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Caracterização da diversidade genética de populações naturais de tambaqui (Colossoma macropomum) através de marcadores moleculares: uma contribuição para conservação da espécie.

Santos, Maria da Conceição Freitas 24 September 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-11T13:38:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Conceicao.pdf: 3479286 bytes, checksum: e423419bc970a5fbce6d4829446d589e (MD5) Previous issue date: 2010-09-24 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The floodplain ecosystem shelters and supports most of the fish stocks of commercial importance, such as the tambaqui, Colossoma macropomum, which is considered a key species of this ecosystem. This fish is the largest characin of the Amazon and it is highly appreciated as food by the local population. Currently the tambaqui represents 70% of the regional pisciculture, but despite increasing aquiculture output, wild populations have been experiencing severe over-exploitation. To manage natural stocks of tambaqui it is necessary to access a range of information from diverse areas of knowledge, including genetics. It is thus of fundamental importance to access levels of genetic variability and how this variability is distributed throughout the Amazon region where the species occurs. This information is necessary to guide management strategies and conservation of this species. To obtain such information, mitochondrial (control region and ATPase gene) and nuclear (microsatellites) molecular markers were used. In this study 14 highly polymorphic microsatellite loci for the tambaqui were developed. These molecular markers were successfully transferred to other species of serrasalmids. For the genetic characterization of the tambaqui, 21 localities in the Amazon basin were sampled. We sequenced 1561pb (control region + ATPase gene) from 539 individuals finding 444 haplotypes, of which 440 were unique. The haplotype diversity was high and relatively homogeneous among all localities, however diversity was smallest in Porto Velho. Data from 12 microsatellite loci were collected from 604 individuals, showing an average of 21,4 alleles per locus. Total HE was 0,78 and heterozygosity levels were homogeneous among sampled localities. Porto Velho and Guaporé showed lower values of HE. These results suggest high levels of genetic variability in the tambaqui. AMOVA and other tests to detect population structure based on both markers indicated that within the Brazilian Amazon basin, the tambaqui comprises a single large population, supported by high gene flow between localities. These results indicate that species management in this area can be unified. Considering the entire sampling scheme, the data suggest a metapopulation scenario between the Brazilian and Bolivian basins, with low genetic differentiation between the basins and restricted gene flow due to isolation by distance. The rapids of the Tapajós and Madeira Rivers are not barriers to gene flow among population samples of tambaqui. A demographically stable population was detected in the Bolivian basin and a historical demographic expansion in the Amazon basin, supported by the large number of haplotypes and the presence of unique alleles in Brazilian localities. The migration rates were higher from white water tributaries to the main channel, while the opposite was true for the clear waters of Tapajós River. The effective population size (Ne) was greater in the channel, and in Jacareacanga and Boca do Acre. Genetic effects of over-exploitation were not detected in the tambaqui due to the high genetic diversity found. However, these findings are showing the historical status compatible with a large effective population size of the species in the past since the time of over-exploitation is still be short to be registered genetically. / O ecossistema de várzea amazônica abriga e sustenta a maior parte dos estoques de peixes de importância comercial, como o tambaqui Colossoma macropomum. Este peixe é o maior caracídeo da Amazônia e é muito apreciado como alimento pela população local. Atualmente corresponde com 70% da piscicultura regional, mas apesar da crescente produtividade cultivada, esta espécie na natureza vem experimentando uma intensa sobre-exploração. Para gerenciar os estoques naturais de tambaqui é necessário acessar um conjunto de informações de diversas áreas do conhecimento e, concernente à genética, é de fundamental importância acessar a variabilidade genética e a forma como esta variabilidade está distribuída ao longo da região Amazônica. Estas informações são importantes para direcionar estratégias de manejo e conservação para espécie. Para obter tais informações, foram utilizados marcadores moleculares mitocondriais (região controle e gene da ATPase) e nucleares (microssatélites). No presente estudo foram isolados 14 locos de microssatélites altamente polimórficos para tambaqui. Estes marcadores moleculares foram transferidos com sucesso para outras espécies de serrasalmídeos. Para a caracterização genética do tambaqui, 21 localidades foram amostradas na bacia Amazônica, e 1561 pb (região controle + gene da ATPase) foram seqüenciados em 539 indivíduos. Foram encontrados 444 haplótipos, sendo que 440 foram únicos. A diversidade haplotípica foi alta e relativamente homogênea para todas as localidades, mas foi menor em Porto Velho. Para dados de microssatélites foram utilizados 12 locos em 604 indivíduos, sendo encontrada uma média de 21,4 alelos por loco. A HE total foi de 0,78, sendo em geral, homogênea para as localidades amostrada. Para Porto Velho e Guaporé a HE apresentou os menores valores. Estes resultados sugerem altos níveis de variabilidade genética em tambaqui. AMOVA e as demais análises para detectar estrutura populacional, com base em ambos marcadores, indicaram que dentro da bacia Amazônica brasileira o tambaqui forma uma única e grande população, suportado por um intenso fluxo gênico entre as localidades. Estes resultados indicam que o manejo da espécie nesta área pode ser unificado. Considerando toda a amostragem do estudo, evidenciou-se um cenário de metapopulação entre as bacias hidrográficas brasileiras e bolivianas. As corredeiras presentes nos rios Tapajós e Madeira não representam uma barreira ao fluxo gênico entre as amostras populacionais de tambaqui. Uma estabilidade populacional foi detectada para a bacia Boliviana e uma expansão para a bacia Amazônica, suportado pelo grande número de haplótipos únicos e a presença de alelos exclusivos nas localidades brasileiras. As taxas de migração foram maiores das localidades dos tributários de água branca para a calha principal, e desta para o rio Tapajós. Os dados genéticos podem estar configurando a migração reprodutiva ou uma dinâmica nos movimentos da espécie. O tamanho efetivo populacional (Ne) foi maior na calha principal, no rio Tapajós e no rio Purus. Não foram detectados sinais de sobreexploração devido à alta diversidade genética encontrada. No entanto estes achados podem estar mostrando um status histórico da espécie compatível a um enorme tamanho efetivo populacional no passado ou que o tempo de sobreexploração pode ainda ser curto para um registro genético.
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Efeito da utilização de gelo ozonizado na qualidade do tambaqui resfriado durante armazenamento

Carvalho Junior, José dos Santos Gomes, 92-98160-9473 25 September 2017 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-11-16T18:06:58Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-11-16T18:07:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-16T18:07:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2017-09-25 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The tambaqui (Colossoma macropomum) is the native species most produced in Brazilian territory. In the state of Amazonas, it stands out for the preference of the consumers and for its role in the region’s economy. However, marketsellers, supermarkets, retailers and producers find it difficulties on maintain the quality of this fish when stored on ice for a reasonable time. The objective of this research was to evaluate the influence of ozonated ice on the shelf life of the cooled whole tambaqui stored for 35 days by physicochemical, microbiological and sensorial analysis. The physicochemical analysis established the Total Volatile Bases (TVB-N), determination of pH, Thiobarbituric Acid Reactive Substances (TBARS); in the microbiological analysis were researched AerobicHeterotrophic Mesophyll Bacteria (AHMB), AerobicHeterotrophicPsychotropicBacteria (AHPB), Totaland ThermotolerantColiforms, coagulase-positive Staphylococcus and Salmonella spp., besides the sensory analyses (QIM). Based on the results, the shelf life of up to 28 days for the whole tambaqui stored on ice was determined. All the analysis presented significant difference (p<0.05) in relation to the storage time, but the TVB-N was the only indicator that presented significant differences of the control treatment. Further researches are suggested with the use of ozone and the quality of the ice used for fish storage, which may become a potential source of contamination. / O tambaqui (Colossoma macropomum) é a espécie nativa mais produzida em território nacional. No Amazonas, se destaca pela preferencia dos consumidores e pelo seu papel na economia da região. Entretanto,os feirantes, supermercados, varejistas e produtores encontram dificuldades em manter por tempo razoável a qualidade desse pescado quando armazenado em gelo. O objetivo desse trabalho foi avaliar por meio de análises físico-químicas, microbiológicas e sensoriaisa influência da utilização do gelo ozonizado sobre o tempo de vida útil do tambaqui inteiro resfriado, armazenadosdurante 35 dias.As análises físico-químicas se constituíram de Bases Voláteis Totais (NBVT), determinação do pH, Substâncias Reativas ao Ácido Tiobarbitúrico (TBARS); nas análises microbiológicas pesquisaram-seBactériasHeterotróficas AeróbiasMesófilas (BHAM), Bactérias HeterotróficasAeróbias Psicrotróficas (BHAP), Coliformes Totais e Termotolerantes, Staphylococcus Coagulase Positiva e Salmonella spp.e a análise sensorial (MIQ).Com base nos resultados determinou-se o tempo de vida útil de até 28 dias para o tambaqui inteiro armazenado em gelo. Todas as análises apresentaram diferençasignificativa(p<0,05) em relação ao tempo de armazenamento, porém o N-BVT foi o único indicador que apresentou diferençasignificativa do tratamento controle. Sugere-semais pesquisas com a utilização do ozônio e sobre a qualidade do gelo utilizado para armazenamento do pescado, o qual pode se tornar uma potencial fonte contaminadora.
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Razão entre ômega-6/ômega-3, AGPI/AGS e caracteriazação físico-química do óleo de Colossoma macropomun (tambaqui) cultivados no Estado de Roraima

Hamilton Hermes de Oliveira 25 November 2008 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nesse trabalho foi realizado o estudo das características físico-químicas, análises qualitativas e quantitativas do óleo de filé de peixe da espécie Colossoma macropomum (tambaqui) criado no regime semi-intensivo em quatro pontos do Estado de Roraima, como também, apresentar as razões entre os ácidos graxos insaturados das séries ômega 6 e ômega 3. Os municípios de Alto Alegre, Bonfim e Boa Vista com as localidades do Uraricoera e Passarão foram escolhidas porque possuem pontos estratégicos que favorecem a criação dessa espécie e estão locados os maiores produtores de pescados do Estado. Nas análises do filé de peixe das quatro localidades, obteve-se como resultados médios: a umidade de 68,555,85 % e 6,572,41 % de lipídios totais. Nas análises físico-químicas do óleo de filé do peixe, obteve-se como resultado um valor médio para a densidade a 25 C de 0,9070,002 g/cm3; ponto de fusão 29,000,82 C; substâncias orgânicas insolúveis em éter 7,070,009 %; rendimento 7,072,58 %; lipídios totais 6,572,41 %; teor de cinzas 0,0420,01 %; umidade 0,0510,005 %; índice de acidez 3,752,72 mg de KOH/g de óleo; acidez em ácido oléico 1,881,36 %; índice de iodo 147,653,04 g I2 / 100 g de óleo; índice de refração 1,4590,001 a 40 C e viscosidade utilizando o modelo exponencial proposto por Andrade (1930) onde se ajustou bastante aos dados experimentais com um coeficientes de correlação superiores a 94 %. Foi realizada a análise termogravimétrica em atmosfera dinâmica de nitrogênio a um intervalo de temperatura de 20 a 600 C onde foi observado e comparado o comportamento térmico. Na identificação e quantificação dos ácidos graxos, foi utilizado um cromatógrafo gasoso, onde foram feitas as comparações dos picos das amostras com os ácidos graxos metilados (Supelco 37) todos nas mesmas condições de processamento no qual foram identificados quatro ácidos graxos majoritários de maior concentração: ácido oléico (C18:1&#969;9), ácido palmítico (C16:0), ácido linoléico (C18:2&#969;6c) e ácido esteárico (C18:0) com média de 24,831,68 %, 17,881,91 %, 13,862,45 % e 9,170,78 % respectivamente, para os peixes das quatro localidades. Os ácidos graxos das séries ômegas-6 e ômegas-3 foram identificados com 20,491,62 % e 2,450,51 % respectivamente, resultando uma razão igual a 8,58; as concentrações médias de ácidos graxos saturados e insaturados encontradas foram 28,562,38 % e 56,802,37 %, respectivamente / In this paper it was studied the physical-chemical characteristics, qualitative and quantitative analysis of the oil of steak of the fish Colossoma macropomum (tambaqui), which is grown in a semi-intensive regime, in four different places in the State of Roraima. This paper also presents the ratio between unsaturated fatty acids of the omega-6 and omega-3 series. The cities of Alto Alegre, Bonfim and Boa Vista as well as the villages of Uraricoera and Passarão were chosen in this study because they present strategic points that favor the growing of this fish species and it is where the biggest producers of fish in the state are located. In the analysis of the oil of steak of tambaqui fish, the results obtained were: humidity of 68,555,85 % and 6,572,41 % of total lipid. In the physical-chemical analysis of the oil of fish steak, it was obtained as result an average value for density to 25oC of 0,9070,002 g/cm3; fusion point of 29,000,82 oC; insoluble organic substances in ether 7,070,009 %; rendiment 7,072,58 %; total lipid 6,572,41 %; ash amount 0,0420,01 %; humidity 0,0510,005 %; acidity rate 3,752,72 mg of KOH/g of oil; acidity in oil acid 1,881,36 %; iodine rate 147,653,04 g I2/100 g of oil; refraction indice to 40 oC 1,4590,001 and viscosity using the exponential model proposed by Andrade (1930) pretty adjusted to the experimental data with correlation coefficient above 94 %. It was made thermal gravimetric analysis in nitrogen atmosphere in a break of temperature from 20 to 600 oC where the finetil fatty behavior was observed and compared. In the identification and qualification of the fatty acids, it was used gas chromatograph, where it was made the comparisons of the highest points of the samples with metylated fatty acids (Supelco 37), all of them in the same processing conditions in which four major fatty acids of bigger concentration were identified: linoleic acid (C18:1&#969;9); palmitic acid (C16:0), linoleic (C18:2&#969;6) and estearic acid (C18:0) with an average of 24,831,68 %, 17,881,91 %, 13,862,45 % e 9,170,78 %, respectively to the fish found in the four locations. The fatty acids of the omega 6 and omega 3 series were identified 20,491,62 % and 2,450,51 %, respectively, resulting in ratio equal to 8,56; the average concentrations of saturated and unsaturated fatty acids found were 28,562,38 % and 56,802,37 %, respectively
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Avaliação de partes distintas do tambaqui (colossoma macropomun) e aproveitamento de seus resíduos na produção de biodiesel

Sueli Caetano de Sousa 29 March 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Devido à necessidade de ampliação de oferta de energia, existe uma crescente busca por novas matérias primas como fontes de energia renovável. Os óleos vegetais, as gorduras animais, óleos de cozinha recuperado e resíduos da produção pesqueira estão sendo avaliados. O presente trabalho teve como objetivo avaliar, através de diferentes métodos de extração, o rendimento do óleo de diversas partes do tambaqui (Colossoma macropomum), inclusive de seus resíduos, determinar a composição em ácidos graxos dos óleos obtidos e produzir biodiesel aproveitando os resíduos deste peixe. Neste trabalho avaliou-se métodos de extração de óleo à frio, com material fresco utilizando o método de Folch e extração com hexano; extração à frio, com material desidratado utilizando a metodologia modificada de Duarte e por fim a extração convencional por Soxhlet. Os óleos obtidos foram inicialmente analisados por cromatografia em camada delgada (CCD) e em seguida convertidos a seus respectivos ésteres metílicos de ácidos graxos. Extraiu-se também óleo das vísceras de tambaqui, através de aquecimento em estufa à 60C. O óleo usado na produção de biodiesel foi submetido a análises físico-químicas, em seguida esterificado pelo método de Fischer com metanol, para redução da acidez, e depois submetido à transesterificação alcalina. A composição em ácidos graxos, dos óleos obtidos e do biodiesel, foi determinada através da cromatografia à gás utilizando detector de ionização por chama (CG-DIC). As propriedades do biodiesel foram determinadas de acordo com as orientações da Agência Nacional de Petróleo, Biocombustíveis e Gás Natural (ANP) através da resolução de N 7 de 2008. De acordo com os resultados obtidos, o método de extração de óleo que apresentou o melhor rendimento foi a metodologia modificada de Duarte (12,31%) enquanto que o método de Folch e a extração com hexano apresentaram rendimentos inferiores à 2%. Através da extração por Soxhlet, usando amostras diversificadas do tambaqui (filé, cabeça e mistura dos resíduos), obteve-se rendimentos de 42,48%, 42,87% e 41,87%, respectivamente. Das vísceras de tambaqui, através do aquecimento em estufa, obteve-se rendimento de 46,78% de óleo. Os resultados físico-químicos indicaram acidez elevada para o óleo da mistura dos resíduos (1,62%) em relação ao óleo das vísceras (0,49%). O índice de saponificação para o óleo das vísceras foi de 163,86 mg de KOH/g, inferior ao encontrado na literatura para o óleo de peixe (189-193). Os resultados cromatográficos apresentaram diferenças tanto na composição química dos óleos e do biodiesel, quanto na proporção de seus constituintes. Os ácidos graxos majoritários determinados nas amostras foram os ácidos oléico (C18:1 &#969;-9) e palmítico (C16:0). O biodiesel apresentou aspecto, massa especifica, viscosidade cinemática dentro dos limites determinado pela ANP, sendo que o ponto de fulgor determinado foi bem acima do mínimo recomendado, um indicativo que o biocombustível produzido apresenta baixo risco de inflamabilidade, no entanto, o índice de acidez e a estabilidade oxidativa encontraram-se fora dos parâmetros pré-estabelecidos. Portanto, o óleo das vísceras de tambaqui mostra-se promissor para a produção de biodiesel, porém existe a necessidade de ampliar-se o estudo. / Due to the need to expand the energy supply, there is an increasing search for renewable energy. Vegetable oils, animal fats, recovered cooking oils and wastes from fish production are being appraised. The present work aimed evaluate, by different extraction methods, the yield of oil from different parts from the Tambaqui (Colossoma macropomum), including its wastes, determine the fatty acid composition of oils obtained and produce biodiesel taking advantage of this fish wastes. In this work we evaluate methods of oils in cold extraction, with fresh material using the Folch method and extraction with hexane; Cold extraction, using dehydrated material utilizing the Duarte modified methodology and finally the conventional Soxhlet extraction. The oils obtained were initially analyzed by thin layer chromatography (TLC) and immediately converted to the respective methyl esters of fatty acid. It was also extract oils from the Tambaqui offal, by heating in a stove at 60 C. The oil used in biodiesel production was submitted to physicochemical analysis, immediately esterified by the Fischer method using methanol, to reduce its acidity, and immediately submitted to alkaline transesterification. The fatty acid composition, from de oils obtained and from biodiesel, was determined by gas chromatography utilizing flame ionization detector (GC-FID). The biodiesel properties were determined according to instructions from the Brazilian National Agency of Petroleum, Natural Gas and Biofuels (ANP) by the resolution N 7, 2008. According to the results obtained, the oil extraction method that presented the best yield was the Duarte modified methodology (12.31%) while the Folch method and the extraction with hexane presented yield of less than 2%. By Sokhlet extraction, using diverse samples from Tambaqui (fillet, head and wastes mixture), it was obtained a yield of 42.48%, 42.87%, 41.87%, respectively. From the Tambaqui offal, by the heating in a stove, it was obtained a yield of 46.78% of oil. The physicochemical results indicated hight acidity for the wastes mixture oils (1.62%) in relation to offal oil (0.49%). The saponification value for offal oil was 163.86 mg of KOH/g lower than that found in the literature for fish oil (189-193). The chromatography results present differences both in biodiesel oils chemical composition, as in this constituents proportion. The major fatty acid determined in the samples were oleic (C18:1 &#969;-9) and palmitic (C16:0). The biodiesel presented aspect, bulk density, kinematic viscosity within the limits set by the ANP, being that the determined flash point was well above the recommend minimum, an indication that biofuel produced presents a low risk of flammability, however the acid value and the oxidative stability found themselves out of the pre-established parameters. Therefore, the Tambaqui offal oil shows promise for biodiesel production, although there is a need to expand the study.
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Caracterização do desenvolvimento embrionário e desempenho de pós-larvas de tambaqui (Colossoma macropomum, Cuvier, 1818) alimentados com diferentes dietas

Almeida, Charlle Andrerson Lima de 27 February 2014 (has links)
The objective of monitoring the embryonic development of the tambaqui (Colossoma macropomum) through induced reproduction. Embryonic development presented the following sequence of events, (minutes after fertilization-MAF) when incubated at 28, 7 0C. The five MAF, the cytoplasm became more evident in the animal pole, forming a disc of cytoplasm, highlighting an increase in perivitelline space. The cleavagens occurred between 25 and 60 MAF. With 87 MAF, it was observed the morula stage, characterized by the presence of more than 64 blastomeres. Was observed with 140 MAF, the blastula stage, characterized by presenting dome above the mass of the yolk. At gastrula stage, can be viewed epibolia movement of embryonic cells, observed with 167 MAF, when approximately 30% of the yolk was covered. With 292 MAF had around 80 to 90% of epibolia and with 325 MAF, it was observed the end of the movement, which was completed with the formation of a portion called yolk plug. At the beginning of the Histogenesis and organogenesis, with 370 MAF, noted the development of cephalic regions, tail and development of the first somitos. The optic vesicle became more obvious MAF 440, occurring simultaneously with the increase in the number of somitos. The tail has been partially disengaged from the vitelline sac to 550 MAF. The embryo has swimming movement inside the chorionic membrane until the moment in which the larvae broke out and became free. Hatching of larvae occurred 774 MAF (12:54h), the equivalent for 360 hours-degree. / Objetivou-se acompanhar o desenvolvimento embrionário do tambaqui (Colossoma macropomum) por meio da reprodução induzida. O desenvolvimento embrionário apresentou a seguinte sequência de eventos, (minutos após a fertilização - MAF), quando incubados a 28,70C. Aos cinco MAF, o citoplasma tornou mais evidente no polo animal, formando um disco de citoplasma, destacando um aumento do espaço perivitelínico. As clivagens ocorreram entre 25 e 60 MAF. Com 87 MAF, foi observado o estágio de mórula, caracterizada pela presença de mais de 64 blastômeros. Foi observado com 140 MAF, a fase de blástula, caracterizada por apresentar forma de cúpula acima da massa do vitelo. Na fase de gástrula, pode ser visualizado o movimento de epibolia das células embrionárias, observado com 167 MAF, quando aproximadamente 30% do vitelo foi recoberto. Com 292 MAF havia cerca de 80 a 90% de epibolia e com 325 MAF, foi observado o final do movimento, que se completou com a formação de uma porção denominada de tampão vitelínico. No início da fase de histogênese e organogênese, com 370 MAF, notou-se o desenvolvimento das regiões cefálica, caudal e desenvolvimento dos primeiros somitos. A vesícula óptica tornou se mais evidente 440 MAF, ocorrendo simultaneamente ao aumento no número de somitos. A cauda demonstrou-se parcialmente desprendida do saco vitelínico aos 550 MAF. O embrião apresentou movimento de natação dentro da membrana coriônica até o momento em que a larva eclodiu e tornou-se livre. A eclosão das larvas ocorreu 774 MAF (12h54min), o equivalente há 360 horas-grau.
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Seleção de marcadores moleculares em associação a características de interesse produtivo no tambaqui (Colossoma macropomum) /

Ariede, Raquel Belini. January 2017 (has links)
Orientador: Diogo Teruo Hashimoto / Banca: Fabio Porto Foresti / Banca: Rafael Vilhena Reis Neto / Resumo: O Tambaqui (Colossoma macropomum), natural das bacias do rio Amazonas e do rio Orinoco, possui características favoráveis ao sistema de cultivo e boa aceitação de mercado. Contudo, há poucos estudos genéticos realizados com esta espécie, especialmente de melhoramento genético. Para a construção de um mapa genético desta espécie, é necessário o desenvolvimento de um elevado número de marcadores moleculares. Desta forma, este estudo teve como objetivo caracterizar microssatélites gene-associados e neutros (não gênicos), obtidos por Next Generation Sequencing (RNA-seq e Whole Genome Shotgun - WGS, respectivamente), para serem disponibilizados em estudos de associação com QTLs (Quantitative Trait Loci) e construção de um mapa genético. De modo geral, a avaliação de 200 marcadores (100 de cada conjunto) resultou em 45 loci polimórficos. Do conjunto de marcadores RNA-seq, as heterozigosidades observada e esperada (HO e HE) variaram de 0,09 a 0,73, e 0,09 a 0,85, respectivamente. Do conjunto WGS, HO e HE variaram de 0,33 a 0,95, e 0,28 a 0,92, respectivamente. Posteriormente, alguns microssatélites foram testados em três famílias de C. macropomum para buscar associações com características de resistência à bactéria e crescimento. Para o estudo de resistência, três famílias (n = 120), foram submetidas ao desafio bacteriano com Aeromonas hydrophila. Os dados do desafio apresentaram diferenças significativas nos tempos de morte e taxa de mortalidade entre as famílias. O crescimento foi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Tambaqui (Colossoma macropomum), is a fish species of the Amazon and Orinoco rivers, with favorable traits to the production system and market acceptance. However, there are few genetic studies with this species, especially genetic improvement. For the construction of a genetic map of this species, the development of a high number of molecular markers is necessary. Thus, this study aimed to characterize gene-associated and neutral (non-gene) microsatellites obtained by Next Generation Sequencing (RNA-seq and Whole Genome Shotgun - WGS, respectively), to be available in association studies with Quantitative Trait Loci (QTLs) and construction of a genetic map. Overall, the evaluation of 200 markers (100 of each set) resulted in 45 polymorphic loci. In the RNA-seq data, the observed and expected heterozygosity (Ho and He) ranged from 0.09 to 0.73, and 0.09 to 0.85, respectively. In the WGS data, Ho and He ranged from 0.33 to 0.95, and 0.28 to 0.92, respectively. Subsequently, some microsatellites were tested in three families of C. macropomum to seek associations with bacterial resistance and growth characteristics. For the resistance study, three families (n = 120) were submitted to the bacterial challenge with Aeromonas hydrophila. The challenge data presented significant differences in time of death and mortality rate among the families. Growth was evaluated by morphometric measures and weight, and all the characteristics were significantly correlated (p < 0.01). Microsatelli... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Mudanças climáticas previstas para o final do século afetam o desempenho e o desenvolvimento esquelético de larvas de tambaqui (Colossoma macropomum) /

Lopes, Ivã Guidini. January 2016 (has links)
Orientador: Maria Célia Portella / Coorientador: Adalberto Luis Val / Banca: Alzira Miranda de Oliveira / Banca: Lizandra Amoroso / Resumo: O aumento das emissões de gases de efeito estufa compõe uma das principais causas do aquecimento global. As mudanças no clima decorrentes de tal fator vêm ocorrendo em grau cada vez mais acelerado, afetando a dinâmica ambiental e, consequentemente, as espécies viventes. Dentre os biomas afetados, a região Amazônica está especialmente sujeita a impactos negativos, haja visto o desmatamento, o regime de chuvas sazonal e as ingerências antropogênicas locais. Logo, as espécies aquáticas nessa região poderão ser afetadas devido ao aumento das temperaturas médias e acidificação dos corpos d'água. O presente estudo teve por objetivo avaliar possíveis impactos das mudanças climáticas previstas para o final do século sobre o crescimento e o desenvolvimento inicial de uma importante espécie íctica Amazônica, o tambaqui, por meio de avaliações de desempenho zootécnico e do acompanhamento inicial do processo de osteogênese e aparecimento de anomalias esqueléticas. Larvas recém-eclodidas foram dispostas em aquários com capacidade para nove litros (densidade inicial de 35 larvas/L), em sistema de recirculação de água. Cada conjunto de 10 aquários estava localizado em quatro salas climatizadas com controle em tempo real de temperatura, umidade e concentração de CO2, representando três cenários de mudanças climáticas previstos pelo IPCC: brando (B1), moderado (A1B) e drástico (A2), além da sala controle, a qual representava o cenário atual (Atual). O experimento teve duração de 16 dias, nos quais foram realizadas amostragens periódicas das larvas. Após aquisição dos dados biométricos, as larvas passaram pelo processo de diafanização, de modo a avaliar o desenvolvimento ósseo inicial e o aparecimento de anomalias esqueléticas. A exposição aos cenários de mudança climática resultou em baixa sobrevivência das larvas, principalmente nos cenários A1B e A2. Os índices de desempenho zootécnico das... / Abstract: Increasing greenhouse gases emissions make up one of the main causes of global warming. Climatic changes arising from such factors have been occurring in an accelerated degree, affecting environmental dynamics and, consequently, the living species. Among all affected biomes, the Amazon region is particularly subjected to adverse impacts, such as deforestation, seasonal precipitation and negative anthropogenic interferences present locally. Hence, Amazonian aquatic species may be affected due to the increase in average temperatures and water acidification. This study aimed at evaluating possible impacts of predicted climate change on the initial growth and development of an important Amazonian fish, the tambaqui, by means of growth performance and by monitoring the initial osteogenic process and the emergence of skeletal abnormalities. Newly hatched tambaqui larvae were placed in 9L tanks (initial density of 35 larvae/L), displayed in water recirculation system. Each system containing 10 tanks was located in four conditioned rooms with real-time control of temperature, humidity and CO2 concentration, representing three climate change scenarios predicted by the IPCC: mild (B1), moderate (A1B) and drastic (A2), besides the control room, representing the current scenario (Atual). The experiment lasted for 16 days, in which periodic samplings were taken. After biometric data acquisition, the larvae underwent a bone staining process, in order to access osteogenesis process and to verify skeletal abnormalities. The exposure to climate change scenarios resulted in low survival, mainly in A1B and A2. Productive performance of B1 and A1B larvae were higher when compared to Atual and A2 scenarios, with the exception of allometric condition factor, higher in Atual and A1B. However, skeletal analysis revealed high incidence of abnormalities in larvae subjected to A1B and A2 scenarios, due to the combination between temperature rise and water ... / Mestre
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Identificación de monogeneos en juveniles de Colossoma macropomum “gamitana” y Piaractus brachypomus “paco” procedentes del distrito de Tambopata, Madre de Dios

Cayulla Quispe, David Benoni January 2018 (has links)
En el Perú, Colossoma macropomum “gamitana” y Piaractus brachypomus “paco” son cultivados en las regiones de Loreto, San Martín, Madre de Dios, Ucayali y Cusco, son especies de peces de importancia económica y nutricional. El objetivo de este trabajo fue identificar las especies de monogeneos encontrados en juveniles de P. brachypomus y C. macropomum provenientes del distrito de Tambopata, Madre de Dios, así como determinar y comparar la prevalencia y abundancia parasitaria en ambos hospederos. El material ictiológico se adquirió de piscicultores del Mercado modelo de Puerto Maldonado, Tambopata. El muestreo se realizó en los meses de enero y febrero de 2017. Los especímenes fueron colectados en solución salina y fijados en formol al 5%, para la tinción se usó Tricrómica de Gomori y se montaron en bálsamo de Canadá. El medio de Hoyer se utilizó para observar las estructuras esclerotizadas. La prevalencia parasitaria fue de 64% (9/14) para C. macropomum encontrándose parasitado con los monogeneos Anacanthorus spathulatus (64,3%), Anacanthorus penilabiatus (64,3%), Notozothecium janauachensis (28,6%), Mymarothecium peruvianus n. sp. (35,7%) y Mymarothecium tambopatensis n. sp. (28,6%); para P. brachypomus se obtuvo una prevalencia parasitaria de 92,9% (13/14) y se halló a A. spathulatus con 14,3%, A. penilabiatus 42,9% y Mymarothecium viatorum 92,9%. De las seis especies registradas, M. viatorum presentó la mayor prevalencia en P. brachypomus, seguido por A. spathulatus y A. penilabiatus en C. macropoum, estos últimos fueron comunes en ambas especies de peces. Se identificaron dos nuevas especies de monogenos de la familia Dactylogiridae del género Mymarothecium: M. peruvianus y M. tambopatensis, ambas halladas en C. macropomum; además, se registra por primera vez para el Perú a N. janauachensis en C. macropomum y A. penilabiatus en P. brachypomus y C. macropomum. / Tesis
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Influência do LHRH comum na ovulação induzida do tambaqui Colossoma macropomum (Cuvier) (Characiforme,Characidae), em diferentes fotoperíodos

MUNIZ, José Antônio Salgado de Moura 13 March 2006 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-14T16:32:58Z No. of bitstreams: 1 Jose Antonio Salgado Moura Muniz.pdf: 595648 bytes, checksum: 22b6683ac5757dc28cc0eed805a97b85 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-14T16:32:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose Antonio Salgado Moura Muniz.pdf: 595648 bytes, checksum: 22b6683ac5757dc28cc0eed805a97b85 (MD5) Previous issue date: 2006-03-13 / Tambaqui Colossoma macropomum is one of the most important fishes in the brazilian fish culture. Since it is an amazonic migrating fish, its ovulation and spawning do not occur in captivity; therefore the induced reproduction is this fish is always needed. The present work investigated the effects of the common LHRH on the ovulation in tambaqui kept in different photoperiods. Seventeen mature females and sixteen males were used in the investigation. Females were induced to ovulate with the common LHRH, under two different photoperiods: In photoperiod A, the first hormonal injection started in later afternoon, while in the photoperiod B it started at early morning time. In each group, the second hormonal injection was done 12-13 after first injection. The total concentration of the LHRH applied in the female fish varied from 500-1200 μg/fish. All male received a single dose of 50-100 μgLHRH/fish. No ovulation occurred in the females of the photoperiod A, while all females in the photoperiod B, ovulated. There was statistic difference in the levels of the 17α OH-P hormone between the two groups, during the considered period of latency of the inducer hormone. The results appoint to an existence of a photoperiodic cue, which can favor the occurrence of the ovulation in tambaqui, when is induced with the common LHRH of veterinary use. / Devido às excepcionais características, o tambaqui, Colosoma macropomum, é dos peixes mais importantes na piscicultura brasileira. Por ser um peixe reofílico, não desova naturalmente em cativeiro, o que se faz necessária que a sua ovulação seja induzida artificialmente. No presente trabalho investigou-se os efeitos do LHRH comum na ovulação induzida do referida espécie em diferentes regimes fotoperiódicos. Utilizaram-se 17 fêmeas e 16 machos maduros, as quais foram induzidas com hormônio sintético LHRH comum (gonadorrelina) nos seguintes fotoperíodos: No fotoperiódico A, a indução hormonal iniciou-se à tardinha, enquanto no fotoperíodo B iniciou-se pela manhã. Em ambos os grupo, a dosagem hormonal decisiva aconteceu entre 12-13 horas após a primeira injeção. As concentrações totais nas fêmeas variou entre 500-1200 μgLHRH/peixe. Os machos receberam dosagem única de 50-100 μgLHRH/peixe. Não houve ocorrência da ovulação no fotoperiódico A, enquanto todas as fêmeas do fotoperíodo B, ovularam. Os níveis do hormônio 17α OH-P plasmático foram estatisticamente diferentes entre os dois grupos durante o considerado período de latência do hormônio indutor. Os resultados apontam para a existência de um ‘gatilho fotoperiódico’ que favorece a ocorrência da ovulação em fêmeas de tambaqui, quando são induzidas com o LHRH comum de uso veterinário.
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Otimização da taxa de fertilização e eclosão de larvas de tambaqui, Colossoma macropomum (Cuvier, 1816) abolindo instrumentos

PONZI JUNIOR, Manlio 14 February 2003 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-16T12:05:52Z No. of bitstreams: 1 Manlio Ponzi Junior.pdf: 1281996 bytes, checksum: 5f8b4de48b96eb8c517e3141a56a43d7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-16T12:05:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Manlio Ponzi Junior.pdf: 1281996 bytes, checksum: 5f8b4de48b96eb8c517e3141a56a43d7 (MD5) Previous issue date: 2003-02-14 / Reproduction by induction is a technic completely dominated, however is possible that some current proceedings utilized, would prejudice the larval production. Thus, the use of the instruments (fowl blume, spatula, etc), to blend the gamets, would can a factor to decrease the larval prodution. This work has as main objetive this hypothesis. For the experiment it was utilized the freshwater fish tambaqui Colossoma macropomum (CUVIER, 1816). To such, it was delineated a test with two conditions: A - blend the gamets with the use of the instruments , and B - blend the gamets without the use of the instruments (blend the gamets with the soft agitation of the vessel). After fertilization , the eggs were analised under a Scanning electron-microscope, thus were confirmed the existence of the damage realized by the instruments on the superficial structure. In B condition occured a increasing rate of fecundation (F(1:14) = 12,90, p < 0,01) and the larval hatching (F(1:14) = 8,43, p < 0,05). Thus, the use of the instruments isn’t to recommended for the enlargemented of larval prodution. / A reprodução induzida de peixes é uma técnica dominada. No entanto, é possível que alguns procedimentos utilizados atualmente possam prejudicar a produção final de larvas. Assim, a utilização de instrumentos (penas de aves,espátulas) para mistura dos gametas, poderia ser um fator de redução da produção. Este trabalho teve como objetivo testar esta hipótese, utilizando-se como modelo experimental desovas de tambaqui, Colossoma macropomum (CUVIER, 1816). Para tal foi delineado um teste com duas condições: A - mistura dos gametas com utilização de instrumento (pena de ave) e B – mistura de gametas sem utilização de instrumentos (com agitação suave do vasilhame). Após a fertilização os ovos foram analisados por eletro-micrografia de varredura, o que comprovou a existência de danos causados pelos instrumentos à superfície dos mesmos. Na condição B a taxa de fecundação foi maior (F(1:14) = 12,90, p < 0,01), assim como a de eclosão das larvas (F(1:14) = 8,43, p < 0,05), o que deve ocorrer em virtude das lesões causada aos ovos pelos instrumentos. Desta forma, a não utilização de instrumentos é recomendável, pois otimiza a produção de larvas.

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