Orientador: Sheila Canevese Rahal / Resumo: O trabalho teve por objetivo avaliar, em cachorros-do-mato, valores goniométricos das articulações dos membros torácicos e pélvicos, com emprego de goniômetro universal de plástico; e valores radiográficos ou tomográficos de ângulos articulares dos membros pélvicos, bem como a proporção do comprimento do ligamento patelar (L) com o comprimento da patela (P). Para tanto, foram utilizados 15 cachorros-do-mato clinicamente saudáveis, com idade acima de 1 ano. A amplitude de movimento das articulações do carpo, cotovelo e ombro para o avaliador 1 foram 138°, 108° e 118°, e das articulações do tarso, joelho e coxofemoral foram 96°, 118° e 84°. Para o Avaliador 2 a amplitude de movimento das articulações do carpo, cotovelo e ombro foram 138°, 110° e 118°, e das articulações do tarso, joelho e coxofemoral foram 94°, 114° e 88°. Não foram detectadas diferenças estatisticamente significantes entre os lados nas mensurações radiográficas. Os valores médios obtidos para os ângulos anatômicos femoral proximal lateral e distal lateral foram 95,43° e 92,75°, e para os ângulos mecânicos femoral proximal lateral e distal lateral foram 93,39° e 96,75°. Os ângulos de inclinação pelos métodos de Tomlinson, Hauptman A e Hauptman B foram 133,80°, 147,32° e 128,63°. Os ângulos de Norberg e de inclinação do platô tibial foram 107,57° e 18,77°. A proporção L:P foi de 1,99 (± 0,13). Escore da subluxação dorsolateral, Ângulo da margem do centro lateral, Ângulo da borda acetabular dorsal, Índice da dist... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of this study was to evaluate goniometric values of the forelimb and hind limb joints by means of a standard plastic goniometer, radiographic values or computed tomographic values of articular angles of the hind limbs, and ratio of patellar ligament length to patellar length (L:P) in crab-eating foxes. Fifteen clinically healthy crab-eating foxes above 1 year of age were used. The range of motion of the carpus, elbow and shoulder for evaluator 1 were 138°, 108° and 118°, and for the tarsus, stifle and hip were 96°, 118° and 84°. The range of motion of the carpus, elbow and shoulder for evaluator 2 were 138°, 110° and 118°, and for the tarsus, stifle and hip were 94°, 114° and 88°. No statistically significant differences were observed between the sides in the radiographic measurements. The anatomic lateral proximal femoral angle and anatomic lateral distal femoral angle had mean values of 95.43° and 92.75°. The mechanical lateral proximal femoral angle and mechanical lateral distal femoral angle had mean values of 93.39° and 96.75°. The angle of inclination by Tomlinson, Hauptman A and Hauptman B methods were 133.80°, 147.32°, and 128.63°. The Norberg angle and slope angle of the tibial plateau were 107.57° and 18.77°, respectively. The L:P value was 1.99 (± 0.13). The dorsolateral subluxation score, lateral center edge angle, dorsal acetabular rim angle, and center distance index measured on the CT images had mean values of were 60.79°, 98.25°, 13.47°, and 0.16. In c... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: José Maurício Barbanti Duarte / Banca: Juan Carranza Almansa / Banca: Ricardo José Garcia Pereira / Resumo: O veado-catingueiro (Mazama gouazoubira) e o veado-roxo (Mazama nemorivaga) possuem características morfológicas semelhantes e distribuição parapátrica, que colocaram em dúvida a classificação taxonômica de M. nemorivaga como espécie válida durante muitos anos. Estudos citogenéticos e morfológicos sugerem M. nemorivaga como espécie válida, porém, na maioria dos conceitos de espécie aceitos atualmente, está implícita a ideia de que duas espécies devem ser não apenas geneticamente distintas, mas reprodutivamente isoladas. Este estudo avaliou a presença de isolamento reprodutivo pós-zigótico entre M. gouazoubira e M. nemorivaga como forma de elucidar a classificação taxonômica deste último. Para tal, foram avaliadas as características seminais, histologia testicular e perfis de metabólitos fecais da testosterona de seis animais, frutos de cruzamentos intra e interespecíficos sendo três M. gouazoubira puros (PG), um M. nemorivaga puro (PN) e dois híbridos (H). Ao longo do estudo material seminal e testicular de mais dois animais puros, um M. gouazoubira e um M. nemorivaga foram acrescentados ás análises. Os resultados mostram que cinco dos seis animais puros analisados (PG1, PG2, PG4, PN1 e PN2) tiveram bom desempenho na análise reprodutiva, enquadrando-se nos parâmetros observados para suas respectivas espécies. O híbrido H1 provou-se completamente estéril enquanto que H2 apresentou severa subfertilidade, parâmetros relacionados diretamente com uma baixa secreção de testosterona e estrutura testicular hipoplásica. Acredita-se que a diferença de níveis reprodutivos entre híbridos esteja diretamente relacionada com o sexo de seus parentais. O animal PG3 apresentou péssimo potencial reprodutivo, provavelmente ligado a um defeito congênito não elucidado. Com base nos dados obtidos, é possível sugerir a existência de isolamento reprodutivo entre M. gouazoubira e M. nemorivaga, reforçando a... / Abstract: The brown brocket deer (Mazamagouazoubira) and the amazonian brown brocket deer (Mazamanemorivaga) have similar morphological features and parapatric distribution, which questioned thetaxonomic classification of M. nemorivagaas a species for many years. Cytogenetic and morphometric studies suggest M. nemorivaga as a valid species but in most species concepts currently accepted is implicit the idea that two species should not only be genetically distinct, but reproductively isolated. This study evaluated the presence of post zygotic reproductive isolation between M. gouazoubira and M. nemorivaga to elucidate the taxonomic classification of the latter. To this end, seminal characteristics, testicular histology and profiles of testosterone of six animals, intra and interespecificbreeding products were evaluated: three pure M. gouazoubira (PG), a pure M. nemorivaga (PN) and two hybrids (H). Throughout the study testicular and seminal material of two pure animals (one M. gouazoubira and one M. nemorivaga) were added in the analyzes. The results show that five of the six purebreds analyzed (PG1, PG2, PG4, PN1 and PN2) performed well in reproductive analysis, fitting the parameters observed for their respective species. The hybrid H1 was completely sterile while H2 showed severe subfertility, parameters directlyrelated with a low secretion of testosterone and testicular hypoplasia. It is believed that the difference of reproductive parameters between the hybridswas directly related to the sex of their parents. The PG3 animal showed bad reproductive potential, probably linked to a birth defect not elucidated. Based on these data it is possible to suggest the existence of reproductive isolation between M. gouazoubira and M. nemorivaga reinforcing the need for revision of these groups to define their taxonomic position / Mestre

Orientador: Noeme Sousa Rocha / Resumo: Uma das principais demandas para peritos médicos veterinários é a investigação forense dos crimes contra a fauna. No Brasil, grande parte dos crimes contra a fauna está relacionada ao tráfico de animais silvestres, cujas condutas envolvem a captura, transporte e comércio ilegais de indivíduos. Todas essas atividades implicam também em diversas formas de maus-tratos aos animais. O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de entender como os policiais ambientais percebem o combate a crimes contra animais silvestres, adequar e padronizar o exame de corpo de delito aplicado às aves da fauna silvestre nativa, e desenvolver um aplicativo móvel que facilite as coletas de dados dos exames realizados em campo. Como resultado, foi desenvolvido o Protocolo de Exame em Bem-estar Animal de Aves Silvestres (PEBEA – Aves Silvestres). O protocolo inclui um formulário de avaliação do bem-estar de aves silvestres composto por 26 indicadores, representando as Cinco Liberdades, subdivididos nas categorias nutricional, de conforto, de saúde e comportamental. Os resultados obtidos demonstram que o protocolo permite a identificação de pontos críticos e o auxílio nas ações de fiscalizações e investigações policiais de casos suspeitos de maus-tratos, contribuindo, assim, para a redução do sofrimento e o incremento da qualidade de vida dos animais envolvidos. / Doutor

O estudo teve como objetivos verificar a suscetibilidade in vitro e in uso de diferentes espécies de leveduras oriundas de animais silvestres frente a diferentes desinfetantes existentes no mercado, bem como fitoquímicos. Foram realizados testes de Microdiluição em Caldo (MC) in vitro, com as seguintes leveduras: Candida albicans, C. catenulata, C. guilliermondii, C. ciferri, C. famata, C. globosa, C. intermedia, C. sphaerica, Trichosporon assahii, Rhodotorula sp., Geotrichum klebahnii e Cryptococcus laurentii, frente a Hipoclorito de Sódio, Pinho, Quaternário de Amônio, Digluconato de clorexidina, Água Sanitária, Óleo de Pinho, Óleo de Mentha piperita, Extrato Hidroálcoolico de Eucalipto, 1,8-Cineol e Óleo de Castanha-do-Brasil. Também foram realizados testes de Eficácia de Desinfetantes (ED) com os desinfetantes químicos, nos tempos de 0.5, 1, 5 e 15 minutos, com as mesmas leveduras. Os testes in uso foram realizados no Núcleo de Reabilitação da Fauna Silvestre da UFPel, com o Pinho, Água Sanitária e Digluconato de Clorexidina. Os resultados demonstraram boa ação dos compostos estudados, sendo que nos testes de MC todos os desinfetantes químicos, o óleo de Pinho e o óleo de Castanha-do-Brasil apresentaram ação fungicida, os demais compostos fitoquímicos apresentaram apenas ação fungistática. Nos testes de ED todas as leveduras estudas foram inativadas em até 15 minutos na presença de matéria orgânica e em cinco minutos quando o desinfetante foi diluído apenas em água. Já para os testes in uso ocorreu uma redução de em média 50% após o uso dos produtos na desinfecção do local. Todos os resultados dependentes do produto utilizado. Os desinfetantes químicos apresentaram resultados positivos frente aos microrganismos estudados, sendo mais eficazes que os fitoquímicos, que também obtiveram uma ação satisfatória neste estudo. Este estudo reforça a importância de manter a higiene das instalações dos Centros de Triagem de Animais Silvestres (CETAS), uma vez que todos os microrganismos estudados são provenientes da microbiota fúngica de animais silvestres. Os cuidados com a limpeza, higienização e a desinfecção são fundamentais na manutenção de qualquer cativeiro. / The study was designed to evaluate the in vitro susceptibility and in use of different yeast species originated from wild animals against different existing disinfectants on the market, as well as phytochemicals. Microdilution tests ( MC ) in vitro, were performed in broth, with the following yeasts : Candida albicans , C. catenulata , C. guilliermondii, C. Ciferri , C. famata, C. globosa, C. intermedia, C. sphaerica, Trichosporon assahii, Rhodotorula sp., Geotrichum klebahnii and Cryptococcus laurentii, compared to Sodium Hypochlorite, Pine, Quaternary ammonium, Chlorhexidine Digluconate, Bleach, Pine Oil, Mentha piperita oil, Hydroalcoholic Extract of Eucalyptus, 1.8 - Cineol and Chestnut- of - Brazil Oil. Efficacy testing of disinfectants (ED) were also carried out with chemical disinfectants, in the times of 0.5, 1, 5 and 15 minutes, with the same yeast. The tests were performed in use at the Núcleo de Reabilitação da Fauna Silvestre, UFPel, with Pine, Bleach and Chlorhexidine Digluconate . The results showed good deed of the compounds studied, and the MC tests all chemical disinfectants, oil Pine and Chestnut Brazil- oil showed fungicidal action, other phytochemical compounds showed only fungistatic . ED tests in all studied yeasts were inactivated within 15 minutes in the presence of organic matter and in five minutes when the disinfectant was diluted with water only. Already in use for the tests was a reduction of 50 % on average after using the products for the disinfection of the site. All results depending on the product used. Chemical disinfectants showed positive results against the microorganisms studied, being more effective that phytochemicals, which also had a satisfactory action in this study. This study reinforces the importance of maintaining the cleanliness of the premises of the Screening Centers of Wild Animals (CETAS) , since all the microorganisms studied are from fungal microbiota of wild animals . The care of the cleaning, sanitizing and disinfection are critical in maintaining any captivity.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Florestal, 2012. / Submitted by Elna Araújo (elna@bce.unb.br) on 2012-06-20T22:01:19Z No. of bitstreams: 1 2012_LucianoEmmert.pdf: 7730211 bytes, checksum: 1f71b56ef557cd139b4a345789ccf45a (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-06-21T11:56:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_LucianoEmmert.pdf: 7730211 bytes, checksum: 1f71b56ef557cd139b4a345789ccf45a (MD5) / Made available in DSpace on 2012-06-21T11:56:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_LucianoEmmert.pdf: 7730211 bytes, checksum: 1f71b56ef557cd139b4a345789ccf45a (MD5) / A dieta do Lobo-guará foi estudada entre outubro de 2010 a setembro de 2011 na Floresta Nacional de Brasília - área 01, uma Unidade de Conservação localizada no Distrito Federal, Brasil. A área é caracterizada por um mosaico de plantios de Eucalipto e Pinus e fragmentos de fitofisionomias do bioma Cerrado. Foram coletadas 117 amostras fecais, ao longo de 1.632 km de transectos percorridos durante as estações seca e chuvosa. Foram identificados 32 itens alimentares, sendo 15 de origem animal, 16 de origem vegetal e lixo. Dentre os itens animais foram identificados 13 ordens e 15 famílias. Dentre os itens de origem vegetal foram identificadas 10 ordens e 11 famílias. As angiospermas representaram cerca de 46% dos itens mais consumidos, seguidos de mamíferos (22,22%), aves (20,51%), lixo (5,13%), insetos (2,56%), gimnospermas e répteis (1,71% cada). Considerando os itens alimentares mais importantes na dieta do lobo-guará, a lobeira (Solanum lycocarpum) e capim, roedores, tatus e tinamídeos, lixo, folhas e galinhas foram os itens mais importantes. A dieta apresentou predomínio de itens vegetais (50%) em relação aos itens animais (46,9%) e lixo (3,1%). A riqueza de itens encontrados foi menor na estação seca que na estação chuvosa (29). A dieta do lobo-guará na FNB-01 não apresentou variação na frequência de consumo de itens alimentares em função das estações do ano, variando somente entre as categorias de itens. O item mais importante na dieta do lobo-guará no presente estudo foi a lobeira (Solanum lycocarpum) seguido de capim, roedores, tatus, tinamídeos e lixo, respectivamente. A largura de nicho total encontrada foi de 0,519 sugerindo uma dieta intermediária entre hábitos especialistas e generalistas. A largura de nicho na estação seca (0,3489) foi menor que na estação chuvosa (0,5921) indicando hábitos mais especialistas na estação seca e hábitos mais generalistas na estação chuvosa. Houve alto consumo de lixo, tanto em relação aos demais itens alimentares (5,13%), quanto em relação à frequência mensal (41,67%), sugerindo consumo de alimentos e lixo deixados por visitantes da FNB, bem como de moradores do entorno da unidade de conservação. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The diet of the maned wolf was studied between October 2010 to September 2011 in Brasilia National Forest - Area 01, a conservation area located in the Federal District, Brazil. The area is characterized by a mosaic of plantations of Eucalyptus and Pinus, and fragments of Cerrado physiognomies. 117 fecal samples were collected along 1632 km of transects covered during dry and rainy seasons. We identified 32 food items, 15 animal, 16 vegetable and urban waste. Among animal items were 13 orders and 15 families. Among the items of plant origin have been identified 10 orders and 11 families. The angiosperms represented about 46% of the items most frequently consumed, followed by mammals (22.22%), birds (20.51%), garbage (5.13%), insects (2.56%), reptiles and gymnosperms ( 1.71% each). Considering the most important food items in the diet of the maned wolf, the lobeira (Solanum lycocarpum) and grass, rodents, armadillos and tinamídeos, garbage, leaves and chickens were the most important. The diet was dominated by plant items (50%) in relation to animal items (46.9%) and Garbage (3.1%). The wealth of items found in the dry season was lower than in the rainy season (29). The diet of maned wolf in the FNB-01 did not change in frequency of consumption of food items according to the seasons, varying only between the categories of items. The most important item in the diet of maned wolf in this study was the lobeira (Solanum lycocarpum) followed by grass, rodents, armadillos, tinamídeos and garbage, respectively. The total niche width was found to be 0.519 suggesting a diet habits intermediate between specialists and generalists. The niche breadth in the dry season (0.3489) was lower than in the rainy season (0.5921) indicating specialists habits in the dry season and more generalist habits in the rainy season. A high consumption of garbage, both in relation to other food items (5.13%), and in relation to monthly frequency (41.67%), suggest consumption of food and garbage left by visitors to the FNB, as well as residents from around the conservation unit.

O estudo teve como objetivos verificar a suscetibilidade in vitro e in uso de diferentes espécies de leveduras oriundas de animais silvestres frente a diferentes desinfetantes existentes no mercado, bem como fitoquímicos. Foram realizados testes de Microdiluição em Caldo (MC) in vitro, com as seguintes leveduras: Candida albicans, C. catenulata, C. guilliermondii, C. ciferri, C. famata, C. globosa, C. intermedia, C. sphaerica, Trichosporon assahii, Rhodotorula sp., Geotrichum klebahnii e Cryptococcus laurentii, frente a Hipoclorito de Sódio, Pinho, Quaternário de Amônio, Digluconato de clorexidina, Água Sanitária, Óleo de Pinho, Óleo de Mentha piperita, Extrato Hidroálcoolico de Eucalipto, 1,8-Cineol e Óleo de Castanha-do-Brasil. Também foram realizados testes de Eficácia de Desinfetantes (ED) com os desinfetantes químicos, nos tempos de 0.5, 1, 5 e 15 minutos, com as mesmas leveduras. Os testes in uso foram realizados no Núcleo de Reabilitação da Fauna Silvestre da UFPel, com o Pinho, Água Sanitária e Digluconato de Clorexidina. Os resultados demonstraram boa ação dos compostos estudados, sendo que nos testes de MC todos os desinfetantes químicos, o óleo de Pinho e o óleo de Castanha-do-Brasil apresentaram ação fungicida, os demais compostos fitoquímicos apresentaram apenas ação fungistática. Nos testes de ED todas as leveduras estudas foram inativadas em até 15 minutos na presença de matéria orgânica e em cinco minutos quando o desinfetante foi diluído apenas em água. Já para os testes in uso ocorreu uma redução de em média 50% após o uso dos produtos na desinfecção do local. Todos os resultados dependentes do produto utilizado. Os desinfetantes químicos apresentaram resultados positivos frente aos microrganismos estudados, sendo mais eficazes que os fitoquímicos, que também obtiveram uma ação satisfatória neste estudo. Este estudo reforça a importância de manter a higiene das instalações dos Centros de Triagem de Animais Silvestres (CETAS), uma vez que todos os microrganismos estudados são provenientes da microbiota fúngica de animais silvestres. Os cuidados com a limpeza, higienização e a desinfecção são fundamentais na manutenção de qualquer cativeiro. / The study was designed to evaluate the in vitro susceptibility and in use of different yeast species originated from wild animals against different existing disinfectants on the market, as well as phytochemicals. Microdilution tests ( MC ) in vitro, were performed in broth, with the following yeasts : Candida albicans , C. catenulata , C. guilliermondii, C. Ciferri , C. famata, C. globosa, C. intermedia, C. sphaerica, Trichosporon assahii, Rhodotorula sp., Geotrichum klebahnii and Cryptococcus laurentii, compared to Sodium Hypochlorite, Pine, Quaternary ammonium, Chlorhexidine Digluconate, Bleach, Pine Oil, Mentha piperita oil, Hydroalcoholic Extract of Eucalyptus, 1.8 - Cineol and Chestnut- of - Brazil Oil. Efficacy testing of disinfectants (ED) were also carried out with chemical disinfectants, in the times of 0.5, 1, 5 and 15 minutes, with the same yeast. The tests were performed in use at the Núcleo de Reabilitação da Fauna Silvestre, UFPel, with Pine, Bleach and Chlorhexidine Digluconate . The results showed good deed of the compounds studied, and the MC tests all chemical disinfectants, oil Pine and Chestnut Brazil- oil showed fungicidal action, other phytochemical compounds showed only fungistatic . ED tests in all studied yeasts were inactivated within 15 minutes in the presence of organic matter and in five minutes when the disinfectant was diluted with water only. Already in use for the tests was a reduction of 50 % on average after using the products for the disinfection of the site. All results depending on the product used. Chemical disinfectants showed positive results against the microorganisms studied, being more effective that phytochemicals, which also had a satisfactory action in this study. This study reinforces the importance of maintaining the cleanliness of the premises of the Screening Centers of Wild Animals (CETAS) , since all the microorganisms studied are from fungal microbiota of wild animals . The care of the cleaning, sanitizing and disinfection are critical in maintaining any captivity.

As aves silvestres são importantes reservatórios de vírus que podem acometer as aves domésticas. O monitoramento da circulação viral em aves silvestres é de extrema importância para garantir a sanidade dos plantéis avícolas. O presente estudo teve como objetivo 1) comparar dois testes moleculares de RT-PCR para a detecção dos vírus da família Paramyxoviridae em aves silvestres e sinantrópicas; 2) caracterizar os vírus detectados nestas amostras. Dois testes de RT-PCR e testes específicos de RT-PCR em tempo real (RRT-PCR) para o vírus da doença de Newcastle (NDV) e o metapneumovírus aviário (aMPV) foram utilizados para comparar o limite de detecção entre as amostras. As amostras de aves silvestres foram testadas por dois testes de RT-PCR. Um pequeno fragmento da região do sítio de clivagem do gene F das amostras positivas foi sequenciado. Os testes de RT-PCR foram validados com sucesso, mas apresentaram diferenças entre os limites de detecção quando comparados aos testes específicos de RRT-PCR utilizando diferentes vírus. No total, 100 amostras de aves (suabes) foram testados pelo teste RT-PCR que apresentou um limite de detecção similar entre os diferentes agentes virais. O teste selecionado foi capaz de detectar duas amostras de aves silvestres que foram também detectadas pelo testes específico para NDV e relacionadas às amostras de NDV vacinais do genótipo II da classe II referentes aos vírus de NDV lentogênico (113RQGR ↓ L117). Nosso estudo demonstra a deficiência na biosseguridade adotada pelos sistemas avícolas por permitir a saída dos vírus vacinais para as aves silvestres / Wild birds are important reservoirs of viruses can affect poultry. Surveillance of circulating viruses in wild birds is of the most importance tool to ensure the poultry health. The present study aimed to 1) compare two molecular tests for detection of family Paramyxoviridae viruses in wild and feral birds; 2) characterize the detected viruses in those samples. Two RT-PCR techniques and specific real time RT-PCR (RRT-PCR) assays for detection of Newcastle disease virus (NDV) and avian metapneumovirus (aMPV) were used to compare the limit of detection among them. Wild bird samples were tested by using two RT-PCR tests. A small fragment of cleavage site region in F gene from positive samples was sequenced. The RT-PCR were successfully validated, however they had differences in the limit of detection when compared to specific RRT-PCR assays using different viruses. In total, 100 wild bird samples (swabs) were tested by the selected RT-PCR with similar limit of detection between tested viruses. Two samples were positive by this test and they were also detected by the specific RRT-PCR for NDV. These samples were closed related to vaccinal NDV strains belonging to genotype II class II. Deduced amino acid sequences of cleavage site region from detected samples were characterized as lentogenic NDV strains (113RQGR ↓ L117). Our study demonstrates the poor biosafety used by poultry industry allowing the vaccinal escape to wild bird species

As aves silvestres são consideradas importantes reservatórios de diversos vírus aviários que podem afetar aves comerciais. Dessa forma, o monitoramento das aves silvestres é fundamental para garantir a sanidade dos plantéis avícolas brasileiros. Nos últimos anos, o número de espécies de aves nas quais os coronavírus aviários foram encontrados aumentou vertiginosamente em diversos países. Contudo, poucos estudos envolvendo a detecção de coronavírus aviários em aves de cativeiro e aves silvestres ou sinantrópicas foram realizados no Brasil. Assim, o presente estudo teve como objetivo identificar a presença dos coronavírus aviários em aves silvestres no Brasil e caracterizá-los molecularmente. As amostras foram testadas através do teste de RRT-PCR para detecção do gene UTR do IBV, bem como uma nested-PCR para detecção do gene S1 dos coronavírus aviários. O sequenciamento de alto desempenho foi utilizado para caracterizar os vírus detectados. No total, foram testadas 300 amostras de aves silvestres (147 suabes orofaringeanos e 153 suabes cloacais). No total, 27 amostras foram positivas pelo teste RRT-PCR. Duas amostras de Anseriformes das amostras positivas no teste de RRT-PCR foram selecionadas para sequenciamento de alto desempenho. Em ambas as amostras sequenciadas foi constatada a co-infecção pelos vírus da bronquite infecciosa e vírus da doença de Newcastle. A análise das amostras demonstrou alta identidade com vírus vacinais, o que demonstra que estirpes vacinais utilizadas na imunização de aves de produção circulam em aves silvestres e de produção de subsistência. / Wild birds are an important reservoir of different viruses that can affect poultry. Viral surveillance in wild birds is, thus, extremely important to ensure the poultry heal in Brazil. In recent years, the number of species of birds in which avian coronaviruses have been found skyrocketed in several countries. However, few studies involving the detection of avian coronaviruses in captive wild birds or wild life birds were conducted in Brazil. Thus, the present study aimed to identify the presence of avian coronaviruses in Brazil and characterize them molecularly. Samples were tested by RRT-PCR test for detection of the UTR gene of IBV, as well as a nested-PCR for detection of S1 gene. In total, 300 samples of wild birds (147 oropharyngeal swabs and 153 cloacal swabs) were tested. In total, 27 samples were positive in RT-PCR assay. Two positive samples in RRT-PCR assay were selected for Next-generation sequencing. In both sequenced samples, co-infection with infectious bronchitis virus and Newcastle disease virus was found. The analysis of samples showed identity with vaccinal strains used in immunization of commercial flocks circulate in wild birds and subsistence flocks.

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:13:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo8_1.pdf: 1293352 bytes, checksum: 746673d69958e017a467483837256871 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / A caça predatória ilegal é o segundo maior fator de impacto em populações de animais silvestres no Brasil, ficando atrás apenas da perda de habitat por desmatamento. Apesar de ser proibida no Brasil (Leis n° 5.197/1967 e n° 9.605/1998), o poder público ainda não dispõe de recursos eficientes e cientificamente testados que possam ser utilizados em análises forenses visando comprovar o ato da caça, seja ela desportiva ou com finalidade comercial. A análise baseada no DNA tem sido utilizada em várias situações, com a finalidade de detectar fraudes comerciais e outras ilegalidades. Diante do exposto, o objetivo do presente trabalho foi à identificação e a utilização de perfis de PCR/RFLP espécieespecíficos para diagnóstico forense de 15 espécies da fauna brasileira e sua diferenciação de quatro espécies domésticas (bovino, suíno, caprino, ovino), totalizando 19 espécies. Para tanto foram realizadas análises de seqüências de nucleotídeos com os programas Sequencher 4.9, BioEdit 6.0.7, CLEAVER, pDRAW e Gene Runner 3.0.5, tendo sido identificados vários SNPs associados à criação de sítios de enzimas de restrição discriminantes. Com apenas 9 enzimas foram obtidos os perfis de PCR/RFLP discriminantes para as 19 espécies. A validação do protocolo in vitro foi realizada com amostras biológicas de 6 espécies silvestres (Agouti paca, Cebus apella, Dasyprocta leporina, Dasypus novemcinctus, Euphractus sexcinctus, Tayassu tajacu) juntamente com 4 espécies domésticas (Bos taurus, Capra hircus, Ovis aries and Sus scrofa), e os perfis detectados na analise in silico foram confirmados em gel de agarose 2%. O presente estudo reforçou o potencial de polimorfismos do gene Citocromo b como poderosos marcadores para identificação de espécies. Os dados produzidos aqui podem ser úteis como ferramentas em conservação no combate a caça predatória e monitoramento do comércio ilegal de carne de caça e de seus produtos

Memoria para optar al Título Profesional de Ingeniero en Recursos Naturales Renovables / La preservación de la naturaleza requiere la identificación, descripción y evaluación de los ecosistemas en diferentes niveles de percepción, para el establecimiento de políticas de conservación apropiadas a diversos objetivos, en contextos complejos, influidos por distintas corrientes filosóficas y ecológicas. En este estudio, se formula una propuesta metodológica para abordar el análisis de los ecosistemas del Parque Pumalín, a través de su caracterización, clasificación y zonificación, más un estudio exploratorio del contexto filosófico y científico de su política de conservación. Para ello se delimitó un área homogénea geográficamente, se realizó una descripción biofísica y ecológica, y se representó su ecología en un modelo sistémico. Todo esto como base para una clasificación jerárquica de ecosistemas en tres escalas de relaciones ecológicas. Se identificó un ecosistema principal a macroescala, siguiendo el patrón general definido por el clima y la orografía; nueve unidades a mesoescala, agrupadas en valles, montañas, llanuras y playas; y, cuarenta y tres ecosistemas a microescala, determinados principalmente por las asociaciones vegetales presentes. De la zonificación se obtuvo que la mayor superficie está dominada por montañas del batolito norpatagónico y valles aluviales o fluvioglaciales. En un nivel inferior se encuentra un mosaico de asociaciones vegetales, entre las cuales dominan las de Nothofagus nitida, Nothofagus betuloides y Fitzroya cupressoides. En una evaluación de la provisión de procesos ecológicos, se obtuvieron los mayores valores en ecosistemas boscosos. En el análisis de la sensibilidad ecosistémica, se asignaron valores elevados a toda el área, mientras los más altos se obtuvieron en la península de Huequi. Se identificaron ecosistemas de muy alta naturalidad, en prácticamente toda la extensión de montañas boscosas; con una alta naturalidad y riqueza, en la península de Huequi; y con una alta naturalidad y fragilidad en los sectores montañosos más elevados. Al analizar el contexto de la política de conservación, la información recopilada se organizó en nueve argumentos éticos o filosóficos y cinco imperativos científicos o ecológicos para la protección de la Naturaleza; además de seis objetivos de las áreas silvestres protegidas; los cuales fueron jerarquizados a partir de una consulta a expertos escogidos según su relevancia para el caso analizado.