Made available in DSpace on 2014-07-29T12:05:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Mayra Pimenta.pdf: 1174963 bytes, checksum: 7ad5f60f55916118d1a33e942aa966e9 (MD5) Previous issue date: 2011-03-18 / Knowledge of the composition of natural communities and their responses to anthropogenic alterations is essential for determining the conservation status of a given system and prioritizing management actions. Anthropogenic impacts could cause a reduction in biodiversity not only due to habitat loss, but also due the loss of habitat heterogeneity across given landscape, especially in systems characterized by a mosaic of different elements (e.g. the Cerrado vegetation in central Brazil). Here we evaluate leaf beetle Coleoptera/Chrysomelidae) as bioindicators in a system whith varying intensities of human impacts and different phyto-physionomies (from open field to forests). We collected 1117 leaf beetle belonging to 245 species, of which 12 species and 5 genus were considered possible bioindicators based on IndVal measure. Higher species richness was observed in forests and regenerating fields, and habitats with lower species richness included pastures, mines and veredas. Only the Eucalyptus areas had a high abundance of Chrysomelidae, followed by forests and the other habitats, which were not significantly different from each other. Natural fields, regenerating fields, natural cerrados and forest had higher values of β-diversity. In general, the proportion of Chrysomelidae over total Coleoptera and over herbivorous Coleoptera were not able to distinguished among the habitats. The large number of rare leaf beetle species, the high proportion of restricted species and the high β-diversity of the natural areas made it difficult to utilize individual of species as a bioindicator. The use of the genus Chrysomelidae as a biondicator of habitat quality, was considered more effective than using individual species. Bioindicator systems that include not only species richness and abundance but also assemblage composition are needed to allow for a better understanding of Chrysomelidae response to environmental disturbance. OBS: Summary of chapter 1. Thesis with three chapters. / O conhecimento da composição das comunidades naturais e de suas respostas as alterações antropogênicas é essencial para determinar o estado de conservação de um determinado sistema e priorizar ações de manejo. Impactos antropogênicos poderiam causar uma redução da biodiversidade, não só devido à perda de habitat, mas também devido à perda de heterogeneidade de habitats em determinada paisagem, especialmente em sistemas caracterizados por um mosaico de diferentes elementos (por exemplo, a vegetação de Cerrado no Brasil Central). Aqui nós avaliamos crisomelídeos (Coleoptera / Chrysomelidae) como bioindicadores em um sistema com diferentes intensidades de impactos humanos e diferentes fitofisionomias (de campo aberto às áreas florestais). Foram coletados 1117 crisomelídeos, pertencentes a 245 espécies, das quais 12 espécies e 5 gêneros foram considerados bioindicadores possíveis, baseada na métrica de IndVal. Uma maior riqueza de espécies foi observada em florestas e campos de regeneração, e os habitats com menor riqueza de espécies foram pastagens, minas e veredas. Áreas de eucalipto apresentaram uma grande abundância de Chrysomelidae, seguido por matas e outros tipos habitats, que não foram significativamente diferentes entre si. Campos naturais, campos em regeneração, cerrados e matas apresentaram maiores valores de diversidade beta. Em geral, a proporção de Chrysomelidae sobre o total de coleópteros e de coleópteros herbívoros não foram capazes de apontar variações entre os tipos habitats. O grande número de espécies raras de crisomelídeos, a alta proporção de espécies de distribuição restrita e os altos valores de diversidade beta das áreas naturais dificultam a utilização de espécies como bioindicadores. O uso do gênero de Chrysomelidae como biondicador da qualidade do habitat, foi considerado mais eficaz do que a utilização de espécies individuais. Sistemas biondicadores, que incluam não apenas a riqueza de espécies e abundância, mas também a composição das assembléias, são necessários para permitir um melhor entendimento da resposta Chrysomelidae às perturbações ambientais. OBS: Resumo do capítulo 1. Tese com 3 capítulos

A bacia do rio Piracicaba tem recebido atenção especial das autoridades municipais, pois possui grandes problemas de aproveitamento de seus recursos hídricos. A bacia do rio Corumbataí, um dos principais afluentes da margem direita do rio Piracicaba, é regionalmente importante, não só porque ainda possui águas de boa qualidade, mas também por apresentar elementos raros na paisagem do interior do estado. Esta tese teve o objetivo de caracterizar as assembléias de peixes na bacia do rio Corumbataí e fornecer ferramentas para avaliação de seu status ambiental. Foram escolhidos 4 rios principais com 3 pontos de coleta em cada um. Foram realizadas coletas no período de março a junho e setembro a dezembro de 2001, totalizando 24 coletas. Os dados bióticos foram avaliados através de medidas de diversidade. Para testar a hipótese de variação espaço-temporal da assembléia de peixes foi aplicado o modelo linear ANCOVA onde a variável resposta foi a riqueza de espécies; o fator foi ordem do rio; sendo utilizadas 2 covariáveis ambientais: temperatura e número de indivíduos, revelando uma variação espaço-temporal e padrões reconhecidos no meio acadêmico: relação espécie-área e conceito de rio contínuo. Técnicas multivariadas foram aplicadas para determinar a correlação entre a riqueza e a paisagem no entorno do ponto de coleta, revelando que existem mais espécies em locais com maior cobertura vegetal e mata ciliar preservada. Algumas espécies de peixes se mostraram bons indicadores ambientais: Hypostomus strigaticeps, Hoplosternum littorale e Salminus hilarii; por outro lado o Astyanax altiparanae não se mostrou um bom indicador / The Piracicaba river basin has received special attention from local authorities because it has presented a lot of problems about the misutilization of its hydric resources. The Corumbataí river basin, one of the major streams of the right side of the Piracicaba river, is regionally important, not only because it still has good water quality but also because it has unique elements inside the landscape of São Paulo state. This thesis aims to characterize the fish assemblage of the Corumbataí river basin and provide tools to assess the present environmental status of the basin. It has been chosen 4 major streams with 3 unit samples in each one of the streams. The samples were carried out from March to June and from September to December in the year of 2001, making up a total of 24 samples. The biotic data were assessed using diversity measurement. An ANCOVA was used to test the hypothesis of time-space variation of the fish assemblage, where the dependent variable was the species richness; the factor was the stream order and 2 environmental co-variates were used: temperature and number of individuals, thus revealing both time-space variation and some patterns which are recognized academically: species-area relationship and river continuum concept (RCC). Multivariate techniques were used to determine the correlation between richness and the landscape characteristics in the sampling unit, revealing that there is a greater number of species along the sites with a larger riparian zone. Some fish species have showed to be a good indicator: Hypostomus strigaticeps, Hoplosternum littorale and Salminus hilarii; on the other hand Astyanax altiparanae has not showed to be a good indicator species

A qualidade do solo está relacionada ao seu funcionamento e é mensurada por indicadores físicos e químicos, como também por organismos, os quais desempenham as mais variadas funções ecossistêmicas. A diversidade da pedofauna nos ecossistemas pode ser afetada por vários fatores, justamente por esses invertebrados serem sensíveis às mudanças ambientais. A pesquisa avaliou a qualidade de solos de fragmentos florestais urbanos na cidade de São Paulo, especificamente nos parques Cientec, Cantareira e Jaraguá, utilizando espécies de minhocas como bioindicadoras. Foi realizada nas áreas de estudo uma coleta concentrada no inverno (09/2014; 10/2014) em ambientes seco e úmido, com o objetivo de verificar a diversidade, ocorrência, biomassa (g.m²) e densidade (Ind.m²) dos indivíduos coletados e sua relação com as variações ambientais, especialmente com a temperatura do solo, profundidade do solo, presença e ausência de drenagem na parcela e atributos químicos como, pH, C.O, K, P, Ca, Mg e Al. Delimitou-se aleatoriamente, em ambiente seco e úmido, uma área fixa de 1,7 hectare por parcela amostral, onde foram amostrados nove TSBF por ambiente, com espaçamento de 30 m entre cada ponto e 20 m de bordadura, totalizando 54 pontos amostrais. Os exemplares de pedofauna subsuperficial foram capturados pela técnica TSBF (Tropical Soil Biology and Fertility), que consiste em monólitos de 30x30 de largura e 30 cm de profundidade. Após a triagem do solo os exemplares foram colocados em soluções de álcool 92%, e posteriormente, mensurados estatisticamente pelos índices de diversidade, equabilidade, e biomassa; por fim, foram identificados ao nível de espécie, as minhocas, e ao nível de família e gênero, as classes arachnida, coleoptera, quilopoda e diplopoda. Nos mesmos pontos do TSBF foram coletadas amostras de solo para a análise dos atributos químicos, assim como foram utilizados dados climáticos para avaliação de atributos físicos, que serviram como variáveis ambientais explicativas. Dos atributos climáticos, nos meses analisados a precipitação mensal não atingiu 70 mm e, em geral, ficou abaixo da média climatológica, caracterizando um período extremamente seco. Encontrou-se uma correlação positiva entre temperatura do solo, diversidade ecológica funcional, distribuição vertical no solo, hábito alimentar e dinâmica de biopedoturbação das minhocas. A umidade do solo influenciou diretamente ocorrência de Ind.m², além de favorecer espécies e gêneros específicos. Na análise de parâmetros químicos, a diminuição da acidez do solo, o aumento do teor de C.O e elevada disponibilidade de macronutrientes influenciaram no aumento de Ind.m² e o que justifica os 159 Ind.m² em ambiente seco e 148 Ind. m² em ambiente úmido para o Parque Jaraguá, representando 46% do total de exemplares coletados. O parque Cientec e Cantareira apresentaram solos muito ácidos e menores índices de C.O e macronutrientes se comparados com o parque Jaraguá, totalizando 24% e 30% dos exemplares coletados. Os índices bioestatísticos apontaram que as minhocas foram predominantes, tanto em densidade (minhocas.m²) quanto em biomassa (g.m²) dentre toda a macrofauna edáfica coletada e confirmaram que as variáveis químicas e climáticas do solo tem maior relevância para explicar a diversidade, ocorrência, biomassa e densidade de minhocas e consequentemente, as funções ecossistêmicas desempenhadas pelas mesmas. / Soil quality is related to its functioning and is measured by physical and chemical indicators, but also by organisms inserted therein, which play the most diverse ecosystem functions. The diversity of soil macrofauna in ecosystems can be affected by many factors, due these organisms being sensitive to environmental changes. The research evaluated the quality of urban forest fragments soils in São Paulo, specifically in Cientec, Cantareira and Jaraguá parks, using earthworms as bioindicators. It was performed at study sites a concentrated collection in winter (09/2014, 10/2014), in dry and wet environments, in order to assess the diversity, occurrence, biomass and density of individuals collected in accordance with variations in environment ,especially with soil temperature, soil depth, presence and absence of the drainage portion and chemical attributes such as , pH, O.C, K, Ca, Mg and Al. Delimited randomly, in a dry and humid environment a fixed area of 1.7 hectare per plot sample, where was sampled nine TSBF per environment, with spacing of 30 m between each point and 20 m margin, totaling 54 sampling points. Exemplary subsurface pedofauna were captured by adapted TSBF technique (Tropical Soil Biology and Fertility) consisting of monoliths 30x30 wide and 30 cm deep. After the soil screening the specimens were fixed in 92% alcohol solution and subsequently measured statistically by the diversity index, equability, and biomass; finally, were identified to species level, earthworms, and the family level and genus, the arachnida, coleoptera, quilopoda and diplopoda classes. In the same points of TSBF soil samples were collected for analysis of chemical attributes, as well as climate data were used for evaluation of physical attributes, which served as explanatory environmental variables. About the climatic attributes in the analyzed months, the monthly rainfall did not reach 70 mm and, in general, was below the climatological average, featuring an extremely dry period. It was found a positive correlation between soil temperature, functional ecological diversity, vertical distribution in the soil, feeding habits and dynamics of bioturbation of earthworms. Soil moisture directly influenced the frequency Ind.m², besides favoring specific genus and species. In the analysis of chemical parameters, the reduction of soil acidity, increased O.C. content and the high nutrient availability influenced the increase of Ind.m² which explains the 159 ind.m² in dry conditions and 148 ind. m² in a humid environment for the Jaraguá park, representing 46% of all copies of the collection TSBF. The Cientec and Cantareira park had more acidic and lower rates of soil organic carbon and macronutrients if compared to the Jaraguá park, totaling 24% and 30% of the collected specimens. The biostatisticians indexes pointed out that the worms were prevalent in both density (earthworms.m²) and biomass (g.m²), among all the soil macrofauna collected in contrasting environments and sites and confirmed that chemical soil and climatic variables have greater relevance to explain the diversity, occurrence, biomass and density of earthworms and consequently the ecosystem functions performed by them.

Biofiltros em Areia (BFAs) estão sendo aperfeiçoados e testados no Brasil com intuito de auxiliar comunidades carentes que são menos favorecidas em relação à água de boa qualidade. O presente estudo tem como objetivo analisar a qualidade da água tratada pelos BFAs a partir de bioensaios de toxicidade, utilizando larvas do inseto Chironomus sancticaroli, oligoqueto Allonais inaequalis e peixes da espécie Danio rerio, analisando possíveis efeitos tóxicos que possam estar presentes quando a água entra em contato com o PVC do corpo do BFA, além de avaliar a toxicidade da água do poço (AP), captada para abastecimento do BFA. Nos testes de toxicidade agudo (com duração de 96h), crônico (8 dias) e testes mais longos (16 dias) com Chironomus sancticaroli, utilizou-se 240mL da solução-teste (água proveniente do BFA ou AP) em 60g de sedimento controle (areia branca fina para aquário) em 4 réplicas, sendo utilizados 6 larvas de IV ínstar por réplica no teste de toxicidade agudo e de I ínstar nos testes de toxicidade crônico e testes mais longos, alimentadas com 5mL de solução contendo 1000mL de água deionizada e 5,0g de ração tipo Tetramim®. Nos testes de toxicidade agudo e crônico com Allonais inaequalis, foram utilizados 100mL da solução-teste em 5g de sedimento controle em quatro réplicas, sendo utilizados 6 organismos por réplica, alimentados com 5mL de solução contendo 1000mL de água deionizada e 2,0g de ração tipo Tetramim® , com duração de 96h e 10 dias, respectivamente. Foram realizados apenas testes de toxicidade agudo com D. rerio no qual utilizou-se 1000mL de solução-teste e 2 organismos por réplica, em duas réplicas, com duração de 48h, sem alimentação. Os resultados apontam para uma baixa toxicidade do Biofiltro em Areia em relação às três espécies testadas. Além de um índice alto de sobrevivência, a espécie C. sancticaroli concluiu seu ciclo em testes mais longos (16 dias), além de reproduzir-se; a espécie A. inaequalis apresentou 100% de sobrevivência em todos os testes realizados; e não houve mortalidade nos testes de toxicidade agudo com D. rerio. Porém, é importante destacar que estes resultados indicam apenas dados toxicológicos para fauna em relação as efluentes testados, não sendo possível responder a questões de potabilidade da água tratada pelo BFA. Esta dissertação é parte integrante de um projeto financiado pela FAPESP (Processo nº 2014/12712-8), intitulado \"Construção e desempenho de filtros lentos domiciliares conforme a realidade das comunidades isoladas do Brasil\" que esteve sob coordenação da Profa. Dra. Lyda Patricia Sabogal Paz e do Prof. Dr. Juliano José Corbi. / Sand Biofilters (SBFs) are being refined and tested in Brazil. These studies are intended to assist needy communities with difficulties to access drinking water. The aim of the current study is analyze the quality of water treated by SBFs, using toxicity bioassays with larvae of fly Chironomus sancticaroli, oligochaete Allonais inaequalis and zebrafishes Danio rerio, as well as verify the occurrence of possible toxic effects of PVC (Polyvinyl chloride), a material component of SBFs\' structure, and also evaluate the toxicity of well water quality (AP), extracted to supply the SBF. In the acute toxicity tests (lasting 96h), chronic (lasting 8 days) and longer tests (lasting 16 days), all involving Chironomus sancticaroli, it was placed 240mL of sample solution (water from SBF or AP) in 60g of sterile sediment (fine white sand for aquarium) in four replicates, where was added 6 larvae (IV instar) in each replicate for the acute toxicity test, and larvae of I instar for chronic toxicity tests, even as in the longer tests. The organisms were fed by 5mL of Tetramim ® solution (5g/L). In the acute and chronic toxicity tests with Allonais inaequalis, it was applied 100mL of sample solution with 5g of sterile sand in four replicates, as above, it was added 6 organisms by replicate, fed by Tetramim ® (2,0g/L) for both tests, with lasting of 96h and 10 days, respectively. It was performed only tests of acute toxicity for D. rerio in which was added 1000mL of sample solution and 2 organisms for each replicate, with two replicates, with duration of 48h, without feeding. The results showed a low toxicity of sand Biofilters\' effluent in relation to the three species exposed to the liquid. Furthermore, the results demonstrate a high index of survival, even in longer tests (16 days lasting) with C. sancticaroli when the organisms could conclude their life cycle. However, besides the 100% of survival in all test, for the A. inaequalis were also observed reproduction; and in the acute toxicity tests for D. rerio it wasn\'t noticed mortality. Although, it is important to highlight that these results represent only toxicological data concerning to aquatic wildlife exposed to effluents, what is not regarding to potability issues of the water treated by SBF. This dissertation is a constituent part of a project financiad by FAPESP (Process number 2014/12712-8), entitled \"Building and performance of domiciliary slow filters according to the isolated comunities reality in Brazil\" which was coordinated by Professors PhD. Lyda Patricia Sabogal Paz and PhD. Juliano José Corbi.

O presente estudo compreendeu a caracterização dos estuários de Santos/São Vicente e Cananéia quanto aos processos naturais e antrópicos; e o estudo de traçadores biológicos - foraminíferos. Estas regiões foram escolhidas, sobretudo devido ao antagonismo no que tange o impacto antrópico e, ainda, à sua complexidade ambiental. Os resultados hidrogeoquímicos, nutrientes e concentração de metais confirmaram a maior influência humana no estuário de Santos/São Vicente, principalmente na área mais interna do sistema, em comparação com a baixa influência antropogênica do estuário de Cananéia. A distribuição dos foraminíferos bentônicos como traçadores do gradiente de tensão ecológica (natural e antrópica) foi discutida a partir da análise de amostras coletadas nos sedimentos superficiais dos estuários, comparando-se a fauna, porém, sem desconsiderar as divergências espaciais das áreas em questão. Amostras foram coletadas para realização de análise qualitativa e quantitativa, além da análise micrométrica das testas dos foraminíferos. Os resultados obtidos revelaram que a distribuição das associações de foraminíferos refletiu o padrão natural em Cananéia, no que diz respeito tanto a abundância quanto ao tamanho específico. Os dados biométricos revelaram que a região de Cananéia concentra os maiores diâmetros médios, que estão sempre associados com as campanhas de inverno. Tal fato evidencia que a matéria orgânica elevada no verão contribui para o aumento da população e não de tamanho médio de organismos. Isso demonstra um esforço reprodutivo que provavelmente visa aproveitar a disponibilidade de alimento do verão. Outros resultados pertinentes foram: estabelecimento das espécies Buliminella elegantissima e Pararotalia cananeiaensis em locais que não são correspondentes no que diz respeito às características ambientais, denotando a plasticidade destas espécies em traçar uma rota de transporte e estabelecimento, que geralmente está relacionado à deposição da matéria orgânica. A partir dos dados obtidos pode-se concluir que os foraminíferos se comportam de maneira singular, de acordo com o tensor que está regendo seu estabelecimento, e através da análise de sua distribuição, foi possível inferir se um tensor antrópico ou ambiental influenciou o estabelecimento de espécies de foraminíferos nos estuários de Santos e Cananéia. / This study had as a goal to characterize two estuaries, Santos/São Vicente and Cananéia, regarding to natural and anthropogenic parameters. Besides that, the biological trace elements - foraminiferal assemblage. The study has been held along the two estuarine areas, and both of them have shown bio-geographical patternal patches. These study areas were chosen in accordance with their antagonist impact approach and their environmental complexity. Among the advantages on developing studies that uses bioindicators to evaluate na environmental quality patterns, it is evident the large amount of experiments on the water and sediments that these areas are constantly under over than three decades. The hydrochemical results, organic content and heavy metal confirm the human influence at Santos estuary, mainly in the internal áreas, in comparison with the low rate anthropogenic influence from Cananéia estuary. Foraminiferal distribution as a ecológical tracer, both natural and human made, was discussed from sediment samples from both áreas, but always concerning about the oceanographic differences. Samples were picked up aldo to biometric analysis on the foraminiferal shells. Results show that foraminiferal distribution follows the natural patterns as the first way, both relating to abundance and size. Biometric data revealed that the largest diameter average was always associated with the winter samples. It is such evidence that the high level of organic matter contributes incrising the population, but no longer raising its diameter size. This is a sight for a reproductive effort in order to not miss out food availability during the summer. Another relevant result is: Buliminella elegantissima and Pararotalia cananeiaensis establishment in areas where they wouldnt normally settle down, denoting they do not correspond with the same variable in both study areas. This fact evidences the plasticity of these species on fitting different environment characteristic in order to establish and to reproduce. This is generally associated with organic matter deposition and makes foraminiferal distribution a singular pattern that allows determining a natural or an anthropogenic influence.

Submitted by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2018-11-07T17:34:33Z No. of bitstreams: 1 HenriqueCesarTeixeiraVerasDissertacao2013.pdf: 26147875 bytes, checksum: 3014f6ec0d791f46e4e1ee8c49894c2f (MD5) / Approved for entry into archive by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2018-11-07T17:35:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 HenriqueCesarTeixeiraVerasDissertacao2013.pdf: 26147875 bytes, checksum: 3014f6ec0d791f46e4e1ee8c49894c2f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-07T17:35:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 HenriqueCesarTeixeiraVerasDissertacao2013.pdf: 26147875 bytes, checksum: 3014f6ec0d791f46e4e1ee8c49894c2f (MD5) Previous issue date: 2013-09-06 / Humans live in constant association with microorganims. The amount of microorganims present in the human body exceeds our own cell number. That community of microorganisms has deep influence in health and disease. The use of high-throughput DNA sequencing technologies and culture independent approaches have been enlarging the understanding concerning the communities of microorganisms and the association of these with the host. The human gastrointestinal tract contains one of the most complex bacterial communities. It was proposed recently that the microbiome can be classified in three enterotypes. In our study, we used data metagenomics quantitative search to identify phylogenetic patterns in the intestinal microbiome to develop prediction models for the enterotypes. To reach this aim, statistical tests were applied to the data regarding abundance of bacteria in level taxonomic corresponding to genus. We identified genus significantly with the abundance different and important correlations. Besides the ratio among genus to be used as parameter bioindicator of the respectives enterotypes. Through the logistic regression test we identified that the prediction model for ET1 was influenced significantly by the ratio of Bacteroides / (Prevotella + Ruminococcus). In the model for prediction of ET2, it was the ratio of Prevotella / Bacteroides with such as characteristic significance. And for the model of ET3, we identified the ratio of (Akkermansia + Alistipes) / (Bacteroides + Prevotella) as significant parameter. These models were assessed against two groups of independent data and associated with the value of cut-off 5%; 20% and 95% respectively. Besides the value of cutoff for each models, the crossed validation allowed the association of the model with the measures of PPV for ET1, specificity for ET2 and PNV for ET3. We propose the experimental validation of these models for the qPCR technique. And with that methodology established, it would be possible to do the diagnosis of the enterotype individually. / Humanos vivem em constante associação com microrganismos. A quantidade de microrganismos presentes no corpo humano ultrapassa o nosso próprio número de células. Essa comunidade de microrganismos tem profunda influência na saúde e doenças. As tecnologias de sequenciamento de DNA de alta capacidade e abordagens moleculares independente de cultura têm ampliado a compreensão acerca das comunidades de microrganismos e a associação destes com o hospedeiro. O trato gastrointestinal humano abriga uma das mais complexas comunidades bacterianas. Foi proposto recentemente que o microbioma pode ser categorizado em três enterotipos. No nosso estudo, utilizamos dados metagenômicos quantitativos buncando identificar padrões filogenéticos no microbioma intestinal para desenvolver modelos de predição para os enterotipos. Para alcançar este objetivo, testes estatísticos foram aplicados aos dados referente a abundância de bactérias em nível taxonômico correspondente a gênero. Identificamos gêneros com a abundância significativamente diferente e correlações importantes. Além da razão entre gêneros para ser utilizada como parâmetro bioindicativo dos respectivos enterotipos. Através do teste de regressão logística identificamos que o modelo de predição para o ET1 foi influenciado significativamente pela razão de Bacteroides / (Prevotella + Ruminococcus). No modelo para predição do ET2, foi a razão de Prevotella / Bacteroides que apresentou significância. E para o modelo do ET3, identificamos a razão de (Akkermansia + Alistipes) / (Bacteroides + Prevotella) como parâmetro significativo. Estes modelos foram avaliados contra dois conjuntos de dados independentes e associados com o valor de cut-off 5%; 20% e; 95% respectivamente. Além do valor de cut-off para cada modelos, a validação cruzada permitiu a associação do modelo com as medidas de PPV para o ET1, especificidade para o ET2 e PNV para o ET3. Propomos a validação experimental destes modelos pela técnica de qPCR. E com essa metodologia estabelecida, seria possível fazer o diagnóstico do enterotipo individualmente.

Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2016-02-29T12:41:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) PDF - Gustavo Correia de Moura.pdf: 4048269 bytes, checksum: 93440f590dbf6da5c94a68be759a0082 (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2016-03-10T15:14:56Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) PDF - Gustavo Correia de Moura.pdf: 4048269 bytes, checksum: 93440f590dbf6da5c94a68be759a0082 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-10T15:14:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) PDF - Gustavo Correia de Moura.pdf: 4048269 bytes, checksum: 93440f590dbf6da5c94a68be759a0082 (MD5) Previous issue date: 2015-08-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This study aimed to analyze the drivers factors of biomass, functional diversity and fatty acids of the zooplankton community in two tropical estuaries with different trophic states (Mamanguape and Paraíba do Norte), located in Northeastern Brazil. The study was divided into two manuscripts which were sampled in dry and rainy season, as follows: Nov/2013 to Jul/2014, for the first manuscript and Dec/2014 and Jul/2014 to the second manuscript, respectively. Four sample zones were selected along each estuary and in each one were selected three sites where at each site three biotic samples (zooplankton community) and abiotic (environmental variables) were sampled. The fatty acid profiles were obtained from gas chromatography techniques from selected copepod species. In the first study, we tested whether the estuarine connectivity, the phylogenetic relationships and the local environmental conditions are the main drivers of the pattern of distribution of biomass and functional diversity of the zooplankton community. It was observed that these three components are sufficient to explain the variation in Mamanguape estuary that is located in a conservation area, and different than is commonly expected, the connectivity can provide greater explicability for the community distribution, when compared to the environmental conditions. However, the three components used were not sufficient to explain the variation in Paraíba do Norte estuary which is influenced by anthropogenic impacts. The study shows the importance of spatial variable to assess the drivers factors of biomass and functional diversity of the zooplankton community, as this part of the analysis the effects of dispersal ability of species and the physical forces acting on the system. Moreover, a thorough investigation is needed to clarify the factors that determine and shape the zooplankton communities in high impacted tropical systems. In the second study, we tested whether the profiles of fatty acids can reveal spatial and temporal changes in diet of copepods, and therefore can be used as indicators of the trophic status of estuaries. It was observed that the fatty acid composition of zooplanktonic organisms revealed seasonal and temporal variations in trophic ecology of copepods in both tropical estuaries. In addition, the profiles of fatty acids were able to reveal differences in the quality of potential food sources in the two estuaries with different levels of anthropogenic impact, with a lower quality of food sources in the most impacted system (Paraíba do Norte estuary). In this study the profiles of fatty acids were sensitive to natural and anthropogenic stresses, being a fast tool to assess the trophic status of tropical estuaries. / O presente estudo teve por objetivo analisar os fatores direcionadores da biomassa, diversidade funcional e ácidos graxos da comunidade zooplanctônica em dois estuários tropicais com diferentes estados tróficos (Mamanguape e Paraíba do Norte), localizados no Nordeste do Brasil. O estudo foi dividido em dois manuscritos os quais tiveram amostragens realizadas no período de seca e cheia, sendo: nov/2013 e jul/2014, para o primeiro manuscrito e dez/2014 e jul/2014 para o segundo manuscrito, respectivamente. Foram selecionados quatro zonas amostrais ao longo de cada estuário e em cada uma foram selecionados três pontos onde em cada ponto três amostras bióticas (comunidade zooplanctônica) e abióticas (variáveis ambientais) foram coletadas. Os perfis de ácidos graxos foram obtidos à partir de técnicas de cromatografia gasosa das espécies de copépodes selecionados. No primeiro estudo, foi testado se a conectividade estuarina, as relações filogenéticas e as condições ambientais locais são os principais direcionadores do padrão de distribuição da biomassa e diversidade funcional da comunidade zooplanctônica. Observou-se que esses três componentes são suficientes para explicar a variação no estuário Mamanguape que se localiza em uma área de conservação, e que diferente do que é comumente esperado, a conectividade pode apresentar uma explicabilidade maior na distribuição da comunidade, quando comparada às condições ambientais. No entanto, os três componentes utilizados não foram suficientes para explicar a variação no estuário Paraíba do Norte o qual sofre a influência de impactos antrópicos. O estudo mostra a importância da variável espacial para avaliar os fatores direcionadores da biomassa e diversidade funcional da comunidade zooplanctônica, visto que esta integra à análise os efeitos da capacidade de dispersão das espécies e das forças físicas que atuam no sistema. Além disso, uma investigação aprofundada é necessária para esclarecer os fatores que determinam e moldam as comunidades zooplanctônicas em sistemas tropicais muito impactados. No segundo estudo, foi testado se os perfis de ácidos graxos podem revelar mudanças espaciais e temporais na dieta de copépodos, e por conseguinte, possam ser usados como indicadores do estado trófico dos sistemas estuarinos. Foi possível observar que a composição de ácidos gráxos dos organismo zooplanctônicos revelaram variações sazonais e temporal na ecologia trófica dos copépodos nos dois estuários tropicais. Além disso, os perfis de ácidos gráxos foram capazes de revelar diferenças na qualidade das potenciais fontes de alimento nos dois estuários com diferentes níveis de impacto antrópico, com uma menor qualidade de fontes alimentares presente no sistema mais impactado (estuário do Paraíba do Norte). Nesse estudo os perfis de ácidos gráxos foram sensíveis à estresses naturais e antrópicos, mostrando ser uma ferramenta rápida para avaliar o estado trófico de estuários tropicais.

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O presente estudo compreendeu a caracterização dos estuários de Santos/São Vicente e Cananéia quanto aos processos naturais e antrópicos; e o estudo de traçadores biológicos - foraminíferos. Estas regiões foram escolhidas, sobretudo devido ao antagonismo no que tange o impacto antrópico e, ainda, à sua complexidade ambiental. Os resultados hidrogeoquímicos, nutrientes e concentração de metais confirmaram a maior influência humana no estuário de Santos/São Vicente, principalmente na área mais interna do sistema, em comparação com a baixa influência antropogênica do estuário de Cananéia. A distribuição dos foraminíferos bentônicos como traçadores do gradiente de tensão ecológica (natural e antrópica) foi discutida a partir da análise de amostras coletadas nos sedimentos superficiais dos estuários, comparando-se a fauna, porém, sem desconsiderar as divergências espaciais das áreas em questão. Amostras foram coletadas para realização de análise qualitativa e quantitativa, além da análise micrométrica das testas dos foraminíferos. Os resultados obtidos revelaram que a distribuição das associações de foraminíferos refletiu o padrão natural em Cananéia, no que diz respeito tanto a abundância quanto ao tamanho específico. Os dados biométricos revelaram que a região de Cananéia concentra os maiores diâmetros médios, que estão sempre associados com as campanhas de inverno. Tal fato evidencia que a matéria orgânica elevada no verão contribui para o aumento da população e não de tamanho médio de organismos. Isso demonstra um esforço reprodutivo que provavelmente visa aproveitar a disponibilidade de alimento do verão. Outros resultados pertinentes foram: estabelecimento das espécies Buliminella elegantissima e Pararotalia cananeiaensis em locais que não são correspondentes no que diz respeito às características ambientais, denotando a plasticidade destas espécies em traçar uma rota de transporte e estabelecimento, que geralmente está relacionado à deposição da matéria orgânica. A partir dos dados obtidos pode-se concluir que os foraminíferos se comportam de maneira singular, de acordo com o tensor que está regendo seu estabelecimento, e através da análise de sua distribuição, foi possível inferir se um tensor antrópico ou ambiental influenciou o estabelecimento de espécies de foraminíferos nos estuários de Santos e Cananéia. / This study had as a goal to characterize two estuaries, Santos/São Vicente and Cananéia, regarding to natural and anthropogenic parameters. Besides that, the biological trace elements - foraminiferal assemblage. The study has been held along the two estuarine areas, and both of them have shown bio-geographical patternal patches. These study areas were chosen in accordance with their antagonist impact approach and their environmental complexity. Among the advantages on developing studies that uses bioindicators to evaluate na environmental quality patterns, it is evident the large amount of experiments on the water and sediments that these areas are constantly under over than three decades. The hydrochemical results, organic content and heavy metal confirm the human influence at Santos estuary, mainly in the internal áreas, in comparison with the low rate anthropogenic influence from Cananéia estuary. Foraminiferal distribution as a ecológical tracer, both natural and human made, was discussed from sediment samples from both áreas, but always concerning about the oceanographic differences. Samples were picked up aldo to biometric analysis on the foraminiferal shells. Results show that foraminiferal distribution follows the natural patterns as the first way, both relating to abundance and size. Biometric data revealed that the largest diameter average was always associated with the winter samples. It is such evidence that the high level of organic matter contributes incrising the population, but no longer raising its diameter size. This is a sight for a reproductive effort in order to not miss out food availability during the summer. Another relevant result is: Buliminella elegantissima and Pararotalia cananeiaensis establishment in areas where they wouldnt normally settle down, denoting they do not correspond with the same variable in both study areas. This fact evidences the plasticity of these species on fitting different environment characteristic in order to establish and to reproduce. This is generally associated with organic matter deposition and makes foraminiferal distribution a singular pattern that allows determining a natural or an anthropogenic influence.

Os Estudos de Impacto Ambiental (EIA) foram legalmente institucionalizados no Brasil durante a década de 1980. Estes são balizados a partir do Termo de Referência (TR) que define as diretrizes que o EIAs deverão seguir, mas não determina qual grupo faunístico e metodologias devem ser adotadas, o que fica a critério dos empreendedores e consultores contratados. Visando verificar se esse procedimento resulta ou não em ausência de padronização entre os TRs e os relatórios de EIAs, bem como em outros possíveis desajustes que resultem na menor eficácia dos relatórios de EIA, foram compararados nove relatórios de empreendimentos hidrelétricos das décadas de 1980, 1990 e dos anos 2000. Para tanto, foram utilizadas informações como atendimento às exigências contidas nos TRs e metodologias utilizadas, no que diz respeito aos métodos de coleta, esforço amostral, levantamento de grupos de aves e mamíferos dependentes de hábitats específicos relacionados, solidez das listas de faunas e análise dos dados. Além disso, foi avaliada a aplicabilidade do delineamento RAPELD na avaliação de impacto de empreendimentos hidrelétricos. Os resultados indicaram que há discrepância quanto aos esforços amostrais e às metodologias utilizadas nos estudos, além da ausência de informações requeridas pelos Termos de Referência e a escassez de dados relacionados aos grupos de fauna associada aos ambientes que serão afetados e a aves e mamíferos dependentes de ambientes aluviais. O delineamento RAPELD muitas vezes não é aplicável em regiões com alterações antrogênicas, mas deve-se levar em consideração que a recomendação de sua utilização pelo órgão ambiental para um casos analisados indica uma sutil evolução recente no delineamento amostral. As análises realizadas neste trabalho podem servir como indicadores sobre o estado geral da efetividade dos EIA como ferramentas a serem utilizadas pela sociedade no que se refere às intervenções ambientais. / Environmental Impact Assessment (EIA) studies were legally institutionalised in Brazil in the 1980s, and their elaboration is based on guidelines established by Terms of Reference (TR) which define the main directives to be followed by each project\'s EIA, but often do not determine the faunal groups to include and the methods to be employed choices which are then left at the discretion of the company proposing the project and their hired consultants. In order to analyse whether this procedure does or does not result in an absence of standardisation among Terms of Reference and EIA studies, as well as in other disparities which may impair the effectiveness of EIA reports, this work compared 9 EIA reports for hydro-power projects from the 1980s, 1990s and 2000s. The reports were compared with regard to such information as compliance with the requirements set by the TRs and methodology used (including sampling methods, sampling effort, study of bird and mammal groups dependent on specific habit types, reliability of the fauna lists provided and data analysis). The appropriateness of the RAPELD sampling design for Hydro-power environmental impact assessments was also analysed. The results indicated incongruities as to the sampling effort and the methodologies employed for the studies, as well as an absence of information required according to the Terms of Reference and a paucity of data specifically dealing with fauna groups associated with environments to be directly affected by the projects and with mammals and birds dependent on alluvial environments. The RAPELD sampling design is often considered inappropriate for highly human-modified regions, but it is noted that its recommendation by environmental agencies for some of the cases analysed indicates a recent improvement in sampling designs. This work\'s findings may serve as indicators of the overall state of the effectiveness of EIA studies as tools for the society to assess the effects of interventions in the environment.