O Parque Estadual de Itapuã, RS, Brasil, é considerado um dos últimos refúgios da Mata Atlântica ainda preservados na região metropolitana de Porto Alegre, local escolhido para as coletas de bromélias. O objetivo deste trabalho foi realizar um levantamento da diversidade de bactérias, tanto endofíticas quanto daquelas presentes na água das cisternas de bromélias. Foram coletadas 38 amostras de folhas e 26 amostras de água das cisternas de sete espécies de bromélias em vários locais do Parque, no período de março de 2006 a maio de 2007. As amostras foram cultivadas após diluições seriadas em ágar para contagem. Os isolados foram identificados através da análise da morfologia colonial, celular, comportamento bioquímico e fisiológico. Das folhas foram isoladas 76 bactérias endofíticas e da água das cisternas 124 bactérias com predomínio dos gêneros Bacillus, Burkolderia, Staphylococcus e Streptomyces. As bactérias Gram positivas apresentaram um maior número de cepas produtoras de enzimas extracelulares comparadas às Gram negativas. As Gram positivas isoladas das folhas foram melhores produtoras de celulase, pectinase e lipase, enquanto que as isoladas da água de cisterna foram melhores produtoras para celulase, amilase e protease. Pôde se observar que a maioria das bactérias endofíticas isoladas das bromélias produz algum tipo de promotor de crescimento. Com exceção da fixação de nitrogênio, que foi detectada somente entre as bactérias Gram negativas, pode-se observar que a produção desses promotores está amplamente disseminada entre as bactérias endofíticas. A análise da biodiversidade foi realizada através do índice de Shannon-Weaver, onde foi encontrado nas folhas (H=3,070) e nas cisternas (H=3,449) evidenciando que as cisternas abrigam uma biodiversidade um pouco mais elevada em relação ao interior da planta. / The State Park of Itapuã, RS, Brazil, is considered one of the latest refuges of the Atlantic Forest still preserved in the metropolitan area of Porto Alegre, where seven bromeliads samples were colected. The objectives of this study were carry out a survey on the diversity of the endophytic bacteria and those present in the water tanks of bromeliads. Thirty eight samples of leaves and 26 samples of water from the water tanks of bromeliads were collected from many places of the Park, between the period of March, 2006 and May, 2007. Samples were cultivated in plate count agar after serial decimal dilutions. Bacteria were identified through analysis of their colonial and cellular morphology, physiological and biochemical characteristics. From leaves it was obtained 76 strains of endophytic bacteria and from water tanks it was obtained 124 strains, with the predominance of Bacillus, Burkolderia, Staphylococcus and Streptomyces genera. The Gram positive bacteria presented a great number of strains producing extra-cellular enzymes compared to Gram negative strains. The Gram positive strains isolated from the leaves were better in the production of cellulase, pectinase and lipase, and those isolated form water tanks were better in the production cellulase, amylase and protease. It was observed that the majority of the endophytic strains produce one kind of promoting growth. With the exception of fixing nitrogen, observed only with Gram negative strains, it was observed that the production of promoting growth substance is disseminated between endophytic bacteria. The analysis of biodiversity was carried out with the Shannon-Weaver index, that demonstrated (H=3.449) and (H=3.070). These results showed that there are a little higher biodiversity in the water tanks than in the leaves.

A produção de resíduos gerou uma problemática a ser abordada em nível de redução, reciclagem e reutilização de produtos. A técnica da compostagem é uma alternativa promissora para tratar resíduos sólidos orgânicos, bem como o lodo produzido nas estações de tratamento de esgotos. Os micro-organismos que promovem a degradação durante o processo de compostagem podem apresentar perfil de resistência a antimicrobianos e metais pesados, consequência da pressão seletiva de produtos químicos que estão misturados à matéria orgânica. Para avaliar o perfil de resistência a antimicrobianos, foram testadas 344 bactérias isoladas do processo de compostagem, utilizando-se 14 antimicrobianos. Para os ensaios de concentração inibitória mínima (CIM) de metais pesados, foram avaliados 91 isolados do início e final do processo, utilizando cromo, cobre, zinco e chumbo. Também foi avaliada a qualidade microbiológica do composto, segundo a Resolução 375/2006 do CONAMA. Os resultados apontaram para um perfil de 88% dos isolados resistentes a pelo menos um antimicrobiano. O antimicrobiano com maior índice de resistência foi a nitrofurantoína (64,82%), e o mais eficiente foi o imipenem, com apenas um isolado resistente. Das bactérias isoladas do início do processo de compostagem, 33,3% foram resistentes a MIC acima de 710 mg.L-1 de cromo, 38,9% foram resistentes ao mínimo de 1020 mg.L-1 de cobre, 91,7% resistentes ao zinco, e 100% resistentes ao chumbo. No final do processo, 41,8% dos isolados foram resistentes ao cromo, 41,8% ao cobre, 94,5% ao zinco e 96,4% ao chumbo. Escherichia coli apresentou NMP de 4x104 UFC/g-1, acima do limite preconizado pelo CONAMA. / With the production of residues comes the need for reduction, recycling and reuse of products. The composting technique is a promising alternative for the treatment of solid organic residues, along with the sludge produced in sewage treatment plants. The microorganisms that promote the degradation during the composting process might show antimicrobial and heavy metal resistance as a result of the selective pressure of chemical products mixed to the organic matter. The antimicrobial resistance profile was evaluated by testing 344 bacteria isolated from the composting process, using 14 antimicrobial agents. The minimum inhibitory concentration (MIC) for heavy metals was evaluated using 91 isolates from the initial and final stages of the process, using chrome, copper, zinc and lead. The microbial quality of the compound was also evaluated, according to the 375/2006 resolution from the Conselho Nacional do Meio Ambiente (CONAMA). The results showed that 88% of the isolates showed resistance to at least one antimicrobial. The antimicrobial nitrofurantoin showed the highest resistance rate (64.82%), and imipenem was the most efficient, as only one isolate showed resistance. Among the bacteria isolated during the initial stages of the composting process, 33.3% showed resistance to MIC over 710 mg.L-1 chrome, 38.9% showed resistance to a minimum of 1020 mg.L-1 copper, 91.7% were resistant to zinc, and 100% were resistant to lead. In the end of the process, 41.8% of the isolates showed resistance to chrome, 41.8% to copper, 94.5% to zinc and 96.4% to lead. Escherichia coli’s NMP was 4x104 UFC/g-1, above the limit recommended by CONAMA.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Saúde Animal, 2014. / Submitted by Guimaraes Jacqueline (jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-10-02T13:00:36Z No. of bitstreams: 1 2014_ManuellaRodriguesDeSouzaMello.pdf: 681269 bytes, checksum: 245580771537987e3030e85ea75ecfa7 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-10-02T13:01:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_ManuellaRodriguesDeSouzaMello.pdf: 681269 bytes, checksum: 245580771537987e3030e85ea75ecfa7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-02T13:01:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_ManuellaRodriguesDeSouzaMello.pdf: 681269 bytes, checksum: 245580771537987e3030e85ea75ecfa7 (MD5) / O recente aparecimento de bactérias produtoras de enzimas carbapenemases representa um problema de saúde pública relacionado com a ineficiência no tratamento de infecções nosocomiais. Além do aumento de isolados humanos, muitas pesquisas apontam o crescente número de bactérias multirresistentes não somente em ambientes hospitalares, mas também em isolados de animais, ambientes e afluentes. Entretanto, estudos direcionados para o potencial zoonótico ainda são limitados. O objetivo do presente estudo foi identificar cepas de Enterobacteriaceae e P. aeruginosa produtores de enzimas carbapenemases circulantes em ambientes veterinários. Foram isoladas 17 amostras provenientes de clínicas veterinárias e submetidas ao teste de difusão em disco com imipenem, ertapenem e meropenem. 11 cepas sugestivas da presença de carbapenemases, com halo ≤22 mm no antibiograma, foram submetidas ao Teste de Hodge Modificado. Todas as amostras foram negativas para o teste de Hodge Modificado. Apesar de não ter sido detectada fenotipicamente a expressão da enzima carbapenemase, a resistência aos carbapenêmicos pode estar relacionada a outro mecanismo de resistência adquirido. Portanto, considerando os crescentes relatos da disseminação de carbapenemases, em especial a KPC, o mapeamento das áreas onde bactérias multirresistentes estão presentes é vital para a elaboração de medidas de controle e manutenção da salubridade da população. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The recent emergence of bacteria producing carbapenemase enzyme represents a public health issue related to the inefficiency in the treatment of nosocomial infections. In addition to the increased human isolates, current studies indicate the increasing number of multidrug-resistant bacteria not only in hospital settings, but also present in isolates from animals, common areas and affluents. However, studies on the zoonotic potential are still limited. The aim of this study was to identify strains of Enterobacteriaceae and P. aeruginosa producing carbapenemase enzymes in veterinary environments. 17 samples from veterinary clinics were isolated and examined through the disk diffusion test with imipenem, meropenem and ertapenem. 11 strains suggesting of the presence of carbapenemase with halo ≤ 22 mm on antibiograma were submitted to the modified Hodge test. All samples were negative for the modified Hodge test. Despite the expression of carbapenemase enzyme has not been phenotypically detected, the carbapenem resistance may be related to another mechanism of acquired resistance. Therefore, considering the increasing reports of the spread of carbapenemases, especially KPC, the mapping of areas where multidrug-resistant bacteria are present is vital for the development of control measures and maintenance of the population health.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, 2013. / Texto parcialmente liberado pelo autor. Conteúdo restrito: Itens 3.4, 4.1, 4.2 e 4.3. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2013-05-15T10:49:00Z No. of bitstreams: 1 2013_FabiolaFernandesdosSantosCastro_Parcial.pdf: 6574803 bytes, checksum: 704abe7ea9a67b0a5cc45d5fb569ed9d (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-05-15T13:36:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_FabiolaFernandesdosSantosCastro_Parcial.pdf: 6574803 bytes, checksum: 704abe7ea9a67b0a5cc45d5fb569ed9d (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-15T13:36:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_FabiolaFernandesdosSantosCastro_Parcial.pdf: 6574803 bytes, checksum: 704abe7ea9a67b0a5cc45d5fb569ed9d (MD5) / O surgimento de bactérias resistentes pode ser observado desde a introdução na prática clínica, dos primeiros agentes antimicrobianos. Desde então, a rápida disseminação destes patógenos multirresistentes tem representado uma séria ameaça, considerando-se fatores como as altas taxas de mortalidade, a restrição de tratamentos e a alta prevalência de bactérias resistentes aos antimicrobianos no ambiente hospitalar. Até o momento, são considerados, pela comunidade científica internacional, patógenos multirresistentes causadores de infecções/colonizações relacionadas à assistência em saúde: Enterococcus spp resistente aos glicopeptídeos, Staphylococcus spp.resistente ou com sensibilidade intermediária a vancomicina, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumanii, e Enterobactérias resistentes a carbapenêmicos (ertapenem, meropenem ou imipenem), destacando-se entre estas a Klebsiella pneumoniae e as espécies de Enterobacter,spp. Os peptídeos antimicrobianos (PAM), são capazes de exercer uma atividade antimicrobiana potente contra diferentes e numerosos micro-organismos, além da grande vantagem de não apresentar nenhuma toxicidade às células animais, ou uma toxicidade extremamente baixa. Neste contexto, o estudo de peptídeos isolados da peçonha de artrópodes peçonhentos tem apresentado um grande potencial.Vespas sociais produzem peptídeos com atividade muito superior, até dezoito vezes maior, que espécies solitárias, os quais agem como barreira inicial contra a invasão microbiana das colônias. A peçonha de vespas sociais é constituída por uma variedade de compostos bioativos, com diversas ações farmacológicas, entre elas a antimicrobiana. Neste trabalho foi feita uma avaliação da atividade antimicrobiana de um novo peptídeo isolado da peçonha da vespa social Polybia dimorpha, em testes de inibição do crescimento bacteriano de cepas sensíveis e multirresitentes, gram negativas e gram positivas, por metodologia de disco difusão e microdiluição em caldo, comparando os resultados aos do desempenho de antimicrobianos convencionais utilizados na última linha de tratamento de infecções graves. Isolou-se um peptídeo de pequeno tamanho, de cadeia linear, que demonstrou potente atividade antimicrobiana contra bactérias gram positivas e gram negativas. O peptídeo descrito nesta pesquisa apresenta atividade contra bactérias padrão, conhecidamente sensíveis aos antibióticos comerciais, não portadoras de genes de resistência, e também sobre cepas multirresistentes, nestas últimas em concentrações inferiores a 1μg/mL. A capacidade de inibição do crescimento bacteriano foi maior e mais potente nas cepas com expressão de elaborados mecanismos de resistência. O estudo da peçonha de vespas tem proporcionado uma gama de novos compostos, com ações farmacológicas diferenciadas e que podem ser utilizados como fármacos modelo para o desenvolvimento de novos antimicrobianos. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The emerging of multi-drug resistant bacteria can be observed since the introduction of clinical practice of the first antimicrobial agents. Ever since, the rapid spread of these multi-drug resistant pathogens is representing a serious threat, considering factors such as high rates of mortality, treatment restrictions and high prevalence of multi-drug resistant bacteria into the hospital environment. Nowadays, the scientific community considers as multi-drug resistant, the pathogens which are able to cause infections/colonizations related to health assistance: glycopeptides resistant Enterococcus spp; vancomycin resistant or reduced susceptibility Staphylococcus spp; Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumanii and carbapenem-resistant enterobacterias (ertapenem, imipenem or meropenem), among those, highlighting Klebsiella pneumoniae and Enterobacter spp. The antimicrobial peptides (PAM) are capable of produce a powerful antimicrobial activity against different and various microorganisms, also presenting the great advantage of having no toxicity consequences to animal cells, or an extremely low toxicity. In this sense, the study of those peptides isolated from the venom of poisonous arthropods has shown a great potencial. Social wasps can produce peptides with a much higher superiority, up to eighteen times more, than lonely species, which act as an initial barrier against microbial invasion of the colonies. The venom of social wasps comprises a variety of bioactive compounds, with many pharmacologic actions, including antimicrobial. In this study, an evaluation of the antimicrobial activity of a new peptide isolated from the venom of the social wasp Polybia dimorpha was made, with bacterial inhibition of growth tests using strains of multi-drug resistant gram-negative and gram-positive bacteria, by disk-diffusion and microdilution methodology, comparing the results with the performance from conventional antimicrobial used in the last line treatment for severe infections. An small-sized, straight chained peptide was isolated, demonstrating a powerful antimicrobial activity against both gram-negative and gram-positive bacteria. The described peptide in this research represented activity against standard strains (noncarriers of multi-resistance genes), recognizably sensible against commercialized antimicrobials, and also against multi-drug resistant strains, at concentrations less than 1μg/mL. The bacterial growth inhibition capacity was greater and more powerful in the strains representing more elaborated resistance mechanism expression. The study of the wasps venom is providing a series of new compounds, with differentiated pharmacology actions which can be used as model drugs for the development of new antimicrobials.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, 2006. / Submitted by wesley oliveira leite (leite.wesley@yahoo.com.br) on 2009-11-09T22:31:57Z No. of bitstreams: 1 Dissert Julio Cesar de Oliveira Carneiro.pdf: 413516 bytes, checksum: 7aebbfcf0035e5aabc704e78d3aa3648 (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2010-07-13T12:00:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissert Julio Cesar de Oliveira Carneiro.pdf: 413516 bytes, checksum: 7aebbfcf0035e5aabc704e78d3aa3648 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-07-13T12:00:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissert Julio Cesar de Oliveira Carneiro.pdf: 413516 bytes, checksum: 7aebbfcf0035e5aabc704e78d3aa3648 (MD5) Previous issue date: 2006 / Introdução: A resistência das bactérias aos antibióticos é um problema de saúde pública emergente e de alcance mundial. A pressão seletiva do uso de antibacterianos é um fator predisponente, sobretudo se este uso for inadequado. A monitorização do consumo de antibacterianos é uma componente estratégica do controle da resistência bacteriana. Objetivos: O objetivo principal foi descrever o padrão de consumo de antibacterianos sistêmicos em termos quantitativos em uma Unidade de Tratamento Intensivo (UTI) e, secundariamente, correlacionar com a densidade de incidência de isolados bacterianos resistentes. Além disso, comparar o consumo de antibacterianos a partir de dados obtidos de forma agregada e individual. Método: Estudo descritivo ecológico realizado em uma UTI geral de um hospital regional da rede pública de Brasília, no período de 1999 a 2004. Para a quantificação do consumo de antibacterianos utilizou-se a classificação Anatômica Terapêutica e Química (ATC) e a unidade “dose diária definida” (DDD). Foram obtidos dados de uma amostra aleatória de 438 pacientes, estratificada por ano. Paralelamente, foram coletados dados do sistema de informação da farmácia hospitalar. Para avaliação da resistência bacteriana, selecionou-se 15 pares bactéria-antibacteriano. As densidades de incidência de consumo de antibacterianos e de isolados resistentes foram correlacionadas. Resultados: O padrão de consumo de antibacterianos obtido pelo estudo da amostra foi diferente daquele indicado pelos dados agregados da farmácia. Este fato evidenciou uma deficiência de qualidade do sistema de informações da farmácia. Na amostra, 73,1% dos pacientes utilizaram antibacterianos com a densidade de consumo de 1487,1 DDD por 1000 pacientes-dia (ou DDD1000). Os principais antibacterianos consumidos foram cefalosporinas de 3ª e 4ª geração (380 DDD1000), carbapenens (282,4 DDD1000), e glicopeptídeos (161,2 DDD1000). Entre os pares bactéria-antibacteriano avaliados, predominou a resistência de estafilococos à oxacilina e de P. aeruginosa a vários antibacterianos. Foi observada correlação positiva e epidemiologicamente importante entre o uso de carbapenens e a resistência de P.aeruginosa (r= 0,83 e p= 0,02). Conclusão: O estudo evidenciou um padrão elevado de consumo de cefalosporinas de 3ª e 4ª geração, carbapenens e glicopeptídeos. Além disso, mostrou um padrão alarmante de resistência bacteriana. Esses padrões indicam a necessidade de promover o uso racional de antimicrobianos. O estudo mostrou também a importância da monitorização do consumo de antibacterianos e da resistência bacteriana e, ainda, a utilidade do sistema ATC-DDD para padronização e comparações. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Introduction: The bacterial resistance is a global public health and emergent problem. The selective pressure of antibiotic use is a predisposing factor, specially if the use is inappropriate. The antibacterial consumption monitoring is a strategical element of bacterial resistance control program. Objectives: The principal aim was to quantify the antibacterial consumption pattern in an Intensive Care Unit (ICU). Furthermore, to estimate the association between this consumption and resistant bacteria rates and to compare the data obtained from the aggregated and individual form. Methods: Descriptive ecological study made in a medical-surgical ICU of a public regional hospital in Brasília, from 1999 to 2004. The Anatomical Therapeutical and Chemical (ATC) classification and the “Defined Daily Doses” (DDD) were used for the antibacterial consumption quantification. The data was obtained from the random samples of 438 pacients stratified by years. The data of pharmaceutical information system was collected parallel. Fifteen selected bacteria-antibacterial pairs were evaluated for resistance. The incidence density of antibacterial use and bacterial resistance were correlated. Results: The antibacterial use obtained from amostral study was different from the pharmaceutical information system. This fact demonstrated the quality deficit of pharmacy’s data. In the sample study, 73,1% pacients used antibacterial agents and the global use density was 1487, DDD for 1000 pacients-day (or DDD1000). Third and fourth generation cephalosporins (380 DDD1000), carbapenems (282,4 DDD1000), and glycopeptides (161,2 DDD1000) were the most used antibacterial agents. Among the bacteria-antibacterial pairs, staphylococcal resistance and multiresistant P. aeruginosa were the most important. Association was found between carbapenems use and carbapenems resistance P. aeruginosa (r= 0,83 e p= 0,02) and this was epidemiologically important. Conclusion: This study showed a higher consume of third and fourth generation cefalosporins, carbapenens and glicopeptídeos. Furthermore, demonstrated an allarming bacterial resistance pattern. These patterns indicate the necessity to improve prudence in the use of antimicrobial agents. The study showed the importance of monitoring antimicrobial use and bacterial resistance and the utility of ATC-DDD system for standartization and comparisons.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Departamento de Engenharia Civil e Ambiental, 2006. / Submitted by Mariana Fonseca Xavier Nunes (nanarteira@hotmail.com) on 2010-09-26T01:01:01Z No. of bitstreams: 1 2006-Renata S+ómia Sobral de Assis.pdf: 1331239 bytes, checksum: 3c2d5f512fe533406fcda31054d5f036 (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2010-10-08T02:20:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006-Renata S+ómia Sobral de Assis.pdf: 1331239 bytes, checksum: 3c2d5f512fe533406fcda31054d5f036 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-10-08T02:20:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006-Renata S+ómia Sobral de Assis.pdf: 1331239 bytes, checksum: 3c2d5f512fe533406fcda31054d5f036 (MD5) / A ocorrência de florações de cianobactérias é preocupante e tem se tornado mais freqüente em mananciais de abastecimento brasileiros. Espécies de cianobactérias tóxicas podem liberar toxinas para a água, oferecendo risco potencial para o homem e animais que tenham contato ou consumam essa água, podendo até levar à morte. Existem alguns estudos que comprovam a eficiência do processo de flotação por ar dissolvido (FAD) no tratamento de água com baixa turbidez e elevada concentração de algas. Porém, poucos são os estudos que avaliam especificamente a remoção de cianobactérias e cianotoxinas e que buscam conciliar a FAD com o conceito de coagulação melhorada. Nesse cenário, o presente trabalho teve como objetivo geral avaliar a aplicabilidade dos processos de coagulação convencional e de coagulação melhorada seguido de flotação na remoção de Microcystis aeruginosa (106 céls/mL) e de microcistinas (140 a 450 μg/L), utilizando dois coagulantes, sulfato de alumínio e cloreto férrico. Os experimentos foram desenvolvidos em escala de bancada utilizando o Floteste. O desempenho do sistema de tratamento como um todo (coagulação/floculação/flotação) foi avaliado a partir de dados de turbidez, clorofila-a, concentração de microcistinas, carbono orgânico dissolvido não purgável (CODNP) e residual do coagulante (alumínio e ferro). Os resultados sugerem que valores de pH de coagulação menores, em torno de 5, promovem uma melhor eficiência na remoção de turbidez, de clorofila-a e de microcistinas intracelular, independentemente do coagulante utilizado. Entretanto, a remoção de microcistinas extracelular (dissolvida) foi muito baixa em todas as condições de coagulação. Comparando o uso do sulfato de alumínio e do cloreto férrico, observou-se que ambos os coagulantes apresentaram vantagens. O sulfato de alumínio promoveu maior remoção de microcistinas intracelular e de CODNP, enquanto o cloreto férrico promoveu maior estabilidade no processo de flotação. __________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The occurrence of cyanobacterial blooms is a matter of concern and it has been more intense in Brazil. Toxic cyanobacterial species can release toxins to the water, which pose risk to humans and animals that have had contact or consumed this water, even leading to death. There are many studies that show that dissolved air flotation (DAF) is a very efficient process to treat waters with low turbidity values and high algae concentrations. However, very few of these studies have investigated the use of DAF to remove cyanobacteria and cyonotoxins and pursued to conciliate DAF with enhanced coagulation. In this scenario, the present work aimed to evaluate the use of conventional coagulation and enhanced coagulation followed by flotation to remove Microcystis aeruginosa (106cells/mL) and microcystins (150 a 450 μg/L). Two coagulants were evaluated, aluminum sulfate and ferric chloride. Bench scale experiments were carried out using a Flotest equipment. The performance of the treatment sequence (coagulation/flocculation/flotation) was evaluated by measuring turbidity, chlorophyll-a, microcystins concentration, nonpurgeable dissolved organic carbon (NPDOC) and coagulant residuals (aluminum and iron) in both raw and treated water. The results suggested that lower coagulation pH values, around 5, promote a higher removal efficiency of turbidity, chlorophyll-a and intra-cellular microcystins, independently of the coagulant used. Nevertheless, the removal efficiencies of extra-cellular microcystins were low. Comparing the use of aluminum sulfate and ferric chloride, it is identified that both coagulants have their advantages. The aluminum sulfate promoted a higher intra-cellular microcystins and NPCOD removal, as the ferric chloride promoted a more stable flotation process.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2011. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2011-09-08T11:16:12Z No. of bitstreams: 1 2011_LianaReisBlume.pdf: 943615 bytes, checksum: db4562d40ebfa0b2073bb525dd86fafb (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2011-09-08T11:16:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_LianaReisBlume.pdf: 943615 bytes, checksum: db4562d40ebfa0b2073bb525dd86fafb (MD5) / Made available in DSpace on 2011-09-08T11:16:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_LianaReisBlume.pdf: 943615 bytes, checksum: db4562d40ebfa0b2073bb525dd86fafb (MD5) / O uso de biomassa lignocelulósica como matéria-prima para a produção de etanol combustível se inicia pela intensa hidrólise de suas estruturas para a obtenção de açúcares fermentáveis. Neste contexto, o objetivo geral deste trabalho foi avaliar a produção de atividades enzimáticas celulolíticas e hemicelulolíticas de dois isolados da bactéria anaeróbica termófila Clostridium thermocellum (ISO1 e ISO2), quando cultivados em meio de cultura contendo celulose cristalina e bagaço de cana-de-açúcar, assim como, analisar o perfil de proteínas secretadas em cada uma destas condições, visando o mapeamento de proteínas envolvidas na degradação destas biomassas. O pH e temperatura ideais para o cultivo dos isolados são pH 7 e 60°C. Os isolados secretam atividade celulolítica, xilanolítica e pectinolítica quando cultivados em meio de cultura contendo celulose cristalina ou bagaço de cana de açúcar como única fonte de carbono. Estas atividades foram detectadas no sobrenadante do meio de cultura e também associadas ao substrato residual, sendo que o maior valor de atividade 0,478 UI/mL foi detectado para a atividade xilanolítica no sobrenadante de ISO2 cultivado em bagaço de cana. Além disso, os isolados foram capazes de degradar celulose cristalina com atividades de 0,052UI/mL e 0,040 UI/mL obtidas para as proteínas eluídas do substrato residual celulósico e proteínas secretadas no meio de cultura com bagaço de cana de ISO2, respectivamente. O perfil protéico do sobrenadante e proteínas associadas ao substrato residual foi analisado por eletroforese SDS-PAGE, no qual foi observada a presença de proteínas de 160 e 220kDa, com perfil semelhante ao celulossoma de um isolado de C. thermocellum utilizado como controle (Cth JW). Adicionalmente, os sobrenadantes das culturas foram utilizados como fonte de proteínas para as análises em géis bidimensionais, 2-DE, nos quais foram observadas diferenças no número e volume de spots entre as condições de crescimento, e na comparação dos isolados ISO1 e ISO 2 com o isolado padrão. A espectrometria de massas MALDI-TOF foi utilizada na identificação de proteínas do secretoma do ISO2 cultivado em celulose como fonte de carbono. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The use of lignocellulosic biomass as feedstock for bioethanol production begins with the intense hydrolysis of its structure to obtain fermentable sugars. The present work aims the evaluation of cellulolytic and hemicellulolytic activities production from two strains of the thermophilic anaerobic bacterium Clostridium thermocellum (ISO1 e ISO2), after growth on crystalline cellulose and sugarcane bagasse, also, the protein profile secreted by these isolates was resolved by SDS-PAGE and 2DE electrophoresis aiming the identification of proteins that participate on the cellulosic raw material degradation. The pH and temperature for optimal growth of the isolates are pH 7 and 60 ° C. The bacterium isolates produce cellulolytic, xylanolytic and pectinolytic activities when cultured in liquid medium containing crystalline cellulose or sugar cane bagasse as the sole carbon source. These activities were detected in the supernatant of the culture medium and also associated with the residual substrate, and the highest value was obtained for the xylanolytic activity (0.478 UI/ mL) from the supernatant of ISO2 grown on sugarcane bagasse. Moreover, the isolates were capable to degrade crystalline cellulose, with activities of 0.052 UI/mL and 0.040 UI/mL for the protein sample eluted from the residual substrate and secreted proteins into the culture medium with sugarcane bagasse ISO2, respectively. The protein profile of the supernatant and substrate associated proteins were analyzed by SDS-PAGE, and the presence of 160 e 220kDa proteins with a similar profile to the cellulosome of a C. thermocellum was observed. Additionally, the culture supernatants were used as a source of proteins for the analysis in two-dimensional gels, 2-DE, and there were differences in the number of spots and its volume between the growth conditions, and in comparison of the two strains ISO1 and ISO and the standard isolate CthJW. Mass spectrometry MALDI-TOF was used to the identification of ISO2’s secretome proteins after growth in liquid medium containing cellulose as carbon sources.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Saúde Animal, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-08-14T10:48:27Z No. of bitstreams: 1 2013_PatriciaRenaultSilva.pdf: 586827 bytes, checksum: b16cd68311c390924bf1d27312eea7b2 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-08-15T12:05:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_PatriciaRenaultSilva.pdf: 586827 bytes, checksum: b16cd68311c390924bf1d27312eea7b2 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-15T12:05:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_PatriciaRenaultSilva.pdf: 586827 bytes, checksum: b16cd68311c390924bf1d27312eea7b2 (MD5) / O objetivo do presente trabalho foi realizar o isolamento de Campylobacter jejuni e Campylobacter coli em carcaças resfriadas de frango comercializadas na região do Distrito Federal e Entorno, bem como verificar a ocorrência de resistência antimicrobiana e de genes de resistência. De um total de 105 carcaças de frango resfriadas coletadas, 11 (11,55%) amostras foram positivas para a pesquisa de Campylobacter spp., sendo 7 (63,64%) amostras positivas para C. jejuni e 4 (36,36%) amostras positivas para C. coli., resultados verificados tanto pelo método de isolamento microbiológico convencional como por PCR. Todas as cepas positivas foram submetidas a teste de susceptibilidade antimicrobiana, pelo método de difusão de discos, a sete antimicrobianos. Das 7 cepas de C. jejuni e das 4 cepas de C. coli testadas, 6 (85,71%) e 4(100%) apresentaram resistência a um ou mais antimicrobianos, respectivamente. A ocorrência dos genes de resistência aph3-1 (aminoglicosídeos), aadE (estreptomicina) e tet(O) (tetraciclina) foi verificada por PCR e os resultados foram de 57,14%, 28,57% e 42,86%, respectivamente, para C. jejuni, enquanto que em C. coli, houve 25% de ocorrência de aph3-1 e tet(O), sem resultados positivos para aadE. Para verificar a resistência às quinolonas em C. jejuni, foi realizado PCR-RFLP com enzima de restrição RsaI, sendo que das 7 cepas testadas, 3 (42,86%) apresentaram mutações que conferem resistência a esta classe de antimicrobianos. Os resultados mostram um alto nível de resistência antimicrobiana em C. jejuni e C. coli, o que evidencia a necessidade de programas de vigilância e monitoramento específicos para Campylobacter spp. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The aim of this work was to perform the isolation of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli in cooled chicken carcasses marketed in the Federal District and surrounding areas, as well as to verify the occurrence of antimicrobial resistance and resistance genes. A total of 105 chicken carcasses were collected, totaling 11 (11.55%) positive samples for the presence of Campylobacter spp., 7 (63.64%) of with C. jejuni and 4 (36.36%) C. coli, both results checked by conventional microbiological isolation method and PCR. All positive strains were subjected to antimicrobial susceptibility testing by the disc diffusion method. Of the 7 strains of C. jejuni tested, 6 (85.71%) showed resistance to one or more antibiotics, while 4 (100%) strains of C. coli had this result. The occurrence of resistance genes aph3-1 (aminoglycosides), aadE (streptomycin) and tet(O) (tetracycline) was verified by PCR and the results were 57.14%, 28.57% and 42.86%, respectively, for C jejuni, whereas C. coli occurrence of tet(O) and aph3 were 25% and no aadE positive results were observed. To check resistance of C. jejuni to quinolones, a PCR-RFLP was performed with the restriction enzyme RsaI. Of the 7 tested strains, 3 (42.86%) had mutations that confer resistance to this class of antibiotics. The results show a high level of antimicrobial resistance in C. jejuni and C. coli, which highlights the need for surveillance and specific monitoring programs for Campylobacter spp.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2010. / Submitted by Washington da Silva Chagas (washington@bce.unb.br) on 2011-04-19T21:55:21Z No. of bitstreams: 1 2010_AlicedaCunhaMoralesAlvares.pdf: 3239774 bytes, checksum: 1a6bf8a22db3e2e23b2651cbe67dc9f1 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2011-05-25T01:52:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_AlicedaCunhaMoralesAlvares.pdf: 3239774 bytes, checksum: 1a6bf8a22db3e2e23b2651cbe67dc9f1 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-05-25T01:52:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_AlicedaCunhaMoralesAlvares.pdf: 3239774 bytes, checksum: 1a6bf8a22db3e2e23b2651cbe67dc9f1 (MD5) / Neste trabalho apresentamos estudo biofísico e estrutural de uma leucil aminopeptidase (LAP), proteína recombinante expressa em Escherichia coli e presente em Leptospira interrogans sorovar Hardjo (LAPr-Li). Essa proteína está diretamente relacionada com a patogenicidade dessa bactéria e com a doença leptospirose em animais e humanos. A LAPr-Li foi obtida por transformação do vetor pET19b-HapepA em E. coli BL21-DE3, expressa a 20ºC, após indução com IPTG 0,3 mM, e purificada por cromatografia de afinidade e de exclusão molecular. Essa enzima apresenta atividade ótima na forma hexamérica em pH 8,5 e temperatura 50ºC. A LAPr-Li é formada por dímeros de trímeros formando o hexâmero, cuja atividade depende desta estrutura. A estrutura secundária é constituída de 44,7% de ?-hélice e 11,6% por folhas-?. A forma hexamérica, de diâmetro 15,2 nm e massa molecular 320 kDa, foi confirmada por ensaios de oligomerização dependentes da temperatura, por espalhamento de luz dinâmico. Estudos de atenuação de fluorescência, utilizando atenuadores carregados e neutros e ajustes de Stern-Volmer, revelaram que a proteína apresenta duas populações de triptofanos. A caracterização dos microambientes foi baseada nas constantes de Stern-Volmer (KSV) obtidas para atenuação com cloreto de césio, apresentou maior acesso aos resíduos de triptofanos, quando comparado ao iodeto de potássio, carregado negativamente. As constantes de atenuação de fluorescência para o césio foram KSV1= 38,6 M-1 e KSV2= 6,4 M-1 e para iodeto KSV1= 4,4 M-1 e KSV2= 0,4M-1. A estabilidade estrutural da LAPr-Li foi analisada a partir de curvas de desnaturação térmica e química obtidas por dicroísmo circular. A elevação da temperatura para 50ºC em pH 8,5 induziu modificações na estrutura secundária e, consequentemente, na conformação da proteína. As curvas de desnaturação térmica (25-95ºC) indicaram maior estabilidade estrutural da LAPr-Li nos pHs 3,0 e 5,0, onde nenhuma alteração estrutural e desnaturação foi observada. Em região alcalina (8,0, 8,5 e 9,0) a LAPr-Li não é desnaturada completamente, resultando, portanto, em valores de ?G25 mais baixos (~2,0 kcal.mol-1) comparados àqueles obtidos nos pHs 6,0 (3,52 kcal.mol-1) e 7,0 (6,63 kcal.mol-1), onde a proteína se desnaturou completamente. Esse último resultado foi confirmado com a curva de desnaturação, utilizando cloridrato de guanidina em água, onde a desnaturação completa da LAPr-Li resultou no valor de ?GH2O de 6,32 kcal. mol-1. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / In this work we present the biophysical studies of the leucine aminopeptidase (LAP), a recombinant protein expressed in Escherichia coli and present in Leptospira interrogans serovar Hardjo (LAPr-Li). This protein is related to pathogenicity of the bacteria and the leptospirosis disease in animals and humans. The LAPr-Li was obtained by transformation of the vector pET19b-HapepA in E. coli BL21-DE3, expressed at 20°C after induction with 0.3 mM IPTG, and purified by affinity and size exclusion chromatography. The enzyme presents optimal activity as hexamer at pH 8.5 and 50°C. LAPr-Li is self assembled as hexamer from trimers of dimmers and its secondary structure consists of 44.7% α-helix and 11.6% for β-sheets. The hexamer with diameter of 15.2 nm and molecular weight 320 kDa was confirmed by dynamic light scattering oligomerization assays. Fluorescence decay studies using charged and neutral quenchers and Stern-Volmer fitting revealed two different populations of tryptophan (exposed and buried) in negatively charged microenvironment. The cesium chloride had greater access to tryptophan residues, when compared to potassium iodide, negatively charged. The constants of fluorescence decay for cesium was KSV1 = 38.6 M-1 and KSV2 = 6.2 M-1 and iodide KSV1 = 4.4 M-1 and KSV2 = 0.4 M-1. The structural stability of LAPr-Li was analyzed from thermal and chemical denaturation curves by circular dichroism spectroscopy. The increase of temperature to 50ºC at pH 8.5 induced secondary structure and conformational changes of the protein. It promotes flexibility of the enzyme that appears to be essential for enzymatic activity. The thermal denaturation curves (25-95ºC) indicated higher structural stability of LAPr-Li at pH 3.0 and 5.0 in which no denaturation profile was observed. At pH 8.0, 8.5 and 9.0 LAPr-Li was partially denatured resulting in lower values of G25 (~ 2.0 kcal.mol-1) compared to those obtained at pH 6.0 (3.52 kcal.mol-1) and 7.0 (6.63 kcal.mol-1), where the protein was completely denatured. The latter result was confirmed by denaturation using aqueous solution of guanidine hydrochloride, where the complete denaturation of LAPr-Li resulted in GH2O value of 6.32 kcal.mol-1.

O Parque Estadual de Itapuã, RS, Brasil, é considerado um dos últimos refúgios da Mata Atlântica ainda preservados na região metropolitana de Porto Alegre, local escolhido para as coletas de bromélias. O objetivo deste trabalho foi realizar um levantamento da diversidade de bactérias, tanto endofíticas quanto daquelas presentes na água das cisternas de bromélias. Foram coletadas 38 amostras de folhas e 26 amostras de água das cisternas de sete espécies de bromélias em vários locais do Parque, no período de março de 2006 a maio de 2007. As amostras foram cultivadas após diluições seriadas em ágar para contagem. Os isolados foram identificados através da análise da morfologia colonial, celular, comportamento bioquímico e fisiológico. Das folhas foram isoladas 76 bactérias endofíticas e da água das cisternas 124 bactérias com predomínio dos gêneros Bacillus, Burkolderia, Staphylococcus e Streptomyces. As bactérias Gram positivas apresentaram um maior número de cepas produtoras de enzimas extracelulares comparadas às Gram negativas. As Gram positivas isoladas das folhas foram melhores produtoras de celulase, pectinase e lipase, enquanto que as isoladas da água de cisterna foram melhores produtoras para celulase, amilase e protease. Pôde se observar que a maioria das bactérias endofíticas isoladas das bromélias produz algum tipo de promotor de crescimento. Com exceção da fixação de nitrogênio, que foi detectada somente entre as bactérias Gram negativas, pode-se observar que a produção desses promotores está amplamente disseminada entre as bactérias endofíticas. A análise da biodiversidade foi realizada através do índice de Shannon-Weaver, onde foi encontrado nas folhas (H=3,070) e nas cisternas (H=3,449) evidenciando que as cisternas abrigam uma biodiversidade um pouco mais elevada em relação ao interior da planta. / The State Park of Itapuã, RS, Brazil, is considered one of the latest refuges of the Atlantic Forest still preserved in the metropolitan area of Porto Alegre, where seven bromeliads samples were colected. The objectives of this study were carry out a survey on the diversity of the endophytic bacteria and those present in the water tanks of bromeliads. Thirty eight samples of leaves and 26 samples of water from the water tanks of bromeliads were collected from many places of the Park, between the period of March, 2006 and May, 2007. Samples were cultivated in plate count agar after serial decimal dilutions. Bacteria were identified through analysis of their colonial and cellular morphology, physiological and biochemical characteristics. From leaves it was obtained 76 strains of endophytic bacteria and from water tanks it was obtained 124 strains, with the predominance of Bacillus, Burkolderia, Staphylococcus and Streptomyces genera. The Gram positive bacteria presented a great number of strains producing extra-cellular enzymes compared to Gram negative strains. The Gram positive strains isolated from the leaves were better in the production of cellulase, pectinase and lipase, and those isolated form water tanks were better in the production cellulase, amylase and protease. It was observed that the majority of the endophytic strains produce one kind of promoting growth. With the exception of fixing nitrogen, observed only with Gram negative strains, it was observed that the production of promoting growth substance is disseminated between endophytic bacteria. The analysis of biodiversity was carried out with the Shannon-Weaver index, that demonstrated (H=3.449) and (H=3.070). These results showed that there are a little higher biodiversity in the water tanks than in the leaves.