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Taxonomia e análise cladística de Cochabamba Bechyné, 1955 (Coleoptera, Chrysomelidae, Galerucinae) / Taxonomy and cladistic analysis of Cochabanba Bechyné, 1955 (Coleoptera, Chrysomelidae, Galerucinae)

Prado, Laura Rocha 20 October 2010 (has links)
O gênero Cochabamba Bechyné, 1955 é estritamente neotropical, com registros de ocorrência confirmados apenas para a América Central e América do Sul. O gênero faz parte do grupo dos Galerucinae diabroticinos, o qual inclui táxons muito estudados por sua importância econômica, mas que, apesar disso, tem a sistemática pouco resolvida. Realizou-se a revisão taxonômica e a análise cladística do gênero, uma vez que não existia nenhum estudo desta natureza para o grupo que incluía, até o presente trabalho,10 espécies. O estudo morfológico foi executado segundo protocolo tradicional, que inclui dissecção e ilustração dos espécimes (pelo menos um macho e uma fêmea de cada espécie, quando disponível). A análise cladística baseou-se em 15 terminais e 58 caracteres morfológicos (sendo 5 referentes à coloração, e 13 à genitália). Considerando a inexistência de informações filogenéticas para o gênero, os terminais do grupo externo foram selecionados dentre representanes da subfamília Galerucinae. A busca exaustiva com pesos iguais dos caracteres encontrou 13 árvores mais parcimoniosas (C=102), cujo consenso teve comprimento igual a 108 passos. A análise com pesagem sucessiva dos caracteres encontrou 3 árvores mais parcimoniosas (C= 102), cujo consenso teve comprimento igual a 103 passos (IC= 74, IR= 60). As topologias encontradas indicam que o gênero Cochabamba como configurado até o presente trabalho era merofilético. A monofilia de Cochabamba é recuperada com a transferência de C. volxemi para o gênero Paranapiacaba Bechyné, 1955 (combinação revalidada) e a inclusão de Diabrotica rufolimbata (nova combinação). Apresenta-se uma chave de identificação para as espécies de Cochabamba, além da redescrição de todas as espécies incluídas, bem como a descrição de uma espécie nova, o que resulta em 11 espécies. Apresentam-se, ainda, mapas indicando a distribuição geográfica do gênero, os quais foram confeccionados a partir de informações de localidade presentes nas etiquetas de cada exemplar examinado, além dos dados obtidos na literatura. / Cochabamba Bechyné, 1955 is a strictly neotropical genus, recorded only from Central and South America. This genus belongs to the Galerucinae diabroticines, a group which includes well studied taxa of economic importance, but has a poorly understood systematics. The present study provides the first revisional and cladistic treatment of this group, up to now composed by 10 species. The morphological study of all specimens followed the traditional methods of dissection and illustration of specimens (at least one male and female of every species, if available). The cladistic analysis was based on 15 terminal taxa and 58 morphological characters (including 5 referring to coloration and 13 to genitalia). Since there were no previous phylogenetic hypothesis for the relationships of this genus, the outgroups were selected among the representatives of the subfamily Galerucinae. The analysis using equally weighted characters produced 13 equally most-parcimonious trees (L=102), which resulted in a consensus diagram 108 steps long. The analysis conducted after sucessive weighting of characters found 3 most-parcimonious trees, which resulted in a consensus diagram 103 steps long (CI= 74; RI= 60). According to the observed topologies, Cochabamba as previously defined is a merophyletic group. To recover its monophyly, the taxon C. volxemi must be transferred back to genus Paranapiacaba Bechyné, 1955 (reinstated combination) and Diabrotica rufolimbata (new combination) included into the genus. An identification key to species is presented, as well as the redescription of all 11 Cochabamba species, including the description of a new species. Maps showing the geographic distribution of the species are also presented, based on the labels of studied material and data collected from literature.
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Diversidade filogenética de Potamotrygonocestus Brooks & Thorson, 1976 (Eucestoda: Onchoproteocephalidea) / Phylogenetic diversity of Potamotrygonocestus Brooks & Thorson, 1976 (Eucestoda: Onchoproteocephalidea)

Olivares, Cláudia Tangerino 14 August 2014 (has links)
Arraias da família Potamotrygonidae (Chondrichthyes: Myliobatoidei) são elasmobrânquios endêmicos dos sistemas fluviais da região Neotropical. Nestes hospedeiros residem uma diversa fauna parasitária que inclui vários gêneros de cestóideos. Tanto as arraias como seus cestóideos são derivados de ancestrais marinhos. A taxonomia e sistemática do sistema hospedeiro/parasita, no entanto, é pouco conhecida. Neste contexto, este estudo documenta, pela primeira vez a diversidade molecular das linhagens de Potamotrygonocestus empregando a otimização direta do genes 28S rDNA, ITS1 rDNA, Calmodulina e Citocromo Oxidase I. Objetiva-se avaliar o posicionamento filogenético de seus membros dentro de uma análise cladística. Os resultados corroboram a monofilia do gênero Potamotrygonocestus e recuperaram dois clados principais que correspondem a agrupamentos morfologicamente diagnosticados com base na morfologia do gancho. A hipótese filogenética apresentou indícios que P. chaoi e P. marajoara são sinônimos júnior de P. travassosi, e que P. orinoconoensis é uma espécie válida. Adicionalmente, os resultados indicam a existência de 14 novas linhagens que podem ser elevadas ao nível de espécie. Os membros Potamotrygonocestus revelaram ser mais especialistas aos seus hospedeiros do que se acreditava e, em relação à biogeografia, a hipótese filogenética apresentou padrões biogeográficos semelhantes a diversos membros da ictiofauna neotropical. A ampliação da representatividade biogeográfica bem como a inclusão de dados moleculares à sistemática do gênero possibilitou reconhecer padrões de distribuição e de infestação que antes eram desconhecidos. Esse refinamento pode contribuir de forma interessante para os outros gêneros parasitas de potamotrigonídeos / Stingrays of the Potamotrygonidae family (Chondrichthyes: Myliobatoidei) are endemic elasmobranchs of river systems in the Neotropics. In these hosts a reside diverse fauna of parasite which includes many genera of tapeworms (Cestoda). Both stingrays and their cestodes are derived from marine ancestors. However, the taxonomy and systematics of this host/parasite system is poorly known. This study documents, for the first time, the molecular diversity of Potamotrygonocestus lineages by employing the direct optimization of 28S rDNA, ITS1 rDNA, Calmodulin and Cytochrome Oxidase I genes. The goal of this study is to understand the phylogenetic position of its members within a cladistic analysis. The results support the monophyly of the genus Potamotrygonocestus and recovered two main clades morphologically diagnosed based on hook morphology hook. The phylogenetic hypothesis presented supports the contention that P. chaoi and P. marajoara are junior synonyms of P. travassosi, and P. orinoconoensis should be considered a valid specie. Additionally, the results suggest that there are 14 new lineages that can be raised to the level of species. Members of Potamotrygonocestus proved to be more host specific than previously thought and, in relation to its biogeography, the phylogenetic hypothesis presented mirrors similar patterns of area association reported for many members of the Neotropical ichthyofauna. The expansion of biogeographical representativeness and inclusion of the molecular data in systematics of the genus allowed the recognition of distribution and infestation patterns that were previously unknown. This refinement could be interesting for other potamotrigonids genus parasites
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Taxonomia e análise cladística de Theages Walker, 1855 (Lepidoptera, Erebidae, Arctiinae, Arctinii, Ctenuchina) / Taxonomy and cladistic analysis of Theages Walker, 1855 (Lepidoptera, Erebidae, Arctiinae, Arctiini, Ctenuchina)

Araujo Junior, Elias da Costa 03 October 2018 (has links)
Theages Walker, 1855 é um gênero estritamente Neotropical constituído por 12 espécies bastante similares entre si quanto aos caracteres cromáticos, revelando-se uma considerável confusão taxonômica e nomenclatural. No presente trabalho, sob uma pespectiva de morfologia comparada, buscou-se reconhecer e elucidar o número de táxons nominais pertencentes ao gênero, bem como propor uma hipótese de relacionamento evolutivo entre eles. A análise cladística contou com 17 terminais (11 do grupo interno e seis do grupo externo) e 41 caracteres morfológicos. A busca exaustiva de pesos iguais resultou em uma única árvore mais parcimoniosa (l=142) e a de busca por pesagem implícita também gerou uma única árvore mais parcimoniosa (l=143). O gênero teve sua monofilia sustentada por oito sinapomorfias, sendo cinco únicas e três homoplásticas. Foram propostos ainda dois complexos de espécies para o gênero: (T. xanthura (T. leucophaea, T albidius)) e (T. pinasi (T. griseatum, T. hoffmanni)) (T. occultus (T. flavicaput, Theages sp. nov.))). Adicionalmente, com base na topologia obtida são fornecidos subsídios para o entendimento da evolução dos caracteres sexuais secundários encontrados no gênero. A revisão taxonômica, por sua vez, permitiu o reconhecimento de 11 espécies válidas, com a inclusão de uma espécie nova para a Colômbia e Equador. Uma sinonímia também foi proposta para o gênero: T. bricenoi torna-se sinônimo júnior subjetivo de T. flavicaput. Todas as espécies são redescritas, ilustradas e tiveram suas distribuições geográficas mapeadas e discutidas. Uma chave de identificação também é fornecida. / Thaeges Walker, 1855 is a strictly Neotropical genus composed of 12 species very similar amongst themselves regarding chromatic characters, thus revealing a considerable taxonomic and nomenclatural confusion. In the present study, under the perspective of comparative morphology, the recognition and elucidation of the number of nominal taxa belonging to this genus was aimed, as well as proposing an evolutionary relationship hypothesis between them. The cladistic analysis comprised 17 terminals (11 from the ingroup and six from the outgroup), and 41 morphological characters. The exhaustive search for equal weights resulted in a single most parsimonious tree (I=142) and the implicit weight search also yielded a single most parsimonious tree (I=143). The genus\' monophyly was well supported by eight synapomorphies, five being unique and three homoplastic. In addition, two species complexes were proposed for the genus: (T. xanthura (T. leucophaea, T albidius)) and (T. pinasi (T. griseatum, T. hoffmanni)) (T. occultus (T. flavicaput, Theages sp. nov.))). Furthermore, based on the topology obtained, subsidies for the understanding of the evolution of the male secondary sexual characters found in the genus were provided. On the other hand, the taxonomic revision enabled the recognition of 11 valid species with the inclusion of a new species for both Colombia and Ecuador. Additionally, a synonym was also proposed to the genus: T. bricenoi becomes a junior subjective synonym of T. flavicaput. All species were redescribed, illustrated, and their geographical distributions mapped and discussed. An identification key was also provided.
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Análise filogenética de Psittaciformes (Aves) com base em caracteres morfológicos siringeais e osteológicos / Phylogenetic analysis of Psittaciformes (Aves) based on siringeal and osteological morphological characters

Lima, Renato Gaban 14 June 2007 (has links)
Este estudo propõe hipóteses das relações filogenéticas entre representantes da ordem Psittaciformes, com base em caracteres morfológicos (osteológicos, principalmente cranianos, e anatômicos da siringe), usando o princípio da parcimônia para análise dos dados. Como o conhecimento prévio da anatomia comparada da siringe na ordem ainda é restrito, com sua nomenclatura anatômica confusa, foi feito, primeiramente, estudo anatômico para possibilitar melhor compreensão dos caracteres siringeais utilizados posteriormente nas análises filogenéticas. Neste estudo anatômico é apresentada uma gama de variações antes desconhecidas, que são confrontadas com o conhecimento prévio da morfologia da siringe dos Psittaciformes. Das variações detectadas, parte ocorre em estruturas que, provavelmente, estão envolvidas na produção dos sons, o que deverá ser levado em consideração em futuros estudos de anatomia funcional. As análises filogenéticas efetuadas contaram com 215 siringes e 208 esqueletos, pertencentes 91 espécies de Psittaciformes (distribuídas em 43 gêneros). Esse conjunto de espécimes foi separado em 53 táxons terminais (monofiléticos em relação ao universo amostrado); uma parte deles (11 ao todo) não tiveram sua siringe ou seu esqueleto estudados, e foram aqui denominados terminais incompletos, por possuírem muitos caracteres indeterminados (?). Ao todo foram codificados 101 caracteres variáveis (62 siringeais e 49 esqueléticos), com os quais foram feitas análises com diferentes composições de terminais incompletos, buscando obter hipóteses filogenéticas mais precisas. Para cada análise principal, efetuada com parte dos caracteres multiestados ordenados, foi realizada análise adicional (com todos os caracteres considerados como não-ordenados) visando verificar a influência desses ordenamentos nas topologias. As hipóteses obtidas foram comparadas com as disponíveis na literatura, e diversas congruências foram encontradas, aumentando assim o \"suporte\" de inúmeros componentes recorrentemente resgatados. As opções de ordenamento afetam mais alguns componentes que outros, e as análises adicionais geraram hipóteses menos concordantes com as da literatura. Os caracteres aqui amostrados contêm inúmeras homoplasias, entretanto, a resolução das hipóteses, fortemente congruentes com as filogenias prévias, reforça a importância e a validade dos caracteres morfológicos para recuperações filogenéticas entre os Psittaciformes, ao contrário do alegado por alguns autores. Com base nas hipóteses aqui obtidas e compiladas, algumas recomendações são feitas para tornar a sistemática dos Psittaciformes mais informativa filogeneticamente: a. inclusão de N. nenday no gênero Aratinga; b. inclusão de A. xanthops no gênero Graydidascalus; c. Reconhecimento de duas famílias na ordem: Nestoridae (Nestor e Strigops) e Psittacidae (com os demais Psittaciformes, inclusive com os representantes da antiga família Cacatuidae). / This study proposes hypothesis of phylogenetic relationships among representatives of the Order Psittaciformes, based on morphological characters (osteological, mainly from skull, and anatomical of syrinx), using the Principle of Parsimony for analysis of data. As previous knowledge on the compared anatomy of syrinx in the order is still restricted, with its anatomical nomenclature confused, an anatomical study was first conducted to yield a better comprehension of syrinx characters, used afterwards in phylogenetic analyses. In this anatomical study, an array of variations not known before is presented, which is compared with previous knowledge of syrinx morphology in Psittaciformes. Among detected variations, some occur in structures that are possibly involved in sound production, which will need to be taken into consideration in future functional anatomy studies. Phylogenetic analyses were based on 215 syrinxes and 208 skeletons, belonging to 91 species of Psittaciformes (distributed in 43 genera). This set of specimens was organized in 53 terminal taxa (monophyletic in relation to the sampled universe); part of them (11 in a whole) did not have their syrinx or skeleton studied and are regarded herein as incomplete terminals for processing many undetermined characters (?). In total, 101 variable characters (62 from syrinx and 49 from skeleton) were coded, with which analyses were made varying composition of incomplete terminals to find more precise phylogenetic hypothesis. For each main analysis, done with part of multi-state characters ordered, an additional analysis was done with all multi-state characters unordered to verify the influence of ordering in topologies. Obtained hypothesis were compared with the ones from literature and many congruencies were found, increasing the \"support\" of innumerous components recurrently retrieved. Options of ordering affect more some components than others, and additional analyses generated hypothesis with less agreement with the ones from literature. Characters herein sampled contain various homoplasies but resolution of hypothesis strongly congruent with previous phylogenies reinforces the importance of morphological characters to retrieve phylogenies among Psittaciformes, contrary to what is affirmed by some authors. Based on hypothesis obtained herein, some recommendations are pointed out to make systematics of Psittaciformes more phylogenetic informative: a. inclusion of N. nenday in the genus Aratinga; b. inclusion of A. xanthops in the genus Graydidascalus; c. Recognition of two families in the order: Nestoridae (Nestor and Strigops) and Psittacidae (with remaining Psittaciformes, including representatives of the former family Cacatuidae).
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Análise cladística e biogeográfica de Mesembrinellidae (Diptera, Oestroidea) / Cladistic and biogeographic analysis of Mesenbrinellidae (Diptera, Oestroidea)

Moll, Priscylla 16 January 2015 (has links)
Mesembrinellidae é um grupo de dípteros de distribuição exclusivamente Neotropical, habitantes de florestas úmidas do Sul do México ao Norte da Argentina. Atualmente são conhecidas 36 espécies e seu posicionamento dentro da superfamília Oestroidea, bem como sua classificação interna, vem gerando frequentes discussões na literatura, com propostas bastante divergentes. Tradicionalmente, Mesembrinellidae é considerado uma subfamília de Calliphoridae s.l. No entanto, devido a características morfológicas e biológicas peculiares desse grupo, diversos autores propuseram a elevação para o status de família, como considerado no presente trabalho. Os objetivos desse trabalho eram: testar a monofilia de Mesembrinellidae; testar a monofilia dos gêneros subordinados; encontrar uma hipótese de agrupamento entre as espécies do grupo e realizar um estudo biogeográfico de Mesembrinellidae, a partir da filogenia gerada. Para tanto, foram construídos 120 caracteres morfológicos e foram realizadas análises cladísticas, sob pesagem igual e implícita dos caracteres. Para a análise de pesagem igual foram obtidas 392 árvores igualmente parcimoniosas (L=671; IC=21; RI=67), porém o consenso estrito mostrou diversas politomias. A análise de pesagem implícita resultou em uma árvore mais parcimoniosa (L=679; CI=21; RI=67; κ=9,6875), muito mais resolvida que a análise anterior. A maioria dos gêneros foram recuperados como monfiléticos, no entanto foram mal suportados, tanto pela ausência de sinapomorfias, na maioria deles, quanto pelo baixo suporte de ramos. As análises biogeográficas mostraram que Mesembrinellidae tem uma origem mais ao sul da região Neotropical, tendo sua distribuição expandida para Norte. Além disso, a área de interseção das Américas do Sul e Central parece ter papel fundamental na evolução biogeográfica do grupo, sendo área ancestral de dois grandes clados. O relacionamento entre as áreas mostrou que o norte da Amazônia é mais proximamente relacionado ao Chaco do que as demais regiões neotropicais florestadas, o que refuta a hipótese de que a diagonal seca do continente sul americano teria uma história isolada das regiões florestadas. De acordo com os resultados obtidos no presente estudo e pelos gêneros de Mesembrinellidae serem pouco suportados pelos nossos dados, nós concluímos que todos os gêneros sejam sinonimizados a Mesembrinella / Mesembrinellidae is an exclusive Neotropical group of Diptera, which includes 36 described species. Members of this group are restricted to tropical rainforests and found from Southern Mexico to Northern Argentina. The placement of this family within Oestroidea has generated frequent discussions in the literature. Traditionally, the group has been placed within the Calliphoridae s.l., but some authors have suggested the subfamily merits full species status. In addition, the interspecific relationships of this group remained unclear and some genera appeared not to be monophyletic. In this study, the main goals were: to test Mesembrinellidae monophyly; to test genera monophyly; to infer the relationships of Mesembrinellidae species and to perform a biogeographic analysis, based on the phylogenetic hypothesis. One hundred twenty (120) characters were constructed and cladistics analyses were performed, under equal and implied weighting schemes. Under the equal weighting analysis, 392 equally parsimonious trees were obtained (L=671; IC=21; RI=67), with the strict consensus showing many polytomies in the cladogram. On the other hand, the implied weighting analysis resulted in only one most parsimonious tree (L=679; CI=21; RI=67; κ=9,6875), much more structured and with few politomies, in comparison to the previous analysis. The results indicated most of genera were recovered as monophyletic. However, they were poorly supported, because of the absence of synapomorphies and a low branch support. The biogeographic analyses showed Mesembrinellidae´s origin was probably in South America and the southernmost part of Central America, having dispersed lateron to Central America. Moreover, the area (Pacific Dominion) that connects Central and South America seems to play an important role in Mesembrinellidae biogeographic evolution, being the ancestral area for two major clades inside the group, in different times. Furthermore, the area relationships indicated the northern part of the Amazon is more closely related to the dry central areas of South America than to jungle regions of this continent, which contradicts the theories about the dry areas being disconnected and having an isolated history in the Neotropical region. Given the results of this study of mesembrinellid genera, and the fact that the genera were weakly supported by our data, we conclude that for now, all species should be placed in a single genus, Mesembrinella
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Evolução e filogenia de Pleurodira (Testudines) com a descrição de uma nova espécie de Bairdemys (Podocnemidae) do Mioceno médio da Venezuela / Evolution and phylogeny of Pleurodira (Testudines) with the description of a new Bairdemys (Podocnemidae) species from the middle Miocene of Venezuela

Gabriel de Souza Ferreira 29 January 2015 (has links)
Apesar de negligenciados por muito tempo, os Pleurodira, uma das duas linhagens de Testudines (cágados, jabutis e tartarugas-marinhas), vem atraindo crescente atenção dos pesquisadores, com trabalhos que geralmente tratam da descrição de novas espécies (viventes ou extintas), de comportamentos ou hábitos alimentares, ou de análises filogenéticas dos sub-grupos de Pleurodira, como Chelidae ou Pelomedusoides, esta sub-dividida em duas linhagens com representates viventes: Pelomedusidae e Podocnemidae. Análises filogenéticas com táxons terminais de todos os principais grupos de Pleurodira existem apenas com dados moleculares. Assim, uma análise baseada em dados morfológicos que englobe táxons de todos os grandes clados do grupo, incluindo fósseis, faz-se necessária para melhor compreensão da história evolutiva do grupo. Nesta dissertação, descrevemos uma nova espécie de Bairdemys (Podocnemidae) do Mioceno médio da Venezuela e a incluímos em uma análise filogenética com ampla amostragem taxonômica, incluindo táxons de todas as linhagens de Pleurodira. Esta análise é baseada em caracteres morfológicos (novos ou previamente propostos) e a maior análise filogenética exclusiva do grupo já realizada, permitindo inferências sobre padrões gerais de diversificação e morfologia de Pleurodira. Ao mesmo tempo, o novo táxon descrito apresenta características morfológicas que, juntamente com aspectos geológicos de sua localidade tipo, permitem a inferência de que houve, durante o Cenozóico, uma irradiação marinha de Podocnemidae, que alcançou grande sucesso, principalmente no final do Oligoceno e começo do Mioceno / Though neglected for a long time, one of the two lineages of Testudines (turtles and tortoises) the Pleurodira has been attracting the researchers, whose articles usually deal with descriptions of new species (extant and extinct), behavior or feeding habits, or phylogenetic analyzes of one of the subgroups of Pleurodira, Chelidae or Pelomedusoides, the latter subdivided in two lineages with extant taxa: Pelomedusidae and Podocnemidae. There some phylogenetic analyzes with terminal taxa from the main groups of Pleurodira, but only with molecular data. Therefore, a morphological data analysis containing taxa from all the clades of this group, including fossils, is necessary to better understand the evolutionary history of this lineage. In this dissertation, I describe a new species of Bairdemys (Podocnemidae) from the middle Miocene of Venezuela, and I include it in a phylogenetic analysis with extensive taxonomic sampling, including taxa from all the lineages of Pleurodira. This analysis is based on morphological characters (new and previously proposed ones) and it is the largest exclusive phylogenetic analysis ever made for Pleurodira, allowing inferences about the general patterns of diversification and morphology of the group. At the same time, the new described táxon shows morphological characters that, along with geological aspects of its type locality, allow inferences about a marine wave of diversification of Podocnemidae during the Cenozoic, which achieved great success, specially by the end of Oligocene and beginning of Miocene
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Influência dos fatores locais, sistêmicos e relativos ao cirurgião na osseointegração de implantes dentais: uma análise sistemática das evidências científicas / Influence of local, systemic and surgeon related factors in dental implants osseointegration

Daniel Isaac Sendyk 25 May 2017 (has links)
Os fatores que possam promover e incrementar a osseointegração, ou prejudicar o processo biológico, aumentando o índice de falhas, têm sido cada vez mais investigados com o objetivo de ampliar indicações e as taxas de sobrevivência dos implantes dentais assim como controlar fatores adversos. O objetivo desta tese foi identificar, analisar e sintetizar as evidências científicas quanto a influência das estatinas, do envelhecimento e da experiência do cirurgião no processo osseointegração e na sobrevivência de implantes dentais. Este volume apresenta um compilado de três revisões sistemáticas orientadas pelas recomendações PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses). O processo de revisão foi realizado por meio de uma busca sistemática em cinco bases de dados eletrônicas (PubMed, Scopus, Web of Science, Embase e Cochrane Library), além de busca manual nas referências bibliográficas dos estudos incluídos. A meta-análise, quando cabível, foi realizada com o auxílio do software Review Manager (RevMan, Versão 5.3). O grau de heterogeneidade entre os estudos foi verificado por meio do teste Q de Cochran e I2. O viés das publicações foi avaliado com o auxílio das escalas Newcasttle-Ottawa e Cochrane Collaboration\'s Tool. A síntese dos dados permitiu a publicação de três artigos científicos dispostos nesta tese. / Factors that may promote and enhance osseointegration, or impair the biological process, have been increasingly investigated in order to expand the indications and survival rates of dental implants and control the adverse factors. The aim of this thesis is to identify and summarize the scientific evidence of statins, ageing and surgeon related factors that can influence osseointegration and survival of dental implants. This volume presents a compilation of three systematic reviews structured by PRISMA guidelines (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses). The review process was carried out through a systematic search in five electronic databases (PubMed, Scopus, Web of Science, Embase and Cochrane Library) and bibliographical references of the included studies. Meta-analyses, when appropriate, were performed using the software Review Manager (RevMan version 5.3). The degree of heterogeneity in the studies was verified by Q Cochran test and I2. The bias of the publications was assessed with the assistance of Newcastle-Ottawa Scale and Cochrane Collaboration Tool\'s. The synthesis of the data was included in three papers prepared for this thesis.
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Análise cladística da subfamília Tegulinae (Vetigastropoda: Turbinidae) / Cladistics analysis of subfamily Tegulinae (Vetigastropoda: Turbinidae)

Ana Paula Siqueira Dornellas 08 October 2015 (has links)
A subfamília Tegulinae é composta por 44 espécies viventes descritas em seis gêneros. Ocorrem nas águas tropicais e subtropicais do Pacífico Oriental, no Caribe, na costa pacífica da América, na costa atlântica da América do Sul e no leste da Ásia, habitando as regiões entre marés e infralitoral. Os tegulíneos foram definidos taxonomicamente por apresentarem: (i) opérculo com o crescimento da borda curto; (ii) perda da habilidade de depositar carbonato de cálcio no opérculo; (iii) rádula com dente raquidiano sem uma cúspide secundária ou aba para prover uma fixação adicional na fita radular. O posicionamento do táxon dentro de Trochoidea nunca foi bem estabelecido e a posição sistemática dos grupos internos de tegulíneos nunca foi investigada como objetivo primário. O presente trabalho abordado no Capítulo 1 apresenta um estudo morfológico detalhado de alguns representantes de Tegulinae e Trochoidea visando testar a monofilia da subfamília, bem como elucidar o posicionamento filogenético dos gêneros que a compõem e seu posicionamento em Trochoidea. Todos os gêneros, exceto Catallocostoma, foram incluídos. As espécies polimórficas Agathistoma hotessierianum, A. patagonicum e A. viridulum foram compostas em subunidades monomórficas, totalizando o grupo-interno em 23 terminais. O grupo-externo incluiu 24 terminais, com representantes das famílias de Trochoidea, além de uma espécie de Pleurotomarioidea (Perotrochus atlanticus), considerada a raiz. Uma análise cladística foi realizada, com buscas heurísticas com pesos iguais e pesagem diferencial. O resultado da análise demonstrou a monofilia de Tegulinae, grupo-irmão de Prisogaster niger, alocada na família Turbinidae. Os gêneros formaram grupos monofilético, embora Tegula excavata não demonstrasse um posicionamento bem definido nas análises alternativas. As espécies polimórficas não foram consideradas como espécies nominais distintas, pois foi constatado que os caracteres que separam cada espécie em subamostra têm alto grau de plasticidade. Caracteres morfológicos foram testados pela primeira vez em um grupo hierarquicamente baixo em Trochoidea e tiveram valor significativo na definição de linhagens internas. O Capítulo 2 teve como objetivo inserir todos os táxons analisados no Capítulo 1, na análise filogenética de Caenogastropoda de Simone (2011). A análise resultou em Vetigastropoda monofilético. A parafilia de Zeugobranchia foi corroborada com outras hipóteses filogenéticas, bem como a monofilia de Trochoidea. As famílias Calliostomatidae, Trochidae, Turbinidae e Margaritidae não formaram um grupo monofilético. A monofilia de Tegulinae foi corroborada, grupo-irmão do clado Prisogaster niger+, bem como os gêneros Intistoma aureotinctum, Norrisia, Chlorostoma e Agathistoma. / Tegulinae encompasses 44 extant species belonging to six genera. They occur in tropical and subtropical waters of the Eastern Pacific, Caribbean, on the Pacific coast of America, Atlantic coast of South America and East Asia, inhabiting intertidal to shallow sublittoral areas. Tegulines are taxonomically defined by (i) a short growing edge of operculum, (ii) inability to calcify the operculum and (iii) rachidian tooth lacking a secondary cusp or flap providing additional attachment to the radular ribbon. A consensual placement of tegulines within Trochoidea has not yet been reached, and the systematic positions of the genera have never been investigated as a primary objective. A cladistics analysis of the subfamily based on detailed morphology is presented herein on Chapter 1, aimed at testing the groups monophyly. Additionally, the phylogenetic positions of the genera are investigated along with the phylogenetic position of Tegulinae within Trochoidea. The sampled ingroup included representatives of all genera except for Cantallocostoma; the polymorphic species Agathistoma hotessierianum, A. patagonicum and A. viridulum were subdivided into monomorphic taxa, totaling 23 ingroup terminals. The outgroup comprised 24 terminals including representatives of trochoidean families. The Pleurotomarioidea were represented by Perotrochus atlanticus, which was also used as root. Cladistics analysis included heuristic searches carried with equal and differential weighting. Results presented here indicate that Tegulinae are monophyletic, being sister to Prisogaster niger and belonging to the family Turbinidae. The genera studied herein were supported as clades, despite the non-consensual position of Tegula excavata between alternative hypotheses. Polymorphic species were considered non-distinct nominal species, since the characters that divide them into subsamples are highly plastic. Morphological characters were used for the first time to support a hierarchically low-level group for Trochoidea and had significant value in the definition of internal lineages. On Chapter 2, the analyzed taxa from the previous chapter were added to Simones (2011) phylogenetic hypothesis of Canogastropoda in order to investigate the phylogenetic position of Trochoidea in a broader scenario. The results support the monophylies of Vetigastropoda and Trochoidea, and indicate the paraphyly of Zeugobranchia, corroborating previous hypotheses. Tegulinae is a monophyletic group, sister to Prisogaster niger+, Intistoma aureotinctum, Norrisia, Chlorostoma and Agathistoma.
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Revisão sistemática do gênero Bunodosoma Verrill, 1899(Cnidaria: Actiniaria: Actiniidae) e estudo de populações do Atlântico Sul / Systematic review of the genus Bunodosoma Verrill, 1899 (Cnidaria: Actiniaria: Actiniidae) and study of populations from the South Atlantic Ocean

Beneti, Julia Silva 15 July 2016 (has links)
Bunodosoma é um gênero cosmopolita de anêmonas que apresentam pólipos grandes e conspícuos, sendo comuns em ambientes costeiros. Atualmente compreende 14 espécies válidas e, apesar de estas serem utilizadas em estudos filogenéticos dentro da ordem Actiniaria, não existem abordagens visando resolver os problemas intragenéricos, e o conhecimento da diversidade do gênero é limitado por problemas taxonômicos e de identificação. Dessa forma, é necessário que se estabeleçam os limites entre a variação inter e intraespecífica dos pólipos, e para isso devem-se integrar informações morfológicas e moleculares. As espécies B. cangicum, B. caissarum e B. zamponii, endêmicas do Atlântico Sul e com diversos registros ao longo da costa, são um interessante modelo para o estudo destas variações. Portanto, os objetivos desse projeto são: 1) realizar a revisão sistemática e propor uma hipótese filogenética para o gênero Bunodosoma com base em evidências moleculares; 2) explorar a viabilidade da utilização do marcador molecular ITS nos estudos de populações de anêmonas e testar outros marcadores nucleares que possam representar as diferenças genéticas inter e intraespecíficas; e 3) verificar a variabilidade morfológica (utilizando dados de tamanhos de cnidocistos) e molecular intraespecífica das espécies B. caissarum e B. cangicum. A revisão sistemática, apresentada no Capítulo 1, evidenciou que 14 espécies podem ser reconhecidas, apesar de o status taxonômico de três delas permanecer aberto a testes. A análise filogenética com os dados moleculares disponíveis não fornece evidência para o monofiletismo de Bunodosoma, que foi recuperado parafilético em relação a outras espécies da família Actiniidae. No Capítulo 2, as análises filogenéticas e filogeográficas com o marcador ITS forneceram suporte para o reconhecimento de dois clados: o primeiro composto por indivíduos de B. caissarum e o segundo por indivíduos de B. cangicum e B. zamponii. Apesar de se mostrar útil na delimitação de grandes grupos, o ITS é um marcador eficiente na delimitação de populações. Em relação à variação morfométrica dos cnidocistos, os resultados apresentados no Capítulo 3 demonstram que, caso bem empregados e analisados, alguns tipos de nematocistos podem ter valor taxonômico na delimitação de populações de anêmonas. O conjunto dos resultados do presente estudo contribuem para um melhor conhecimento da sistemática e biologia desses organismos, além de gerar subsídios para a compreensão de aspectos evolutivos da ordem Actiniaria / Bunodosoma is a cosmopolite genus of sea anemones of large and conspicuous polyps, common in costal environments. It currently comprises 14 species and, despite being employed in phylogenetic studies within the order Actiniaria, no study so far has tried to solve intrageneric problems in Bunodosoma, so the knowledge about the genus\' diversity is limited by problems of taxonomy and identification. Thus, it is necessary to establish the limits of inter and intraspecific variation of the polyps. To accomplish that, integrative studies using morphological and molecular data must be carried out. The species B. cangicum, B. caissarum, and B. zamponii are endemic of the South Atlantic Ocean. They represent an interesting model to study the aforementioned variation. Therefore, the goals of this study are: 1) to review the systematics and to propose a phylogenetic hypothesis for the genus Bunodosoma based on molecular evidence; 2) to explore the usage of the molecular marker ITS in population studies of sea anemones, as well as to test other nuclear regions that may show inter and intraspecific variation; and 3) to access the phenotypic (based on cnidocyst size variation) and molecular intraspecific variability of B. caissarum and B. cangicum. The systematic review, presented in Chapter 1, showed that there are 14 recognized species; three of them need further analyses. The molecular phylogenetic analysis did not provide evidences for the monophyly of Bunodosoma, which was recovered paraphyletic regarding other species of the family Actiniidae. In Chapter 2, the phylogenetic and phylogeographic analysis of ITS provided support to recognize two major clades: one composed by B. caissarum individuals and the other by individuals of B. cangicum plus B. zamponii. Despite been useful to delimit major groups, the ITS marker is not efficient to delimit populations. Regarding the morphometric variation of the cnidocysts, the results presented in Chapter 3 demonstrated that, when employed with caution, some types may present taxonomic value in population delimitation. The results of the present study contribute to a better understanding of the systematics and the biology of Bunodosoma, and provide support to the comprehension of evolutionary aspects of the order Actiniaria
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Miologia cefálica e filogenia de Nematogenyidae e Trichomycteridae (Siluriformes: Loricarioidea) / Não informado

Silva, Alessio Datovo da 02 October 2006 (has links)
Nematogenyidae é composto por uma única espécie endêmica do Chile Central; Trichomycteridae, seu grupo-irmão, é a segunda família mais diversificada de Loricarioidea e possui ampla distribuição pela região Neotropical. Estas famílias formam o clado mais basal de Loricarioidea e, por esta razão, são da maior importância para o entendimento das intra¬relações da superfamília, e desta com os demais siluriformes. Entretanto, muitas destas questões ainda não foram esclarecidas satisfatoriamente, especialmente dentro de Trichomycteridae. Vários fatores contribuem para esta situação, entre eles, o ainda escasso conhecimento de vários de seus sistemas morfológicos, como o muscular. Um estudo comparativo da miologia, guiado pela metodologia cladista, jamais foi feito até então com nenhum outro grande grupo de Siluriformes. A presente dissertação representa uma tentativa de solucionar aqueles problemas através de uma nova abordagem, a pesquisa da musculatura cefálica, principalmente de Nematogenyidae e Trichomycteridae. Este estudo apresenta um detalhado componente descritivo aliado a uma análise cladística rigorosa dos caracteres miológicos da região cefálica de Nematogenyidae e Trichomycteridae. Com relação à parte descritiva deste estudo, foram descobertos quatro músculos novos e observadas várias modificações na musculatura cefálica entre os grupos examinados. O levantamento de novos caracteres oriundos principalmente do estudo miológico acrescentou relevante informação ao cladograma destas famílias. O uso destes caracteres, juntamente com a revisão de grande parte daqueles da literatura, corroborou fortemente alguns arranjos anteriores assim como produziu novas hipóteses sobre as relações internas de Trichomycteridae. Nematogenyidae foi corroborado como sendo o grupo-irmão de Trichomycteridae; Copionodontinae e Trichogeninae são sucessivos grupos-irmãos na base de Trichomycteridae; a natureza não monofilética de Trichomycterinae foi mais uma vez confirmada; e Pareiodon foi excluído de Stegophilinae e a subfamília Pareiodontinae deveria ser reutilizada. / Nematogenyidae is composed of a single species endemic to Central Chile; Trichomycteridae, its sister group, is the second most diversified family of Loricarioidea, and has a broad distribution throughout the Neotropical Region. These families form the most basal clade of the Loricarioidea and are therefore of great importance to understand its intrarrelationships and the relationships between it and remaining siluriforms. However, several of these questions remain to be satisfactorily resolved, especially within the Trichomycteridae. Several factors contribute to this problematic situation, among which is the poor state of knowledge of a number of morphological systems, such as their myology. A comparative study of myology, guided by cladistic methodology, has not been attempted for any large catfish group. The present dissertation is an attempt to solve these problems by means of a new approach based on the scrutiny of cephalic myology, mainly of the Nematogenyidae and Trichomycteridae. This study presents a detailed descriptive component allied to a rigorous cladistic analyses of myological characters of the cephalic region of the Nematogenyidae and Trichomycteridae. Concerning the descriptive part of this study, four new muscles were discovered and several modifications in the cephalic muscles within the examined groups were observed. The new characters sampled, mainly from the myological study, added valuable information to the cladograms of these families. The use of these features, along with a review of most characters employed in the literature, strongly corroborated some previous arrangements and produced a new hypotheses on the relationships within the Trichomycteridae. Nematogenyidae was confirmed as the sister group of Trichomycteridae. Copionodontinae and Trichogeninae are the basal successive sister groups of the remaining Trichomycteridae. The non-monophyletic nature of the Trichomycterinae was supported as in previous studies. Pareiodon was removed from the Stegophilinae and the subfamily Pareodontinae should be resurrected for it.

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