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Avaliação genética na presença de heterogeneidade utilizando dados simulados / Genetic evaluation with heterogeneity across herds, using simulation

Carneiro, Antonio Policarpo Souza 31 March 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-12T16:24:50Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 230332 bytes, checksum: 5b41a9ec99d8c6835507f9f522bb1e8c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-12T16:24:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 230332 bytes, checksum: 5b41a9ec99d8c6835507f9f522bb1e8c (MD5) Previous issue date: 2003-03-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os objetivos deste trabalho foram simular estruturas de dados similares às condições reais observadas em rebanhos bovinos em relação a heterogeneidade; comparar os resultados das análises que consideram ou não a presença da heterogeneidade; quantificar o real efeito da heterogeneidade sobre a avaliação genética e seleção de touros, vacas e progênies, além de verificar a relação entre heterogeneidade e conexidade genética dos dados. Foram simulados vários conjuntos de dados formados por 75 touros, 3750 vacas e 7500 progênies, distribuídos em 15 rebanhos, por intermédio do programa Genesys (EUCLYDES, 1996). Quatro estruturas de heterogeneidade foram simuladas: rebanhos com heterogeneidade para todos os parâmetros tanto genéticos quanto fenotípicos - RHTP; rebanhos com médias genéticas similares e demais parâmetros heterogêneos - RMGS; rebanhos com heterogeneidade fenotípica - RHF e rebanhos sem heterogeneidade - RSH. Os rebanhos foram agrupados em três níveis: alta, média e baixa variabilidade. Foram simulados quatro graus de conexidade genética entre os níveis de variabilidade: 0%, 20%, 40% e 100% de conexidade genética (CG-0, CG-20, CG-40 e CG-100). Os arquivos de dados foram utilizados em análise de característica única que não considerava a heterogeneidade. Também, efetuou-se análise de características múltiplas, onde a produção em cada nível de variabilidade foi analisada como uma característica diferente, considerando- se, portanto, a heterogeneidade. As estimativas de variância genética e herdabilidades foram subestimadas para a estrutura de dados RHTP, mesmo nas análises de características múltiplas e para conjuntos de dados com alto grau de conexidade. Para as estruturas de dados que não apresentavam heterogeneidade para médias genéticas (RMGS, RHF e RSH), estas estimativas foram próximas dos valores simulados. Os valores genéticos preditos nas diferentes estruturas de dados foram comparados com os valores genéticos verdadeiros, através das correlações de ordem e de Pearson. Para RHTP, estas correlações foram inferiores a 50%, exceto para os valores genéticos de touros com 100% de conexidade entre os níveis de variabilidade. Para RMGS e RHF, as correlações foram altas e próximas às obtidas para dados sem heterogeneidade (RSH). Valores baixos para as correlações de Pearson indicam baixa acurácia na predição dos valores genéticos, enquanto baixas correlações de ordem indicam que a ordem de classificação dos animais com base nos valores genéticos preditos e verdadeiros é diferente. Conseqüentemente, classificados, animais com menor incorretamente, entre os valor animais genético poderão geneticamente ser superiores, prejudicando a eficiência da seleção. A heterogeneidade de média genética entre rebanhos prejudicou a acurácia da predição dos valores genéticos de touros e, principalmente de vacas e progênies, mas a heterogeneidade para outros parâmetros, não influenciou a avaliação genética dos animais. A análise de características múltiplas não foi eficiente para eliminar os problemas da heterogeneidade sobre a avaliação genética e o grau de conexidade dos dados influenciou os resultados das análises, apenas quando os rebanhos tinham médias genéticas heterogêneas. Assim, verificou-se que o problema da heterogeneidade sobre as avaliações genéticas é devido, basicamente à presença de médias genéticas diferentes entre rebanhos. / The objectives of this study were to simulate data structures similar to the real conditions observed in bovine herds according to parameters heterogeneous; to compare the results of the analysis that account or not for heterogeneity; to quantify the true effect of heterogeneity on the genetic evaluation and selection of bulls, cows and progenies, and to verify the relationship between parameters heterogeneous and genetic connectness of the data. It were simulated several groups of data formed by 75 bulls, 3750 cows and 7500 progenies, distributed in 15 herds, through the program Genesys (EUCLYDES, 1996). Four parameters heterogeneous structures were simulated: herds with heterogeneity for all the parameters, genetic and phenotypic - RHTP; herds with genetic means similar and the other parameters heterogeneous - RMGS; herds with heterogeneity phenotypic - RHF and herds without heterogeneity - RSH. Herds were grouped in three levels: high, mean and low variability. It were simulated four degrees of genetic connectness between the variability levels: 0%, 20%, 40% and 100% of genetic connectness (CG-0, CG-20, CG-40 and CG-100). Data files were used in single-trait analysis that didn't account for parameters heterogeneous. Also, it was carried out a multiple-trait analysis in which the production in each variability level was analyzed as a different trait. The estimates of genetic variance and heritability were underestimated for the data structure RHTP, even in the multiple-trait analysis and for groups of data with high connectness degree. For the structures of data that didn't present heterogeneity for genetic means (RMGS, RHF and RSH), these estimates were close to the simulate values. The estimated breeding values in the different structures of data were compared with the true breeding values, through rank correlations and Pearson correlations. For RHTP, these correlations were lower than 50%, except for the breeding values of bulls with 100% of connectness between the variability levels. For RMGS and RHF, correlations were high and close to values obtained for data without heterogeneity (RSH). Low values for Pearson correlations indicate low accuracy in the prediction of breeding values, while low rank correlations indicate that the ranking of animals based on estimated and true breeding values is different. Consequently, animals with smaller breeding value may be included, incorrectly, among the animals genetically superiors, harming the efficiency of selection. The heterogeneity of genetic mean between herds harmed the accuracy of breeding value predictions of bulls and, mainly of cows and progenies, but the heterogeneity for other parameters, didn't influence the genetic evaluation of the animals. The multiple- trait analysis was not efficient to eliminate the problems of parameters heterogeneous on genetic evaluation. The degree of connectness of the data influenced the results of the analysis, just when the herds had heterogeneous genetic means. Like this, it was verified that the problem of parameters heterogeneous about the genetic evaluations is due, basically to the presence of different genetic means between herds. / Tese importada do Alexandria
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Análise genômica da resistência às raças 3 e 9 do nematóide de cisto e avaliação da variabilidade genética de caracteres agronômicos em soja / Genomic analysis of resistance to races 3 and 9 of Heterodera glycines and assessment of genetic variavility for agronomic characters in soybean

Cervigni, Gerardo Domingo Lucio 03 April 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-12T17:44:22Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 249302 bytes, checksum: 7ab4a51ba30163ad7cbc59ba6ca054b6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-12T17:44:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 249302 bytes, checksum: 7ab4a51ba30163ad7cbc59ba6ca054b6 (MD5) Previous issue date: 2003-04-03 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Neste trabalho foram realizados os experimentos: (1) estimativa da herdabilidade da resistência às raças 3 e 9 do nematóide de cisto da soja (NCS), (2) mapeamento de locos de resistência ao NCS e (3) avaliação da variabilidade genética de caracteres agronômicos em soja. Nos três experimentos foi utilizada uma população de linhagens endogâmicas recombinantes derivada do cultivar norte- americano Hartwig (genitor resistente ao NCS) e a linhagens brasileira Y23 (genitor suscetível ao NCS). A herdabilidade no sentido amplo para raça 3 foi estimada em 80,97%, e para raça 9 em 80,39%. Com a finalidade de identificar e mapear QTLs associados à resistência para as raças 3 e 9, a genotipagem da população acima mencionada foi realizada com 40 marcadores microssatélites. A análise de regressão linear simples identificou 6 e 2 marcadores associados à resistência para as raças 3 e 9, respectivamente. Porém, na regressão linear múltipla, apenas o marcador Satt038 foi significativo para as duas raças, explicando 25,38% (P>F=0,0001) da variação fenotípica da raça 3 e 12,60% (P>F=0,0001) da raça 9 do NCS. O QTL ligado ao marcador Satt038 foi identificado como correspondendo ao gene rhg1, mapeado na extremidade do grupo de ligação G. Para o terceiro experimento foram avaliados treze caracteres agronômicos. A identificação de QTLs realizou-se através do contraste de médias e pela regressão linear simples. Foram identificados QTLs para doze dos treze caracteres considerados. Os QTLs identificados foram localizados nos grupos de ligação B2, O, G, E e H. A variabilidade genética detectada na população foi significativa para as treze características, sugerindo que a população é útil para realizar estudos genéticos e de mapeamento de QTLs. / In this works were accomplished the experiments: (1) estimating of resistance to race 3 and 9 of the sobean cyst nematode (SCN), (2) mapping loci for resistance to SCN and (3) assesment of genetic variability for agronomic characters in soybean. In the three experiments were carried out to using a population of recombianant inbred lines derived from Hartwig (resistant parent) and Y23 (susceptible parent). Broad sense heritability estimates for race 3 was 80,97% and 80,39% for race 9. To mapping quantitative tratis loci (QTLs) for resistance to SCN and each agronomic characters, forty SSRs markers were amplified in the population. Single linear regression identified 6 and 2 SSRs associates to resistance for races 3 and 9, respectively. However, evaluation through multiple regression, showed that only Satt038 was significant for both races. This marker explained 25.38% (P>F=00001) of the phenotypic variation of race 3, and 12.60% (P>F=0.0001) of race 9 of NCS. QTL linked to Satt038 was identified as rhg1 gene, and mapped at the extreme of the linkage group G. In the third experiment thirteen characters were mensured. QTLs identification were accomplished comparing the mean for each allelic form. The proportion of the phenotypic variance explained by markers linked to a QTL was investigated by simple linear regression analysis. QTLs for all characters were identified and positioned in the linkage groups B2, O, G, E and H. The genetic variability detected in the RIL population was significant for the thirteen traits. It is suggested that the population will be useful to accomplish further genetic studies and QTLs mapping. / Tese importada do Alexandria
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Seleção genômica não paramétrica via distância genética entre subpopulações / Non-parametric genomic selection via genetic distance between subpopulations

Lima, Leísa Pires 15 February 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-25T17:27:15Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 886003 bytes, checksum: c69002eae8113ea24d4bedd4735dda69 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-25T17:27:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 886003 bytes, checksum: c69002eae8113ea24d4bedd4735dda69 (MD5) Previous issue date: 2017-02-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A seleção genômica ampla (Genome Wide Selection – GWS) consiste na análise de um grande número de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) amplamente distribuídos no genoma. As principais metodologias propostas e utilizadas na GWS se dividem em metodologias paramétricas, semi-paramétricas ou metodologias de redução de dimensionalidade. Dessa forma, um dos objetivos desse trabalho foi avaliar metodologias não paramétricas, denominadas Delta-p e Regressão Categórica Tripla (TCR), além de compará-las com métodos tradicionalmente aplicados a GWS, tais como G-BLUP (Genomic Best Linear Unbiased Predictor) e BLASSO (Bayesian Least Absolute Shrinkage and Selection Operator). O primeiro capítulo deste trabalho consiste em uma revisão de literatura sobre a GWS apresentando sua definição e importância no melhoramento genético, abordando sobre o desenvolvimento dos métodos propostos e avaliados e também retratando sobre o processo de validação utilizado para a comparação das metodologias. No segundo capítulo, foi proposto e analisado o método Delta-p e um índice de seleção, denominado índice Delta-p/G-BLUP que combina os valores genômicos provenientes do método G-BLUP com os valores genômicos estimados via Delta-p. Sob o contexto Bayesiano, foi incorporado ao LASSO Bayesiano, por meio de uma distribuição a priori altamente informativa, os valores genômicos estimados via G-BLUP, essa abordagem foi denominada método Bayes Híbrido. Para avaliar a eficiência dos métodos estatísticos, no que se refere à estimação dos valores genômicos aditivos e devidos à dominância, foram utilizados dados simulados, sendo estabelecidos oito cenários (dois níveis de herdabilidade × duas arquiteturas genéticas × ausência de dominância e dominância completa) sendo cada cenário simulado dez vezes. Os resultados do segundo capítulo indicaram que o índice Delta-p/G-BLUP e o Bayes Híbrido se mostraram eficientes para predição dos valores genômicos podendo ser usados vantajosamente na GWS. Ademais, no terceiro capítulo, foi avaliada a eficiência do método TCR em comparação com os métodos G-BLUP e BLASSO utilizando quatro cenários (dois níveis de herdabilidade × modelo infinitesimal × ausência de dominância e dominância completa) sendo cada cenário simulado dez vezes. Os resultados indicaram que o método TCR mostrou-se adequado para a estimação dos componentes de variação genômica e da herdabilidade. Em vista disso, uma metodologia baseada em uma modificação do método G-BLUP, denominada TCR/G-BLUP, foi proposta e consiste em estimar a herdabilidade via TCR e fixá-la nas equações de modelos mistos do método G-BLUP. A eficiência dos métodos G- BLUP e TCR/G-BLUP foram comparadas utilizando dados reais, seis caracteristicas avaliadas em mandioca (Manihot esculenta). O experimento foi instalado segundo um delineamento em blocos casualizados com três repetições e 10 plantas por parcela. Os resultados indicaram que o método TCR/G-BLUP foi capaz de aumentar a acurácia e fornecer valores genômicos não viesados se comparados ao método G-BLUP, sendo, portanto recomendado para a aplicação na GWS. / The genomic wide selection (GWS) consists in analyzing of a large number of single nucleotide polymorphisms (SNPs) markers widely distributed in the genome. The main methodologies proposed and used in GWS are divided into parametric methodologies, semi-parametric methodologies or dimensionality reduction methodologies. Thus, one of the objectives of this work was to evaluate non- parametric methodologies, called Delta-p and Triple Categorical Regression (TCR), and to compare them with methods traditionally applied to GWS, such as G-BLUP (Genomic Best Linear Unbiased Predictor) and Bayesian LASSO (Bayesian Least Absolute Shrinkage and Selection Operator). The first chapter of this work consists of a literature review about GWS presenting its definition and importance in genetic improvement, discussing the development of the proposed and evaluated methods and also describing the validation process used to compare the methodologies. In the second chapter, were proposed and analyzed the Delta-p method and a selection index, called the Delta-p / G-BLUP index, combining the genomic values derived from the G-BLUP method with the estimated genomic values via Delta-p. Under the Bayesian context, it was incorporated into the Bayesian LASSO, by means of a highly informative a priori distribution, the genomic values estimated by G-BLUP, this approach was called the Hybrid Bayes method. In order to evaluate the efficiency of the statistical methods, in the estimation of the additive and dominance genomic values, simulated data were used, being established eight scenarios (two levels of heritability × two genetic architectures × absence of dominance and complete dominance) each scenario being simulated ten times. The results of the second chapter indicated that the Delta-p/G-BLUP index and the Hybrid Bayes proved to be efficient for predicting the genomic values and could be advantageously used in GWS. In addition, in the third chapter, the efficiency of the TCR method was evaluated in comparison to the G-BLUP and BLASSO methods using four scenarios (two levels of heritability × infinitesimal model × absence of dominance and complete dominance), each scenario being simulated ten times. The results indicated that the TCR method proved adequate for the estimation of the components of genotype variation and heritability. Therefore, a methodology based on a modification of the G-BLUP method, called TCR/G-BLUP, was proposed and consists of estimating the heritability by means of TCR and fixing it in the mixed model equations of the G-BLUP method. The efficiency of the G-BLUP and TCR/G-BLUP methods were compared using real data, six characteristics evaluated in cassava (Manihot esculenta). The experiment was installed according to a randomized block design with three replicates and 10 plants per plot. The results indicated that the TCR / G-BLUP method was able to increase accuracy and provide non-biased genomic values when compared to the G-BLUP method and is therefore recommended for GWS application.
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Sistema de automação do irrigâmetro utilizando-se instrumentos digitais / Automation system for the irrigâmetro by using digital instruments

Pinto, Paulo Raimundo 31 July 2008 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-05-30T16:42:03Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1837196 bytes, checksum: b72273e5cd391b064b6835902c4e9b88 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-30T16:42:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1837196 bytes, checksum: b72273e5cd391b064b6835902c4e9b88 (MD5) Previous issue date: 2008-07-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O manejo da irrigação consiste em determinar o momento de irrigar e o tempo de funcionamento de um equipamento de irrigação, ou a sua velocidade de deslocamento, com a finalidade de aplicar a quantidade de água necessária ao pleno desenvolvimento da cultura. O Irrigâmetro é um aparelho evapo- pluviométrico que aglutina a ciência relacionada ao manejo da irrigação no que se refere às características da cultura, do solo, do clima e do sistema de irrigação, visando otimizar o uso da água na agricultura irrigada. Nesse aparelho, o momento de irrigar e o tempo de irrigação são definidos pelo deslocamento de uma coluna de água dentro de um tubo denominado tubo de alimentação. O sistema de automação desenvolvido neste trabalho contempla: medição do nível de água no tubo de alimentação; medição da precipitação pluvial; programação das estratégias de controle em um microcontrolador; sinalização luminosa para instruir o operador sobre operações manuais necessárias; controle liga-desliga para o acionamento automático do equipamento de irrigação; controle automático para acionamento das válvulas de controle instaladas no Irrigâmetro. Para todo o controle do sistema automático foi utilizado um microcontrolador PIC ® (Periferal Interface Controler), 16F877, fabricado pela Microchip Technology Inc. O microcontrolador foi programado para converter o dado analógico vindo do sensor de nível do tubo de alimentação em digital, contar os pulsos provenientes do sensor de precipitação pluvial, comandar o equipamento de irrigação com o respectivo tempo de funcionamento, controlar os servomotores para o posicionamento dos atuadores das válvulas de controle do Irrigâmetro no momento de incluir no manejo a lâmina de água precipitada, gerenciar e armazenar dados, além de receber dados do operador como, por exemplo, qual equipamento de irrigação será comandado. / The operation of an irrigation system consists of determining the moment of irrigating and the duration time the irrigation equipment should operating, or its displacement speed, with the purpose of applying the necessary amount of water for the complete development of the crop. The Irrigâmetro is an apparatus based on the evapotranspiration and precipitation that agglutinates the science related to the management of the irrigation process related to the characteristics of the crop, the soil, the climate and irrigation system, seeking to optimize the use of the water in the irrigated agriculture. In that equipment, the moment of irrigating and the time of irrigation are defined by the displacement of a column of water inside of a tube installed on it, named as feeding tube. The automation system developed in the present work includes: measurement of the level of water in the feeding tube; measurement of the precipitation; programming of the control strategies in a microcontroller; luminous signaling to instruct the operator about necessary manual operations; on-off control for the automatic activation of the irrigation equipment; automatic control for activating of the control valves installed in the Irrigâmetro. For the complete control of the automatic system a PIC® 16F877 microcontroller, manufactured by the Microchip Technology Inc., was used. The microcontroller was programmed to convert the analog data coming from the level sensor of the feeding tube in digital, to count the coming pulses of the precipitation sensor, to command the irrigation equipment with the respective operating time, to control the servomotors for the positioning of the Irrigâmetro control valves actuators in the moment of including in the irrigation management the amount of water precipitated, to manage and store data, besides receiving data from the operator such as, for example, which irrigation equipment will be commanded. / Não foi localizado o cpf do autor. Tese resgatada via internet.
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Dinâmica de obstrução de gotejadores em sistema de fertirrigação operando com águas residuárias domésticas e a ação de bactérias na desobstrução / Dynamic obstruction of drip fertigation system on operating with domestic wastewater and bacterial action in clearing

Noronha, Cassio Roberto Silva 28 February 2013 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-05-31T15:56:09Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1710729 bytes, checksum: 05a783d681c93dbb627563736a6de8a8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-31T15:56:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1710729 bytes, checksum: 05a783d681c93dbb627563736a6de8a8 (MD5) Previous issue date: 2013-02-28 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar a viabilidade técnica da utilização de bactérias inibidoras de biofilme na desobstrução de gotejadores de sistemas de fertirrigação com esgoto doméstico, avaliando: a formação de biofilme no sistema de fertirrigação por gotejamento que usa água de esgoto doméstico bruto, esgoto doméstico tratado por rampa de escoamento superficial e esgoto doméstico tratado por lagoa facultativa; o desempenho hidráulico do sistema de irrigação por gotejamento durante o processo de formação de biofilme utilizando esgoto doméstico na fertirrigação; a eficiência de colônias de três tipos de bactérias na inibição de biofilme no sistema de irrigação por gotejamento com o uso de esgoto doméstico, na fertirrigação. Na 1° fase, as unidades de fertirrigação funcionaram diariamente por oito horas, com esgoto doméstico bruto, esgoto doméstico tratado por rampa de escoamento superficial e esgoto doméstico tratado por lagoa facultativa, até completar 300 horas de funcionamento. A cada 50 horas mediu-se a vazão de todos os gotejadores de cada linha lateral efluente determinou-se os coeficientes de uniformidade de Christianwen (CUC) e de distribuição (CUD). Na 2° fase do experimento o sistema funcionou diariamente por oito horas, aplicando-se o esgoto doméstico por 250 horas de funcionamento determinando os indicadores de uniformidade, identificando a obstrução dos gotejadores. Na 3° fase do experimento foram utilizadas três colônias de bactérias inibidoras de formação de biofilme, como agentes de desobstrução dos gotejadores, correspondentes a três cepas de Bacillus subtilis pertencentes à Coleção de Culturas do Laboratório de Biotecnologia e Biodiversidade/BIOAGRO/UFV, selecionadas a partir da identificação dos microrganismos presentes nos biofilmes. Utilizou-se colônias no nível populacional de 109 UFC mL-1 (unidades formadoras de colônias por mililitro). O esgoto doméstico bruto apresenta maior capacidade de formação de biofilme. O desempenho hidráulico do sistema de irrigação é afetado pelo uso do esgoto doméstico em fertirrigação reduzindo os valores de CUD e CUC; As colônias de bactérias utilizadas na desobstrução do sistema de fertirrigação localizada por gotejamento são eficientes quanto a seu desempenho na desobstrução dos gotejadores na fertirrigação, mas não o suficiente para tornar o sistema tecnicamente viável. / This aim of this research was to evaluate the technical feasibility of using bacteria-inhibiting biofilm in clearing a drip fertirrigation system with sewage, evaluating: the ability of biofilm formation in the system an drip fertirrigation using domestic raw sewage and treated sewage for ramprunoff and domestic sewage treated by facultative lagoon, the hydraulic performance of drip irrigation system during the process of biofilm formation using domestic sewage in fertirrigation; and the efficiency of colonies of three bacteria in the inhibition of biofilm in a drip irrigation system using domestic sewage, in fertirrigation. In the 1st phase, fertirrigation units functioned for eight hours daily, with raw sewage, treated sewage for ramp runoff and domestic sewage treated by facultative pond, to complete 300 hours of operation. Every 50 hours the discharge was measured in all emitters of each drip lateral line to determine the Christiansen uniformity coefficient (CUC) and distribution uniformity nd coefficient (CUD). In a 2 stage of the experiment the system operated daily for eight hours, applying the sewage identified in the first stage for 250 hours of operation. And then take, uniformity indicators were determined identify the drippers obstruction. In the 3rd phase of the experiment three colonies of biofilm inhibiting bacteria were used, as agents of clearing the emitters, correspondenting of three strains of Bacillus subtilis belonging to the Culture Collection of the Laboratory of Biotechnology and Biodiversity / BIOAGRO / UFV, selected using microorganism’s presents in biofilms. We used colonies in the population level of 109 CFU ml-1 (colony-forming units per milliliter). The gross domestic wastewater has higher ability of biofilm formation; Performance Hydraulic irrigation system is affected by the use of domestic sewage in fertirrigation reducing the values of CUD and CUC at levels considered bad or unacceptable from the point of view of irrigation uniformity clearing system of drip irrigation are efficient as his performance in clearing the drippers in drip irrigation, but not enough to make the system technically feasible, the bacteria colony "155" is the most efficient in clearing the drip fertirrigation system in the colony then "111" and "RI 4914 ".
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Desenvolvimento de metodologia para o dimensionamento de câmaras de combustão para gases oriundos do processo de carbonização de madeira / Methodology development to design combustion chambers for gases from wood carbonization process

Coelho, Marcelo Pereira 19 March 2013 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-05-31T16:28:53Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1887138 bytes, checksum: b259883126417dab59f8a394dc375d7c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-31T16:28:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1887138 bytes, checksum: b259883126417dab59f8a394dc375d7c (MD5) Previous issue date: 2013-03-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O carvão vegetal é um importante insumo na cadeia produtiva do ferro gusa no estado de minas gerais. Entretanto, sua produção recebe muitas críticas devido às elevadas emissões de poluentes e gases causadores de efeito estufa. Essas críticas podem, por outro lado, serem mitigadas com a incineração dos gases gerados, reduzindo as emissões a dióxido de carbono e água. A incineração dos gases abre novas oportunidades de negócios, pois a energia gerada durante o processo de incineração tem potencial para ser transformada em energia elétrica, gerando mais receita aos produtores, e ainda usada na secagem da madeira a ser carbonizada, diminuindo o tempo de ciclo de produção, aumentando a capacidade produtiva e, consequentemente, a renda dos produtores. O aproveitamento dos subprodutos da carbonização da madeira para a produção de carvão vegetal não é muito explorado na literatura. Alguns trabalhos experimentais objetivando incinerar os gases gerados foram conduzidos em empresas e na academia, porém não existe um método formal para dimensionamento desses sistemas. Desse modo, esse trabalho foi desenvolvido para criar uma metodologia coerente para dimensionamento de câmaras de combustão cilíndricas, sem uso de energia elétrica em sopradores ou geradores de centelha, obtendo-seequações para o projeto de câmaras de queima cilíndricas para gases de combustão provenientes do processo de carbonização. A produção rudimentar em fornos de alvenaria gera passivos sociais econômicos e ambientais devido à emissão de gases poluentes e de efeito estufa. Uma solução para esse problema é a incineração dos gases gerados durante o processo de carbonização. Entretanto, é importante que o processo de incineração de gases não influencie negativamente os padrões de qualidade do carvão produzido. Por esse motivo este trabalho foi feito, objetivando a construção e avaliação de um protótipo de um incinerador de gases provenientes da carbonização de baixo custo e fácil construção, além de avaliar se a incineração dos gases gera impactos negativos na qualidade do carvão. Os resultados indicam que o protótipo funcionou satisfatoriamente, reduzindo a emissão de metano em 99,8 % e 74,14 % da emissão de monóxido de carbono e não houve indícios de que a incineração dos gases piorou a qualidade do carvão produzido. Entretanto, modificações para a melhoria do incinerator devem ser feitas para, reduzir as emissões de monóxido de carbono ao máximo. Um modelo em CFD foi testado, usando os dados do protótipo construído. Considerando a alta variabilidade do processo de carbonização, bem como variáveis difíceis de prever, como intempéries, pode-se afirmar que os resultados mostram boa concordância entre as simulações e os resultados experimentais. Após a validação do modelo, foi possível propor um metamodelo, baseado em CFD, que foi utilizado para propor melhoriasno projeto da câmara de combustão, visto que não é reportado na literatura uma metodologia adequada para projetos dessa natureza. Foi utilizado um metamodelo, construindo uma superfície de resposta usando o método de Kriging. O bom ajustamento do metamodelo tornou possível a aplicação da otimização multi-objetivo, por meio do uso de um algoritmo genético. A solução ótima escolhida deu subsídios para o levantamento de parâmetros de projeto e uma metodologia para o dimensionamento de câmaras de combustão cilíndricas para gases advindos do processo de carbonização foi desenvolvida. / Charcoal is an important input in the pig iron productive chain in Minas Gerais State, Brazil. However, its production is highly criticized because of the elevated emissions of pollutants and gases that cause the greenhouse effect. Thiscriticism can, however, be mitigated through incineration of the gases generated, thereby reducing emissions of carbon dioxide and water. Incineration of gases opens up new business opportunities, since the energy generated during the incineration process can be transformed into electric energy, generating more income to the producers, and it can also be used in the drying of the wood to be burnt, reducing the production time cycle and increasing productive capacity and consequently the income of producers. The use of by-products of wood carbonization to produce charcoal is not very exploited in literature. Some experimental research aimed at incinerating the generated gases has been conducted by companies and in the academic circle; however, there is no formal method to design these systems. Thus, this study was carried out to create a coherent methodology todesign cylindrical combustion chambers without the use of electric energy in blowers or sparkers, developing equations to project cylindrical combustion chambers for gases originated from the carbonization process. The rough production in masonry ovens generates social, economic and environmental liabilities due to the emission of pollutant and greenhouse gases. A solution to this problem is the incineration of the gases generated during the carbonization process.However, it is important that the gas incineration process not influence the quality standards of the charcoal producednegatively. For this reason, we conducted this study in order tobuild and evaluate a low cost and easily constructible prototype of an incinerator of gases originated from carbonization, in addition to verifying if gas incineration has negative impacts on charcoal quality. Results indicated that the prototype worked satisfactorily, reducing emission of methane by 99.8, and carbon monoxide by 74.14%, and there were no signs that incineration of gases worsened the quality of charcoal produced. However, modifications for the improvement of the incinerator should be done so as to reduce carbon emissions as much as possible. A CFD model was tested using the data from the prototype built.Given the high variability of the carbonization process, as well as the variables difficult to predict such as bad weather, we can affirm that the results show a good agreement between simulations and experimental results. After validating the model, it was possible to propose a CFD-based meta-model, which was utilized to propose improvements in the combustion chamber project, given that the literature does not report any appropriate methodology for projects of this nature. We used a meta- model, creating a response surface using the Kriging method. The good fit of the meta- model made it possible to apply the multi-objective optimization through a genetic algorithm. The optimal solution chosen allowed for the creation of project parameters, and a methodology to design cylindrical combustion chambers for gases generated by the carbonization process was developed.
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Qualidade de frutos de goiabeiras sob manejo orgânico, ensacados com diferentes diâmetros / Quality of guava fruits in organic management, bagged with different diameters

Moreira, Raquel Noleto Ayres Guimarães 08 June 2004 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-06-01T16:23:35Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 379242 bytes, checksum: ed43a70116fb084c4a325910d0d90d08 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T16:23:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 379242 bytes, checksum: ed43a70116fb084c4a325910d0d90d08 (MD5) Previous issue date: 2004-06-08 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Dentre as principais fruteiras cultivadas no Brasil, a goiabeira se reveste de especial importância, uma vez que a goiaba pode ser consumida ao natural ou processada por diversas empresas do setor alimentício. A goiabeira apresenta sérios problemas fitossanitários, sendo utilizada uma enorme quantidade de agrotóxicos nas diversas fases da cultura. Preocupados com a contaminação dos frutos por produtos tóxicos, muitos consumidores têm procurado adquirir frutas provenientes de sistemas orgânicos de produção, onde o uso de agrotóxicos é proibido. No cultivo orgânico, o ensacamento de frutos constitui uma das principais medidas de controle de insetos-praga e doenças. Apesar da eficiência desta prática no controle de pragas, principalmente moscas-das-frutas, o ensacamento ainda é realizado de forma bastante empírica, uma vez que os frutos são ensacados com diversos tipos de embalagens e em diferentes estágios de desenvolvimento, sem haver uma avaliação adequada da qualidade final dos frutos colhidos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade física e química de goiabas, provenientes de um pomar sob manejo orgânico, ensacadas em diferentes estágios de desenvolvimento, visando o controle de moscas-das-frutas e outros insetos- praga. O experimento foi conduzido no pomar orgânico de goiabeiras da Universidade Federal de Viçosa, em Viçosa-MG, no período de abril de 2003 a janeiro de 2004. As plantas foram podadas em abril e os frutos com diâmetro entre 1 e 5 cm começaram a ser protegidos, com sacos de polipropileno transparente microperfurado, em agosto. A ocorrência de moscas-das-frutas no pomar foi monitorada com armadilhas do tipo "frasco caça-mosca", confeccionadas com garrafas plásticas tipo pet de 2 litros, contendo suco de maracujá a 25% (v/v) e açúcar cristal a 10% (p/v). A partir de 19 de setembro, os frutos começaram a ser colhidos, o tempo de ensacamento determinado e avaliadas as seguintes características: infestação por moscas-das-frutas, peso, comprimento, diâmetro, pH, Sólidos Solúveis Totais (SST), Acidez Total Titulável (ATT), relação SST/ATT, vitamina C, clorofilas a e b e carotenóides. Para análise dos dados da característica lesão do fruto por moscas-das-frutas foi adotado o modelo Próbit. Para o estudo do comprimento do fruto, do diâmetro final do fruto e do teor de vitamina C, foram utilizadas análises de regressão em função do diâmetro de ensacamento, a 5% de probabilidade. Para as características pH, SST, ATT e SST/ATT foram realizadas análises de variância segundo o delineamento inteiramente casualizado com números diferentes de repetições por tratamento (faixas de diâmetro) e gráficos de colunas, com a apresentação do resultado da aplicação do teste de Duncan em função das diferentes faixas de diâmetro, a 5% de probabilidade. O pomar orgânico apresentou elevada infestação por moscas-das-frutas. A porcentagem de frutos danificados por larvas de moscas-das-frutas mostrou-se dependente do diâmetro do fruto por ocasião do ensacamento. Frutos ensacados com diâmetro entre 1,0 e 2,0 cm apresentaram infestação inferior a 1%. Não se observou variação nas características químicas dos frutos ensacados em diferentes estágios de desenvolvimento, com exceção dos teores de vitamina C, que foram mais elevados nos frutos ensacados com diâmetro entre 1,0 e 2,0 cm. / Among the main commercial fruits produced in Brazil, guava has special importance, because it can be consumed as in natural form as used in many kind of food industry. The guava tree has serious phytossanitary problems, because it has been used high quantity of pesticides in many stages of the crop development. Worried with contamination of fruits by pesticides, many consumers have looked for fruits produced in organic systems, where the pesticides are forbidden. In organic management, the technique of put the fruits into the bags is one the most important practice to control of pest agents and diseases in guava crop. Although this technique has just been proven to control of pest agents, mainly fly fruits (Anastrepha spp. or Ceratitis capitata), the bagging is still realized without previous scientific researches, in empiric conception. The fruits are bagged in many sort of packing and in different stages of development, however there’s no enough scientific evaluation about the final quality of bagged fruits. The objective of this work was to evaluate the physical and chemical quality of guavas. The guavas were produced in organic management, bagged in different stages of fruit development to protect of fly fruits and others insects that could harm guava fruits viability. The experiment was carried out in the guava organic orchard of the Federal University of Viçosa, from April 2003 until January 2004. The guava trees were pruned in April and the fruits with diameter within 1 till 5 cm started to be protected with polypropylene micro perforated bags in august. The occurrence of fly fruits in the orchard was monitored with traps to capture made of plastic bottle of two liters containing passion fruit juice at 25% (v/v) and crystal sugar at 10%. The harvest started in September 19. The time of bagging was determined and were evaluated the follow characteristics: infestation by fly fruits, weight of fruits, length, diameter, pH, total soluble solids (TSS), total titrable acidity (TTA), TSS/TTA rate, ascorbic acid content, a and b chlorophyll and carotenoid content. To evaluation of dates of lesions provoked by fly fruits was adopted the PROBIT model. To study of fruit’s length, final diameter, and ascorbic acid content were used regression analysis in function of bagging diameter at 5% of probability. To study of pH, TSS, TTA, and TSS/TTA were realized variance analyses using entirely casually experimental delineation with different numbers of repetitions for each treatment (band of diameter) and graphic of columns, with presentation of Duncan text results in function of different bands of diameters, at 5% of probability . The organic orchard presented high level of infestation by fly fruits. The percentage of damaged fruits by fly fruit’s larva showed dependent of fruit diameter in the time of bagging. Bagged fruits from 1,0 until 2,0 cm presented infestation smaller than 1%. It wasn’t noticed variation in fruits bagged’s chemical characteristics in different stages of bagging, excepting the 5 ascorbic acid content that was higher in bagged fruits from 1,0 until 2,0 cm of diameter.
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Modificações fisiológicas e genéticas em ciclos de seleção no cultivar BRS 4154 tolerante ao encharcamento / Physiological and genetic changes in recurrent selection of cultivar BRS 4154 tolerant to flooding

Coelho, Celso Henrique Moreira 06 December 2004 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-06-01T17:41:58Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 132780 bytes, checksum: aa2fa3f63a6e1b87bc5ed6a8d7b379d1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T17:41:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 132780 bytes, checksum: aa2fa3f63a6e1b87bc5ed6a8d7b379d1 (MD5) Previous issue date: 2004-12-06 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / As espécies vegetais cultivadas apresentam ampla variação de comportamento, quando submetidas a condições extremas de ambiente (estresses). O melhoramento genético pode manipular essa variabilidade, visando ao desenvolvimento de variedades tolerantes a condições específicas de estresse. Para isso, é necessária a utilização de metodologia que permita uma avaliação clara dos fatores limitantes e das reações das plantas de milho a elas submetidas. Neste sentido, a Embrapa milho e sorgo (CNPMS), iniciou em 1986, um trabalho de seleção massal em um composto de milho, onde, após 15 ciclos de seleção recorrente foi realizado um experimento com objetivo de avaliar alguns desses ciclos quanto às alterações fisiológicas e os ganhos de seleção obtidos ao longo da seleção. Os materiais utilizados foram: os ciclos 1, 5, 9 e 15 da variedade de milho BRS 4154-Saracura, selecionada para condição de encharcamento intermitente do solo, BR 107 sensível ao encharcamento e o híbrido simples BRS 1010, escolhido por ser bastante cultivado no Brasil. As características fisiológicas avaliadas foram: fluorescência da clorofila, teor de clorofila, área foliar, porosidade de raiz e o teor de macro e micronutrientes. Avaliaram-se também, as características genéticas de produção: altura de planta e da inserção da espiga, número de fileiras de grãos, comprimento da espiga, índice da espiga, peso de 100 sementes, número de grãos por planta e peso de grãos. O delineamento experimental utilizado foi de blocos ao acaso com 4 repetições em esquema fatorial. Os resultados permitiram concluir que a porosidade de raiz foi o principal mecanismo de tolerância utilizado pelas plantas de milho em condições de encharcamento. A característica número de grãos por planta foi o componente de produção, no ambiente encharcado, de maior efeito isolado no peso de grãos. Desta forma, a seleção para número de grãos por planta resulta em aumento da produtividade. A seleção no ambiente encharcado proporcionou um ganho no peso de grãos do ciclo 1 para o ciclo 15. / The crop species present a wide variation of performance when cultivated under extreme conditions (stresses). Plant breeding can manipulate that variability, seeking to the development of tolerant varieties to specific conditions of stress. To accomplish that, it is necessary to use a methodology that allows a clear evaluation of the factors limiting plant development. In this regard, the Embrapa CNPMS, began in 1986, a work of mass selection in a composite variety of corn, where, after 15 cycles of selection an experiment was carried out with objective of evaluating some of those cycles with relationship to the physiological alterations and genetic progress obtained along the cycles. The used materials were: the cycles 1, 5, 9 and 15 of the corn variety BRS 4154- Saracura, selected for condition of intermittent flood of the soil, BR 107 sensitive to flooding and the single hybrid BRS 1010, chosen for being widely cultivated in Brazil. The appraised physiologic characteristics were: fluorescence of chlorophyll, chlorophyll level, leaf area, root porosity and the level of macro and micronutrients. They were also evaluated the traits associated with yield: plant height and of height of the ear of corn, number of rows in the cob, number of grains, length of the ear of corn, ear index, weight of 100 seeds, number of grains per plant and weight of grains. The used experimental design was random blocks with 4 repetitions in factorial outline. The results allowed to conclude that the root porosity was the main mechanism of tolerance to flood present in corn. The trait number of grains per plant was the yield component, in flooded environment, of larger isolated effect in the weight of grains. Therefore, the selection for number of grains per plant results in increase in yield. The selection under flooding provided gain for weight of grains from cycle 1 to cycle 15.
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Viés nos ganhos genéticos preditos com seleção massal e de famílias de meios-irmãos / Obliquity in predicted genetic gains with mass and half-sib families selection

Aloisio, Alcantara Vilarinho 01 April 2004 (has links)
Submitted by Cleber Casali (clebercasali@ufv.br) on 2017-06-01T18:02:06Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 453678 bytes, checksum: 7001f1d3e25059ffa579718f498bf4f1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T18:02:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 453678 bytes, checksum: 7001f1d3e25059ffa579718f498bf4f1 (MD5) Previous issue date: 2004-04-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo deste trabalho foi avaliar o viés nas expressões de predição de ganho genético com seleção de plantas (capítulo 1) e de famílias de meios- irmãos (capítulo 2) em programas de melhoramento intrapopulacional. O estudo foi feito por meio de simulação, no qual, para seleção massal, foram considerados sistemas gênicos com um e 10 genes com distribuição independente. Para seleção de famílias foi considerado apenas sistema gênico de 10 genes. Foram consideradas três classes de população (muito melhorada, pouco melhorada e com freqüências intermediárias dos genes favoráveis), três valores de herdabilidade (10, 50 e 90%) e sete graus de dominância (2 e -2, 1 e -1, 0,5 e -0,5 e 0), sendo que com grau de dominância positivo o gene favorável é dominante e com grau de dominância negativo é recessivo. Foram considerados os 10 genes com as mesmas freqüências gênicas e com freqüências diferentes. Foram avaliados o viés percentual entre ganhos teórico e predito no primeiro ciclo de seleção massal e a correlação entre os mesmos ao longo de 10 ciclos de seleção, considerando as diferentes situações. Com seleção entre as famílias de meios-irmãos a pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada foi a principal causa do viés, enquanto que com seleção massal o foi apenas nos casos de viés percentual baixo (inferior a 100%). Nas situações de elevado viés percentual (acima de 100%) a principal fonte de viés foi o uso de variância genotípica ou herdabilidade em sentido amplo no lugar de variância aditiva ou herdabilidade em sentido restrito, respectivamente. Com sistema gênico de 10 genes as expressões foram mais precisas que com sistema gênico de apenas um gene. Verificou-se que assumir ganho predito com seleção em ambos os sexos o dobro do ganho predito com seleção em apenas um sexo é apenas uma aproximação. Comparativamente à seleção após o florescimento, a seleção antes do florescimento aumentou o viés devido à pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada e diminuiu o viés devido ao uso de variância genotípica ou herdabilidade em sentido amplo no lugar de variância aditiva ou herdabilidade em sentido restrito, respectivamente, e aumentou a média das correlações entre os dois ganhos. O aumento na proporção de selecionados aumentou consideravelmente a média do viés percentual e diminuiu a média da correlação entre os ganhos teórico e predito ao longo de 10 ciclos de seleção, mas apenas com o uso de variância genotípica ou de herdabilidade em sentido amplo (estimadas ou paramétricas). Com o uso de variância genotípica ou de herdabilidade em sentido amplo estimadas, comportamento semelhante foi observado com a redução no tamanho amostral. Viés de 30% na estimativa de variância ambiental aumentou o viés percentual entre ganhos teórico e predito apenas quando utilizados valores estimados de variância genotípica ou de herdabilidade em sentido amplo. Com seleção dentro de famílias e mesmas freqüências gênicas, o uso de variância genotípica ou herdabilidade em sentido amplo foi a principal fonte de viés, quando utilizados para predição do ganho genético valores paramétricos de variância ou de herdabilidade. Com freqüências diferentes, a pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada é que foi a principal fonte de viés. Quando avaliadas as três fontes de viés juntas, tanto considerando mesmas freqüências gênicas como freqüências diferentes, a principal fonte de viés foi a pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada. Com seleção dentro a magnitude do viés foi mais elevada que com seleção entre. / Aim of this study was to evaluate obliquity in expressions for the prediction of genetic gains due mass (chapter 1) and half-sib families selection (chapter 2) through intrapopulational improvement programs. Genetic systems with one and 10 genes of independent distribution for mass selection were simulated. Only the 10 gene system was admitted for family selection. Three population classes (strongly improved, slightly improved, and with intermediate frequencies of favorable genes), three heritability values (10, 50, and 90%) and seven dominance degrees (2 and -2, 1 and -1, 0.5 and -0.5, and 0) were taken into consideration. With a positive dominance degree, the favorable gene is dominant, and with a negative dominance degree it is recessive. 10 genes with equal and different genetic frequencies were focused on. The percentile obliquity between theoretical and predicted genetic gains in the first cycle of mass selection and the correlation between them along the 10 selection cycles were evaluated for the different situations. In the case of selection between half- sib families, the assumption in relation to additive covariance between an individual in the selection unit and its relative in the improved population was the main cause of obliquity, while in the case of mass selection this was only true when the obliquity percentage was low (below 100%). When it was high (above 100%), the main cause of obliquity was the use of genotypic variance or broad-sense heritability instead of additive variance or heritability in the restricted sense, respectively. Expressions were more precise in the genetic system of 10 genes than the one with only one gene. Assuming a predicted gain due selection in both sexes as twice the predicted gain with selection in only one sex is merely an approximation. Selection before compared to selection after flowering increased obliquity, owing to the supposition in relation to additive covariance between the individual in the selection unit and its relative in the improved population, and decreased obliquity because of the use of genotypic variance or broad-sense heritability instead of additive variance or restricted sense heritability, respectively, and increased the correlation means between both gains. An increased percentage of the selected plants increased the mean obliquity percentage considerably and diminished the correlation mean between the theoretical and predicted along 10 selection cycles though with the use of genotypic variance or broad-sense heritability (estimative or parametric) only. When genotypic variance or broad-sense heritability were used for estimates, a similar behavior was observed for a smaller sample size. A 30% obliquity in the environmental variance estimate increased the obliquity proportion between theoretical and predicted gains only when estimated values of genotypic variance or broad-sense heritability were used. In selection within families and with equal genetic frequencies, the use of the genotypic variance or broad-sense heritability was the main source of obliquity, when parametric values in variance or heritability was used for the prediction of the genetic gain. With different frequencies, the supposition expressing additive covariance between the plant in the selection unit and its relative in the improved population was main source of obliquity. Of the three obliquity sources evaluated together, both for equal and different genetic frequencies, main obliquity source was the assumption describing additive covariance between the plant in the selection unit and its relative in the improved population. Selection within increased the magnitude of obliquity in comparison to selection between.
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Diversidade e estrutura genética em populações de Melipona rufiventris e Melipona mondury (Hymenoptera: Apidae) por análise de microssatélites / Genetic diversity and structure in Melipona rufiventris and Melipona mondury populations (Hymenoptera: Apidae) by analysis of microsatellites

Lopes, Denilce Meneses 28 July 2004 (has links)
Submitted by Cleber Casali (clebercasali@ufv.br) on 2017-06-01T19:10:55Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 641690 bytes, checksum: 192a865a962268cc1e6e97448d12fefd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T19:10:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 641690 bytes, checksum: 192a865a962268cc1e6e97448d12fefd (MD5) Previous issue date: 2004-07-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Melipona rufiventris é uma espécie de meliponíneo que encontra-se ameaçada de extinção no estado de Minas Gerais. Até recentemente, as “formas” encontradas tanto em regiões de mata Atlântica quanto em regiões de cerrado dentro deste estado eram, consideradas uma única espécie. No entanto, devido ao grande número de diferenças morfológicas encontradas entre espécimens provenientes de diferentes regiões, a “forma” encontrada em regiões de mata passou a ser considerada como Melipona mondury e a “forma” presente no cerrado como M. rufiventris. Com o objetivo de estimar a variabilidade genética em populações dessas duas espécies, foram feitas análises com nove “primers” microssatélites em 45 colônias coletadas em diferentes localidades do estado de Minas Gerais. O seqüenciamento de alguns dos locos demonstrou que os fragmentos amplificados realmente continham regiões microssatélites. Considerando todas as amostras analisadas, 7 locos foram polimórficos, sendo que alguns alelos estavam presentes somente em M. rufiventris e outros eram exclusivos de M. mondury. A análise de agrupamento permitiu a formação de dois grupos distintos: o primeiro constituído pelas colônias de M. mondury e o segundo pelas de M. rufiventris. Nesse último observou-se a formação de dois subgrupos, sendo que as colônias de Brasilandia de Minas e Dom Bosco encontraram-se separadas das demais colônias de cerrado. A porcentagem de locos polimórficos foi de 33,3% para as espécies M. mondury e M. rufiventris e 22,2% para as colônias de Brasilandia de Minas/Dom Bosco. A heterozigosidade observada nessas populações foi de 0,1159 para M. mondury, 0,0684 para M. rufiventris e 0,0222 para as colônias de Brasilandia de Minas/ Dom Bosco. M. mondury e M. rufiventris apresentaram valores de F ST próximo de 0,25, mostrando que essas espécies possuem uma elevada estruturação populacional, com grande diferenciação genética entre as subpopulações. / Melipona rufiventris is one species of the stingless bee that is becoming very rare in Minas Gerais state. Therefore it was included on the endangered species’ list of Minas Gerais. Until recently, the different "forms" of M. rufiventris founded in the Atlantic forest areas or in the cerrado areas of this state, were considered as a unique species. However, due to the high number of morphological differences founded among specimens from different geographic regions, the "form" found in forest areas passed to be called Melipona mondury while the "form " found in the cerrado was assumed to be M. rufiventris. Aiming to estimate the genetic variability in populations of these two species, we analysed samples from 45 colonies collected at different places of the Minas Gerais state with nine microsatellites primers. The sequencing of some of these loci revealed that the amplified fragments really corresponded to microsatellite areas. Considering all the samples, 7 loci were polymorphic, with some alleles presented only in M. rufiventris while others were exclusive to M. mondury. The Grouping Analysis allowed the establishment of two different groups: the first constituted by the M. mondury’s colonies and the second by the M. rufiventris’ colonies. In the last one, the establishment of two subgroups was observed, being the colonies from Brasilândia de Minas/Dom Bosco separated from the others colonies from the cerrado. The percentage of polymorphic loci was 33.3% to the species M. mondury and M. rufiventris and 22.2% to the colonies from Brasilândia de Minas/Dom Bosco. The observed heterozygosity in these populations was of 0.1159 for M. mondury, 0.0684 for M. rufiventris and 0.0222 for the colonies from Brasilândia de Minas/ Dom Bosco. M. mondury and M. rufiventris presented F ST close to 0.25, indicating that their subpopulations are well structured, with a great genetic differentiation among them.

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