A costa austral da América do Sul (CAAS) e o oceano Austral (OA) possuem grande variedade de habitats e estão historicamente conectados desde a abertura da passagem de Drake. A fauna marinha de ambas as regiões é altamente diversa e muitas espécies possuem distribuições geográficas contraditórias, como é o caso dos hidroides bentônicos (Cnidaria, Hydrozoa). Toda essa heterogeneidade faunística atrai estudos adicionais em biogeografia, envolvendo a busca por áreas de endemismo e outros padrões de distribuição geográfica. Uma atualização do status taxonômico das espécies de hidroides bentônicos da CAAS e OA foi feito, reunindo informações sobre sua riqueza, grau de endemismo, substrato biológico e distribuição geográfica. Um total de 5.621 amostras e 359 morfoespécies de hidroides bentônicos foram levantadas para a área de estudo e checadas taxonomicamente, sendo 256 identificadas até o nível específico. Os registros de presença e ausência ao longo da área foram usados em uma análise de similaridade pelo índice de Bray-Curtis, sendo os resultados sintetizados em \"clusters\" hierárquicos e nMDS. A taxa de endemismo para ambos a CAAS e OA foi de 54%, sendo o OA responsável por 88% dos registros de espécies endêmicas. As espécies de leptotecados foram as que apresentaram maior amplitude de distribuição horizontal e vertical. A maior parte das espécies de hidroides bentônicos levantadas são substrato-generalistas. Treze assembleias ecológicas de hidroides bentônicos foram encontradas ao longo da CAAS e OA, as quais foram relacionadas com a dinâmica oceanográfica da área e comparadas com ecorregiões, realms, assembleias e áreas de endemismo previamente delimitadas para a região. As áreas de endemismo para a CAAS e OA foram hipotetizadas por meio da Análise de Endemicidade (AE) em uma otimização pelo software NDM-VNDM, com uma grade de 10° latitude X 10° longitude. Nove (F=0.5) e 10 (F=1.0) áreas consensuais de endemismo foram historicamente relacionadas com o isolamento da Antártica e comparadas com hipóteses já existentes para a CAAS e OA. Todas as áreas foram discutidas considerando-se os processos de vicariância e dispersão, e com relação ao real grau de endemicidade que elas representam. Uma PAE também foi realizada mas apenas com 61 espécies de hidroides bentônicos endêmicos da região acima de 45°S. Essa análise foi feita com o objetivo de reanalisar os dados previamente publicados por Marques & Peña Cantero (2010), inserindo um conjunto de dados complementar para a obtenção de uma melhor definição e acurácia nas áreas de endemismo delimitadas para a região. Oito áreas de endemismo foram definidas como subregiões dos padrões previamente encontrados. O uso de diferentes técnicas e conjuntos de dados biogeográficos são meios alternativos para clarear padrões gerais de áreas de endemismo e também outros padrões relacionados à comunidades ecológicas e estudos em conservação da biodiversidade / The southern South America (SSA) coast and the Southern Ocean (SO) have a high differentiation of habitats and are historically connected since the opening of the Drake Passage. The marine fauna of both regions are connected, highly diverse and many species are contradictory distributed, such as the benthic hydroids (Cnidaria, Hydrozoa). All this faunistic heterogeneity calls attention for additional biogeographic investigations, involving the search for areas of endemism and other geographic distribution patterns. An update of the taxonomic status of the species of benthic hydroids from SSA and SO was carried out, gathering information about their richness, endemicity level, biological substrates and geographic distribution. A total of 5.621 samples and 359 morphospecies of benthic hydroids were surveyed for the studied area and taxonomically checked, being 256 identified up to the specific level. The records of presence-absence along the SSA and SO were used in a Bray-Curtis similarity analysis and the results were synthesized in hierarchical clusters and nMDS. The level of endemism at both the SSA and the SO is 54%, being the SO responsible for 88% of the records of endemic species. Leptothecate species had the widest horizontal and vertical distribution and most part of the benthic hydroids surveyed were considered substrate-generalists. Thirteen ecological assemblages of benthic hydroids were found along the SSA and SO and compared with the oceanographic dynamics of the area, as well as with earlier ecoregions, realms, assemblages, and areas of endemism delimited for the region. Areas of endemism were hypothesized for the SSA and SO using the Endemicity Analysis (EA) through an optimization performed by the software NDM-VNDM, with a 10° latitude X 10° longitude grid. Nine (F=0.5) and 10 (F=1.0) consensus areas of endemism were historically related with the isolation of Antarctica, and compared with previous hypotheses for the SSA and SO. All areas were discussed in the context of vicariance/dispersal processes, and concerning the real degree of endemicity that they represent. PAE was also performed but only with 61 endemic species of benthic hydroids for the region above the 45°S. This analysis was carried out with the aim to reanalyze previous data already published by Marques & Peña Cantero (2010), inserting a complementary dataset in order to obtain a better definition and accuracy in the areas of endemism delimited for the region. Eight areas of endemism were defined as subregions of the patterns previously found. The use of different techniques and biogeographic datasets are alternative strategies to clarify general patterns of areas of endemism, as well as other patterns related with ecological communities and studies in conservation biology

Pela primeira vez considerou-se a fauna de mamíferos dos Pampas do sul do Brasil e do Uruguai como um todo, independentemente de fronteiras políticas. Primeiramente, foi obtida informação sobre ocorrência das espécies na área de estudo a partir de diferentes fontes e logo se elaboraram mapas de distribuição para todas elas. Na seqüência, tratou-se de determinar por meio de análises quantitativas o padrão de distribuição geográfica das mesmas realizando, primeiramente, uma análise entre sub-regiões (UGOs) dentro da área de estudo, para logo compará-la com regiões vizinhas e, por último, com ambientes similares distribuídos em outros continentes. Também, analisou-se preliminarmente o estado de conservação das espécies de mamíferos que ocorrem dentro da área de estudo. Foi obtida informação de coleções científicas (2.080 registros), de literatura (439 registros de resumos de reuniões científicas e 868 de revistas periódicas, livros, dissertações, teses e relatórios), 63 de observação ou comunicação pessoal de diferentes pesquisadores e o restante de outras fontes. No total, consideraram-se 3.522 registros (1.738 no Uruguai e 1.784 Brasil) distribuídos em 1.041 localidades. Foram identificadas 125 espécies (80 para o Uruguai e 117 para o Rio Grande do Sul), sete delas são endêmicas e seis são consideradas como extintas. Os roedores junto aos quirópteros e marsupiais somam 68,6% dos gêneros e os dois primeiros também ultrapassam 60% do total de espécies. As maiores riquezas foram encontradas naquelas áreas mais estudadas. A análise de agrupamento das UGOs mostrou dois grupos bem definidos, um conformado pelo Uruguai e pela região da Campanha Gaúcha e o outro, pelo litoral Atlântico, leste e centro do Rio Grande do Sul. Em relação às regiões vizinhas, observou-se claramente um grupo formado pelas Províncias florestais, onde está incluída a área de estudo. Na análise das ecoregiões o grupo conformado por aquelas de origem tropical e/ou florestal também foi o que incluiu a área de estudo. Existiram diferenças significativas nos hábitos de locomoção e marginalmente significativas nos hábitos alimentares em comparação com as regiões vizinhas. No entanto, na comparação dos hábitos alimentares com outros ambientes similares de campos temperados distribuídos em outros continentes, sim houve diferença significativa indicando pouca semelhança entre a estrutura das comunidades. Por último, 31 espécies foram consideradas ameaçadas nos Pampas do Rio Grande do Sul e 21 no Uruguai, resultando num total de 47 para toda a região (37,6% do total). Este trabalho pretendeu colaborar com a geração de informação básica fundamental para a formulação de políticas de conservação que contemplem toda a região independentemente dos países que a compõem. / For the first time the mammalian fauna of the Pampas from Uruguay and southern Brazil was considered as a whole, despite political borders. Information on species distribution in the study area was obtained from different sources and a distribution map was elaborated for each species. After that we identified the pattern of geographical distribution of mammals in the region by using quantitative analysis. First of all, we analyzed the sub-regions (OGUs) inside the study area, after that we compared those OGUs with neighbour areas, and finally with similar environments around the world. We also did a preliminary analysis of the conservation status of the species registered. Information was obtained from scientific collections (2,080 records), from literature (439 from scientific reunion abstracts; 868 from manuscripts, books, thesis and other kind of bibliography), 63 from personal communications or observations, and the rest from other sources. In general, 3,522 registers were considered (1,738 in the Uruguay and 1,784 in the Brazil), totaling 1,041 different localities. One hundred twenty five species were identified (80 from Uruguay and 117 from Rio Grande do Sul), being seven of them endemic species and six extinct species at the moment. The rodents together with the bats and the marsupials conform 68.6% of the genera found. Also, the two former exceed 60% of the total number of species. Largest richness was found in most studied areas. Cluster analysis showed two welldefined groups of OGUs: 1. Uruguay and Campanha Gaucha region and 2. Atlantic coast, East and Center of Rio Grande do Sul State. Concerning the neighbour areas we observed a group structured by the forestal Provinces in which the study area was included. The Ecoregions analysis showed three groups, and the one composed by forestal and/or tropical regions also integrate the study area. There were significant differences related to locomotor habits when comparing the structure of community with neighbour regions and marginally significant differences concerning diet. However, when comparing the diet with similar environments of temperate grasslands in other continents there were significant difference, which means little similitude between the mammalian communities. Finally, we identified 31 species with some degree of threat in the Pampas from Rio Grande do Sul and 21 from Uruguay, with 47 threatened species in the region (37,5% of the total). This work intended to collaborate with essential information in order to elaborate conservation politics that consider the entire region, independent of the countries which compose it.

Até recentemente, o povoamento das Américas era visto como um produto de uma expansão em linhas paralelas do norte para o sul do continente. Sob este cenário, os sítios arqueológicos dos primeiros americanos deveria obedecer um gradiente cronológico seguindo a mesma lógica, independente de sua longitude. Recentemente, no entanto, especialistas começaram a reconhecer que certas características dos diferentes biomas poderiam favorecer diferentes taxas de expansão populacional. Beaton (1991), por exemplo, sugeriu que as expansões humanas em escala continental seriam mais condicionadas às características do ambiente (biomas) de que a distâncias geográficas lineares, ideia esta, também suportada por Dixon (2001). Neste estudo foi testada a hipótese de Beaton e Dixon, aplicada às Américas, investigando se a estrutura genética dos nativos americanos atuais é influenciada pelos biomas que elas ocupam. Para fazer isso, três diferentes tipo de matrizes foram construídas baseadas em dados de DNA mitocondrial e microssatélites de grupos de nativos americanos: uma, formada por distâncias genéticas (Fst) entre as populações, outra formada pelas distâncias geográficas entre as mesmas populações em quilômetros, e uma última formada pelas distâncias fisiográficas. Essas matrizes foram comparadas pela correlação de Pearson seguida de testes de Mantel e parciais de Mantel. Os resultados obtidos mostraram que em geral os diferentes biomas não tiveram um papel significativo na estruturação genética das populações nativas americanas, ao menos como estão distribuídas hoje. / Until recently, the settlement of the Americas was seen as the product of a \"bow wave\" human expansion from north do south. Under this scenario, the archaeological sites of the first americans should obey a chronological gradient following the same logic, independent of their longitude. Recently, however, specialists began to recognize that certain characteristics of different biomes could have favored different rates of demic expansion. Beaton (1991), for instance, suggested that human expansions in continental scales are much more conditioned by the ecological attributes of the macro environmental zones (biomes) involved than by linear geographic distances, an idea also spoused by Dixon (2001). In this study we test Beaton´s and Dixon´s ideas, as applied to the Americas, by investigating if the genetic structure of recent native american populations is influenced by the biomes they occupy. In order to do this, three different kinds of matrices were constructed based on the frequency of mtDNA and microsatelites from native american groups: one formed by the genetic distances (Fst) among the populations, a second one formed by the geographic distances among the same populations in kilometers, and a last one formed by their \"physiographic\" distances. These matrices were compared by Pearson´s correlation followed by Mantel and partial Mantel tests. The results obtained showed that in general the different biomes did not play a significant role in the native american genetic structuring, at least as they are distributed today.

A história evolutiva dos animais é altamente influenciada pela história do ambiente em que estes vivem. A floresta Atlântica é uma das mais biodiversas do mundo, e a segunda maior na região Neotropical. A história biogeográfica desta floresta é complexa, sendo que inúmeros fatores devem ter contribuído para a diversificação de sua biota. Esta dissertação estudou os padrões de distribuição da diversidade genética e morfológica em Didelphis aurita, uma espécie de marsupial didelfídeo, endêmico desta floresta, a fim de esclarecer eventos biogeográficos que tenham desempenhado um papel importante na história da floresta. A distribuição desta espécie é concordante com a distribuição da floresta, do norte do Rio Grande do Norte ao sul do Rio Grande do Sul. Os resultados mostraram que existe uma população muito divergente na porção nordeste desta distribuição (estados de Alagoas e Pernambuco), sendo que o grau de divergência tanto molecular quanto morfológica é um indicativo de que se trata de outra espécie. Além disso, os dados apontam que há pouco ou nenhum fluxo gênico entre as duas espécies. O relacionamento deste grupo do Nordeste com a espécie D. aurita e sua espécie irmã D. marsupialis, não pôde ser solucionado. No entanto, o evento de separação foi datado entre 800-500 mil anos, no período Quaternário. Uma vez que a Mata Atlântica e Floresta Amazônica sofreram vários eventos de expansão e retração nesta época, sugeriu-se que a dinâmica climática do Quaternário tenha desempenhado um importante papel na divergência deste grupos. Além disso, D. aurita (excluindo-se a população do Nordeste) foi estudado a fim de testar as predições da hipótese de Refúgios nesta floresta para este grupo. Os padrões de diversidade genética e morfológica dentro deste grupo foram concordante com várias das premissas da Hipótese de Refúgios, porém ao datar-se o evento de expansão, este, é mais antigo do que o previsto para a hipótese. Não obstante, dados de simulação mostraram que testes de refúgios baseados nestas premissas simplistas, podem não ser aplicáveis a história da Mata Atlântica. Desta forma, embora haja indícios de que a Hipótese de Refúgios tenha sido importante para a diversidade deste grupo, é necessário avaliar se esta expansão demográfica realmente deve-se a dinâmica climática do Quaternário e, portanto, avaliar se a diversidade encontrada nesta população pode ser explicada pela hipótese de Refúgios. / The evolutionary history of animals is highly influenced by the history of the environment where these animals live. The Atlantic rainforest is one of the most diverse in the world, and the second largest forest in the Neotropics. The biogeographical history of this forest is complex, and numerous factors might have played a role in the diversification of the biota. This dissertation has studied the patterns of distribution of the genetics and morphological variation in Didelphis aurita, a Didelphidae marsupial, endemic from this forest. This study aims to clarify the biogeographical events that have been important in the diversification of the Atlantic biota. D. aurita distribution is concordant with the forest distribution, going from the north of Rio Grande do Norte state to the south of Rio Grande do Sul state. The results have showed a very diverging population in the northeast distribution (Alagoas and Pernambuco states), and both molecular and morphological divergences indicate that it might be a different species. Moreover, both species might have very low or none gene flow between them. The phylogenetic relationship between this population with the other two species (D. aurita and D. marsupialis), cannot be solved. Even so, the separation event has been dated about 500-800 hundreds years ago, in the Quaternary period. Seeing that both Neotropical forests (Atlantic and Amazonian forests) have experienced several expansions and retractions events in this period, it has been suggested that the climatic dynamics of this period might have played a key role in the divergence of the three species. Moreover, D. aurita (excluding the Northeast population) has been studied with the purpose of testing the Refugee hypothesis in this forest. The genetic and morphological and molecular variations patterns are in agreement with several of this Hypothesis premises. However, the dating of the expansion event is not in agreement with the hypothesis, once it\'s much older than expected. Moreover, simulated data showed that this Refugee tests based in such simplistic assumptions might not be applicable to the history of the Atlantic forest. In this way, even though there are evidences supporting that the Quaternary climate oscillations have been important for this group, it is necessary to evaluate if this demographic expansion is really due to the cyclic glaciations events, and hence evaluate the roll of the Refugee hypothesis for this population.

Os roedores Cricetidae (Myomorpha, Muroidea) são representados por cinco subfamílias: Arvicolinae, Cricetinae, Neotominae, Tylomyinae e Sigmodontinae. Os Sigmodontinae, por sua vez, são os representantes sul-americanos com a quase totalidade das espécies pertencentes a esta subfamília. Representa o mais diversificado grupo de mamíferos da América do Sul, o que significa aproximadamente 20% da mastofauna do continente. Algumas contribuições marcaram as pesquisas paleontológicas dos Sigmodontinae sul-americanos, como os registros do naturalista dinamarquês Peter Lund, que coletou grande número de material nas grutas e cavernas de Lagoa Santa, Minas Gerais. Todavia, os dados paleontológicos são escassos quando comparados à diversidade atual dos roedores sigmodontíneos. Com relação à região do Parque Nacional Serra da Capivara, no estado do Piauí, conhecida pelas descobertas arqueológicas e paleontológicas, numerosos restos de mamíferos de pequeno porte foram recuperados de grutas e abrigos calcários, entre eles os roedores Sigmodontinae, objeto do presente trabalho Os materiais estudados provenientes de três localidades da região (Toca do Gordo do Garrincho, Toca do Barrigudo e Toca do Serrote das Moendas) foram identificados e descritos. São registrados aqui: Bibimys labiosus, Necromys lasiurus, Cerradomys sp., Holochilus sciureus, Pseudoryzomys simplex, Calomys sp. e Wiedomys sp. Aspectos ecológicos e biogeográficos de cada táxon também foram considerados para discutir aspectos paleoambientais da região, destacando-se o primeiro registro de B. labiosus para o Quaternário do nordeste brasileiro, sugerindo uma distribuição paleobiogeográfica diferente da atualmente conhecida para espécie. Assim, contribuímos com novos registros de sigmodontíneos para a Serra da Capivara, ampliando o conhecimento sobre o grupo no Quaternário do nordeste do Brasil e mostrando que os materiais recuperados na região apresentam grande potencial para fornecer esclarecimentos sobre a dinâmica biogeográfica dos Sigmodoninae ao longo do Quaternário. / The Cricetidae rodents (Myomorpha/Muridae) are composed by five groups: Arvicolinae, Cricetinae, Neotominae, Tylomyinae and Sigmodontinae. The Sigmodontinae are the South American representatives with almost all Cricetidae species in this subfamily. They are the most diverse mammalian taxon in South America, which means about 20% of South American mammalian fauna. Some important contributions marked the Sigmodontinae paleontological researches in south American, as the records of the Danish naturalist Peter Lund, who collected numerous materials in Lagoa Santa caves, Minas Gerais. However, the paleontological data are scarce when compared to current sigmodontinae diversity. In relation to the region of Serra da Capivara National Park, State of Piauí, is known by archaeological and paleontological researches, and there many remains of small mammals were recovered from caves and rock shelter, between them the Sigmodontinae rodents are the object of this study. Remains of the Sigmodontinae from three shelters in the region (Toca do Gordo do Garrincho, Toca do Barrigudo e Toca do Serrote das Moendas) that were identified and described. The taxa identified is: Bibimys labiosus, Necromys lasiurus, Cerradomys sp., Holochilus sciureus, Pseudoryzomys simplex, Calomys sp. e Wiedomys sp. Ecological and biogeographical feature from each taxon were evaluated to discuss the feature paleoenvironment from region, with the first quaternary record from B. labiosus in Brazilian northeast, that suggest a different paleobiogeographic range from currently know. Therefore, we contributed through new Sigmodontinae records from Serra da Capivara, expanding the quaternary sigmodontinae knowledge from Brazilian northeast and showing that there are a large potential for clarify the Sigmodontinae biogeographic dynamic.

A costa austral da América do Sul (CAAS) e o oceano Austral (OA) possuem grande variedade de habitats e estão historicamente conectados desde a abertura da passagem de Drake. A fauna marinha de ambas as regiões é altamente diversa e muitas espécies possuem distribuições geográficas contraditórias, como é o caso dos hidroides bentônicos (Cnidaria, Hydrozoa). Toda essa heterogeneidade faunística atrai estudos adicionais em biogeografia, envolvendo a busca por áreas de endemismo e outros padrões de distribuição geográfica. Uma atualização do status taxonômico das espécies de hidroides bentônicos da CAAS e OA foi feito, reunindo informações sobre sua riqueza, grau de endemismo, substrato biológico e distribuição geográfica. Um total de 5.621 amostras e 359 morfoespécies de hidroides bentônicos foram levantadas para a área de estudo e checadas taxonomicamente, sendo 256 identificadas até o nível específico. Os registros de presença e ausência ao longo da área foram usados em uma análise de similaridade pelo índice de Bray-Curtis, sendo os resultados sintetizados em \"clusters\" hierárquicos e nMDS. A taxa de endemismo para ambos a CAAS e OA foi de 54%, sendo o OA responsável por 88% dos registros de espécies endêmicas. As espécies de leptotecados foram as que apresentaram maior amplitude de distribuição horizontal e vertical. A maior parte das espécies de hidroides bentônicos levantadas são substrato-generalistas. Treze assembleias ecológicas de hidroides bentônicos foram encontradas ao longo da CAAS e OA, as quais foram relacionadas com a dinâmica oceanográfica da área e comparadas com ecorregiões, realms, assembleias e áreas de endemismo previamente delimitadas para a região. As áreas de endemismo para a CAAS e OA foram hipotetizadas por meio da Análise de Endemicidade (AE) em uma otimização pelo software NDM-VNDM, com uma grade de 10° latitude X 10° longitude. Nove (F=0.5) e 10 (F=1.0) áreas consensuais de endemismo foram historicamente relacionadas com o isolamento da Antártica e comparadas com hipóteses já existentes para a CAAS e OA. Todas as áreas foram discutidas considerando-se os processos de vicariância e dispersão, e com relação ao real grau de endemicidade que elas representam. Uma PAE também foi realizada mas apenas com 61 espécies de hidroides bentônicos endêmicos da região acima de 45°S. Essa análise foi feita com o objetivo de reanalisar os dados previamente publicados por Marques & Peña Cantero (2010), inserindo um conjunto de dados complementar para a obtenção de uma melhor definição e acurácia nas áreas de endemismo delimitadas para a região. Oito áreas de endemismo foram definidas como subregiões dos padrões previamente encontrados. O uso de diferentes técnicas e conjuntos de dados biogeográficos são meios alternativos para clarear padrões gerais de áreas de endemismo e também outros padrões relacionados à comunidades ecológicas e estudos em conservação da biodiversidade / The southern South America (SSA) coast and the Southern Ocean (SO) have a high differentiation of habitats and are historically connected since the opening of the Drake Passage. The marine fauna of both regions are connected, highly diverse and many species are contradictory distributed, such as the benthic hydroids (Cnidaria, Hydrozoa). All this faunistic heterogeneity calls attention for additional biogeographic investigations, involving the search for areas of endemism and other geographic distribution patterns. An update of the taxonomic status of the species of benthic hydroids from SSA and SO was carried out, gathering information about their richness, endemicity level, biological substrates and geographic distribution. A total of 5.621 samples and 359 morphospecies of benthic hydroids were surveyed for the studied area and taxonomically checked, being 256 identified up to the specific level. The records of presence-absence along the SSA and SO were used in a Bray-Curtis similarity analysis and the results were synthesized in hierarchical clusters and nMDS. The level of endemism at both the SSA and the SO is 54%, being the SO responsible for 88% of the records of endemic species. Leptothecate species had the widest horizontal and vertical distribution and most part of the benthic hydroids surveyed were considered substrate-generalists. Thirteen ecological assemblages of benthic hydroids were found along the SSA and SO and compared with the oceanographic dynamics of the area, as well as with earlier ecoregions, realms, assemblages, and areas of endemism delimited for the region. Areas of endemism were hypothesized for the SSA and SO using the Endemicity Analysis (EA) through an optimization performed by the software NDM-VNDM, with a 10° latitude X 10° longitude grid. Nine (F=0.5) and 10 (F=1.0) consensus areas of endemism were historically related with the isolation of Antarctica, and compared with previous hypotheses for the SSA and SO. All areas were discussed in the context of vicariance/dispersal processes, and concerning the real degree of endemicity that they represent. PAE was also performed but only with 61 endemic species of benthic hydroids for the region above the 45°S. This analysis was carried out with the aim to reanalyze previous data already published by Marques & Peña Cantero (2010), inserting a complementary dataset in order to obtain a better definition and accuracy in the areas of endemism delimited for the region. Eight areas of endemism were defined as subregions of the patterns previously found. The use of different techniques and biogeographic datasets are alternative strategies to clarify general patterns of areas of endemism, as well as other patterns related with ecological communities and studies in conservation biology

Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Denise de Cerqueira Rossa Feres / Banca: Cynthia Peralta de Almeida Prado / Banca: José Perez Pombal Junior / Banca: Paulo Christiano de Anchieta Garcia / Resumo: A Mata Atlântica é um dos biomas mais biodiversos e, ao mesmo tempo, mais ameaçados do planeta. Estudos com anuros têm corroborado este padrão de diversidade, demonstrando que há grande variação na composição de espécies, mesmo entre localidades próximas neste bioma. Sob estas condições estudos de comunidades com anuros são de alta relevância e oportunos para investigar os fatores que estruturam as comunidades. Deste modo, foram caracterizadas as espécies de anuros de uma área de Mata Atlântica, detalhando a estrutura da comunidade. Investigou-se a organização sazonal das espécies, o padrão de uso do ambiente e a partilha dos recursos e a similaridade com outras taxocenoses do Sul e Sudeste. Para tanto, foram feitas 25 amostragens no Núcleo Santa Virgínia do Parque Estadual da Serra do Mar. As espécies em atividade vocal e demais evidências de reprodução foram registradas e as vocalizações gravadas. Nas excursões, durando de quatro a oito dias, eram amostrados e registrados os ambientes usados pelos anuros. Foram registradas 50 espécies de anuros sendo a ampla maioria tipicamente associada à Mata Atlântica. Na atividade sazonal ocorreu uma gradação entre espécies restritas aos meses do verão, passando por espécies com período mais amplo de atividade, até espécies restritas ao inverno. O padrão de uso do ambiente em geral refletiu a filogenia e a maior sobreposição nesta dimensão do nicho ocorreu entre espécies aparentadas, apesar de também ocorrerem convergências entre espécies pouco aparentadas. Restrições herdadas são mais razoáveis para explicar os padrões gerais de uso do ambiente do que competição interespecífica ou predação ocorrendo no presente. A taxocenose de anuros deste estudo se assemelhou àquelas situadas em áreas serranas da Mata Atlântica. A similaridade na composição de espécies entre as localidades está fortemente relacionada às distâncias geográficas entre elas. / Abstract: The Atlantic forest is one the world's most diverse biomes and at the same time on of the most threatened. Studies on frogs are confirming this pattern, showing great variance in species composition, even among close localities in this biome. From this perspective, studies on frog communities are of extreme importance to elucidate the factors structuring these communities. Thus, herein we characterize the frog species from a locality in the Atlantic Forest, providing details on community structure. Seasonal activity of species, pattern of habitat use, resource partitioning, and species composition similarity between regions in the South and Southeast Brazil were investigated. Twenty-five samples were carried out at Núcleo Santa Virgínia, at the Serra do Mar State Park, São Paulo state, southeast Brazil. Calling activity of species, other reproductive evidences, and vocalizations were registered. During the surveys, which lasted from four to eight days, habitats used by the species were sampled and characterized. A total of 50 anuran species was registered; the great majority typical of the Atlantic Forest. Regarding seasonality, we detected a continuum from species with activity during the summer, to species exhibiting a more prolonged season, up to species restricted to the winter. Habitat use, in general, reflected the phylogeny and the greater overlap occurred among close related species, although convergence among distant species was also observed. Restrictions related to phylogeny are more plausible to explain the general pattern of habitat use observed here, than are present interspecific competition or predation. Community composition at the study site was more similar to those from montane areas located in the Atlantic Forest and species composition similarity was strongly related to the geographic distances among them. Localities under the influence of the Atlantic Forest are less similar among them than are those ... / Doutor

A Política Nacional do Meio Ambiente completou 25 anos em 2006. Houve muitos avanços no planejamento ambiental tanto para criação de Unidades de Conservação como para o processo de licenciamento ambiental de atividades de grande porte, por meio do Estudo de Impacto Ambiental e suas decorrências. Por outro lado, em muitos aspectos do planejamento, a fauna foi ignorada ou abordada com superficialidade. Neste trabalho, considera-se a ampla distribuição histórica de felinos na américa do sul e evidencia-se a existência de felinos de grande porte (Puma concolor) e dos pequenos gatos selvagens na região entre as rodovias Fernão Dias e Presidente Dutra no Estado de São Paulo. Evidencia-se, também um mosaico de usos da terra que formam um expressivo corredor para a fauna e embasam a discussão para o necessário avanço das ferramentas de planejamento que ainda carecem de normatizações e parâmetros básicos à conservação de felinos. Propõe-se uma matriz qualitativa de avaliação de impactos ambientais e monitoramento de obras lineares para felinos. / The National Policy of the Environment completed 25 years in 2006. There were several advances in the environmental planning both for the creation of Conservation Units and for the process of environmental licence of far-reaching activities, through Environmental Impact Study and its results. On the other side, in many aspects of the planning, the fauna was ignored or tackled with superficiality. In this work, it is considered the broad historical distribution of the felines in South America and it is showed the existence of big felines (Puma concolor) and small wild cats in the region between the highways Fernão Dias and Presidente Dutra, in the State of São Paulo. It is showed as well a mosaic of land uses that constitutes an important fauna corridor and supports the discussion for the necessary advance of the planning tools that still need standardization and basic parameters for the felines conservation. It is proposed a qualitative evaluation mould for environmental impacts and linear constructions for felines.

A história evolutiva dos animais é altamente influenciada pela história do ambiente em que estes vivem. A floresta Atlântica é uma das mais biodiversas do mundo, e a segunda maior na região Neotropical. A história biogeográfica desta floresta é complexa, sendo que inúmeros fatores devem ter contribuído para a diversificação de sua biota. Esta dissertação estudou os padrões de distribuição da diversidade genética e morfológica em Didelphis aurita, uma espécie de marsupial didelfídeo, endêmico desta floresta, a fim de esclarecer eventos biogeográficos que tenham desempenhado um papel importante na história da floresta. A distribuição desta espécie é concordante com a distribuição da floresta, do norte do Rio Grande do Norte ao sul do Rio Grande do Sul. Os resultados mostraram que existe uma população muito divergente na porção nordeste desta distribuição (estados de Alagoas e Pernambuco), sendo que o grau de divergência tanto molecular quanto morfológica é um indicativo de que se trata de outra espécie. Além disso, os dados apontam que há pouco ou nenhum fluxo gênico entre as duas espécies. O relacionamento deste grupo do Nordeste com a espécie D. aurita e sua espécie irmã D. marsupialis, não pôde ser solucionado. No entanto, o evento de separação foi datado entre 800-500 mil anos, no período Quaternário. Uma vez que a Mata Atlântica e Floresta Amazônica sofreram vários eventos de expansão e retração nesta época, sugeriu-se que a dinâmica climática do Quaternário tenha desempenhado um importante papel na divergência deste grupos. Além disso, D. aurita (excluindo-se a população do Nordeste) foi estudado a fim de testar as predições da hipótese de Refúgios nesta floresta para este grupo. Os padrões de diversidade genética e morfológica dentro deste grupo foram concordante com várias das premissas da Hipótese de Refúgios, porém ao datar-se o evento de expansão, este, é mais antigo do que o previsto para a hipótese. Não obstante, dados de simulação mostraram que testes de refúgios baseados nestas premissas simplistas, podem não ser aplicáveis a história da Mata Atlântica. Desta forma, embora haja indícios de que a Hipótese de Refúgios tenha sido importante para a diversidade deste grupo, é necessário avaliar se esta expansão demográfica realmente deve-se a dinâmica climática do Quaternário e, portanto, avaliar se a diversidade encontrada nesta população pode ser explicada pela hipótese de Refúgios. / The evolutionary history of animals is highly influenced by the history of the environment where these animals live. The Atlantic rainforest is one of the most diverse in the world, and the second largest forest in the Neotropics. The biogeographical history of this forest is complex, and numerous factors might have played a role in the diversification of the biota. This dissertation has studied the patterns of distribution of the genetics and morphological variation in Didelphis aurita, a Didelphidae marsupial, endemic from this forest. This study aims to clarify the biogeographical events that have been important in the diversification of the Atlantic biota. D. aurita distribution is concordant with the forest distribution, going from the north of Rio Grande do Norte state to the south of Rio Grande do Sul state. The results have showed a very diverging population in the northeast distribution (Alagoas and Pernambuco states), and both molecular and morphological divergences indicate that it might be a different species. Moreover, both species might have very low or none gene flow between them. The phylogenetic relationship between this population with the other two species (D. aurita and D. marsupialis), cannot be solved. Even so, the separation event has been dated about 500-800 hundreds years ago, in the Quaternary period. Seeing that both Neotropical forests (Atlantic and Amazonian forests) have experienced several expansions and retractions events in this period, it has been suggested that the climatic dynamics of this period might have played a key role in the divergence of the three species. Moreover, D. aurita (excluding the Northeast population) has been studied with the purpose of testing the Refugee hypothesis in this forest. The genetic and morphological and molecular variations patterns are in agreement with several of this Hypothesis premises. However, the dating of the expansion event is not in agreement with the hypothesis, once it\'s much older than expected. Moreover, simulated data showed that this Refugee tests based in such simplistic assumptions might not be applicable to the history of the Atlantic forest. In this way, even though there are evidences supporting that the Quaternary climate oscillations have been important for this group, it is necessary to evaluate if this demographic expansion is really due to the cyclic glaciations events, and hence evaluate the roll of the Refugee hypothesis for this population.

Neste estudo a assembleia de cocolitoforídeos de 44 amostras de sedimentos marinhos de superfície da Margem Continental Brasileira foram analisados e comparados com os parâmetros oceanográficos locais. Com o intuito de obter um melhor entendimento da área de estudo, foram incluídas as análises de 36 amostras do estudo de Boeckel et al. (2006). A partir destes dados, os padrões de abundância das principais espécies e suas afinidades ecológicas foram verificadas. E. huxleyi, F. profunda e Gephyrocapsa spp. são as espécies mais abundantes. E. huxleyi dominou as assembleias características de águas mais frias e ricas em nutrientes, Gephyrocapsa spp. as regiões com menores profundidades da camada de mistura, ou seja, estas espécies demonstram uma preferência por uma nutriclina mais rasa. Por outro lado, F. profunda, foi mais abundante nas águas quentes e oligotróficas das regiões subtropicais, revelando sua preferência por uma nutriclina mais profunda. Além disso, os resultados da Análise de Correspondência Canônica revelaram uma afinidade de C. leptoporus, E. huxleyi, C. pelagicus e G ericsonii com águas mais enriquecidas em nutrientes. Em contraste, Gephyrocapsa spp. e Helicosphaera spp. foram associadas a regiões mesotróficas. Uma vez que G. flabellatus e D. tubifera parecem estar associadas a águas com camadas de mistura mais profundas, elas podem ser utilizadas, juntamente com F. profunda, como indicadoras de uma termo/nutriclina mais profunda. A partir de análise de clusters e análise por componentes principais, 4 províncias foram identificadas e parecem refletir as características oceanográficas da zona fótica. / In this study the coccolitophore assemblages of 44 samples of marine surface sediments from the Brazilian Continental Margin were analyzed and compared with the local oceanographic parameters. In order to obtain a better understanding of the study area, were included the analysis of 36 samples from the study by Boeckel et al. (2006). From these data, the abundance patterns of the main species and their ecological affinities were verified. E. huxleyi, F. profunda and Gephyrocapsa spp. are the most abundant species. E. huxleyi dominated the assemblages characteristic of colder and nutrient-rich waters, Gephyrocapsa spp. the regions with lower mixed layer depths, in other words, these species demonstrate a preference for a shallower nutricline. On the other hand, F. profunda, was more abundant in the warm and oligotrophic waters of the subtropical regions, revealing its preference for a deeper nutricline. In addition, the results of the Canonical Correspondence Analysis revealed an affinity of C. leptoporus, E. huxleyi, C. pelagicus and G ericsonii for waters enriched in nutrients. In contrast, Gephyrocapsa spp. and Helicosphaera spp. were associated with mesotrophic regions. Since G. flabellatus and D. tubifera appear to be associated with waters that have deeper mixed layers, they may be used, along with F. profunda, as indicators of a deeper nutricline. From the cluster analysis and by the principal components analysis, 4 provinces were identified and seems to reflect the oceanographic characteristics of the photic zone.