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Análises filogenéticas no gênero Anacardium / Phylogenetic analysis of the genus Anacardium L.Alexandre Franco Garcia 24 August 2009 (has links)
O gênero Anacardium L. é composto por um número relativamente pequeno de espécies arbóreas e arbustivas, dentre elas Anacardium occidentale L., única espécie cultivada e distribuída em todo o mundo tropical. O Brasil é o provável centro de origem, com dois centros de diversidade identificados. Neste trabalho, duas regiões gênicas comumente empregadas (ITS1 e trnL) foram utilizadas para avaliar a diversidade intra e interespecífica do gênero. Há evidências de variação intraespecífica principalmente para a região ITS1, que dificulta as reconstruções filogenéticas, uma vez que relativamente pouca variação interespecífica foi detectada para as espécies avaliadas. Para a região trnL, há uma evidência de que essas regiões podem identificar diferenças entre os centros de diversidade do gênero. Os agrupamentos observados nas árvores sugerem o mesmo tipo de agrupamento já descrito na literatura por taxonomia numérica. No entanto, mais dados devem ser avaliados para testar essa evidência. / The genus Anacardium L. is composed by a relatively small number of species, being A. occidentale the only species that is cultivated and distributed in all tropical regions. Brasil is probably the center of origin, with two different diversity centers. Here, two genic regions commonly used (ITS1 e trnL) were employed to evaluate the diversity present between and within species of the genus. The results showed evidences of the existence of intraspecific variation, mainly for the ITS1 region, which can difficult the phylogenetic reconstructions, since small variation was observed among the analysed species. The trnL region showed an evidence that this region could be used to discriminate the two diversity centers. The groups obtained suggest the same groups observed in the literature by numerical taxonomy. However more data is necessary to test those evidences.
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Análise genética e molecular da variação somaclonal em Stylosanthes guianensis (Aubl.) Sw. (Leguminosae) / not availableLuciano Consoli 28 August 1995 (has links)
O objetivo deste trabalho foi estudar os efeitos da cultura de tecidos em características quantitativas de interesse agronômico e também detectar possíveis alterações ao nível molecular, através da técnica de RAPD, em progênies de plantas regeneradas de Stylosanthes guianensis. Sessenta e três progênies derivadas da cultura de tecidos (R2) e 53 derivados da população original (O2) foram avaliadas para os caracteres da produção de matéria verde e seca (PMV) e produção de matéria seca (PMS). Detectou-se na população regenerada, em média, uma variabilidade genética 2,6 vezes superior à variabilidade presente na população original, para os dois caracteres. As estimativas do coeficiente de herbabilidade e do ganho esperado com seleção para os dois caracteres, também foram superiores para a população regenerada. No entanto, a população regenerada apresentou reduções significativas nas médias, para os caracteres PMV (2656,32 g/planta) e PMS (891,27 g/planta), em relação às médias da população original (PMV=2978,11 e PMS=1000,90). Apesar destas reduções, as médias esperadas da população regenerada selecionada, para os dois caracteres, foram superiores às médias esperadas da população original. Estes resultados indicam que a cultura de tecidos foi capaz de gerar uma variabilidade genética superior à variabilidade encontrada na população original, podendo ser aproveitada em programas de melhoramento. Amostras de 16 progênies de cada uma das populações original e regenerada foram analisadas através da técnica de RAPD utilizando-se 10 primers de sequência aleatória. Estes primers geraram 219 produtos de amplificação apresentando 51,6% de polimorfismo. O agrupamento das progênies pelo método UPGMA, baseado no coeficiente de similaridade Simple Matching, gerou um dendrograma no qual visualiza-se a formação de dois grupos distintos, separando as progênies originais das regeneradas. Apesar da semelhança nos valores dos coeficientes de similaridade genética observados dentro de cada população, a separação das progênies em dois grupos indica que a cultura de tecidos provocou alterações ao nível molecular, capazes de alterar os padrões de RAPDs. / not available
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Análise da frequência das variações M121V (rs1799990) e E200K (rs2893385) e do gene PRNP em pacientes brasileiros com doença de AlzheimerCunha, José Eriton Gomes da 31 January 2012 (has links)
Submitted by Israel Vieira Neto (israel.vieiraneto@ufpe.br) on 2015-03-05T18:18:45Z
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Previous issue date: 2012 / CAPES, CNPq / A Doença de Alzheimer (DA) e a Doença de Creutzfeldt-Jakob (DCJ) apresentam
caráter neurodegenerativo, ocasionadas pelo acúmulo extracelular de proteínas
insolúveis. Dentre alguns fatores de risco, as mutações nos códons M129V e
E200K do gene PRNP são os mais importantes na DCJ. Alguns estudos foram
realizados com o códon 129, sendo bastante controversos. Este trabalho teve
como objetivo verificar a influência dos códons 129 e 200 e a presença da mutação
E200K na DA. 145 amostras de DNA de pacientes com DA e 198 controles foram
genotipadas para os códons 129 e 200 através da técnica da PCR e digestão
enzimática com as enzimas NspI para o códon M129V e BsmAI, para o códon 200.
Onze pacientes e oito controles foram sequenciados com o MegaBace1000.
Quarenta e dois pacientes e quarenta e dois controles foram genotipados para o
códon 129 sendo 16 MM, 20 MV e 6 VV nos pacientes e 24 MM, 15 MV e 3 VV nos
controles. Não foram encontradas diferenças estatísticas significativas. Para a
mutação E200K, 61 pacientes e 75 controles foram genotipados, não ocorrendo
mutação em nenhuma amostra. Nossos dados corroboram com outros grupos
mostrando que o códon 129 parece não estar associado a DA. A baixa frequência
da mutação E200K pode justificar a ausência desta na nossa amostragem, o que
precisa ser confirmado com maior número de amostras, com devida atenção pela
possível estratificação associada a grupos étnicos e outros fatores como cosegregação
de outros genes associados ao PRNP. Este trabalho contribuiu para
um melhor conhecimento do perfil neuroepidemiológico da população local.
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Desempenho silvicultural de clones e progênies de Eucalyptus grandis em relação às árvores matrizes / Eucalyptus grandis clones and progenies silvicultural performance in relation to the matrix treesSantos, Glêison Augusto dos 25 June 2004 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-01-13T16:38:07Z
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Previous issue date: 2004-06-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O presente trabalho objetivou avaliar a eficiência da seleção de árvores matrizes de Eucalyptus grandis e o desempenho silvicultural dessas em teste clonal e em teste de progênies. Na seleção das árvores matrizes foram mensuradas as características dap, altura total (Ht), volume com casca (VCC), e sem casca (VSC) e o volume de casca (VC), bem como foram mensuradas as cinco árvores “codominantes” em um raio de 10 metros da matriz selecionada, para verificar a superioridade dessa matriz em relação aos seus pares. O desempenho silvicultural dos clones dessas matrizes foi realizado por meio da instalação de um teste clonal no delineamento em blocos ao acaso, com três repetições e parcelas quadradas de 25 plantas, em espaçamento de 3 x 2 metros. O desempenho das progênies também foi realizado através da instalação de um teste de progênies no delineamento em blocos ao acaso, com oito repetições e parcelas lineares de seis plantas, em espaçamento de 3 x 2 metros. Com base nas avaliações realizadas, pode-se concluir que a medição da superioridade em Ht para os clones e, superioridade em dap e Ht para as progênies, das árvores selecionadas, em relação às árvores “co-dominantes” do local de seleção é um parâmetro importante para a escolha inicial de árvores matrizes. A análise multivariada é eficaz para a alocação das matrizes em grupos divergentes, bem como para a classificação de árvores matrizes selecionadas posteriormente, dentro dos grupos pré-definidos pelo método de Tocher. Esses resultados possibilitam a redução do número de materiais genéticos a serem avaliados, no entanto, a instalação dos testes é imprescindível no processo de seleção, principalmente devido à existência da interação do genótipo com os efeitos ambientais. / The objective of the present study was to assay the Eucalyptus grandis matrix trees selection and these matrixes silvicultural performances in a clonal test and in progenies tests. In the matrix trees selection the diameter (dap) characteristics, total height (Ht), volume with the bark (VCC), without the bark (VSC) and bark volume (VC) were measured as well as the five “co-dominant” trees in a 10 meter range from the selected matrix, to evaluate this matrix superiority in relation to their pairs. The clones from these matrixes silvicultural performance was carried out through a clonal test installation in the delineation in blocks at random, with three repetitions and square parcels of 25 plants, in a 3 x 2 meters spacing. The progenies performance was also carried out through a progenies test installation in the delineation in blocks at random, with eight repetitions and linear parcels of six plants, in a 3 x 2 meters spacing. Based on the evaluations carried out, it could be concluded that the superiority in Ht measurement for the clones, and the superiority in dap and Ht for the progenies, from the selected trees, in relation to the selected site “co-dominant” trees is an important parameter for the matrixes tress initial choosing. The multi-varied analyzes is efficient for the matrix placing in diverging groups, as well as for the matrixes trees selected afterwards classification, within the groups pre-defined by the Tocher method. These results make the reduction in the genetic material number to be evaluated possible, however, the tests installation is vital in the selection process, especially due to the genotype interaction with the environmental effects.
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Inoculum dynamics of Ralstonia spp.: potential sources, persistence in a local population and selection of phages to reduce bacteria survival / Dinâmica de inóculo de Ralstonia spp.: fontes potenciais, persistência em uma população local e seleção de fagos para reduzir a sobrevivência da bactériaYamada, Jaqueline Kiyomi 27 September 2018 (has links)
Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-11-01T13:24:40Z
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Previous issue date: 2018-09-27 / Ralstonia spp. são conhecidas por causar murcha bacteriana em várias plantas de interesse econômico. O patógeno possui alta variabilidade genética, ampla variedade de hospedeiros e pode sobreviver no solo mesmo na ausência de hospedeiros. A compreensão das potenciais fontes de inóculo, que contribuem para a variabilidade genética no centro de origem do patógeno é interessante para o manejo da doença. O papel dos rios, plantas daninhas e da população nativa de Ralstonia spp. em áreas de vegetação natural no desenvolvimento de epidemias de murcha bacteriana é pouco compreendido. A variabilidade genética entre cepas de Ralstonia spp. em uma região onde a doença é endêmica pode elucidar a contribuição dos meios de dispersão e fatores associados à sobrevivência. No presente estudo, a detecção de Ralstonia spp. em rios de diferentes biomas do Brasil revelou o potencial destes recursos naturais para dispersar o patógeno. As plantas invasoras mostraram ser importantes reservatórios de ambas as espécies de Ralstonia que ocorrem no Brasil e colaboram para sua sobrevivência. Métodos de detecção não foram sensíveis para confirmar a presença de Ralstonia spp. em amostras de solo de áreas sem ocorrência de murcha bacteriana. Quando se analisaram 204 isolados de R. solanacearum e 60 isolados de R. pseudosolanacearum obtidos do município de Coimbra, Minas Gerais, constatou-se haver baixa variabilidade genotípica e clonalidade. Nenhuma estruturação foi observada para as regiões do município, mas a composição genotípica variou entre os anos amostrados. Para o controle alternativo da murcha bacteriana, cinco fagos pertencentes à família Siphoviridae, ordem Caudovirales, foram isolados em amostras de solo. A análise molecular e a gama de hospedeiros com diferentes isolados de Ralstonia spp., representando o Brasil, revelaram diferenças entre os vírus. Adicionalmente, houve diferenças quanto à gama de hospedeiros quando os cinco fagos foram expostos a 24 isolados de Ralstonia spp. Os fagos não foram capazes de prevenir a infecção e controlar o número de células de Ralstonia spp. no solo. Outros métodos de aplicação são necessários para avaliar a eficiência dos fagos no controle da murcha bacteriana. / Ralstonia spp. are known to cause bacterial wilt in several plants of economic interest. The pathogen has high genetic variability, wide host range and can survive in the soil even in the absence of hosts. Understanding potential inoculum sources that contribute to genetic variability in the center of origin is interesting to the management of the disease. The importance of rivers, weeds and native population of Ralstonia spp. in areas of natural vegetation in the development of epidemics of bacterial wilt is poorly understood. Genetic variability among strains of Ralstonia spp. in a local region where the disease is endemic can elucidate the contribution of the means of dispersal and factors of survival. In the present study, the detection of Ralstonia spp. was attempted in water of rivers of different biomes of Brazil and revealed the potential of these natural resources to disperse the pathogen. Weeds were important reservoirs of both species of Ralstonia that occur in Brazil, and collaborate to their survival. Methods of detection were not sensitive to confirm the presence of Ralstonia spp. in soil samples from areas without the occurrence of bacterial wilt. The genetic variability of 204 strains of R. solanacearum and 60 strains of R. pseudosolanacearum from the municipality of Coimbra, Minas Gerais, was low and there was evidence of clonality in the population. The population was not genetically structured according to the geographic region in the municipality, however the genotypic composition varied in time. To assess an alternative measure to control bacterial wilt, five phages were isolated. All phages belong to the Siphoviridae family, Caudovirales order. Molecular analysis and host range with different R. solanacearum strains revealed differences among the viruses. There were differences in the host range when the five phages were exposed to 24 Ralstonia spp. strains. The phages were not able to prevent tomato infection and control the number of cells of Ralstonia spp. in the soil. Other methods of application are necessary to evaluate the efficiency of the phages to control of bacterial wilt.
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Diversidade genética de linhagens de feijão preto e “carioca” recomendadas no Brasil nos últimos 50 anos / Multi-environmental analysis of the genetic diversity of black and “carioca” common bean lines recommended in brazil over the last 50 yearsPossobom, Micheli Thaise Della Flora 11 April 2018 (has links)
Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-09-25T14:04:36Z
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Previous issue date: 2018-04-11 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de MInas Gerais / Ao longo de vários anos de melhoramento genético de feijão (Phaseolus vulgaris L.) no Brasil, inúmeras cultivares foram recomendadas, especialmente dos grupos comerciais preto e “carioca”. A cultura do feijoeiro é um dos produtos agrícolas de maior importância econômico-social, devido especialmente à mão-de-obra empregada desde o preparo para a semeadura até chegar ao produto final. O estudo da diversidade genética de linhagens de feijão preto e “carioca” é importante para facilitar o processo de conhecimento e direcionamento dos programas de melhoramento da cultura no país. Assim, os objetivos destes estudos foram: 1) avaliar a diversidade genética das linhagens de feijão preto e “carioca” recomendadas no Brasil nos últimos 50 anos, por meio de técnicas multivariadas, considerando a interação genótipos x ambientes (GxA) e 2) identificar as melhores linhagens de feijão preto e “carioca” para compor blocos de cruzamentos, com base no índice de seleção FAI, o qual se baseia na análise de fatores. Foram utilizadas 77 cultivares e três linhagens elites do programa de melhoramento da Universidade Federal de Viçosa, totalizando 40 genótipos do grupo comercial preto e 40 do “carioca”, avaliadas em sete experimentos, nos municípios de Viçosa e Coimbra-MG, no período de 2013 e 2016. Os resultados do primeiro estudo mostraram interação GxA para todos os 15 caracteres morfoagronômicos avaliados, com predominância de interação do tipo complexa, o que refletiu em diferentes dendrogramas em cada ambiente auferidos pela estatística M 2 de Procrustes. As linhagens recomendadas após a década de 90 apresentaram melhor aspecto de grão e maiores produtividade e massa de 100 grãos, número de vagens por planta, número de grãos por planta e número de grãos por vagem. As linhagens de feijão preto apresentaram arquitetura de planta mais ereta e maior diâmetro do hipocótilo comparadas às de grãos carioca. O número de vagens por planta e aspecto de grãos foram os caracteres que mais contribuíram para a diversidade genética. Há variabilidade genética entre as linhagens dos dois grupos comerciais, bem como entre as linhagens oriundas de diferentes instituições de pesquisa e décadas de recomendação. Linhagens de feijão preto e “carioca” apresentam entre si elevada variabilidade genética, com maior diversidade entre as linhagens de feijão do grupo “carioca” do que as do preto. A estratégia de soma das matrizes de dissimilaridade genética se mostrou eficiente para quantificar a diversidade multiambientes. O segundo estudo baseou-se em oito caracteres morfoagronômicos avaliados em sete ambientes, totalizando 56 caracteres analisadas. Os resultados obtidos a partir do índice FAI, o qual se baseia na análise de fatores, identificaram as linhagens de maior potencial para rendimento de grãos, independente de grupo comercial que são: IPR Campos Gerais, IPR Tiziu, BRS Expedito, IAC Ybaté, Iapar 65, IPR Uirapurú, BRSMG Majestoso, IPR Andorinha, VC 15 e IPR Tuiuiú. As linhagens BRS Valente, IPR Graúna, IPR Uirapurú, BRS Supremo, BRS Esplendor, IPR Tuiuiú, IPR Tiziu, VP 22, IPR Gralha (grupo comercial preto) e BRS Cometa (grupo comercial “carioca”) devem ser consideradas em blocos de cruzamento quando o objetivo for melhorar a arquitetura de planta. As linhagens do grupo comercial “carioca”: VC 15, IAC Alvorada, IPR 139, IAC Formoso, Pérola, IPR Tangará, BRS Estilo, IPR Campos Gerais, IPR Andorinha e IAC Imperador devem ser consideradas em blocos de cruzamento quando o objetivo for melhorar aspectos de grão. O desempenho de linhagens em ambientes favoráveis e desfavoráveis contribui para a escolha de genitores divergentes e deve ser consideradana formação dos blocos de cruzamentos. / Over several years of genetic improvement of common beans (Phaseolus vulgaris L.) in Brazil, numerous cultivars were recommended, especially from the black and "carioca" commercial groups. The common bean crop is one of the agricultural products of major economic and social importance, especially due to the workforce employed from the preparation for sowing to the final product. The study of the genetic diversity of common beans black and "carioca" lines is important to facilitate the process of knowledge and direction of the breeding programs of the culture in the country. Thus, the objectives of these studies were: 1) to evaluate the genetic diversity of black and "carioca" common bean lines recommended in Brazil in the last 50 years, using multivariate techniques and considering genotypes x environments interaction and 2) to recommend the best crosses of lines of black and "carioca" groups based on the FAI selection index, which is based on factor analysis. A total of 77 cultivars and three elite lines of the breeding program of the Federal University of Viçosa were used, totaling 40 genotypes of the commercial black group and 40 of the "carioca" group, evaluated in seven experiments in the municipalities of Viçosa and Coimbra-MG in the period of 2013 and 2016. The results of the first study showed interaction GxE for all 15 morphoagronomic characters evaluated, with a predominance of complex type interaction, which reflected in different dendrograms in each environment obtained by the Procrustes M 2 statistic. The recommended lines after the 90s presented better grain appearance and higher yield and mass of 100 grains, number of pods per plant, number of grains per plant and number of grains per pod. The black common bean lines presented a more erect plant architecture and a larger hypocotyl diameter compared to those of carioca grains. The number of pods per plant and grain aspect were the main contributors to genetic diversity. There is genetic variability between the lines of the two commercial groups, as well as between the lines coming from different research institutions and decades of recommendation. Black and "carioca" common bean lines have high genetic variability among them, with greater diversity among the common bean lines of the carioca group than those of black. The sum strategy of the genetic dissimilarity matrices was shown to be efficient in quantifying the multienvironmental diversity. The second study was based on eight morphoagronomic characters evaluated in seven environments, totaling 56 analyzed variables. The results obtained from the FAI index, which is based on the analysis of factors, identified the 10 lines of greatest potential for grain yield, independent of commercial group: IPR Campos Gerais, IPR Tiziu, BRS Expedito, IAC Ybaté, Iapar 65, IPR Uirapurú, BRSMG Majestoso, IPR Andorinha, VC 15 e IPR Tuiuiú. The lines BRS Valente, IPR Graúna, IPR Uirapurú, BRS Supremo, BRS Esplendor, IPR Tuiuiú, IPR Tiziu, VP 22, IPR Gralha (black commercial group) and BRS Cometa ("carioca" commercial group) should be considered in crossing blocks when the aim is to improve plant architecture. The lines of the "carioca" commercial group: VC 15, IAC Alvorada, IPR 139, IAC Formoso, Pérola, IPR Tangará, BRS Estilo, IPR Campos Gerais, IPR Formoso and IAC Imperador should be considered in crossing blocks when the objective is to improve aspects of grain. The performance of lines in favorable and unfavorable environments contributes to the choice of divergent parents and should be considered as the formation of crossing blocks.
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Estudo de possíveis alterações agroindustriais induzidas pelo método de cultura de tecido irradiado em cana-de-açúcar variedade NA 56-79 / Study of the agroindustrial alterations induced by the irradiated tissue culture in sugar cane variety NA 56-79Osmy Figueiredo Junior 10 April 1991 (has links)
O método de cultura de tecido vegetal e a aplicação de radiação gama, como agentes indutores de variabilidade genética, na cana-de-açúcar variedade NA 5679, a fim de proporcionarem variações nos , teores de brix, pol, fibra, pureza, extração, fósforo, nitrogênio, açúcares redutores e nas características morfológicas, foram estudadas. Para tal os calos originados pela cultura de tecidos, foram irradiados com as seguintes doses: 20, 40 e 60 Gy. Alguns calos não sofreram irradiação (O Gy) para evidenciarem apenas o emprego da cultura de tecido. Os calas foram cultivados em laboratório até a diferenciação em plântulas, seguindo para aclimatação em casa de vegetação, onde amostras de plantas reproduzidas vegetativamente foram acrescentadas ao experimento, para servirem como plantas padrão. Após o período de crescimento no campo, foram realizadas as análises morfológicas e tecnológicas. A análise estatística dos resultados mostrou que o método de cultura de tecidos pode eventualmente propiciar aumento nos teores dos parâmetros tecnológicos e que as dosagens de irradiação não foram eficientes em tal propósito. / This research deals with the use of plant tissue culture and the application of gamma radiation as mutation inducing agents, in the sugar cane plant, variety NA 5679, in order to provide variation in the contents of brix, pol, fiber, purity, extraction, phosphorus, nitrogen, reducing sugars as well as in the morphological characteristics (features). The"callus·obtained by the tissue culture were irradiated with the following doses: 20, 40 and 60 Gy. Some callus were not irradiated (0 Gy) to make clear the use of tissue culture only. The callus"were cultivated in laboratory up to their seedling stage, when they were placed in a greenhouse where samplings of vegetative reproduced plants were added to the experiment for serving as pattern plants. Morphological and technological analyses were done after the growth period in the field. The statistical analysis of the results indicated that the method of tissue culture may, eventually, increase the contents of the technological parameters and that the dosages of gamma radiation were not efficient for such purpose.
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Conectividade genética, filogeografia e conservação de tubarões pelágicos no Oceano Atlântico ocidental /Domingues, Rodrigo Rodrigues. January 2016 (has links)
Orientador: Otto Bismarck Fazzano Gadig / Resumo: As espécies Carcharhinus falciformis e Carcharhinus signatus, são tubarões oceânicopelágicos, caracterizados por habitarem o ambiente epipelágico de águas quentes e temperados de todo o mundo. Devido ao alto valor da suas nadadeiras, estas espécies são demasiadamente capturadas pela pesca de espinhel pelágico, direcionado para a captura de atuns e espadarte. Em decorrência dessa severa pressão pesqueira, estima-se que estas espécies tiveram reduções populacionais em torno de 75%, e estão atualmente listadas como próximo de ameaçada (C. falciformis) e vulnerável (C. signatus) na lista vermelha da Internation union for Conservation of Nature (IUCN). Por serem espécies migratórias e por habitarem águas internacionais, as ações de conservação exigem esforços conjuntos de vários países, tarefa que no Oceano Atlântico compete à International Commission for the Conservation of Atlantic Tunas – ICCAT. A presente tese avaliou os aspectos genéticos populacionais e filogeográficos de ambas espécies, utilizando marcadores moleculares mitocondriais (C. falciformis e C. signatus) e microssatélites (C. signatus). Especificamente, foram avaliados os níveis de diversidade genética, testada a hipótese nula de panmixia e inferidos os cenários filogeográficos responsáveis pelas relações filogenéticas intraespecíficas, e aspectos demográficos populacionais. Além disso, a diversidade genética da subclasse elasmobrânquios foi avaliada e discutida a sua utilização nas avaliações do ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The shark species, Carcharhinus falciformis and Carcharhinus signatus, are oceanic-pelagic species that inhabit tropical, subtropical and temperate waters worldwide. The high value of their fins associated with the by-catch these species by longline fisheries, which targeting tuna and swordfish, has led to a population reduction around 75%. Currently, these species are listed on the IUCN Red list as Near Threatened (C. falciformis) and Vulnerable (C. signatus). Due to their high vagility and migratory behavior, inhabiting internation waters, management and conservation plans require joint efforts from the many country, a task that in the Atlantic Ocean is entrusted to the International Commission for the Conservation of Atlantic Tunas – ICCAT. This Thesis assessed the main aspects of population genetics and phylogeography in both species. Using mitochondrial marker (C. falciformis and C. signatus) and nine loci microsatellites (C. signatus). Especifically, the levels of genetic diversity were assessed, panmixia null hypothesis was tested and the phylogeography scenarios responsible for intraspecific phylogenetic relationships and populations demography were inferred. Furthermore, the genetic diversity of subclass Elamosbranchii and its usefullness to assess conservation policies were discussed. The overall genetic diversity at CR mtDNA in both species was high (h = 0.88±0.012 and π = 0.005±0.003 – C. falciformis; h = 0.74±0.027 and π = 0.0034±0.0019 – C. signatus). However, C... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Melhoramento em progênies de seringueira [Hevea brasiliensis (Willd. Ex Adr. de Juss.) Muell.- Arg.] por caracteres quantitativos e marcadores moleculares do tipo SSR em duas populações de diferentes procedência /Dourado, Cecília Luzia. January 2016 (has links)
Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Resumo: O objetivo principal do trabalho foi o de quantificar a variabilidade genética em progênies de seringueira fundamentando-se na avaliação de caracteres quantitativos e na caracterização molecular do tipo microssatélites (SSR). A primeira população do estudo é originária da floresta primária de Rio Branco- Acre (população selvagem-PS), e a outra, trata-se de uma população, originada de matrizes clonais (população melhorada-PM). Encontram-se instaladas na forma de teste de progênies na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira/UNESP (FEPE), localizada em Selvíria, MS. Para as duas populações foram avaliados os seguintes caracteres silviculturais de crescimento, altura (ALT), altura comercial (AC), diâmetro médio de copa (DMC), forma do fuste (FOR), perímetro do caule (PAP e P50) e produção de borracha seca (PBS), aos oito (PM) e 23 (PS) anos de idade. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, compostos por 31 famílias, quatro repetições e parcelas lineares de 10 plantas, no espaçamento de 3 x 3 m (PM). Para PS o delineamento experimental foi de blocos causalizados com 37 famílias distribuídas em três repetições, de forma desbalanceada com no máximo 10 plantas por progênies no espaçamento de 5 x 3 m (PS). As estimativas dos parâmetros genéticos foram feitas utilizando-se a metodologia de modelo linear misto univariado aditivo REML/BLUP e ganhos na seleção pelo método índice multiefeitos (IME). O DNA genômico foi e... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The main objective of this work is to quantify the genetic variability in progenies of rubber tree, based on the quantitative characterization and the molecular characterization of the microsatellite type (SSR). The first population of the study originated in the primary forest of Rio Branco-Acre (wild population-PS), and the other population is a population originated from clonal matrices (improved population-PM). They are installed as progeny tests at the Teaching, Research and Extension Farm, That belongs to Engeneering College of the Julio Mesquita Filho State University of São Paulo, In Selvira, State of South Mato Grosso Brazil. For the two populations, the following silvicultural characteristics of growth, height (ALT), commercial height (AC), average crown diameter (DMC), stem shape (FOR), stem perimeter (PAP and P50) and dry rubber yield (PBS) at eight (PM) and 23 (PS) years old. The experimental design consisted of randomized blocks, composed of 31 families, four replications and linear plots of 10 plants, spaced 3 x 3 m (MP). For PS the experimental design was of causalized blocks with 37 families distributed in three replications, unbalanced with a maximum of 10 plants per progeny in the spacing of 5 x 3 m (PS). Estimates of the genetic parameters were made using the mixed linear univariate model (REML / BLUP) methodology and gains in selection by multi-effects index (MEI). Genomic DNA was extracted, quantified and genotyped for the two study populations. The anal... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Genotype by environment interaction in slash pine and methodologies comparison for radiata pine wood properties /Pagliarini, Maximiliano Kawahata January 2016 (has links)
Orientador: Ananda Virginia de Aguiar / Abstract: Exotic forest species have been introduced in Brazil in order to promote improvements in socioeconomic development and help to reduce the pressure caused to native forests. With growing demand for these species, research on genetic improvement has increased to find new, more productive germplasm and preferably in less time. Two species were used in the study: slash pine (Pinus elliottii Engelm. var. elliottii) and radiata pine (Pinus radiata D. Don). The first part of the study had the purpose to identify the stability, adaptability, productivity and genetic parameters, in addition to selection gain and genetic divergence in slash pine open pollinated second generation progenies considering phenotypic trait. Two tests were established, one in Ponta Grossa-PR with 24 progenies and one in Ribeirão Branco-SP with 44 progenies, both in Brazil, to identify the most productive genotypes for commercial planting areas in both sites. There was significant variation (p<0.01) among progenies for growth and form traits. The high coefficients of genetic variation for wood volume (14.31% to 16.24% - Ribeirão Branco-SP and 31.78% to 33.77% - Ponta Grossa-PR) and heritability (0.10 to 0.15 – Ribeirão Branco-SP and 0.36 to 0.48 – Ponta Grossa-PR) have shown low environmental influence on phenotypic variation, which is important for the prediction of genetic gain by selecting and confirming genetic potential in both places, especially Ponta Grossa. The effect of genotype x environment interact... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: Espécies exóticas de Pinus foram introduzidas no Brasil para promoverem o crescimento socioeconômico do país e ajudar na redução da pressão causada pelo uso de florestas nativas Com a crescente demanda por essas espécies, pesquisas em melhoramento genético tem aumentado na busca de novos germoplasma mais produtivos em menor tempo. Duas espécies foram utilizadas no presente trabalho: Pinus elliottii Engelm. var. elliottii e Pinus radiata D. Don. A primeira parte do trabalho teve a finalidade de identificar a estabilidade, a adaptabilidade, a produtividade e os parâmetros genéticos, além do ganho de seleção e diversidade genética em progênies de polinização aberta de segunda geração de P. elliottii var. elliottii considerando os caracteres fenotípicos. Foram estabelecidos dois testes, um em Ponta Grossa-PR com 24 progênies e outro em Ribeirão Branco-SP com 44 progênies visando identificar os genótipos mais produtivos para áreas de plantio comercial em ambos locais. Foi observada variação significativa (p<0,01) entre as progênies para os caracteres de crescimento e alguns caracteres de forma. Os altos coeficientes de variação genética para volume de madeira (14,31% a 16,24% - Ribeirão Branco e 31,78% a 33,77% - Ponta Grossa) e herdabilidade (0,10 a 0,15 – Ribeirão Branco e 0,36 a 0,48 – Ponta Grossa) mostraram baixa influência do ambiente na variação fenotípica, o que é importante para a predição do ganho genético mediante a seleção e confirmam potencial genético em ambos os loc... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor
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