Žilvino Brobliausko magistro studijų baigiamajame darbe atliekamas daugiašalio reliacinių duomenų bazių saugumo modelio teorinis tyrimas: suformuluojami pagrindiniai reikalavimai, keliami tokio tipo modeliui; pasiūlomas modelis, leidžiantis vykdyti paiešką ir taikyti sumos, bei vidurkio agregatines funkcijas neiššifruojant skaitinių duomenų RDBVS pusėje; nurodomi pateikto modelio privalumai ir trūkumai. Pateikiama demonstracinė programa, realizuojanti pasiūlytą modelį. / The multilateral security model of relational databases is analyzed in master thesis of Žilvinas Brobliauskas. The results of research includes: the formulated requirements for multilateral security model of relational databases, proposed model, which allows range queries and aggregation functions over encrypted data without decrypting them at RDBMS level, and determined advantages and disadvantages of it. The program which realizes proposed model is given as proof of concept.

Šio darbo tyrimo sritis – programinės įrangos projektavimo metodai, leidžiantys išplėsti egzistuojančias sistemas, ir jų taikymas bibliotekų informacinei sistemai. Tyrimo objektas – mokslo publikacijų, atitinkančių lituanistikos sampratą, bibliografinės duomenų bazės projektavimas ir kūrimas. Darbo tikslas – pagerinti lituanistikos sampratą atitinkančių mokslo publikacijų vertinimo bei sklaidos galimybes, automatizuoti šių publikacijų pateikimo, ekspertavimo bei sklaidos procesus. / International social and humanitarian science and abstract bibliographic databases includes the most important and most significant of these documents in scientific fields. Databases developed thematically (eg, MLA International Bibliography, Sociological Abstracts CSA) and / or regional basis (eg, British Humanities Index). Search of international databases are a great tool for quickly and efficiently find information about the world of the studies performed and published scholarly works in the social and humanitarian sciences publications. Lithuanian academic journals and research publications in international databases is increasing in recent years, but in Lithuania the tests and researchers work to develop international databases is only fragmentary. International social and humanitarian sciences databases of lithuanistic ensure the development of Lithuanian scientists work visibility in national and international level and at the same scientists laid down in recognition of excellence. This database should be based on best international social and humanitarian experience of databases.

Duomenų bazės projektuojamos pagal specifinius reikalavimus ir tai dažniausiai daroma rankiniu būdu. Suprojektuotai duomenų bazei valdyti kuriamos programinės priemonės, kurios pritaikytos tik tai duomenų bazei valdyti. Gautas rezultatas dažniausiai tenkina vartotoją, tačiau neilgai. Nuolat besikeičiantys reikalavimai duomenims didina atotrūkį tarp norimos apdoroti ir galimos apdoroti informacijos. Taigi išlaikyti duomenų bazę suderintą su poreikiais yra sudėtinga. Nuolat besikeičiantys poreikiai didina informacinės sistemos palaikymo sąnaudas. O tai smulkaus verslo įmonėms gali tapti nepakeliama našta. Kyla poreikis pačiam sistemos vartotojui pakoreguoti ją taip, kad sistema tenkintų pasikeitusius reikalavimus duomenų apdorojimui. Šiame darbe pristatomas duomenų bazės kūrimas naudojant vartotojo sukurtus duomenų pildymo šablonus. Pagal vartotojo sukurtus šablonus keičiasi ir informacinės sistemos vartotojo sąsaja skirta duomenims apdoroti. Tikslas – duomenų bazės bei jos valdymo sistemos kūrimo automatizavimas. Siekiama sukurti algoritmą duomenų bazės bei jos valdymo sistemos kūrimo automatizavimui. Pagal šį algoritmą realizuota sistema vartotojas, neišmanantis apie duomenų bazių kūrimą, galėtų sukurti duomenų bazę bei jos valdymo sistemą pritaikytą savo reikmėms. Galėtų bet kada modifikuoti duomenų bazės struktūrą – pridėti, pašalinti stulpelius. Duomenų bazės struktūra koreguojama pagal šablonus. Šablonų sudėtis saugoma duomenų bazės lentelėse. Pagal aprašytą algoritmą... [toliau žr. visą tekstą] / Databases are designed according to specific requirements, and in most cases it is carried out manually. Having database already designed, software tools to manage the particular database are developed. Usually the result meets user’s needs, but just on a short term basis. Since the requirements keep changing constantly, gap between information to be processed and information possible to process in practice is growing bigger, so it is complicated to keep the database updated according to user’s needs. Shifting needs have significant influence on information system support input, which can become a challenge to minor businesses. Therefore particular system users have to modify it themselves to meet the changing requirements of data processing. This final thesis analyses the development of database using data filling templates designed by the user. According to the templates designed by the user, information system user interface for data processing keeps changing as well. The purpose is automatic design of database and its management system, and development of algorithm to automate database and its management system. In case the system is based on this algorithm, its user having very little knowledge of database development still is able to design a database and to shape its management system according to his needs. It is possible to modify database structure – to add or to remove columns – at any time. Database structure is adjusted by the templates kept in database tables... [to full text]

Šio darbo tikslas buvo sukurti reikalavimais grindžiamą duomenų saugumo ir matomumo metodų pasirinkimo bei jų kombinavimo metodinę medžiagą. Pateikti reikalavimas grindžiamą kompleksinės saugos modelį. Pašalinti kompleksinės apsaugos metodų informacijos trūkumą. Darbe išnagrinėti ir palyginti garsių pasaulio saugos specialistų kompleksinės saugos sprendimai. Atlikta sistemos pažeidimų analizė ir sisteminimas. Darbe buvo siekiama atskleisti svarbiausius pažeidimus, jų veikimo principus ir kaip nuo jų tinkamai apsisaugoti. Praktinėje dalyje aprašytas kompleksinis saugos modelis, kuris vėliau smulkinamas į detalius apsaugos modelius. Modelis buvo pritaikytas šiandien populiariausiose kombinuotoje sistemose Microsoft Windows Server 2008 serveryje ir Microsoft SQL Server 2008 duomenų bazių valdymo sistemoje. Naudojantis metodika galima atlikti esamos sistemos saugumo analizę ir remiantis veiklos modeliais teisingai konfigūruoti esamą ar naujai kuriamą sistemą. / This work destination was to create requirements based on data security and availability method choosing and their combination methodology. Introduce requirements based on complex security model. Eliminate information lack of complex security. In work analyzed and compared complex security solutions of famous the word security specialists. Accomplished system vulnerability analysis and systematized information. During the work revealed most important vulnerabilities, explain how it works and how correctly secure of them. In this research described security model of complex security, which later detailed as smaller part of model. Complex security model were used at nowadays most popular combined information system. For research were used Microsoft Windows Server 2008 and Microsoft SQL Server 2008. Created methodology is useful then necessary to test existing or creating new configuration of system.

DNA cytosine-5 methyltransferases (MTases) recognize short DNA sequences and catalyze the transfer of the methyl group from the cofactor AdoMet to the C5-position of a target cytosine. In this work both these aspects of the MTase mechanism have been addressed. First, using rational protein design and directed evolution approaches the specificity of the HhaI MTase, GCGC, has been changed to GCG by functional elimination of one of the two target recognition elements. In addition, the introduced structural changes endowed the MTase with the ability to transfer extended groups from synthetic cofactor analogs, providing the first example of a dual specificity change in a DNA MTase. Second, the kinetics of fast pre-catalytic conformational transitions in the MTase and DNA has been investigated. A new method to follow the target cytosine flipping and its subsequent covalent activation has been proposed, which allows a direct real-time observation of these processes by monitoring associated UV absorbance changes in a chemically unperturbed DNA. These studies for the first time demonstrate that the flipping of the target cytosine and the closure of the catalytic loop in the enzyme occur simultaneously, whereas the covalent activation of the target cytosine and the transfer of the methyl group are temporally distinct steps in the catalytic cycle of M.HhaI. Since the new method is based on the general phenomenon of hyperchromicity, it is thus applicable for studies of other systems... [to full text] / DNR citozino-5 metiltransferazės (MTazės) atpažįsta specifines DNR sekas ir katalizuoja metilgrupės pernešimą nuo kofaktoriaus AdoMet ant taikinyje esančio citozino. Šiame darbe nagrinėjami abu MTazių veikimo mechanizmo aspektai. Baltymų inžinerijos ir kryptingos evoliucijos metodais pašalinant vienos iš dviejų taikinio atpažinimo kilpų funkciją, MTazės HhaI atpažįstamas taikinys GCGC pakeistas į GCG. Dėl įvestų struktūros pakeitimų nauja unikalaus specifiškumo MTazė efektyviai katalizuoja ne tik metilo, bet ir didesnių grupių pernešimą nuo sintetinių kofaktoriaus analogų, ir gali tapti naudingu molekulinės biologijos įrankiu. Katalitinės reakcijos metu MTazės kilpa užsidaro, apglėbdama surištą DNR, o taikinio citozinas išsukamas iš DNR spiralės ir aktyvuojamas, kovalentiškai prisijungiant katalitiniam cisteinui. Šiems greitiems prieškatalitiniams procesams tirti buvo panaudotas naujas metodas, leidžiantis realiu laiku stebėti M.HhaI sąlygotą citozino išsukimą bei kovalentinę aktyvaciją, registruojant mažus UV absorbcijos pokyčius gamtinį substratą atitinkančioje DNR. Pirmą kartą parodyta, kad M.HhaI katalizuojamoje reakcijoje citozino išsukimas ir katalitinės kilpos užsidarymas vyksta sinchroniškai, o kovalentinė citozino aktyvacija ir metilgrupės pernešimas yra kinetiškai netapačios katalitinio ciklo stadijos. Kadangi naujasis metodas remiasi fundamentine nukleorūgščių savybe – hiperchrominiu efektu, todėl jis gali būti naudojamas ir kitų DNR bazę išsukančių baltymų... [toliau žr. visą tekstą]

DNR citozino-5 metiltransferazės (MTazės) atpažįsta specifines DNR sekas ir katalizuoja metilgrupės pernešimą nuo kofaktoriaus AdoMet ant taikinyje esančio citozino. Šiame darbe nagrinėjami abu MTazių veikimo mechanizmo aspektai. Baltymų inžinerijos ir kryptingos evoliucijos metodais pašalinant vienos iš dviejų taikinio atpažinimo kilpų funkciją, MTazės HhaI atpažįstamas taikinys GCGC pakeistas į GCG. Dėl įvestų struktūros pakeitimų nauja unikalaus specifiškumo MTazė efektyviai katalizuoja ne tik metilo, bet ir didesnių grupių pernešimą nuo sintetinių kofaktoriaus analogų, ir gali tapti naudingu molekulinės biologijos įrankiu. Katalitinės reakcijos metu MTazės kilpa užsidaro, apglėbdama surištą DNR, o taikinio citozinas išsukamas iš DNR spiralės ir aktyvuojamas, kovalentiškai prisijungiant katalitiniam cisteinui. Šiems greitiems prieškatalitiniams procesams tirti buvo panaudotas naujas metodas, leidžiantis realiu laiku stebėti M.HhaI sąlygotą citozino išsukimą bei kovalentinę aktyvaciją, registruojant mažus UV absorbcijos pokyčius gamtinį substratą atitinkančioje DNR. Pirmą kartą parodyta, kad M.HhaI katalizuojamoje reakcijoje citozino išsukimas ir katalitinės kilpos užsidarymas vyksta sinchroniškai, o kovalentinė citozino aktyvacija ir metilgrupės pernešimas yra kinetiškai netapačios katalitinio ciklo stadijos. Kadangi naujasis metodas remiasi fundamentine nukleorūgščių savybe – hiperchrominiu efektu, todėl jis gali būti naudojamas ir kitų DNR bazę išsukančių baltymų... [toliau žr. visą tekstą] / DNA cytosine-5 methyltransferases (MTases) recognize short DNA sequences and catalyze the transfer of the methyl group from the cofactor AdoMet to the C5-position of a target cytosine. In this work both these aspects of the MTase mechanism have been addressed. First, using rational protein design and directed evolution approaches the specificity of the HhaI MTase, GCGC, has been changed to GCG by functional elimination of one of the two target recognition elements. In addition, the introduced structural changes endowed the MTase with the ability to transfer extended groups from synthetic cofactor analogs, providing the first example of a dual specificity change in a DNA MTase. Second, the kinetics of fast pre-catalytic conformational transitions in the MTase and DNA has been investigated. A new method to follow the target cytosine flipping and its subsequent covalent activation has been proposed, which allows a direct real-time observation of these processes by monitoring associated UV absorbance changes in a chemically unperturbed DNA. These studies for the first time demonstrate that the flipping of the target cytosine and the closure of the catalytic loop in the enzyme occur simultaneously, whereas the covalent activation of the target cytosine and the transfer of the methyl group are temporally distinct steps in the catalytic cycle of M.HhaI. Since the new method is based on the general phenomenon of hyperchromicity, it is thus applicable for studies of other systems... [to full text]

Huge amounts of digital information are stored in the World today and the amount is increasing by quintillion bytes every day. Approximate data mining algorithms are very important to efficiently deal with such amounts of data due to the computation speed required by various real-world applications, whereas exact data mining methods tend to be slow and are best employed where the precise results are of the highest important. This thesis focuses on several data mining tasks related to analysis of big data: frequent pattern mining and visual representation. For mining frequent patterns in big data, three novel approximate methods are proposed and evaluated on real and artificial databases: • Random Sampling Method (RSM) creates a random sample from the original database and makes assumptions on the frequent and rare sequences based on the analysis results of the random sample. A significant benefit is a theoretical estimate of classification errors made by this method using standard statistical methods. • Multiple Re-sampling Method (MRM) is an improved version of RSM method with a re-sampling strategy that decreases the probability to incorrectly classify the sequences as frequent or rare. • Markov Property Based Method (MPBM) relies upon the Markov property. MPBM requires reading the original database several times (the number equals to the order of the Markov process) and then calculates the empirical frequencies using the Markov property. For visual representation... [to full text] / Didžiuliai informacijos kiekiai yra sukaupiami kiekvieną dieną pasaulyje bei jie sparčiai auga. Apytiksliai duomenų tyrybos algoritmai yra labai svarbūs analizuojant tokius didelius duomenų kiekius, nes algoritmų greitis yra ypač svarbus daugelyje sričių, tuo tarpu tikslieji metodai paprastai yra lėti bei naudojami tik uždaviniuose, kuriuose reikalingas tikslus atsakymas. Ši disertacija analizuoja kelias duomenų tyrybos sritis: dažnų sekų paiešką bei vizualizaciją sprendimų priėmimui. Dažnų sekų paieškai buvo pasiūlyti trys nauji apytiksliai metodai, kurie buvo testuojami naudojant tikras bei dirbtinai sugeneruotas duomenų bazes: • Atsitiktinės imties metodas (Random Sampling Method - RSM) formuoja pradinės duomenų bazės atsitiktinę imtį ir nustato dažnas sekas, remiantis atsitiktinės imties analizės rezultatais. Šio metodo privalumas yra teorinis paklaidų tikimybių įvertinimas, naudojantis standartiniais statistiniais metodais. • Daugybinio perskaičiavimo metodas (Multiple Re-sampling Method - MRM) yra RSM metodo patobulinimas, kuris formuoja kelias pradinės duomenų bazės atsitiktines imtis ir taip sumažina paklaidų tikimybes. • Markovo savybe besiremiantis metodas (Markov Property Based Method - MPBM) kelis kartus skaito pradinę duomenų bazę, priklausomai nuo Markovo proceso eilės, bei apskaičiuoja empirinius dažnius remdamasis Markovo savybe. Didelio duomenų kiekio vizualizavimui buvo naudojami pirkėjų internetu elgsenos duomenys, kurie analizuojami naudojant... [toliau žr. visą tekstą]

Dažnai būna taip, kad internetiniame tinklapyje yra daug svarbių duomenų, tačiau jie nėra pateikti lengvai suprantamoje formoje. Būtent pateiktos informacijos interaktyvumo stoka, sąlygoja ne tik esamos informacijos sudėtingesnį suvokimą ar įsisavinimą, bet taip pat tiesiogiai siejasi su lankytojų srauto mažėjimu. Pastarosios situacijos buvimas ypač aktualus internetiniams tinklapiams, kuriuose kaupiama ir publikuojama daug specifinės srities duomenų. Šiame magistriniame darbe siekiama Exhibit įrankį pritaikyti korektiškam ir pilnavertiškam informacinės sistemos duomenų bazėje kaupiamų duomenų publikavimui ir vizualizavimui. Esamų sprendimų analizė leido atskleisti, kad Exhibit pritaikytas dirbti su statine, tai yra failuose saugoma informacija. Be to Exhibit vidinės duomenų struktūros formavimas gana ilgai užtrunka [Zhao et al., 2008]. Taigi, magistriniame darbe surastos ir pritaikytos priemonės leidžiančios Exhibit įrankį pritaikyti dažnai kintančios ir nuolatos atsinaujinančios informacijos atvaizdavimui. O taip pat, patobulintas metodas, kuris leidžia greičiau suformuoti vidinę Exhibit duomenų struktūrą. / There is common situation where are much of important data on the website, but the data are given in an inconvenient form to use. The lack of information interactivity determines complicated understanding and acquisition of the given information, also it directly determines the decline of website visitors. The being of the mentioned situation is topical to websites where collecting and publishing a lot of specific data. An aim of this research is to find a way to realize qualitatively publishing and visualization of the data stored in information system database. An analysis of the present decisions showed that Exhibit is great tool to solve existing problem. But this tool have a limitation. Exhibit is working with static (stored in files) information. Also creation of internal Exhibit data structure takes too long time. In this research were found and adapted facilities that let to use an Exhibit tool for publishing dynamic information. Also was improved method for faster internal Exhibit data structure creation.

SQL injekcijos atakos taikinys – interaktyvios interneto programos, kurios naudoja duomenų bazės serverius. Šios programos leidžia vartotojams įvesti informaciją ir ją įvedus formuojamos SQL užklausos, kurios siunčiamos į duomenų bazės serverį. Darydamas SQL injekcijos ataką, atakuotojas per įvesties laukus suformuoja kenksmingą SQL užklausos segmentą, kuris modifikuoja buvusią užklausą. Naudodamas SQL injekcijos ataką, atakuotojas gali prieiti prie konfidencialios informacijos, ją modifikuoti ar, apeidamas autorizacijos scenarijų, prisijungti prie sistemos nežinodamas slaptažodžio. Šiame darbe pasiūlytas saugos modulis perima visą vartotojo įvedamą informaciją, pritaiko saugumo taisykles ir taip padidina saugumą apsisaugant nuo SQL injekcijų el. verslo žiniatinklio programose bei registruoja potencialius bandymus sutrikdyti normalų sistemos darbą. Norint įdiegti pasiūlytą saugos modulį, nereikia konfigūruoti serverio ar jo programinės įrangos – modulio diegimo metu keičiasi tik žiniatinklio programos failai. Darbui atlikti pasirinkta PHP programavimo kalba ir MySQL duomenų bazė. Tyrimo metu atlikti testavimo rezultatai parodo, kokius saugos modulio konfigūravimo parametrus reikia taikyti norint užtikrinti maksimalų saugumo lygį. / The target of SQL injection attack – interactive web programs, which use database servers. Those programs allow users to input information and as it is imputed, it forms SQL queries, which are sent into database server. With SQL injection help, the attacker using input fields forms harmful section of SQL query, which modifies previous query. Exploiting attack of SQL injection, the attacker may learn confidential information, modify it or connect to system without knowing the password by authorisation bypass. In this research-paper the proposed security model takes over all information inputted by user, adjusts the safety rules and that way it improves the safety in order to guard from SQL injections at electronic business web systems as well as it register potential attempts to disrupt normal work of the system. In order to install the proposed safety model there is no need to configure the server or its software because in the moment of installation it changes only files of website programs. For purpose of executing this work, we use PHP programming language and MySQL database. During the analysis, the received test results show what configuration parameters of safety model we need to use in order to guarantee the maximum level of safety.

Šiame moksliniame darbe siekiama ištirti Plungės rajono Platelių ir Žemaičių Kalvarijos seniūnijų teritorijų panaudojimo galimybes, vadovaujantis kaimo plėtros žemėtvarkos projektais. Iškeltiems uždaviniams išspręsti, naudojamasi žemės informacinės sistemos duomenų bazėmis. Vykdant sėkmingą kaimo plėtros įgyvendinimą, svarbu atsižvelgti į gamtinės aplinkos sukurtas sąlygas. Analizuojama teritorija pasižymi saugomų objektų gausa. Plungės rajone yra devynios saugomos teritorijos, kurių plotas sudaro 25 proc. visos Plungės rajono teritorijos. Tiriamų seniūnijų bendras plotas yra 26161 ha., abi seniūnijos patenka į Žemaitijos nacionalinį parką. Iš bendro analizuojamos teritorijos ploto, 15163 ha užima Žemaitijos nacionalinis parkas, tai sudaro beveik 58 proc. visos teritorijos. Tam, kad kaimo vietovėse teritorijų planavimas ir naudojimas neturėtų neigiamų pasekmių kraštovaizdžiui ir gamtinei aplinkai, vykdant planavimą privaloma vadovautis kaimo plėtros žemėtvarkos projektais, specialiosiomis žemės ir miško naudojimo sąlygomis, bei kitais teisės aktais. Iškelti uždaviniai išspręsti vadovaujantis kaimo plėtros žemėtvarkos projektų rengimo taisyklėmis, miško įveisimo ne miško žemėje taisyklėmis, Plungės rajono savivaldybės teritorijos bendruoju planu, Žemaitijos nacionalinio parko planavimo schema, išskirtos teritorijos tinkamos sodybos vietai parinkti bei miškui ne miško žemėje įveisti. Atliekant tyrimą ArcMap 10.2.1 programa, sudaryti du skirtingi modeliai, taip išskirtos... [toliau žr. visą tekstą] / This thesis is aimed at exploring the possibilities to use the territories of Plateliai and Žemaičių Kalvarija in Plungė District pursuant to the organization of land exploitation plans of rural development. The databases of the land information system are used to solve the tasks. In pursuance of successful implementation of rural development, it is important to take the conditions created by natural environment into consideration. The territory under review characterizes for the abundance of protected objects. Plungė District includes nine protected territories, the area of which constitutes 25 percent of the entire territory of Plungė District. Total area of elderships under review is 26161 ha; both elderships are within the boundaries of Žemaitija National Park. Out of total territory area analyzed, 15163 ha are covered by Žemaitija National Park, which constitutes almost 58 percent of the entire territory. For the territorial planning and use in rural areas to not have negative consequences for the landscape and natural environment, while planning it is mandatory to follow the organization of land exploitation plans of rural development, special terms and conditions of land and forest use, as well as other legal acts. The tasks were solved pursuant to the rules of preparation of organization of land exploitation plans of rural development, the rules of afforestation in non-forest land, the general plan of the territory of Plungė District Municipality, the planning scheme... [to full text]