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Modelos de dose-resposta com censura intervalar aplicados a dados de germinação de sementes / Dose-response models with interval-censored applied to seed germination data

Azevedo, Iábita Fabiana Sousa 26 August 2016 (has links)
O crescimento de investimentos em biotecnologia na agricultura tem sido um elemento primordial para a segurança alimentar global. Isso tem levado a uma reorganização da indústria mundial de sementes na busca por técnicas mais adequadas de cultivo, mecanização, uso de fertilizantes, defensivos agrícolas e a utilização de sementes. O Brasil por ser um dos ambientes mais sólidos nesse contexto tem contribuído com o crescimento e a diversificação da produção de sementes levando as lavouras brasileiras a atingirem um novo patamar de produtividade. Diferentes metodologias estatísticas têm sido utilizadas para analisar o comportamento da germinação de uma população de sementes. Entretanto, usar abordagens estatísticas que analisam os dados de germinação da melhor maneira possível permitirá uma maior confiabilidade dos resultados, bem como, ganho de informações pertinentes. Como em testes de germinação de sementes estuda-se o tempo até a ocorrência do evento, que envolve medidas repetidas feitas no mesmo lote e não se conhece o tempo exato da germinação da semente, propõe-se o uso de modelos de dose-resposta com censura intervalar, que permitem a interpretação biológica dos parâmetros usados para medir o processo germinativo e refletem o desenho experimental dos dados. Neste trabalho foram utilizadas duas metodologias estatísticas usuais na análise de dados de germinação de sementes e seus resultados foram comparados com os da abordagem de modelos dose-resposta com censura intervalar. Foram utilizados os modelos de dose-resposta Weibull 2 e log-logístico para explicar o processo germinativo de sementes de Brachiaria e Citrumelo Swingle respectivamente, com diferentes tempos de observação. Os experimentos foram realizados em delineamento inteiramente aleatorizado e os procedimentos dos testes de germinação de acordo com as Regras para Análise de Sementes (RAS). As conclusões obtidas a partir da análise dos dados por meio da metodologia proposta, em geral, divergiram das conclusões obtidas por abordagens tradicionais (modelos de regressão não-linear considerando a distribuição normal e índices de germinação com o uso da análise de variância) utilizadas para analisar dados de germinação. Os modelos de dose-resposta com censura intervalar apresentaram ajustes satisfatórios e sendo portanto uma análise mais adequada que as abordagens usuais. / The growth of investment in biotechnology in agriculture has been a vital element for global food security. This has led to a reorganization of the world seed industry in the seeking of the most appropriate techniques of cultivation, mechanization, use of fertilizers, pesticides and seeds. The Brazil for being one of the most solid in the world context of the seed industry has contributed to the growth and diversification of seed production, leading Brazilian crops to a new level of productivity. Different statistical methodologies have been used to analyze the germination behavior. However, using statistical approaches that analyze germination data as efficiently as possible will allow a greater reliability of the results, as well as relevant information gain. As in seed germination test studies the time until the occurrence of the event, involves repeated measurements on the same experimental unit and do not know the exact time of germination, we propose the use of dose-response models with interval censured that allow biological interpretation of parameters used to measure the germination process and reflect the experimental design of the germination data. In this work we used two methodologies of usual statistical analysis and their results were compared with those of the approach that uses the dose-response models with interval censured. We used the dose response models Weibull 2 and log-logistic to explain the process of seed germination of Brachiaria and Citrumelo Swingle with different observation times. The experiments were carried out in completely randomized design and testing procedures according to the rules for seed analysis (RAS). The conclusions obtained from the analysis of the data by the proposed methodology in general diverged from the conclusions obtained by traditional approaches (regression models nonlinear considering normal distribution and germination indices using analysis of variance) used to analyze data germination. The dose-response models with interval-censored showed satisfactory adjustments and therefore a more accurate analysis than the usual approaches.
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Riqueza, estrutura e composição de espécies arbóreas em floresta secundária invadida por hovenia dulcis thunb, caracterização do seu nicho de regeneração e efeitos alelopáticos

Boeni, Bruna de Oliveira 25 February 2011 (has links)
Submitted by Silvana Teresinha Dornelles Studzinski (sstudzinski) on 2016-03-01T13:33:32Z No. of bitstreams: 1 Bruna de Oliveira Boeni_.pdf: 3880093 bytes, checksum: 44409bac37cd34534884441441dcba95 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-01T13:33:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bruna de Oliveira Boeni_.pdf: 3880093 bytes, checksum: 44409bac37cd34534884441441dcba95 (MD5) Previous issue date: 2011-02-25 / CNPQ – Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O impacto das espécies exóticas invasoras sobre as espécies nativas nas comunidades e nos ecossistemas tem sido amplamente reconhecido como uma causa importante das mudanças na diversidade global. Estas espécies aumentam suas populações podendo afetar a estrutura e a função dos ecossistemas invadidos. Dentre as espécies exóticas de plantas que invadem ambientes florestais no Brasil, Hovenia dulcis Thunb. é freqüente em áreas que sofreram perturbações. Assim, a primeira parte deste trabalho procurou comparar os parâmetros fitossociológicos e avaliar a riqueza, a estrutura e composição de espécies arbóreas em áreas de floresta secundária em regeneração com e sem a invasão por H. dulcis. A espécie exótica estudada apresentou um dos maiores valores de densidade e área basal, demonstrando sua importância nas áreas onde ocorre. No entanto, estas variáveis estruturais e a riqueza não foram alteradas pela presença da espécie exótica. A composição de espécies sofreu influência da presença da espécie invasora quando se controlou o efeito causado por variáveis ambientais não mensuradas como histórico de perturbação, condições bióticas entre outros que influenciam a dinâmica de sucessão florestal. Isto indica que as variações florísticas entre as unidades amostrais são em maior parte determinadas pela diferença nas condições abióticas e no histórico de cada área e, secundariamente, pela presença de H. dulcis. A abundância e distribuição das espécies de plantas são determinadas em parte durante os estágios iniciais de regeneração, quando estão mais vulneráveis ao seu ambiente imediato. Mudanças no requerimento de fatores bióticos nos diferentes estágios de desenvolvimento ontogenético da planta podem manifestar mudança do nicho de regeneração desta. A disponibilidade de luz, a queda e o acúmulo de serrapilheira são fatores que afetam a estrutura e a dinâmica da comunidade de plantas de maneiras diferentes. Assim, a segunda parte deste estudo pretendeu avaliar se as variáveis ambientais no entorno de indivíduos de H. dulcis diferem durante as fases de desenvolvimento ontogenético: juvenil inicial, juvenil tardio e adulto, procurando verificar se existem alterações no nicho de regeneração em relação às variáveis ambientais; estágio ontogenético e deciduidade sazonal de H. dulcis. As análises mostram diferenças entre os estágios ontogenéticos apenas para abertura de copa e cobertura herbácea. A composição de espécies também variou entre os estágios ontogenéticos. A porcentagem de abertura de copa diferiu entre indivíduos adultos em relação aos juvenis apenas no período não-decidual, em função da dominância de H. dulcis compondo o dossel. Assim, observa-se uma mudança no nicho de regeneração em função da abertura de copa. A copa pouco densa de adultos de H. dulcis acentua o efeito da abertura de copa nestes pontos em relação aos indivíduos juvenis. A profundidade da serrapilheira durante o período decidual foi maior no entorno de adultos e juvenis iniciais. A deciduidade e conseqüente aumento da serrapilheira podem favorecer a sobrevivência e o crescimento das espécies mais exigentes à luz como as secundárias iniciais, em decorrência do aumento na quantidade de luz que chega ao sub-bosque, mas pode afetar negativamente plântulas intolerantes à luminosidade. Os compostos alelopáticos produzidos pelos vegetais provêm do metabolismo secundário e podem estar presentes em diferentes órgãos e tecidos da planta e serem liberados no ambiente de diferentes maneiras. A alelopatia tem sido reconhecida como um importante mecanismo ecológico que influencia a dominância vegetal, podendo determinar a estrutura, composição e a dinâmica de comunidades vegetais. H. dulcis apresenta, entre outros, compostos fenólicos em suas folhas que podem causar mudanças durante o processo de germinação de espécies nativas. Assim, a terceira parte deste trabalho testa os potenciais efeitos alelopáticos das folhas de H. dulcis sobre a germinação e crescimento de raiz e parte aérea de plântulas de Casearia sylvestris. Os extratos aquosos de folhas de H. dulcis apresentaram efeito alelopático em sementes e plântulas de C. sylvestris. Os lixiviados em todas as concentrações reduziram a porcentagem de germinação. Da mesma forma, ocorreu um maior efeito inibitório nas raízes do que na parte aérea das plântulas que pode impedir o futuro estabelecimento dos regenerantes, afetando a tomada de recursos vitais à planta. As sementes em contato com os lixiviados apresentaram uma redução na velocidade de germinação. Com isso, as plântulas de C. sylvestris expostas aos compostos aleloquímicos das folhas de H. dulcis tiveram seu desenvolvimento inicial atrasado em função da espécie exótica. Assim, conclui-se que a grande densidade de indivíduos de H. dulcis corrobora com a invasão desta espécie, que altera a composição de espécies na floresta em regeneração. Ainda, H. dulcis altera seu nicho de regeneração e assim influencia o nicho das espécies nativas regenerantes e ainda apresenta efeitos alelopáticos inibitórios sobre a germinação e desenvolvimento de plântulas de C. sylvestris. / The impact of invasive species on native species has been widely recognized as an important cause of the changes in the global diversity. Invading species are able to affect the structure and function of invaded ecosystems. Among the exotic plant species that invade forests in Brazil, Hovenia dulcis is frequent in areas of secondary vegetation. Thus, the first part of this work compares the phytosociological parameters among areas of secondary vegetation invaded by H. dulcis and areas without this exotic species. H. dulcis presented one of the biggest values of absolute density and basal area, demonstrating its importance for the structure of the areas where it occurs. However, the structural variables and the species richness had not been modified in function of the presence of the exotic species. The species composition was altered by the presence of the invading species when the effects caused by unmeasured variables that influence the dynamics of forest succession were controlled, indicating that variations in the composition among areas are in good part determined by differences in abiotic conditions and history of each area, and secondarily by the presence of H. dulcis. The abundance and distribution of the plant species are determined in part during the initial periods of regeneration, when they are more vulnerable to its immediate environment. Changes in require of biotic factors in the different periods of phases of ontogenetic development of the plant can reveal change of the niche of regeneration of this. The availability of light, the fall and accumulation of litter are factors that affect the structure and dynamics of the plant community in different ways. Thus, the second part of this study intends to evaluate the ambient variables around individuals of H. dulcis during the phases of ontogenetic development from young to old saplings and adults, evaluating changes in the regeneration niche in relation to the ambient variables, the ontogenetic period and the seasonal deciduousness of H. dulcis. The analyses indicated differences among the ontogenetic phases only in canopy opening and herbaceous covering. The species composition around H. dulcis individuals also varied among the ontogenetic phases. The percentage of canopy opening differed between adult individuals in relation to young saplings only in the non deciduous period, probably due to the dominance of the exotic species in the canopy. Thus, a change in the regeneration niche in function of the canopy opening is observed. The low density of the tree crowns of H. dulcis exacerbates the effect of the canopy opening in points where adults are established in relation to young saplings. The litter depth during the deciduous period was higher around adults and young saplings. The deciduousness and consequent increase in the leaf litter can favor the survival and growth of the most light demanding species, such as those typical of the initial stages of forest succession, as a result of the increase in the amount of light that arrives at the understory, which, however, can negatively affects seedling that are intolerant to elevated luminosity. The allelopathic compounds produced by plants come from the secondary metabolism and may be present in different plant tissues, being released to the environment in different ways. The allelopaty has been recognized as an important ecological mechanism that influences the dominance in plant communities, being able to determine the structure, composition and the dynamics of such communities. H. dulcis presents among others phenolic compounds, in its leaves that can cause changes during the process of seed germination of native species. Therefore, the third part of this work tests the potential allelopathic effects of leaf extracts of H. dulcis on the germination and growth of the root and aerial parts of seedlings of Casearia sylvestris. The watery leaf extracts of H. dulcis present allelopathic effect in seeds and seedlings of C. sylvestris. The leaf extracts in all concentrations reduced the germination percentage, and lead to a great inibitory effect in root development that can hinder the future establishment of the plants, affecting the uptake of vital resources. Seeds in contact with the leaf extracts presented a reduction in the germination speed. Thus, seedlings of C. sylvestris exposed to alleloquimic compounds of H. dulcis leaves had its initial development delayed. Thus, one concludes that the great density of individuals of H. dulcis corroborates the invasion for this species that modifies the composition of species in the forest in regeneration. H.dulcis modifies its niche of regeneration and thus it influences the niche of the regenerant native species and still it presents inibitiry allelophatic effect on the germination and development of seedlings of the native species.
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Curva de maturação de frutos e potencial germinativo de sementes de jabuticaba 'Sabará' (Myrciaria Jaboticaba Berg) / Jabuticaba\'s Sabará (Myrciaria jaboticaba Berg.) fruits maturation curve and seeds germination power

Luana Yoneda Coletti 07 February 2013 (has links)
As jabuticabeiras são árvores tipicamente brasileiras, de origem subtropical e tem como principal distribuição o centro sul do país. Dentre elas está a Sabará, a qual é a mais cultivada em todo o país. Sua propagação é realizada basicamente através de sementes, pois métodos de propagação vegetativa ainda são pouco utilizados. Contudo, a enxertia tem se mostrado promissora e a necessidade de porta enxertos bem formados torna-se essencial para o sucesso desta técnica. As sementes de jabuticaba são classificadas com recalcitrantes por serem sensíveis à dessecação o que dificulta seu armazenamento. As jabuticabeiras Sabará (Myrciaria jaboticaba Berg) são frutas nativas do Brasil, cuja distribuição concentra-se no centro sul do país. Trata-se de uma espécie subtropical com frutos pequenos, de coloração escura e muito doces, sendo utilizados principalmente para a confecção de geleias, licores e vinhos, pois o fruto in natura possui vida de prateleira muito curta, de até dois dias. Fatores externos e de cultivo limitam a produção de frutos e um deles poderia ser a presença de luz solar na maturação do fruto. O objetivo deste trabalho foi avaliar a influencia da luz solar na maturação do fruto de jabuticaba, através da divisão da planta em quadrantes e se a germinação da semente diminui durante o armazenamento em dois ambientes, geladeira e temperatura ambiente. Para a primeira etapa dividiu-se cinco plantas em quadrantes Norte, Sul, Leste e Oeste, onde foram coletados frutos para a análise físico-química e os parâmetros avaliados foram: o diâmetro, peso do fruto, Brix, acidez titulável, o índice de maturação e pH. Foi observado que apenas para o parâmetro Brix e, consequentemente para o índice de maturação, houve diferença estatística entre o quadrante Sul dos demais. A partir disso pode-se concluir que há influência da luz solar sobre alguns parâmetros de qualidade do fruto de jabuticabeira. Para o armazenamento sementes de jabuticaba Sabará foram coletadas e armazenadas em geladeira (5°C) e temperatura ambiente (~25°C) durante 105 dias em saquinhos de polietileno. Foram postas para germinar aos 7, 14, 21, 28, 42, 56, 70 e 105 dias e foram feitas avaliações semanais. Foi possível perceber que não houve diferença estatística entre os dois ambientes, mostrando que se trata de uma semente tolerante a temperaturas baixas para o armazenamento. A partir do teste de secagem foi possível observar o comportamento recalcitrante da semente, pois esta perdeu o poder germinativo com a perda gradual de umidade. Conclui-se, então, que a semente de jabuticaba é recalcitrante, porém classificada como minimamente recalcitrante já que tolerou armazenamento em temperaturas baixas. / Jabuticaba trees are typical Brazilian trees and are mainly distributed in the country\'s center- south. Among them there is Sabará, which is the most spread specie through Brazil. Its propagation is basically made with seeds since the vegetative propagation is still less used. However, grafting seems to be efficient and the necessity of good rootstocks becomes essential to the technique\'s success. Jabuticaba seeds are classified as recalcitrant because they are drying sensible turning the storage difficult. Jabuticaba Sabará trees (Myrciaria jaboticaba Berg) are brazilian native fruits, which are mainly distributed in the country\'s center-south. It is subtropical specie with small fruits, dark colored and very sweet, being used to make jellies, liquors and wines, since in natura fruits are very perishable not lasting two days. This work aimed to evaluate the influence of the sun light in jabuticaba\'s maturation and if the germination decrease during the storage in two different environments. It was possible to notice that during jabuticaba\'s development it was possible to notice that TSS, and consequently the TSS/TTA ratio, was influenced by the position of the fruit on the tree. The south side had lower results compared to the other quadrants, showing that there should be a sunlight influence in some quality parameters in jabuticaba\'s fruits. For storage test jabuticaba\'s seeds were collected and stored in fridge (5°C) and in environmental temperature (~25°C) during 105 days in polyethylene bags. Germination tests were taken at 7, 14, 21, 28, 42, 56, 70 e 105 days and weekly evaluations were made. It was possible to notice that there were no differences between both environments, showing that this seed tolerates low storage temperatures. From the drying test it was possible to observe the recalcitrant behavior of the seed, since it lost its germination power with the humidity loss. Therefore, it is possible to conclude that jabuticaba\'s seeds are recalcitrant, however it could be classified as minimally recalcitrant due the fact that it could be stored in low temperatures.
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Seed germination and dormancy in south-western Australian fire ephemerals and burial as a factor influencing seed responsiveness to smoke

Baker, Katherine S January 2006 (has links)
[Truncated abstract] Fire ephemerals are pioneer species that germinate in large numbers after fire and generally live for between six months and four years. Seeds produced during the short life span of these plants persist in the soil seedbank until a subsequent fire. This study examined the dormancy characteristics and germination requirements of ten Australian fire ephemeral species from five families. Seeds of four species germinated at one or more incubation temperatures in the laboratory, indicating that a proportion of their seedlots were non-dormant at the time of testing. Austrostipa compressa and Austrostipa macalpinei (Poaceae) produced >80% germination at 10?C and Alyogyne hakeifolia and Alyogyne huegelii (Malvaceae) produced 30-40% and 35-50% germination respectively at 10 to 25°C. In each of the Alyogyne species approximately 50% of seeds were impermeable to water, but scarification did not enable germination of all viable seeds suggesting that seeds which did not germinate, may have possessed physiological dormancy as well as physical dormancy. Remaining species had water permeable seeds. ... Germination of both Alyogyne species declined after six months of winter burial but was enhanced by heat treatments after a further six months of summer burial. Actinotus leucocephalus and Tersonia cyathiflora seeds exhibited annual dormancy cycling over two years of burial. Dormancy was alleviated over summer, allowing seeds of both species to germinate in smoke water when seeds were exhumed in autumn, and reimposed over winter, suppressing germination in spring. In Actinotus leucocephalus these dormancy changes were induced in the laboratory by warm (≥15°C) and cold (5°C) temperatures, alleviating and re-imposing dormancy, respectively. Wetting and drying seeds stored at 37°C further accelerated the rate of dormancy release. This dormancy cycling would increase the likelihood of seeds germinating when moisture availability in south-western Australia is greatest for seedling survival. It also explains the variation in germination response to smoke water observed in many species. Thus under natural conditions dormancy levels of fire ephemerals were altered during soil storage which enabled them to respond to fire-related cues such as heat and smoke water, and germinate in autumn. This information will assist in the use of these species in land rehabilitation and ornamental horticulture, and in the conservation of rare or endangered fire ephemerals.
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Propagação e diferenciação floral do abacateiro /

Oliveira, Inez Vilar de Morais. January 2006 (has links)
Orientador: Antonio Baldo Geraldo Martins / Banca: Dalmo Lopes de Siqueira / Banca: João Alexio Scarpare Filho / Banca: Fabíola Vitti Môro / Banca: Teresinha de Jesus Deléo Rodrigues / Resumo: Esse trabalho teve por objetivo fornecer informações sobre aspectos morfológicos da semente; determinar a possibilidade de clonagem da variedade Duke 7 por alporquia; avaliar influência da época no pegamento da enxertia em abacateiro das variedades 'Hass' e 'Fortuna' e caracterizar, por estudos anatômicos e morfológicos, mudanças na gema vegetativa à florífera, para duas variedades de abacate 'Hass' e 'Fortuna'. As sementes são monoembriônicas e exalbuminosas, de germinação hipógea e a emergência das plântulas ocorreu 33 dias após a semeadura; a raiz primária é longa e de coloração branca e as raízes secundárias são curtas e filiformes; os cotilédones são maciços e de coloração rosada sendo que foi possível observar a presença de múltiplos caulículos na semente de abacate, originados do colo; os frutos são do tipo baga; as sementes apresentam policaulia; o início da estabilização da emergência de plântulas ocorre na oitava semana. Não houve enraizamento dos alporques; o período mais indicado para o sucesso da enxertia, é de modo geral, compreendido entre os meses de novembro e dezembro para ambas as variedades 'Hass' e 'Fortuna'. A transição entre a fase vegetativa e a reprodutiva ocorre no mês de maio, quando há diminuição da temperatura; a evocação floral ocorre um mês após, caracterizado pelo formato arredondado das gemas; a iniciação da inflorescência ocorre dois meses após a transição, no mês de julho. / Abstract: This work aimed to study morphological aspects of seeds; determine the cloning possibility of Duke 7 cultivar by air layering; evaluate the influence of the season on grafting of Hass and Fortuna avocado cultivars and to characterize by anatomical and morphological studies the modifications on vegetative to flowering bud. The seeds are monoembryonic, the germination is hypogea and the emergence of seedlings occurred 33 days after planting; the main root is long, white and the secondary roots are short; the cotiledons are hard and pink; the seeds presented polystems it was observed the presence of many small stems on avocado seed; the fruit is a berry. The stabilization of seed emergency occurred with eight weeks. There was no rooting in the air-Iayerings; the season more indicated for grafting is between November and December for both cultivars. The change from vegetative to reproductive phase was in May, when there is lower temperatures; the floral evocation occurs one month after, characterized by the rounded format of buds; the initiation of the inflorescence occurs after two months of the transition, in July. / Doutor
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Využití klíčivosti v badatelsky orientovaném vyučování na ZŠ a nižším stupni gymnázia / Use of seed germination test in the inquiry-based science education at primary and lower secondary schools

LANDOVÁ, Tereza January 2018 (has links)
This diploma thesis discusses the possibilities of diversifying the teaching on the issue of germination in the form of worksheets as well as possibility of using germination tests in the inquiry-based teaching of biology at elementary schools and lower secondary schools. The readers are introduced into the general issues regarding seed development, construction and germination. It then deals with iquiry-based teaching, which is one of the most used methods in biology education in recent years. Worksheets created for this purpose are therefore validated through teaching practice and subsequently processed and evaluated. The paper discusses whether germination is a suitable biological material for inquiry-based teaching and also whether these worksheets can be recommended as a didactic teaching material for the development of skills and theoretical knowledge of germination.
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Caractérisation fonctionnelle des régulateurs chromatiniens ZRF1-Like chez Arabidopsis thaliana / Functional characterization of ZRF1-like chromatin regulators in Arabidopsis thaliana

Feng, Jing 13 March 2015 (has links)
Des études chez les animaux ont montré que ZRF1 a une fonction lectrice au niveau de H2Aub1 dans la dérépression de gènes réprimés par polycomb. Deux gènes homologues au gène humain ZRF1 ont été identifiés dans le génome d'Arabidopsis, et ont par la suite été appelés AtZRF1 a etAtZRF1 b. La caractérisation fonctionnelle de ces gènes n'a pas encore été rapportée. Ma première objective était d'obtenir des connaissances générales sur AtZRF1 a et AtZRF1 b. Tous les deux sont exprimés dans des plantes d'Arabidopsis et la protéine AtZRF1 b est localisée dans le noyau et dans le cytoplasme. En plus, nous avons trouvé que la protéine AtZRF1 b lie H2Aub1 avec les mêmes caractéristiques que la protéine ZRF1 humaine. J'ai utilisé les outils génétiques puissants disponibles pour Arabidopsis pour étudier la fonction d'AtZRF1 a et AtZRF1 b. Plusieurs lignées d'insertion de T-DNA indépendantes ont été identifiées. A cause d'une rédondance fonctionelle,des mutants simples n'ont pas de défauts de développement évidents. C'est pourquoi j'ai étudié un mutant double qui montrent une perte de fonction pour les deux gènes AtZRF1 a et AtZRF1 b. Ce double mutant révèle des rôles importants pour ces gènes dans la croissance et le développement,qui vont de la prolifération cellulaire et la différenciation jusqu'au contrôle du temps de floraison. J'ai ensuite étudié les rôles d'AtZRF1 a et AtZRF1 b dans la régulation de la transcription et j'ai constaté que AtZRF1 a et AtZRF1 b ont une fonction similaire a PRC1. Finalement, j'ai étudié les niveaux de H3K4me3, H3K27me3 et H2Aub1 dans la chromatine de certains gènes dont l'expression est perturbée dans les doubles mutants. Les résultats montrent que la déubiquitination de H2Aubi1 n'est pas un événement majeur dans la régulation de la transcription chez Arabidopsis. / Studies in animais show that ZRF1 can read the histone H2AK119ub1 modification in the derepression of polycomb-repressed genes. Two homologs of human ZRF1 have been identified in the Arabidopsis genome, and here in after are named AtZRF1 a and AtZRF1 b. So far, their functional characterization had not been reported. My first objective was to acquire basic knowledge about AtZRF1 a and AtZRF1 b. Both are broadly expressed in Arabidopsis plants and the AtZRF1 b protein is localized in the nucleus and thecytoplasm. Moreover, we found that AtZRF1 b binds H2Aub1 with characteristics similar to those previously reported for the human ZRF1 protein. I subsequently used the powerful genetic tools available in Arabidopsis to investigate the AtZRF1 a and AtZRF1b function. Several independent T-DNA insertion Arabidopsis mutant lines were identified. Because of functional redundancy, single mutants have no obvious developmental defects. I therefore focused on double mutants displaying loss of function of both AtZRF1a and AtZRF1 b. The study of a double mutant revealed important roles for these genes in plant growth and development ranging from cell proliferation and differentiation to flowering time control.I then investigated the roles of AtZRF1 a and AtZRF1 b in gene transcription regulation and found that AtZRF1a and AtZRF1 b function in a way that is partially similar to PRC1 function. Lastly, I investigated H3K4me3, H3K27me3 and H2Aub1 levels in the chromatin regions of some expression-perturbed genes in double mutants. The results show that ZRF1-mediated deubiquitination of H2Aub1 is not a major event in transcription regulation in Arabidopsis.
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Doses de regulador vegetal em sistema de semeadura convencional e direta sobre a produtividade, teor de nutriente nas folhas e nas sementes e qualidade fisiológica das sementes de três cultivares de feijão

Abrantes, Fabiana Lima [UNESP] 25 April 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-04-25Bitstream added on 2014-06-13T20:46:28Z : No. of bitstreams: 1 abrantes_fl_dr_ilha.pdf: 753180 bytes, checksum: 909aa2e6c49234e34d2b836ea8485de4 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / A maioria dos trabalhos com diferentes sistemas de manejo do solo e com uso de regulador vegetal (citocinina, giberelina e auxina) busca obter resultados quanto a aumentos na produtividade. Já, quanto ao seu efeito nos teores de nutrientes nas folhas e sementes e na qualidade fisiológica das sementes produzidas nessas condições há carência de informações. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar o desenvolvimento, produtividade, nutrientes nas folhas e sementes e qualidade fisiológica das sementes de feijão, cultivares Carioca Precoce, IAC Apuã e IAC Alvorada, em função do uso de regulador vegetal, via foliar, em sistema convencional e plantio direto em implantação, no inverno com uso de irrigação. A pesquisa foi conduzida em 2009 e 2010, no Município de Selvíria/MS. Realizaram-se três experimentos com os cultivares Carioca Precoce, IAC Apuã e IAC Alvorada, em blocos casualizados, em faixas, com quatro repetições. Os fatores foram: sistemas de semeadura convencional com incorporação da palhada do milheto ao solo e direta sobre a palhada do milheto e cinco doses do regulador vegetal (0; 1,0; 2,0; 3,0 e 4,0 L p.c ha-1) composto por três hormônios vegetais: cinetina, ácido giberélico e ácido indolbutírico, aplicadas em R5. Avaliou-se: clorofila e nutrientes foliares, características agronômicas e produtivas, teor de proteína e nutrientes nas sementes e a qualidade fisiológica das sementes através dos testes de: germinação, primeira contagem, emergência de plântulas em campo, índice de velocidade de emergência, altura de plântula, massa da matéria seca de plântula, envelhecimento acelerado, teste de frio sem solo e condutividade elétrica. O plantio direto mesmo em fase de implantação propiciou: aumento na clorofila e nos teores foliar de N, P e Mg variando em função do cultivar e do ano; e de maneira geral, considerando os três cultivares... / The most studies with different systems of soil management and use of plant growth regulator (cytokinin, auxin and gibberellin) search results as increases in productivity. Already, in its effect on nutrient concentrations in leaves and seeds and physiological quality of seed produced under these conditions there is a lack of information. Thus, the objective was to evaluate the development, productivity, nutrients in the leaf and seeds and physiological seed quality of common bean cultivars, Carioca Precoce, IAC Apuã and IAC Alvorada, depending on the use of growth regulators on leaf, in the conventional or no-tillage system in the implantation, in the winter with irrigation use. The research was conducted in 2009 and 2010, in Selvíria - MS State. They were conducted three experiments with varieties Carioca Precoce, IAC Apuã and IAC Alvorada, in a randomized blocks design in strips with four replicates. The treatments were: conventional tillage system with millet straw incorporation to the soil or directly over the millet straw, and five doses of the plant growth regulators (0, 1.0, 2.0, 3.0 and 4.0 L cp ha -1) which consists of three plant hormones, kinetin, gibberellic acid and IBA, applied at R5. It was evaluated: chlorophyll and foliar nutrients, agronomic and productive characteristics, protein and nutrients in the seeds and physiological quality of seeds through the tests of germination, first count, seedling emergence in the field, speed of emergence index, seedling height, mass of dry matter of seedlings, accelerated aging, cold test without soil and electric conductivity. The no-tillage even in implantation phase resulted in: increased leaf chlorophyll and on N, P and Mg, depending on the cultivar and year, and in general, considering the three cultivars used, it was the better development of plants and seed yield. The growth regulator did not affect the levels... (Complete abstract click electronic access below)
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Ecologia de espécies poliembriônicas com ênfase no Bioma Cerrado / Ecology of polyembryonic species with emphasis in Cerrado Biome

Mendes-rodrigues, Clesnan 25 August 2010 (has links)
Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / The of more than an embryo per seed, known as polyembryony, and the asexual reproduction via seed, known as apomixis, are usually associated. The records and importance of these events have increased in the last decades both for the Angiosperms as a whole and for specific biomes, as the Cerrado, where sexual reproduction is predominant. Despite these records, information on the ecology of polyembryonic seeds is still lacking. In this scenario, we aimed to confirm polyembryony as an indicator of apomixes in woody species of Cerrado and, based on studies of embryo resource allocation, seed germination, emergency and seedling growth, try to define the advantages and disadvantages of polyembryony for the ecology of these species. Out of a 132 species sample, 30.30% presented polyembryony, although only 6.82% did have the percentage of polyembryonic seeds above 5% and were more readily associated with apomixes. Among the Melastomataceae, a characteristic Neotropical family very well represented in the Cerrado, 33.96% of the species presented polyembryony, which predominated in the tribe Miconieae. Both in the Cerrado as a whole and in the Melastomataceae in particular, the polyembryony was associated with apomixes, but in the later, the apomixes was less often associated to higher frequencies of polyembryony. More specific studies with species of Eriotheca (Malvaceae-Bombacoideae) showed mosaics of monoembryonic and polyembryonic populations in E. gracilipes and E. pubescens, with ecological differences between either types of population. Polyembryony did not affected markedly seed germinability and seedling emergence, but resulted in less homogeneous processes than the one found in monoembryonic seeds. Resource allocation studies showed that both embryo and seedling mass decreased with the number of embryos or seedling per seed. These differences reduced the survival ability of seedlings emerging from polyembryonic seeds but, on the other hand, increased the survival chances of at least one of the seedlings from these seeds (seed individual survival). In Handroanthus chrysotrichus (Bignoniaceae), some of the putative advantages of polyembryony, as allee effect and bet hedging could be experimentally evaluated. Polyembryony was clearly correlated with the occurrence of apomixis and the results presented here showed that both processes can be important factors for the persistence and distribution of plant species in the Cerrado Biome. / A ocorrência de mais de um embrião por semente, conhecida como poliembrionia, e a reprodução assexuada via semente, conhecida como apomixia, são processos comumente associados. Os registros e a importância destes eventos vêm aumentando nas últimas décadas, tanto entre as Angiospermas como um todo quanto em biomas como o Cerrado, reconhecido como um bioma onde a reprodução sexuada é predominante. Apesar destes registros, existem ainda poucas informações sobre a ecologia das sementes poliembriônicas. Nesse cenário, objetivou-se confirmar a poliembrionia como indicador de apomixia em espécies arbóreas e arbustivas de Cerrado e, a partir de estudos alocação de recursos entre embriões, de germinação de sementes, emergência e crescimento de plântulas, tentar definir quais são as vantagens e desvantagens da poliembrionia para a ecologia das espécies. De um total de 132 espécies amostradas, 30,30% apresentaram poliembrionia, embora somente 6,82% apresentem porcentagens de sementes poliembriônicas acima de 5% e sejam mais diretamente associadas a presença de apomixia. Entre as melastomatáceas, uma família característica dos Neotrópicos e muito bem representada no Cerrado, 33,96% das espécies apresentam poliembrionia, com predominância em espécies da tribo Miconieae. Nos dois grupos amostrados, a poliembrionia foi associada à espécies apomíticas, poliplóides e com amplo padrão de distribuição, mas entre as Melastomataceae, a apomixia nem sempre estava associada a freqüências altas de poliembrionia. Estudos mais específicos com espécies de Eriotheca (Malvaceae-Bombacoideae) mostraram a ocorrência de mosaicos de populações monoembriônicas e poliembriônicas em E. gracilipes e E. pubescens, com diferenças na ecologia dos diferentes tipos de populações. A poliembrionia afetou pouco a germinabilidade e emergência das sementes, mas produziu um processo menos homogêneo que aquele das sementes monoembriônicas. Os estudos de alocação mostraram que a massa dos embriões diminuiu com o número de embriões por semente, fator que se repetiu com a massa individual de cada plântula. Estas diferenças de alocação reduziram a capacidade de sobrevivência das plântulas de sementes poliembriônicas, mas de uma maneira geral, aumentaram as possibilidades de sobrevivência de alguma das plântulas destas sementes. Em Handroanthus chrysotrichus (Bignoniaceae) algumas das vantagens da poliembrionia como a ocorrência de allee effect e bet hedging puderam ser avaliadas experimentalmente. A poliembrionia foi fortemente correlacionada com a presença de apomixia e os resultados mostram que a presença de poliembrionia e apomixia podem ser fatores importantes para a persistência e distribuição de espécies no Bioma Cerrado. / Doutor em Ecologia e Conservação de Recursos Naturais
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Predação pré-dispersão, chuva de sementes e dinâmica de saída do banco de sementes em florestas jovem e madura da caatinga / Predispersal seed predation, seed rain and output of the soil seed bank in young and mature forests of the caatinga

SOUZA, Jefferson Thiago 20 June 2014 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-06-20T16:07:28Z No. of bitstreams: 1 Jefferson Thiago Souza.pdf: 1154686 bytes, checksum: 3909c2a25caa7b398ccf23b4cb98fddb (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-20T16:07:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jefferson Thiago Souza.pdf: 1154686 bytes, checksum: 3909c2a25caa7b398ccf23b4cb98fddb (MD5) Previous issue date: 2014-06-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Forest conversion to agriculture areas modify attributes and ecological processes required for forest regeneration. We aim (i) investigate how the conversion of a mature forest in a abandoned agriculture area affects predispersal seed predation, the seeds size and mass, (ii) verify the annual, seasonal variation and dispersal modes effect in the seed rain, and (iii) investigate the effect of the forest age, season and seed deposition in the dynamics of soil seed bank of woody species. Both forests are located Caruaru, PE, Brazil. Fruits and seeds of the species, Mimosa arenosa and Croton blanchetianus, we collected and measured the seed size and mass, observed the predispersal seed predation. Seed rain was monitored monthly in both forests by seed traps. Output seed bank of the species, M. arenosa, C. blanchetianus and Piptadenia stipulacea were monitored in mesh bags, and placed on the surface and buried at 0-5 cm in the forests. Predispersal seed predation was 18.8% for M. arenosa and 4.3% for C. blanchetianus in the mature forest. In young forest, predispersal seed predation were 16 % and 4.0 %, respectively to M. arenosa and C. blanchetianus. Seed size and mass of the C. blanchetianus differed between mature and young forests. To C. blanchetianus, only the seeds of mature forest showed a significant effect of the size on predispersal seed predation. Seed rain in mature forest had significantly higher density in young forest. Richness and density differed between seasons and higher in the dry season. Richness and seed density also differed between dispersal modes. In the young forest, richness of autochorous, anemochoric and zoochorous species were 25, 21 and 10, while the densities were 159 seeds•m-2•month-1, 16.5 without•m-2•month-1 and without 2.7•m-2•month-1, respectively. The floristic similarity between forests was 0.79, and the year I was 0.75 and was 0.68 in year II. The failure in the output seed bank of M. arenosa suffered significant effect only on the forest age. To C. blanchetianus. Season and seed deposition influenced inn the output seed bank with higher failure in the dry season and seeds buried. Season affected the success in the output seed bank M. arenosa and C. blanchetianus being higher in the rainy season for M. arenosa and in the dry season to C. blanchetianus. Output seed bank of P. stipulacea was not affected. In general, the young forest has features of the initial stages of succession, but the time of abandonment was enough to recovery some ecological process of the populations. / A conversão de florestas em áreas de agricultura pode afetar os atributos e processos ecológicos necessários para a regeneração. Objetivou-se investigar (i) como a conversão de uma floresta madura, em Caruaru (Pernambuco), em uma floresta jovem pós uso para agricultura afeta a predação pré-dispersão, o tamanho e massa de frutos e sementes; (ii) como a chuva de sementes destas florestas responde aos efeitos anuais, sazonais e dos modos de dispersão; (iii) o efeito da idade de florestas, sazonalidade climática e deposição de sementes na dinâmica de sementes banco do solo. Foram coletadas frutos e sementes de Mimosa arenosa e Croton blanchetianus verificando o tamanho e massa e as evidências de predação pré-dispersão. A chuva de sementes foi monitorada mensalmente por meio de coletores. Foram colocadas sementes de M. arenosa, C. blanchetianus e Piptadenia stipulacea em sacos de malha e dispostas na superfície e enterradas no solo de 0-5 cm para as duas florestas. A predação foi 18,8% e 4,3% para M. arenosa e C. blanchetianus, respectivamente, na floresta madura e de 16% e 4,0%, respectivamente na floresta jovem. Para C. blanchetianus, tamanho e massa de frutos, bem como a massa de sementes diferiram entre as florestas madura e jovem. Para C. blanchetianus, apenas na floresta madura houve efeito do tamanho na predação pré-dispersão. A chuva de sementes na floresta jovem teve densidade maior que a floresta madura. Riqueza e densidade diferiram entre estações, sendo maiores na seca. Riqueza e densidade também diferiram entre os modos de dispersão. Na floresta jovem, a riqueza de autocóricas, anemocóricas e zoocóricas foram de 25, 21 e 10, enquanto as densidades foram de 159 sem·m-2·mês-1, 16,5 sem·m-2·mês-1 e 2,7 sem·m-2·mês-1, respectivamente. A similaridade florística foi de 0,79 entre florestas. O fracasso na saída de sementes de M. arenosa sofreu efeito apenas da idade da floresta. A sazonalidade e a deposição influenciaram o maior fracasso em sementes de C. blanchetianus na seca e enterradas. A sazonalidade afetou o sucesso de M. arenosa sendo maior na chuvosa e de C. blanchetianus sendo maior na seca. A saída do banco de P. stipulacea não foi afetado por nenhum dos fatores analisados. Em geral, a floresta jovem tem características que permite classificá-la em fase de sucessão inicial, mas o tempo do abandono já recuperou alguns processos para determinadas populações.

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