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Variabilidade genética e morfológica em populações de Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 (Brachyura, Trichodactylidae) no Brasil / Genetic and morphological variability in populations of Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 (Brachyura, Trichodactylidae) at Brazil.

Carvalho, Edvanda Andrade Souza de 29 October 2013 (has links)
O caranguejo de água doce Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 apresenta uma considerável variabilidade morfológica, aliada a uma ampla distribuição geográfica e ocupação de ambientes costeiros e continentais. Tal variabilidade tem gerado, em alguns casos, dúvidas quanto à delimitação da espécie. O presente trabalho tem como objetivo averiguar se as populações de T. fluviatilis apresentam divergências morfológicas e genéticas compatíveis com o nível intraespecífico avaliando-se a hipótese de validade deste táxon. Para isto, foi realizada a análise da variabilidade genética entre as populações e uma revisão taxonômica. O material analisado foi obtido por meio de coletas, visitas e empréstimos de coleções carcinológicas do Brasil. Foram analisados caracteres descritos na literatura e obtidas sequências parciais dos genes mitocondriais 16S rRNA e citocromo c oxidase subunidade I (COI). Dentre os caracteres morfológicos analisados alguns tiveram muita variação, enquanto outros se mostraram bem informativos para alguns grupos. O resultado da análise molecular mostrou a formação de clados internos com altas divergências genéticas entre eles, tanto para o gene 16S quanto para o COI. Além disso, a espécie T. petropolitanus foi alocada entre os clados reconhecidos morfologicamente como T. fluviatilis. Tais estruturações genéticas, aliada ao polimorfismo morfológico, mostraram claramente que a espécie reconhecida morfologicamente como T. fluviatilis não forma um grupo monofilético, podendo ser considerada um complexo de espécies, que precisa de ajustes taxonômicos consideráveis. / The freshwater crab Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 presents a considerable morphological variability, as well as a wide geographical distribution and occupancy of coastal and continental environments. Such variability has generated, in some cases, doubts concerning the species delimitation. The present work aims to investigate whether the populations of T. fluviatilis exhibit morphological and genetic divergence compatible with the intraspecific level, assessing the hypothesis of validity of this taxon. Therefore, we have performed the analysis of genetic variability among populations and a taxonomic revision. The material analyzed was obtained from field expeditions, visits and loans from carcinological collections. We analyzed morphological characters described in the literature as well as obtained partial sequences of the 16S rRNA and cytochrome c oxidase subunit I (COI) mitochondrial genes. Some morphological characters analyzed had a wide variation, while others were well informative for some groups. The results of molecular analysis showed the formation of internal clades with high genetic divergence among them, both for 16S and COI. Moreover, the species T. petropolitanus was allocated among clades recognized morphologically as T. fluviatilis. Such genetic structuration and morphological polymorphism clearly indicate that the species morphologically recognized as T. fluviatilis does not form a monophyletic group. Therefore, it must be considered as a species complex, which claims for huge taxonomic adjustments.
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Ajuste autonômico e endotelial frente a eletroestimulação ganglionar em homens com insuficiência cardíaca chagásica : ensaio controlado e randomizado

Nakata, Cláudio Hiroshi, Nakata, Cláudio Hiroshi 26 July 2018 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ceilândia, Programa de Pós-Graduação Stricto Sensu em Ciências e Tecnologias e Saúde, 2018. / Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ceilândia, Programa de Pós-Graduação Stricto Sensu em Ciências e Tecnologias e Saúde, 2018. / Introdução: A estimulação elétrica nervosa transcutânea (TENS) aplicada na região cérvico-torácica tem demonstrado capacidade de aumentar o fluxo sanguíneo periférico por meio da modulação autonômica em indivíduos saudáveis e isquemia vascular. Pacientes com insuficiência cardíaca de etiologia chagásica manifestam fibrose das fibras miocárdicas que induz uma sobrecarga autonômica compensatória. Nossa hipótese é que a EEG possa modular a hiperatividade simpática e melhorar a função vascular nessa população. Objetivos - Avaliar o efeito da estimulação elétrica nervosa transcutânea ganglionar na variabilidade da frequência cardíaca (VFC) e na dilatação mediada por fluxo (FMD) em homens com insuficiência cardíaca chagásica. Métodos: Foi realizado um ensaio clínico randomizado. Vinte homens (10 saudáveis e 10 chagásicos) foram submetidos a uma intervenção (TENS ou placebo) aplicada sobre a região ganglionar (vértebras C7 e T4) durante 30 minutos. A VFC e as imagens de fluxo sanguíneo e resistência vascular foram continuamente monitoradas durante as sete etapas do protocolo de coleta enquanto que as imagens da FMD foram registradas antes e após a intervenção durante os 5 minutos de liberação do manguito da oclusão da artéria braquial. Os efeitos da intervenção foram comparados utilizando-se o Teste ANOVA Two-way com Teste post-hoc de Tukey para ambos os grupos, considerando um p <0,05. Resultados: A FMD aumentou 69,93% nos indivíduos saudáveis (6,32 ± 2,39% para 10,74 ± 2,52%) e 28,45% em pacientes chagásicos (8,33 ± 2,44% para 10,7 ± 1,98%) após aplicação da TENS ganglionar. A VFC apresentou um padrão de redução da atividade simpática durante a modulação autonômica. Conclusão: Apesar de não alterar os índices da VFC, a aplicação da TENS sobre a região cérvico-torácica melhorou o ajuste da função endotelial da artéria braquial. Este resultado ratifica o efeito vascular da TENS aplicada sobre o gânglio estrelado e demonstra a capacidade preservada de dilatação dos vasos na insuficiência cardíaca chagásica. / Introdução: A estimulação elétrica nervosa transcutânea (TENS) aplicada na região cérvico-torácica tem demonstrado capacidade de aumentar o fluxo sanguíneo periférico por meio da modulação autonômica em indivíduos saudáveis e isquemia vascular. Pacientes com insuficiência cardíaca de etiologia chagásica manifestam fibrose das fibras miocárdicas que induz uma sobrecarga autonômica compensatória. Nossa hipótese é que a EEG possa modular a hiperatividade simpática e melhorar a função vascular nessa população. Objetivos - Avaliar o efeito da estimulação elétrica nervosa transcutânea ganglionar na variabilidade da frequência cardíaca (VFC) e na dilatação mediada por fluxo (FMD) em homens com insuficiência cardíaca chagásica. Métodos: Foi realizado um ensaio clínico randomizado. Vinte homens (10 saudáveis e 10 chagásicos) foram submetidos a uma intervenção (TENS ou placebo) aplicada sobre a região ganglionar (vértebras C7 e T4) durante 30 minutos. A VFC e as imagens de fluxo sanguíneo e resistência vascular foram continuamente monitoradas durante as sete etapas do protocolo de coleta enquanto que as imagens da FMD foram registradas antes e após a intervenção durante os 5 minutos de liberação do manguito da oclusão da artéria braquial. Os efeitos da intervenção foram comparados utilizando-se o Teste ANOVA Two-way com Teste post-hoc de Tukey para ambos os grupos, considerando um p <0,05. Resultados: A FMD aumentou 69,93% nos indivíduos saudáveis (6,32 ± 2,39% para 10,74 ± 2,52%) e 28,45% em pacientes chagásicos (8,33 ± 2,44% para 10,7 ± 1,98%) após aplicação da TENS ganglionar. A VFC apresentou um padrão de redução da atividade simpática durante a modulação autonômica. Conclusão: Apesar de não alterar os índices da VFC, a aplicação da TENS sobre a região cérvico-torácica melhorou o ajuste da função endotelial da artéria braquial. Este resultado ratifica o efeito vascular da TENS aplicada sobre o gânglio estrelado e demonstra a capacidade preservada de dilatação dos vasos na insuficiência cardíaca chagásica. / Background: Transcutaneous electrical nerve stimulation (TENS) over cervicothoracic region has been shown to increase peripheral blood flow through autonomic modulation in healthy individuals and vascular ischemia. Patients with heart failure with chagasic etiology show fibrosis of the myocardial fibers without severe vascular impairment, but with greater compensatory autonomic overload. Our hypothesis is that GEE may modulate sympathetic hyperactivity and vascular function in this population. Objectives - To evaluate the effect of ganglionic transcutaneous electrical nerve stimulation on heart rate variability (HRV) and flow - mediated dilatation (FMD) in patients with chagasic heart failure. Methods: It was a randomized controlled trial. Twenty men (10 healthy and 10 chagasic) underwent interventional stimulation (TENS or placebo) applied over the ganglionic region (C7 and T4 vertebrae) for 30 minutes. HRV and images of blood flow and vascular resistance were continuously monitored during the seven steps of the collection protocol while images of FMD were recorded before and after the intervention during the 5 minutes of cuff-occlusion release of brachial artery. The effects of the intervention were compared using the Two-Way ANOVA test with Tukey Post-hoc test for bothe groups considering a p <0.05. Results: Flow-mediated dilation (FMD) increased 69.93% in healthy subjects (6.32 ± 2.39% to 10.74 ± 2.52%) and 28.45% in chagasic patients (8.33 ± 2.44% to 10.7 ± 1.98%) after GEE application. Heart rate variability (HRV) showed a pattern of reduction of sympathetic activity during autonomic modulation. Conclusion: Despite we didn't find any change in HRV indexes, the application of TENS over cervico-thoracic region improved the endothelial function of the brachial artery. This result ratifies the vascular effect of TENS applied on the star ganglion and demonstrates the preserved capacity of vessel dilatation in chagasic heart failure. / Background: Transcutaneous electrical nerve stimulation (TENS) over cervicothoracic region has been shown to increase peripheral blood flow through autonomic modulation in healthy individuals and vascular ischemia. Patients with heart failure with chagasic etiology show fibrosis of the myocardial fibers without severe vascular impairment, but with greater compensatory autonomic overload. Our hypothesis is that GEE may modulate sympathetic hyperactivity and vascular function in this population. Objectives - To evaluate the effect of ganglionic transcutaneous electrical nerve stimulation on heart rate variability (HRV) and flow - mediated dilatation (FMD) in patients with chagasic heart failure. Methods: It was a randomized controlled trial. Twenty men (10 healthy and 10 chagasic) underwent interventional stimulation (TENS or placebo) applied over the ganglionic region (C7 and T4 vertebrae) for 30 minutes. HRV and images of blood flow and vascular resistance were continuously monitored during the seven steps of the collection protocol while images of FMD were recorded before and after the intervention during the 5 minutes of cuff-occlusion release of brachial artery. The effects of the intervention were compared using the Two-Way ANOVA test with Tukey Post-hoc test for bothe groups considering a p <0.05. Results: Flow-mediated dilation (FMD) increased 69.93% in healthy subjects (6.32 ± 2.39% to 10.74 ± 2.52%) and 28.45% in chagasic patients (8.33 ± 2.44% to 10.7 ± 1.98%) after GEE application. Heart rate variability (HRV) showed a pattern of reduction of sympathetic activity during autonomic modulation. Conclusion: Despite we didn't find any change in HRV indexes, the application of TENS over cervico-thoracic region improved the endothelial function of the brachial artery. This result ratifies the vascular effect of TENS applied on the star ganglion and demonstrates the preserved capacity of vessel dilatation in chagasic heart failure.
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Configuração meteorológica do verão (2013-2014) anomalamente quente das regiões Sul e Sudeste do Brasil / Meteorological configuration of the anomalously warm summer (2013-2014) in Southern and Southeastern Brazil

Bezerra, Jeymison Margado, Bezerra, Jeymison Margado 29 April 2016 (has links)
Submitted by Ubirajara Cruz (ubirajara.cruz@gmail.com) on 2017-08-28T12:58:18Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertcao_jeymison_bezerra.pdf: 16162349 bytes, checksum: 9f76cd869e7b7a9da31c0415636c74e0 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-08-28T20:57:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertcao_jeymison_bezerra.pdf: 16162349 bytes, checksum: 9f76cd869e7b7a9da31c0415636c74e0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-28T20:57:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertcao_jeymison_bezerra.pdf: 16162349 bytes, checksum: 9f76cd869e7b7a9da31c0415636c74e0 (MD5) Previous issue date: 2016-04-29 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul - FAPERGS / Neste trabalho são apresentados os resultados de um estudo sinótico sobre o comportamento anômalo da temperatura do ar nas regiões sul e sudeste do Brasil para o período referente aos meses de dezembro (2013), janeiro, fevereiro e março (2014). Aqui, optou-se pelo verão astronômico (janeiro, fevereiro e março, JFM), pois o trimestre de dezembro, janeiro e fevereiro apresentou locais com significativas anomalias negativas. Foram usados dados de reanálise do projeto MERRA do período de 1979 a 2008 para os referidos meses, com o objetivo de se obter a climatologia e as anomalias das variáveis meteorológicas. De acordo com os resultados das anomalias de temperatura, foram observadas na região sudeste as maiores variações espaciais de anomalias positivas, sendo os maiores valores na região litorânea, assim como na região sul, no entanto, se expandido praticamente sobre todo o Rio Grande do Sul (RS), sendo este o Estado com os maiores valores positivamente anômalos da região. Em baixos níveis (850 hPa), no sudeste, foi observada anomalia negativa (atmosfera seca) e no sul positiva (atmosfera úmida) resultado do escoamento anômalo do vento norte em 850 hPa e das anomalias de pressão ao nível médio do mar, que mostraram deslocamento mais para sul da região ciclogenética da América do Sul (AS) e deslocamento para oeste do Anticiclone semipermanente do Atlântico. Observou-se fortes anomalias positivas de altura geopotencial em 500 hPa no Atlântico e no Pacífico, em que a primeira influenciou diretamente a circulação continental. Em 250 hPa notou-se a formação de um bloqueio do tipo dipolo sobre a região de estudo. Para comparação, ainda foi feito o estudo das anomalias dos cinco verões (1984, 2001, 2003, 2006 e 2010) anomalamente quentes nas referidas regiões. Percebeu-se que em superfície, em verões anomalamente quentes há o surgimento de anomalia positiva de pressão ao nível médio do mar próximo à costa sudeste da AS relacionado com o deslocamento para oeste e intensificação da Alta subtropical do Atlântico Sul (ASAS). Foi possível observar, ainda, que a Alta Subtropical do Pacífico Sul se intensificou provocando situação de bloqueio. Em 250 hPa, percebeu-se o enfraquecimento do jato subtropical, indicando diminuição ou menor frequência das instabilidades baroclínicas na região. / This work presents the results of a synoptic study of the anomalous behavior of the air temperature in the south and southeast of Brazil for December (2013), January, February and March (2014). It was, we opted for the astronomical summer (January, February and March, JFM), because the quarter December, January and February showed places with significant negative anomalies. Project MERRA reanalysis data were used from 1979 to 2008 for those months, in order to obtaining the climatology and the anomalies of meteorological variables. According to the results of temperature anomalies have been observed in the Southeast the highest spatial variations of positive anomalies, being the highest values in the coastal region, as well as in the South, however, expanded over the practically whole Rio Grande do Sul (RS) - the State with the highest positively anomalous values in the region. At low levels (850 hPa), in Southeast a negative anomaly was observed (dry atmosphere) and in the South was observed a positive (humid atmosphere), resulting from an anomalous northern flow and from anomalies of mean sea level pressure, which showed a shifting further south of South American ciclogenetic region and a shift to the west of the semi-permanent Atlantic anticyclone. Strong positive anomalies of geopotential height at 500 hPa over the Atlantic and the Pacific was observed, in which the first one influenced directly the continental circulation. At 250 hPa was observed the formation of a dipole blocking system on the study area. In compare, we have made the study of anomalies of the five anomalously warm summers (1984, 2001, 2003, 2006 and 2010), in these referred regions. In anomalously warm summers there is a sea level pressure positive anomaly near the southeast coast of AS associated with the displacement to the west and intensification of the South Atlantic subtropical high. We also observed that the South Pacific subtropical high intensified causing a blocking situation. At 250 hPa, the weakening of the subtropical jet indicating a decay or lower frequency of baroclinic instabilities over the region.
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Caracterização in situ, molecular e morfológica de acessos de Gossypium do Estado de Pernambuco / In situ, molecular and morphological caracterization of Gossypium accesses of Pernambuco state

RIBEIRO, Carla Sibere Nogueira 04 August 2008 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-06T16:09:00Z No. of bitstreams: 1 Carla Sibere Nogueira Ribeiro.pdf: 1627886 bytes, checksum: d308c35b334df86939e3a2810d83adf2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-06T16:09:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carla Sibere Nogueira Ribeiro.pdf: 1627886 bytes, checksum: d308c35b334df86939e3a2810d83adf2 (MD5) Previous issue date: 2008-08-04 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Cotton (G. hirsutum L.) has the most important natural textile fiber in the world. The Gossypium remainders in Pernambuco state are in risk of disappearing due to ecological and agricultural process. The study of species in situ, about they genetic and morphological characteristics gives support in order to find and implement preservation options. The aims of this work was characterize the genetic variability of G. hirsutum e G. barbadense accesses of Sertão, Agreste and Zona da Mata of Pernambuco state by morphological and molecular marks. On the in situ study were evaluated 82 accesses in the 29 counties during expedition in 2005 and 2006 by interview and observation about morphological and phenological characters, and condition of conservation. The identified plants uses were: medical, ornamental and for confection of lamp wick. The genetic erosion risk observed were: change and loss of cultural human habit, animal pastry and environmental depredate. In the molecular study was used fifteen pair of microssatelites primers in order to evaluate the allelic frequency, genetic diversity and genetic distance by Nei statistical. The average of heterozygosis expected (He) that correspond the genetic diversity was 0.321, it was biggest for upland cotton (0.481). For the three studied biomes on the Sertão and the Agreste where predominate of the upland cottonthe He had highest value, 0.548 e 0.444, respectively. The average of inbreeding index was 0.806, highest for G. barbadense (0.968). Cluster shoed an interspecific hybrid between G. barbadense and G. hirsutum (PE 0553). On the morphological characterization ex situ were evaluated 38 morphological characters and nine fiber characters of 72 Gossypium accesses PE0553 (G. barbadense), PE0516 (upland cotton) and PE0524 (moco cotton) were the most morphological divergent and showedmore variability for studied characters. The majority of accesses of three types of cotton shoed good index for fiber being what herbaceous cotton were better about fiber uniformity, reflectance, resistance and percentage of fiber. The information obtained on morphological and molecular cauterization Gossypium genus on Pernambuco state showed high genetic diversity that should be conserving in order gives genes to breeding programs. / O algodoeiro (G. hirsutum L.) possui a mais importante fibra têxtil natural no mundo. Os remanescentes de Gossypium no Estado de Pernambuco correm sérios riscos de desaparecerem em decorrência de fatores ecológicos e agrícolas. O estudo das espécies in situ, em relação suas características genéticas e morfológicas, contribui potencialmente à implantação de medidas de manejo e preservação de espécies naturalizadas. O presente trabalho teve por objetivo caracterizar a variabilidade genética de acessos de G.hirsutum e G. barbadense do Agreste, Sertão e Zona da Mata do Estado de Pernambuco, por meio de marcadores morfológicos e moleculares. No estudo in situ, avaliou-se os 82 acessos durante expedições em 29 municípios nos anos 2005 e 2006, investigando-se por entrevistas e observações, sobre caracteres morfológicos, fenológicos e de conservação. Os usos das plantas identificados foram: medicinal, asséptico, ornamental e confecção de pavios de lamparina. Os riscos de erosão genética constatados foram: mudança e abandono de hábitos culturais, pastejo e depredação do ambiente. Na análise molecular, utilizou-se quinze pares de primers microssatélites para avaliar freqüências alélicas, diversidade genética e distância entreos genótipos pelas estatísticas de Nei. A heterozigosidade média esperada (He), que correspondem a diversidade genética, foi 0,321, sendo mais alta para o algodoeiro mocó (0,481). Considerando-se os três biomas estudados, no Sertão e no Agreste, locais em que predominou algodoeiro mocó, tiveram os maior valore de He, 0,548 e 0,444, respectivamente. O coeficiente de endogamia média foi de 0,806, tendo sido mais elevado em G. barbadense (0,968). O agrupamento revelou um híbrido interespecífico entre G. barbadense e G. hirsutum (PE 0553). Na caracterização morfológica ex situ, avaliou-se 38 caracteres morfológicos e nove caracteres de fibra, de 72 acessos de Gossypium. Dos três tipos de algodoeiros caracterizados, constatouse maior diversidade morfológica nos acessos de algodoeiro mocó. Os acessos PE0553 (G. barbadense), PE0516 (algodoeiro herbáceo) e PE0524 (algodoeiro mocó) foram os mais divergentes morfologicamente, apresentando maior variabilidade nos descritores avaliados. A maioria dos acessos dos três tipos de algodoeiros revelaram índices satisfatórios de características intrínsecas de fibra, sendo que os algodoeiros herbáceos foram superiores em relação ao índice de uniformidade de fibra, reflectância,resistência e percentagem de fibra. As informações obtidas na caracterização molecular e morfológica mostraram elevada diversidade genética nos acessos de Gossypium, no Estado de Pernambuco, que deve ser conservada para servir de fonte de genes para os programas de melhoramento genético.
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A influência da temperatura da superfície do mar sobre a distribuição e abundância relativa da albacora bandolim (Thunnus obesus, Lowe 1839) no Atlântico Oeste Tropical

SOUSA NETO, Aprigio Marques de 21 August 2009 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-08T11:57:22Z No. of bitstreams: 1 Aprigio Marques de Sousa Neto.pdf: 1174109 bytes, checksum: b0262e812fcb006c6f76782c56519e12 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-08T11:57:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Aprigio Marques de Sousa Neto.pdf: 1174109 bytes, checksum: b0262e812fcb006c6f76782c56519e12 (MD5) Previous issue date: 2009-08-21 / In recent years, with the advent of global climate change, several studies have been developed in order to better understand the changes in the pelagic ocean environment and its effects on the main fishing resources explored in the three oceans. This present study was to evaluate the influences of environmental variability on the CPUE of bigeye tuna (Thunnus obesus) caught by Brazilian longline fleet in the period from 1978 to 2008. For this, we analyzed the data on settings, seasonality, fishing areas, effort, catch, time of immersion, number of hooks / Basket and fishing time, and some environmental data such as sea surface temperature (SST), the depth of the layer of mixture (PCM) and the rate of illumination of the moon (IIL). We performed a cluster analysis with the aim of categorizing the fishing effort associated with the catches of different species, then an analysis with generalized additive models (GAMS) in order to assess the relationship between these factors and the CPUE from big eye tuna. The results showed that as regards the variable latitude, the higher values of CPUE occurred around the equator. The case of the month on the CPUE index, we observed the highest values between October and April. Already the level of lunar illumination on the CPUE showed an increasing trend of the new moon to crescent. The SST showed a positive trend with higher values occurring between 26 and 30° C on CPUE. The effect of PCM, highest CPUEs occurred in areas where the thermocline is closer to the surface, between 40 and 70 m. In relation to the variable year, positive effects were only observed from 2000. These results are probably related to the reproductive activity of the specie, which is focused off the Brazilian coast for spawning. / Nos últimos anos, com o advento das mudanças climáticas globais, diversos estudos vêm sendo desenvolvidos no intuito de melhor compreender às variações do ambiente pelágico oceânico e seus efeitos sobre os principais recursos pesqueiros explorados nos três oceanos.O presente estudo teve como objetivo avaliar as influências da variabilidade ambiental sobre a CPUE da albacora bandolim (Thunnus obesus) capturada pela frota espinheleira brasileira no período de 1978 à 2008. Para isto, foram analisados os dados referentes aos lançamentos, sazonalidade, área de pesca, esforço, captura, tempo de imersão, número de anzóis/samburá e turno de pesca, e alguns dados ambientais, como a Temperatura da Superfície do Mar (TSM), a Profundidade da Camada de Mistura (PCM) e o Índice de Iluminação da Lua (IIL). Foi realizada uma análise de cluster com o objetivo de categorizar o esforço de pesca associandoo as capturas de diferentes espécies e, em seguida, uma análise com Modelos Aditivos Generalizados (GAMs) com o intuito de avaliar a relação entre estes fatores e a CPUE da albacora bandolim. Os resultados obtidos mostraram que no que se refere a variável latitude, os maiores valores de CPUE ocorreram no entorno do equador. Se tratando do índice mês sobre a CPUE, observou-se os maiores valores entre outubro e abril. Já o índice de iluminação lunar sobre a CPUE apresentou uma tendência crescente de lua nova para quarto-crescente. A TSM mostrou uma tendência positiva com maiores valores ocorrendo entre 26° e 30°C sobre a CPUE. No efeito da PCM, as CPUEs mais elevadas ocorreram em áreas onde a termoclina encontra-se mais próxima da superfície, entre 40 e 70 m. Em relação à variável ano, efeitos positivos só foram observados a partir de 2000. Estes resultados estão provavelmente associados à atividade reprodutiva da espécie, que se concentra ao largo da costa brasileira para desova.
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Efeitos da variabilidade ambiental na distribuição e abundância relativa da albacora branca (Thunnus alalunga, Bonaterre 1788) no Atlântico Sul

OLIVEIRA, Bruno de 31 August 2010 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-08T16:07:31Z No. of bitstreams: 1 Bruno de Oliveira.pdf: 2373684 bytes, checksum: 5f89aaf529fed3c21f21b9c51546d9b8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-08T16:07:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bruno de Oliveira.pdf: 2373684 bytes, checksum: 5f89aaf529fed3c21f21b9c51546d9b8 (MD5) Previous issue date: 2010-08-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Analysis between the environmental variability in the pelagic ocean environment, distribution and abundance of the main oceanic fishing resources, have been evaluated in several studies, mainly with the intensification of global climate changes in the recent decades. The main objective of this study was to evaluate the relations between the catches (CPUE) of albacore(Thunnus alalunga) and some environmental parameters, together with spatio temporal data of fishing activities during the period between 1980 and 2007. The fishing data used, including the spatio temporal distribution of effort and catches are referred of long line fleet operations of Brazil (BNDA) and China Taipei (ICCAT). The environmental parameters (SST– Sea Surface Temperature and DML – Depth Mixed Layer) were obtained in international oceanographic data banks. Generalized Additive Models (GAM’s) were used for analyses between CPUE (dependent variable) and the environmental variability. Furthermore, spatio temporal aspect(latitude, longitude, month and year) of fish activity were included, in order to evidence the seasonality in catches. The results obtained show that the environmental variability on oceanographic conditions have a strong influence in the distribution and abundance of albacore, and, consequently, in its catch rate (CPUE). The SST (positive correlation with latitude, for the area of this study) was the most important environmental parameter in catch rates (CPUE). Besides that, we inferred that catches received a positive influence in areas where the thermocline is more superficial and there is a seasonal pattern in the distribution and abundance characteristic. These aspects seem to be in relation with the migratory movements of this specie in the South Atlantic Ocean, including the concentration along the Brazilian coast for spawn in austral summer. / Relações entre a variabilidade ambiental do ambiente pelágico oceânico e a distribuição e abundância relativa dos principais recursos pesqueiros oceânicos, vêm sendo avaliadas em diversos estudos, principalmente com a intensificação dos processos de mudanças climáticas, ocorridos em décadas recentes. O objetivo principal deste estudo foi avaliar a relação entre a captura (CPUE) da albacora branca (Thunnus alalunga) e algumas variáveis ambientais, juntamente com dados espaço-temporais da atividade pesqueira, referentes ao período compreendido entre 1980 e 2007. Os dados de pesca utilizados, incluindo a distribuição espaço-temporal do esforço de pesca e das capturas, são referentes à operação da frota espinheleira do Brasil (Banco Nacional da Pesca de Atuns e Afins) e de China Taipei (International Comission for Conservation of Atlantic Tunas, em inglês). Os dados ambientais (TSM – Temperatura da Superfície do Mar e PCM – Profundidade da Camada Mistura) foram obtidos de bancos internacionais de dados oceanográficos. Modelos Aditivos Generalizados (GAM’s) foram utilizados para averiguar as relações entre o rendimento pesqueiro, expresso através da CPUE (variável dependente), e à variabilidade ambiental. Além disto, aspectos espaço-temporais (latitude, longitude, mês e ano) foram incorporados, de modo a evidenciar a sazonalidade das capturas na área do estudo. Os resultados obtidos mostram que à variabilidade ambiental do ambiente oceanográfico influencia fortemente à distribuição e abundância da espécie e, consequentemente, das capturas. A TSM (correlação positiva com a latitude, para a área de estudo) foi o fator ambiental que mais influenciou a CPUE. Além disto, podemos inferir que as capturas sofrem influência positiva em áreas com a termoclina mais próxima da superfície aquática e que existe um padrão sazonal de distribuição e abundância bem marcado. Estes aspectos parecem estar relacionados com o padrão migratório da espécie no Atlântico sul, incluindo a concentração da mesma ao largo da costa brasileira para fins reprodutivos, durante o verão austral.
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Variabilidade espacial da composição e qualidade do leite cru refrigerado no estado de Alagoas e no agreste pernambucano / Spatial variability of the composition and quality of raw milk refrigerated in Alagoas state and rural Pernambuco

FÉRRER, Moisés Tenório 27 July 2016 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-02-13T13:10:07Z No. of bitstreams: 1 Moises Tenorio Ferrer.pdf: 2245013 bytes, checksum: 440b63b0a25d6263c4d43cc9c2a774c9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T13:10:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Moises Tenorio Ferrer.pdf: 2245013 bytes, checksum: 440b63b0a25d6263c4d43cc9c2a774c9 (MD5) Previous issue date: 2016-07-27 / The aim of this study was to analyze the spatial variability of the composition and quality of refrigerated raw milk in the state of Alagoas and in the middle region of Pernambuco Agreste, in the years 2014 and 2015. Thus, were obtained from the three companies in the dairy sector submitted to the federal inspection service (SIF) that collect milk in the state of Alagoas and in the middle region of Pernambuco Agreste, 3863 monthly official reports on somatic cell count (SCC) and total bacterial (CBT), fat, protein, lactose, total solids and nonfat dry extract of 432 different tanks direct expansion milk in the years 2014 and 2015. the data were analyzed for spatial dependence and geographically weighted regression, using the ArcGIS 10.3 software. It was observed predominantly spatial distribution of CBT log 5.07 to 5.19 and diffuse areas with values from 5.20 to 5.54. It was observed predominant value of somatic cell score (SCS) from 2.81 to 2.99; sites with from 1.87 to 2.80; places with 3.00 to 3.16, and isolated points with peaks from 3.17 to 3.39. It was identified low influence of altitude, rainfall and altitude interaction x rainfall on the ECS and the CBT log. The analysis of spatial dependence was observed that there is high spatial dependence between variables fat, lactose and total solids. Still, protein, ECS and CBT log have moderate spatial dependence and the dry extract low spatial dependence. The altitude, rainfall and altitude interaction x rainfall have low influence on the fat, lactose, protein, total solids, nonfat dry extract, ECS and CBT log. Finally, geostatistics is an important tool for the analysis of milk quality, helping the classical statistics for better understanding of the phenomenon when the variable is regionalized. / O objetivo com este trabalho foi analisar a variabilidade espacial da composição e qualidade do leite cru refrigerado no Estado de Alagoas e na mesorregião do Agreste pernambucano, nos anos de 2014 e 2015. Para tanto, foram obtidos, junto as três empresas do setor de lácteos submetidas ao serviço de inspeção federal (SIF) que captam leite no Estado de Alagoas e na mesorregião do Agreste pernambucano, 3.863 laudos oficiais mensais sobre a contagem de células somáticas (CCS) e bacteriana total (CBT), os teores de gordura, proteína, lactose, sólidos totais e extrato seco desengordurado do leite de 432 diferentes tanques de expansão direta nos anos de 2014 e 2015. Os dados foram analisados quanto a dependência espacial e regressão geograficamente ponderada, com o uso do software ArcGIS 10.3. Foi observada distribuição espacial predominante da log CBT de 5,07 a 5,19 e áreas difusas com valores de 5,20 a 5,54. Foi observado valor predominante do escore de células somáticas (ECS) de 2,81 a 2,99; locais com 1,87 a 2,80; locais com 3,00 a 3,16, e pontos isolados com picos de 3,17 a 3,39. Foi identificada baixa influência da altitude, da precipitação pluviométrica e da interação altitude x precipitação sobre o ECS e o log CBT. Quanto a análise da dependência espacial, foi observado que há dependência espacial alta entre as variáveis gordura, lactose e sólidos totais. Ainda, proteína, ECS e log CBT têm dependência espacial moderada e o extrato seco desengordurado baixa dependência espacial. A altitude, precipitação pluviométrica e a interação altitude x precipitação têm baixa influência sobre os teores de gordura, lactose, proteína, sólidos totais, extrato seco desengordurado, ECS e log CBT. Por fim, a geoestatística é uma ferramenta importante para a análise da qualidade do leite, auxiliando a estatística clássica para um melhor entendimento do fenômeno quando a variável é regionalizada.
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Determinação da heterose e da capacidade geral e específica de combinação para dez características agronômicas em pimentão (Capsicum annuum L.)

MESQUITA, Júlio Carlos Polimeni de 18 February 2008 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-17T16:11:57Z No. of bitstreams: 1 Julio Carlos Polimeni de Mesquita.pdf: 1621948 bytes, checksum: 21d761249ed53577812a123c5680e21d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-17T16:11:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Julio Carlos Polimeni de Mesquita.pdf: 1621948 bytes, checksum: 21d761249ed53577812a123c5680e21d (MD5) Previous issue date: 2008-02-18 / The aim of the present study was to evaluate the agronomic potential, general and specific capability to combine and heterosis between the varieties of sweet pepper (Capsicum annuum L.). The experiments were conducted at the Crop Area of the Agronomy Department of the Federal Rural University of Pernambuco in Recife, Pernambuco (Brazil) (latitude 8° 10'52''S and longitude 34° 54'47''W) from December 27, 2007 to May 9, 2008. There was partial diallel cross balanced between four varieties (HTV-1, HTV-2, HTV and HTV-3-4), resulting in six F1 hybrids without the reciprocal. The four strains used as parents and the six hybrids from the diallel were planted in polystyrene trays; 30 days after sowing, the plants were transplanted into 5-L plastic pots containing powdered coconut as substrate and fertirrigated daily with a nutritive solution. We evaluated the overall capability (GCC) and specific capability (SCC) of the combination of the four varieties and six hybrids, with differences found in GCC and SCC in December regarding the following agronomic characteristics: total number of fruits; number of the fruits from early production;early production weight; total weight of fruit; average weight of fruit; average fruit length; average fruit diameter;length/diameter ratio (C/D); average thickness of the pericarp; and average number of locules. According to GCC estimates (gi), HTV-2 and HTV-4 varieties achieved positive values for early production weight and the strain HTV-2 also achieved positive values for total weight of fruits. The SCC revealed that the hybrid combinations with positive values of heterosis were HTV-1 x HTV-2 and HTV-3 x HTV-4 for seven of the ten characteristics evaluated, followed by HTV-2 x HTV-3, which received positive values for total weight of the fruit, average fruit weight and average fruit diameter. Systems of diallel crosses are important for evaluating alternative genotypes as well as indicating the best hybrids and choosing the most promising parents for use in hybridization programs. Another experiment was conducted using the HTV-1, HTV-2, HTV-3, HTV-4, HTV-5, HTV and HTV-6-7 varieties, fifteen experimental hybrids (HTV-1 x HTV-2 , HTV-1 x HTV-3, HTV-1 x HTV-4, HTV-2 x HTV-3, HTV-2 x HTV-4, HTV-3 x HTV-4, HTV-5 x HTV-2, HTV -6 X HTV-2, HTV-5 x HTV-3, HTV-6 x HTV-3, HTV-2 x HTV-7, HTV-3 x HTV-7, HTV-5 x HTV -4, HTV-6 x HTV-4 and HTV-7 x HTV-4), an open-pollinated cultivar ("All Big") and a commercial hybrid("Atlantis"), which were evaluated in a hydroponic production system of a greenhousein order to identify the seven most promising strains for inclusion in breeding programs as well as study the effects of heterosis in 16 experimental hybrids (F1) regarding the mean of the parents, mean of the superior parent, a standard cultivar (All Big) and a standard hybrid (Atlantis F1) for December, addressing ten agronomic characteristics. The ratio between the coefficient of genetic variation and the coefficient of environmental variation (CVg/CVe) achieved values greater than 1.0 for all characteristics studied. For the heterosis, the most expressive values were found for the characteristics of early production and total weight of fruits. The hybrids HTV-2 x HTV-3, HTV-2 x HTV-4, HTV-5 x HTV-2, HTV-6 x HTV-2, HTV-2 x HTV-7 and HTV-6 x HTV-4 achieved positive heterosis values regarding early production in relation to the mean of the parents, the parent with the larger mean, the standard cultivar and the standard hybrid. The HTV-5 x HTV-2, HTV-2 x HTV-7 treatments achieved positive heterosis values regarding weight of the fruit in relation to the standard hybrid. The hybrid HTV-2 x HTV-7 was found to have potential for use in field evaluations in order to test its superiority. The presence and magnitude of heterosis demonstrate theprospect for the production of hybrids. Knowledge on the behavior of the F1 hybrids in relation to their cultivar parents allows the selection of the best genetic combinations for the desired characteristic. / Este trabalho teve como objetivo avaliar o potencial agronômico, a capacidade geral e especifica de combinação e a heterose entre as linhagens de pimentão (Capsicum annuum L.). Os experimentos foram conduzidos, no Departamento de Agronomia, Área de Fitotecnia, da Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE), em Recife-PE, com latitude de 8º10’52’’S e longitude de 34º54’47’’W, no período de 27 de dezembro de 2007 a 9 de maio de 2008. Realizou-se um cruzamento dialélico parcial, balanceado entre quatro linhagens HTV-1, HTV-2, HTV-3 e HTV-4, obtendo-se seis híbridos F1’s sem os recíprocos. As quatro linhagens utilizadas como pais e os seis híbridos provenientes do dialelo foram semeados em bandeja de poliestireno expandido e, 30 dias após o semeio foram transplantadas para vasos plásticos com capacidade para 5 litros contendo pó-de-coco como substrato e fertirrigadas diariamente com solução nutritiva. Avaliou-se a capacidades geral (CGC) e específica (CEC) de combinação entre as quatro linhagens e os seis híbridos, observando-se as diferenças significativas quanto a CGC e a CEC para dez características agronômicas: número total de frutos (NTF), número de frutos da produção precoce (NFPP), peso da produção precoce (PPP),peso total de frutos (PTF), peso médio de fruto (PMF), comprimento médio de frut (CMF), diâmetro médio de fruto (DMF), relação comprimento/diâmetro (C/D), espessura média do pericarpo (EMP), número médio de lóculos (NML). De acordo com as estimativas da CGC (gi) as linhagens HTV-2 e HTV-4 apresentaram valores positivos de gi para a característica peso produção precoce (PPP), evidenciando-se a linhagem HTV-2 que apresentou valores positivos de gi tanto para o PPP quanto para, o peso total de frutos (PTF). A CEC mostrou que as combinações híbridas com valores positivos de heterose foram HTV-1 x HTV-2 e HTV-3 x HTV-4 para sete das dez características avaliadas, seguida da HTV-2 x HTV-3 que obteve valores positivos para as características PTF, PMF e DMF. Os sistemas de cruzamentos dialélicos são importante alternativa de avaliação dos genótipos, pois além de indicar os melhores híbridos, auxiliam na escolha dos genitores mais promissores a serem utilizados nos programas de hibridação. Outro experimento foi realizado utilizando-se as linhagens (HTV-1, HTV-2, HTV-3, HTV-4, HTV-5, HTV-6 e HTV-7), quinze híbridos experimentais(HTV-1 x HTV-2, HTV-1 x HTV-3, HTV-1 x HTV-4, HTV-2 x HTV-3, HTV-2 x HTV-4, HTV-3 x HTV-4, HTV-5 x HTV-2, HTV-6 x HTV-2, HTV-5 x HTV-3, HTV-6x HTV-3, HTV-2 x HTV-7, HTV-3 x HTV-7, HTV-5 x HTV-4, HTV-6 x HTV-4 e HTV-7 x HTV-4), uma cultivar de polinização aberta “All Big” e um híbrido comercial “Atlantis”, que foram avaliados em condições de cultivo protegido no sistema hidropônico de produção, com o objetivo identificar entre as sete linhagens as mais promissoras para serem incluídas em programas de melhoramento bem como estudar os efeitos da heterose de dezesseis híbridos experimentais F1’s em relação à média dos pais, à média do pai superior, a média da cultivar-padrão “All Big” e a média do híbridopadrão “Atlantis F1”, para dez características agronômicas. A razão entre coeficiente de variação genético e o coeficiente de variação ambiental mostraram valores superiores a 1,0 para todas as características estudadas, evidenciando que a seleção apresenta ganhos genéticos. Para a heterose encontramos valores mais expressivos para as características PPP e PTF. Pode-se destacar os tratamentos HTV-2 x HTV-3, HTV-2 x HTV-4, HTV-5 x HTV-2, HTV-6 x HTV-2, HTV-2 x HTV-7 e HTV-6 x HTV-4, que apresentaram valores positivos de heterose em relação à média dos pais, a do pai de maior média, a da cultivar-padrão e ao hibrido-padrão, para o PPP. Os tratamentos HTV-5 x HTV-2,HTV-2 x HTV-7, foram os que apresentaram valores positivos de heterose em relação ao híbrido-padrão, para a característica PTF. Observou-se que o híbrido HTV-2 x HTV- 7 têm potencial para ser utilizado em avaliações de campo, com a finalidade de se constatar sua superioridade. A presença e a magnitude da heterose evidenciam a perspectiva para a produção de cultivares híbridas. O conhecimento do comportamento dos híbridos F1s em relação às suas cultivares genitoras permite ao melhorista escolher as melhores combinações genéticas para o caráter desejado.
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Variabilidade de Acidovorax avenae subsp. citrulli e epidemiologia da mancha-aquosa do melão

SOUZA, Elineide Barbosa de 28 June 2002 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-16T14:38:17Z No. of bitstreams: 1 Elineide Barbosa de Souza.pdf: 390725 bytes, checksum: 343f1ce1b17f2c507a8bc4587f0077ac (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T14:38:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Elineide Barbosa de Souza.pdf: 390725 bytes, checksum: 343f1ce1b17f2c507a8bc4587f0077ac (MD5) Previous issue date: 2002-06-28 / The variability of 20 Acidovorax avenae subsp. citrulli isolates in relation to melon fruit blotch components, hypersensitive reaction, and the bacterial transmission by seeds from inoculated fruits were studied. The influence of duration (0, 6, 24 and 48 h), the onset of leaf wetness period (0, 6, 24 and 48 h after inoculation), and inoculum concentration of A. avenae subsp. citrulli (3.4 x 101 to 3.4 x 107 CFU mL-1) on severity of fruit blotch in melon plants were also evaluated. The effects of temperature (15, 20, 25, 30, 35 and 40° C), humidity (0 and 6 h of moist chamber), inoculum concentration (3.4 x 101 to 3.4 x 107 CFU mL-1) and fruit age (40, 50, 60 and 70 days) on the development of melon fruit blotch were also verified. Seeds, plants and fruits were inoculated through vacuum infiltration, atomization and sub-epidermal injection, respectively. Seedlings and plants were assessed in relation to incubation period, diseaseindex, area under disease progress curve and disease progress rate; incubation period, diameter of external lesion and lesion depth were assessed on the fruits. The data were submitted to mean comparison tests, clustering tests or regression analysis. The Euclidian distance–single linkage confirmed the variability among the A. avenae subsp. citrulli strains allowing their separation in four similarity groups. Seed transmission ranged from 30 to 64 % and all strains induced hypersensitive reaction on tobacco and tomato leaves. The regression equations for the analyzed variables in melon plants were better adjusted by the quadratic or logarithmic models. The incubation period ranged from 1.3 to 2.7 days and was higher in plants without leaf wetness, although the disease index and area under disease progress curve increased as the duration of leaf wetness increased. The beginning of the leaf wetness period at 48 h after inoculation elevatedthe incubation period and disease progress rate in relation to the other periods. The disease progress rate, disease index and area under disease progress curve increased as the inoculum concentration increases, reaching maximum values of 4.4 infection units/day, 73.7 % and 18.9 at 3.4 x 107 UFC mL-1, respectively, at 3.4 x 101 CFU mL-1. The temperature and humidity influenced significantly (P=0,05) the severity of melon fruit blotch, however, the incubation period was not affected. The larger external lesions were observed in the fruits incubated at 35 and 30° C without moist chamber, and at 30° C in moist chamber for six h. In relation to lesion depth, those lesions in fruits incubated without moist chamber were deeper at 25 and 30° C. However, with moist chamber the lesions at 30° C were deeper than the others. No disease symptoms were observed onfruits incubated at 15 and 20° C. The humidity significantly (P=0,05) influenced the development of external lesions and lesions depth at 35 and 25° C, respectively. The diameter and depth of lesions increased as the inoculum concentration was higher and were reduced as the fruit age increased. No external or internal lesions were detected on fruits with 60 and 70 days inoculated with the pathogen at 3.4 x 101 CFU mL-1. / Foi estudada a variabilidade de 20 isolados de Acidovorax avenae subsp. citrulli quanto aos componentes da mancha-aquosa do melão e reação de hipersensibilidade, e analisada a transmissão da bactéria pelas sementes dos frutos inoculados. Foi também avaliada a influência da duração (0, 6, 24 e 48 horas) e início do período de molhamento foliar (0, 6, 24 e 48 horas após a inoculação), bem como da concentração de inóculo de A. avenae subsp. citrulli (3,4 x 101 a 3,4 x 107 UFC mL-1) na severidade da mancha-aquosa em meloeiro. A influência da temperatura (15, 20, 25, 30, 35 e 40° C), da umidade (0 e 6 horas de câmara úmida), da concentração de inóculo ( 3,4 x 101 a 3,4 x 107 UFC mL-1) e da idade do fruto (40, 50, 60 e 70 dias) no desenvolvimento da mancha-aquosa em melão, foram ainda verificadas. Sementes, plantas e frutos foram inoculados pelos métodos de infiltração a vácuo, pulverização e injeção subepidérmica, respectivamente. Plântulas e plantas foram avaliadas quanto ao período de incubação,índice de doença, área abaixo da curva do progresso da doença e taxa de progresso da doença, e os frutos, quanto ao período de incubação, diâmetro da lesão externa e profundidade da lesão. Os dados obtidos foram submetidos a testes de comparação de médias, testes de agrupamento ou análises de regressão. A análise da distância Euclidiana por ligações simples, confirmou a variabilidade entre os isolados de A. avenae subsp. citrulli, permitindo a separação destes em quatro grupos de similaridade. A transmissão da bactéria por sementes variou de 30 a 64 % e todos os isolados induziram reação de hipersensibilidade em folhas de fumo e tomate. As equações de regressão para as variáveis analisadas em meloeiros foram melhor ajustadas pelos modelos quadrático ou logarítmico. O período de incubação variou de 1,3 a 2,7 dias, emaior nas plantas sem molhamento foliar, contudo o índice de doença e a área abaixo da curva de progresso da doença aumentaram com o incremento da duração do molhamento foliar. O início do período de molhamento foliar às 48 horas após a inoculação elevou o período de incubação e a taxa de progresso da doença em relação aos demais períodos. O incremento da concentração de inóculo elevou a taxa de progresso da doença, índice de doença e área abaixo da curva de progresso da doença, os quais atingiram valores máximos de 4,4 unidades de infecção/dia, 73,7 % e 18,9, respectivamente, na concentração 3,4 x 107 UFC mL-1. A temperatura e umidade influenciaram significativamente a severidade da mancha-aquosa nos frutos, embora o período de incubação não tenha sido afetado. As maiores lesões externas foram observadas em frutos incubados a 35 e 30 ° C sem câmara úmida, e a 30° C em câmaraúmida por seis horas. Com relação à profundidade, as lesões nos frutos incubados sem câmara úmida foram maiores às temperaturas de 25 e 30° C. Em câmara úmida, as lesões a 30° C foram maiores que as demais. Não foi observado desenvolvimento da mancha-aquosa em frutos incubados a 15 e 20° C. A umidade influenciou significativamente (P=0,05) o diâmetro e profundidade da lesão, exceto às temperaturas de 35 e 25° C, respectivamente. O diâmetro e profundidade das lesões aumentaram com a elevação da concentração de inóculo e foram reduzidos com o aumento da idade do fruto. Na concentração 3,4 x 101 UFC mL-1 não foi observada a presença de sintomas da doença na casca e na polp
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Estrutura e relações genéticas de Curvularia eragrostidis no Nordeste do Brasil

FRANÇA, Isadora Fernandes de 28 February 2011 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T13:55:35Z No. of bitstreams: 1 Isadora Fernandes de Franca.pdf: 1420687 bytes, checksum: 6cec52a0fb3778ca5533af6c71262265 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T13:55:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Isadora Fernandes de Franca.pdf: 1420687 bytes, checksum: 6cec52a0fb3778ca5533af6c71262265 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The yam (Dioscorea spp.) has great social importance for the Northeast region of Brazil, due to the excellent nutritional quality and energy of their tubers and very useful for human alimentation. Leaf-spots on white yam, caused by the fungus Curvularia eragrostidis, is responsible for damage to yam in northeast Brazil, mainly in the states of Paraíba and Pernambuco. The aim of this study was to analyze the population structure of isolates of C. eragrostidis pathogenic to yam, D. cayennensis, in the states of Alagoas, Pernambuco and Paraiba, and to study the phylogenetic relationships of these with other species in the genus Cochliobolus. In the first study, 151 isolates were obtained from leaves of yam, which were analyzed the sequences of part of the ITS region and -tubulin gene and gpd and the profiles of DNA with ISSR. It was observed that the DNA sequences had no variation, and ISSR data showed the presence of six haplotypes. The pathogen population is characterized by low genotypic diversity, predominance of one or two genotypes evenly distributed, the predominance of asexual reproduction, and the presence of genotypic flow between the regions of cultivation. In the second study, it was conducted phylogenetic analysis sequences of 81 isolates of species of the family Pleosporaceae using the methods of maximum likelihood and Bayesian inference. The 16 isolates of C. eragrostidis from yam analyzed are related to the genus Cochliobolus species which has smaller conidia and they are phylogenetically closer to the species C. clavata, C. brachyspora, C. oryzae and C. intermedia. / A cultura do inhame (Dioscorea spp.) apresenta grande importância socioeconômica para a região Nordeste do Brasil, devido à excelente qualidade nutritiva e energética de suas túberas e a utilidade para a alimentação humana. A queima das folhas, conhecida também como pinta preta, causada pelo fungo Curvularia eragrostidis, é responsável por grandes prejuízos à cultura do inhame no Nordeste brasileiro, principalmente nos Estados da Paraíba e Pernambuco, que são os maiores produtores. Este trabalho teve como objetivos analisar a estrutura populacional de isolados de C. eragrostidis patogênicos ao inhame, D. cayennensis, nos estados de Alagoas, Pernambuco e Paraíba, bem como estudar as relações filogenéticas destes com as demais espécies do gênero Cochliobolus. No primeiro estudo, foram obtidos 151 isolados, dos quais foram analisados as sequências de parte da região ITS, e dos genes -tubulina e gpd e os perfis de DNA com marcadores ISSR. Observou-se que as sequências de DNA não apresentaram variabilidade, e os dados de ISSR mostraram a presença de seis haplótipos. A população do patógeno é caracterizada por baixa diversidade genotípica, predominância de um ou dois genótipos uniformemente distribuídos, predominância de reprodução assexual, presença de fluxo genotípico entre as regiões de cultivo. No segundo estudo, foram realizadas analises filogenéticas de sequências de 81 isolados de espécies da família Pleosporaceae, através dos métodos de máxima verossimilhança e inferência bayesiana. Os 16 isolados de C. eragrostidis de inhame analisados estão relacionados com espécies do gênero Cochliobolus que apresentam conídios menores e mais próximos filogeneticamente de C. clavata, C. brachyspora, C. oryzae e C. intermedia.

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