Orientador: André Luís Laforga Vanzela / Banca: César Martins / Banca: Marielle Cristina Schneider / Banca: Mary Massumi Itoyama / Banca: Patrícia Pasquali Parise Maltempi / Resumo: As espécies da subordem Heteroptera possuem cromossomos holocinéticos, variação do número cromossômico, meiose invertida e aquiasmática nos cromossomos sexuais e acúmulo de heterocromatina predominantemente nas extremidades cromossômicas. Das 30 espécies analisadas das infraordens Pentatomomorpha e Cimicomorpha, foram observadas variações nos números cromossômicos e cariótipos assimétricos, sobretudo em Reduviidae. O bandamento C-CMA3/DAPI também mostrou que há variabilidade na distribuição de bandas heterocromáticas entre autossomos e alossomos, contudo, a localização da heterocromatina predominou nos terminais cromossômicos. Os sítios de DNAr 18S foram localizados principalmente nas regiões terminais, com tendência à distribuição entre os autossomos nos Pentatomomorpha, enquanto que nas espécies de Cimicomorpha houve uma maior variação entre autossomos e alossomos. Para um estudo mais aprofundado sobre a origem e a organização de famílias de DNA repetitivo, foi escolhida Triatoma infestans como modelo. Este estudo mostrou as duas sequências de DNA satélite ricas em AT que predominam nas regiões terminais dos cromossomos, são compostas por motivos curtos com 79 bp e 33 bp de comprimento, que foram originadas possivelmente de elementos transponíveis gigantes conhecidos como Polintons. As comparações citogenéticas de todas as amostras estudadas neste trabalho mostraram algumas tendências, tais como a predominância do sistema sexual XY/XX, a localização preferencial da heterocromatina e dos sítios de DNAr 18S nas regiões terminais dos cromossomos e a ocorrência de cromossomos holocinéticos. Contudo, as variações na organização e assimetria dos cariótipos observadas de cada grupo mostram uma relativa dinâmica nos genomas desses heterópteros / Abstract: The species of the suborder Heteroptera have holokinetic chromosomes, variation in chromosome number, inverted/achiasmatic meiosis in the sex chromosomes and accumulation of heterochromatin predominantly in chromosome ends. In the 30 species analyzed of the infraorders Pentatomomorpha and Cimicomorpha, variations in chromosome numbers and asymmetrical karyotypes were observed, especially in Reduviidae. The C-CMA3/DAPI banding also showed that there is variability in the distribution of heterochromatic bands between autosomes and alossomos, however, the predominant location of heterochromatin were in the chromosome terminals. The 18S rDNA sites were located mainly in the terminal regions, with a tendency to distributed among the autosomes in Pentatomomorpha, whereas in species Cimicomorpha there was greater variation between autosomes and alossomos. To a more detailed study of the origin and organization of families of repetitive DNA, Triatoma infestans was chosen as a model. This study showed the two sequences of AT-rich satellite DNA that predominate on the ends of chromosomes, are composed of short motifs with 79 bp and 33 bp, which were possibly originated from transposable elements known as giant Polintons. Cytogenetic comparisons of all samples studied in this work showed some trends, such as the predominance of the sexual system XY/XX, the preferred location of heterochromatin and 18S rDNA sites on the ends of chromosomes and the occurrence of holokinetic chromosomes. However, changes in the organization and asymmetry of karyotypes observed in each group show a relative dynamic in the genomes of these heteropteran / Doutor

Orientador: Antonio Maria Garcia Tommaselli / Banca: Veraldo Liesenberg / Banca: Aluir Porfirio Dal Poz / Resumo: As erosões marginais são causadas por uma série de fatores que impactam ou atenuam o processo, tais como o tipo de erosão, a constituição do solo, ventos, regime hidrológico, presença e tipo de vegetação, entre outros. Os processos de erosão marginal ocorrem às margens de corpos d'água e demandam estudos específicos para seu entendimento e possível mitigação. Os escâneres LASER (Light Amplification by Stimulated Emission of Radiation) móveis são indicados para o levantamento de dados para séries temporais, principalmente em áreas com alterações pequenas ao longo do tempo, em virtude de sua elevada resolução espacial e acurácia. Sistemas de escaneamento LASER dotados de posicionamento GNSS/RTK (Global Navigation Satellite System/Real Time Kinematic) têm a vantagem de demandar menos etapas de pós-processamento, uma vez que os resultados imediatos do levantamento são as nuvens de pontos prontas para edição, e com precisão compatível à do RTK... / Abstract: River bank erosions are caused by a set of factors that affect or attenuate the process, such as type of erosion, constitution of the soil, and environmental factors such as wind, water regime, presence and type of vegetation, among others. Bank erosion processes occur on the banks of water bodies and require specific studies for their understanding and possible mitigation. Mobile LASER (Light Amplification by Stimulated Emission of Radiation) scanner systems are suitable to survey data to compose temporal series, mainly in areas with small changes over time, due to their high spatial resolution and accuracy. Laser scanning systems equipped with GNSS/RTK (Global Navigation Satellite System/Real Time Kinematic) positioning have advantage because demand less post-processing steps, since the immediate results of survey are point clouds ready for editing, and their accuracy is compatible with RTK accuracy... / Mestre

Orientador: Milton Hirokazu Shimabukuro / Coorientador: João Francisco Galera Monico / Banca: Felipe Geremia Nievinski / Banca: Eurico Rodrigues de Paula / Resumo: Cintilações ionosféricas são rápidas variações na amplitude e/ou fase de um sinal de rádio ao se propagar por irregularidades na densidade de elétrons na ionosfera. Este fenômeno prejudica a acurácia dos Sistemas Globais de Navegação por Satélite (Global Navigation Satellite Systems - GNSS), já que podem acarretar, dentre outros aspectos, que o receptor perca a sintonia com um ou mais satélites durante o rastreio do sinal. A ocorrência e a intensidade de cintilações ionosféricas variam de acordo com vários fatores, tais como a atividade solar, época do ano, região no globo terrestre e horário local. Em períodos de máxima atividade solar, os efeitos da cintilação ionosférica são ainda mais intensos, principalmente em regiões equatoriais como o Brasil. Estações GNSS de monitoramento contínuo da ionosfera foram instaladas no território brasileiro desde fevereiro de 2011 através de projetos que contam com a cooperação de diversas instituições da Europa e do Brasil, dentre as quais está inserida a Faculdade de Ciências e Tecnologia (FCT) da Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (UNESP). Estas Estações contam com receptores capazes de fornecer Índices de cintilação ionosférica e métricas sobre os sinais recebidos, os quais são denominados Ionospheric Scintillation Monitor Receivers (ISMR). Com a infraestrutura de monitoramento disponível, mais de dez milhões de observações de monitoramento são obtidas diariamente. Extrair informações relevantes em meio a esta grande quantidade de dados pode-se tornar um processo árduo. Neste contexto, nesta pesquisa foi investigado o uso de técnicas de mineração e visualização de dados visando estender as possibilidades de análise do comportamento da cintilação ionosférica no Brasil, além de seus efeitos no posicionamento GNSS... / Abstract: Ionospheric scintillations are rapid variations on amplitude and/or phase of a radio signal as it passes through irregularities on electron density on the ionosphere. This phenomenum decrease the accuracy of Global Navigation Satellite Systems (GNSS) once can lead to, among other aspects, that receiver lose the lock of one or more satellites during signal tracking. The occurence and intensity of ionospheric scintillations change according to several factors like solar activity, epoch in the year, geographic location and local time. During high solar activity the e ects are more intense mainly at equatorial regions like Brazil. GNSS monitoring stations were deployed on Brazilian territory since February 2011 through projects of cooperation of several institutions of Europe and Brazil, among is inserted the Faculdade de Ciências e Tecnologia (FCT) da Universidade Estadual Paulista J ulio de Mesquita Filho (UNESP). Receivers installed at these stations provide scintillation indexes and signal metrics for each satellite tracked, so called Ionospheric Scintillation Monitor Receivers (ISMR). With the monitoring infrastructure, more than ten million monitoring observations are obtained daily. Extract relevant information in this big amount of data can be a hard process. In this context, this research investigated the usage of data mining and data visualization techniques in order to extend the possibilities of analyzing the scintillations in Brazil and its e ects on GNSS positioning. / Mestre

Este trabalho tem como objetivo apresentar o sistema óptico desenvolvido para a câmera WFI (Wide Field Imaging Camera) que integrará os satélites CBERS 3 e 4 (China Brazil Earth Resources Satellite). O Brasil é responsável por duas das câmeras dos satélites CBERS 3 e 4, a WFI e a MUX (Multispectral Camera). Estas câmeras são destinadas a sensoriamento remoto orbital da Terra. É a primeira vez que câmeras destinadas a este tipo de aplicação são inteiramente desenvolvidas e construídas no país. Devido ao alto nível de vibração durante o vôo, à exposição a vácuo e a radiação espacial durante o período de vida útil em órbita, o desenvolvimento desta câmera exige um cuidadoso processo de análise e avaliação do desempenho óptico em terra de modo a garantir seu funcionamento a bordo. Em especial, serão apresentados as análises ópticas realizadas durante a fase de projeto preliminar e os testes ópticos realizados em terra dos requisitos: distância focal, campo de visada - FOV, função de transferência de modulação - MTF, distorção, sensibilidade à polarização, transmitância, sensibilidade à luz espalhada e degradação da transmitância com a radiação espacial. Os resultados obtidos comprovaram que o desempenho do sistema óptico atende os requisitos de projeto. / The purpose of this work is to present the optical system developed for the WFI camera (Wide Field Imaging Camera), which will be integrated to the CBERS 3 and 4 satellites (China Brazil Earth Resources Satellite). Brazil is responsible for two cameras of CBERS 3 and 4 satellites, WFI and MUX (Multispectral Camera). These cameras are used for orbital remote sensing of the Earth. It is the first time that cameras for this type of application are being entirely developed and built in our country. Due to the high vibration level during flight, the vacuum and space radiation exposure during the lifetime in orbit, the development of this camera requires a meticulous analysis process and evaluation of optical performance on the ground in order to ensure the effective operation on board. In particular, the optical analyses performed during the preliminary design and optical test requirements performed on ground will be presented, such as: focal length, field of view - FOV, modulation transfer function - MTF, distortion, polarization sensitivity, transmittance, stray light sensitivity and transmittance degradation with space radiation. The results obtained exhibit that the optical system performance satisfies all project requirements.

Imagens de satélite dos canais visível, infravermelho e vapor d\'água são ferramentas essenciais para o diagnóstico de previsão do tempo observação de cada imagem, é possível determinar a distribuição de diversos tipos de nuvens e estimar o seu respectivo potencial pluviométrico. A imagem de um mesmo tipo de nuvem apresenta-se de diferentes maneiras, quando registrada em cada um dos espectros. Neste trabalho, será implementada a fusão dessas três imagens, considerando-se que a imagem resultante deve conter todas as informações relevantes de cada espectro. Os algoritmos de fusão aqui descritos são obtidos tendo como base a execução da transformada pirâmide de cada imagem original, resultando em uma pirâmide de imagens. Esta consiste em um conjunto de cópias de imagem inicial, onde cada cópia representa um padrão de informação em diferentes formatos: 512 x 512; 256 x 256; 128 x 128, por exemplo. Com essa transformada multiescalar é possível determinar em que escala, ou em que resolução, se encontra a melhor informação, seguindo critério pré-determinados para a obtenção de uma imagem fundida na escala das imagens iniciais. Serão apresentados os métodos e os resultados qualitativos de fusões de imagens. São dados exemplos práticos, com aplicações meteorológicas, uma delas envolvendo imagens captadas pelo INPE, de três canais, cujos resultados são discutidos. / Weather forecast diagnosis is done having as a fundamental tool the analysis of satellite images such as visible (VIS), infra-red (IR) and water vapour (WV) channels. By observing each image it is possible to determine the distribution of many kinds of clouds and to estimate its respective pluviometric potential. The image of clouds of the same kind presents itself in different ways when it is registered in each of the channels. Here it will be implemented the fusion of these three images, taking into consideration that the resulting image should have all the important information of each spectrum and its use in the weather forecast determination by observing the screen images. The fusion algorithms described here are obtained from the execution of the so called transformed pyramid of each original image, resulting in an image pyramid. A pyramid of images is a set of copies of the first image, each copy representing an information standard in different formats, 512 x 512, 256 x 256, 128 x 128, for example. With this changed multiscale it is possible to determine in which scale or in which resolution is the best piece of information following pre-determined rules to obtain an image that is a fusion of the first ones. There will be presented the methods and qualitative results of image fusions, practical examples will be presented given, with meteorological applications, one of them involving images capted by INPE, of three channels, and the results will be discussed.

Este trabalho avalia a potencialidade da geração de ortoimagens advindas do sensor CCD do CBERS 2 produzidas através de um modelo matemático generalizado, a Transformação Linear Direta (DLT). O modelo de transformação foi implementado na linguagem Delphi 4.0 por alunos de pós-graduação da Universidade Federal do Paraná (UFPR), sendo gerado um utilitário para adaptar a leitura do Modelo Digital de Elevação (MDE) do SRTM (Shuttle Radar Topography Mission) no programa. A área utilizada como teste é uma região de relevo variando de plano a acidentado com variação de até 700m de altura, localizada no Centro Oriental Paranaense e abrangendo o cânion do Guartelá. Para a geração das ortoimagens utilizou-se de duas fontes de informação altimétrica, um MDE gerado pela missão SRTM e outro MDE gerado por curvas de nível e pontos contados de cartas topográficas na escala 1:50.000. Foi realizado o processo de ortorretificação de um recorte da cena CBERS utilizando os diferentes MDE’s, sendo as ortoimagens analisadas por testes estatísticos, e classificadas pelo Padrão de Exatidão Cartográfica (PEC) com o uso de pontos de verificação. Para a avaliação da necessidade de ortorretificação da cena CCD CBERS 2 o mesmo recorte foi também corrigido geometricamente por um polinômio de 2°. Os resíduos planimétricos gerados pela simples correção através do polinômio de 2° demonstram que há necessidade do processo de ortorretificação, ou seja, correção de erros devido à topografia do relevo nesta cena. E a comparação entre as ortoimagens geradas pelos diferentes MDE’s demonstra que é satisfatória a utilização do MDE do SRTM na ortorretificação de imagens advindas do sensor CCD do CBERS 2. / This work evaluates the orthoimages generation potentiality of the CCD sensor from the CBERS 2, by using a generalized mathematical model, say, the “Direct Linear Transformation (DLT)”. The transformation model was implemented by the pos graduated students from the Federal University of Paraná using the Delphi 4.0 language, and in this task an utilitarian software to adapt the Digital Elevation Model (DEM) from the Shuttle Radar Topography Mission (SRTM) function, on the program was produced. The land area surface used for trial is localized at the Paraná Oriental Centre and comprising the Guartelá canyon, varies in shape from an irregular to a plane embossment where variations up to 700m in height are found.Two DEM sources of altimetry information data for the orthoimages generations were used: The first generated from SRTM mission and the another one developed from contour lines and topographic points counted in a 1:50.000 scale. A orthorretification process, of a cutting out scene from the CBERS, was realized utilizing both MDE´s. The images were analyzed by statistics inferences and classified according to the Padrão de Exatidão Cartográfica (PEC) using check points. To evaluate the CCD CBERS 2 scene orthorefications necessity, the same cutting out was also object of geometric corrections having a second degree polynomial as a tool. The planimetrics residues generated by the second degree polynomial simplified corrections were just enough to demonstrate the necessity of the orthoretification process, it is, corrections of errors due to the embossment topography at the considered scene. The comparison of the images produced by the differents DEM´s demonstrate that the utilization of the DEM from the SRTM is a satisfactory tool for images orthoretifications of the CBERS 2.

Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-08-02T22:30:42Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Franciele Eunice Araujo.pdf: 9395585 bytes, checksum: 62db99508030899bed5d15a6d5bccb39 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-08-07T21:01:03Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Franciele Eunice Araujo.pdf: 9395585 bytes, checksum: 62db99508030899bed5d15a6d5bccb39 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-07T21:01:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Franciele Eunice Araujo.pdf: 9395585 bytes, checksum: 62db99508030899bed5d15a6d5bccb39 (MD5) Previous issue date: 2017-02-01 / CAPES / A Cartografia é a arte e a ciência das representações espaciais. Sua aplicação é de extrema importância para a sociedade, principalmente na gestão dos territórios. A Cartografia Escolar é uma área de estudo de refinamento à percepção espacial dos alunos por meio de mapas, auxiliando-os a compreender o espaço geográfico em que estão inseridos. Diante disso, o objetivo central dessa pesquisa foi o desenvolvimento de um atlas que servisse de apoio às atividades e conteúdos didáticos das disciplinas de Geografia, História, Ciências e Matemática, ministradas em uma escola da rede pública dos bairros de Candeias e Barra de Jangada em Jaboatão dos Guararapes – PE. Para a criação do material, fez-se necessário um estudo do território com o apoio de mapas antigos e as imagens da série de satélites Landsat, usando os sensores MSS, TM, ETM+ e OLI. As imagens do período de 1978 a 2013 foram submetidas à composições coloridas RGB, classificação não supervisionada e extração de índices físicos. Assim, pôde-se fazer uma análise de crescimento urbano e mudanças espaciais nos bairros de Candeias e Barra de Jangada, na qual se verificou que os anos de maior crescimento da mancha urbana foram após a década de 90 para as duas localidades. A aplicação do material em sala de aula foi feita na Escola Estadual Benedito Cunha Melo, em Barra de Jangada. Alunos do primeiro ano do ensino médio foram inicialmente submetidos a um questionário avaliativo para averiguar o nível de aprendizado da turma em Cartografia. Verificou-se que os alunos têm dificuldades com os conceitos cartográficos básicos. Em seguida, foi desenvolvida uma atividade de demonstração para que os estudantes tivessem contato com o material produzido. / Cartography is the science of spatial representations. Its application is of extreme importance to society, mainly in what concerns territorial management. Educational Cartography is an area that works on the refinement of students' spatial perception through maps, helping them understand the geographical space in which they live. Taking that into consideration, the main aim of this research was to develop an atlas that would be used as a support material to didactic activities of Geography, History, Science and Mathematics classes delivered in a governmental school of the neighborhoods of Candeias and Barra de Jangada - Jaboatão dos Guararapes, PE. For the creation of the material, a territorial study was necessary. The study was done by gathering old maps and imagery from the Ladsat satellites series, using the sensors MSS, TM, ETM+ and OLI. Images from 1978 to 2013 were submitted to RGB color compositions, unsupervised classification and physical indexes extraction. Then, the urban growth and spatial changes in Candeias and Barra de Jangada went under analysis, which verified that the greatest growth of urban areas for both locations happened during the 1990s. The implementation of the material in class was done in the State School Benedito Cunha Melo, in Barra de Jangada. Students in Year 10 answered an evaluation questionnaire, which aimed at gauging their knowledge of Cartography. It was verifies that the students have difficulties with basic cartographical concepts. After it, a demonstration activity was done so that the learners could get in contact with the produced material.

Orientador: Luciana Bolsoni Lourenço Morandini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-16T00:03:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nascimento_Juliana_M.pdf: 2159511 bytes, checksum: 592ca4a405512c2a06472a0c276eb206 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Os primeiros resultados citogenéticos obtidos para a espécie Physalaemus ephippifer, atualmente alocada no grupo P. cuvieri, mostraram um interessante heteromorfismo cromossômico ligado ao sexo. As 14 fêmeas analisadas presentaram um par cromossômico 8 heteromórfico, enquanto nos 7 machos analisados esse par era homomórfico. A diferença entre os cromossomos das fêmeas era devida à presença de um segmento adicional, composto por uma NOR e uma banda heterocromática a ela adjacente, localizado na região terminal do braço curto de apenas um desses homólogos, denominado de morfo 8b. Apesar desse importante achado, o uso de técnicas citogenéticas convencionais nessa e em outras espécies do grupo P. cuvieri não foram suficientes para esclarecer os mecanismos envolvidos na evolução cromossômica, já que poucos caracteres citogenéticos informativos foram evidenciados e também uma grande variação em relação às NORs foi encontrada. Com a intenção de buscar novos marcadores citogenéticos que auxiliem no estudo dos cromossomos sexuais de P. ephippifer e que colaborem na análise citogenética desse grupo de Physalaemus, foram estudadas sequências de DNA repetitivo isoladas desta espécie. Para tanto, o DNA genômico extraído de duas fêmeas de P. ephippifer, provenientes de Belém (Pará), foi digerido com a enzima de restrição BamHI e os fragmentos gerados foram separados por eletroforese em gel de agarose. Fragmentos posteriormente denominados de Pep194, Pep165 e Pep320 isolados a partir desse gel, foram clonados, sequenciados e localizados in situ no cariótipo de P. ephippifer. A seqüência Pep320 mostrou correspondência parcial com o fragmento EU343727.1 isolado de P. cuvieri, cuja sequência está disponível no GenBank. Apesar desses fragmentos não apresentarem similaridade entre si, as sequências Pep165 e Pep320 foram mapeadas no mesmo sítio cromossômico, correspondente à banda pericentromérica do braço curto do cromossomo 3. Esse resultado levanta um questionamento, ainda não respondido, acerca da organização molecular dessas sequências, que podem estar arranjadas em clusters independentes ou representar partes de uma mesma unidade repetitiva. A sequência Pep194 foi mapeada em regiões coincidentes com as NORs, localizadas no braço longo dos cromossomos identificados como Z e W, e no braço curto do cromossomo W. Apesar deste resultado, a análise da sequência Pep194 não apresentou nenhuma similaridade com regiões codificadoras do DNAr nucleolar, nem mesmo com regiões intergênicas associadas a elas já descritas. Tal sequência apresentou interessante arranjo interno, sendo composta de duas repetições diretas terminais, cada uma com 63 pb, sendo ambas flanqueadoras deuma região interna de 68 pb. Para melhor investigar a organização desta sequência no genoma de P. ephippifer, foram analisados produtos resultantes da amplificação por PCR de segmentos do DNA genômico, efetuada com o auxílio de primers construídos especificamente para se anelarem em regiões internas do segmento isolado. Os resultados obtidos por essa análise evidenciaram a presença de uma unidade repetitiva de 131 pb, que representa parte do fragmento Pep194, diferindo desse por não apresentar uma das regiões de 63 pb. No entanto, não é possível descartar a co-existência de uma unidade repetitiva de 194 pb, não detectada nessas análises. Em paralelo a esses experimentos, sequências pertencentes a elementos retrotransponíveis Rex1 foram isoladas do genoma de P. ephippifer por PCR, clonadas, sequenciadas e mapeadas por FISH em uma região heterocromática pericentromérica do braço curto do cromossomo 3. A análise das sequências desses fragmentos comprovou serem correspondentes a parte da sequência codificadora da enzima transcriptase reversa do elemento Rex1. A fim de verificar a presença desse elemento em outras espécies de Physalaemus, os mesmos primers utilizados nos experimentos com P. ephippifer, foram usados para a amplificação de sequências a partir de amostras do DNA genômico de P. albifrons, P. albonotatus, P. henselli e P. spiniger. A sequência isolada de P. albonotatus apresentou uma deleção interna de cerca de 220 pb quando comparada com as sequências correspondentes, aqui descritas ou disponíveis no GenBank. Isso permite sugerir que, embora derivado de um elemento Rex1, esse segmento provavelmente deixou de ser um elemento de transposição ativo. Embora esse seja o primeiro trabalho que descreve a ocorrência de Rex1 em anuros, a presença desse elemento parece comum, pelo menos no gênero Physalaemus. Além de apresentar similaridade com o segmento de Rex1 e com os fragmentos Pep165 e Pep320, a banda heterocromática pericentromérica de 3p é também o sítio de ocorrência de DNAr 5S. Tal região, reconhecida como DAPI-positiva na presente análise, permite clara distinção entre os cromossomos 3 e 4 de P. ephippifer, frequentemente confundidos se analisados apenas em relação à sua morfologia. As quatro sequências repetitivas aqui isoladas apresentaram-se eficientes marcadores citogenéticos e poderão ser utilizadas para futuros estudos comparativos entre espécies do gênero Physalaemus. / Abstract: Previous cytogenetic studies of Physalaemus ephippifer, a species currently allocated to the group P. cuvieri, showed an interesting female-specific chromosome heteromorphism. In 14 females of P. ephippifer, chromosome pair 8 was heteromorphic with regard to the occurrence of an NOR anda terminal C-band. Such heteromorphism was not found in the seven analyzed male specimens. These findings suggest that the chromosomes of pair 8 may be sex chromosomes in P. ephippifer, characterizing a ZZ ?/ ZW ? sex-determination system in this species. Despite these important data, conventional cytogenetic techniques performed in this and other species of the Physalaemus group were not sufficient to clarify the processes involved in the karyological divergence in this anuran group. Aiming to look for new cytogenetic markers that may help in the study of P. ephippifer sex chromosomes and in the cytogenetic analysis of this group of Physalaemus, we studied repetitive DNA sequences isolated from P. ephippifer. Genomic DNA extracted from two females of P. ephippifer from Belém (Pará) was digested with the restriction enzyme BamHI. The restriction fragments were separated by electrophoresis in agarose gel. DNA fragments, which were ultimately named Pep194, Pep165, and Pep320, were isolated from the gel, cloned, sequenced, and localized in situ in the karyotype of P. ephippifer. The sequence Pep320 was very similar to the fragment EU343727.1 isolated from P. cuvieri. Although Pep320 and Pep165 were totally different in nucleotide sequence, they were mapped on the same chromosome site, which corresponded to the pericentromeric C-band in the short arm of chromosome 3. This raises doubts about the molecular organization of these sequences, which can be arranged in independent clusters, but can also represent partial regions of the same repeat unit. The sequence Pep194 was mapped in regions that coincided with the NORs, located in the long arm of Z and W chromosomes and in the short arm of the W chromosome. However, the Pep194 sequence had no similarity with the coding regions of the nucleolar rDNA or with intergenic spacers associated to them. The restriction fragment Pep194 had an interesting internal arrangement, being composed of two terminal direct repeats, each with 63 bp, flanking an internal region of 68 bp. To further investigate the organization of this sequence in the genome of P. ephippifer, we amplified some Pep194 segments from genomic DNA by PCR using specific primers designed to anneal in inner / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Biologia Celular e Estrutural

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2016-12-20T10:57:25Z No. of bitstreams: 2 Tese - Sylvia Elaine Marques de Farias - 2016.pdf: 7335718 bytes, checksum: 48824dd4042523e464e099f9a62371b3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-12-27T12:49:46Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Sylvia Elaine Marques de Farias - 2016.pdf: 7335718 bytes, checksum: 48824dd4042523e464e099f9a62371b3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-27T12:49:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Sylvia Elaine Marques de Farias - 2016.pdf: 7335718 bytes, checksum: 48824dd4042523e464e099f9a62371b3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-04-18 / The Brazilian savanna is the second largest biome, covering an approximate area of 21% of the national territory. Among other factors, the rainfall favored the activities of agribusiness and hydro-dependent activities of the climate pattern of rainfall. However, the biome is complex climatologically and rainfall network is sparse or poorly distributed. In this sense, this study sought to evaluate the precipitation estimates of the Savanna. The main results of this thesis are: a) by the need to assess the rainfall pattern on the Savanna it was found that the rains are caused due to phenomena of weather and climate that operate seasonally, featuring the region by dry winters, from May to August, and rainy summers, from September to April. A deficit above -5,0 mm.mes-1 is observed between May and June, while the excess water, the rainy season can reach 240,0 mm.mes-1; b) given the complexity rainfall observed in the biome, statistical tests showed that version 7 algorithm was more accurate to estimate precipitation. As for the regions of the state inserted in the biome, Goiás presented the highest value as the Pearson correlation, 0,99. Estimates between area and pixel showed that the satellite estimates are consistent with the observations. Considering the ability of estimates of the annual and seasonal pattern, the precipitation anomalies reproduce the variability of dry and wet periods. The estimate for the year 2009, under the influence of the beginning of a moderate El Nino, played a rainy year throughout the Savanna. Conversely, 2007, characterized by end of an El Nino low intensity, reproduced a dry year; c) Analysis of Main Components (ACP) were characterized by the three most significant factors explaining 97,5% of the total variance of monthly precipitation data both for Brazil and for the Savanna. The CP1 varies linearly indicating that it explains both the Savanna as to Brazil the annual variation in rainfall. The CP2 brand significantly seasonality between Brazil and the Savanna. The CP3 varies significantly between characteristic months due to seasonality. The results suggest that the satellite rainfall estimates, version (3B43), are accurate on a complex and extensive biome as the Savanna. / O cerrado é o segundo maior bioma brasileiro, ocupando uma área aproximada de 21% do território nacional. Dentre outros fatores, a pluviosidade favoreceu ao agro e ao hidro negócio, atividades dependentes do padrão climático da precipitação. No entanto, o bioma é complexo climatologicamente e a rede pluviométrica é escassa ou mal distribuída. Neste sentido, esta pesquisa procurou avaliar as estimativas de precipitação sobre o bioma Cerrado. Os principais resultados desta tese são: a) mediante a necessidade de se avaliar o padrão pluviométrico sobre o bioma Cerrado, constatou-se que as chuvas são originadas devido a fenômenos de tempo e clima que atuam sazonalmente, caracterizando a região por invernos secos, entre maio a agosto, e verões chuvosos, entre setembro a abril. Um déficit superior a -5,0 mm.mes-1 é observado entre maio e junho, enquanto o excedente hídrico, no período chuvoso, pode chegar até 240,0 mm.mes-1; b) diante da complexidade pluviométrica observada no bioma, os testes estatísticos mostraram que a versão 7 do algoritmo se mostrou mais acurada para estimar a precipitação. E, quanto às regiões dos Estados inseridas no bioma, Goiás apresentou o maior valor quanto à correlação de Pearson, 0,99. As estimativas entre área e pixel mostraram que as estimativas por satélite estão de acordo com as observações. Considerando-se a habilidade de estimativas quanto ao padrão anual e sazonal, as anomalias de precipitação reproduziram a variabilidade dos períodos secos e chuvosos. A estimativa para o ano de 2009, sob a influência do início de um El Niño moderado, reproduziu um ano chuvoso em todo o Cerrado. Por outro lado, o ano de 2007, caracterizado pelo final de um El Niño de fraca intensidade, reproduziu um ano seco; c) as Análises de Componentes Principais (ACP) foram caracterizadas por três fatores mais significativos que explicam 97,5% da variância total dos dados mensais de precipitação tanto para o território brasileiro quanto para o bioma Cerrado. A CP1 varia linearmente indicando que ela explica tanto para o Cerrado quanto para o Brasil a variação anual da precipitação. A CP2 marca significativamente a sazonalidade entre o Brasil e o Cerrado. A CP3 varia significativamente entre meses característicos devido à sazonalidade. Os resultados sugerem que as estimativas de precipitação por satélite, versão (3B43), são acuradas sobre um bioma complexo e extenso como o Cerrado.

As células-satélite musculares vêm sendo muito estudadas em diferentes pesquisas, especialmente com o objetivo de aumentar a compreensão do mecanismo de sua ação na regeneração muscular e as respectivas implicações nas diferentes miopatias, visando identificar possíveis alvos terapêuticos. Dois modelos para distrofias, os camundongos Largemy d e Lama2dy2j/J possuem um padrão de degeneração intenso e bastante semelhante, mas com diferenças na expressão de genes envolvidos na cascata de regeneração. Por isso, estes constituem interessantes modelos para o estudo de possíveis diferenças no mecanismo de ativação e atuação das células-satélite no músculo distrófico. Assim, os objetivos específicos deste projeto consistiram em: 1) isolar e caracterizar por citometria de fluxo as populações de células-satélite dos modelos Largemy d e Lama2dy2j/J em comparação com o normal C57Black6, quanto a expressão de marcadores de miogênese e de células-tronco pluripotentes; e 2) estudar e comparar o perfil de expressão gênica destas populações de células satélites através de microarray de expressão. Na caracterização fenotípica das células isoladas do músculo normal, aquelas que aderem mais precocemente (PP1) e mais tardiamente (PP2) mostram um padrão fenotípico semelhante entre si e com características mais próximas às miogênicas. Já a população de células de adesão bem mais tardia (PP6) apresentou um padrão de marcação misto, mantendo as características miogênicas, mas apresentando tambem padrão de células-tronco mesenquimais, sugerindo o fenótipo de células mais imaturas. Nos músculos distróficos, identificamos diferenças na constituição do pool de células presentes inicialmente no músculo, onde na linhagem Lama2dy2j/J há indícios de uma população em estágio proliferativo, enquanto que na linhagem Largemy d há presença de células com maior imaturidade. Os resultados da analise de expressão gênica nas populações caracterizadas se mostraram concordantes com os fenótipos celulares avaliados por citometria. Identificamos a hipo-expressão de genes ligados à regeneração e remodelamento muscular em ambos modelos distróficos. Considerando os genes diferentemente expressos somente em cada um dos modelos, os resultados sugerem ativação de proliferação celular e inibição da diferenciação na linhagem Lama2dy2j/J e distúrbios na miogênese na linhagem Largemy d. Assim, pudemos identificar vias importantes alteradas em cada um dos modelos que explicam parte das diferenças encontradas nos trabalhos anteriores / Muscle satellite cells have been widely studied, especially to understand their mechanism of action in muscle regeneration and correspondent implications in the different dystrophic processes, aiming the identification of potential therapeutic targets. Two mice models for muscular dystrophies, Largemyd and Lama2dy2j/J, have a pattern of an intense and very similar degeneration, but with differences in the expression of genes involved in the regeneration cascade. Therefore, they are interesting models to study possible differences in the mechanism of activation and action of satellite cells in the dystrophic muscle. The main objectives of this project are: 1) to isolate and characterize by flow cytometry, populations of satellite cells from Largemyd and Lama2dy2j/J models, as compared to normal C57Black6, evaluating the presence of myogenic and pluripotent stem cells markers; and 2) to study and compare gene expression profiles of these populations of satellite cells using microarray technique. In the phenotypic characterization of cells harvested from normal muscle, both faster (PP1) and slower (PP2) populations to adhere in culture flasks show similar phenotypic characteristics, which were closer to myogenic phenotype. On the other hand, the population of cells with very delayed adhesion ability (PP6) presented a mixed pattern, maintaining the myogenic characteristics, but associated to positive mesenchymal stem cell´s markers, suggesting a phenotype of more immature cells. In dystrophic muscles, we could identify differences in the constitution of the first pool of cells present in the Lama2dy2j/J muscle where there is evidence of a population in proliferative stage, while in the Largemyd strain, we found more immature cells. Gene expression profile in the characterized populations showed consistent concordance with the cellular phenotypes assessed by flow citometry. In both dystrophic models, we identified down-regulated genes related to regeneration and remodeling of the muscle. Considering only the genes differently expressed in each dystrophic model, data suggest the activation of cell proliferation and inhibition of differentiation pathways in Lama2dy2j/J strain and altered myogenesis in the Largemyd model. Thus, we identified important altered pathways in each of the dystrophic models that could explain most of the differences in gene expression profile in the muscle, described in our previous work