristems produced plants with bacterial titers on average 25 times lower than their mother plants, but not completely exempted them from Lxx, except 8 plants that showed no Lxx after 90 days of cultivation (4 plants were from cultivation of meristems with 0,5 mm, 1 plant from 1,0 mm meristem and 3 plants from 1,5 mm meristems size). Furthermore, the meristems of 0,5 mm does not necessarily regenerate plants with lower title of the bacteria compared with the meristems of 1.0 mm and 1.5 mm, showing that these sizes tested did not present direct correlation with the level of infection on the plants regenerated from them. Regarding the second experiment, RT-PCR results showed that the increase in time of thermotherapy provided greater reduction in bacterial titers, and the treatments of 2 and 3 hours were the most successful with average reduction of 80,08 % and 81,73%, respectively, but was not able to eliminate the bacteria. Therefore, these experiments showed that thermotherapy associated with tissue culture is a promising methodology because it reduced titer of Lxx in sugarcane, but were not fully effective in eliminating the same, reinforcing the need for complementary studies.

Made available in DSpace on 2016-12-23T14:37:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luciano Roncete Pimenta.pdf: 4278509 bytes, checksum: cdad20bdec2ee8d4e840d4a31725f4c8 (MD5) Previous issue date: 2012-12-14 / O Painel Intergovernamental sobre Mudanças Climáticas - IPCC vem alertando que o aquecimento global é inequívoco. Já está evidenciada uma elevação de aproximadamente 0,2 °C na temperatura média global nos últimos 30 anos. Os resultados apresentados no Quarto Relatório de Avaliação das Mudanças Climáticas Globais do IPCC (IPCC-AR4), publicado em 2007, alertam para um aumento médio global das temperaturas entre 1,8 °C e 6,4 °C até 2100. Assim, a aptidão climática para as culturas das diversas regiões do planeta será modificada. A necessidade de substituição dos combustíveis fósseis por fontes renováveis de energia torna a cana-de-açúcar uma cultura estratégica devido à produção de etanol, fonte de energia renovável. Na América do Sul, a cana-de-açúcar representa uma cultura de grande potencial econômico. O objetivo deste trabalho foi avaliar os potenciais efeitos das mudanças climáticas projetadas sobre o zoneamento agroclimático para a cana-de-açúcar na América do Sul. Os períodos considerados foram 1961-1990 centrado na década de 1980, como referência, e as projeções climáticas pelo modelo OM-ECHAM5_MPI no cenário A2 (cenário de visão pessimista do mundo) para os períodos de 2010-2039, 2040-2069, 2070-2099, centrados nas décadas de 2020, 2050 e 2080 respectivamente. O balanço hídrico climatológico foi calculado segundo a metodologia proposta por Thornthwaite & Mather (1955) e a evapotranspiração potencial - ETP (mm dia-1) calculada pela metodologia proposta por Thornthwaite (1948). Para o Zoneamento Agroclimático, as classes consideradas foram: áreas aptas; áreas restritas por temperatura média anual; áreas restritas por deficiência hídrica; e áreas inaptas. Toda a metodologia de cálculo da estimativa do balanço hídrico foi implementada no Software Matlab 6.5® para obtenção das variáveis Deficiência Hídrica Anual (Da) e Excedente Hídrico Anual (Ea). Entre os resultados obtidos verifica-se que: as áreas aptas que em 1980 correspondia a 10,9% serão diminuídas para 8,6% na década de 2080; as áreas inaptas diminuirão de 51,6% para 32,3% da década de 1980 até 2080; e algumas áreas do sul que na década de 1980, foram consideradas inaptas, se tornarão apta devido aquecimento global projetado pelo IPCC / The Intergovernmental Panel on Climate Change - IPCC has been alert that the global warming is unequivocal. It is evidenced an elevation of about 0,2 °C in global temperature over the last 30 years. The results presented in the Fourth Assessment Report on Global Climate Change IPCC (IPCC-AR4), published in 2007, alert for a mean increase global temperatures between 1.8 °C and 6.4 º C by 2100. Thus, the climate suitability for crops in different regions of the planet will be modified. The necessity of replacing fossil fuels with renewable energy sources makes the cane sugar a strategic crop due to ethanol production, renewable energy source. In South America, the sugar cane is a crop of great economic potential. The objective of this study was to evaluate the potential effects of climate change projected on the agroclimatic zoning for the cane sugar in the South America. The periods considered were 1961-1990 decade centered on 1980, as reference, and climatic projections by the model OM-ECHAM5_MPI in the scenario A2 (scenario of pessimistic view of the world) for the periods 2010-2039, 2040-2069, 2070 - 2099, focused on the decades of 2020, 2050 and 2080 respectively. The climatic water balance was calculated second the methodology proposed by Thornthwaite & Mather (1955) and the potential evapotranspiration - ETP (mm day-1) calculated by the methodology proposed by Thornthwaite (1948). For the agroclimatic zoning the classes considered were: suitable areas, areas restricted by annual mean temperature, areas restricted by water deficit, and unsuitable areas. All the methodology of calculation of the estimated water balance was implemented in Matlab 6.5® Software for obtain the variable Annual Water Deficiency (Da) and Annual Water Surplus (Ea). Among the results obtained check that: the suitable areas that in the decade 1980 were 10.9% is decreased to 8.6% in the decade 2080; the unsuitable areas decrease from 51.6% to 32.3% of the decade 1980 until 2080; and some areas in the south that in the decade 1980 were considered unsuitable, will become suitable areas due the global warming projected by IPCC