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A study on the molecular and epidemiological characteristics of antibiotic-resistant salmonellae isolated in Hong Kong. / CUHK electronic theses & dissertations collectionJanuary 2008 (has links)
A total of 842 single patient isolates of Salmonella spp. from the New Territories East Cluster hospitals, Hong Kong, were collected during 2002 and 2004. The most common Salmonella enterica serotype isolated was S. Enteritidis (29.7%, 250 of 842) followed by S. Typhimurium (13.7%, 115 of 842). The remaining 29.6% (249 of 842) belonged to 44 serotypes and 27.1% (228 of 842) were non-typeable. The majority of isolates were from patients aged two years or younger and were isolated during June to October of each of the three years. The susceptibilities to 19 antimicrobial agents of the 834 isolates that survived were tested. Resistant strains were investigated for [1] the mechanisms of resistance to fluoroquinolones and the third generation cephalosporins; [2] the genetic mechanisms of emergence of antibiotic-resistant salmonellae; and [3] their molecular epidemiology. / Less than half (46.9%, 391 of 834) of the isolates were susceptible to all the antimicrobial agents tested and 21.3% (178 of 834) were resistant to three and up to 14 in a total of 75 resistance patterns. Resistance to nalidixic acid increased from 18.9% (53 of 280) in 2002 to 36.6% (94 of 259) in 2004 (p <0.001) while reduced susceptibility and resistance to ciprofloxacin increased from 17.9% (50 of 280) to 39.4% (102 of 259) (p <0.001). All salmonellae remained susceptible to the third generation cephalosporins until 2003 when we isolated the first resistant isolate and two more in 2004. / No mutations in the quinolone resistance-determining region of target genes gyrA, gyrB, parC and parE were detectable in six of the 59 isolates that were resistant to 0.03 mg/l of ciprofloxacin and 14 that were susceptible to 0.03 mg/l of ciprofloxacin, all isolates being obtained in 2002. Forty-two isolates harboured one mutation, and one to eight harboured two to four mutations with those in positions Ser83 and/or Asp87 of the gyrA gene being the most common (89.8%, 53 of 59). No mutation was detected in the gyrB gene. A parC mutation at Ser80 was present only in strains with one or two gyrA mutation(s) while that at Thr57 could be present in strains without any other target gene mutations. A parE mutation (Ser458→Pro) was detected together with two gyrA and one parC mutations in only one isolate which was resistant to high concentrations of fluoroquinolones. Complementation experiments using a wild-type gyrA gene performed on isolates with gyrA gene mutations showed that mutations in gyrA contributed to fluoroquinolone-resistance. Only two among the 349 isolates that were obtained during 2002-2004 and resistant to 0.03 mg/l of ciprofloxacin harboured the qnr gene. / Of the three isolates that were resistant to the third generation cephalosporins, one, a S. Typhimurium, produced a beta-lactamase, CTX-M-9, of pI 8.1, and two, a S. Typhimurium and a S. Enteritidis, produced CTX-M-14, of pI 7.9. The blaCTX-M-9 gene was located on a class 1 integron on a 62 kb transferable plasmid and the blaCTX-M-14 gene was associated with the insertion sequence ISEcp1 and present on a 70 kb and a 92 kb transferable plasmid, respectively. This is the first report of a CTX-M-9 enzyme in S. Typhimurium in Hong Kong. (Abstract shortened by UMI.) / The MICs of nalidixic acid in the presence of 20 mg/l of Phe-Arg beta-naphthylamide (PAbetaN) for the 73 isolates that were tested for the presence of target gene mutations and S. Typhimurium ATCC 13311 were at least 4-fold lower than those of nalidixic acid in the absence of PAbetaN, indicating presence of an efflux system that could be inhibited by PAbetaN and of which nalidixic acid was a substrate. / Twenty-one isolates with different target gene mutations and fluoroquinolone susceptibilities were selected to investigate the effect of active efflux system, outer membrane permeability and target gene expression on fluoroquinolone-susceptibility. The amount of ciprofloxacin accumulated in the presence of carbonyl cyanide m-chloro-phenylhydrazone (CCCP) was significantly more than that in the absence of CCCP in 15 of these 21 strains, indicating presence of an efflux system that used proton motive force as energy. The amount of ciprofloxacin accumulated in 15 strains was significantly less than that in the standard strain (ATCC 13311) after the addition of CCCP, indicating that these strains were less permeable to ciprofloxacin than the standard strain. Real-time PCR experiments revealed that there were strains with overexpression of target genes as well as the acrB gene that codes for AcrB in the AcrAB-TolC efflux system. No aac(6')-Ib-cr was detected in our strains. / Jin, Yujuan. / "January 2008." / Adviser: M. L. Ling. / Source: Dissertation Abstracts International, Volume: 69-08, Section: B, page: 4543. / Thesis (Ph.D.)--Chinese University of Hong Kong, 2008. / Includes bibliographical references (p. 195-219). / Electronic reproduction. Hong Kong : Chinese University of Hong Kong, [2012] System requirements: Adobe Acrobat Reader. Available via World Wide Web. / Electronic reproduction. [Ann Arbor, MI] : ProQuest Information and Learning, [200-] System requirements: Adobe Acrobat Reader. Available via World Wide Web. / Abstract in English and Chinese. / School code: 1307.
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Atividade mutagênica em bacia hidrográfica influenciada por sítio de contaminação de solosCosta, Thatiana Cappi da January 2010 (has links)
A região objeto do presente estudo compreende uma área localizada às margens do rio Taquari, no município de Triunfo (RS), que pertence à bacia hidrográfica Taquari – Antas, com contaminação de solo específica por preservantes de madeira, cujo passivo ambiental são pentaclorofenol, creosoto e hidrosal arseniato de cobre cromado. O local é percorrido por corpos d’água associados à drenagem principal, formando sub-bacias. Através dos ensaios de microssuspensão com Salmonella/microssoma e Allium cepa, o trabalho teve por objetivo relacionar a atividade genotóxica com rotas de dispersão de poluentes. Analisando a área do sítio contaminado a partir dos extratos orgânicos do material drenado para o corpo d’água, após eventos de chuvas significantes e análises de extrato orgânico, água intersticial e sedimento bruto do rio. No teste Salmonella/microssoma, diversas linhagens permitiram avaliar diferentes danos ao DNA, como deslocamento no quadro de leitura (TA97a e TA98) e substituição de pares de base (TA100) em ausência (-S9) e presença (+S9) de ativação metabólica. No teste de Allium, foi possível verificar alterações em nível cromossômico. Respostas positivas de mutagenicidade pelo teste de Salmonella/microssoma do material exportado para fora da área do sítio indicam que este material pode estar sendo carreado para o rio Taquari. Isto pode ser evidenciado pela atividade mutagênica detectada em ambos os testes, na amostra de sedimento do rio coletada em frente ao sítio contaminado. O ponto a jusante no rio em relação ao ponto em frente ao sítio contaminado também foi avaliado e atividade mutagênica foi detectada, já o ponto de referência a montante mostrou pequena atividade mutagênica proveniente de fonte de contaminação diferente. Entretanto, tais poluentes não foram detectados no ponto abaixo. Os bioensaios empregados puderam indicar um possível risco de contaminação para o rio Taquari e mostraram ser eficientes para avaliar a mutagenicidade no material drenado do solo e no sedimento do rio. Embora a atividade mutagênica possa ser relacionada em parte à presença de hidrocarbonetos policíclicos aromáticos nos extratos orgânicos das amostras, derivados do preservante de madeira creosoto ou de fontes antrópicas diversas, outros compostos orgânicos podem ser encontrados nos extratos, uma vez que resíduos de pentaclorofenol estão presentes no sítio. Além disso, a complexidade das amostras de sedimento do rio poderia ainda sofrer a influência de traços de metais pesados. / Mutagenic activity, using Salmonella/microsome and Allium cepa bioassay, was employed as markers to detect pollutant dispersion routes in contaminated soil site covered by water bodies associated with the drainage toward the river. The site of the present study comprises an area located along the banks of the Taquari River, in the city Triunfo (RS) belonging to the Taquari - Antas river basin with identified environmental contaminants (pentachlorophenol, creosote and hydrosalt CCA). The Salmonella/microsoma test evaluated organic extracts of the material drained into the water body after significant rain events as well as Taquari River samples including organic sediment extract, interstitial water and gross sediment. In the Salmonella/microsome test, different strains enabled evaluation of different DNA mutations including frameshift (TA97a and TA98) and base pair substitution (TA100) in the absence (- S9) and presence (+S9) of metabolic activation. The Allium test allowed verification of chromosomal alterations. Positive mutagenicity results in the Salmonella/microsome assay of material from the area indicate that contaminant mixtures may have drained into the Taquari River, as indicated by mutagenic activity detected in both bioassays in sediment samples collected at the contaminated site. Mutagenic activity was also detected at a site downstream from the contaminated site. Although the reference area upstream showed low mutagenic activity originating from a different pollutant source, such pollutants were not found at the downstream sites. The bioassays employed, mainly the Salmonella/microsome assay, can indicate a possible contamination route toward the Taquari River and were proven efficient at evaluating the mutagenicity of drained soil material and sediment from the river.
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Salmonella spp. em ovos brancos para consumo humano /Campello, Paula Letícia. January 2012 (has links)
Orientador: Angelo Berchieri Júnior / Banca: Oswaldo Durival Rossi Júnior / Banca: Nilce Maria Soares / Resumo: Salmonella spp. é um dos patógenos mais comumente encontrados em infecções de origem alimentar em seres humanos. Ovos, produtos contendo ovos e carne de aves são os principais veículos de transmissão do microrganismo, representando um desafio para saúde pública. Com o intuito de pesquisar Salmonella spp. em ovos brancos destinados ao consumo humano foram analisadas, por meio de análise microbiológica convencional e pela Reação em Cadeia pela Polimerase, 340 amostras compostas por cinco ovos cada, de quatro diferentes estabelecimentos comerciais. Foram observadas, do número total de amostras, cinco contaminadas pela bactéria (1,47%), sendo três provenientes do supermercado A (2,9%), uma do supermercado B (1,3%) e uma do supermercado D (1,3%) tanto na pesquisa bacteriológica quanto na PCR, não se isolando a bactéria em nenhuma das amostras do supermercado C. Os sorovares isolados nas amostras provenientes do supermercado A e B foram Salmonella Mbandaka e Salmonella enterica subespécie enterica 6,7: z10:- e Salmonella Braenderup no supermercado D. No teste para analisar o comportamento dos isolados frente a antimicrobianos, todas as estirpes apresentaram resistência a pelo menos três dos antimicrobianos testados. Os resultados demonstraram que ovos contaminados estão chegando à mesa dos consumidores, representando um risco a saúde da população / Abstract: Salmonella spp. is one of the most common pathogens found in food-borne infections in humans. Products containing eggs and poultry meat are the main vehicles of transmission of microorganisms, representing a challenge for public health. In order to search for Salmonella spp. white eggs for human consumption were analyzed by methods of conventional microbiological analysis and by the Polymerase Chain Reaction, 340 samples composed of five eggs, of four different establishments. Of the total samples, five were contaminated by bacteria (1.47%). Three of them were from supermarket A (2.9%), one from supermarket B (1.3%) and one from supermarket D (1.3%), all contaminated in bacteriological analyzes and in PCR, and the bacteria was not isolated in the samples of the supermarket C. The serovars isolated in samples from the supermarket A and B were Salmonella Mbandaka and Salmonella enterica subspecies enterica 6,7: z10: - and Salmonella Braenderup at the supermarket D. In a test to analyze the behavior of isolated bacteria against antimicrobial agents, all strains were resistant to at least three of the antimicrobials tested. The results showed that contaminated eggs are coming to the consumers table, representing a risk to health / Mestre
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Susceptibilidade a antimicrobianos e resistência plasmidial de cepas de Salmonella spp isoladas de dois estuários do Estado do Ceará, Brasil /Figueirêdo, Francileide Vieira. January 2008 (has links)
Resumo: A salmonelose é uma das doenças de origem alimentar mais freqüente e considerada uma das zoonoses mais relevantes para a saúde pública em todo o mundo. A Organização Mundial de Saúde (OMS) assinalou aumento alarmante de estirpes de Salmonella resistentes aos antibióticos devido ao seu uso abusivo em criações intensivas, especialmente nas aquícolas. Diante do exposto, o escopo deste trabalho foi o de isolar e identificar a resistência plasmidial em bactérias do gênero Salmonella, em amostras de água de dois ambientes estuarinos, um do Norte (Acaraú) e outro do Sul (Jaguaribe) do Estado do Ceará, ambos com atividades de carcinicultura. Durante sete meses, de novembro de 2006 a maio de 2007, foram coletadas 84 amostras de água dos dois estuários. A pesquisa de Salmonella seguiu a metodologia do "Bacteriological Analytical Manual". As salmonelas foram testadas quanto à susceptibilidade a dez antimicrobianos: Ácido nalidíxico, Ampicilina, Ciprofloxacina, Ceftriazona, Cloranfenicol, Gentamicina, Imipenem, Nitrofurantoína, Sulfametoxazol e Tetraciclina. A Concentração Inibitória Mínima dos antibióticos seguiu a técnica de macrodiluição em caldo. Em atividade de base, mediu-se o pH, a temperatura e a salinidade da água. Foram confirmadas 103 cepas de Salmonella, 90 no Rio Acaraú e 13 no Rio Jaguaribe, pertencentes aos sorovares: S. Newport, S. Saintpaul, S. Panama, S. Rubislaw, S Albany, S. Anatum, S. Corvallis, S. Madelia. O Rio Acaraú apresentou-se mais contaminado do que o Rio Jaguaribe, onde foram encontradas cepas resistentes a antimicrobianos, com um percentual de 25% para resistência plasmidial, e 75% para a cromossômica. Esses resultados ressaltam dois problemas de saúde pública: a presença de cepas de Salmonella resistentes e a possibilidade de contaminação humana pelo consumo dos crustáceos. Somado a isso,...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Salmonellosis is one of the most common foodborne diseases, was considered and the most important for public health authorities throughout the world. The World Health Organization (WHO) recently drew attention to the rapid increase in Salmonella strains resistant to antibiotics employed in farming activities, especially in aquaculture. Thus, the objective of this study was to test the antimicrobial susceptibility of Salmonella strains isolated from water samples collected in the estuaries of the Acaraú and Jaguaribe rivers (respectively in the north and south of Ceará State, Brazil), both of which are subject to extensive shrimp farming. Eighty-four samples were collected between November 2006 and May 2007. The susceptibility tests were performed following the guidelines of the Bacteriological Analytical Manual (BAM). The strains were exposed to 10 different antibiotics: nalidixic acid, ampicillin, ciprofloxacin, ceftriaxone, chloramphenicol, gentamicin, imipenem, nitrofurantoin, sulfamethoxazole and tetracycline. The minimum inhibitory concentration of the antibiotics was determined with the broth macrodilution method. In base activity, mensure the factores as Temperature, salinity and pH values were registered for all water samples. One hundred three Salmonella strains were isolated (Acaraú n=90; Jaguaribe n=13) belonging to the serotypes S. Newport, S. Saintpaul, S. Panama, S. Rubislaw, S Albany, S. Anatum, S. Corvallis and S. Madelia. Thus, the Acaraú river was more severely contaminated than the Jaguaribe river, where strains resistant to antimicrobial were found in a rate of 25% to plasmid resistance and 75% to chromosomal resistance. These results show up two problems of public health: the presence of resistant strains of Salmonella and the possibility of human contamination though crustacean consumption. In addition to this,...(Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Julieta Rodini Engracia de Moraes / Coorientador: Regine H. S. dos Fernandes Vieira / Banca: Fabiana Pilarski / Banca: Angela Cleusa de Fátima Banzatto de Carvalho / Banca: Gilson Pereira de Oliveira / Banca: Fabiana Rizzi Bozzo / Doutor
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Salmoneloses: avaliação epidemiológica, clínica e laboratorial dos pacientes do Instituto de Infectologia Emílio Ribas com infecção por Salmonella spp. no período de janeiro de 1992 a dezembro de 2002 / Salmonellosis: epidemiological, clinical and laboratorial evaluation of the patients from \"Instituto de Infectologia Emílio Ribas\" with infection due to Salmonella spp. in the period from January 1992 to December 2002João Manoel Cruz Nascimento 24 April 2007 (has links)
OBJETIVOS: conhecer os perfis epidemiológico, clínico e laboratorial dos pacientes com infecção por Salmonella spp. e o perfil de sensibilidade antimicrobiana destas cepas de Salmonella spp., no Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo (SP), no período de 1992 a 2002.MÉTODOS: revisão dos prontuários médicos dos pacientes e avaliação do perfil de sensibilidade das cepas de Salmonella ssp. pelo método de disco difusão das cepas aos antimicrobianos ciprofloxacina, ceftriaxone, cloranfenicol, ácido nalidíxico, ampicilina, sulfametoxazol-trimetropim (SMX-TMP), tetraciclina e estreptomicina. RESULTADOS: um total de 146 cepas de Salmonella spp. foram isoladas a partir de pacientes diferentes durante o período avaliado. Cento e onze (76,0%) pacientes eram do sexo masculino e 35 (24,0%), do feminino. A média de idade dos pacientes foi de 29,33 ± 12,76 anos (mínima de um ano e máxima de 70 anos). Cento e seis (72,6%) pacientes residiam na cidade de São Paulo. Em 128 (87,7%) casos, a fonte provável de contaminação por Salmonella spp. era desconhecida. A febre, diarréia, náuseas e/ou vômitos e sintomatologia respiratória estiveram presentes em, respectivamente, 111(76%), 92 (63%), 67 (45,9%) e 63 (43,2%) pacientes na admissão hospitalar. Em indivíduos HIV-positivos, os sintomas respiratórios foram mais os comuns. A maior parte das cepas foi obtida de sangue e fezes, respectivamente, 109 (74,4%) e 22 (15,1%) cepas. Trinta e cinco (24,0%) cepas eram do sorotipo Salmonella Typhi e 111 (76%), sorotipos não-Typhi, sendo os sorotipos mais comuns Enteritidis com 42 (37,8%) cepas; Typhimurium, 23 (20,7%); I,4,[5],12:i:-, 16 (14,4%) e Dublin, 16 (14,4%). Noventa e sete (66,4%) pacientes tinham sorologia para HIV positiva e seis (4,1%), negativa. Quarenta e três (29,5%) pacientes tinham sorologia anti-HIV desconhecida. Entre os 97 pacientes HIV-positivo, em 14 (14,4%), o episódio atual de salmonelose, com ou sem patologias oportunistas, foi a responsável pela descoberta da infecção pelo HIV ou desenvolvimento para a sida em indivíduos já sabidamente HIV-positivo. Os seguintes percentuais de sensibilidade foram encontrados nos antimicrobianos estudados: ciprofloxacina, 100% de sensibilidade; ceftriaxone, 99,3%; cloranfenicol, 96,6%; ácido nalidíxico, 95,2%; ampicilina, 92,5%; sulfametoxazoltrimetoprim, 91,8%; tetraciclina, 86,3% e estreptomicina, 65,8%. Trinta e oito (26,0%) pacientes evoluíram para o óbito, sendo todos HIV-positivo/AIDS (p< 0,0001) e em todos isoladas cepas de Salmonella não-Typhi (p = 0,0001). CONCLUSÕES: a ocorrência dos sorotipos Typhi e não-Typhi e a sintomatologia diferem segundo a condição sorológica para o HIV. A cultura do sangue e de fezes deve fazer parte da rotina do diagnóstico. Ciprofloxacina, ceftriaxone,cloranfenicol e ampicilina constituem opções terapêuticas adequadas para a infecção por Salmonella spp.. Foram fatores de risco para o óbito, sorologia anti-HIV positiva e o isolamento de Salmonella não-Typhi. / OBJECTIVES: knwon the epidemiological, clinical and laboratorial characteristics of the patients with infection due to Salmonella spp. and the pattern of susceptibility to antimicrobials of such isolates of Salmonella spp., from \"Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo\" (SP), in the period of January 1992 to December 2002. METHODS: review of the patients charts and evaluation of the pattern of susceptibility from the isolates of Salmonella spp. performing the disk diffusion method to the antimicrobials ciprofloxacin, ceftriaxone, chloramphenicol, nalidixic acid, ampicillin, trimethoprim/sulfamethoxazole, tetracycline and streptomycin. RESULTS: a total of 146 isolates were obtained from different patients in the period evalueted. One-hundred and eleven (76.0%) patients were male and 35 (24.0%), female. The median age was 29.33 ± 12.76 years (range one year 70 years). One-hundred and six (72.6%) patients lived in the city of São Paulo. In 128 (87.7%) cases, the probable source of contamination with Salmonella spp. was unknwon. Fever, diarrhoea, nausea and/or vomiting and respiratory sintomatology were present, respectively, in 111(76%), 92 (63%), 67 (45.9%) and 63 (43.2%) patients at presentation. In HIV-seropositive patients, respiratory sintomatology was the most common. Most of the isolates were obtained from blood and stool, respectively, 109 (74.4%) and 22 (15.1%) isolates. Thirty-five (24.0%) isolates belonged to serotype Salmonella Typhi and 111 (76%) to non-Typhi serotypes, being the most common Enteritidis with 42 (37.8%) isolates; Typhimurium, 23 (20.7%); I,4,[5],12:i:-, 16 (14.4%) and Dublin, 16 (14.4%). Ninety-seven (66.4%) patients had HIVserology positive and six (4.1%) patients, negative. In 43(29.5%) patients, the HIV serology was unknown. Considering the 97 HIV-seropositive patients, in 14 (14,4%), the actual episode of salmonellosis, with or without oportunistic infections, was the responsible for the discovery of the HIV infection or to development to Acquired Immunodeficiency Syndrome in already known HIV-seropositive patients. The following percentages of susceptibility were found in the antimicrobials analysed: ciprofloxacin, susceptibility of 100%; ceftriaxone, 99.3%; chloramphenicol, 96.6%; nalidixic acid, 95.2%; ampicillin, 92.5%; trimethoprim/sulfamethoxazole, 91.8%; tetracycline, 86.3% and streptomycin, 65.8%. Thirtyeight (26.0%) evoluted to death, being all HIV-positive patients (p < 0.0001) with infection to non-typhoidal Salmonellae (p = 0.0001). CONCLUSIONS: the occurrence of serotypes Typhi and non-Typhi and the patients sintomatology depends on the HIV-serology. Culture of blood and stool should be part of the diagnosis. Ciprofloxacin, ceftriaxone, chloramphenicol and ampicillin are good therapeutic options for Salmonella spp. infection. HIV-serology positive and the isolation of non-Typhi Salmonella were risk factors to death.
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Avaliação de risco de infecção por Salmonella spp. associado ao uso agrícola de lodo de esgoto: risco de consumo de hortaliças e ao trabalhador / Risk assessment for Salmonella spp. infection associated with the agricultural use of sewage sludge: vegetable consumption and risk to the workerFlavio Krzyzanowski Junior 15 December 2014 (has links)
Introdução A presença de Salmonella spp.,que é um patógeno de importância clínica, tem sido detectada em lodos de esgoto gerados ao redor do mundo. O objetivo desse estudo foi o de estimar o risco anual de infecção relacionado à ingestão de alface, tomate e cenoura cultivados em solos acondicionados com o lodos de esgoto provenientes de cinco Estações de Tratamento de Esgoto (ETEs) da Região Metropolitana de São Paulo bem como o risco de infecção anual que trabalhadores agrícolas, através da ingestão involuntária de partículas de solo, são submetidos. Como no Brasil ainda não há o estabelecimento de valor de risco tolerável, o valor usado pela USEPA, de 1/10.000 (10-4), foi utilizado para que a comparação com os resultados obtidos fosse realizada. Métodos Foram coletadas 54 amostras de lodos de esgotos de cinco ETEs num período de 12 meses (janeiro a dezembro de 2011). A concentração de Salmonella spp nessas amostras foi obtida utilizando o método USEPA 1682/2006. Foram selecionadas 40 cepas isoladas e identificadas como Salmonella spp. para sorotipificação em laboratório de referência. Essas cepas foram submetidas à detecção dos genes de virulência invA, ssel e spvC, presença de plasmídeo por técnicas moleculares e ainda à resistência a antimicrobianos. Para a estimativa dos riscos anuais de infecção por Salmonella foram desenhados nove cenários diferentes considerando como fatores principais a presença ou ausência da variação da concentração de Salmonella spp. nos solos tratados com lodos de esgoto, a presença ou a ausência de crescimento desta bactéria nas hortaliças, a inibição do crescimento de Salmonella spp. nas cenouras e a ingestão involuntária de partículas de solo pelos trabalhadores agrícolas. Resultados Cepas de Salmonella spp. estavam presentes em 38,9 por cento (21/54) das amostras de lodos de esgoto analisadas. As maiores concentrações foram encontradas na ETE 2, sendo a maior delas de 12,19 NMP/g ST. Das 40 cepas selecionadas para sorotipificação 35 foram confirmadas como sorotipos de Salmonella comumente envolvidos em surtos alimentares e em casos clínicos como S. Typhimurium, S. Agona e S. Infantis. Destas, todas apresentaram o gene sseL e duas cepas de S. Typhimurium portavam os três genes de virulência pesquisados. Das 35 cepas 14 (40 por cento ) apresentaram plasmídeos e 14,2 por cento (3/35) foram sensíveis a pelo menos dois antimicrobianos, 5,7 por cento (3/35) foram identificadas como multi-droga resistentes (MDR). O maior risco anual de infecção foi obtido no cenário 9 para trabalhadores que aplicam lodos de esgoto nos solos (9,4x10-2) seguidos, em ordem decrescente, dos riscos de infecção para a ingestão de tomates e alfaces nos cenários 1 e 3 que consideravam o crescimento de Salmonella spp. nas hortaliças. Os menores riscos foram obtidos nos cenários 5 e 6 que envolviam o consumo de cenouras. Conclusões: Os riscos foram considerados elevados tendo em vista o valor utilizado como referência. O fator que mais impactou nos riscos obtidos foi o crescimento de Salmonella spp. nas hortaliças (alface e tomate). A variação da concentração de Salmonella spp. no solo teve pouco impacto nos riscos obtidos. / Introduction - The presence of Salmonella spp., an important pathogen, has been reported in sewage sludge worldwide. The aim of this study was to estimate the annual risk of infection related to ingestion of lettuce, tomatoes and carrots grown in soil conditioned with sewage sludge from five Wastewater Treatment Plant (WWTP) in the Metropolitan Region of São Paulo. Also the annual risk of infection of farm workers through involuntary ingestion of soil particles were estimated. As in Brazil there is no establishment of the value of tolerable risk, the value used by the USEPA, 1/10,000 (10-4), was adopted in order to proceed the comparison with the results obtained. Methods - 54 samples of sewage sludge from the five WWTPs were collected over a period of 12 months (January to December, 2011). The concentration of Salmonella spp. in these samples was obtained using the method 1682/2006 USEPA. 40 strains identified as Salmonella spp were selected for serotyping in a reference laboratory. These strains were subjected by molecular techniques to detection of virulence genes invA, sseL and spvC, presence of plasmid and even resistance to antimicrobials. To estimate the annual risk of infection by Salmonella spp. nine different scenarios were designed considering the presence or absence of varying concentrations of Salmonella spp. in soils treated with sewage sludge, the presence or absence of growth of the bacteria in vegetables, the growth inhibition of Salmonella spp. in carrots as well as the involuntary ingestion of soil particles by agricultural workers. Results -Salmonella spp. strains were present in 38.9 per cent (21/54) of samples of the sewage sludge analyzed. The highest concentrations were found in WWTP 2, being the highest 12.19 MPN/g TS. From the 40 previously selected strains, 35 strains were confirmed as commonly involved in food borne outbreaks and clinical cases as such S. Typhimurium, S. Agona and S. Infantis. All the 35 strains harbored the sseL gene and two strains of S. Typhimurium carried the three virulence genes surveyed. A total of 14 from the 35 strains (40 per cent ) had plasmids and 14.2 per cent (3/35) were sensitive to at least two antimicrobials and 5.7 per cent (3/35) were identified as multi-drug resistance (MDR). The highest annual risk of infection was obtained in scenario 9 for workers applying sewage sludge in soils (9,4x10-2) followed, in descending order of risk of infection, to the intake of tomatoes and lettuces in scenarios 1 and 3 which considered the growth of Salmonella spp. in the vegetables. The lowest risks were obtained in scenarios 5 involving the consumption of carrots. Conclusions: The risks were considered high given the value used as a reference. The factor that most impacted the annual risk of infection obtained was the growth of Salmonella spp. in vegetables (lettuce and tomato). The variation of the concentration of Salmonella spp. in soil had little effect on the risks obtained.
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Estudo da resposta imune, da colonização e invasão por Salmonella enterica subsp enterica sorotipo Typhimurium Nalr em frangos de corte, tratados com glucano, probióticos e produtos de exclusão competitiva / Study of immune response, colonization, and invasion by Salmonella enterica subsp. enterica serotype Typhimurium (1796NR) Nalr, in broiler chickens, treated with glucans, probiotics, and competitive exclusion productsLiliana Revolledo 13 January 2006 (has links)
O efeito de sete tratamentos, contendo β-glucano, um probiótico experimental, e um produto de exclusão competitiva assim como suas associações, foram avaliados frente a um desafio com Salmonella Typhimurium Nalr e na resposta imune, em frangos de corte. Dois experimentos foram realizados; o primeiro experimento apresentou seis tratamentos que consistiram de: a) produto de exclusão competitiva (EC); b) EC + probiótico experimental (LEB); c) EC + betaglucano (G); d) EC+LEB+G; e) controle negativo e f) controle positivo. O segundo experimento, foi delineado com nove tratamentos que consistiram em: a) EC; b) LEB; c) G; d) EC+LEB; e) EC+G; f) EC+LEB+G; g) LEB+G; h) controle negativo e i) controle positivo. Experimento 1: no dia 0 do experimento as aves foram tratadas com 0,1mL de EC por inoculação no inglúvio. No dia 1 do experimento as aves foram desafiadas com 107 CFU/mL de Salmonella Typhimurium (1796NR) Nalr. Durante o período de 1 ao 6 dia, as aves foram tratadas com o tratamento apropriado, e sacrificadas aos 7 dias de idade. Experimento 2: no dia 0 do experimento as aves foram tratadas com 0,1mL de EC por inoculação no inglúvio. Durante 28 dias as aves foram tratadas com o tratamento apropriado. Nos dias 1, 9, 16 e 23 do experimento as aves foram desafiadas com 107 UFC/mL de Salmonella Typhimurium (1796NR) Nalr, e sacrificadas uma semana após cada desafio. Nos dois experimentos, cecos, fígado e baço foram removidos assepticamente e examinados para Salmonellae; e foram colhidas amostras de soro e fluido intestinal, para se avaliar as concentrações de IgG e IgA totais. Os dados foram analisados por análise de variança de uma via, e as médias comparadas pelo teste de Duncan. Os tratamentos EC+LEB+G e LEB+G mostraram uma inibição significativa (p<0,05) de invasão dos órgãos por Salmonella Typhimurium (1796NR) Nalr, com altos níveis de proteção. No segundo experimento, a colonização cecal foi reduzida somente após a segunda semana de tratamento. Os níveis de IgG não foram significativos no soro ou fluido intestinal, mas a concentração de IgA foi significativamente (p<0,05) alta no soro e fluido intestinal, quando comparada com a do controle negativo. Estes resultados sugerem que os tratamentos associados usando produto de EC, probióticos e betaglucano são mais eficazes no controle de Salmonella, do que preparações individuais; estimulando a produção de IgA sistêmica e de mucosas. Outros estudos complementares são necessários para se determinar os mecanismos pelos quais as interações destas substâncias poderiam regular a resposta imune inata. / The effects of seven treatments, containing β-glucan, experimental probiotic, competitive exclusion products and their associations were evaluated, on a Salmonella Typhimurium Nalr challenge and assessment of the immune response, in broiler chickens. Two sets of trials were performed; the first trial was arranged with six treatments. Treatments in the first set consisted of a) commercial competitive exclusion (EC), b) EC + experimental probiotic (LEB), c) EC + betaglucan (G), d) EC+LEB+G, e) negative control, and e) positive control. The second one, was designed with nine treatments consisted of a) EC, b) LEB, c) G, d) EC+LEB, e) EC+G, f) EC+LEB+G, g) LEB +G, h) negative control, and i) positive control. Trial 1: on day 0 birds were administered 0,1mL of the EC treatment by oral gavage. On day 1, birds were challenged with 107CFU/mL of Salmonella Typhimurium (1796NR) Nalr. During 1 to 6 days, birds were administered of appropriate treatment, and were sacrificed at 7 days of age. Trial 2: on day 0 birds were administered 0,1mL of the EC treatment by oral gavage. During 28 days, birds were administered of appropriate treatment. On day 1, 9, 16 and 23 birds were challenged with 107CFU/mL of Salmonella Typhimurium (1796NR) Nalr, and were sacrificed one week after challenge. In two sets of trials, ceca, liver and spleen were aseptically removed and examined for salmonellae; and were taken serum and intestinal fluid samples, in order to evaluate total antibody concentrations of IgG and IgA. Data were analyzed by one-way analysis of variance, and means compared by Duncan′s test. Treatments EC+LEB+G and LEB+G resulted in a significant inhibition (p<0,05) in Salmonella Typhimurium (1796NR) Nalr organ invasion offering a higher level of protection. In the second set of trial, colonization was reduced after the second week of treatment. IgG was no significantly in serum and intestinal fluid samples, but IgA was found significantly (p<0,05) higher in serum and intestinal fluid samples, when compared to control ones. These results suggest that associated treatment using EC products, probiotics and betaglucans are more effective in Salmonella control, than individual preparations; stimulating the systemic and mucosal immune response mediated by IgA. Further research is necessary to determine the mechanisms by which the interaction of these substances could regulate avian innate immune response.
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Salmonella sp em répteis e aves silvestres no Estado de São Paulo: freqüência de isolamento, caracterização dos isolados e as conseqüências para o manejo em cativeiro e reintrodução / Salmonella sp in reptiles and wild birds at São Paulo Estate: isolation frequency, characterization of isolates and the consequences for management in captivity and reintroductionLuiz Fernando Larangeira Lopes 22 February 2008 (has links)
A Salmonella sp é um importante agente zoonótico no mundo todo e diversas são as técnicas desenvolvidas para a sua identificação, com o isolamento microbiológico ainda sendo a técnica de escolha. Além de sua importância em microbiologia de alimentos e em criações comerciais de aves, ultimamente vem se destacando a sua presença na microbiota de animais silvestres. No presente estudo, foram colhidos \"swabs\" cloacais de 200 aves e 200 répteis, com o intuito de se observar a freqüência de isolamento do agente, caracterizar os isolados através da determinação dos perfis bioquímico e de resistência a antimicrobianos além da sorotipagem. Buscamos também comparar diferentes técnicas de isolamento com diversos meios de cultura e determinar qual a mais eficiente. Desse modo, os \"swabs\" coletados foram submetidos ao plaqueamento em ágar Mac Conkey, suspensão paralela em caldo Rappaport e Tetrationato com posterior plaqueamento em ágar XLT4. Das 200 aves amostradas nenhuma apresentou resultado positivo para o isolamento de Salmonella sp, ao passo que dos 200 répteis, 71 apresentaram-se positivos para o agente, totalizando uma proporção de 35,5%. Dentre os répteis as serpentes foram as que apresentaram maior proporção de animais positivos com 83,9% em contraste às tartarugas que formaram a ordem com menor isolamento (7,1%). Diversos sorotipos foram isolados, muitos não sendo freqüentemente relacionados a animais silvestres com vários apresentando algum grau de resistência aos antimicrobianos testados. A técnica de isolamento que possibilitou a maior recuperação do microorganismo foi a suspensão em caldo Rappaport seguida do plaqueamento em ágar XLT4. Concluímos que os répteis podem ser considerados importantes reservatórios para a Salmonella sp, ao passo que as aves não merecem destaque nesse quesito, embora seu potencial disseminador não deva ser desprezado. / Salmonella sp is an important zoonotic agent in the whole world and many are the techniques developed for its identification, although the microbiological isolation is still the preferred one. Salmonela\'s importance in food microbiology and poultry are unquestionable, but in the late years there is a growing concern about the presence of this bacteria in many species of wild animals. In the present study we collected cloacal swabs from 200 wild birds and 200 reptiles with the following goals: Determination of the isolation frequency, characterization of the isolates through biochemical and antimicrobial susceptibility profiles and serotyping. We also target a comparison between different isolation techniques and culture media to determine wich one is the most effective. In this way, the collected swabs were submitted to direct plating in Mac Conkey agar and parallel suspension in Rappaport and Tetrationate broths with posterior streaking in XLT4 agar. None of the 200 tested birds were positive for Salmonella sp, while 71 from the 200 reptiles were positives for the agent, in a 35,5% proportion. Among the reptiles, the snakes presented the higher prevalence, with 83,9% of the animals being positives, in contrast to turtles, the Order with less isolation, totalizing only 7,1%. A lot of different serotipes were isolated, many of them infrequently related with wild animals and showing at least some degree of antimicrobial resistance. The use of Rappaport broth followed by the XLT4 agar showed the best recovering rates of Salmonella sp from the cloacal swabs. We conclude that reptiles may act as important reservoirs for this pathogen. Wild birds doesn\'t seems to play the same role, but theirs spreading potencial must not be underestimated.
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Avaliação do perfil sanitário de urubu-de-cabeça-preta (Coragyps atratus) em ambiente urbano / Health evaluation of black vulture (Coragyps atratus) in urban environmentJean Carlos Alves Barbara 06 May 2015 (has links)
O urubu-de-cabeça-preta (Coragyps atratus) é uma ave de vida livre com ampla distribuição no Brasil. Esta espécie é comumente encontrada em áreas urbanas concentrando-se em locais de deposição de lixo. O fato de se alimentarem de carcaças em decomposição facilita o contato de urubus-de-cabeça-preta com muitos patógenos. No entanto, ainda não está clara qual a real implicação de muitos desses microrganismos para a saúde dos mesmos. Assim, o objetivo desse estudo foi investigar a ocorrência de alguns patógenos selecionados, avaliar o perfil hematológico e a microbiota cloacal de C. atratus em ambiente urbano. Para isso, amostras de sangue, soro e swab cloacal foram obtidos de 120 urubus de vida-livre capturados na Fundação Parque Zoológico de São Paulo, SP. A prova de soroaglutinação rápida (SAR) foi utilizada na detecção de anticorpos contra Salmonella Pullorum/Gallinarum, Mycoplasma synoviae e M. gallisepticum. O teste de aglutinação em látex (AL) foi utilizado para a pesquisa de antígeno de Cryptococcus neoformans. Foram utilizadas técnicas convencionais de hematologia, microbiologia e testes de sensibilidade microbiana. Das amostras de soro analisadas pela SAR, 15% foram reagentes para M. gallisepticum. Anticorpos contra S. Pullorum/Gallinarum e M. synoviae não foram detectados. Nenhuma amostra foi positiva para C.neoformans ou para hemoparasitas. A média e o desvio padrão dos seguintes valores hematológicos foram obtidos para 61 aves: eritrócitos (1.8x10¹²/L); leucócitos (13,11x10/L); hemoglobina (10,4 g/dL); hematócrito (48,44%); VCM (275,1 fL); HCM (42 pg); CHCM (15,8 g/dL); proteína sérica total (3,76 g/dL); heterófilos (78%); linfócitos (13,5%); eosinófilos (5,4%); monócitos (2,8%); basófilos (0,1%); trombócitos (14,14x10/L). De 75 colônias bacterianas isoladas de 20 swabs cloacais, 78,7% foram Gram-positivas e 21,3% Gram-negativas, sendo Enterococcus sp. o gênero mais frequente. Aproximadamente 86,7% das cepas isoladas foram resistentes a pelo menos um dos antibióticos testados. Cepas de Bacillus sp. e Enterococcus casseliflavus apresentaram resistência a sete dos oito antibióticos testados. Leveduras não foram isoladas em nenhumas das culturas. As informações obtidas nessa pesquisa são de suma importância, uma vez que poucos estudos avaliam o estado de saúde de urubus no mundo. / Black vulture (Coragyps atratus) is a free-living bird widely distributed across Brazil. These birds feed on rotting carcasses and large groups are commonly found in urban areas, including rubbish dumps. By feeding on decomposing carcasses, they are often exposed to innumerous pathogens. However, the role of infectious microorganisms on vultures health still need to be clarify. Thus, the aim of this study was to investigate the occurrence of selected infectious agents, the hematological profile and cloacal microbiota of black vulture in urban areas. Therefore, blood, serum and cloacal swabs were obtained from 120 free-living vultures trapped in Fundação Parque Zoológico de São Paulo, SP. The rapid seroagglutination test (RST) was performed for detection of antibodies against Salmonella Pullorum/Gallinarum, M. synoviae and M. gallisepticum. Furthermore, latex agglutination test was used to detect Cryptococcus neoformans \' antigen. Conventional techniques for hematology, microbiology and antimicrobial susceptibility testing were performed. From the serum samples analyzed by RST, 15% were positive for M. gallisepticum, antibodies against S. Pullorum/Gallinarum and M. synoviae were not detected. None sample was positive to Cryptococcus neoformans or hemoparasites. Mean and standard deviation from the following hematological values were obtained for 61 birds: erythrocytes (1.8x10¹²/L); leukocytes (13.11x10/L); hemoglobin (10.4 g/dL); hematocrit (48.44%); MCV (275,1 fL); MCH (42 pg); MCHC (15,8 g/dL); total serum protein (3.76 g/dL); heterophils (78%); lymphocytes (13.5%); eosinophils (5.4%); monocytes (2.8%); basophils (0,1%); thrombocyte (14.14x10/L). From 75 bacterial colonies isolated from 20 cloacal swabs, 78.7% were Gram-positive and 21.3% were Gram-negative. Enterococcus sp. was the most frequent genus. Approximately 86.7% of the isolated strains were resistant to at least one of the antibiotic tested. Bacillus sp. and Enterococcus casseliflavus strains shown resistance to seven in eight antibiotics tested. Yeasts were not isolated. The information obtained in this research is of paramount important since few studies have been carried out on the vultures health condition in the world.
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Vida útil dos mexilhões Perna perna cultivados no litoral norte de São Paulo: aferição dos parâmetros físico-químicos e microbiológicos. / The mussels Perna perna shelf-life cultivated in the são paulo state north coast: gauging of the physicochemistry and microbiological parameters.Érika Fabiane Furlan 01 October 2004 (has links)
A qualidade para consumo dos moluscos bivalves está intimamente ligada a qualidade do ambiente onde estes se encontram inseridos. Em função da atual degradação ambiental, provocada pelo crescimento populacional e conseqüente aumento na descarga de dejetos no ambiente, bem como, pela ausência de programas de monitoramento da qualidade da água destinada ao cultivo destes organismos e, ainda, pelo fato da comercialização deste pescado ser realizada de forma clandestina na região de Ubatuba, SP., fez-se necessário caracterizar, sob os aspectos físico-químicos e microbiológicos, os mexilhões Perna perna cultivados e comercializados nesta região, visando a segurança do consumidor. Foram eleitas três distintas áreas de cultivo em Ubatuba, a saber; praia do Engenho da Almada, praia da Barra Seca e costão do Cedro; onde os mexilhões foram coletados, no período de novembro de 2002 a março de 2003 e submetidos às análises de nitrogênio não protéico (NNP), bases nitrogenadas voláteis totais (BNVT), trimetilamina (TMA), pH e composição centesimal. Foram também realizadas, concomitantemente, as contagens microbiológicas da carne e da respectiva água de cultivo quanto aos coliformes totais e fecais, Staphylococcus aureus e Salmonella sp. As amostras apresentaram qualidade satisfatória e condizente com os padrões da legislação vigente para pescado, em todos os quesitos analisados, durante a maior parte do período de estudo, excetuando-se no mês de fevereiro, quando o valor de TMA encontrado (6,9mg N/100g) superou o padrão de 4mg N/ 100g. Os mexilhões provenientes da Barra Seca, no mês de março, se apresentaram inadequados para o consumo humano direto, devido ao resultado positivo para Salmonella sp. As maiores contagens para coliformes totais ocorreram em mexilhões provenientes de áreas de cultivo densamente povoadas e que recebiam efluentes não tratados (Barra Seca), excetuando-se no mês de novembro, quando os mexilhões do costão apresentaram maior população destes microorganismos (1,3x103 NMP/ g). As contagens microbianas da carne do mexilhão sempre superaram a contagem da respectiva água de cultivo e, a contagem da água extrapolada pelo cultivo da Barra Seca (5,7x101 NMP/ mL), no mês de março, coincidiu com a detecção da Salmonella sp. neste lote. / The quality for consumption of the bivalve mollusks is intimately linked to the environment quality, where these are inserted. In function of the current environmental degradation caused by the growth population and consequent increase in the discharge of sewage in the environment, as well as, for the absence of quality management programs of the cultivations waters and the Ubatubas city, SP., clandestine marketing fish. For the consumer's safety was necessary to characterize, in the physicochemistry and microbiological aspects, the mussels Perna perna cultivated and marketed in this region. Three different cultivation points were chosen in Ubatuba; Engenho da Almada and Barra Secas beaches and Costãos coast; where the mussels were collected for evaluation from November, 2002 to March, 2003. The analysis determined were: non-protein-nitrogen (NPN), total volatile basic nitrogen (TVBN), trimethylamine (TMA), pH and proximal composition analysiss, microbiological counts of the meat and cultivation water for total and fecal coliforms, Staphylococcus aureus and Salmonella. During most of the study period, the samples presented satisfactory quality with the effective legislation for fish, in all the analyzed requirements, excepted on February, when the TMA value finded (6,9mg N/100g) overcome the standard 4mg N/ 100g. In March, the Barra Secas mussels occurs inadequate for the direct human consumption, because of the positive result to Salmonella sp. The largest total coliforms counts happened in mussels cultivated in densely populated areas and that received sewage without previous treatment (Barra Seca), except in November, when the mussels from Cedros coast have largest counts of these microorganisms (1,3x103 NMP/ g). The microbial counts of the meat always overcame of the respective cultivation water and, the overcome of fecal coliforms count of water from Barra Seca (5,7x101 NMP/ mL), on March coincided with the detection to Salmonella sp.
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