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Antixenose em acessos de tomateiro do Banco de Germoplasma de Hortaliças da UFV a Tuta absoluta e suas possíveis causas químicas / Antixenosis to Tuta absoluta in tomatoes accesses of UFV Vegetable Germoplasma Bank and possible chemical causes

Oliveira, Fabrício Alves de 10 February 2004 (has links)
Submitted by Cleber Casali (clebercasali@ufv.br) on 2017-06-01T19:44:54Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 168895 bytes, checksum: 7efade196ad93aa8f018ae8b2395472a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T19:44:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 168895 bytes, checksum: 7efade196ad93aa8f018ae8b2395472a (MD5) Previous issue date: 2004-02-10 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O objetivo deste trabalho foi avaliar cinqüenta e sete acessos de tomateiro do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade federal de Viçosa e os cultivares ‘Moneymaker’ e ‘TOM-601’ e ‘Santa Clara’ quanto a resistência por antixenose a traça do tomateiro Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera:Gelechiidae) e identificar suas possíveis causas químicas. A primeira parte do experimento foi conduzida em casa de vegetação no período de abril a julho de 2003 na Horta de Pesquisa do departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa. O delineamento utilizado foi o de blocos ao acaso com 3 repetições. Foram realizadas infestações semanais com adultos de T. absoluta. As avaliações foram realizadas 30, 45 e 60 dias após transplantio. As características avaliadas foram número de minas grandes (diâmetro ≥ 0,5 cm), pequenas e totais/folha e porcentagem de folhas minadas. Folíolos de tomateiro com 90 dias de idade foram coletados e levados ao laboratório onde realizou-se extração hexânica e análise cromatográfica dos extratos obtidos. Foi observada baixa infestação por T. absoluta nos primeiros 45 dias de experimento. Já aos 60 dias após transplantio verificou-se alta infestação possibilitando a discriminação dos acessos avaliados para todas as características. Nos acessos BGH-55, BGH-83, BGH-225, BGH-227, BGH-320, BGH-406, BGH- 603, BGH-674, BGH-1282, BGH-1497, BGH-1708, BGH-1532, BGH-1989, BGH- 1990, BGH-7235, BGH-7238 ocorreram os menores números de minas grandes/folha e menores porcentagens de folhas minadas, indicando que estes podem ser os acessos candidatos a resistência por antixenose a T. absoluta . Nos acessos BGH-674 e BGH-1497, não foram observados qualquer dano causado pela traça do tomateiro em nenhuma das avaliações. Foram encontrados oito picos nos extratos hexânicos dos folíolos de tomateiro, os quais foram identificados como hexadecano, heptadecano, eicosano, 2-metil-tricosano, tetracosano, hexacosano, octacosano e dotriacontano. Em dois destes identificados com índice de viisimilaridade de 94% como tetracosano e hexacosano foram observadas correlações significativas com características de suscetibilidade a T. absoluta. Em nenhum dos picos identificados foram observadas correlações significativas com resistência do tomateiro à T.absoluta. / The aims of this study were to evaluate fifty-seven tomato accesses UFV Vegetable Germoplasma Bank (BGH-UFV), and the cultivars ‘Moneymaker’ and ‘TOM-601’ and ‘Santa Clara’ to resistance to Tuta absoluta by antixenosis mechanism besides identifying possible chemical causes. The first part of this experiment was carried out in a greenhouse between April and July 2003 at Horta de Pesquisa of UFV. A completely randomized block design with three replications was used. Infestations with T. absoluta adults were made weekly and evaluations were conducted thirty, forty-five and sixty days after transplanting. The characteristics evaluated were: number of mines (large mines with diameter ≥ 0.5 cm and small mines) and total mines per leaf and percentage of mined leaves. At ninety days, tomato leaflets were collected, transported to the laboratory, extracted with hexane and analyzed by gas chromatography/mass spectrometry (GC/MS.) A lower infestation was observed in the first forty-five days after transplanting. Sixty days after transplanting, a higher infestation was observed allowing the discrimination of the accesses evaluated. Accesses, BGH-55, BGH-83, BGH-225, BGH-227, BGH-320, BGH-406, BGH-603, BGH-674, BGH-1282, BGH-1497, BGH- 1708, BGH-1532, BGH-1989, BGH-1990, BGH-7235, BGH-7238 showed a lower number of large mines and lower percentage of mined leaves, indicating possible existence of antixenosis mechanism to T. absoluta. In BGH-674 and BGH-1497 accesses, no damage was by tomato pinworm. Eight peaks were observed in all the hexane extracts of tomatoes leaflets on GC/MS analysis, which were identified by the database as hexadecane, heptadecane, eicosane, tetracosane, hexacosane, octacosane and dotriacontane. 2-methyl-tricosane, Two of the peaks, identified with a similarity index of 94%, as tetracosane and hexacosane showed ixsignificant correlations with susceptibility characteristics of T. absoluta. None of peaks showed significant correlation with resistance characteristics.
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Citotaxonomia de populações do gênero Astyanax (Characiformes, Characidae) da bacia do rio Doce / Cytotaxonomy of populations of genus Astyanax (Characiformes, Characidae) of the Doce Basin

Ramos, Fabrício Oliveira 17 June 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T11:03:57Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 703389 bytes, checksum: 1197f7672503105fdcb75cdd0aca1d60 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T11:03:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 703389 bytes, checksum: 1197f7672503105fdcb75cdd0aca1d60 (MD5) Previous issue date: 2004-06-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Foram realizados estudos citogenéticos em três espécies pertencentes à subfamília Tetragonopterinae, provenientes de seis localidades na bacia do rio Doce. Astyanax fasciatus apresentou 2n=50 (4m+14sm+34a) e um par de cromossomos com regiões organizadoras do nucléolo, sugerindo se tratar de uma nova espécie, por apresentar um cariótipo diferente aos indicados para a espécie até o momento. As populações de Astyanax scabripinnis apresentaram 2n=50 (4m+10sm+20st+16a) no rio Casca, 2n=50 (4m+12sm+18st+16a) no rio Das Pacas e 2n=48 (8m+20sm+14st+6a) no rio Turvo e respectivamente um, três e dois pares cromossômicos portadores de regiões organizadoras do nucléolo, confirmando a extensa variabilidade cariotípica existente nesse complexo de espécies na região neotropical. Os resultados de Astyanax bimaculatus confirmam a estabilidade cariotípica característica da espécie, apresentando 2n=50 (14m+22sm+6st+8a) no rio Turvo e rio Piranga e 2n=50 (14m+24sm+4st+8a) no rio Santo Antônio. Os resultados sugerem que a bacia do rio Doce tem sido um cenário de evolução cariotípica independente para as espécies do gênero Astyanax. / Three species of Tetragonopterinae from six locales in the rio Doce basin were subject to cytogenetic analyses. Astyanax fasciatus showed a diploid number of 2n=50 (4m+14sm+18st+14a) and one pair of NOR-bearing chromosomes, this unique karyotype suggests that this population represents a new species within the A. fasciatus species complex. Populations of Astyanax scabripinnis were 2n=50 (4m+10sm+20st+16a) in rio Casca, 2n=50 (4m+12sm+34a) in rio das Pacas, and 2n=48 (8m+20sm+14st+6a) in rio Turvo, while chromosome bearing pairs varied from one, three and two for each population, showing high levels of variation characteristic of this species complex elsewhere in the Neotropical region. Patterns of variation in Astyanax bimaculatus indicated stability of diploid number 2n=50 (14m+22sm+6st+8a) in the Turvo and Piranga rivers, and 2n=50 (14m+24sm+4st+8a) in rio Santo Antônio. The results suggest that the rio Doce basin has been a scenario of independent karyotypic evolution for fish populations of the genus Astyanax.
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Efeito da época de aplicação do AG3 sobre o florescimento, frutificação e produção da tangerineira ‘Poncã’ / Effect of time of GA3 application on flowering, fructification and production of ‘Poncã’ tangerine

Esposti, Marlon Dutra Degli 16 June 2004 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-06-02T11:25:51Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 491588 bytes, checksum: 95cd445fa95e86e3fe78bb2c7288ba14 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T11:25:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 491588 bytes, checksum: 95cd445fa95e86e3fe78bb2c7288ba14 (MD5) Previous issue date: 2004-06-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar a influência do ácido giberélico (AG3) sobre o florescimento e frutificação da tangerineira 'Poncã', determinar a(s) melhor(es) época(s) de aplicação e reduzir a alternância de produção das plantas. O experimento foi conduzido em delineamento em blocos casualizados com cinco tratamentos e quatro repetições. Em 2001, as plantas foram pulverizadas com ácido giberélico na dose de 25 mg L-1 de AG3 mais 0,1% do espalhante adesivo Silwet®, nos meses de maio (120 dias antes do pleno florescimento – DAPF), junho (90 DAPF), julho (60 DAPF) e agosto (30 DAPF). Em 2002, realizaram-se as pulverizações nos meses de maio (150 DAPF), junho (120 DAPF), julho (90 DAPF) e agosto (60 DAPF), com a dose de 50 mg L-1 de AG3 mais 0,1% do espalhante. A aplicação foliar do ácido giberélico em 2001 promoveu redução no número de brotações reprodutivas desta planta, a qual variou de 89,2% nas plantas pulverizadas com AG3 aos 30 DAPF a 97,8% nas pulverizadas aos 90 DAPF, com redução média de 93,9% nas plantas que foram pulverizadas com AG3 em relação à testemunha. No ano de 2002, houve redução de 83,4% no número de brotações reprodutivas nas plantas pulverizadas aos 60 DAPF, não sendo observado o mesmo comportamento nos demais tratamentos em relação à testemunha. Na safra de 2001/2002, a maior produção total de frutos (21,87 kg planta -1) e o maior número de frutos por planta (120,75 frutos) foram obtidos pelas plantas- testemunha. A menor produção total de frutos (8,38 kg planta -1) e o menor número de frutos por planta (37,25 frutos) foram obtidos pelas plantas pulverizadas com AG3 aos 60 DAPF. Na safra de 2002/2003, o comportamento das plantas foi diferente, sendo os maiores valores de produção total de frutos (36,95 e 28,43 kg planta -1) e número de frutos (246,50 e 194,50 frutos planta -1) obtidos pelas plantas pulverizadas com AG3 aos 120 e 150 DAPF. A alternância de produção da tangerineira ‘Poncã’ não foi reduzida, mas a média de produção (kg planta -1) das duas safras avaliadas (2001/2002 e 2002/2003) foi aumentada, principalmente nas plantas pulverizadas nos meses de maio e junho, indicando ser esses os meses mais propícios para a aplicação do ácido giberélico. Na safra de 2001/2002, as características vitamina C, firmeza da casca, sólidos solúveis totais e acidez total titulável foram as únicas variáveis analisadas nos frutos, que apresentaram diferenças significativas pelo teste de Dunnett. O maior valor de vitamina C, de 48,98 mg/100 mL de suco, foi observado nos frutos das plantas pulverizadas com AG3 aos 90 DAPF, enquanto com relação à firmeza da casca se observaram valores de 24,56 e 32,98 N nas plantas pulverizadas aos 90 e 120 DAPF, respectivamente. As menores porcentagens de sólidos solúveis totais (10,70) e acidez total titulável (0,45) foram verificadas nas plantas pulverizadas aos 120 DAPF. Na safra de 2002/2003, os diâmetros equatorial e transversal, bem como a firmeza da casca, vitamina C, sólidos solúveis totais, açúcares solúveis totais e açúcares não-redutores, foram as características avaliadas que apresentaram diferenças significativas, exibindo os maiores valores (6,02 cm, 8,06 cm, 44,47 mg/100 mL) de suco, 40,26 N, 10,84%, 9,90% e 6,00%, nas plantas pulverizadas com AG3 aos 60, 60, 120, 150, 120, 120 e 120 DAPF, respectivamente. O desenvolvimento do fruto da tangerineira ‘Poncã’ seguiu uma curva do tipo sigmóide simples, sendo a fase I compreendida da antese até o 85o dia após o pleno florescimento, com um período de transição na fase II, que foi até o 101o dia após o pleno florescimento. A fase II teve início logo após a fase de transição, prolongando-se até o 251o dia após o pleno florescimento. A fase III de amadurecimento do fruto iniciou-se no 251o dia após o pleno florescimento, e prolongou-se até a colheita dos frutos, a qual foi realizada no 276o dia após o pleno florescimento. De maneira geral, as plantas pulverizadas com AG3 exibiram o mesmo comportamento das respectivas testemunhas, não sendo possível observar diferenças marcantes com relação às concentrações foliares de carboidratos e teores de nutrientes durante o período em que as mesmas foram avaliadas, com exceção de algumas épocas. As plantas-testemunha exibiram, na maioria das épocas avaliadas, as maiores concentrações de açúcares solúveis totais, redutores, não-redutores e amido, não sendo verificado o mesmo comportamento dos nutrientes N-orgânico, fósforo, cálcio e magnésio. No caso do potássio, as plantas pulverizadas com AG3 exibiram os maiores teores foliares desse nutriente, principalmente no período de maio a dezembro de 2003. / The objectives of this work were to evaluate the influence of gibberellic acid (GA 3) on flowering and fructification of ‘Poncã’ tangerine, to determine the best time of application and to reduce plant production fluctuation. The experimental design was a randomized block design, with five treatments and four repetitions. In 2001, the plants were sprayed with 25 mg L-1 plus 0,1% wetting agent spreader Silwet®, in May (120 days before full flowering – DAPF), June (90 DAPF), July (60 DAPF) and August (30 DAPF). In 2002, spraying took place in May (150 DAPF), June (120 DAPF), July (90 DAPF) and August (60 DAPF), with 50 mg L-1 GA3 plus 0,1% spreader. In 2001, foliar application of gibberellic acid reduced the number of reproductive shoots, varying from 89,2% in plants sprayed with GA 3 at 30 DAPF to 97,8% in those sprayed at 90 DAPF, with 93,9% mean reduction in plants sprayed with GA 3 compared with the control. In 2002, there was 83,4% reduction in the number of reproductive shoots of sprayed plants at 60 DAPF, not being observed the same behavior of other treatments compared to the control. In the 2001/2002 harvest, the highest total production (21,87 kg plant-1) and the largest number of fruit per plant (120,75 fruits) were obtained by the control plants, while the lowest total production (8,38 kg plant-1) and the smallest number of fruit per plant (37,25 fruits) were obtained by plants sprayed with GA 3 at 60 DAPF. In the 2002/2003 harvest, plant performance was different, with the largest values for total fruit production (36,95 and 28,43 kg plant-1) and fruit number (246,50 and 194,50 fruits.plant-1) obtained by the plants sprayed with GA 3 at 120 and 150 DAPF. The production fluctuation of the ‘Poncã’ tangerine was not reduced, but the production average (kg plant-1) of the two harvests evaluated (2001/2002 and 2002/2003) increased, mainly in plants sprayed in May and June, indicating those to be the best months to gibberellic acid application. In 2001/2002 crop, the characteristics vitamin C, peel firmness, total soluble solids and total tritable acidity were the only variables analyzed in fruits showing significant differences by Dunnett ́s test. The largest vitamin value C (48,98 mg/100 ml juice) was observed in fruits derived from plants sprayed with GA 3 at 90 DAPF, while values of 24,56 and 32,98 N for peel firmness were found in plants sprayed at 90 and 120 DAPF, respectively. The lowest percentages of total soluble solids (10,70) and total tritable acidity (0,45) were found in plants sprayed at 120 DAPF. In the 2002/2003 crop, equatorial and transversal diameters, as well as peel firmness, vitamin C, total soluble solids, total soluble sugars and non- reducer sugars were the characteristics evaluated that presented significant differences, showing the largest values (6,02 cm, 8,06 cm, 40,26 N, 44,47 mg/100 ml juice, 10,84%, 9,90% and 6,00%) in plants sprayed with GA 3 at 60, 60, 120, 150, 120, 120 and 120 DAPF, respectively. Fruit development followed a simple sigmoid curve, with phase I extending from anthesis to the 85th day after full flowering, with a transition period to phase II that lasted up to the 101st day after full flowering. Phase II began soon after the transition phase, extending up to the 251st day after full flowering. Phase III, fruit ripening, began at the 251st day after full flowering and it was prolonged until harvest, which was carried out at the 276th day after full flowering. Generally, plants sprayed with GA3 showed the same behavior of its respective controls, with no observation of important differences in relation to foliar concentrations of carbohydrates and nutrient levels during the period they were evaluated, except for some times of application. The control-plants, in most of times of application analyzed, showed the highest concentrations of total soluble sugars, reducers, non-reducers and starch, but it was not observed the same results for organic-N, phosphorus, calcium and magnesium. The plants sprayed with GA 3 showed the highest foliar levels of potassium, especially from May to December, 2003. / Não foi localizado o cpf do autor.
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Seleção de linhagens elites de milho-pipoca com base no desempenho e na genealogia de progênies e plantas S 5 / Selection of elites lines of popcorn with base in the performance and pedigree of families and plants S 5

Faria, Héder Henrique Ribeiro 25 November 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T11:57:06Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 238640 bytes, checksum: f22d6a84f82158073d2647db60b8be75 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T11:57:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 238640 bytes, checksum: f22d6a84f82158073d2647db60b8be75 (MD5) Previous issue date: 2004-11-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Com o objetivo de selecionar linhagens elites para obtenção de híbridos e sintéticos, foram avaliadas 144 famílias S 5 da população de milho- pipoca Beija-Flor. O experimento foi realizado no campo experimental do Setor de Genética do Departamento de Biologia Geral. Foi utilizado o delineamento em blocos incompletos, repetindo-se as testemunhas a cada 10 progênies. Foi verificada variabilidade genética para altura de planta, proporção de espigas atacadas por doenças, proporção de espigas atacadas por pragas e capacidade de expansão (CE). Não foi observada variabilidade genética significativa para produção. As famílias apresentaram média de produtividade de 1.791 kg/ha, satisfatória, visto que estas possuem alto grau de endogamia. Para a capacidade de expansão, foram observados valores médios de 30,29 mL/g, sendo encontrados valores de até 44,67 mL/g, acima daqueles obtidos por cultivares comerciais. As herdabilidades encontradas para CE, para famílias, e para plantas autofecundadas, foram, respectivamente, 60% e 66%. Visando o melhoramento populacional, foi realizada seleção com base no índice de Mulamba e Mock, com pesos 3 e 1 para CE e produtividade, respectivamente. Como o ganho predito para CE, utilizando-se o índice, foi equivalente a 95% do ganho com seleção direta para a característica, sendo este de 1,74 mL/g, e apesar de não ser possível estimar os ganhos preditos para produção, foi observado aumento significativo na média da produção das plantas selecionadas, de 482 kg/ha. Deste modo, optou-se pela seleção com base no índice de Mulamba e Mock. Para selecionar as linhagens elites, visando obtenção de híbridos, foram utilizadas diversas estratégias, sendo elas: seleção massal; seleção entre com base no melhor indivíduo da família; seleção entre famílias endogâmicas; seleção entre e dentro de famílias endogâmicas; e três estratégias utilizando o índice de Mulamba e Mock – seleção com base em CE de parcela e CE de planta autofecundada, com pesos 1 e 3, respectivamente; seleção para produção e CE de planta autofecundada, com pesos 1 e 3, respectivamente; e seleção com base em CE, produção e genealogia de planta autofecundada, com pesos iguais para as três características. Depois de consideradas todas as estratégias, foi observado que 17 famílias ou plantas (dependendo da estratégia) eram comuns a pelo menos duas das estratégias. Desta forma, optou-se por selecionar entre estas, as 14 famílias de maior destaque, para a obtenção das linhagens, visto que as mesmas são consistentemente superiores, pois aparecem em mais de uma das estratégias. Para a formação de sintético, foram selecionadas 30 famílias, sendo estas as 14 selecionadas para obtenção de híbridos e outras 16 que mais se destacaram nas várias estratégias. Foi realizado um estudo sobre a eficiência do processo seletivo e pôde-se concluir que, de uma maneira geral, o que parece ser mais adequado seria selecionar um maior número de famílias e dentro das famílias superiores, selecionar todas as plantas superiores. Já para aquelas famílias de menor desempenho, comparativo às melhores, selecionar pelo menos uma planta superior dentro das mesmas. / With the objective to select ancestries elites for attainment of synthetic and hybrids, 144 S5 families of population had been evaluated Beija-flor maize-popcorn. The experiment was carried out in the experimental field of the Sector of Genetics of the Department of General Biology. It was used the delineation of incomplete block-type, happening again the witnesses to each 10 lineages. It was verified genetic variability only for height of plant, ratio of spikes attacked for illnesses, ratio of spikes attacked for plagues and capacity of expansion. Variability for production was not observed, however, this does not mean that the same one does not exist. In average, the production presented for the families was satisfactory, for as much these possess high degree of endogamy. For the question quality, raised values had been observed, being found values above of those gotten by commercial cultivating. The inheritance found for CE, as much for families, as for self-fertilized plants, had been similar, being a little superior for the self-fertilized plants. Aiming the population improvement, the index of Mulamba and Mock was carried out by election on the basis of, weights 3 and 1 for CE and production, respectively. As the profit predicted for CE, using itself the index, was equivalent 95% of the profit with direct election for characteristic, being this 1,74 mL/g, and although not to be possible esteem the profits predicted for production, a significant increase in the average of the production of the selected plants was observed, being this of 482 kg/ha. In this way, the index of Mulamba and Mock was opted on the basis of to the election. To select the elites ancestries for attainment of hybrids, diverse strategies had been used, being they: massal election, election on the basis of the best individual of the family, election between the endogamy’s families, election inside the endogamy’s families, and three strategies using the index of Mulamba and Mock, being they: election for CE of parcel and CE of self- fertilized plant, with weights 1 and 3, respectively; election for production and CE of self-fertilized plant with weights 1 and 3, respectively; and CE election, production and genealogy of plant on the basis of self-fertilized, with equal weights for the three characteristics. After considered all the strategies, it was observed that 17 families or plants (depending on the strategy) were common at least the two of the strategies. Of this form, it was opted to selecting between these, the 14 families with bigger prominence, for the attainment of the ancestries, in as much as the same ones must exactly be superior; therefore appear more than in one of the strategies. For the formation of the synthetic one, 30 families had been selected, being these, the 14 selected for attainment of hybrids and others 16 of bigger prominence inside the vary strategies. Was carried out a study about the efficiency of the selective process, and it could conclude that, in a general way, what more seems to be suitable would be to select a bigger number of families and inside the superior families, select all the superior plants. Then for those families of lesser performance, comparative degree to the best ones, select at least one superior plant inside the same ones.
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Análise AMMI e SREG da interação genótipos x ambientes em milho / AMMI and SREG analyses of the genotype x environment interaction in maize

Souza, Heraldo Namorato de 29 March 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T12:12:15Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 817945 bytes, checksum: 6059141ae362003700d54ee3a0e7bb21 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T12:12:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 817945 bytes, checksum: 6059141ae362003700d54ee3a0e7bb21 (MD5) Previous issue date: 2004-03-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A avaliação de cultivares e a identificação de mega-ambientes são os objetivos mais importantes em ensaios de avaliação de cultivares. Com este propósito foram avaliados, nas safras 1998/1999 e 1999/2000, os dados de produtividade de milho precoce do Ensaio Nacional no Estado de Minas Gerais, objetivando não apenas o conhecimento do desempenho dos cultivares comerciais e pré-comerciais, mas, principalmente, avaliar por meio da comparação das metodologias multivariadas AMMI (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction) e SREG (Sites Regression) de análise de interação genótipos x ambientes. Estas metodologias também possuem propriedades de estratificação de ambientes e de avaliação de adaptabilidade. Realizou-se comparação com outras metodologias tradicionais e com metodologia multivariada recém-proposta por Murakami (2001), com base na análise de fatores. O desempenho dos cultivares foi analisado mediante a utilização de análises de variância, metodologias de adaptabilidade e estabilidade. As análises AMMI e SREG apresentaram como vantagens o fato de explicarem uma maior parcela das soma de quadrados da interação G x A e possibilitar uma fácil interpretação gráfica dos resultados da análise estatística. Apesar de possuírem propriedades metodológicas de análise semelhantes, os resultados diferiram, na maioria das vezes, entre as análises AMMI e SREG. A análise SREG por incorporar o efeito de genótipo e por este na maioria dos casos estar altamente correlacionado com os escores do primeiro componente principal, possui a vantagem de permitir a avaliação gráfica direta do efeito de genótipo. O desenho de setores no biplot apresentado por Yan et al. (2000) e a análise SREG identificam com melhor propriedade a existência de mega-ambientes graficamente, prestando-se ao zoneamento agronômico. Como limitações das análises AMMI e SREG podem-se citar o requisito de dados balanceados, a explicação de apenas uma pequena porção da total da soma de quadrados G ou G + G x A, respectivamente, e a perda da medida de incerteza, pois não permitem o cálculo de uma hipótese em particular. A metodologia para estratificação de ambientes com base na técnica multivariada de análise de fatores mostrou-se eficiente em reunir locais pela similaridade de desempenho dos cultivares. Os agrupamentos de ambientes formados pela estratificação ambiental e a capacidade de discriminação de genótipos foram em parte coincidentes pelas metodologias utilizadas na avaliação dos dados. Dadas as condições de realização dos ensaios, alguns cultivares se destacaram por sua produtividade média, por seus resultados nas análises de estabilidade e pela adaptabilidade. Na safra 1998/1999, os genótipos P 30F33 e P 3041 se notabilizaram pelas suas produtividades e estabilidade através dos ambientes de avaliação. Na safra 1999/2000, o destaque foi o genótipo 98 HS 16B. Os ambientes Patos de Minas 2 e Uberlândia 2 de destacaram pela coincidência no agrupamento pela unanimidade das metodologias utilizadas, levando a inferir o forte caráter de homogeneidade edafoclimática pela proximidade geográfica, altitudes semelhantes e de localização nos Cerrados. Também a homogeneidade de manejo agrícola, praticada para estes dois ambientes, teve importância. As análises AMMI e SREG apresentaram propriedades importantes e adequadas ao estudo da interação genótipo x ambientes, sendo recomendadas suas utilizações pelos melhoristas de plantas. / The evaluation and identification of mega-environments are the major objectives in cultivar evaluation trials. Thus, the Minas Gerais National Trials data on early maize productivity were evaluated during 1998/1999 and 1999/2000, aiming not only to understand the performance of commercial and pre-commercial cultivars but especially to evaluate them by comparing the multivariate AMMI methodologies (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction) and SREG (Sites Regression) of genotype x environments interaction analysis. Such methodologies also have environment stratification and adaptability evaluation properties. Comparison was made to other traditional methodologies and to the multivariate methodology recently proposed by Murakami (2001), based on factor analysis.Cultivar performance was analyzed by using variance analyses, and adaptability and stability methodologies. The AMMI and SREG analyses had the advantages of explaining a greater portion of the square sum of G x A interaction and allowing an easy graphic interpretation of the statistical analysis results. Despite having similar analysis methodological properties, the AMMI and SREG analyses xresults differed most of the times; the latter for incorporating the genotype effect and since, in most cases, it is highly correlated with the scores of the principal first component, having the advantages of allowing the direct graphic evaluation of the genotype effect. The sector design in the biplot presented by Yan et al. (2000) and the SREG analysis could better identify the existence of mega- environments graphically, being suitable for agronomical zoning. The AMMI and SREG analyses presented the following disadvantages: the requirement of balanced data, the explanation of only a small portion of the total sum of the squares G or G + G x A, respectively, and loss of uncertainty measurement, since it did not allow the calculation of a hypothesis in particular. The methodology applied for environment stratification based on factor analysis multivariate technique was found to be efficient in grouping locations based on cultivar performance similarity. The environment groupings formed by environmental stratification and genotype discrimination capacity coincided in part with the methodologies applied to data evaluation. Given the assay performance conditions, some cultivars stood out for their average productivity and stability and adaptability analysis results.In the 1998/1999 harvests, the genotypes P 30F33 and P 3041 presented outstanding productivities and stability in the evaluated environments. In the1999/2000 harvest, the genotype 98 HS 16B was the most outstanding. The environments Patos de Minas 2 and Uberlândia 2 stood out for coinciding in the grouping for unanimous methodology application, leading to infer the strong character of edaphoclimatic homogeneity due to geographic proximity, similar altitudes and locations in the cerrados. Homogeneity of the agricultural management practiced in these two environments was also important. The AMMI and SREG analyses presented important properties adequate to the study of genotype x environment interaction, their application being thus recommended by plant breeders.
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Associação entre polimorfismos no gene candidato Leptina e características quantitativas em suínos / Association between leptin candidate gene polymorphisms and quantitative traits in swine

Peixoto, Jane de Oliveira 30 July 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T12:58:01Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 416709 bytes, checksum: 2bb727f4c0fb775d57edba4fdab8f115 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T12:58:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 416709 bytes, checksum: 2bb727f4c0fb775d57edba4fdab8f115 (MD5) Previous issue date: 2004-07-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Neste estudo investigou-se a associação entre polimorfismos no gene da Leptina e características quantitativas em suínos produzidos pelo cruzamento divergente entre machos da raça naturalizada brasileira Piau e matrizes comerciais. Foram avaliadas características de desempenho, carcaça, cortes de carcaça e qualidade da carne. Os polimorfismos detectados por seqüenciamento nos animais parentais foram reconhecidos pelas enzimas Pvu II, Dde I, Bam HI, Fok I e Hinf I, respectivamente nas posições do gene 798, 828, 2411, 3266 e 3469 pb. Apenas o polimorfismo T3469C estava localizado em região de exon; os demais polimorfismos se encontravam em regiões não- expressas do gene. Os genótipos para cada polimorfismo foram obtidos pela técnica de PCR-RFLP. Nas análises estatísticas de associação entre os polimorfismos e as características foi utilizado o modelo com efeitos fixos de genótipo, sexo, lote, interação genótipo x sexo e efeito aleatório de pai. Foram consideradas diferentes covariáveis para cada grupo de características. As médias dos genótipos foram comparadas pelo teste F ou t. Quando a interação genótipo x sexo foi significativa, realizou-se a comparação entre as médias dos genótipos dentro de sexo por meio do teste t. Os efeitos médios da substituição alélica e os desvios da dominância dos genótipos foram determinados. O polimorfismo C798T apresentou associações com as características número total de tetas (p=0,02), número de tetas esquerdas (p=0,03), espessura de toucinho UL (p=0,06), comprimento de intestino (p=0,02) e peso total de carré (p= 0,01). O sítio polimórfico C828T esteve associado a variações nas características peso da banda direita (p=0,06) e banda esquerda (p=0,06), peso da copa limpa (p= 0,07), peso total de paleta (p=0,03) e peso de bacon (p=0,03). O polimorfismo T2411C esteve associado a variações nas características espessura de toucinho P2 (p=0,06), peso de paleta limpa (p=0,06), peso de copa (p=0,08), peso do filezinho (p=0,01) e peso do rim (p=0,01). O polimorfismo T3266G apresentou associações significativas com as características idade ao abate (p=0,08), espessura de toucinho medida imediatamente após a última costela, a 6,5 cm da linha dorso-lombar (p=0,07), espessura de toucinho imediatamente após a última costela, na linha dorso- lombar (p=0,04), espessura de toucinho entre a última e a penúltima vértebra lombar, na linha dorso-lombar (p=0,07), peso de costela (p=0,09), peso de copa limpa (p= 0,08) e peso de bacon (p=0,04). O polimorfismo T3469C apresentou associação com as características peso aos 21 (p=0,03), 42 (p=0,05), 63 (p=0,02) e 77 dias de idade (p=0,04), peso ao abate (p=0,03), consumo de ração (p=0,01), ganho de peso médio diário (p< 0,01), conversão alimentar (p<0,01), comprimento de carcaça medido pelos métodos brasileiro (p=0,09) e americano (p=0,04), índice de vermelho (p=0,02) e tonalidade da carne (p=0,03). Foi observada a interação entre sexo e os genótipos para muitas características. Os efeitos médios da substituição alélica e os desvios da dominância foram determinados somente para os polimorfismos T828C e T2411C. Os resultados sugerem que os polimorfismos são potenciais marcadores para características produtivas de importância econômica como taxa de crescimento, consumo de ração e espessura de toucinho. No entanto, as associações foram detectadas em população experimental, sendo necessária a validação desses resultados em populações comerciais. / The association of polymorphisms in the porcine Leptin gene and quantitative traits in pigs produced by initial mating of native Brazilian boars and commercial sows was investigated. Performance, carcass, carcass cuts and meat quality traits were analyzed. The polymorphic sites detected by sequencing parental animals DNA were recognized by the enzymes Pvu II, Dde I, Bam HI, Fok I e Hinf I, respectively observed in the positions 798, 828, 2411, 3266 e 3469 pb. Only T3469C polymorphism was observed in exonic region; the other ones were observed at a not expressed region of Leptin gene. Genotypes were identified by PCR – RFLP. Association analyses were performed using a model that included genotype, sex, group and genotype x sex interaction as fixed effects and sire as random effect. Different covariates were assumed according to different trait groups. Genotypes means were compared by F test or t test. The existence of interaction between genotype and sex was evaluated and genotypes means were compared for each sex by t test. The polymorphism C798T was associated with variation in total number (p=0.02) and left number of teats (p=0.03), backfat thickness between last and last but one lumbar vertebrae (p=0.06), intestine length (p=0.02) and total loin ix(bone-in) weight (p=0.01). The polymorphic site C828T was associated with variation on right half carcass weight (p=0.06), left half carcass weight (p=0.06), boston shoulder weight (p=0.07), picnic shoulder weight (p=0.03) and bacon weight (p=0.04). The polymorphism T2411C was associated with variation in backfat thickness after last rib, at 6.5 cm from the midline (p=0.06), skinless and fatless picnic shoulder weight (p=0.06), boston shoulder weight (p=0.08), sirloin weight (p=0.01) and kidney weight (p=0.01). The polymorphism T3266G was associated with slaughter age (p=0.08), backfat thickness after last rib, at 6.5 cm from the midline (p=0.07), backfat thickness after last rib (p=0.04), and backfat thickness between last and last but one lumbar vertebrae (p=0.07), spareribs weight (p=0.09), skinless and fatless boston shoulder weight (p=0.08) and bacon weight (p=0.04). The T3469C polymorphism was associated with weight at 21 (p=0.03), 42 (p=0.05), 63 (p=0.02) and at 77 days of age (p=0.04), slaughter weight (p=0.03), feed intake (p=0.01), average daily gain (p<0.01), feed/gain ratio (p<0.01), carcass length by the Brazilian carcass classification method (p=0.09) and by the American carcass classification method (p=0.04), redness (p=0.02) and hue (p=0.03). Association between genotype and sex was observed for many traits. Allelic substitution and dominance effects were estimated for polymorphisms T828C and T2411C. The observations suggest that these Leptin polymorphisms may be considered potential molecular markers for economically important production traits such as feed intake, growth rate and back fat in swine. However, associations need to be confirmed in commercial populations.
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Herança do teor de isoflavonas em sementes de soja (Glycine max (L.) Merrill) / Inheritance of the isoflavone content in soybean seeds (Glycine max (L.) Merrill)

Chiari, Lucimara 03 April 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T13:04:42Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 357285 bytes, checksum: 04fb880e71ef2e7c0b481ce931c17268 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T13:04:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 357285 bytes, checksum: 04fb880e71ef2e7c0b481ce931c17268 (MD5) Previous issue date: 2003-04-03 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os efeitos benéficos à saúde associados às isoflavonas da soja incluem a atenuação dos sintomas da menopausa, redução da osteoporose, melhora dos níveis de colesterol do sangue, diminuição do risco de certos tipos de câncer e de doenças coronarianas. Os teores e a composição de isoflavonas variam de acordo com a parte morfológica da semente de soja (cotilédone, hipocótilo e tegumento); e, também, em função do genótipo e das condições ambientais. Os objetivos deste trabalho foram: avaliar os efeitos do genótipo do embrião, do genótipo nuclear e citoplasmático da planta-mãe, bem como os mecanismos de ação gênica e grau de dominância para a característica teor de isoflavonas em sementes de soja; estimar herdabilidades e correlações entre as formas de isoflavonas encontradas e entre cada forma e a característica teor de proteína. Para isso, foram estudadas populações derivadas dos cruzamentos recíprocos entre IAC-100 (alto teor de isoflavonas) e BARC-8 (baixo teor de isoflavonas), obtidas no verão de 2000/2001. Os teores das isoflavonas foram determinados por cromatografia líquida de alta eficiência e o teor protéico pelo método de Kjeldahl. Foram analisados três contrastes para verificar efeitos de dominância, citoplasmático e materno. O efeito citoplasmático foi testado juntamente com os efeitos epistáticos entre genes citoplasmáticos e nucleares pela análise de variância (ANOVA) do modelo genético Y ijk = m + n j + c i + (cn) ij + ε ijk. Em que: Y ijk = valor observado no citoplasma i no núcleo j na repetição k; m= média geral; c i = efeito do i-ésimo citoplasma; n j = efeito do j-ésimo núcleo e; (cn) ij = efeitos epistáticos entre os genes citoplasmáticos e nucleares; ε ijk = erro experimental. Os componentes de médias foram estimados utilizando dois modelos genéticos, um com e outro sem interação epistática citoplasma x núcleo, utilizando o método dos quadrados mínimos ponderados. A importância relativa de cada componente genético foi avaliada pelo método de eliminação de Gauss. Seis formas de isoflavonas foram detectadas nas sementes de soja: daidzina, genistina, glicitina, malonildaidzina, malonilgenistina e malonilglicitina. Glicitina e malonilglicitina não foram significativamente contrastantes entre os progenitores. Os resultados indicam a existência de efeito materno e citoplasmático atuando sobre os teores das isoflavonas estudadas. Tais informações são relevantes nos processos de seleção para estas características, pois na presença de pelo menos um desses efeitos, a seleção praticada em sementes F 2 é inferior àquela baseada na média das plantas F 2 , ou na média de progênies. Na análise dos componentes de médias os resultados foram similares para o teor de daidzina e malonildaidzina, pois todos os parâmetros foram significativos pelo teste t e o efeito citoplasmático foi o de maior importância relativa. Porém, para o teor de genistina, os efeitos aditivos, de desvio de dominância e de interação citoplasma x dominância não foram significativos e o efeito citoplasmático foi o efeito mais importante. Já para o teor de malonilgenistina os parâmetros genéticos significativos foram: efeitos aditivos e epistáticos citoplasma x aditivo e citoplasma x dominante, sendo o efeito aditivo o de maior importância relativa. Tais informações podem ser úteis na escolha do melhor progenitor materno, o qual possua o melhor citoplasma, para aumentar o ganho na seleção. Devido à influência dos efeitos materno e citoplasmático sobre os teores das isoflavonas estudadas foi necessário estimar as herdabilidades para essas características com base na progênies F 3 . As sementes F 3 foram obtidas, juntamente com sementes dos progenitores, na safra 2001/2002. A herdabilidade no sentido amplo para os teores de daidzina, genistina, malonildaidzina, malonilgenistina e teor de isoflavonas totais foram superiores a 90%, sugerindo sucesso na seleção feita em gerações precoces. A herdabilidade no sentido amplo para o teor de proteína foi 33%. Os coeficientes de correlações fenotípicas entre as isoflavonas foram positivos e de grande magnitude (>0,80), indicando que essas características podem ser melhoradas simultaneamente. Os coeficientes de correlações fenotípicas entre as isoflavonas estudadas e o teor de proteína foram todos negativos, e entre isoflavonas totais e teor de proteína foi 0,47, confirmando a tendência de correlação negativa entre essas características. / The beneficial effects associated with isoflavone include the attenuation of the symptoms of menopause, reduction of osteoporosis, reduction on blood cholesterol levels, decrease on the risk of certain types of cancer and of coronary diseases. The objectives of this study were: to evaluate the effects of the genotype of the embryo, of the nuclear and cytoplasmatic genotypes, as well as of the mechanisms of genic action and of dominance on the isoflavone contents of soybean seeds, to estimate heritabilities for the isoflavone contents in soybean seeds and to estimate correlations between total isoflavone and between each isoflavone type, and protein content. Populations derived from the reciprocals cross between BARC-8 (low isoflavone content) and IAC-100 (high isoflavone content) were produced during the summer of 2000/2001. The isoflavones content were determined by high- performance liquid chromatography and the protein content were determined by the Kjekdahl method. Three contrasts were analyzed for to verify the effects of dominance, cytoplasmatic and maternal. The identified cytoplasmatic effect were tested with the epistatics effects among cytoplasmatic genes and nuclear genes by the analysis of variance (ANOVA) of the genetic model Y ijk = m + n j + c i + (cn) ij + e ijk . In which: Y ijk = value observed in the i cytoplasm in the j nucleus in the k repetition; m = general average; c i = effect of the i-th cytoplasm; n j = effect of the j-th nucleus and; (cn) ij = epistatic effects between cytoplasmatic and nuclear genes, e ijk = experimental error. The study of the components of means considered two genetic models, one with and the other without interaction cytoplasm x nucleus. The genetic components of the means were estimated by the weighted least square method squares and the relative importance of each genetic effect was evaluated by the Gauss elimination method. Six isoflavone kinds were detected: daidzin, genistin, glycitin, malonyldaidzin, malonylgenistin and malonylglycitin. Glycitin and malonylglycitin were not significantly contrasting among the progenitors. The results indicate the existence of maternal and cytoplasmatic effects on the determination of soflavone contents in soybean seeds. Such information is important for breeders during the processes of selection for high isoflavone contents, because in the presence of at least one of these effects, the success of the selection in F 2 seeds is lower than that based on the average of the F 2 plants, or on the average of the progenies. The resulted of the genetic components of the means were similar to daidzin and malonildaidzin contents,all the parameters were significant by the t test and the cytoplasmic effect was the most important one. However, for genistin content the addictive effects, of dominance deviation and of interaction cytoplasm x dominance were not significant and the cytoplasmic effect and of interaction cytoplasm x nucleus were the first and the second, respectively, most important effects. For malonylgenistin content the genetic parameters significant were: the addictive effects and of epistatic effects (cytoplasm x addictive and cytoplasm x dominant). The addictive effect was the one with the largest relative importance. Such information is especially important during the choice of the best maternal progenitor, with the best cytoplasm and interaction of the cytoplasm with the nucleus, increasing the probability of gain in the selection process. Due to the maternal and cytoplasmic effects on isoflavone contents it was necessary to estimate the heritability for that characteristic based on F 3 progenies. Heritability estimates for daidzin, genistin, malonyldaidzin, and malonylgenistin contents and for total isoflavone contents were superior to 90%, indicating a high probability of success in the selection in early generations. Heritability for protein content was 33%. The correlations coefficients for the kinds isoflavones were positives and of high magnitude (>0.80) among them, indicating that such characteristics can be breeding simultaneously. The correlations coefficients between isoflavone contents and protein contents were all negative. The phenotypic correlation between these characteristics was -0.47, agreeing with the literature. / Tese importada do Alexandria
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Mapeamento físico da região cromossômica próxima ao gene de resistência a Meloidogyne exigua (Mex-1) em Coffea arabica L. / Physical maping of the chromosomal region close to Meloidogyne exigua resistance gene (Mex-1) in Coffea arabica L.

Diniz, Leandro Eugenio Cardamone 11 February 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T13:51:26Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1349164 bytes, checksum: 9c19c3653448f602368f6e79a2562b38 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T13:51:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1349164 bytes, checksum: 9c19c3653448f602368f6e79a2562b38 (MD5) Previous issue date: 2004-02-11 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O nematóide de galhas, Meloidogyne exigua, parasita o cafeeiro (Coffea sp.) e sua erradicação das regiões infestadas é impraticável. Estudos anteriores mostraram que a resistência a M. exigua é controlada por um gene de herança simples, designado Mex-1, presente em C. canephora. Linhagens de café arábica apresentando resistência têm sido desenvolvidas em programas de melhoramento genético por meio da introgressão deste gene. Uma biblioteca BAC de café foi avaliada inicialmente utilizando-se três marcadores (Exi-2, Exi-3 e Exi-4) ligados a Mex-1, obtidos a partir de marcadores AFLP previamente clonados. Os clones positivos associados à região Mex-1 foram identificados e isolados. O DNA destes clones foi então analisado por hibridização e amplificação com marcadores SCAR (Exi-2 e Exi- 3) e 9 combinações de primers das extremidades BAC. Os clones BAC positivos, relativos aos marcadores Exi-2, Exi-3 e Exi-4, foram reunidos em 5 contigs. O primeiro contig apareceu composto de dois clones BAC identificados com o marcador Exi-4. Dos cinco clones BAC identificados com o marcador Exi-2, dois contigs designados Exi-2 I e Exi-2 II foram distintos. Os clones BAC Exi-3 foram organizados em dois contigs distintos chamados Exi-3 I e Exi-3 II. No total, nove sítios de restrição ou de PCR, correspondendo a sete marcadores físicos, foram localizados na região Exi-3. As três regiões cromossômicas correspondentes ao contig Exi-4, aos dois contigs Exi-2 e aos dois contigs Exi-3 não apresentaram sobreposição. A presença de clones BAC contendo análogos de gene de resistência (RGA) na região Mex-1 foi investigado por meio de amplificação com primers degenerados e hibridização com sondas RGA de café. Alguns clones BAC contendo RGAs foram identificados. Para confirmar a introgressão do gene Mex-1, vinte e uma linhagens de Icatu foram comparadas a três testemunhas resistentes, Iapar 59, Híbrido de Timor e Sarchimor e a uma testemunha susceptível, Catuaí. Foi avaliada, por meio de marcadores AFLP, a presença do fragmento introgredido associado ao locus Mex-1. Nove marcadores AFLP foram amplificados. Destes, os marcadores Exi-1, Exi-2, Exi-3, Exi-11 e Exi-13 confirmaram a presença do fragmento associado à resistência a M. exigua, mostrando que esta marca pode ser utilizada em programas de seleção assistida. Uma biblioteca de cDNA de Caturra foi utilizada para se isolar fragmentos de genes associados à resistência, através da hibridização com sondas RGA. Após a utilização das nove famílias RGA de café, 32 colônias foram isoladas e seqüenciadas. Destas, 25 seqüências não apresentaram similaridade com outras seqüências disponíveis na base de dados do NCBI ou não puderam ser seqüenciadas. Seis amostras continham seqüências muito pequenas e não confiáveis, e apenas uma amostra resultou em uma seqüência de 428 nucleotídeos (142 aminoácidos). Esta seqüência apresentou alta homologia a catalases de outras plantas como Nicotiana plumbaginifolia, Glycine max, Phaseolus vulgaris, entre outras. A esta catalase descoberta em café foi dado o nome de Cat-C. A catalase de ligação ao ácido salicílico (SR1) e a seqüência parcial de aminoácidos da proteína de ligação ao ácido salicílico (SABP), ambos de N. tabacum, apresentaram 82% e 77% de identidade, respectivamente, quando comparadas a Cat- C. Na região C-terminal desta catalase foi detectada a presença de uma seqüência peroxissomal. No entanto, ao invés de uma seqüência SRL (Serina-Arginina- Leucina), foi encontrada uma seqüência TRL (Treonina-Arginina-Leucina). Esta diferença é devido à troca de uma timina por uma adenina. Estes dados sugerem que Cat-C pode estar associado ao mecanismo de resistência em café. / The root-knot nematode Meloidogyne exigua parasites the arabica coffee tree (Coffea sp.) and its eradication of the infested areas is impracticable. Previous studies showed that the resistance to M. exigua is controlled by a simple inheritance gene, designated Mex-1, present in C. canephora. Lineages of resistant Arabica coffee have been developed in some genetic breeding programs through the introgression of this gene. The BAC library of coffee was initially evaluated by three markers (Exi-2, Exi-3 and Exi-4) linked to Mex-1, previously obtained from cloned AFLP markers. The positive clones associated with Mex-1 region were identified and isolated. DNA clones were then analyzed by hybridization and amplification with SCAR (Exi-2 and Exi-3) markers and 9 combinations of primers of the BAC-end. The positive BAC clones, relative to the Exi-2, Exi-3 and Exi-4 markers, were assembled in 5 contigs. The first contig identified with the Exi-4 marker is composed of two positive BAC clones. Of the five BAC clones identified with Exi-2 markers, two contigs designated Exi-2 I and Exi-2 II were different from each other. The BAC clones Exi-3 were organized in two different contigs called Exi-3 I and Exi-3 II. In the total, nine restriction sites or PCR, corresponding to seven physical markers were located in the Exi-3 region. The three chromosomal regions that corresponded to the Exi-4 contig, the two Exi-2 contigs and the two Exi-3 contigs did not present any superposition. The presence of BAC clones containing resistance gene analogs (RGA) in the Mex-1 region was investigated by both PCR amplification with degenerate primers, and hybridization with coffee RGA probes. Some BAC clones containing RGA were identified. To confirm the introgression of Mex-1 gene, twenty-one Icatu lineages xiiiwere compared to three resistant cultivars, Iapar 59, Hibrido de Timor and Sarchimor and to a susceptible cultivar Catuaí, through AFLP markers, evaluating the presence or not of the introgressed fragment associated with the Mex-1 locus. Nine AFLP markers were amplified. Among these, Exi-1, Exi-2, Exi-3, Exi-11 and Exi-13 markers confirmed the presence of the fragment associated to the resistance to Meloidogyne exigua, showing that this marker can be used in selected assistent programs. A cDNA library of Caturra was used to isolate fragments of genes associated with the resistance, through the hybridization using RGA probes. After the use of the nine coffee RGA families, 32 colonies were isolated and sequenciated. Among these, 25 sequences either did not present similarity with other available sequences in the NCBI data base or could not be sequenced. Six samples contained very small and not trustable sequences, and just one sample resulted in a sequence of 428 nucleotides (142 aminoacids). This sequence presented high homology to catalases of other plants such as Nicotiana plumbaginifolia, Glycine max, Phaseolus vulgaris, etc. To this discovered coffee catalase was given the name of Cat-C. The salicylic acid receptor (SR1) and the partial sequence of aminoacids of the salicylic acid binding protein (SABP), both in Nicotinana tabacum, showed 82% and 77% of identities, respectively, when compared with Cat-C. In the C-terminal region of this catalase was detected the presence of a peroxisomal sequence. However, instead of a SRL sequence (Serine-Arginine-Leucine), a TRL sequence was found (Treonine- Arginine-Leucine). This difference is due to the change of a timine by an adenine. These data suggest that Cat-C can be associated with resistance mecanism in coffee.
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Cultivares-ponte de feijoeiro, resistência à mancha- angular e mapeamento de QTLs / Common bean bridge cultivars, resistance to angular leaf spot and QTL mapping

Vilarinho, Lucianne Braga Oliveira 05 February 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T14:11:46Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1066933 bytes, checksum: dd7d7c73c5b9ed09f2f70bc684d1ff87 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T14:11:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1066933 bytes, checksum: dd7d7c73c5b9ed09f2f70bc684d1ff87 (MD5) Previous issue date: 2004-02-05 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A mancha-angular do feijoeiro comum, causada pelo fungo Phaeoisariopsis griseola, encontra-se distribuída em todas as regiões do mundo onde se cultiva esta leguminosa. No Brasil, apresenta distribuição generalizada e ocorrência freqüente, afetando, com maior ou menor intensidade, todos os cultivares recomendados para plantio. As perdas no rendimento são maiores quanto mais precoce for o aparecimento da doença. As perdas podem variar de 7 a 70%, dependendo da suscetibilidade dos cultivares. O cultivar Jalo EEP 558, freqüentemente citado como resistente a esta enfermidade, foi caracterizado no capítulo I deste trabalho. Este cultivar mostrou-se moderadamente resistente a oito de doze isolados de P. griseola testados, apresentando poucas pústulas de pequeno tamanho, típicas de resistência quantitativa. Contudo, uma vez que Jalo EEP 558 é de origem andina e freqüentemente estes cultivares são incompatíveis em cruzamento com cultivares mesoamericanos, foram estudadas nos capítulos II e III alternativas para a transferência destes genes de resistência andinos para cultivares mesoamericanos, que são de maior interesse no mercado consumidor brasileiro. No capítulo II, foi testado o cultivar Milionário como ponte no cruzamento entre Jalo EEP 558 e o cultivar Rudá (grão carioca e origem mesoamericana). Milionário já havia sido citado como ponte em outros trabalhos, no entanto, os resultados aqui obtidos demonstraram que este cultivar não foi eficiente como ponte, apresentando incompatibilidade quando cruzado com Jalo EEP 558. Sendo assim, no capítulo III foram investigados cultivares alternativos a serem utilizados como ponte, no cruzamento entre Jalo EEP 558 e Rudá. Pela avaliação dos híbridos resultantes, os cultivares andinos Diacol Calima, AND 277 e Novo Jalo apresentaram plantas normais em cruzamento com o cultivar Rudá, o mesmo foi observado para os cultivares mesoamericanos CNF10, CNF261, Small White, KW765 e KW780 em cruzamento com cultivar Jalo EEP 558. Entretanto, o modelo atualmente aceito para explicar a herança da incompatibilidade não foi adequado para justificar os dados deste trabalho. Desta forma um novo modelo foi proposto com a presença de um terceiro gene de incompatibilidade. No último capítulo deste trabalho, foi investigada a herança quantitativa da resistência do cultivar Jalo EEP 558 à mancha-angular. Locos de herança quantitativa (QTL) foram identificados e mapeados. Marcadores moleculares ligados a genes de resistência à ferrugem e antracnose também foram mapeados e mostraram uma organização em “cluster”. Estes dados geram importantes implicações que devem ser consideradas em programas de melhoramento de feijoeiro que visam à obtenção de cultivares com resistência múltipla. O último capítulo deste trabalho foi submetido à revista Euphytica, portanto encontra-se formatado para tal. / Common bean angular leaf spot (ALS), caused by the fungus Phaeoisariopsis griseola, is distributed in all bean growing regions of the world. In Brazil, it is widely distributed affecting all cultivars presently recommended for cultivation. Yield losses are greater if the symptoms appear early during the growing season. They can range from 7 to 70% depending on the susceptibility of the cultivars used. Jalo EEP 558, frequently cited as resistant to ALS was evaluated. It was moderately resistant to eight out of 12 P. griseola isolates tested, presenting few and small sized pustules which characterize quantitative resistance. However, Jalo EEP 558 is an andean cultivar and these cultivars are often incompatible with those of mesoamerican origin. ‘Milionário’ was tested as a bridge cultivar in the cross between ‘Jalo EEP 558’ and ‘Rudá’ (mesoamerican with carioca type grain). ‘Milionário’ had already been mentioned as an effective bridge cultivar in other studies, however, our results demonstrate that this cultivar was not effective for the cross we tested. It presented incompatibility in the cross with Jalo EEP 558. Other cultivars were also tested as bridge cultivars. Andean cultivars Diacol Calima, AND 277 and Novo Jalo produced normal plants in crosses with ‘Rudá’. The same was observed for crosses involving mesoamerican cultivars CNF10, CNF261, Small xiiWhite, KW765 and KW780, and andean cultivar Jalo EEP 558. However, the present model proposed to explain the inheritance of incompatibility in crosses between andean and mesoamerican cultivars was not adequate to justify the results in our work. For this reason, we propose a new model involving a third incompatibility gene. In this work, we investigated the quantitative inheritance of ALS resistance present in ‘Jalo EEP 558’. Quantitative trait loci (QTLs) were identified and mapped. Molecular markers linked to resistance genes for rust and anthracnose were also mapped. The data showed that the disease resistance genes were organized in clusters. Our results have important implications and should be considered in bean breeding programs aimed to develop cultivars with multiple disease resistance.
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Morfogênese in vitro e transformação genética de laranja ‘Pêra’ [Citrus sinensis (L.) Osb.], mediada por Agrobacterium / Morphogenesis in vitro and genetic transformation of ‘Pêra’ orange [Citrus sinensis (L.) Osb.] mediated by Agrobacterium

Oliveira, Maria Luiza Peixoto de 26 February 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T14:57:17Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 287684 bytes, checksum: c5eb42af7676e85b16363c3edd753449 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T14:57:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 287684 bytes, checksum: c5eb42af7676e85b16363c3edd753449 (MD5) Previous issue date: 2004-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A transformação genética está se tornando, cada vez mais, uma ferramenta importante em programas de melhoramento genético de diversas espécies, sendo uma alternativa para a incorporação de gene(s) exógeno(s) no genoma da planta, modificando características de interesse. Para citros, essa ferramenta permite romper barreiras naturais dessa espécie, visto que o desenvolvimento de novas variedades pelo melhoramento convencional possui uma série de limitações impostas pela sua biologia reprodutiva. Entretanto, os protocolos de transformação genética requerem, primariamente, o estabelecimento de um eficiente sistema de morfogênese in vitro para que o sucesso do método de transformação seja alcançado. Portanto, o objetivo deste trabalho foi o estabelecimento das melhores condições de cultivo in vitro para a organogênese e a posterior adequação de uma metodologia eficiente de transformação genética para a variedade de laranja-doce [Citrus sinensis (L.) Osb.] ‘Pêra’. Na avaliação das melhores condições da organogênese in vitro, segmentos de epicótilos foram introduzidos em meio de cultura MT contendo diferentes concentrações de BAP. A concentração de 1,0 mg L -1 de BAP utilizada na fase de indução de brotações assegurou as melhores freqüências de organogênese. Foram também estudados fatores que possam influenciar o processo de transformação genética de citros via Agrobacterium tumefaciens, utilizando epicótilos de laranja ‘Pêra’ como fonte de explante. Os fatores testados foram: tempo de inoculação com Agrobacterium, o período de co-cultivo e a presença de auxina no meio de pré-cultivo. O protocolo otimizado para a transformação genética de laranja ‘Pêra’ foi a imersão do explante em uma solução contendo Agrobacterium, por um tempo de 5 minutos, seguido de um período de co-cultivo de 2 dias em meio de cultura contendo 100 μM de acetoseringona e transferidos para o meio de seleção, constituído do meio MT e ainda de 75 mg L -1 de canamicina, 500 mg L -1 de Timetin ® e 1 mg L -1 de BAP. / Genetic transformation is a technique whose importance is increasing as an important tool for breeding programs of several species, being a reliable alternative for introducing characteristics of interest. For citrus, this tool helps to overcome natural reproductive barriers, the obtention of new cultivars by conventional breeding methods has several constraints, mainly linked to its reproductive biology. However, genetic transformation protocols demand, primarily, the establishment of efficient regeneration systems, in order to guarantee the success of transformation method. The objective of the present work was to establish promotive conditions for a reliable in vitro regeneration system from epicotyl explants, and further adequate an efficient and reproducinle transformation methodology for a sweet orange variety [Citrus sinensis L. (Osb.) ‘Pêra’]. For organogenesis, epicotyl explants were cultured onto a MT medium containing different BAP concentrations. For induction phase, 1.0 mg L -1 BAP enabled higher regeneration frequencies of adventitious shoots. Also, factors affecting Agrobacterium-mediated transformation efficiency were tested, as follows: incubation period with bacteria, co-culture period, and the presence of auxin in the pre-culture step. The following conditions generated and optimized protocol for ‘Pêra’ transformation: immersion for 5 minutes of the explants in a diluted Agrobacterium suspension; a 2-days co-culture period in a 100 μM acetoseryngone-supplemented medium; transfer for a selective regeneration MT-based medium, supplemented with 1.0 mg L -1 BAP, 75 mg L -1 kanamycin, and 500 mg L -1 Timentin ® .

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