Ce travail concerne la mise en oeuvre de la technique de la « lentille thermique » pour l'étude des phénomènes d'absorptions multiphotoniques dans les matériaux organiques. La technique de la lentille thermique utilisée ici, est dans son principe une technique pompe-sonde où le faisceau pompe provient d'un laser pulsé (25ps, 532nm ou 1064nm) tandis que le faisceau sonde est issu d'un laser continu (He-Ne : 632nm). Cette technique s'apparente aussi à la technique de z-scan dans la mesure où l'échantillon est déplacé de part et d'autre du point focal d'une lentille convergente disposée sur le trajet du faisceau pompe. Selon le rapport des diamètres des faisceaux pompe et sonde, on distingue deux variantes principales de la technique de la lentille thermique en régime pulsé : la variante dite en « modes accordés » (les diamètres des deux faisceaux sont identiques) et la variante en « modes désaccordés » (les diamètres des deux faisceaux sont différents). Pour des raisons de simplicité de mise en oeuvre et de sensibilité, nous avons choisi la variante en modes désaccordés. Cette variante de la technique de la lentille thermique, ayant été peu utilisée jusque là, a été utilisée pour mesurer le coefficient et la section efficace de l'absorption à deux photons dans différents matériaux organiques. Ces résultats sont comparés à d'autres mesures provenant de technique de mesure plus connue comme « transmission non linéaire » ou la technique de z-scan.

Les matériaux nanocomposites formés à partir de particules métalliques incluses dans une matrice diélectrique présentent des propriétés inusitées que l'on ne retrouve pas dans les matériaux massiques étant donné la taille nanométrique des particules métalliques. Notamment, la résonance des électrons de conduction du métal sous l'excitation d'une lumière incidente, appelée résonance plasmon de surface (spr), donne lieu à l'apparition d'une bande d'absorption dans le visible ayant une influence drastique sur les propriétés optiques du nanocomposite. La position, la largeur et l'amplitude de cette bande d'absorption sont des fonctions complexes des caractéristiques nano-structurales du nanocomposite, notamment : la nature et la concentration du métal, la taille des nanoparticules, leur forme, l'indice de réfraction de la matrice, etc. Spécifiquement, la présence de particules asymétriques, comme par exemple des particules de forme nano ellipsoïdale, permet l'observation de bandes d'absorption spr multiples résultant en un matériau non-symétrique possédant des propriétés anisotropes. Dans cette thèse, nous présenterons le développement et l'analyse de techniques avancées de fabrication permettant le contrôle précis de la synthèse d'un nanocomposite formé de nanoparticules d'or incluses dans une matrice de silice. Nous avons développé une technique en trois étapes permettant de fabriquer des couches nanocomposites comprenant des particules de tailles et de formes contrôlées. Ces étapes sont : 1) dépôt hybride pulvérisation/dépôt chimique en phase vapeur assisté par plasma, 2) recuits thermiques, 3) irradiation à l'aide d'un faisceau d'ions de haute énergie. Subséquemment, la performance optique des matériaux fabriqués a été testée par différentes techniques afin d'en évaluer les propriétés linéaires et non-linéaires. Les premières ont été étudiées par ellipsométrie et spectrophotométrie alors que les deuxièmes l'ont été par les techniques P-Scan et Z-Scan. Plus précisément, nous nous sommes intéressés à la métrologie et au contrôle de l'anisotropie des propriétés du système nanocomposite formé par faisceau d'ions. Une nouvelle approche de mesure des propriétés optiques non-linéaires anisotropes sera présentée. Dans ce document, le lecteur retrouvera une description théorique exhaustive des propriétés optiques (linéaires et non-linéaires) des matériaux nanocomposites métal/diélectrique incluant des modèles détaillés pour la description des propriétés de chacun des constituants du nanocomposite : métal (Drude, Lorentz) et diélectrique (Cauchy).

<p>Larger systems today, like telephone and optical switches, are usually based on a multiboard architecture where a set of printed-circuit boards are connected to a backplane board. These systems are also equipped with Boundary-Scan to enable testing, however, the backplane in a multi-board system has a limited wiring capability, which makes the additional backplane Boundary-Scan wiring highly costly. The problem is to access the Boundary-Scan enabled boards with the Boundary-Scan controller located at a central board. In this MSc. thesis project we propose an approach suitable for the Advanced Telecommunication Computing Architecture (ATCA) standard where we make use of the existing Intelligent Platform Management Bus (IPMB) and expands its protocol for application of Boundary-Scan tests. We have also defined a command set as well as a test data format for storing embedded test data on the boards to support the remote execution of Boundary-Scan tests. For validation of the proposed approach we have developed demonstrator.</p>

<p>There is a gap between low-fidelity prototyping using paper and high-fidelity prototyping using computers in web design. Both serve well in different stages of web design, but are not well integrated. Prior studies have examined the practice of web designers. The studies resulted in a number of alternative prototyping tools, which focus on informal representation and try to prolong sketching in the design process.</p><p>The thesis proposes a design of a prototyping tool that makes use of existing paper sketches. In paper prototyping, a human who acts as the “computer” makes the sketches interactive. In the prototyping tool put forward in the thesis, the interactivity of the sketches is instead created on the computer. The novel prototyping tool needs to support the interactions and behaviours used in web design, and it must be easy to use so that the web designers do not have to invest too much time learning it.</p><p>The prototype of the tool is a sketch-and-scan interface, thus allowing the use of paper the way it is. The functionality supports both documentation and computer interactivity. Usability tests and expert reviews were conducted, involving students, lecturers and researchers in human-computer interaction.</p><p>The results elaborate previous research on prototyping practice, and a designers’ wish list was formulated. A prototyping tool is expected to support communication between users, designers and developers; as well as to reduce a designer’s need to change his work practice when using the tool.</p>

<p>We present a geometrical and mathematical solution to a problem faced in the glass industry in this work. Volume measurement of the glass gob is vital in making glassware. Geometric models were used to represent the glass gob.</p><p>A line scan camera system takes the images of the glass gob and the volume information of the glass gob is obtained by the image processing in the industry. This work is carried out to implement a simulator which estimates the change in the volume measurement of glass gob through line scan when it is rotated or when its shape is changed. A mixture of graphical and mathematical approaches is used to carry out this study. Geometric models have been used to represent the different gob models. Geometric models facilitate the manipulation of volumetric data.A simple and effective technique is used in this work. The problem is divided into steps. Volume measurement through a line scan technique is simulated. An easy to use graphical user interface (GUI) is designed to interact with the gob model and check the results of volume measurements.We present a geometrical and mathematical solution to a problem faced in the glass industry in this work. Volume measurement of the glass gob is vital in making glassware. Geometric models were used to represent the glass gob.A line scan camera system takes the images of the glass gob and the volume information of the glass gob is obtained by the image processing in the industry.This work is carried out to implement a simulator which estimates the change in the volume measurement of glass gob through line scan when it is rotated or when its shape is changed. A mixture of graphical and mathematical approaches is used to carry out this study. Geometric models have been used to represent the different gob models. Geometric models facilitate the manipulation of volumetric data.</p><p>A simple and effective technique is used in this work. The problem is divided into steps. Volume measurement through a line scan technique is simulated. An easy to use graphical user interface (GUI) is designed to interact with the gob model and check the results of volume measurements.</p>

<p>Cervical cancer is a multifactorial disease. Infection by oncogenic types of the human papillomavirus (HPV) is the major environmental risk factor and host genetic susceptibility also influences disease development. </p><p>The aim of this thesis is to identify and analyse risk genes involved in the genetic predisposition to cervical carcinoma. A unique and extensive population-based affected sib-pair (ASP) material and a large case-control sample were used in the investigations.</p><p>In paper I the human leukocyte antigen (HLA) class II DQB1 and DRB1 loci are confirmed, for the first time in a family-based material, as genetic susceptibility factors for cervical cancer. It is also proposed that the HLA class II DPB1 locus independently contributes to risk of developing disease. In addition, no evidence is found for an involvement of the class I HLA-B and HLA-A loci in the genetic predisposition. Paper II conclude that the Fas receptor –670 single nucleotide polymorphism (SNP) do not have a major impact on the susceptibility to cervical carcinoma <i>in situ</i> in the Swedish population. In paper III we show that interactions between the HPV16 E6 gene subtype and host HLA class II genotype potentially occur during infection and disease progression. Paper IV suggests that three chromosomal regions, 9q32, 12q24 and 16q24, contain risk factors of low to moderate effects on cervical cancer development. In paper V linkage signals are further identified between a 9q32 gene encoding the thymic stromal co-transporter (TSCOT) and the disease in ASPs with mean age over 30.5 years at diagnosis within the sib-pair.</p><p>These findings are important contributions towards understanding more about the aetiology of this complex cancer. The identification of new susceptibility regions opens up for further characterisation, replication and candidate gene analysis.</p>

This thesis presents a collection of photogrammetry techniques aimed at the analysis of short-lived events. The small time scale on which these phenomena happen makes them difficult to capture not only from the point of view of hardware but also because one can not obtain several measurements of events that are not repeatable. Three subjects are presented in ascending order of complexity. We first detail a new approach that uses a simple unidimensional image sensor for traffic monitoring in order to obtain a large number of accurate measurements like speed, acceleration or inter-vehicle distances. This is followed by a discussion on the reconstruction of the surface of an evanescent liquid flow using stereovision on floating tracers. Finally, a new spectral model is used for the three-dimensional detection of aircraft wake vortices from IR LIDAR measurements. The approach was successfully tested during flight tests and proved to be invaluable to detect the wakes under these specific conditions.

Surface characteristics such as topography and critical dimensions serve as important indicators of product quality and manufacturing process performance especially at the micrometer and the nanometer scales. This paper first reviews different technologies used for obtaining high precision 3-D images of surfaces, along with some selected applications. Atomic force microscopy (AFM) is one of such methods. These images are commonly distorted by convolution effects, which become more prominent when the sample surface contains high aspect ratio features. In addition, data artifacts can result from poor dynamic response of the instrument used. In order to achieve reliable data at high throughput, dynamic interactions between the instrument's components need to be well understood and controlled, and novel image deconvolution schemes need to be developed. Our work aims at mitigating these distortions and achieving reliable data to recover metrology soundness. A summary of our findings will be presented. / Singapore-MIT Alliance (SMA)

Natural hydrocarbon seeps harbor distinctive geological, chemical, and biological features in the marine environment. This thesis verified remote sensing signatures of seeps using in-situ observation and repeated collections of satellite imagery. Bubble streams in the Gulf of Mexico water column from four natural seep sites on the upper continental slope were imaged by a side-scan sonar, which was operated from a submarine near the seafloor, and by acoustic profilers, which were operated from surface ships. These data were correlated with sea surface slicks imaged by Synthetic Aperture Radar (SAR) on the RADARSAT satellite. Comparing non-oily bubble streams from rapidly venting mud volcanoes with oily bubble streams from shallow deposits of gas hydrate showed that they produced notably different signatures. Non-oily bubbles produced high backscatter on the side-scan sonar records, but were difficult to detect with the acoustic profilers. Oily bubbles from hydrate deposits produced acoustic shadows on the side-scan sonar records. The oily bubbles generated clear signatures extending from the seafloor to the near surface on the acoustic profile records. RADARSAT SAR images verified the presence of surface oil slicks over the hydrate deposits, but not over the mud volcanoes. This indicates that SAR imagery will not be able to capture every oil and gas seep in a region because non-oily bubble streams do not create surface oil slicks. A total of 113 natural oily seep sources were identified based on surface slicks in eleven SAR images collected over the northern continental slope. A persistence analysis verified that SAR is a dependable tool for capturing oil slicks because 93.5% of the slick sources identified in the 2001 images were corroborated with slicks in the 2002 images. The sources ranged in depth from 100 to 2000 m and 79% of the sources were in 900 meters or greater of water. Seventy-six percent of the seep sources were associated with salt less than 1500 m below the seafloor and none of the sources were located in the bottom of salt withdrawal basins. Geographical Information Systems (GIS) proved to be a useful tool in these analyses.

L'objectif de ce travail est de développer et d'évaluer des approches méthodologiques pour la prédiction de séquences cis-régulatrices. Ces approches ont été intégrées dans la suite logicielle RSAT (Regulatory Sequences Analysis Tools). Ces séquences jouent un rôle important dans la régulation de l'expression des gènes. Cette régulation, au niveau transcriptionnel, s'effectue à travers la reconnaissance spécifique entre les facteurs de transcription et leurs sites de fixation (TFBS) au niveau de l'ADN. Nous avons développé et évalué une série d'outils bioinformatiques qui utilisent les matrices position-poids pour prédire les TFBS ainsi que les modules cis-régulateurs (CRM). Nos outils présentent l'avantage d'intégrer les différentes approches déjà proposées par d'autres auteurs tout en proposant des fonctionnalités innovantes. Nous proposons notamment une nouvelle approche pour la prédiction de CRM basé sur la détection de régions significativement enrichies en TFBS. Nous les avons appelés les CRER (pour Cis-Regulatory Elements Enriched Regions). Un autre aspect essentiel de toute notre approche réside dans le fait que nous proposons des mesures statistiques rigoureuses pour estimer théoriquement et empiriquement le risque associé aux différentes prédictions. Les méthodes de prédictions de séquences cis-regulatrices prédisent en effet un taux de fausses prédictions généralement élevé. Nous intégrons un calcul des P-valeurs associées à toutes les prédictions. Nous proposons ainsi une mesure fiable de la probabilité de faux positifs. Nous avons appliqué nos outils pour une évaluation systématique de l'effet du modèle de background sur la précision des prédictions à partir de la base de données de TRANSFAC. Nos résultats suggèrent une grande variabilité pour les modèles qui optimisent la précision des prédictions. Il faut choisir le modèle de background au cas par cas selon la matrice considérée. Nous avons ensuite évalué la qualité des matrices de tous les facteurs de transcription de drosophile de la base de données ORegAnno, c'est à dire leur pouvoir de discrimination entre les TFBS et les séquences génomiques. Nous avons ainsi collecté des matrices des facteurs de transcription de drosophile de bonne qualité. A partir des matrices de drosophile que nous avons collectées, nous avons entamé une analyse préliminaire multi-genome de prédictions de TFBS et de CRM dans la région de lʼenhancer dorsocentral (DCE) du complexe achaete-scute de drosophile. Les gènes de ce complexe jouent un rôle important dans la détermination des cellules système nerveux périphérique de drosophile. Il a été prouvé expérimentalement qu'il existe un lien direct entre le phénotype du système nerveux périphérique et les séquences cis-régulateurs des gènes de ce complexe. Les outils que nous avons développés durant ce projet peuvent s'appliquer à la prédiction des séquences de régulation dans les génomes de tous les organismes.