Orientador: Roberto de Oliveira Roça / Banca: André Mendes Jorge / Banca: Germano Francisco Biondi / Banca: João Garcia Caramori Júnior / Banca: Carmem Josefina Contreras / Resumo: Foram utilizados 20 bovinos sãos, castrados, da raça Nelore, sendo divididos em cinco abates realizados em épocas diferentes. As colheitas foram divididas em 2 fases, de 10 animais cada, e para cada avaliação foram utilizados 5 animais estimulados (EE) e 5 não estimulados eletricamente (NE). O tempo de maturação foi de 28 dias. Foram avaliados força de cisalhamento, índice de fragmentação miofibrilar e avaliação sensorial no músculo Longissimus dorsi. Quando avaliada a força de cisalhamento, as carcaças estimuladas eletricamente apresentaram carne mais macia que as não estimuladas, com diferenças significativas entre os tratamentos nos períodos de 2 e 7 dias de maturação. As carcaças EE não apresentaram aumento do índice de fragmentação miofibrilar (IFM) em relação ao tempo de maturação, porém nas carcaças NE houve aumento do IFM avaliado aos 21 dias de maturação. Na avaliação sensorial, a estimulação elétrica melhorou os atributos de maciez e mastigabilidade. / Abstract: Twenty healthy castrated bovines (Bos taurus indicus) were used and divided into 5 slaughters, which were done at different time. The study was divided into two phases with ten animals each, and for each evaluation 5 electrically stimulated animals and 5 non-stimulated animals were used. The ageing time was 28 days. It has been evaluated shear force, myofibril fragmentation index and sensorial evaluation in the Longissimus dorsi muscle. When the shear force was evaluated, the electrically stimulated carcasses showed a meat more tender than the non-stimulated ones, with real differences among treatments in the periods of 2 and 7 days of ageing. The electrically stimulated carcasses did not show an increase in the myofibril fragmentation index toward the ageing time. Nevertheless, in the non-stimulated carcasses there was an increase in the myofibril fragmentation index evaluated after 21 days of ageing. In the sensorial evaluation, the electric stimulation improved the attributes of tenderness and mastication. / Doutor

O objetivo do presente trabalho foi determinar a força de cisalhamento Warner-Bratzler do músculo Longissimus lumborum de animais zebuínos machos inteiros (Bos indicus) durante o período de maturação, nas faixas de pH final (pHf 48 horas post mortem) normal (pH entre 5,5 e 5,8) e anormal (pH entre 5,81 e 6,19) e temperaturas internas de cozimento. Concomitante com a avaliação de força de cisalhamento, foram avaliadas também a degradação da desmina e troponina T, o comprimento do sarcômero, o teor de colágeno total e solúvel, as temperaturas máximas de desnaturação das proteínas e a morfologia geral de agregação das fibras do músculo no cozimento. A degradação da desmina e troponina T foi maior no pHf normal, aparecendo produtos de degradação a partir do dia 7 nessa faixa de pHf. Não houve diferenças nos valores de comprimento do sarcômero, descartando-se assim, a contribuição desse parâmetro sobre a temperatura máxima de desnaturação (Tmáx) das proteínas, determinada utilizando calorímetro exploratório diferencial (DSC). Similarmente, não foram encontradas diferenças para os teores de colágeno total e solúvel, e os valores de colágeno total foram baixos, sugerindo que sua contribuição na segunda transição térmica e nos valores de força de cisalhamento foi mínima. As Tmáx1 e Tmáx2, correspondentes à desnaturação da meromiosina leve e pesada, respectivamente, foram menores no pHf normal, mas o efeito foi maior para a Tmáx2. A Tmáx3 da actina e titina aumentou até 14 dias post mortem na faixa de pHf normal, e posteriormente diminuiu significativamente após 21 dias, sugerindo possível degradação dessas proteínas nesse período de dias. Não foram encontradas diferenças nos valores de Tmáx no pHf anormal, em todos os dias post mortem, o que sugere a contribuição de um possível mecanismo de proteção que estabiliza as miofibrilas no aquecimento. Houve maior agregação das fibras do músculo no pHf normal nas temperaturas internas de cozimento de 65 e 80°C, provavelmente devido à maior desnaturação térmica das miofibrilas. Os valores de força de cisalhamento foram maiores com o aumento da temperatura interna de cozimento, devido ao aumento da desnaturação térmica das miofibrilas do músculo. Independente da temperatura interna de cozimento, os valores de força de cisalhamento foram altos em quase todos os dias post mortem para ambas as faixas de pHf, o que sugere a necessidade de utilizar métodos físicos ou químicos para aumentar a maciez do músculo Longissimus lumborum de animais zebuínos. / The aim of this work was to determine the Warner-Bratzler shear force of Longissimus lumborum muscle of Zebu bulls during ageing, at the normal (pH between 5.5 e 5.8) and abnormal (pH between 5.81 e 6.19) ultimate pH (pHu) groups (pH 48 hours post mortem) and internal temperatures of cooking. Concomitant with the Warner-Bratzler shear force evaluation, the degradation of desmin and troponin T, sarcomere length, total and soluble collagen content, maximum temperature of proteins denaturation, and aggregation of muscle fibers during cooking were also evaluated. The degradation of desmin and troponin T was higher in the normal pHu, appearing degradation products at day 7. There were no differences in the sarcomere length values, discarding the contribution of this parameter on the maximum temperature of proteins denaturation (Tmax) determined by differential scanning calorimeter (DSC). Similarly, no differences were found for total and soluble collagen contents, and the total collagen values were low, suggesting that its contribution in the second thermal transition and in the shear force values was minimal. The Tmax1 and Tmax2, corresponding to the denaturation of light and heavy meromyosin, respectively, were lower in the normal pHu group, but the effect was higher for Tmax2. The Tmax3 of actin and titin increased up to 14 days post mortem in the normal pHu group, which subsequently significantly decreased after 21 days, suggesting the possible degradation of these proteins in that period of time. No differences were found in the Tmax values for the abnormal pHu group at all days post mortem, suggesting the contribution of a possible protective mechanism that stabilizes the myofibrils during heating. There was higher aggregation of muscle fibers in the normal pHu, at internal temperatures of cooking of 65 and 80°C, probably due to a higher thermal denaturation of myofibrils. The shear force values were higher with the increase of the internal temperature of cooking due to the increased denaturation of the muscle myofibrils. Regardless of internal temperature of cooking, the shear force values were higher in almost all days post mortem for both pHu groups, which suggest the need of physical or chemical methods to increase the tenderness of Longissimus lumborum muscle of Zebu bulls.

Beef quality in Brazil is important for both consumers and the food industry due to high demand and competitiveness in the domestic and international markets. Therefore, it is necessary to develop research to improve beef quality of Nellore cattle (Bos indicus), mainly tenderness, one of the main features to add value to meat. New-generation technologies provide accurate, rapid and inexpensive information on the entire genome, showing great advantage over conventional methods for sequencing and gene expression. However, these new technologies generate large database, which require the use of bioinformatics tools for data analyses of sequencing and for a better understanding of biological regulation mechanisms , cellular control, gene interactions, among other applications. In a previous study, samples were collected from the Longissimus dorsi muscle of 790 animals from Nellore cattle and shear force assessments were made 24 hours after slaughter, with seven and 14 days of aging. Aiming to identify differentially expressed (DE) genes, 34 samples from Nellore animals with extreme levels of estimated breeding value (EBV) for shear force (SF) were selected, sequenced by the method of RNA sequencing (RNA-Seq) (Illumina HiScanSQ). This study performed the processing of data generated by RNA-Seq using software QuasiSeq and Cuffdiff. In the QuasiSeq analysis, 22 DE genes were found, while in the Cuffdiff analysis, 113 DE genes were found. To better understand the biological process involved in meat tenderness, integrative analysis identified possible regulators that can explain the activity of transcriptional regulation in this process using partial correlation coefficient with information theory (PCIT), phenotypic impact factor (PIF) and regulatory impact factor (RIF) methods. The genes found in the PCIT analysis USP2, GBR10, ANO1 and TMBIM4; microRNAs found in RIF analysis bta-mir-133a-2 and bta-mir-22, and the genes with high PIF value MB, ENO3, CA3 could be fundamental to unravel the complex molecular mechanisms that control the meat tenderness in Nellore cattle. / A qualidade da carne bovina no Brasil é importante tanto para o consumidor, como para a indústria alimentícia devido à alta competitividade e exigência do mercado nacional e internacional. Portanto, é necessário o desenvolvimento de pesquisas para melhorar a qualidade da carne bovina da raça Nelore (Bos indicus), principalmente a maciez, que é considerada uma das principais responsáveis por agregar valor à carne. Tecnologias de nova geração proporcionam informações precisas, rápidas e baratas de todo genoma, mostrando grande vantagem em relação aos métodos convencionais de sequenciamento e de estudos de expressão gênica. Essas novas tecnologias geram um grande volume de dados, sendo necessário o uso de ferramentas de bioinformática para realizar as análises de sequenciamento e ter uma maior compreensão de mecanismos biológicos de regulação, controle celular, interações gênicas, entre outras aplicações. Em um estudo prévio, foram coletadas amostras do músculo Longissimus dorsi de 790 animais da raça Nelore e foram realizadas avaliações da força de cisalhamento 24 horas após abate, e com sete e 14 dias de maturação. Com o objetivo de identificar genes diferencialmente expressos (DE), foram selecionadas no total 34 amostras de animais da raça Nelore com valores extremos de valor genético estimado (EBV) para força de cisalhamento (SF), e sequenciados pelo método de sequenciamento de RNA (RNA-Seq) (Illumina HiScanSQ). Neste estudo foi realizado o processamento dos dados gerados pelo RNA-Seq através dos softwares QuasiSeq e Cuffdiff. Foram encontrados 22 genes DE para as análises do QuasiSeq e 113 genes DE para as análises do Cuffdiff. Para melhor compreensão dos processos biológicos envolvidos na maciez da carne, análises integrativas identificaram possíveis reguladores que podem explicar a atividade de regulação transcricional neste processo utilizando os métodos do Coeficiente de Correlação Parcial com Teoria da Informação (PCIT), Fator de Impacto Fenotípico (PIF) e Fator de Impacto Regulatório (RIF). Os genes encontrados nas análises análises do PCIT USP2, GBR10, ANO1 e TMBIM4, assim como os microRNAs encontrados nas análises do RIF, bta-mir-133a-2 e bta-mir-22 e os genes de maior valor de PIF MB, ENO3, CA3 podem ser fundamentais para desvendar os complexos mecanismos moleculares que controlam a maciez da carne na raça Nelore.

Amaciamento natural devido proteólise miofibrilar pelas enzimas calpaínas (cálcio-dependentes) e descoloração devido oxidação do pigmento mioglobina podem ocorrer em carne maturada. Em bovinos, o tipo biológico Bos indicus apresenta maior atividade de calpastatina (CAST, inibidora das calpaínas) no músculo e concentração de melanina (modulador de vitamina D3) na pele do que Bos taurus. Maior concentração de melanina na pele reduz fotossíntese de vitamina D3 e, subsequentemente, poderia reduzir as concentrações de seus metabólitos 25-hidróxivitamina D3 (25-D) e 1,25-di-hidróxi-vitamina D3 (1,25-D; modulador de cálcio) no plasma de Bos indicus. Nos casos de maiores concentrações de 1,25-D plasmático, uma melhor absorção de cálcio da dieta com aumento de suas concentrações no plasma e músculo poderia resultar em atividade melhorada das calpaínas. Além disso, maiores concentrações de 1,25-D plasmático poderiam colaborar para minimizar oxidação de carne devido sua propriedade antioxidante. Então, além da maior atividade de CAST no músculo, os Bos indicus poderiam ter mais duas desvantagens para produzir carne mais macia e menos oxidada: concentrações maiores de melanina na pele e menores de 1,25-D no plasma. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi estudar as relações entre as concentrações de melanina total (MELT) e suas frações [faeumelanina (FAE) e eumelanina (EUM)] na pele, metabólitos da vitamina D3 (25-D e 1,25-D) no plasma, cálcio plasmático e muscular e maciez [Índice de Fragmentação Miofibrilar (MFI) e força de cisalhamento (FC)] e cor (valores de L*, a* e b*) em carne maturada (1, 7 e 14 dias) e suas associações com polimorfismos de um único nucleotídeo (SNPs) nos genes candidatos receptor da melanocortina-1 [MC1R; rs109688013 (C/T) e rs110710422 (G/-)], proteína ligante à vitamina D3 [DBP; rs136359868 (T/C) e rs135330728 (T/C)] e CAST [rs109384915 (T/C)]. Bovinos Nelore (n=86), abatidos com 516 ± 39 kg aos 24 ± 1 meses, foram usados para determinação dos genótipos e mensuração das características. Na pele, a fração EUM foi positivamente correlacionada com MELT, mais do que a fração FAE. As frações de melanina na pele foram correlacionadas negativamente. A fração FAE foi correlacionada negativamente com 1,25-D plasmático, mas não foi correlacionada com 25-D plasmático. Melanina e suas frações na pele e metabólitos da vitamina D3 no plasma não foram correlacionadas com cálcio plasmático e muscular. Todavia, cálcio no plasma e músculo foram correlacionados positivamente com MFI e valores de L* e b* e negativamente com FC e valores de a*. A EUM e MELT na pele foram correlacionadas negativamente com FC e valores de a* e b* e positivamente com valores de L*, enquanto que 25-D no plasma foi correlacionada positivamente com MFI e valores de a* e b* e negativamente com valores de L*. A FAE foi correlacionada positivamente com MFI e negativamente com os valores de L*, a* e b*. No gene MC1R, o alelo T do SNP rs109688013 apresentou-se fixado (100%) na população, enquanto que o alelo G e sua deleção (-) do SNP rs110710422 tiveram frequência de 97,7 e 2,3%, respectivamente. SNPs do gene MC1R resultaram nos genótipos do loco Extension (E/E = T/T + G/G e E/e = T/T + G/-), que foi associado com 1,25-D plasmático e valores de b* no dia 1. No gene DBP, o alelo C do SNP rs136359868 foi menos frequente (3,5%) do que o alelo T, enquanto que os alelos C e T do SNP rs135330728 tiveram uma frequência de 73,8 e 26,2%, respectivamente. SNPs do gene DBP foram associados com MELT na pele e valores de L* e a* em diferentes dias. No gene CAST, os alelos C e T do SNP rs109384915 tiveram a mesma frequência. O SNP rs109384915 foi associado com MFI ao dia 7 e a substituição do alelo T por C reduziu os valores de MFI e a* no dia 7 e os valores de b* no dia 1. Ao final, maiores concentrações de FAE na pele e 25-D no plasma melhoraram proteólise miofibrilar e cor de carne, enquanto as maiores concentrações de EUM e MELT na pele resultaram em uma carne mais macia com uma pior cor. Associações do loco Extension e dos SNPs no gene DBP com cor de carne parecem consequência das diferenças em 1,25-D no plasma e melanina na pele. SNP do CAST associou-se com proteólise miofibrilar e cor de carne maturada, mas não com FC. / Natural tenderization by myofibrillar proteolysis through the calpains enzymes (calcium-dependent) and discoloration by oxidation of myoglobin pigment may occur in aged meat. In cattle, the Bos indicus biological type has higher calpastatin activity (CAST, inhibitor of calpains) in muscle and melanin concentration (modulator of vitam in D3) in skin than Bos taurus. Higher melanin concentration in skin reduces photosynthesis of vitamin D3 and, subsequently, could reduce the concentrations of its metabolites 25-hydroxy-vitamin D3 (25-D) and 1,25-di-hydroxy-vitamin D3 (1,25-D; modulator of calcium) in plasma from Bos indicus cattle. In cases of higher plasma 1,25-D concentrations, an improved absorption of calcium from the diet followed by increased plasma calcium concentrations could result in enhanced activity of calpains. Furthermore, higher plasma 1,25-D concentrations could collaborate to minimize meat oxidation due to its antioxidant propriety. Then, in addition to higher CAST activity in muscle, the Bos indicus cattle could have two more disadvantages to produce tender and less oxidized meat: higher melanin concentrations in skin and lower 1,25-D concentrations in plasma. Hence, the objective of this work was to study the relationships between the concentrations of total melanin (MELT) and its fractions [pheomelanin (PHEO) and eumelanin (EUM)] in skin, vitamin D3 metabolites (25-D and 1,25-D) in plasma, plasma and muscle calcium, and tenderness [Myofibrillar Fragmentation Index (MFI) and shear force (SF)] and color (L*, a*, and b* values) in aged meat (1, 7, and 14 days) and their associations with single nucleotide polymorphisms (SNPs) in candidate genes as melanocortin-1 receptor [MC1R; rs109688013 (C/T) and rs110710422 (G/-)], vitamin D3-binding protein [DBP; rs136359868 (T/C) and rs135330728 (T/C)], and CAST [rs109384915 (T/C)]. Nellore cattle (n=86), slaughtered with 516 ± 39 kg at 24 ± 1 months, were used for genotyping and traits measurements. In skin, the EUM fraction was positively correlated with MELT than the PHEO fraction. The melanin fractions in skin were negatively correla ted. The PHEO fraction was negatively correlated with plasma 1,25-D, but not with plasma 25-D. Melanin and its fractions in skin and vitamin D3 metabolites in plasma were not correlated with plasma and muscle calcium. Nevertheless, plasma and muscle calcium were positively correlated with MFI, and L* and b* values and negatively correlated with SF and a* values. The EUM and MELT in skin were negatively correlated with SF, and a* and b* values and positively correlated with L* values, while 25-D in plasma was positively correlated with MFI, and a* and b* values and negatively correlated with L* values. The PHEO was positively correlated with MFI and negatively correlated with L*, a*, and b* values. In MC1R gene, the rs109688013 SNP allele T was fixed (100%) in the population, while the rs110710422 SNP allele G and its deletion (-) had a frequency of 97.7 and 2.3%, respectively. MC1R SNPs resulted in genotypes of the Extension locus (E/E = T/T + G/G and E/e = T/T + G/-), which was associated with plasma 1,25-D and b* values at the day 1. In DBP gene, the rs136359868 SNP allele C was less frequent (3.5%) than allele T, while rs135330728 SNP alleles C and T had a frequency of 73.8 and 26.2%, respectively. DBP SNPs were associated with MELT in skin, and L* and a* values at different days. In CAST gene, the rs109384915 SNP alleles C and T had a similar frequency. The rs109384915 SNP was associated with MFI at the day 7 and the substitution from allele T to C reduced the MFI and a* values at the day 7 and the b* values at the day 1. At last, higher skin PHEO and plasma 25-D concentrations improved the myofibrillar proteolysis and meat color, while higher skin EUM and MELT concentrations resulted in a meat with improved tenderness and worsened color. Associations of the Extension locus and polymorphisms in DBP gene with the meat color seem to be a consequence of the differences in plasma 1,25-D and skin melanin. CAST SNP is associated with myofibrillar proteolysis and meat color, but not with SF.

Made available in DSpace on 2016-08-15T20:31:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AnaPPA_DISSERT.pdf: 877034 bytes, checksum: 4037d6f20248b460d51697c6abd68a4c (MD5) Previous issue date: 2014-02-27 / The objective of thisstudywastoevaluatethephysico- chemical parameters of meat quality of goats feddifferentliquid diets until 60 days of life , in additiontoperformingmicrobiological and sensoryanalysis of meat of theseanimals . 24 male goats , SPRD , distributed in a completelyrandomized design withthreetreatments and eightreplicateswereused : goat milk ( control ) ; Bovinemilk ; 50 % bovinemilk + 50 % Serumcheese. The animalswereslaughtered at 60 days . PH measurements at roomtemperature and after 24 hours of slaughter (- 30 minutes and pH24h - pH0 24 hours) weretaken color parameters ( L *, a *, b *) , waterretentioncapacitywerestudied (CRA ) , weightlossduringcooking ( PPC ) , shear force ( FC ) , wateractivity ( Aw ) , themoisture , protein, lipid and ashwereobtained . Sensory quality wasevaluatedbyapplying a test of acceptance and purchaseintent , and for microbiologicalanalysis , samplesweresubjectedtothedetermination of thermotolerantcoliforms , Salmonella spp . and Staphylococcus Coagulase Positive . The muscle used for theanalysiswasthe ribeye . Data wereanalyzedby General Linears Models procedure ( GLM ) of thestatisticalpackage SAS , and meanswerecomparedby Tukey test at 5%. The average pH of the carcass after slaughter pH0 was 6.3 and 5.5 pH24h . Therewas no significantdifferencebetweenthetemperatures of hot carcass and cold carcass , meat of animalsfedthedifferent diets . The sampleshadlowervalues for L * (brightness) and upwardsonthecoordinate b * (yellow). The meat of the goat milk diet retained more water . The meat of themilk + whey diet hadlessweightlossduringcooking and lowershear force . The slaughter age and thedifferentliquid diets interferedsignificantly ( P < 0.05 ) in moisture, protein and lipids . Microbiologicalanalysisshowedthatthesamplesmetthemicrobiological standards for fresh beef . Sensoryanalysisshowedthat meat from the goats gotanappropriateacceptance rate , correspondingtothethird and fourthlevels of thehedonicscale ( moderatelyliked and likedslightly ) . The characteristicsthatmostinfluencedtheacceptance of theproductwerethe color ( 7.58 ) , followedbytenderness ( 7.30) . The age of slaughter of animals at 60 dayscanbeusedtoproducebetter quality meat , significantlyimprovingthephysicalattributes - chemical , microbiological and sensory meat / Objetivou-se com o presente trabalho avaliar os parâmetros físico-químicos de qualidade da carne de cabritos recebendo diferentes dietas líquidas até os 60 dias de vida, além da realização da análise microbiológica e sensorial da carne destes animais. Foram utilizados 24 cabritos machos, SPRD, distribuídos em delineamento inteiramente casualizado com três tratamentos e oito repetições: Leite caprino (Controle); Leite bovino; 50% Leite bovino + 50% de Soro de queijo. Os animais foram abatidos aos 60 dias. Foram tomadas as medidas de pH e temperatura ao abate e após 24 horas (pH0 30 minutos e pH24h 24 horas), foram estudados os parâmetros de cor (L*,a*,b*), capacidade de retenção de agua (CRA), perda de peso na cocção (PPC), força de cisalhamento (FC), atividade de água (Aw), foram obtidos os teores de umidade, proteínas, lipídeos e cinzas. Foi avaliada a qualidade sensorial, aplicando um teste de aceitação e de intenção de compra, e para análise microbiológica, as amostras foram submetidas à determinação de Coliformes Termotolerantes, pesquisa de Salmonella spp. e Staphylococcus Coagulase Positivo. O músculo utilizado para as análisefoi o Longissimus dorsi. Os dados foram analisados pelo procedimento General Linears Models (GLM) do pacote estatístico do SAS, e as médias comparadas pelo teste de Tukey 5%. O pH médio da carcaça pH0 pós-abate foi de 6,3 e o pH24h de 5,5. Não houve diferença significativa entre as temperaturas de carcaça quente e da carcaça fria, na carne dos animais recebendo as diferentes dietas. As amostras apresentaram valores inferiores para L* (luminosidade) e superiores para a coordenada b* (amarelo). A carne dos animais da dieta leite caprino reteve maior quantidade de água. A carne dos animais da dieta leite + soro apresentaram menor perda de peso na cocção e menor força de cisalhamento. A idade de abate e as diferentes dietas líquidas interferiram significativamente (P<0,05), nos teores de umidade, proteína e lipídeos.As análises microbiológicas demonstraram que as amostras atenderam aos padrões microbiológicos para carne in natura. A análise sensorial evidenciou que a carne dos cabritos obteve um adequado índice de aceitação, correspondendo ao terceiro e quarto níveis da escala hedônica (gostei moderadamente e gostei ligeiramente). As características que mais influenciaram a aceitação do produto foram a cor (7,58), seguida da maciez (7,30). A idade de abate aos 60 dias de animais poderá ser utilizada para a produção de carne de melhor qualidade, melhorando significativamente os atributos físico químicos, microbiológicos e sensoriais da carne

Submitted by Socorro Pontes (socorrop@ufersa.edu.br) on 2017-05-24T12:52:15Z No. of bitstreams: 1 DeboraCFS_DISSERT.pdf: 959405 bytes, checksum: d84cdb5dd73a237b1df97ec439e0072c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-24T12:52:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DeboraCFS_DISSERT.pdf: 959405 bytes, checksum: d84cdb5dd73a237b1df97ec439e0072c (MD5) Previous issue date: 2017-05-23 / The aim of this study was to make a comparison of physicochemical, microbiological and sensory properties of meat of free-range and industrial chicken strains from local trade. Analyses of chemical composition, color, pH, shear force and sensory analysis were made. The chromaticity revealed higher intensity of yellow for free-range broiler chicken meat (b = 11.56), finding a lower pH, a negative correlation with luminosity, and the meat more tenderness with average value of 2.95 kgf /cm2 (P <0.05), associated with muscle stiffness or change in texture compared to industrial chicken meat, which may be indicative of pre-slaughter stress, an effect of physical activity of the semi-confined breeding, beyond genetic differences between muscle energy metabolism in chickens. Statistical differences were observed in relation to the protein of the thigh (15.7% and 18%), lipids for thigh (3.4% and 2.2%) and thigh (5.0% and 3.0%) for industrial and rustic free range chickens, respectively, possibly due to genetic and nutritional characteristics of the rearing system. Microbiological analysis showed satisfactory standard for fecal coliforms in all samples, according to Brazilian legislation, with average values of 2.45 log NMPg-1 for industrial and 2.75 log NMPg-1 for free-range chickens. Analysis of Salmonella spp. was more prevalent in free-range carcass (50%) compared to the industrial (25%), possibly due to handling and hygiene pre-slaughter. Thus, all the sensory attributes (odor, flavor, texture, juiciness and overall impression) were evaluated by the judges as slightly worse for freerange samples / O objetivo desse trabalho foi fazer uma avaliação comparativa das características físico-químicas, microbiológicas e sensoriais de carnes de frango oriundos de sistemas caipira e industrial adquiridas no comércio. Foram realizadas análises de composição química, cor, pH, força de cisalhamento e análise sensorial. A cromaticidade revelou maior intensidade de amarelo para a carne de frango tipo caipira (b=11,56), constatando-se menor pH, correlação negativa com a luminosidade, apresentando essa carne menor maciez com valor médio de 2,95kgf/cm2 (p<0,05), associado ao enrijecimento muscular ou alteração na textura em relação a carne de frango tipo industrial, o que pode ser indicativo de estresse préabate, um efeito da atividade física da criação semi-confinada (ou caipira), além das diferenças genéticas entre o metabolismo energético muscular das aves. Diferenças estatísticas foram observadas em relação ao teor de proteína para coxa (15,7% e 18%), lipídeos para coxa (3,4% e 2,2%) e sobrecoxa (5,0% e 3,0%) para os frangos industrial e caipira, respectivamente, possivelmente devido à características genéticas e nutricionais do sistema de criação. A análise microbiológica mostrou padrão satisfatório para Coliformes fecais para todas as amostras, segundo a legislação brasileira vigente, com valores médios de 2,45 log NMPg-1 para industrial e 2,75 log NMPg-1 para frango caipira . A análise de Salmonella spp. foi prevalente nas carcaças caipiras (50%) comparado às industriais (25%), possivelmente devido à manipulação e higienização pré-abate. Desta maneira, todos os atributos sensoriais (odor, sabor, textura, suculência e impressão geral) foram avaliadas pelos provadores como ligeiramente piores para as amostras de frangos tipo caipira e industrial / 2017-05-23

Orientador: Paulo Roberto Rodrigues Ramos / Banca: Cledson Augusto Garcia / Banca: Cíntia Ludovico Martins / Banca: Luiz Artur Loyola Chardulo / Banca: Roberto de Oliveira Roça / Resumo: O trabalho objetivou identificar por eletroforese as mudanças nas frações das proteínas musculares, separadas no período post-mortem de bovinos de quatro diferentes grupos genéticos (Nelore, TRC-Brahman, Brangus e TRC-Pardo), submetidos ao modelo biológico superprecoce, assim como determinar os valores da força de cisalhamento destas amostras. Foram utilizadas 12 amostras do músculo Longissimus dorsi por grupo genético. De cada uma delas foram retiradas duas fatias, uma foi refrigerada por 24 horas e a outra foi maturada por 7 dias a 2oC. As amostras submetidas a 7 dias de maturação não diferiram quanto à maciez da carne nos grupos genéticos, mas todas apresentaram maciez aceitável, o que pode ser explicado pela baixa idade ao abate destes animais. Na análise das bandas da eletroforese, notou-se degradação da miosina (MHC) e da Troponina-T (TN-T) e o aparecimento do fragmento de 30 kDa para todos os grupos genéticos durante o período de 7 dias de maturação. / Abstract: This study aimed to identify by means of eletrophoresis the changes in fractions of the muscular proteins, separated within the post-mortem period from cattle from four different genetic groups ( Nelore, TRC- Brahman, Brangus and TRC- Pardo), submitted to the superprecoce biologic model, as well as to determine the values of those samples shear force. Twelve samples of the muscle Longissimus dorsi were used for each genetic group. From each of those there were taken two slices, one of them was kept cold along 24 hours and the other one was aged during 7 days at 2oC. The samples that came through a seven-day-aging process didn't show any changes concerning the meat tenderness in the genetic groups, even though all of them had acceptable tenderness, which can be explained due to the low age of these animals when slaughtered. In the analysis of the eletrophoresis' bands, it was noticed some degradation of the myosin ( MHC) and of the Troponin-T (TN-T) and the presence of the fragment of 30 kDa for all the genetic groups during the seven-day-ageing period. / Doutor

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:07:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Final_Leticia de Castro.pdf: 529055 bytes, checksum: b285c0565af0c730f3734a65427c2422 (MD5) Previous issue date: 2012-03-01 / One of the features that detract Brazilian s beef quality is the lack of tenderness, and that happens because most of their meat comes from Bos indicus animals, known to be less tender than Bos taurus beef. This study was carried out to identify individuals which have higher probabilities to carry meat tenderness genes, as well as mating the progenitors to produce an experimental population to phenotype meat tenderness. The purpose of this study was to analyze the interrelationships among the variables and also to estimate the genetic correlations between meat tenderness feature (WBSF), and growth (PI, PF and GPD) and carcass (EG, P8 and AOL) features. The data were from Guaporé Agropecuária s OB Choice Program. Factor analysis and canonical correlations were used to analyze the phenotypic relationships. The covariance components and genetic parameters were estimated using Gibbs Sampling method. The heritability estimated for shear force trait was of a low magnitude (0.11). Thus, based on the principle of identical genes probability by ancestry to identify individuals which have higher probabilities to carry meat tenderness genes, two segregating populations were formed. A lack of phenotypical correlations between the WBSF trait and the other measured productive traits was also observed. The genetic correlations between WBSF and the other evaluated traits were of a low magnitude, with values of -0.15; -0.18; -0.13; 0.10; -0.12 and 0.18, between WBSF and PI, PF, GPD, EG, P8 and AOL, respectively. The results of this study support the conclusion that tenderness selection will not affect the selection of other economic traits and vice-versa. For a better knowledge of the genetic relationships between WBSF and other traits for Polled Nellore breed more studies are required. / O Brasil se apresenta como o maior exportador em volume de carne e não em valores financeiros, onde se destacam outros países, como EUA, Austrália e Argentina. Uma das características que depreciam a qualidade da carne bovina brasileira é a falta de maciez, isso porque a grande maioria dessa carne vem de animais com maior proporção genética zebuína, sabidamente menos macia do que as raças de corte taurinas. Objetivou-se com este estudo, identificar indivíduos que apresentem alta probabilidade de serem portadores de genes favoráveis à maciez, bem como acasalar os progenitores e produzir animais experimentais para fenotipagem de maciez da carne. Foi proposto também, analisar os inter-relacionamentos entre as variáveis, além de estimar as correlações genéticas entre as características de maciez (WBSF), crescimento (PI, PF e GPD) e carcaça (EG, P8 e AOL) dos animais avaliados. Foram utilizados dados do Programa OB Choice da Guaporé Agropecuária. Para análises de relacionamentos fenotípicos foram utilizadas análises de fatores e correlações canônicas. Os componentes de variância necessários à obtenção dos parâmetros genéticos foram estimados pelo método da Amostragem de Gibbs. A estimativa de herdabilidade para a característica de força de cisalhamento foi de baixa magnitude (0,11). Para identificar aqueles com alta probabilidade de carregar genes favoráveis à maciez, e, por meio de técnicas de acasalamento otimizado, formar as duas populações segregantes, baseou-se no princípio da probabilidade de genes idênticos por descendência. Observou-se ausência de correlações fenotípicas entre WBSF e as outras características produtivas avaliadas. As correlações genéticas entre WBSF e as outras características foram de baixa magnitude, com valores de -0,15; -0,18; -0,13; 0,10; -0,12 e 0,18, entre WBSF e PI, PF, GPD, EG, P8 e AOL, respectivamente. Os resultados desse estudo sugerem que, a seleção para a maciez não influenciará na seleção de outras características de interesse econômico e vice-versa. São necessários mais estudos para um melhor conhecimento sobre as relações genéticas de WBSF e outras características produtivas em bovinos da raça Nelore Mocho.

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2015-02-03T09:48:47Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maria Izabel Amaral Souza - 2014.pdf: 2005376 bytes, checksum: 3bfdb741e6e197bd29313dcc4bfee4e9 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-02-05T13:27:25Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maria Izabel Amaral Souza - 2014.pdf: 2005376 bytes, checksum: 3bfdb741e6e197bd29313dcc4bfee4e9 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-05T13:27:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maria Izabel Amaral Souza - 2014.pdf: 2005376 bytes, checksum: 3bfdb741e6e197bd29313dcc4bfee4e9 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Due to the need for alternative sources of food for cattle nutrition, research on agribusiness by-products has been carried out, such as the use of babassu mesocarp bran ( MB ) in the ruminants diet. In this experiment, we analyzed 30 Longissimus dorsi samples obtained from animals that received babassu meal replacing pearl millet grain, in six different treatments: ( T1 ) 100% pearl millet ; ( T2 ) 88% pearl millet + 12% MB; ( T3 ) 76% pearl millet + 24% MB, ( T4 ) 64% pearl millet + 36% MB, ( T5 ) 52% pearl millet and 48% MB, and ( T6 ) 100% corn. Several physico-chemical analyzes were performed to identify possible factors affecting the tenderness of the meat. We use flame atomic absorption spectrophotometry, to quantify the minerals: copper, iron, calcium, magnesium, manganese, zinc, sodium and potassium from babassu mesocarp bran, pearl millet and Longissimus dorsi samples. In babassu mesocarp bran the minerals that presented the greatest levels were K ( 590.49 mg/100 g ), followed by Ca, Fe, and Mg, in pearl millet K ( 484.86 mg/100 g ) followed by Mg and Capresented the highest level, whithout showing concentrations of Fe, in meat samples Mn was not found with the methodology used, and the minerals with the highest concentrations were K, (with difference between the standard treatment and the one with greater MB inclusion), followed by Na and Mg. The average shear force was 5.74 kgf. The water holding capacity was determined by thawing weight loss ( 13%), cooking weight loss (14.16%) and pressure weight loss (26.3%) . Regarding the myofibrillar fragmentation index (MFI) there was difference between the standard treatment and the one with greater MB inclusion, demonstrating that the MB can reduce the MFI. As for total collagen, the value found was 3.06% and soluble collagen was of 7.5% ( relative to total collagen content). The MB is an interesting alternative source for ruminants' feed and, taking MFI into consideration, the concentrations lower than 48% MB would be ideal, MB inclusion also favours potassium concentration. / Confrontados com a necessidade de fontes alternativas de alimentos na nutrição de bovinos, muitas pesquisas tem sido realizadas com subprodutos das agroindústrias, assim o uso do farelo de mesocarpo de babaçu (FB) tem sido objeto de estudo na dieta de ruminantes. Neste experimento foram analisadas 30 amostras de Longissimus dorsi, de animais que receberam a inclusão de farelo de babaçu em substituição ao grão de milheto, obedecendo seis tratamentos: (T1) 100% milheto; (T2) 88% milheto + 12% FB; (T3) 76% milheto + 24% FB, (T4) 64% milheto + 36% FB, (T5) 52% milheto e 48%FB e (T6) 100% milho. Várias análises físico-químicas foram realizadas para identificar os possíveis fatores que interferem na maciez da carne. A partir das amostras de farelo de mesocarpo de babaçu, milheto e de Longissimus dorsi, por espectrofotometria de absorção atômica em chama, puderam-se quantificar os minerais: cobre, ferro, cálcio, magnésio, manganês, zinco, sódio e potássio. No farelo de mesocarpo de babaçu o mineral encontrado em maior quantidade foi o K (590,49 mg/100g), seguido por Ca, Fe e Mg, no milheto a maior quantidade também foi de K (484,86 mg/100g), seguida de Mg e Ca, não apresentando concentrações de Fe. Nas amostras de carne não foi encontrada concentrações de Mn com a metodologia utilizada, o mineral com maior concentração foi o K, (foi encontrada diferença entre o tratamento padrão e o tratamento de maior inclusão de FB), seguido de Na e Mg. Para força de cisalhamento a média encontrada foi de 5,74 kgf. A capacidade de retenção de água foi determinada através das análises por perdas de peso no descongelamento (13%), perdas de peso na cocção (14,16%) e perdas de peso por pressão (26,3%). Para análise de índice de fragmentação miofibrilar (IFM) houve diferença entre o tratamento padrão e a maior inclusão de FB, demonstrando que o FB pode diminuir o IFM, consequentemente a maciez. Na análise de colágeno total o valor encontrado foi de 3,06% e para colágeno solúvel de 7,5% (em relação ao conteúdo de colágeno total). O farelo de mesocarpo de babaçu é uma fonte de alimentos alternativa interessante para os ruminantes, levando em consideração o IFM valores menores de 48% de inclusão seria ideal, a inclusão de FB favorece a concentração de potássio.

Amaciamento natural devido proteólise miofibrilar pelas enzimas calpaínas (cálcio-dependentes) e descoloração devido oxidação do pigmento mioglobina podem ocorrer em carne maturada. Em bovinos, o tipo biológico Bos indicus apresenta maior atividade de calpastatina (CAST, inibidora das calpaínas) no músculo e concentração de melanina (modulador de vitamina D3) na pele do que Bos taurus. Maior concentração de melanina na pele reduz fotossíntese de vitamina D3 e, subsequentemente, poderia reduzir as concentrações de seus metabólitos 25-hidróxivitamina D3 (25-D) e 1,25-di-hidróxi-vitamina D3 (1,25-D; modulador de cálcio) no plasma de Bos indicus. Nos casos de maiores concentrações de 1,25-D plasmático, uma melhor absorção de cálcio da dieta com aumento de suas concentrações no plasma e músculo poderia resultar em atividade melhorada das calpaínas. Além disso, maiores concentrações de 1,25-D plasmático poderiam colaborar para minimizar oxidação de carne devido sua propriedade antioxidante. Então, além da maior atividade de CAST no músculo, os Bos indicus poderiam ter mais duas desvantagens para produzir carne mais macia e menos oxidada: concentrações maiores de melanina na pele e menores de 1,25-D no plasma. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi estudar as relações entre as concentrações de melanina total (MELT) e suas frações [faeumelanina (FAE) e eumelanina (EUM)] na pele, metabólitos da vitamina D3 (25-D e 1,25-D) no plasma, cálcio plasmático e muscular e maciez [Índice de Fragmentação Miofibrilar (MFI) e força de cisalhamento (FC)] e cor (valores de L*, a* e b*) em carne maturada (1, 7 e 14 dias) e suas associações com polimorfismos de um único nucleotídeo (SNPs) nos genes candidatos receptor da melanocortina-1 [MC1R; rs109688013 (C/T) e rs110710422 (G/-)], proteína ligante à vitamina D3 [DBP; rs136359868 (T/C) e rs135330728 (T/C)] e CAST [rs109384915 (T/C)]. Bovinos Nelore (n=86), abatidos com 516 ± 39 kg aos 24 ± 1 meses, foram usados para determinação dos genótipos e mensuração das características. Na pele, a fração EUM foi positivamente correlacionada com MELT, mais do que a fração FAE. As frações de melanina na pele foram correlacionadas negativamente. A fração FAE foi correlacionada negativamente com 1,25-D plasmático, mas não foi correlacionada com 25-D plasmático. Melanina e suas frações na pele e metabólitos da vitamina D3 no plasma não foram correlacionadas com cálcio plasmático e muscular. Todavia, cálcio no plasma e músculo foram correlacionados positivamente com MFI e valores de L* e b* e negativamente com FC e valores de a*. A EUM e MELT na pele foram correlacionadas negativamente com FC e valores de a* e b* e positivamente com valores de L*, enquanto que 25-D no plasma foi correlacionada positivamente com MFI e valores de a* e b* e negativamente com valores de L*. A FAE foi correlacionada positivamente com MFI e negativamente com os valores de L*, a* e b*. No gene MC1R, o alelo T do SNP rs109688013 apresentou-se fixado (100%) na população, enquanto que o alelo G e sua deleção (-) do SNP rs110710422 tiveram frequência de 97,7 e 2,3%, respectivamente. SNPs do gene MC1R resultaram nos genótipos do loco Extension (E/E = T/T + G/G e E/e = T/T + G/-), que foi associado com 1,25-D plasmático e valores de b* no dia 1. No gene DBP, o alelo C do SNP rs136359868 foi menos frequente (3,5%) do que o alelo T, enquanto que os alelos C e T do SNP rs135330728 tiveram uma frequência de 73,8 e 26,2%, respectivamente. SNPs do gene DBP foram associados com MELT na pele e valores de L* e a* em diferentes dias. No gene CAST, os alelos C e T do SNP rs109384915 tiveram a mesma frequência. O SNP rs109384915 foi associado com MFI ao dia 7 e a substituição do alelo T por C reduziu os valores de MFI e a* no dia 7 e os valores de b* no dia 1. Ao final, maiores concentrações de FAE na pele e 25-D no plasma melhoraram proteólise miofibrilar e cor de carne, enquanto as maiores concentrações de EUM e MELT na pele resultaram em uma carne mais macia com uma pior cor. Associações do loco Extension e dos SNPs no gene DBP com cor de carne parecem consequência das diferenças em 1,25-D no plasma e melanina na pele. SNP do CAST associou-se com proteólise miofibrilar e cor de carne maturada, mas não com FC. / Natural tenderization by myofibrillar proteolysis through the calpains enzymes (calcium-dependent) and discoloration by oxidation of myoglobin pigment may occur in aged meat. In cattle, the Bos indicus biological type has higher calpastatin activity (CAST, inhibitor of calpains) in muscle and melanin concentration (modulator of vitam in D3) in skin than Bos taurus. Higher melanin concentration in skin reduces photosynthesis of vitamin D3 and, subsequently, could reduce the concentrations of its metabolites 25-hydroxy-vitamin D3 (25-D) and 1,25-di-hydroxy-vitamin D3 (1,25-D; modulator of calcium) in plasma from Bos indicus cattle. In cases of higher plasma 1,25-D concentrations, an improved absorption of calcium from the diet followed by increased plasma calcium concentrations could result in enhanced activity of calpains. Furthermore, higher plasma 1,25-D concentrations could collaborate to minimize meat oxidation due to its antioxidant propriety. Then, in addition to higher CAST activity in muscle, the Bos indicus cattle could have two more disadvantages to produce tender and less oxidized meat: higher melanin concentrations in skin and lower 1,25-D concentrations in plasma. Hence, the objective of this work was to study the relationships between the concentrations of total melanin (MELT) and its fractions [pheomelanin (PHEO) and eumelanin (EUM)] in skin, vitamin D3 metabolites (25-D and 1,25-D) in plasma, plasma and muscle calcium, and tenderness [Myofibrillar Fragmentation Index (MFI) and shear force (SF)] and color (L*, a*, and b* values) in aged meat (1, 7, and 14 days) and their associations with single nucleotide polymorphisms (SNPs) in candidate genes as melanocortin-1 receptor [MC1R; rs109688013 (C/T) and rs110710422 (G/-)], vitamin D3-binding protein [DBP; rs136359868 (T/C) and rs135330728 (T/C)], and CAST [rs109384915 (T/C)]. Nellore cattle (n=86), slaughtered with 516 ± 39 kg at 24 ± 1 months, were used for genotyping and traits measurements. In skin, the EUM fraction was positively correlated with MELT than the PHEO fraction. The melanin fractions in skin were negatively correla ted. The PHEO fraction was negatively correlated with plasma 1,25-D, but not with plasma 25-D. Melanin and its fractions in skin and vitamin D3 metabolites in plasma were not correlated with plasma and muscle calcium. Nevertheless, plasma and muscle calcium were positively correlated with MFI, and L* and b* values and negatively correlated with SF and a* values. The EUM and MELT in skin were negatively correlated with SF, and a* and b* values and positively correlated with L* values, while 25-D in plasma was positively correlated with MFI, and a* and b* values and negatively correlated with L* values. The PHEO was positively correlated with MFI and negatively correlated with L*, a*, and b* values. In MC1R gene, the rs109688013 SNP allele T was fixed (100%) in the population, while the rs110710422 SNP allele G and its deletion (-) had a frequency of 97.7 and 2.3%, respectively. MC1R SNPs resulted in genotypes of the Extension locus (E/E = T/T + G/G and E/e = T/T + G/-), which was associated with plasma 1,25-D and b* values at the day 1. In DBP gene, the rs136359868 SNP allele C was less frequent (3.5%) than allele T, while rs135330728 SNP alleles C and T had a frequency of 73.8 and 26.2%, respectively. DBP SNPs were associated with MELT in skin, and L* and a* values at different days. In CAST gene, the rs109384915 SNP alleles C and T had a similar frequency. The rs109384915 SNP was associated with MFI at the day 7 and the substitution from allele T to C reduced the MFI and a* values at the day 7 and the b* values at the day 1. At last, higher skin PHEO and plasma 25-D concentrations improved the myofibrillar proteolysis and meat color, while higher skin EUM and MELT concentrations resulted in a meat with improved tenderness and worsened color. Associations of the Extension locus and polymorphisms in DBP gene with the meat color seem to be a consequence of the differences in plasma 1,25-D and skin melanin. CAST SNP is associated with myofibrillar proteolysis and meat color, but not with SF.