Orientador: Adilson Fransozo / Banca: Katia Aparecida Nunes Hiroki / Banca: Aridiane Cristine Almeida / Banca: Rogério Caetano da Costa / Banca: Antonio Leão Castilho / Resumo: Não disponivel / Abstract: Not avaliable / Doutor

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-01-26T12:29:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_VariabilidadeMorfometricaMolecular.pdf: 4841557 bytes, checksum: f98bac4b966e74cac366c8276fdf7ac3 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-01-26T12:29:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_VariabilidadeMorfometricaMolecular.pdf: 4841557 bytes, checksum: f98bac4b966e74cac366c8276fdf7ac3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-26T12:29:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_VariabilidadeMorfometricaMolecular.pdf: 4841557 bytes, checksum: f98bac4b966e74cac366c8276fdf7ac3 (MD5) Previous issue date: 2011 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O presente estudo objetivou testar a hipótese da heterogeneidade populacional morfológica e molecular em diversos grupos de Desmodus rotundus na Amazônia oriental, bem como descrever a relação desta heterogeneidade com processos e padrões de produção da Raiva em humanos e bovinos. Para tanto, um total de 776 exemplares de vampiro comum, de 72 localidades do Pará foram cedidos pelo Instituto Evandro Chagas (IEC - Ministério da Saúde/Belém), Laboratório Nacional Agropecuário (Lanagro/Belém) e Fundação de Vigilância em Saúde do estado do Amazonas (FVG/Manaus). Quanto a descrição espacial e temporal da Raiva em humanos e bovinos no Pará, ao longo de uma década (1999-2008), tais registros foram obtidos junto a Secretaria Executiva de Saúde Pública do Pará (SESPA). Do total de espécimes de D. rotundus, apenas os indivíduos adultos (329 machos e 315 fêmeas) foram submetidos a 39 medidas fenotípicas (16 externas e 23 cranianas). Na abordagem genética, 236 indivíduos (53% fêmeas e 47% machos) foram caracterizados por meio de 10 marcadores do tipo microssatélites. Já para a descrição de áreas de risco foram utilizadas feições ecológicas, biológicas, socioeconômicas e de cobertura e uso do solo, georreferenciadas geograficamente. Como um dos principais resultados das inferências fenotípicas foi observado que apenas as fêmeas de D. rotundus no Pará, mostraram tendências a formação de grupos que reúnem espécimes da porção mais ao norte do estado (Baixo Amazonas, Marajó e Nordeste), como sendo menos similares as do sudeste e sudoeste. No geral, fenotipicamente D. rotundus não mostrou elevada estruturação entre os grupos no Pará. A maior ocorrência de variabilidade observada para D. rotundus não foi entre os grupos geográficos. Segundo os dados de análise molecular de variância (AMOVA) ocorreram variações em 96% dos acontecimentos dentro de cada grupo. No geral, muitos grupos estudados do Pará ainda encontram-se sobre equilíbrio de Hardy-Weinberg, levando a crer na existência de uma única população caracteristicamente panmítica, contudo, com tendências à formação de três grandes grupos (Baixo Amazonas, Marajó e Nordeste). Para tal população, os padrões reprodutivos e adaptativos da espécie, garantiriam a alta equidade da riqueza alélica e os bons índices de diversidade genética de D. rotundus na Amazônia oriental, mesmo sob os efeitos da fragmentação de áreas, que se processa principalmente no lado leste no estado do Pará. / At the present study the hypothesis of population morphological and molecular heterogeneity was tested in several groups of the common vampire bat Desmodus rotundus from oriental Amazonia as well the relationship among the environmental heterogeneity and the process and patterns of rabies outbreaks in human and bovine population was described. For this 776 individuals of common vampire bats from 72 different places of state of Pará were disposed by Instituto Evandro Chagas (IEC - Ministério da Saúde/Belém), Laboratório Nacional Agropecuário (Lanagro/Belém) and Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas (FVG/Manaus). Data from 1999 to 2008 of rabies upon humans and bovines in Pará were disposed by the Secretaria Executiva de Saúde Pública do Pará (SESPA). For morphometric analysis, 39 phenotypic measures (16 bodies and 23 cranials) all adult individuals (329 males and 315 females) were obtained. For genetic analysis, 258 bats (47% males and 53% females) were characterized by 10 microsatelite markers. To describe the areas of rabies risk we used the ecological, biological and socioeconomic shapes of environment as well the soil using, all these geographically georeferenced. One of our results of phenotypic inferences suggest that vampires from Pará showed the tendency to group formation with individuals of the north region of state (Amazonas basin, Marajóand Northeastern regions), only as well they were less similar to bats from southern and southwestern regions. In general, D. rotundus did not show high phenotypically structure among the groups in Pará. The highest variability occurrence in D. rotundus, was not observed among geographic groups. According to molecular analysis of variance (AMOVA), 96% of them were found within each studied group. Our data showed that several of the groups studied in Pará are still under Hardy-Weinberg equilibrium, suggesting the existence of one single panmitic population of the common vampire bat in this North state, but with tendencies to the formation of three great groups (Amazon basin, Marajóand Northeast). To this panmitic population, the reproduction and adaptation patterns garanteed the high equity of allelic richness and good rates of genetic diversity in D. rotundus from oriental Amazon, even under the fragmentation effects in many areas of Pará state, mainly in the east side.

A família Baculoviridae é um grande grupo de vírus com cerca de 700 espécies de insetos hospedeiros, com dois fenótipos: o ODV (occlusion derived virion), que faz a infecção primária do intestino médio; e o BV (budded virus), responsável pela infecção sistêmica. No Brasil, o nucleopoliedrovírus Anticarsia gemmatalis (AgMNPV) é utilizado como controle biológico da lagarta-da-soja Anticarsia gemmatalis. O genoma do AgMNPV-2D contém 152 ORFs, 26 das quais codificam proteínas estruturais. Entre elas, a glicoproteína GP64 é fundamental para infecção secundária. Este estudo visa identificar proteínas estruturais do AgMNPV-2D por duas abordagens de espectrometria de massas. Também comparar a variabilidade da gp64 de isolados geográficos por sequenciamento por Sanger e de alta cobertura. Assim, identificamos as substituições de gp64 e vimos que ela não suporta a separação geográfica dos isolados. Também identificamos 44 e 33 proteínas em ODV e BV, respectivamente. Seis novas proteínas foram identificadas no ODV e sete delas no BV. Além disso, 11 proteínas celulares foram identificadas no AgMNPV-2D, possivelmente necessárias para infecção. Este achado contribui para o entendimento da morfogênese do AgMNPV e fatores associados à multiplicação viral. / Baculoviridae are arthropod-specific viruses with more than 700 host insects, which produce two phenotypes: the budded virus (BV) and, the occlusion-derived virus (ODV) for intra and across host spread, respectively. Brazil uses the Anticarsia gemmatalis multiple nucleopolyhedrovirus (AgMNPV) as a biological control agent of the velvet bean caterpillar (A. gemmatalis). The genome of the AgMNPV-2D carries 152 ORFs, 26 of which code for structural proteins. Herein, the structural proteins of AgMNPV-2D were analyzed by two mass spectrometry techniques. The additional objective was to compare the gene gp64. of different geographical populations by Sanger and next generation sequencing. This analysis allowed us to observe the substitutions of gp64 and refuted the notion of a geographical isolation of the samples. We also observed a total of 44 proteins of the ODV and 33 of the BV. Six new proteins were found in the ODV and seven in the BV. Furthermore, 11 cellular proteins were also identified, which are possibly assorted during viral morphogenesis. These findings may provide novel insights into AgMNPV biology and its host interaction, leading us to a better understanding about morphogenesis and also the associated factors of the viral multiplication.

Orientador: Antonio Goes / Banca: Margarete Camargo / Banca: Ivan Antonio dos Anjos / Resumo: Thielaviopsis paradoxa, agente causal da podridão-abacaxi, é um fungo apontado como a principal causa da baixa germinação de toletes de cana-de-açúcar. A doença é uma das principais causas pela redução da brotação e consequente falhas no stand. Não existem variedades resistentes, e quanto mais rápida é a emergência das plantas, menor é o dano causado pelo patógeno. Nesse estudo foi avaliada a diversidade patogênica de onze isolados de T. paradoxa oriundos de toletes de canas-de-açúcar com sintomas, coletados em cinco Estados brasileiros (SP, GO, MG, BA e PR). Na inoculação foram empregados toletes de cana-de-açúcar da variedade IACSP95-5000, de nove meses de idade. Constatou-se diferença estatisticamente significativa entre os isolados, com destaque para os isolados 6 e 7, os mais patogênicos, ambos provenientes de Guaíra-SP. O isolado 2, proveniente de Santa Juliana-MG, foi o menos patogênico. Testes complementares com três isolados contrastantes (baixo, intermediário e alto grau de patogenicidade) inoculados em três variedades de cana-de-açúcar (IACSP95-5000, IAC911099 e IACSP97-4039) comprovaram o comportamento diferenciado, sendo reproduzidas características fenotípicas semelhantes àquelas quando da inoculação na variedade IACSP95-5000. As três variedades de cana-de-açúcar empregadas nesse estudo mostraram-se suscetíveis, com indicação e possível comprovação da inexistência de variedades resistentes. Não foi constatado relação entre a origem geográfica dos isolados e níveis de patogenicidade. Testes in vitro com fungicidas dos grupos das estrobilurinas (trifloxistrobina e piraclostrobina) e triazol (tebuconazole), nas concentrações 1, 10 e 100 μgmL-1 de ingrediente ativo, tornaram evidente que apenas o fungicida tebuconazole, isoladamente ou em combinação com trifloxistrobina, mostrou-se eficiente na inibição do tamanho das colônias... / Abstract: Thielaviopsis paradoxa, causal agent of pineapple disease is a main cause of poor germination of sugarcane sets. The disease is one of major cause for the reduction of budding and consequent failures on the stand. There is no resistant varieties, and as faster is the plant emergence, less is the damage caused by the pathogen. In this study it was evaluated the pathogenic diversity of eleven isolates of T. paradoxa from stalks of sugarcane with symptoms collected from five Brazilian states (SP, GO, MG, BA and PR). For the inoculation it was used sugarcane sets of the variety IACSP95-5000, with nine months of age. Data analysis revealed differences among the isolates, especially isolates 6 and 7, the most pathogenic, both from Guaíra-SP. The isolated 2, from Santa Juliana-MG was the least pathogenic. Additional tests with three contrasting isolates (low, intermediate and high level of pathogenicity) inoculated in three varieties of sugarcane (IACSP95-5000, IAC911099 and IACSP97-4039) confirmed the different behavior, being reproduced phenotypic characteristics similar to those when inoculated in variety IACSP955000 . The three varieties of sugarcane used in this study showed to be susceptibles, with indication and possible evidence of absence of resistant varieties. It was not found relation between the geographical origin of the isolates and pathogenicity levels. In vitro tests with fungicides of the strobilurin group (pyraclostrobin and trifloxystrobin) and triazole (tebuconazole) at concentrations of 1, 10 and 100μgmL-1 active ingredient, became clear that only the fungicide tebuconazole alone or in combination with trifloxystrobin, showed efficient in inhibiting the size of the colonies, when at 100μgmL-1. Complementary studies about the fungicide viability of the group triazoles, in vitro, at higher ... / Mestre

Orientador: Reinaldo Monteiro / Banca: Eulalia Soler Sobreira Hoogerheide / Banca: Maria Antonia Carniello / Banca: Elizabeth Ann Veasey / Banca: Marcos Aparecido Pizano / Resumo: Sabe-se que os agricultores de pequena escala que praticam agricultura de modo tradicional desempenham um importante papel na manutenção da agrobiodiversidade, podendo complementar o trabalho de conservação ex situ. Um dos cultivos mais presentes na agricultura tradicional tropical é a mandioca (Manihot esculenta Crantz.), base alimentar de mais de 800 milhões de pessoas no mundo. No Brasil, encontra-se elevada diversidade intraespecífica da referida tuberosa, sobretudo entre os agricultores da Baixada Cuiabana, Mato Grosso, que ainda praticam agricultura nos moldes tradicionais por meio de técnicas que não apenas mantêm, mas também amplificam essa diversidade. O presente estudo teve como objetivo caracterizar a dinâmica de cultivo das variedades locais de mandioca das comunidades tradicionais contíguas Mutum (Mt), Vaquejador (Vq), Ribeirão das Pedras Acima (Ra) e Quilombo (Qb), localizadas no município de Jangada-MT e analisar a influência dos aspectos socioeconômicos, culturais e genéticos na manutenção da agrobiodiversidade local, bem como analisar as relações entre as comunidades estudadas e suas influências sobre o manejo da agrobiodiversidade. Os capítulos que compõem este trabalho consistem em: 1) Apresentação da problemática, área de estudo, métodos e análises utilizados; 2) Caracterização socioeconômica das comunidades estudadas e dos agricultores; 3) Descrição dos espaços de cultivo, técnicas de manejo e produção de farinha de mandioca; e 4) Levantamento etnobotânic... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Small-scale farmers who perform agriculture in a traditional manner are known to play an important role in maintaining agrobiodiversity and, therefore, they may complement ex situ conservation work. Cassava (Manihot esculenta Crantz.) is one of the most important crops in traditional tropical agriculture, being considered as staple food for more than 800 million people in the world. There is a high intraspecific diversity in Brazil, especially among farmers located in the region of Baixada Cuiabana, Mato Grosso, which still cultivates it in a traditional way, using techniques that contribute not only to maintain but also to expand the diversity. Thus, this study aimed to characterize the dynamics of cultivation of local cassava varieties, given its relevance to small scale farmers, of four contiguous traditional communities located in the municipality of Jangada, State of Mato Grosso, Brazil; Mutum (Mt), Vaquejador (Vq), Ribeirão das Pedras Acima (Ra), and Quilombo (Qb); and it also aimed to analyze the influence of socioeconomic, cultural and genetic aspects in the maintenance of agrobiodiversity, as well as the relations between studied communities and their influences on the agrobiodiversity management. The chapters of this work consist of: 1) Problem presentation, study area, methods and adopted analysis; 2) Socioeconomic characterization of studied communities and farmers; 3) Description of crop spaces, management techniques and production of cassava flour; and 4) Ethnob... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Luciana Rossini Pinto / Coorientador: Marcos Guimarães de Andrade Landell / Banca: Ana Lilia Alzate Marin / Banca: Dilermando Perecin / Resumo: A cana-de-açúcar figura mundialmente como uma importante cultura econômica, com grande participação no suprimento da demanda global por energia e açúcar. Bancos ativos de germoplasma são repositórios in vivo de variabilidade genética para os programas de melhoramento, estando diretamente relacionados ao sucesso do programa. Para uma gestão adequada e eficiente do banco é necessário conhecer a magnitude e distribuição da variabilidade genética dentro e entre os grupos de acessos das respectivas espécies que o compõe bem como identificar os acessos duplicados ou erroneamente identificados. Marcadores moleculares microssatélites são adequados para tal finalidade. O presente trabalho teve como objetivo principal avaliar a estrutura genética de um grupo de 593 genótipos, constituído por germoplasma básico e melhorado, disponíveis no banco de germoplasma do Programa Cana - IAC. Além disso, a magnitude da diferenciação genética entre as principais cultivares brasileiras e o germoplasma básico de cana-de-açúcar também foi investigada. Para tanto, 12 pares de primers SSR de alto poder discriminatório foram utilizados. A análise da estrutura genética separou os genótipos em dois grupos principais, um constituído por germoplasma básico e o outro por genótipos melhorados. A partição da variabilidade genética mostrou que 14,44% (P<0,001) da variabilidade total detectada pelos marcadores encontra-se entre estes dois grupos. Resultados semelhantes foram observados entre as principais cultiv... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sugarcane is a crop with worldwide economic importance due to its large participation in supplying the global demand for energy and sugar. Active germplasm banks are in vivo repositories of genetic variability for breeding programs, being directly related to their success. For its adequate management, a constant routine of surveillance and control over the accessions is required. Microsatellite (SSRs) molecular markers are suitable for this purpose. The present work aims to evaluate the genetic structure of a group of 593 individuals, composed by basic germplasm accessions and breeding genotypes, available within the germplasm bank of the Campinas Agronomic Institute (IAC) Sugarcane Genetic Breeding Program, based on these markers, with a focus on the comparison between the genetic diversity of Brazilian clones and cultivars (IAC, CTC, SP and RB) with accessions of diverse species, genera and exotic hybrids. In addition, the magnitude of the genetic differentiation between the main Brazilian cultivars and the basic sugarcane germplasm was also investigated. For this purpose, 12 pairs of SSR primers with high discriminatory power were used. The genetic variability present in the group is structured in a way where breeding materials differ from wild accessions, constituting two groups of individuals. Genetic variability among them is 14.44%, while 85.56% is present within them (P<0.001). Similar results were observed between the main Brazilian cultivars and the basic germplasm,... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T04:04:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 282458.pdf: 2633740 bytes, checksum: 477fe973bcb08eab24756caf9fd2bf45 (MD5) / A ocorrência de variações genéticas e epigenéticas foi avaliada em clones de macieira e de morangueiro obtidos por via vegetativa convencional e micropropagação, em três ciclos de cultivo consecutivos. As plantas multiplicadas pelas duas modalidades foram caracterizadas quanto à fidelidade genotípica através de marcadores AFLP, visando detectar mutações, com a utilização de uma combinação de enzimas de restrição e uma combinação de iniciadores e MSAP, visando estimar o padrão de metilação, com a utilização de duas combinações de enzimas de restrição e uma combinação de iniciadores, bem como sua evolução ao longo dos ciclos de cultivo, comparando-as com a planta matriz. Foram feitas observações visuais em plantas de macieira com relação a: i) coloração pela antocianina na folha em crescimento; ii) posição folhas em relação ao caule; iii) comprimento folha; iv) largura folha; v) conformação da margem da folha; vi) flexibilidade dos ramos e em morangueiro, com relação a: i) forma dentes dos folíolos; ii) cor da folha; iii) posição da inflorescência em relação a folhagem, visando detectar a ocorrência de variações fenotípicas, nas duas modadlidades de propagação. Os resultados obtidos indicam a ocorrência de variações genéticas, tanto na propagação vegetativa convencional como na micropropagação, variando de 3,7 a 100% das plantas analisadas e ainda, modificações no padrão de metilação, variando de 25 a 96,2% das plantas analisadas. Entretanto, estas variações não tiveram reflexo no fenótipo das plantas propagadas. O presente estudo indica que variações genéticas e epigenéticas são passsíveis de ocorrência quando plantas são submetidas à propagação vegetativa, seja via convencional, seja via micropropagação, com maior probabilidade de ocorrência quanto maior o número e a variação dos métodos envolvidos.

Tese (Doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciencias Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T08:23:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 279462.pdf: 1524764 bytes, checksum: 6aeeb1f55ba566debda7335ec88f37c1 (MD5) / As bromélias representam um grupo taxonômico importante sob os prismas ecológico e econômico, ocorrendo majoritariamente no bioma Mata Atlântica, o qual se encontra entre os mais ameaçados do planeta. Assim, o desenvolvimento das tecnologias que utilizam sistemas regenerativos de alta eficiência de cultivo ou de conservação de germoplasma vegetal apresenta alto potencial de aplicação. No presente trabalho o sistema de micropropagação baseado na indução e desenvolvimento de culturas nodulares (CNs) foi estudado e caracterizado a partir de segmentos nodais extraídos de brotos estiolados em Billbergia zebrina, e a partir de sementes e de bases foliares em Vriesea reitzi. Foi também testada a suplementação ao meio de cultura MSB de diferentes tipos, concentrações, balanços de fitorreguladores e submetidos a diferentes condições de cultivo, durante a indução, regeneração e alongamento de microbrotos. Em B. zebrina, segmentos nodais, extraídos de brotos estiolados foram cultivados em meios de cultura MS liquido, suplementados com diferentes concentrações de TDZ, ANA e BAP. CNs e folhas de brotações foram empregadas para análises moleculares por meio de marcadores AFLP. O uso do meio de cultura MS com diferentes concentrações de TDZ resultou em CNs com diferentes morfologias e potenciais regenerativos. CNs induzidas com TDZ (0,01 µM) e subcultivadas em meio de cultura MSB isento de fitorreguladores apresentam alta freqüência regenerativa. CNs originadas em meio com TDZ, (0,1 µM) quando foram subcultivadas em MSB com ANA (2 µM) e 2-iP (4 µM) resultaram em maior número médio de brotos adventícios por grama de CN inoculada. Brotos alongados (>3 cm) foram aclimatizados com sucesso em ambiente in vivo e mudas transplantadas para vasos apresentaram padrão normal da espécie. Análises histológicas e em MEV revelaram que a indução de CNs ocorreu a partir da região da gema do segmento nodal e confirmaram características morfogenéticas intermediárias entre organogênese e embriogênese somática, típico de CNs. A análise molecular com base na técnica de AFLP revelou 88% de similaridade dos regenerantes em relação à planta mãe, sugerindo a ocorrência de alta diversidade. Esta diversidade pode ter aplicação em programas de melhoramento genético ou como ferramenta eficaz em programas de conservação desta espécie. Em V. reitzii foram estudados os fatores determinantes do controle da morfogênese in vitro das CNs. Os fitorreguladores suplementados ao meio MSB inibiram a germinação das sementes e promoveram a indução de CNs após duas semanas em cultivo. CNs induzidas em meio suplementado com ANA (4 µM) e subcultivadas em meio MSB com ANA e 2-iP (2 µM cada) apresentaram textura granular e alta taxa de proliferação. O cultivo destas CNs em meio MSB suplementado com AIA (4 ?M) resultou em alto número médio de microbrotos (1.468 brotos/g de CNs). A partir do modelo de regressão foi possível inferir que o número máximo de brotos alongados (66,3 brotos/g) pode ser obtido com o subcultivo dos microbrotos em meio MSB suplementado com AIA (2 µM) e AG3 (10 ?M). Em explantes foliares, em todos os meios de cultura testados observou-se a indução de CNs a partir da região basal. Estas CNs responderam de forma diferencial aos tratamentos em termos de características morfogenéticas e potencial regenerativo. CNs mantidas na presença de luz resultaram em maior produção de massa fresca e de microbrotos em comparação com aquelas mantidas na ausência de luz. CNs subcultivadas em meio MSB líquido e suplementado com ANA (4 µM) e 2-iP (2 µM) revelaram elevada eficiência regenerativa. A maior eficiência regenerativa e proliferação de microbrotos foram obtidas com o uso do meio MSB suplementado com ANA e 2-iP (2 µM cada). O subcultivo em meio MSB suplementado com AG3 (10 µM) promoveu um maior alongamento de brotos e de forma sincronizada. A utilização destes meios de cultura resultou em uma eficiência regenerativa de 12,4 g/g de CN inoculada. Estima-se, a partir disto, uma regeneração de mais de 5.300 novos microbrotos e na fase de alongamento, uma taxa efetiva de 75% destes microbrotos podem ser convertidos em brotos completos a cada 10 semanas de cultivo. As análises estruturais das CNs revelaram que os processos de indução da morfogênese e da regeneração de microbrotos ocorrem a partir da proliferação de grupos de células meristemáticas e que desenvolvem a formação de múltiplos meristemas caulinares. Estas estruturas regenerativas sustentam a classificação de CNs organogênicas. Brotos maiores do que 3,0 cm resultaram em mais de 95% de sobrevivência ex vitro. Os resultados obtidos com as CNs de V. reizii se configuram, com base em estudos morfohistológicos, em uma rota regenerativa in vitro intermediária entre a organogênese e a embriogênese somática. Esta rota apresenta elevado potencial regenerativo para a propagação em larga escala de bromélias ornamentais e/ou ameaçadas de extinção, como são o caso de V. reitzii e B. zebrina.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T04:45:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 291237.pdf: 5528836 bytes, checksum: 89b2d27edaf5442e5fe4329b22f651f9 (MD5) / O abacaxizeiro (Ananas comosus var. comosus) é uma espécie domesticada no norte da América do Sul, a partir da espécie selvagem A. comosus var. ananassoides. No período anterior a conquista a espécie já estava dispersa por toda América Tropical e parte da Subtropical, configurando uma planta de grande importância social para os grupos humanos. Após o contato com os europeus o abacaxizeiro foi disperso pelo globo, e hoje se configura como uma das frutas tropicais de maior importância econômica mundial. O Brasil é um dos maiores produtores mundiais de abacaxi, tendo como principal consumidor o próprio mercado interno, mesmo apresentando um baixo consumo per capita da espécie. Isto configura um potencial de crescimento da exploração comercial da fruta, tanto no mercado interno como no externo. Em Santa Catarina a baixa produção de abacaxi, aliada ao consumo médio per capita da espécie maior que o nacional, tornam a revitalização do cultivo uma potencial oportunidade para a agricultura catarinense. Porém, para revitalizar o cultivo, os agricultores devem ter acesso a mudas de alto valor genético e isentas de pragas e doenças. A presente dissertação objetivou a caracterização genética de 29 genótipos presentes na coleção de germoplasma do CCA/UFSC, através de 7 marcadores microssatélites. Os acessos conservados na coleção são, em geral, genótipos locais do estado de Santa Catarina, configurando-se de grande importância genética regional. Nesta abordagem foi possível adaptar com sucesso um protocolo de extração de DNA genômico, extraído de partes de folhas basais de plantas adultas (aproximadamente 0,5g), obtendo-se em média 3750 ng de DNA genômico para cada acesso, concentrados em 75 µL de solução estoque. Porém, entre os lócus estudados o maior polimorfismo encontrado foi de 27,58%, o maior número de alelos foi 4, o máximo número efetivo de alelos foi de 1,597 e foi encontrado 3 alelos raros, sendo que dois deles em um mesmo lócus. Isto configura baixo poder de informação, impossibilitando a análise da distância genética e índices de variabilidade genética. A abordagem quanto a qualidade fitossanitária se deu por meio da elaboração de um protocolo de alta performance de micropropagação de abacaxizeiro baseado em culturas nodulares associadas a sistemas de imersão temporária. O protocolo foi dividido em indução e multiplicação de culturas nodulares, regeneração de microbrotos, crescimento à brotos e aclimatização. Os explantes utilizados foram bases foliares retiradas de brotos desenvolvidos in vitro. A melhor combinação de fitorreguladores para a indução de culturas nodulares foi 2 µM de ANA e 8 µM de 2-iP. Para a multiplicação de culturas nodulares a combinação que gerou os melhores resultados foi a de 2 µM de ANA e 2 µM de BAP em sistema de imersão temporária por meio de frascos duplos. Esta mesma combinação de fitorreguladores mostrou-se eficiente para a regeneração de microbrotos, porém, utilizando-se sistema de imersão temporária em frascos RITA®. Posteriormente, em sistema de imersão permanente, o crescimento de microbrotos foi mais adequado em meio de cultura contendo 10 µM de AG3. Brotos acima de 2 cm foram aclimatizados com sucesso em substrato composto por mistura (1:1) de casca de arroz carbonizada e Plantmax® HT, com uma porcentagem de sobrevivência superior a 92%.

Orientador: Paula Rahal / Coorientador: Laura Sichero / Banca: Enrique Mário Boccardo Pierulivo / Banca: Márcia Guimarães da Silva / Banca: Alessandra Vidotto / Banca: Cíntia Bittar / Resumo: A papilomatose respiratória recorrente (PRR) é uma doença caracterizada pela formação de papilomas benignos no trato respiratório superior. A infecção pelo Papilomavírus Humano (HPV) é a principal causa da doença, principalmente os tipos 6 e 11, que são considerados de baixo risco oncogênico. A região promotora LCR (long control region) contêm elementos cis-reguladores para fatores transcricionais (FTs) celulares e virais que controlam a expressão gênica precoce e a replicação viral. Alterações nucleotídicas dentro da LCR podem sobrepor sítios de ligação de FTs e influenciar a afinidade de ligação, a atividade transcricional e o curso clínico das doenças associadas á infecções por HPV. Os objetivos deste trabalho foram caracterizar as variantes moleculares de HPV entre os indivíduos com diagnóstico de PRR e analisar o impacto da variabilidade nucleotídica da LCR sob a transcrição viral. O sequenciamento da LCR de amostras HPV-6 positivas revelou cinco variantes genômicas não descritas anteriormente. Por meio de análise computacional, observou-se que as alterações nucleotídicas detectadas sobrepõem potenciais sítios de ligação para alguns fatores de transcrição. A variante HPV-6vc foi a mais prevalente dentre as amostras analisadas (69,2%), sendo mais prevalente nos casos de papilomatose juvenil. Com relação à atividade transcricional, a variante HPV-6vc é mais ativa que a variante molecular HPV-6a. Além disso, observou-se que outras alterações observadas influenciaram na atividade transcricional que foi indiretamente medida por ensaios de luciferase. Vale ressaltar que este é o primeiro trabalho que descreve as diferenças de atividade do promotor entre variantes naturais de HPV-6. Esta pesquisa é de extrema relevância, pois fornece informações importantes sobre a função biológica de variabilidade genômica intratípica de HPV-6 / Abstract: Recurrent respiratory papillomatosis (RRP) is a disease characterized by the formation of benign papillomas in the upper respiratory tract. Human Papillomavirus infection (HPV) is the main cause of the disease, particularly types 6 and 11 which are considered low-risk oncogenic HPV. The promoter region LCR (Long Control Region) contains cis-regulatory elements for cellular and viral transcription factors (TF) that control viral early gene expression and replication. Nucleotide alterations within the LCR may overlap TFs elements and impact upon the binding affinity, the transcriptional activity and ultimately on the clinical outcome associated to HPV infections. Our aim was to characterize molecular variants of HPV among individuals diagnosed with RRP and to analyze the impact of LCR nucleotide divergence upon viral early transcription. LCR sequencing of the HPV-6 positive samples revealed five genomic variants not previously described. Through computational analysis, we found that nucleotide changes detected overlapps potential binding sites for several transcription factors. HPV-6vc-related variant was the most prevalent among the samples analyzed (69.2%) and more prevalent in cases of juvenile papillomatosis. Concerning transcriptional activity, HPV-6vc-related variant is more active than HPV-6a molecular variant. Further, we observed that other alterations observed strongly impacts transcriptional activity indirectly measured by luciferase assays. To our knowledge, this is the first report describing differences in promoter activity among naturally occurring variants of HPV-6. Research in this area is anticipated to provide important information concerning the biological significance of HPV-6 intratype genomic variability / Doutor