Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2017-03-28T11:45:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - João Neto Cronemberger Galvão - 2017.pdf: 3677244 bytes, checksum: 131ab2bd6a3da711a718560ca96c89b6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-03-28T13:49:38Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - João Neto Cronemberger Galvão - 2017.pdf: 3677244 bytes, checksum: 131ab2bd6a3da711a718560ca96c89b6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-28T13:49:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - João Neto Cronemberger Galvão - 2017.pdf: 3677244 bytes, checksum: 131ab2bd6a3da711a718560ca96c89b6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Over the years, biometrics has become a valuable resource for human identification be- cause it is an affordable, safe and reliable technique. Various security entities throughout the world, public and private, are committed to the use of biometrics in security; both in access control and for identifying suspects. In addition, many crimes can be prevented with tools that allow crosschecking of biometric data. However, biometric systems cur- rently in use are developed and provided by companies as proprietary systems. For this reason, the creation of a free and open tool will bring more security, control and savings for the government. For this reason, the objective of this work is to create a prototype of a free and open tool, developed within the Web Services approach, associated to the development of an API that will aim at a standardization of biometrics services, conside- ring the exchange of data between distinct and independent biometric applications with a low level of coupling and interoperability between systems of different platforms and technologies, so that it is possible to add to the service and use of multiple biometric functionalities such as face recognition, voice, fingerprints, hand geometry, iris, or even a combination, among others, to perform a task of personal identification. / A cada dia que passa, a biometria vem se tornando um recurso valioso para identifica- ção humana, pois trata-se de uma técnica acessível, segura e confiável. Várias entidades de segurança, por todo o mundo, públicas e privadas, estão empenhadas na utilização da biometria na área de segurança, tanto no controle de acesso, quanto para identifica- ção de investigados. Além disso, diversos crimes podem ser evitados com ferramentas que possibilitam o cruzamento de dados biométricos. No entanto, a maioria dos sistemas biométricos em uso atualmente são desenvolvidos e fornecidos por empresas como siste- mas proprietários, desenvolvidos isoladamente, sem o compartilhamento de informações e base de dados, não atendendo, a contento, as necessidades de agentes governamentais no que se refere à escala, controle e economia no uso das aplicações de biometria. Por esta razão, o objetivo deste trabalho será a criação de um protótipo de uma ferramenta livre e aberta, desenvolvida dentro da abordagem de Serviços Web, associado ao desen- volvimento de uma API que visará a padronização dos serviços de biometria, tendo em vista o intercâmbio de dados entre aplicações biométricas distintas e independentes, com um nível reduzido de acoplamento e com interoperabilidade entre sistemas de diferentes plataformas e tecnologias, de modo que seja possível agregar ao serviço o uso de várias funcionalidades biométricas tais como: o reconhecimento de face, a voz, as impressões digitais, a geometria da mão, a íris, ou mesmo a combinação destas, dentre outras, para executar a tarefa de identificação pessoal.

Made available in DSpace on 2016-08-17T14:53:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Flavio_Marcilio_Paiva_Ramos.pdf: 2116529 bytes, checksum: ec39ed91f835e580a43ccfbf8a3c4d1a (MD5) Previous issue date: 2009-05-04 / Nowadays, peer-to-peer networks are very popular mainly, when we wish to search or share a considerable amount of information and resources among various participants. One of the main difficulties of this technology is how to avoid that those participants maintain, at the same time, a considerable number of shared resources and to guarantee that those resources are not corrupted or polluted content. Another problem commonly found in P2P networks is the lack of interoperability among existing P2P solutions especially because the inconsistencies of metadata and operation interfaces used in node communication. This work describes P2PWSRep, a reputation management protocol that identifies non-cooperative nodes or that can hinder network performance by sharing corrupted, infected or non-existent files. P2PWSRep infrastructure was based on web services in order to tackle interoperability problems and to facilitate its extensibility, making it feasible to be accessed by several other P2P applications. The P2PWSRep protocol employs a distributed reputation computation using an exponentially weighted average that takes into account the current and previous node reputation and which is tuned by an adjustment parameter in order to obtain the final reputation, thus considering the node s behavior. The P2PWSRep protocol is validated by means of simulation and our results show that it is able to point out the more trustable nodes in the network as well as to insulate those which are not reliable or cooperative. Besides, the protocol does not unnecessarily impacts on the network load P2PWS. / As redes peer-to-peer (P2P) são muito populares atualmente, principalmente quando se deseja buscar ou compartilhar uma grande quantidade de informações e recursos entre os seus participantes. Uma das grandes dificuldades desse tipo de tecnologia é evitar que esses participantes mantenham, ao mesmo tempo, um número considerável de arquivos compartilhados, e ainda garantir que esses arquivos não sejam conteúdo poluído ou corrompido. Outro problema bem comum nas redes P2P, é a falta de interoperabilidade entre as diversas redes existentes, principalmente devido às incompatibilidades dos metadados e das interfaces das operações utilizadas na comunicação entre os nós. Este trabalho descreve o P2PWSRep, um protocolo de gerenciamento de reputação para identificar nós que não desejam cooperar ou que podem prejudicar o desempenho da rede pelo compartilhamento de arquivos corrompidos, infectados ou inexistentes. A infraestrutura da rede do P2PWSRep foi baseada em serviços web para contornar problemas de interoperabilidade e facilitar sua extensibilidade, tornando-o fácil de ser utilizado por diversas aplicações de redes P2P. O protocolo P2PWSRep possui um cállculo de reputação distribuído, utilizando-se uma média ponderada exponencial, que considera o valor da reputação anterior do nó e o valor atual, obtido dos demais nós da rede, e regulado por um parâmetro de ajuste, para obter a reputação final, de forma que o histórico do comportamento do nó seja considerado. O protocolo P2PWSRep é validado por meio de simulação e os resultados obtidos mostram que o mesmo é capaz de apontar os nós ou recursos mais confiáveis da rede, ao mesmo tempo em que isola aqueles nós que não são íntegros ou pouco cooperativos, além de não impor uma sobrecarga desnecessária à rede P2PWS.

Made available in DSpace on 2016-08-17T14:53:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eduardo Devidson Costa Bezerra.pdf: 6161794 bytes, checksum: 61fa31f8c5757b2b771df924fa5e9483 (MD5) Previous issue date: 2011-07-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The use of the Internet as a way to publish new applications and deliver new functionalities has consolidated the use of web services technology. Once web services technology enables a high degree of autonomy and interoperability, it provides a basic infrastructure for the development and composition of new services, which has benefited the business process management providing the agility required by enterprises to meet the need of rapidly changing business environment. Recently, new paradigms are being developed to deal with the increasing complexity in the development, maintenance and evolution of software systems. Among the new paradigms, Model Driven Engineering (MDE) and the Ontology stands out as the most promising for handling complex software systems. This work presents an approach to perform the dynamic composition of web services using techniques of match models (metamodels) that represent services. Models representing services must include semantic and structural aspects of the web service achieved through approaches to ontologies. Thus, we conjecture to establish matchings and measure the degree of similarity between models and investing in research about Ontologies and MDE in order to generate a tool that can assist in a Dynamic Composition of Web Services. A case study is presented to illustrate this approach. / A utilização da internet como forma de publicar novas aplicações e disponibilizar novas funcionalidades tem consolidado o uso da tecnologia de serviços web. Uma vez que essa tecnologia viabiliza um alto grau de interoperabilidade e autonomia, a tecnologia de serviços web fornece uma infra-estrutura básica para o desenvolvimento e a composição de novos serviços, o que tem beneficiado à gerência de processos de negócio oferecendo assim, a agilidade necessária e requerida pelos empreendimentos frente à necessidade de rápidas mudanças no ambiente de negócios. Recentemente, novos paradigmas vêm sendo desenvolvidos para fazerem face à complexidade cada vez mais crescente no desenvolvimento, manutenção e evolução de softwares. Dentre eles a Engenharia Dirigida por Modelos (MDE Model Driven Engineering) e as Ontologias se destacam como os mais promissores. Neste trabalho, apresenta-se uma abordagem para realizar a composição dinâmica de um novo serviço web utilizando técnicas de Matching de modelos (ou metamodelos) que representem serviços. Tal representação deverá conter aspectos semânticos e estruturais do serviço web conseguidos através de abordagens de Ontologias. Sendo assim, vislumbra-se estabelecer correspondências e medir o grau de similaridade entre modelos investindo na pesquisa de MDE e Ontologias com o intuito de gerar uma ferramenta que possa auxiliar na Composição Dinâmica de um Serviço. Para validar a abordagem, um estudo de caso será apresentado.

Made available in DSpace on 2016-08-17T14:53:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Wagner Elvio.pdf: 4463476 bytes, checksum: 4fda2686652d403cd2641f98f3b51575 (MD5) Previous issue date: 2012-10-10 / The antivirus system and firewall are protection systems designed to prevent malicious work in the network, thus constituting a barrier to invaders (e.g. vírus, worms e hackers). However, there is no guarantee a full protection to network and computers, invasions can occur by exploiting vulnerabilities, known, and allow running programs remotely, changing privileges within the system and the dissemination of important information. In this case, Intrusion Detection System IDS (Intrusion Detection System) allows the detection of intrusions and subsequent notification to the network administrator or, in conjunction with the firewall blocks the port used in the invasion or the IP address of the attacker. An important factor for the intrusion detection is the quality of subscriber base. However IDS systems are isolated systems and the interoperability among different vendors IDS is complex and difficult to implement. Existing IDS systems in the literature, including the IDS NIDIA (Instrusion-Detection System Network Intrusion Detection System based on Intelligent Agents) are isolated systems, are not easily reused. Generally, they communicate using different protocols and are designed with different programming paradigms. In this work it is proposed an architecture based on the philosophy SOA (Service Oriented Architecture) to support interoperability between IDS systems. The IDS-NIDIA will be adapted and extended according to the SOA philosophy, containing layers of web services in order to provide a static service composition between the layers of the application and reuse of information with other IDS s. / Os sistemas antivírus e firewall são sistemas de proteção que visam impedir a execução de ações maléficas na rede, constituindo, portanto, uma barreira aos invasores (e.g.vírus, worms e hackers). Entretanto, não há como garantir uma proteção total da rede e dos computadores, podendo ocorrer invasões através da exploração de vulnerabilidades, já conhecidas, que permitem a execução de programas remotamente, a alteração de privilégios dentro do sistema e a divulgação de informações importantes. Neste caso, o Sistema de Detecção de Intrusão-IDS(Intrusion Detection System) permite a detecção de intrusões e a consequente notificação ao administrador da rede ou, em conjunto com o firewall, bloqueia a porta utilizada na invasão ou o endereço IP do atacante. Um fator importante para a detecção de intrusões é a qualidade da base de assinaturas. Entretanto os sistemas IDS são sistemas isolados e a interoperabilidade entre IDS de fornecedores diferentes é complexa e de difícil implementação. Os sistemas IDS existentes na literatura, incluindo o IDS-NIDIA (Instrusion Detection System- Network Intrusion Detection System based on Intelligent Agents), são sistemas isolados, não são facilmente reutilizados. Geralmente, estes se comunicam utilizando diferentes protocolos e são criados com paradigmas de programação diferentes. É proposta uma arquitetura baseado na filosofia SOA (Service Oriented Architecture ) para suportar a interoperabilidade entre sistemas IDS. O sistema IDS-NIDIA será adaptado e estendido de acordo com esta filosofia SOA, contendo camadas de serviços web com o propósito de oferecer uma composição de serviço estática entre as camadas de aplicação e o reuso de informações com outros IDS s.

Orientador: Cecília Mary Fischer Rubira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-25T19:51:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Franco_RomuloJose_M.pdf: 10351473 bytes, checksum: 560e490e6acebcaf56e0a906dd45d0ec (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Serviços Web são usados como uma das formas de se obter uma Arquitetura Orientada a Serviços (SOA). Com aspectos interoperáveis, dinâmicos e distribuídos, tais serviços agregam valores de negócio, são unidades de software com alta coesão e são utilizados para integração entre aplicações empresariais. Em um contexto de SOA, provedores de serviços devem oferecer garantias de funcionamento de seus serviços. Esta garantia é realizada através de atributos de Quality of Service (QoS) inseridos em contratos do tipo SLA (Service Level Agreement). Atributos de QoS podem ter flutuações ou mudança de estado ao longo do tempo, dado que um serviço opera em um ambiente de alta dinamicidade e alta imprevisibilidade que são propriedades inerentes ao contexto SOA. Diante deste cenário, há uma clara necessidade de se conhecer as variações que ocorrem nos atributos de QoS. Para isso, é fundamental aplicar uma monitoração que possibilite conhecer os valores de atributos de QoS para compreender o contexto geral do ambiente que opera o serviço. Uma boa solução de monitoração deve oferecer meios flexíveis de monitorar diferentes atributos de QoS (e.g. disponibilidade, desempenho e confiabilidade), de diferentes modos de operar, considerando diferentes alvos ligados ao serviço (e.g. servidor, rede e aplicação servidora). Por meio de uma Revisão Sistemática da Literatura identificamos que as soluções encontradas não apoiam a flexibilidade na monitoração. Face a este contexto, esta dissertação propôs a FlexMonitorWS uma solução de monitoração de serviços Web e de recursos de infraestrutura de TI ligada ao serviço Web. A FlexMonitorWS adota técnicas de Linhas de Produtos de Software para criar uma família de monitores a partir da variabilidade de software existente em sistemas de monitoração de serviços Web. Três estudos de caso foram executados para avaliar a viabilidade da ferramenta, obtendo-se resultados satisfatórios na entrega de valores de atributos de QoS e na compreensão do ambiente que opera o serviço Web. Ao final, apresentamos conclusões, contribuições e direções para trabalhos futuros / Abstract: Web services are used as a way of obtaining a Service Oriented Architecture (SOA). With interoperable, dynamic and distributed aspects such services add business values are software units with high cohesion and are used to integrate business applications. In a SOA context, service providers must offer guarantees of the servces operations. This warranty is carried out by attributes Quality of Service (QoS) type contracts entered into SLA (Service Level Agreement). QoS attributes can have fluctuations or changes of state over time, given that a service operates in an environment of high dynamics and high unpredictability inherent in the SOA context properties. Given this scenario, there is a clear need to understand the fluctuations in the QoS attributes. Therefore, it is essential to apply a monitoring which allows to know the QoS attributes values to understand the overall context of the environment that operates the service. A good monitoring solution must offer flexible ways to monitor different QoS attributes (e.g. performance, availability and reliability) in different ways to operate, considering different targets linked to the service (e.g. server, network and server application). By analyzing existing solutions through a Systematic Literature Review identified that solutions do not support the flexibility in monitoring. Against this background, this thesis proposed a solution FlexMonitorWS monitoring of Web services and IT infrastructure resources connected to the Web services. FlexMonitorWS adopts techniques from Software Product Lines to create a monitors family from the existing variability in the Web services monitoring systems. Three case studies were performed to assess the tool feasibility, obtaining satisfactory results in delivering QoS attributes values and understanding to environment that operates the Web service. In the end, conclusions, contributions and directions for future work are presented / Mestrado / Ciência da Computação / Mestre em Ciência da Computação

Orientador: Edmundo Roberto Mauro Madeira / Dissertação (mestrado) ¿ Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-24T01:33:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_GeraldoMagela_M.pdf: 6211710 bytes, checksum: 5a88c999846d2e6c89c5a5487e7cbed2 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Agências governamentais ao redor do mundo estão realizando grandes investimentos na utilização de Tecnologia da Informação e Comunicação em suas atividades. Essa tendência, conhecida como Governo eletrônico, impulsiona grande demanda por pesquisas cujo foco principal é o desenvolvimento de aplicações destinadas a um governo mais transparente e colaborativo. Aplicações para esse tipo de cenário introduzem uma série de desafios que precisam ser enfrentados, incluindo maior interoperabilidade entre sistemas, escalabilidade, questões de segurança, entre outros. Nesse sentido, o paradigma de Arquitetura Orientada a Serviços (SOA) apresenta-se como uma interessante proposta para mitigar a heterogeneidade dos serviços prestados pelas diversas entidades envolvidas. Além disso, computação em grade pode ser considerada uma solução promissora para aplicações de middleware em Governo eletrônico, graças à sua alta capacidade de armazenamento e processamento, além de sua recente orientação a serviços, tornando-a uma poderosa ferramenta para aplicações intra-domínio. Considerando esses desafios, este trabalho propõe uma plataforma para aplicações de Governo eletrônico em sistemas em grades utilizando serviços de suporte fornecidos pelo Globus Toolkit 4 (GT4) no contexto da Web Semântica. O trabalho inclui a implementação de um protótipo do middleware e sua validação através de um cenário de aplicação / Abstract: Government agencies around the world are making large investments in the use of Information and Communication Technology in their activities. This trend, known as electronic government, drives a demand for research focused on development of applications aimed at a more transparent and collaborative government. Applications for this type of scenario pose a series of challenges to be faced, including greater interoperability between systems, scalability, and security issues, among others. In this sense, the paradigm of Service-Oriented Architecture (SOA) presents itself as an interesting proposal to mitigate the heterogeneity of services provided by various involved entities. Furthermore, grid computing can be considered a promising solution for middleware applications in e-Government due to its high storage and processing capacity, and also its recent service orientation, making it a powerful tool for intra-domain applications. Considering these challenges, this dissertation proposes a platform for e-Government applications on grid computing, using the support services provided by the Globus Toolkit 4 (GT4) in the context of the Semantic Web. The work includes the implementation of a middleware prototype and its validation through an application scenario / Mestrado / Ciência da Computação / Mestre em Ciência da Computação

Aplicações de sistemas computacionais emergentes atribuindo requisitos de resposta na forma de tempo de resposta requerem uma abordagem de sistemas de tempo real. Nesses sistemas, a qualidade de serviço é expressa como garantia das restrições temporais. Um amplo leque de técnicas para provisão de QoS encontram-se na literatura. Estas técnicas são baseadas tanto na diferenciação de serviço (QoS relativa), quanto na especificação de garantia de desempenho (QoS absoluta). Porém, a integração de QoS relativa e absoluta em nível de aplicação não tem sido tão explorada. Este trabalho realiza o estudo, a análise e a proposta de um método de escalonamento de tempo real em um ambiente simulado, baseado em contratos virtuais adaptativos e modelo re-alimentado. O objetivo é relaxar as restrições temporais dos usuários menos exigentes e priorizar usuários mais exigentes, sem degradar a qualidade do sistema como um todo. Para tanto, estratégias são exploradas em nível de escalonamento para o cumprimento dos contratos especificados por requisitos de tempo médio de resposta. Os resultados alcançados com o emprego do método proposto sinalizam uma melhoria em termos de qualidade de serviço relativa e absoluta e uma melhor satisfação dos usuários. Este trabalho também propõe uma extensão para os modelos convencionalmente estudados nesse contexto, ampliando a formulação original de duas classes para n classes de serviços / Emerging computer system application posing responsiveness requirement in the form of response time demand a real-time system approach. In these systems, the quality of service is expressed as guarantees on time constraints. A wide range of techniques for QoS provision is found in the literature. These techniques are based both on either service differentiation (relative QoS) or specification of performance guaranteeS (absolute QoS). However, integrated provision of both relative and absolute QoS at application level is not as well explored. This work conducts the study, analysis and proposal of a real time scheduling method in a simulated environment. This method is based on adaptive virtual contracts and feedback model. The goal is to relax the time constraints of less demanding users and prioritize the time constraints of most demanding users, without degrading the quality of the system as a whole. Strategies toward this goal are exploited in the system scheduling level and are aimed at the problem of fulfulling service-level agreements specifying average response times requirements. The results achieved with the proposed method indicate an improvement in relative and absolute QoS and a better user satisfaction. This work also proposes an extension to the conventional models studied in this context, extending the original formulation of two classes for n classes of services

Estudos de expressão gênica geralmente envolvem a realização de processos de análise integrados para a obtenção de respostas biológicas de interesse. A realização destes processos frequentemente requer o uso combinado de uma série de ferramentas de software. No entanto, o processo de integração manual de ferramentas pode ser demorado e propenso a erros devido ao crescente número de ferramentas e formatos de dados disponíveis no domínio. De modo a automatizar o processo de integração, algumas abordagens têm sido propostas tanto para a adaptação das ferramentas de análise existentes como serviços web semânticos, quanto para o desenvolvimento de ambientes de suporte à integração (composição) de serviços web semânticos. Embora estas abordagens representem avanços, nenhuma solução adequada para o desenvolvimento e composição de serviços foi especificamente definida para o domínio de genômica funcional. Neste contexto, o principal objetivo deste projeto foi investigar uma solução completa para o desenvolvimento e composição de serviços web semânticos para a análise de expressão gênica. Como parte da solução proposta, definimos uma metodologia integrada para a implementação de serviços web semânticos criados a partir de ferramentas de software existentes e para a anotação semântica destes serviços. Nossa metodologia fornece diretrizes concretas para o desenvolvimento sistemático de serviços, considerando também os principais aspectos técnicos associados ao processo de desenvolvimento. Esta metodologia foi aplicada a um conjunto representativo de serviços que fornecem suporte às principais atividades de análise realizadas em diferentes tipos de dados de expressão gênica. De forma complementar, definimos uma solução completa para a composição semântica de serviços no domínio de análise de expressão gênica. A solução proposta foi implementada em uma plataforma de suporte semi-automático à composição de serviços web semânticos, chamada SemanticSCo. Esta plataforma fornece suporte flexível a todas as atividades envolvidas no processo de composição de serviços, incluindo a criação, publicação, requisição, descoberta, seleção, composição e execução de serviços. Além disto, a plataforma SemanticSCo foi projetada para prover suporte adequado a diferentes tipos de usuários, incluindo biologistas e bioinformatas. Neste sentido, a plataforma fornece aos usuários um alto nível de abstração para a definição de seus processos de análise, permitindo que os mesmos se concentrem mais nas questões de pesquisa biológicas do que nos aspectos subjacentes do processo de composição. Adicionalmente, a plataforma SemanticSCo suporta a definição e incorporação não apenas de serviços simples, definidos em termos de uma única operação, mas também de serviços complexos, definidos em termos de um conjunto de condições que restringem a ordem de invocação de suas operações. Finalmente, de modo a avaliar a plataforma de suporte desenvolvida, definimos diferentes cenários de composição para a análise (integrada) de dados de expressão gênica. O uso da plataforma SemanticSCo facilitou a definição destes cenários, permitindo assim a reprodução dos resultados obtidos a partir de diferentes estudos de expressão gênica previamente documentados na literatura / Gene expression studies usually involve the creation of integrated analysis processes for obtaining responses for a biological question. The creation of such processes often require the combined use of a number of software tools. However, the manual integration of tools can be cumbersome and error prone due to the increasing number of tools and data formats available in the domain. In order to automate the integration process, some approaches have been proposed for the adaptation of existing analysis tools as semantic web services as well as for the development of software environments to support the integration (composition) of semantic web services. Although these approaches present advances, to the best of our knowledge, no suitable solution has been proposed for the development and composition of web services in the functional genomics domain. In this context, this project aimed at investigating a complete solution for the development and composition of semantic web services to support gene expression analysis. As part of the proposed solution, we have defined an integrated methodology for the implementation of semantic web services created from existing software tools and the semantic annotation of such services. Our methodology provides concrete guidelines for the systematic development of services, also taking into account the main technical aspects associated with the development process. This methodology has been applied in the development of a representative set of services that support the main analysis activities performed on different types of gene expression data. Complementary to our methodology, we have defined a complete solution for the semantic composition of web services in the gene expression analysis domain. The proposed solution has been implemented in a software platform to support the semi-automatic composition of semantic web services, named SemanticSCo. This platform provides flexible support to all activities involved in the service composition process including service creation, publication, request, discovery, selection, composition and execution. Additionally, the SemanticSCo platform has been designed to support different types of users, including biologists and bioinformaticians. In this sense, the platform provides users with a high level of abstraction in the definition of their analysis processes, thus allowing them to focus more on biological research issues rather than on underlying details of the composition process. In addition, the SemanticSCo platform supports not only the definition and incorporation of (simple) services defined in terms of a single operation, but also (complex) services defined in terms of a set of conditions that constrain the order in which service operations should be invoked. Finally, in order to evaluate the developed support platform, we have defined a number of composition scenarios for the (integrated) analysis of gene expression data. The use of the SemanticSCo platform has facilitated the definition of these scenarios, thus allowing the reproduction of the results obtained from different gene expression studies previously documented in the literature.

Um ambiente inteligente é um sistema de computação ubíqua e sensível ao contexto onde os sistemas computacionais embutidos no ambiente, a comunicação entre dispositivos e o ambiente, e a acessibilidade aos serviços do ambiente são transparentes ao usuário. O presente trabalho tem como objetivo propor um modelo para ambientes inteligentes baseado em serviços web semânticos, em que os serviços disponíveis para os dispositivos do ambiente são proporcionados como serviços web e a interação dispositivo - ambiente é feita em um contexto de computação móvel, onde a disponibilidade dos serviços e a informação de contexto do dispositivo mudam freqüentemente. No modelo proposto todas as funcionalidades do ambiente são fornecidas como serviços. Estes serviços são descobertos e executados automaticamente com a finalidade de ajudar o usuário a desenvolver tarefas específicas, permitindo ao usuário se concentrar nas tarefas e não na interação com o ambiente. O modelo se fundamenta na oferta de serviços dirigida pela tarefa a ser desenvolvida, o que é conhecido como Task-driven Computing. Por outro lado, para a automação do processo de descoberta e execução dos serviços é necessário ter uma especificação não ambígua da semântica dos serviços. Empregamos para isso a ontologia WSMO (Web Services Modeling Ontology) que fornece os elementos necessários para a descrição dos serviços disponíveis no ambiente e o contexto do dispositivo. Finalmente, como prova de conceitos do modelo proposto, foi implementado um ambiente inteligente para uma biblioteca. A ativação de um ambiente inteligente baseado no modelo proposto se baseia na definição de ontologias, descrição semântica dos serviços no ambiente e a implementação de serviços web tradicionais. / A smart environment is a system computing ubiquitous computing and context awareness, in which the computational systems embedded in the environment, the communication between devices and the environment, and the accessibility to services are transparent to the users. The aim of this work is to propose a semantic web services based model for smart environments, in which services are offered to devices as web services and the device - environment interactions are based on a mobile computing environment, in which the contextual information and availability of services change frequently. In the proposed model all functionalities in the environment are offered as services. These services are automatically discovered and executed to support the user in a specific task, allowing to the user to focus on his task and not in the interactions with the environment. The model is based on a task-driven offer of services and on task-driven computing. To automate the discovery and execution of services, we need a nonambiguous specification of the semantic of services. We use the WSMO ontology (Web Services Modeling Ontology), which provides the required elements for description of the services in the environment and the context device. Finally, as a conceptual proof of the proposed model, we implemented a smart environment for a library. In the proposed model the activation of a smart environment is based in the ontologies definition, semantic description of the services.

A implantação de composições de serviços web de grande escala apresentam vários desafios, tais como falhas corriqueiras na infraestrutura, heterogeneidade tecnológica, distribuição do sistema por diferentes organizações e atualização frequente dos serviços em operação. Nesta dissertação, estudamos como uma implantação automatizada baseada em middleware pode auxiliar na superação de tais desafios. Para isso, desenvolvemos o CHOReOS Enactment Engine, um sistema de middleware que possibilita a implantação distribuída e automatizada de composições de serviços web em uma infraestrutura virtualizada, operando no modelo de computação em nuvem denominado Plataforma como um Serviço. O middleware desenvolvido é avaliado qualitativamente em comparação a abordagens de implantação ad-hoc e quantitativamente pela sua escalabilidade em relação ao tempo de implantação das composições de serviços. / The deployment of large-scale service compositions presents several challenges, such as infrastructure failures, technological heterogeneity, distributions across different organizations, and continuous services updating. In this master thesis, we study how the automated deployed supported by middleware can help in overcoming such challenges. For this purpose, we developed the CHOReOS Enactment Engine, a middleware system that enables the distributed and automated deployment of web service compositions in a virtualized infrastructure, operating in the cloud computing model known as Platform as a Service. The developed middleware is evaluated qualitatively by comparing it with ad-hoc deployment solutions, and it is also evaluated quantitatively by its scalability regarding the deployment time of service compositions.