Submitted by Geandra Rodrigues (geandrar@gmail.com) on 2018-03-19T18:11:37Z No. of bitstreams: 1 danieleliasferreirabarbosa.pdf: 2623086 bytes, checksum: 9c30260d3a86fc41b642599a5f607b4b (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2018-03-19T19:52:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 danieleliasferreirabarbosa.pdf: 2623086 bytes, checksum: 9c30260d3a86fc41b642599a5f607b4b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-19T19:52:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 danieleliasferreirabarbosa.pdf: 2623086 bytes, checksum: 9c30260d3a86fc41b642599a5f607b4b (MD5) Previous issue date: 2012-11-10 / A heterogeneidade vegetacional é um dos fatores responsáveis pela alta biodiversidade encontrada na Floresta Atlântica, com destaque para a Floresta Estacional Semidecidual (FES) que, embora apresente elevada riqueza e endemismo, é menos conhecida do que outras formações deste Bioma como as Florestas Ombrófilas. Esta formação é uma das mais degradadas devido, sobretudo, a ocupações urbanas na Região Sudeste do Brasil. Atualmente, em Minas Gerais é representada principalmente por remanescentes de florestas secundárias, destacando-se, no complexo da Mantiqueira, a Serra do Ibitipoca que devido a sua importância biológica figura entre as áreas prioritárias para a conservação da flora no estado e, mesmo assim, vem sofrendo com a fragmentação e destruição de habitats. A fragmentação de habitats é uma das maiores ameaças a biodiversidade, afetando particularmente a comunidade epifítica. Outro importante fator na composição desta comunidade é o gradiente altitudinal que disponibiliza elevada heterogeneidade ambiental mesmo em pequenas distâncias. Epífitas são um importante componente para a diversidade das florestas tropicais devido ao elevado número de espécies, além de apresentar importante função ecológica. O estudo foi realizado em cinco fragmentos de FES com extensões entre ca. 2 e 8 ha e altitudes variando entre 1230 e 1430 m.s.m. na Serra do Ibitipoca, Minas Gerais entre setembro de 2013 e dezembro de 2016. Os resultados são apresentados em dois capítulos. O primeiro capítulo teve como objetivos realizar o levantamento da comunidade de epífitas vasculares e avaliar a importância da heterogeneidade de habitats na riqueza e composição de espécies. Foram registradas 96 espécies de epífitas vasculares distribuídas em 40 gêneros sendo Peperomia Ruíz e Pav. o mais rico (oito spp.) e 10 famílias das quais, Orchidaceae é a mais rica (30 spp.). As samambaias apresentaram riqueza de espécies acima do esperado, provavelmente em função da elevada altitude na área de estudo. O estudo apresentou a maior riqueza registrada até o momento para FES ressaltando a importância da manutenção de xi fragmentos com diferentes estruturas para a comunidade epifítica. O segundo capítulo avaliou a diversidade da comunidade de epífitas vasculares e a correlação da riqueza de espécies com a altitude e tamanho dos fragmentos, além de porte dos forófitos. Para isso foram amostrados em cada um dos fragmentos os 60 maiores forófitos contendo ao menos uma planta epífita. Foram calculados para cada fragmento os índices de diversidade de Shannon (H’) e de uniformidade de Pielou (J), além dos índices de distinção taxonômica média (Δ+) e variação na distinção taxonômica (Λ+). Uma análise de regressão linear simples foi realizada com o intuito de verificar uma possível correlação entre altitude, área e riqueza. Foram amostrados 300 forófitos com 1270 ocorrências de epífitas, distribuídas em 85 espécies. O número de espécies não apresentou correlação positiva com o tamanho da área indicando que os fragmentos tiveram históricos de perturbação distintos, fato corroborado pela similaridade encontrada estar abaixo do esperado. Os fragmentos mais próximos e com maior riqueza apresentaram os maiores valores de H’ e Δ+ demonstrando melhor estado de conservação dentre os fragmentos analisados. Embora não tenha havido correlação significativa entre altitude e riqueza (p>0,05) ficou evidente a influência da altitude na composição da comunidade com sete espécies ocorrendo até 1230 m e 13 apenas acima de 1380 m. / The vegetation heterogeneity is one feature responsible for the high biodiversity found in Atlantic forest, especially for the Seasonal Semidecidual Forest (SSF), which, despite high richness and endemism, is less known than other physiognomies like the rainforests. This phytophysiognomy is one of the most affected due to, especially the urban occupation in the Southeastern Region of Brazil. Currently in Minas Gerais, this physiognomy is represented especially by remnants of secondary forests. In this sense, we must highlight that the Serra do Ibitipoca, due to its biological importance, appears among the priority areas for conservation of the flora in this state, and nevertheless, is suffering with fragmentation and destruction of habitats. Fragmentation of habitats greatly threatens the biodiversity, affecting especially the epiphytic community. Other important feature in the composition of this community is the elevation gradient which provides high habitat heterogeneity even at short distances. Epiphytes are an important component for diversity of the tropical forests due to its high number of species, also presenting relevant ecological function. We studied five fragments with sizes varying between 2 and 8 ha and altitudes varying between 1230 and 1430 m.s.m. in the Serra da Mantiqueira, Minas Gerais between September 2013 and December 2016. Results are presented in two chapters. The aims of the first chapter were to realize the survey of vascular epiphytic community and evaluate the importance of the habitat heterogeneity to the richness and composition of species. We recorded 96 species of vascular epiphytes distributed in 40 genera of which Peperomia was the richest (eight spp.) and 10 families, of which Orchidaceae was the richest (30 spp.). The ferns presented richness higher than expected, probably due to the high altitude of the studied area. This study presented the highest richness to date know for SSF, highlighting the importance of maintenance of fragments with distinct structures for the epiphytic community. In the second chapter we evaluated the diversity of the community of vascular epiphytes and the correlation of species xiii richness with altitude and fragment size, besides phorophytes sizes. In each fragment we evaluated 60 largest phorophytes with at least one epiphyte. We calculated for each fragment the indices of diversity of Shannon (H‟) and equability of Pielou (J), besides the indices of taxonomic distinction (Δ+) and variation in taxonomic distinction (Λ+). An analysis of linear regression was conducted in order to verify correlation between altitude, area size and richness of species. We sampled 300 phorophytes with 1270 occurrences of epiphytes, distributed in 85 species. The number of species did not correlate with the size of the fragments pointing to a distinct history of disturbance, a feature confirmed by the relatively low indices of similarity. The closest and richest fragments presented the highest values of H‟ and Δ+ showing the best conservation status among the analyzed fragments. Although we did not find significant correlation between altitude and richness (p>0.05) it was clear the influence of the elevation in the composition of the community once seven species occur up to 1230m.s.m. and 13 were present only above the 1380m.s.m.

Orientador: Marlies Sazima / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-23T01:09:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bugoni_Jeferson_M.pdf: 1779584 bytes, checksum: 28e75bbf88520708b08ce2dffeb7b431 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Neutralidade, complementaridade nos fenótipos das espécies e restrições filogenéticas são alguns dos principais determinantes da estrutura das redes de interações entre espécies. Embora diversos padrões estruturais das redes tenham sido descritos, a importância relativa dos mecanismos que os geram permanece em discussão. Neste estudo, investigamos a importância relativa da abundância (neutralidade) e da complementaridade fenológica e morfológica (interações permitidas ou proibidas) na estruturação de uma rede de interações planta-beija-flor na Floresta Atlântica (SE Brasil). Encontramos que fenologia e morfologia juntas compõem o modelo que melhor prediz a frequência de interações entre pares de espécies, entretanto os modelos não foram capazes de predizer acuradamente a maioria das métricas agregadoras de redes (aninhamento, conectância, equitabilidade e assimetria na força de interação). Em contraste com os estudos prévios, nossos resultados mostram que a importância das interações proibidas pode sobrepujar a importância da abundância na determinação de quais interações ocorrem na comunidade. Os estudos prévios podem ter subestimado a importância das interações proibidas em detrimento das abundâncias relativas (neutralidade) devido à insuficiência amostral. Adicionalmente, discutimos que as métricas de redes, ainda que sejam úteis para descrever padrões de interações em comunidades, podem ser pouco informativas sobre os mecanismos geradores da estrutura das redes de interações / Abstract: Neutrality and complementarity in the phenotypes of species as well as phylogenetic constraints are the main determinants of the structure of interaction networks. Although several structural patterns of the networks have been described, the relative importance of the mechanisms that generate them remains under discussion. In this study, we investigated the relative importance of abundance (neutrality) and phenological and morphological complementarity (forbidden links) in the structure of a plant-hummingbird network in the Atlantic Forest (SE Brazil). We found that the combination of phenological and morphological matches of interacting species represents the best model that predicts the frequency of interactions between pairs of species. Nevertheless, models were not able to accurately predict most of the network metrics - nestedness, connectance, and interaction evenness and interaction asymmetry. In contrast to previous studies, our results highlight the importance of forbidden links that may overcome the importance of relative abundances (neutrality) in the structure of the interactions at the community level. Previous studies could have underestimated the importance of complementarity in the species phenotypes due to insufficient sampling effort, while neutrality was likely overestimated. Finally, although network metrics have been useful for describing network structures, we argue that these metrics can tell us little about the mechanisms that generate the structure of networks / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientadores: Carlos Roberto Espindola, Raquel Maria de Oliveira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Geociências / Made available in DSpace on 2018-08-19T20:03:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_Renatados_M.pdf: 6198017 bytes, checksum: 5aa39ecf5f645aa9039abd03fc2501d2 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: A Floresta Atlântica do sudeste da Bahia apresenta uma das maiores riquezas de espécies arbóreas por área do planeta, com uma significativa porcentagem endêmica. Essas espécies encontram-se altamente ameaçadas pelos elevados índices de desmatamento, fragmentação de habitat e corte seletivo decorrente na região. As Unidades de Conservação têm , dentre suas metas, proteger esses remanescentes florestais. O objetivo deste estudo foi avaliar a relevância da rede de Unidades de Conservação (UCs) no sudeste da Bahia na proteção das espécies dos remanescentes da Mata Atlântica desta região a partir da análise de ocorrência de 10 (dez) espécies arbóreas ameaçadas de extinção. Fez-se o uso de geotecnologias como os programas Arc Gis 9.2 e DIVA GIS 7.2 para elaboração dos mapas de ocorrências das espécies arbóreas e das Unidades de Conservação e da distribuição potencial das espécies arbóreas. As 10 (dez) espécies selecionadas são endêmicas da Mata Atlântica do sudeste da Bahia e com alto grau de ameaça, integrando a Lista Vermelha da IUCN e do Ministério do Meio Ambiente. O levantamento de dados e de registro de ocorrência das espécies contou com o banco de dados oriundo da CEPEC, compilação de listas de espécies de artigos e de plano de manejo de UCs, mais a realização de trabalhos de campo, tendo sido realizado também um levantamento de dados sobre as UCs encontradas na região. Os mapas de ocorrência das dez espécies arbóreas foram sobrepostos com os mapas das UCs, possibilitando verificar os registros de ocorrência de todas as espécies arbóreas. Para que as UCs possam cumprir todos os seus objetivos, políticas mais eficazes devem ser adotadas, bem como a participação mais direta de órgãos fiscalizadores na elaboração e aplicação dos seus Planos de Manejo, os quais devem ser mais efetivos, garantindo a conservação das espécies arbóreas, bem como de todo a gama de recursos naturais encontrados dentro dos limites das UCs. A distribuição potencial demonstrou áreas com maior probabilidade de ocorrência das espécies, onde deverão ser realizados outros estudos que possam fortalecer a indicação destas áreas para o estabelecimento e/ou ampliação ou de novas UCs / Abstract; The Atlantic Forest of Southeast of Bahia presents one of the greatest resources of tree species per area of the planet, with a significant endemic percentage. Those species are very threatened by the high rates of deforestation, habitat fragmentation, and selective logging in the region. The Conservation Units among other aims protect those forest remnants. The objective of this study was to evaluate the network relevance of Conservation Units (CUs) present in the southeast of Bahia for the species protection of Atlantic Forest remnants of this region from the analysis of occurrence of 10 species threatened by extinction. The use of geotechnologies was made as the programs Arc Gis 9.2 and DIVA GIS 7.2 to elaborate occurrence maps of tree species, the Conservation Units, and the potential distribution of tree species. About the selected species, 10 (ten) are endemics of Atlantic Forest from southeast of Bahia and with a high level of threats integrating the IUCN Red List and the Ministry of Environment. The data collection and record of the occurrence of the species counted with database of CEPEC, compilation of species lists of paper and management plan of CUs but studies in field. A collection data was also accomplished about CUs that were found in the region. The occurrence maps of the ten tree species were superimposed with maps of CUs, making possible to check the records of the occurrence of tree species. For CUs can meet all goals, more efficient policies must be adopted as the more direct participation of enforcement organs in the preparation and application of Management Plan, which must be effective ensuring the conservation of the tree species as well as all the range of natural resources found within the limits of CUs. The potential distribution has shown areas with more probability of species occurrence, where it must be accomplished other studies that can reinforce the indication of these areas to establish an expansion, and/or new Cus / Mestrado / Análise Ambiental e Dinâmica Territorial / Mestre em Geografia

Orientadore: Andre Victor Lucci Freitas / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-14T10:59:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Uehara-Prado_Marcio_D.pdf: 1891833 bytes, checksum: 07fcfb4d89fca542db5456806263add0 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: No presente estudo, foram examinadas respostas de artrópodes a diferentes tipos de perturbação antrópica, com o intuito de selecionar e testar indicadores ecológicos. Para tal, dez grupos de artrópodes terrestres foram selecionados e amostrados em uma reserva de Floresta Atlântica com duas áreas com histórico contrastante de perturbação: uma com corte seletivo ('conservada') e outra com corte raso e queimada ('perturbada'). A abundância de espécies exóticas foi maior na área perturbada, padrão que aparentemente é um bom indicador de perturbação antrópica. Não houve correlação significativa da riqueza de espécies entre nenhum dos taxa selecionados. Por outro lado, a composição de espécies discriminou claramente a área perturbada da conservada, e foi significativamente correlacionada entre maior parte dos grupos. A composição de espécies de borboletas frugívoras e besouros epigéicos foram os melhores indicadores de perturbação, discriminando ambas as áreas mesmo com baixa resolução taxonômica e atuando como representantes de outros grupos de artrópodes. Para poder validar os resultados encontrados na primeira etapa, foram amostradas outras duas reservas de Floresta Atlântica com diferentes tipos de perturbação antrópica, com o objetivo de se verificar se existem respostas consistentes para três diferentes fontes de perturbação. Uma vez que se mostraram boas indicadoras de perturbação, borboletas frugívoras foram escolhidas como grupo focal. Mudanças na composição de espécies, abundância total e representatividade de três subfamílias (Brassolinae, Charaxinae e Satyrinae) foram consistentes nas áreas de estudo com diferentes tipos e graus de contraste de perturbação. Os resultados indicam que borboletas frugívoras podem ser prontamente aplicadas como indicadoras de perturbação antrópica em Floresta Atlântica. Por outro lado, os efeitos de perturbações na fauna do Cerrado ainda são pouco conhecidos. No terceiro estudo, a abundância de ordens e guildas tróficas de artrópodes epigéicos foi comparada entre áreas de uma reserva de Cerrado com diferentes frequências de queima: frequente (HighFi), intermediária (MidFi) e infrequente (LowFi). Nenhuma das ordens ou guildas tróficas analisadas apresentou maior abundância na LowFi, sendo mais abundantes na HighFi ou MidFi, ou não apresentando diferença entre as frequencias de queima. Os resultados indicam que alguns grupos de artrópodes podem não apenas ser resilientes aos efeitos do fogo, mas de fato se beneficiar dele. Os resultados encontrados devem ser considerados uma primeira abordagem a partir da qual estudos mais detalhados devem ser feitos. De acordo com os resultados, Collembola e formigas são grupos focais promissores para estudos exploratórios adicionais com o intuito de verificar suas propriedades indicadoras na escala de espécie, uma vez que são abundantes nas amostras e, no caso das formigas, relativamente bem conhecidas no Cerrado. Os resultados do presente trabalho reafirmam o potencial de artrópodes como indicadores ecológicos em diferentes biomas, e apontam as direções a ser tomadas em futuros estudos nesta área. / Abstract: In this study, the responses of terrestrial arthropods to different types of anthropogenic disturbance were examined, aiming to select and test ecological indicators. Ten groups of terrestrial arthropods were selected and sampled in an Atlantic Forest reserve with two sites with contrasting histories of disturbance, one with history of selective logging (preserved) and another with history of slash-and-burn (disturbed). The abundance of exotic species was higher in the disturbed area, and this pattern seems to be an adequate indicator of anthropogenic disturbance. Species richness was not significantly correlated between any pair of taxa. In contrast, species composition was significantly correlated among most groups, and clearly discriminates the disturbed from the undisturbed site. The composition of fruit-feeding butterflies and epigaeic Coleoptera were the best indicators in this study, discriminating between the disturbed and the undisturbed sites even in higher taxonomic categories, and acting as surrogates of the remaining arthropod groups. To validate the above findings, two additional Atlantic Forest reserves with different kinds of anthropogenic disturbance were sampled, aiming to find consistent responses to the three sources of disturbance. Fruit-feeding butterflies were used as focal group due to its usefulness as ecological indicators in the first study. Shifts in the species composition, abundance and proportion of three subfamilies (Brassolinae, Charaxinae and Satyrinae) were found to be consistent in our three study areas with different disturbance types and degrees. Results indicate that fruit-feeding butterflies may be promptly employed as disturbance indicators in the Atlantic Forest. On the other hand, disturbance effects on the fauna of the Brazilian Cerrado are still poorly understood. In the third study, the abundance of epigaeic arthropod orders and trophic guilds was assessed in cerrado sites subjected to three burning frequencies: frequent (HighFi), intermediary (MidFi) and infrequent (LowFi). None of the orders or trophic guilds analyzed had higher abundance in the LowFi, being either more abundant in the HighFi or MidFi, or did not differ among the burning frequencies. Results indicate that some arthropod groups may not only be resilient to fire effect, but actually benefit from fire effect in cerrado. Based on the results, springtails (Collembola) and ants (Hymenoptera, Formicidae) seem to be particularly appropriate focal groups for further exploratory studies at species level aiming to verify their indicator properties, since they are abundant in samples and, in the case of ants, relatively well known in the Cerrado. To sum up, the present study supports the potential of using arthropods as ecological indicators in different biomes, showing new directions to future research. / Doutorado / Doutor em Ecologia

Orientador: Carlos Alfredo Joly / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-26T15:29:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Padgurschi_MairadeCamposGorgulho_D.pdf: 2203233 bytes, checksum: 061495425cb80606c109e3a4acbfa7a5 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Os sistemas tropicais megadiversos são alvo de estudos ecológicos que tentam explicar os padrões de diversidade, densidade e distribuição espacial das espécies. O padrão espacial representa a síntese dos processos ecológicos que atuam em diferentes escalas, e as teorias neutra, de nicho e da dependência negativa de densidade (NDD) buscam predizer tal padrão das espécies, que pode ser agregado, regular ou aleatório. Essas teorias estão bem descritas para as árvores, mas negligenciam outras formas de vida como os bambus. Características da sua história de vida, como a floração monocárpica e o rizoma bem desenvolvido, podem agir na determinação do padrão espacial dos bambus. As densas moitas dão origem a centenas de sementes que, sem adorno para dispersão, caem próximas aos parentais e germinam rapidamente. A germinação pode ser favorecida pela entrada de luz nas clareiras abertas pela morte parental após a reprodução (monocárpica), resultando em alta densidade local de coespecíficos, que pode ser influenciada pela NDD. O objetivo da tese foi avaliar a distribuição espacial local de espécies nativas de bambu e propor um modelo para a dinâmica do grupo neotropical. Foram utilizadas três espécies endêmicas da Mata Atlântica classificadas de acordo com seu tamanho (em 1, 2, 3) relativo ao último evento reprodutivo local da respectiva espécie. Assim, a espécie cujo evento reprodutivo é o mais recente apresenta o menor tamanho (1). Quando foi possível obter dados das sementes, estas foram representadas pelo número zero. Foram registrados os dados da posição espacial da parcela, densidade de indivíduos e variáveis ambientais para todas as classes de tamanho. A Análise Espacial baseada em Índices de Distância (SADIE) foi utilizada para analisar o padrão espacial individual de cada tamanho e as covariações espaciais entre os diferentes tamanhos. A ferramenta SEVM foi utilizada na determinação dos modelos. A associação espacial entre os tamanhos 1 e 3 e a agregação dos indivíduos de tamanho 0 indicam que a limitação por dispersão pode determinar o recrutamento inicial. Por outro lado, a ausência de estrutura espacial nos demais tamanhos e a dissociação espacial entre o tamanho 0 e 2 indicam que a NDD é importante na determinação da distribuição espacial dos bambus nas maiores classes de tamanho. Contudo, independentemente do tamanho, todas as populações ocorrem associadas às variáveis ambientais, embora tais variáveis sejam distintas entre os tamanhos. Isto pode indicar uma mudança de preferência de habitat ao longo das fases de desenvolvimento, como já registrado para diferentes espécies arbóreas tropicais. A distribuição espacial dos bambus na Mata Atlântica é influenciada pela limitação de dispersão das sementes e mecanismos NDD que agem de maneira a reforçar as associações das espécies com o habitat / Abstract: The mega-diverse tropical systems are the subject of ecological studies that attempt to explain the patterns of diversity, density and spatial distribution of species. The spatial pattern represents the synthesis of ecological processes operating at different scales. The neutral, niche and negative density dependence (NDD) theories seek to predict such a pattern of the species, which can be aggregated, regular or random. These theories are well tested for the trees, but neglect other forms of life such as bamboos. Characteristics of its life history, as the monocarpic flowering and well developed rhizome, may act in determining the spatial pattern of bamboo. The dense clumps give rise to hundreds of seeds that fall close to the parent, because they have no adornment for dispersion, and germinate quickly. Germination may be favoured by light entering the gaps, which was opened by parental death after reproductive event (monocarpic plants). This might lead to a high local density of conspecifics, which can be influenced by the NDD. The aim of the thesis was to evaluate the local spatial distribution of native bamboo species and propose a model for the dynamics of the Neotropical group. Three endemic species of the Atlantic Forest were studied and classified according to their size (1, 2, 3) and based on the last local reproductive event of the respective species. Thus, the species whose reproductive event is the latest shows the smaller size (1). When available, the seeds (represented by zero) were also recorded. The data of the spatial position of the plot, density of individuals and environmental variables for all size classes were recorded. The Spatial Analysis Based on Distance Indices (SADIE) was used to analyse the spatial pattern of each individual size and the spatial covariance between the different sizes. The SEVM tool was also used to determine the models. The spatial positive covariance between the sizes 1 and 3 and the aggregation of the size 0 indicates that limited seed dispersion may determine the initial recruitment. On the other hand, the NDD importance in determining the spatial distribution of bamboos in larger size classes is indicated by the absence of the spatial structure in the other sizes and the spatial decoupling of the size 0 and 2. However, regardless of size, all populations occur associated with environmental variables, although these variables are distinct between the sizes. This suggests a change in habitat preference over development phases, as recorded from different tropical tree species. The spatial distribution of bamboos in the Atlantic Forest is influenced by the limitation of seed dispersal and NDD mechanisms, which act in order to strengthen the associations of species habitat / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutora em Biologia Vegetal

Este trabalho encontra-se focado nas populações de preguiça comum da Mata Atlântica brasileira, em seus níveis de diversidade genética e sua estruturação populacional. O refinamento dos padrões de diversidade genética destas populações, e a procura dos processos que estariam na sua origem, levaram a que neste trabalho se incluíssem contribuições para o conhecimento do habitat e da espécie. Para tal, utilizaram-se ferramentas não de genética, biogeografia, etologia e ecologia, numa perspectiva integrativa e comparativa. Inicialmente, a simplicidade da distribuição da biodiversidade da Mata Atlântica foi contrariada, propondo-se nove componentes bióticos de vertebrados terrestres, estritamente florestais. Além disso, essa heterogeneidade foi encontrada a nível local e regional. Na sua base, estariam inúmeros e distintos processos climáticos, orográficos e biológicos, atuando de diferente modo em cada componente. O estudo genético das populações de preguiça comum da Mata Atlântica corroborou que estes processos gerais influenciaram também esta espécie, e que o estudo de fina-escala contribui para uma melhor definição dos processos históricos e demográficos que influem seus padrões de diversidade genética. Pela primeira vez foram inferidas a formação e a manutenção de sistemas de metapopulações na Mata Atlântica, através da análise dos padrões de diversidade genética e da demográfica da preguiça comum. Também pela primeira vez se realizou o estudo genético da preguiça anã, espécie criticamente ameaçada. Tal como esperado, sua única população apresentou baixos níveis de diversidade genética, com sinais de gargalo demográfico, mas não de endogamia. Finalmente, apesar da preguiça comum ser considerada não-ameaçada, este trabalho identifica a necessidade de medidas de conservação a nível populacional para a espécie. As populações Atlânticas carecem de medidas de conservação devido à sua diferenciação e isolamento em relação às populações Amazônicas, com presença de alelos únicos na Mata Atlântica; à estruturação populacional no bioma, com indícios de baixo fluxo gênico e elevados índices de endogamia dentro de cada uma das populações; aos baixos níveis de diversidade genética encontrados nas populações da Mata Atlântica (particularmente a diversidade genética da população do sul é menor do que a registrada em populações ameaçadas de preguiça de coleira e de preguiça anã); às evidências de requerimentos biológicos distintos dessas populações, pela percepção de épocas reprodutivas diferentes; e à forte influência antrópica, quer pelo impacto direto do desmatamento e aumento do contato com regiões urbanas. A redefinição das unidades de manejo anteriormente descritas, a proposta de utilização da preguiça comum como espécie bandeira em ações para a sua conservação, da Mata Atlântica e de outras espécies de preguiça e o forte incentivo à realização de mais estudos genéticos (com aumento de amostragem) e ecológicos constituem as medidas de conservação sugeridas para o futuro da preguiça comum na Mata Atlântica. / This work is focused on the Atlantic forest common sloth populations, their genetic diversity levels and structure. The refinement of these populations\' genetic diversity patterns and the investigation of the processes on their origin were the main goals. Thus contributions to the knowledge of the habitat and the species are included. Genetic, but also biogeographic, ecologic and ethologic tools were used, in an integrative and comparative perspective. Initially, the simplicity of the distribution of diversity patterns within the Atlantic forest was refuted by proposing nine biotic components of terrestrial forest-dependent vertebrates. Heterogeneity at local and regional level was found, and reported to be influenced by many different processes, climatic, orographic and biological, acting differently in each component. The genetic study of the Atlantic forest common sloth populations corroborated that these general processes have also influenced this species, and that the fine-scale study contributes to a better definition of the historical and demographic processes influencing it. The formation and maintenance of metapopulation systems within the Atlantic forest were inferred for the first time. The analyses of the common sloth patterns of genetic diversity and its historical demography contributed to this conclusion. This is also the first study on the genetic diversity of the pygmy sloth, a critically endangered species. As expected, its single population has low levels of genetic diversity and signs of bottleneck, although it seems not to be an inbred population. Finally, despite the common sloth being considered a least concerned species, this work identifies the need for conservation at the species\' population level. Atlantic forest populations require management measures due to: their differentiation and isolation from the Amazonian populations, with private alleles within Atlantic forest; the population structure within the biome, with evidences of low gene flow and high levels of inbreeding within each population; the low levels of genetic diversity found within these management units (particularly the genetic diversity of the southern population is inferior to that recorded in populations of the endangered maned sloth and pygmy sloth); the evidence of these populations\' distinct biological requirements, by the perception of different reproductive seasons; and the strong anthropogenic influence, either by the direct impact of deforestation, and the increased contact with urban areas. The redefinition of previously described management units, the proposal of the common sloth as a flagship species in conservation actions for the species itself, the Atlantic forest\'s and other sloth species\', and the recommonedation to increase genetic (with increased sampling) and ecological studies constitute the conservation measures suggested for the future of the common sloth populations within the Atlantic forest.

A bacia do rio Paraíba do Sul (sudeste do Brasil) está inserida no domínio da Floresta Atlântica, em altitudes que vão do nível do mar até 2797 metros. Há grande complexidade topográfica e climática, que resulta na presença de inúmeras fitofisionomias, como os Campos de altitude, Cerrado, Floresta Estacional Semidecidual e Florestas Ombrófilas Densa e Mista. Apesar da grande complexidade florestal, esta bacia ainda não foi objeto de estudos fitogeográficos. Análises das relações de similaridade florística entre comunidades arbóreas conduz em geral ao estabelecimento de padõres condicionados por fatores diversos que determinam a ocorrência das espécies. As florestas estacionais semideciduais da bacia do rio Paraíba do Sul mostram-se bastante fragmentadas e têm sido pouco estudadas do ponto de vista florístico e fitossociológico. O presente estudo objetivou conhecer e comparar a composição florística, a estrutura e os aspectos ecológicos do componente arbóreo de três fragmentos. Além disso, foram utilizadas análises de agrupamento e correspondência para estabelecer comparações florísticas com outras 31 áreas de Floresta Atlântica, 17 delas pertencentes à bacia do rio Paraíba do Sul (bacia do RPS). O fragmento maior (300 ha) situa-se no município de Areias e os dois menores (14 ha cada) em São José do Barreiro (22°41\'S; 44°3\'W), ambos no Estado de São Paulo. Para a amostragem, foram lançados 135 pontos quadrantes em cada um dos fragmentos, e incluídos os indivíduos com PAP≥ 15cm. Foram encontrados 1.620 indivíduos, 227 espécies, 138 gêneros e 51 famílias. As coletas extensivas acresceram 64 espécies, totalizando 290. As famílias Leguminosae, Myrtaceae, Rubiaceae, Lauraceae, Euphorbiaceae e Annonaceae apresentaram a maior riqueza de espécies. A riqueza de espécies variou entre 165 e 178, a partir da amostragem total, e os índices de diversidade variaram entre 3,88 e 4,4. Há 13 novos registros citados para o Estado de São Paulo (e.g. Casearia selloana, Mollinedia longifolia, Pseudolmedia hirtula), com a presença de cinco espécies ameaçadas (Dalbergia nigra, Melanoxylon brauna, Mollinedia glabra, Ocotea odorifera, Urbanodendron bahiense). Os fragmentos apresentam-se em estágio avançado de sucessão, com predomínio de zoocoria, o que demonstra sua importância ecológica para a manutenção da fauna. As análises florísticas e a composição de espécies indicaram que, apesar de seus caracteres de transição entre florestas estacionais semideciduais e ombrófilas densas, a flora arbórea 188 dos fragmentos tem laços mais fortes com as primeiras. As florestas estacionais semideciduais da bacia do RPS apresentaram maior semelhança com as de mesma fitofisionomia da bacia do rio Doce, sugerindo que ambas correspondam a um contínuo de distribuição. O maior aporte de umidade das bacias RPS e do rio Doce deve ser o principal fator responsável pela distribuição de diversas espécies de forma exclusiva entre as florestas estacionais destas bacias e as florestas ombrófilas. Sugeriu-se que as variáveis mais fortemente ligadas à diferenciação florística entre as florestas comparadas sejam a duração da estação seca (estacionalidade das chuvas), a precipitação total, a altitude e a proximidade espacial entre as áreas. A alta riqueza e o elevado número de espécies de ocorrência restrita ou pouco frequentes na Floresta Atlântica denotam a importância da conservação dos fragmentos de florestas estacionais desta região. Ressaltamos ainda que o Vale do Paraíba paulista não possui unidades de conservação de proteção integral que incluam remanescentes de Floresta Estacional Semidecidual, o que compromete seriamente a conservação de parte importante da biota que é exclusiva deste tipo florestal, como constatado neste estudo. / The Paraíba do Sul River Basin (southeastern Brazil) is inserted into the Atlantic Rain Forest domain, at elevations from sea leval to 2797 a.s.l.. Ample topografic and climatic complexity is evident, as a result of diverse phytophysionomies, such as the high mountain grassland and savana, as well as seasonal Semi-deciduous, Tropical Rain and Araucaria forests. In spite of evident forest complexity, this basin has not come under the scope of phytogeographical studies. Through an analysis of floristic similarity among tree communities, it is possible to detect species pattern occurrence, as well as to explain conditioning factors. The Seasonal Semi-deciduous Forest of the Vale do Paraíba river basin occurs in highly fragmented areas, and has received but little attention as to floristic and phytosociological factors. With this in mind, the aim was to characterize and compare pertinent aspects of floristic composition, structure and ecology. The study areas were compared with other forests in the Atlantic domain, 17 of which occurring in this basin (RPS basin). Attention was focused on three fragments, two of 14 ha and another of 300.. 135 quarter-centered-points were sampled in each 189 fragment, by considering trees with circumferences equal or wider than 15 cm. 1620 individuals, belonging to 227 species, 138 genera and 51 families, were recorded. 64 species were compounded by random collectioning, to a total of 290. Those families with the highest number of species were Leguminosae, Myrtaceae, Rubiaceae, Lauraceae, Euphorbiaceae and Annonaceae. The total number of species varied from 165 to 178, and Shannon diversity indexes from 3,88 to 4,4. 13 species were first-time- encounters in São Paulo state (e.g. Casearia selloana, Mollinedia longifolia, Pseudolmedia hirtula), and five threatened (Dalbergia nigra, Melanoxylon brauna, Mollinedia glabra, Ocotea odorifera, Urbanodendron bahiense). The fragments were in advanced stages of succession, with predominant zoochory, making their maintenance essential in regional fauna conservation. Through the analysis of floristic and species composition, there was every indication that, in spite of the transitional character between seasonal semi-deciduous and dense ombrophylous forests, there was a stronger link of tree-flora fragments with the former. There was greater similarity between the seasonal semi-deciduous forests of the Paraíba do Sul and those of the Doce river basins, thereby implying continuous distribution. Higher humidity could be the main factor inducing the exclusive distribution of many species among seasonal semi- deciduous forests of the Paraíba do Sul and Doce river basins, as well as dense ombrophylous forests. We suggest that variables, such as rainfall seasonality and volume, altitude and spatial proximity, are those that most strongly influence floristic differences. The richness and number of rare and restricted species emphasize the importance of preserving these regional fragments. In the Paraíba do Sul River Basin, there are no conservation units that include remnant semi-deciduous forest. This aspect seriously compromises the conservation of a unique biota, exclusive to this type of forest.

Esta tese compreende a revisão taxonômica, filogenia e morfologia do gênero Alcantarea (E. Morren ex Mez) Harms, bromeliáceas rupícolas endêmicas dos afloramentos rochosos do leste do Brasil. Apresenta-se inicialmente uma caracterização geral de Bromeliaceae, os objetivos e justificativas da tese, que segue estruturada em capítulos. O capítulo 1 apresenta a caracterização morfológica e a revisão do gênero baseada nos trabalhos de campo, de herbários e bibliografia. São apresentadas as descrições para as espécies, chave para identificação, ilustrações, mapa de distribuição e estado de conservação dos táxons. Entre os resultados desse capítulo destaca-se que são reconhecidas 26 espécies, sendo cinco novas e descritas pelo autor no decorrer do projeto (A. martinellii Versieux & Wand., A. patriae Versieux & Wand., A. tortuosa Versieux & Wand., A. trepida Versieux & Wand., A. turgida Versieux & Wand.), quatro novos sinônimos são apresentados (A. brasiliana (L.B. Sm.) J.R. Grant, A. edmundoi (Leme) J.R. Grant, A. lurida Leme, A. mucilaginosa Leme) e um neótipo é designado. Em quase sua totalidade os táxons estão individualmente ilustrados em detalhe e são também apresentadas pranchas fotográficas. Amplo material foi coletado e incorporado aos herbários e uma coleção-viva foi montada no Instituto de Botânica. Apesar de geralmente formarem grandes populações em locais de difícil acesso, seis táxons são considerados ameaçados de extinção em razão de áreas de ocorrência restritas e por perda do habitat e para seis espécies não foi possível determinar o estado de conservação em razão de insuficiência de dados. No capítulo 2 é apresentada a filogenia de Alcantarea baseada em caracteres moleculares. Foram empregados dois marcadores do cloroplasto (trnK-rps16, trnC-petN), um gene nuclear de baixa cópia (Floricaula/Leafy) e também 20 loci de microssatélites nucleares. Os resultados obtidos nas análises Bayesianas e de Parcimônia apontam para o bem suportado monofiletismo de Alcantarea. Nesta análise Alcantarea surge como grupo-irmão das espécies de Vriesea do leste do Brasil. Entre os marcadores, o Floricaula/Leafy apresenta os melhores resultados e se mostra com uma região potencial para outros estudos com Bromeliaceae. Os microssatélites delimitam grupos de espécies, com forte correspondência biogeográfica e também sugerem que a hibridização interespecífica seja um fenômeno freqüente em Alcantarea, sendo observados indivíduos de uma mesma espécie aparecendo proximamente relacionados a grupos díspares. No capítulo 3 é delimitado o complexo Alcantarea extensa com ocorrência predominante no Espírito Santo e ao leste de Minas Gerais, sendo esse complexo corroborado pelos dados dos microssatélites (cap. 2). São pelo menos 10 táxons que apresentam pouca variação na morfologia floral, vegetativa e proximidade geográfica entre as populações. Ainda neste capítulo é apresentada a ocorrência de viviparidade nos frutos de Alcantarea e uma nova espécie é descrita. No capítulo 4 é apresentada a caracterização morfo-anatômica foliar. Várias das características anatômicas observadas contribuem para a sobrevivência em ambientes xéricos (campo rupestre/inselbergs). Entre elas destacam-se a epiderme com paredes espessadas, abundante cobertura de ceras epicuticulares, hipoderme mecânica, parênquima aqüífero, parênquima esponjoso preenchendo canais de ar estreitos e estômatos restritos à face abaxial. Os dados obtidos nos capítulos 1, 2 e 4 serviram de base para decisão de manter Alcantarea como gênero distinto, independente de Vriesea. Os caracteres moleculares indicam que se trata de um grupo monofilético bem suportado e irmão de Vriesea s.s. O histórico taxonômico; a morfologia das pétalas longas, liguladas, espiraladas e efêmeras; as sementes bicomosas; a posição do ovário semi-ínfero também sustentam tal segregação. Em adição, os caracteres diagnósticos disponíveis para o caso da união de Alcantarea e Vrisea são inconsistente e baseados exclusivamente em simplesiomorfias. Sugere-se o potencial dos caracteres anatômicos tais como a extensão do parênquima aqüífero, o formato dos canais de ar, a extensão das projeções das fibras do feixe vascular, que conferem nervuras mais salientes, e a presença de nectários septais mais desenvolvidos como características adicionais, facilmente observáveis e que separam tais gêneros. / This thesis comprises the taxonomic revision, phylogeny, and morphology of the genus Alcantarea (E. Morren ex Mez) Harms, composed of rupiculous bromeliads endemic to eastern Brazil rock outcrops. An overall characterization of Bromeliaceae is presented initially then followed by the objectives and justification of the thesis, which is structured in chapters. Chapter 1 presents the morphological characterization and revision of the genus based in field, herbaria and bibliography. Species descriptions, identification key, map and taxa conservation statuses are presented. The highlight results of this chapter are that 26 species are recognized, five of them being new and described by the author during the project (A. martinellii Versieux & Wand., A. patriae Versieux & Wand., A. tortuosa Versieux & Wand., A. trepida Versieux & Wand., A. turgida Versieux & Wand.), four new synonyms are presented (A. brasiliana (L.B. Sm.) J.R. Grant, A. edmundoi (Leme) J.R. Grant, A. lurida Leme, A. mucilaginosa Leme), and one neotype is designated. Almost all taxa are illustrated in detail, and photographic plates are also presented. A large number of specimens were collected and incorporated in herbaria and a living-collection was built at the Instituto de Botânica. In spite of usually forming large populations in difficult to access places six taxa are threatened of extinction due to restricted occurrence areas and habitat loss. In addition, it was not possible to determine conservation statuses for six species due to data deficiency. In Chapter 2 the molecular phylogeny of Alcantarea is presented. Two chloroplast markers (trnK-rps16, trnC-petN), one low copy nuclear gene (Floricaula/Leafy), and also 20 nuclear microsatellites loci were employed. Results point to a well supported monophyly of Alcantarea, in both bayesian and parsimony analyses. In these analyses Alcantarea emerges as the sister genus of eastern Brazilian Vriesea. Floricaula/Leafy provides better resolution and is recommended for future studies within Bromeliaceae. Microsatellites delimit species groups with strong biogeographic correspondence and also suggest that hybridization is frequent , once individuals of the same species appear closely related to different species groups. In chapter 3, a species complex predominantly from Espírito Santo and eastern Minas Gerais States is delimited and named Alcantarea extensa complex and its status as a complex is supported by microsatellite analysis (Ch. 2). At least 10 taxa that show low floral and vegetative morphological variation and posses geographic proximity among populations are included in this complex. A new species and viviparous seeds in Alcantarea fruit are also described in this chapter. Leaf anatomical characterization for nine species of Alcantarea is presented in chapter 4. Several of the observed features contribute to the survival of Alcantarea in xeric environments (campo rupestre/inselbergs) as the thick-walled epidermis, abundant covering of epicuticular waxes, mechanic hypodermis, aquiferous parenchyma, narrow air-lacunae filled up with the spongy parenchyma, and stomata restricted to the abaxial surface. Data obtained in chapters 1, 2, and 4 provided evidence to keep Alcantarea as a distinct genus, independent from Vriesea. Molecular data indicate that it is a monophyletic and well supported group sister of Vriesea s.s. The taxonomic history; the morphological distinctiveness of the long, ligulate, spiraled and ephemeron petals; seeds with basal and apical appendages and semi-inferior ovary also support this segregation. In addition, diagnostic characters available for the recognition of Alcantarea and Vrisea united are inconsistent and based on sympleisiomorphies exclusively. It is also suggested that the anatomical features such as the extension of the aquiferous parenchyma, the shape of the air channels and the extensions of the fibers bundles that forms more salient nerves and the presence of more developed septal nectaries are additional useful features to separate both taxa.

A busca pela melhoria na qualidade de vida está diretamente relacionada com a manutenção da qualidade ambiental. Com esta afirmação, torna-se imprescindível o conhecimento dos resultados da ação humana sobre o ambiente natural. A ausência de estudos específicos que possibilitem a gestão e a manutenção de fragmentos florestais de Mata Atlântica, margeada pela área urbana do município de São Sebastião - SP, motivou a realização desta pesquisa, que tem o intuito de apresentar subsídios para a identificação da cobertura vegetal natural adequada a Zona de Amortecimento do Parque Estadual da Serra do Mar, considerando para tanto as diretrizes do Zoneamento Ecológico Econômico do Litoral Norte, do Plano Diretor Municipal e do Tombamento da Serra do Mar, apresentando ainda informações estatísticas sobre a ação humana neste bioma e suas tendências com base no banco de dados do Sistema de Administração Ambiental SAA, do Policiamento Ambiental, e na aerofotogrametria como ferramenta de interpretação e individualização desses espaços naturais. / The betterment on quality of life is directly related with the conservation from quality environmental. Like this, is indispensable the knowledge from the results of the human action a above environment natural. The necessity of studies specific what will allow the management and the maintenance of fractions forest bordering the urban area for the São Sebastião SP county, has caused the realization from this research, with the objective of introducing subsidies for identification from cover vegetable natural to establish areas adequate for border protection in the State Park (The Serra do Mar State Park is a Unit of Conservation from the Atlantic forest), with special attention on the parameters of the Zone Ecologic-Economic and on the guidelines from municipal planning. The area of tombamento da Serra do Mar (area with special protection on the Atlantic forest) established the base of limitation of the zoning, presenting again information statistics above the degradation in the vegetable covering and his tendencies based on the data bank of the Environmental Administration System EAS, from the Environmental Police, and on aerial photography like tool of interpretation and individualization of this areas naturals.

[pt] Esta Dissertação se ocupa de uma reflexão acerca das atividades agrícolas, desenvolvidas em uma área remanescente da Mata Atlântica, em tempos pretéritos. Através de levantamentos etnobotânicos, realizados através de entrevistas com 17 moradores do bairro de Vargem Grande, mensuramos a forma como o conhecimento advindo deste legado cultural encontra-se disperso entre os atuais agricultores e seus familiares. Analisamos o repertório de plantas cultivadas com finalidades medicinais e utilitárias através de levantamentos etnobotânicos. Este bairro está situado no Maciço da Pedra Branca, que abriga o Parque Estadual da Pedra Branca (PEPB). A criação do PEPB, através da lei estadual nº.2377, de 28 de junho de 1974, impôs progressivamente novas formas de uso e delimitação do espaço que entraram em choque com as práticas tradicionalmente estabelecidas por moradores. Visando o resgate e uma sistematização destes saberes, conhecimentos tradicionais que representam o legado humano na composição da paisagem, explicitaremos as formas como a população local identifica, utiliza e valoriza os recursos botânicos da área de estudo. As coletas botânicas se deram nos quintais dos moradores e/ou nos espaços de cultivo, de acordo com as informações dos participantes. Foram identificadas 221 espécies, 172 gêneros e 71 famílias botânicas das quais Lamiaceae e Asteraceae foram as que mais se sobressaíram e número de espécies. As categorias que se sobressaíram em número de espécies foram as medicinais (122); alimentares (71); ornamentais (34) em comparação com as condimentares (16), rituais (15), uso animal (5), usadas para construção (4) e cosméticas (1). A categoria medicinal foi analisada mais detalhadamente: nove espécies apresentaram valores de CUPc maior que 50% indicando uma alta concordância de uso principal destas. O grande número de espécies alimentares (cultivadas ou não localmente) bem como de medicinais reflete um resultado coerente com o a realidade do grupo social estudado: um grupo inserido em ambiente florestal relativamente distante de grandes centros comerciais / [en] This dissertation deals with a reflection on the agricultural activities carried out in a remnant of the Atlantic, in past times, and by considerations about the ethnobotanical surveys conducted through interviews with 17 residents of the neighborhood Vargem Grande, inferences about how knowledge gained from this cultural legacy is scattered among existing farmers and their families. We analyzed the repertoire of cultivated plants with medicinal purposes and utilitarian through ethnobotanical surveys. This neighborhood is located in the Pedra Branca, which houses the State Park of Pedra Branca (PEPB). The creation of PEPB by state law No .2377, dated 28 June 1974, gradually imposed new forms of use and definition of space that clashed with practices traditionally defined by residents. Seeking redemption and a systematization of this knowledge, traditional knowledge that represent the human legacy in the composition of the landscape, exploring the ways in which the local population identifies, uses and values the botanical resources of the study area. The botanical collections were found in the backyards of residents and / or areas of cultivation, according to information from participants. We identified 221 species, 172 genera and 71 botanical families including Asteraceae and Lamiaceae were the ones that stand out and number of species. The categories that stood out in number of species were medicinal (122), food (71), ornamental (34) compared with the condiments (16), ritual (15), animal use (5), used for construction (4 ) and cosmetic (1). The medical category was analyzed in more detail: nine species showed CUPc values greater than 50% indicating a high agreement of primary use of these. The large number of food species (locally grown or not) as well as medicinal reflects a result consistent with the the reality of the social group studied: one group entered in the forest environment relatively far from major shopping centers and large number of members performing proper agricultural practices said.